
Sed0017652 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATGTGATCCCCACTCTAATCATAAAACTAATTTTAAATCATCAAACCTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTGAGTATTACTGGAATCACCGCACGAGTTCCTTCCAGCGTCACCCGCATGCAAATCCTCTCCAGCCGCCACGTGCACAACCGGACATCCTCCCGCCACTCTCACGCGCGCGTGTGTACGATGTCTGTGACCGTCACCTACTATCTCACACTCCACGCGCTTCTCACGCGCGTCACCTTCACGGAATCGCTCCAAGGGGTAGTTTCGTAATTTCCCGCCATGCTTCCGAATAAAGAAGCCCCTCAAAACACTTTGTTCCGAAGTAACTGCCCCGGGGACCACCCACCACACCCCCTTCTTTAATTATCCCAACTGTTTTTCCATTTATCTCCACCGTCGGATCATATCTACTCCCGGAGTATTACAATCCAACGGTTTAGGAAAAATGCTCCACTGTATTGTTATGAGCTGCACCGCACTGCAGTGTGCTTTGATATTTTAAATTCCTTTTTTTTTTTTTCCTTTATCAGGAGATTTTTCAGAGTTGGGTAAATTTATTAATTCTTTTTGAACTCACCAATTGCCAGTGTGGGAGCAGGAAAGAAGCTAATCCATCCAGTGCTGCTACAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAGGGGGAAATTGGAAAAAAAATGGAAAATTGAAATCCATGGAGCTTTCAAGTTCATGTTTTTCATAGATTGTAAGCTCCATTTTTCTCTGGCCCATTGCTCATTCTTGCTCTGTTCTTTTGTTTTTTTTTAAAATTTTGATTCCATTTTTGTTTTCACTTTCTTGGCTACTGTGTAGATCTCTATCTGTTTTTCCAGCTGCTTGGTTTTTAGGGTAAGGTGATCTTGTTTCTCTGAGATTTGTTTTCTTTTCTGGAATGGTAGAATGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTGAAAAGTGGGAGCATTGAGTGAGGTGGGTAAGTTTCAGATCTGGTGCTGTGGGTGTTGAACTTTGTTTGTCTTTTGGGTTGTGTTTATTTTGTGGGTTGTTTTAGGGTTTAGTGATTAGTGCAACTGGATATTTGGTTTGTGAGGTTAGTTTGTTTTCTTCAGGGGGTTTCTTAGAATTCTGCCTTTTTTGGGTTGCTGTTTCTTCATTGGATGTGATCTATGTGAATTGGGTTTTGTTTGATTTGTTCATTTGTGATTGTGATTTGTGGAGTTTTGATTTTATTGTTCCTTTGACAACTTGTTTTTGTTTTATAATGGGTCCTTCGGCTTTTGGACCCCCTGAGAGTTTGGATTTGGATGATCGATCTGTTGCTTAGAAATTCTTCAAGTCAATGTGTTATTTCTTTCTGGGTCGGTGAAGTTAAGGAAGATTATGGCTAGGAATATGAGAGTAGCTTGTGCTGCTTTTAATTTGGTAGCTCATGAAAGGGGAAATGTTGGTCTTATAAGGGATGATCTGGTAGAATATGTACTGTATGTCAATTACGTACCCTACCAATTATGTTTAGTGTGATCATGTTGTGGAGTTTGAGTGAGTAATTGGAGTTTTCTTATTTGAATTAAAGGATGTTTTTGATGTTTCTTATTTACTGCCGAGAATTTGATGTTGCTGCGTTGTTCACTAAGTTTTATGTTTGCAGAGTTTAACCTTTTCAGCAATGGGGAAGTCGCCGGGGAAATGGATTAAGACTATCTTGTTTGGGAAGAAGTCTTCCAAATCTAATCTTTCTAGGGGCAAAGAGGTAATTTGGGTTCCATTATTGTACAAAGGCAGCTAACTTCCAAGTTTCTTTTAAGGTTCCTTGCTATTCACTTGAGTTATATATCTGGTTGTATTTGTTGTGAGCCTATAACTCAATTGTAAAATATCCATTTAATCTTTTTGTCATAGTCATTCTATTAAAAGTAACATATTTTTGTGGAAAAATCATTATGTGCATGGTTGTTGGAAGATTAGGGGTATGTTTGGGCCCCCATTTATGTAAACGGTCAGGTTGGTTATGACAACCCAACCGATGTTTGCCCCACTGTTTATTATAAACGGTGGTTACCTAAACCTGTGTGCCCATTTATCTAAACCTACGTGCCCGTTTATTTAAACCTTACATATATTACTTTTTGTTACATAATCAGCCCCCCAAACACCGTTTATCATAATCCCTGTTATAACAACTTCCCCCTCAAACACCATTTATAATAACCTACCGTTTATCATAACCTTCCGTCTATTATAACCAAACCGGTGCTCCAAACATACCCTTGAAGTTAAATCATGTTTGTTAGCTTCACGTTGACCTGGAGTTGATGACTGAACTTTCACTTTCTATCCTAGTACATTCAGTTTCATGGCAAAACCTCGATACTCTCGATTTCAATAAACTGAAGTACCAATTGTTTAATACATCTCTCTTTGATACTGTGTAGAAAAATGGAAATGAGAAGGAAGTAGTCGTTTCTGCCAAGGCATCAGAGGCAACTTCTGTTATTAGTCATCCTGTAGCTTCACAACCAACCCCAAATACCATTGATTCAAATGAAGGGGTGTCAAAAATCACCAATAATGAGGCAGCTAATGTGTCGAACGAAAGATCAATATCAGTTCAAGGAAATCAAGATGCAGAAATTCAAGGATCTACCTGCGAAGATGCACTGTCCGATCCTGAGAGAATCCGTAAAGAGGAGGCTGCAACTAAGACTCAAGCTGCTTTTAGGGGTTATTTGGTAAGCAAAGAGATGCTGAAACTAAAGTTCAAACTGCTTTTAGGGGTTATTTGGTTACACTTTTTTCTTACTTTCTAAAGTAATACTTCTGAGAATGTGGTAGTAGTATCTGCTCTTTTACCTTTTCACTTATCACTACTAATTATCTTTCGATGCTGGAGTCGAATCCTCTTTGAAGTTTTGTGATAAGGTTGGGCCTAGGGCTCGATTGGGCCTAGGGCTCTATTTAGCCATTACTTGGAGAATAAGTTAGTATTTTGTTATAAATAGAGTGGGTTAGGTTAGAGTTTAGGCATTCAATTGTTAAATGAGTTATTGAGTGATTTATTGTAAGGGCTCAAGAGATTCTCTTGAGAAGGGAGGTTCCAAGTTCCTATCAAAACTTGGTTTATCTTTATTCTTTTATCTTTTGATATAATCTAGATCCTGGATCATATCAATTGGTATCAGAGCCGTTCGATTCTTGGTTGTAGAGATGGATCAAGAGGTTCTTCGTTTCATTCAAGAAAAGTTGCAAAGTTTGATGGTGGACTTGAAAAAAGACCTCAGAGAAGAGGTAGCTTCTCTAAAAAAAGAAATTAGAGAAGACCTAAAGGAGAGTTTCAATGACCTAAAACGATGTTTTAGGAGGAAATTAGGTTGGAAAAAACAATGACGGCTAGGGTTTTGACCCCGCCACCACCGCCTCCTCCGTTGCCGCCTCCGCCTTCCCCACCGCTTCTTGCCGCGCCGTTGCCCCTACCTCCGCCACCATCACCAACCCCACCTGCGGCGCTGCTGCCGCCGCCACGTCACCACCTCCGCCACCACCATCGCCGCCACCACTTCTAACATCGCCGCCGCCATCTCCACCGTCACCACCTCCGACACTGCCGCCACCACCACCACCAGTGTTGCCGCTCTGTCATCACCACCACCTCTGTCACTGCTGCCTCCACCACCGACTCGCCGCTGCTGCCGCCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAATATATTTTTGTTTATGCCCACCTTGAGGACAATGTGCTTTAAAGGGGCGGGTATTGATAAGGTTGGGCCTAGGGCTCGATTGGGCCTAGGGCTCTATTTAGCCATTACTTGGAGAATAAGTTAGTATTTTGTTATAAATAGAGTGGGTTAGGTTAGAGTTTAGGCATCCAATTGTTAAATGAGTTATTGAGTGATTTATTGTAAGGGCTCAAGAGATTCTCTTGAGAAGGGAGGTTCCAAGTTCCTATCAAAACTTGGTTTATCTTTATTCTTTTATCTTTTGATATAATCTAGATCCTGGATCATATCATTTTGATTATTGGGACTTGATGAAATAATACTTTTGTTGTGTGTTGTCTCACTTAATATGCTAGGTTTATTTCCTTCTAGTTGACAGTGTCATGATATTTTACTGACACAAATTTTGATTGAAGGCTCGCCGTGCATTCCGGGCCCTCAAAGGTATTATTAGGTTGCAGGCACTTATTCGTGGTCACTTGGTAAGGAGACAGGCTGTTGCTACTCTATGTTGTATGCTTGGAATTGTTAAGTTTCAGGCTATTGCTCGGGGAAGAAGTGTGAGGCTTTCTGATAAAGGGCAAAGCAAATATAGATTAGGGCAGCCACAGGTAATGCAGAAAATATCACTGCTATTATTATCAACGTTCATTTTGTGTACAGTTCAATGGAATAATTTCATATGGCCTCTGCAATTTCTTTTAGTTTTCTATTTCTTTCAATCCTTTTTAATGAGCTTGATATCTCAGGTTCTCATATTGTTTTTGAACCTACGGCTTTATCTTGCTCATCGCTGTTTAAATTTTGCAGTGTTAAAAATCGTATTAATCCTATATTAGATGTACTGTTTGTGTTTTCTAGCTATGTCTATAGACTTTATTAATGGGAAATAAACTTCATAAGCAACCGTCAAACAAGAAATTGTTTGCAAATTTGAAATGTAGCTCATTCATACACAAATAGGCCCGGGCCTTATACCGATCTCATGAATGTCAAGATTGTTACTTGGAATAGTAGTTGACAAATCTTACTTATTTTTTACATTTTCAACATCAGGAGCAACCATTAGTGGATCGAGCAAGTTTCTCTACACGAATGACAAAGCTTTCAGCTAATGCTTTCACTATCAAGGTAAGTTCATCATTACATCATTCTCCGGATGTGGCCCTACTAATTTTCATCAGTTAAATTAGCAATGAGTAGAAACCCTTTTAATCCTTAAGGAGGAACCTTCCTGGTATCTGTCTCCACTCTCCACAT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MNVIPTLIIKLILNHQTSKKKKKKLSITGITARVPSSVTRMQILSSRHVHNRTSSRHSHARVYLYLFFQLLVISATGYLVCEVSFFDFIVPLTTCFCFIMGPSAFGPPESLDLDDRSKNGNEKEVVVSAKASEATSVISHPVASQPTPNTIDSNEGVSKITNNEAANVSNERSISVQGNQDAEIQGSTCEDALSDPERIRKEEAATKTQAAFRGYLARRAFRALKGIIRLQALIRGHLVRRQAVATLCCMLGIVKFQAIARGRSVRLSDKGQSKYRLGQPQEQPLVDRASFSTRMTKLSANAFTIKLASSTSAKPLQIYFDNGDENSALKWLERWSNSRFWKPIPQVKKAPETKSQRRLSTGQPGEAHTIRSKRTRRVPTVNDNAAIQSSAEVEKPKRTLRKVSTHAAAEQVQENPQLELEKVKRSLRKIHNPVLENSAPVEADADKLKESLDKASNVPGRDVLARGSNGNSSEKMKKEAMPVPVQPDLETTPEPVPIIEVLNVPNGDPVVEPPPLVESSDKDKNIVGDEAAVETKPLTESYSKDEDKSLSNGESNHKEDYTINENPKSGRKASTPAKQERVENGLQHSPTVPSYMAATESAKAKLRAQGSPRFGQETETNNLNRRHSLPSPANAKISSQSPRTQRLVQAGGKGGNKNGKALQGSRDGNAAGNSPYANVCILHINRFCFQWKRIRIHQLFFFMRYRNSDINGGSISSGFHLLYPSKCAAQEKFNLPVNYELDKPKNNCGCACVDTNGDGVCEKVCGLEYSTLIQAASCPIPNPPQWPPILQMPAPDFRAVRTYFYPYEDLPNKSCRDSLSCPVTMLFTGNNRSLGTLLAASMVPSSLSLNTSDVKYGGSQNVLGSESQPKTNNFLEPALFSDLPLYYMQRQCAAGPTLKVPVSIFSLTKIQDIICAQGLQLWRNSSSEVNDEIYRGYQDGNSEGKINEILSGFDFLNSDGNNFNVTIWYNSSYKSVDLFSQGLLRVPRLVNLVSNSYLKFLLGAGKEMSFEFVKEMPKPATKIRLDFSSLLGALFFTWVILQLFPVILSSLVYEKQQKLRIMMKMHGLGDKPYWMISYVYFLTISAVYMFCFVMFGSVIGLKFFTLNDYSIQFAFYLLFINLLVSVAFLVSAMFSNVKTAEVSSYMCVFGTGLLGAFLFQFFVEDSSFPRGWITIMELYPGFLLYRGLYEFAFYSFTGNLMGTYGMRWGDLTDSVNGMREVLIIMLVEWIVVLLVAYCIDQIFSSGSWKHPLFFLRRHDKKPPSQNPGLELEKSKNLDQIDKPDVREEREKVEWSLKEGDPSHAIVCDHLRKVYPGKDGNPEKFAVRGLSLSLVRGECFGMLGPNGAGKTSFISMMIGLIKPTAGTAFVEGLDIRNEMNGIYASMGVCPQHDLLWETLTGREHLLFYGRLKNLKASALTQAVEESLKGVNLFHGGVADKPAGKYSGGMKRRLSVAISLIGDPKVVYMDEPSTGLDPASRKHLWNVVKRAKQDRAIILTTHSMEEAEVLCDRIGIFEDGSLQCIGNPKELKARYGGTYVFTITTSPTHEGDVENMVKRLAPGASKIYRLSGTQKFELPKREVRIADVFQAVENAKSRFRVLAWGLADTTLEDVFIKVANGAQSSDKLS Homology
BLAST of Sed0017652 vs. NCBI nr
Match: KAG6584265.1 (ABC transporter A family member 7, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2410.2 bits (6245), Expect = 0.0e+00 Identity = 1286/1623 (79.24%), Postives = 1389/1623 (85.58%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. NCBI nr
Match: TYJ99098.1 (ABC transporter A family member 7-like isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2106.6 bits (5457), Expect = 0.0e+00 Identity = 1129/1587 (71.14%), Postives = 1260/1587 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. NCBI nr
Match: KAB2633493.1 (ABC transporter A family member 7-like [Pyrus ussuriensis x Pyrus communis]) HSP 1 Score: 1707.6 bits (4421), Expect = 0.0e+00 Identity = 952/1549 (61.46%), Postives = 1143/1549 (73.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. NCBI nr
Match: XP_038895716.1 (ABC transporter A family member 7-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1577.8 bits (4084), Expect = 0.0e+00 Identity = 784/892 (87.89%), Postives = 822/892 (92.15%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. NCBI nr
Match: XP_023001516.1 (ABC transporter A family member 7-like isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1567.4 bits (4057), Expect = 0.0e+00 Identity = 778/892 (87.22%), Postives = 826/892 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9STT5 (ABC transporter A family member 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCA7 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 1114.0 bits (2880), Expect = 0.0e+00 Identity = 569/899 (63.29%), Postives = 688/899 (76.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9STT7 (ABC transporter A family member 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCA5 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 1067.0 bits (2758), Expect = 2.1e-310 Identity = 549/904 (60.73%), Postives = 677/904 (74.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1PEH6 (ABC transporter A family member 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCA3 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 1052.0 bits (2719), Expect = 7.0e-306 Identity = 536/900 (59.56%), Postives = 669/900 (74.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LPK0 (ABC transporter A family member 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCA8 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 1048.9 bits (2711), Expect = 6.0e-305 Identity = 537/866 (62.01%), Postives = 656/866 (75.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9STT8 (ABC transporter A family member 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCA4 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 1047.7 bits (2708), Expect = 1.3e-304 Identity = 542/904 (59.96%), Postives = 665/904 (73.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LTA9 (ABC transporter domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G045470 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2172.1 bits (5627), Expect = 0.0e+00 Identity = 1150/1540 (74.68%), Postives = 1281/1540 (83.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BLQ1 (ABC transporter A family member 7-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold248G003030 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 2106.6 bits (5457), Expect = 0.0e+00 Identity = 1129/1587 (71.14%), Postives = 1260/1587 (79.40%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5N5I2Z5 (ABC transporter A family member 7-like OS=Pyrus ussuriensis x Pyrus communis OX=2448454 GN=D8674_029740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1707.6 bits (4421), Expect = 0.0e+00 Identity = 952/1549 (61.46%), Postives = 1143/1549 (73.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KIU7 (ABC transporter A family member 7-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495633 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1567.4 bits (4057), Expect = 0.0e+00 Identity = 778/892 (87.22%), Postives = 826/892 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E7X1 (ABC transporter A family member 7-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431463 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1567.0 bits (4056), Expect = 0.0e+00 Identity = 779/892 (87.33%), Postives = 826/892 (92.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. TAIR 10
Match: AT3G47780.1 (ABC2 homolog 6 ) HSP 1 Score: 1114.0 bits (2880), Expect = 0.0e+00 Identity = 569/899 (63.29%), Postives = 688/899 (76.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. TAIR 10
Match: AT3G47740.1 (ABC2 homolog 2 ) HSP 1 Score: 1052.0 bits (2719), Expect = 5.0e-307 Identity = 536/900 (59.56%), Postives = 669/900 (74.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. TAIR 10
Match: AT3G47790.1 (ABC2 homolog 7 ) HSP 1 Score: 1048.9 bits (2711), Expect = 4.2e-306 Identity = 537/866 (62.01%), Postives = 656/866 (75.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. TAIR 10
Match: AT3G47750.1 (ATP binding cassette subfamily A4 ) HSP 1 Score: 1039.6 bits (2687), Expect = 2.6e-303 Identity = 541/914 (59.19%), Postives = 666/914 (72.87%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017652 vs. TAIR 10
Match: AT5G61700.1 (ABC2 homolog 16 ) HSP 1 Score: 996.5 bits (2575), Expect = 2.5e-290 Identity = 520/858 (60.61%), Postives = 638/858 (74.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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