
Sed0017008 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAGGGCGTCCCAAGCCAAGCCTGTAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAAAGTCTCAGAGGCGTTCCCGATATTTTCCCATTTCCAGTCCCGCAATGAGGTGTGCTTCTCTTGTTCCTCTTCTCGATTTCCAATTCTTTTGGAGTAATTTGTGATCAATTATGAAATTCAATCAATTGCTTCACTGAAAGTAGTGCTTGTTCGTTGGATCTATCCTCATTTCCAGAAATTTTGGATTTAGTTTTGCCTTGTTTCATTGTTTTTTCGAATCAACGCTGTGGAATCTTCTTGGTTGTTTTGCTCTGATTCAAATGTGCTTATTTTATTTTATTTTTCTTAGAATTGATGGGGTTAGGGTGCAGAAATGAGCTTCACTGTCTTCTCAGGTGAAGCTCAATTCGTTTTGTTGTGGTTAAGAATTGCATAACGGGGTGCTAGGAGGATTAAAGTTCAAGTATTAGCTTAGCTTGCTTGTGTTTATTTATATCTAATTTGATTGATTTTATATGATTATTATTTATGTTTCGTCGTTTGTATAATTCTACTATCCTAGGCTGTGATGAACACTTTTAATTTATGCATATCCACTGCTCTGAAAGACTCGCTCATGTGTGCCCAAGCTCAGGTCTAGCACCTCGCCTTGAATTGGCGAGACGTAAGTAAAATGACGTGCGCCTTCATGTGGTTCATAATAAAAGTTAAGGTTGTCCGCAAGAGGTGGCACAGTGGATGAAGACTTGGGCTTTAAGGGTATGCTCCCCTCTAAGTCTCAGGTTTAAGACTCACCTGTAACATTACTTCTTTGATGTCTCTAGTACTTGTCCTAACATTAAATATATTCGTATCTTAATATGTATTGTAAATATTTTACTAATCAGGCCTACTCCTAAAAACATTCCTATTTTTTTTAATGTTCCAATTAAAATATTTTATTTTATATATATAGCGTGCCTCAGATAAAAAAAATTTAGTTTTTTTTGTGTCTTGTGCCTAAATTTCAATAGGCTATTGCATCTTAGTGCACCATGAGCTTTTAAAAATACCGTGTTTATAATTGTACCTAGTTTTTGTCTATTGATTTTTTAGGATGTGTTTGAGATTAATATATATTTTCTACTTACCACCAAACATCGGAAATTTGAATTACACTGGGGCTTGTATTACATATGAAGTATATGTATGCATTGAAGGTGATTTTTTTCCCCTATGCTTCTTGTTCTACTGTTAGACAAAGCTCTGTCTCGTGCATTTTGCTTTTATGTCTCCACCTGGCTCTATGTTTAATAGATTTTAACTTTTATCAGACTTTTTTTTTAAAGACTTATCTAGATTCTAAATTACAAATAACTGGTTGAAAAGTTAATCTAGAAATTGGCCTAGGGACGGACGTGGTTATCCTTATTTCAAAAGAAAAAAGAAAAGTCAATCTAAAAATATACATACTGTTATGAAAACAACAATCAACAATTGATCGAAGAATAAAGAAAACGCGAGAGAAGAAGAACAAACACATAGAAATTTACGTGGTTCACTAACGTAGTGTTAACTAGTCAACGGGTAGAGAGGGGGTGTTGTTTTATCAAGGAGAGACGAACAAAAAATATAGATTACAGAATGAATGTCATATTACGGCTAGGGTTTAATTCGAATTTATATATGCACTCTCATCAAACCCTATTACAGAATGCGTAAGCATAAACAAAATGCGGATGCACTAGCATACACGGAACGCACAACATAGTGTGGAAGTGCTGACTACTAATCACAGGGTATTAATGCGTTCAAGACATATCTTCAATACATACATATATATACATACATATGCACACATACATATTTATACATACATTTACATACATATACATACATACGTACATATACATACATACATACGTACATATACATACATACATACATATGTACATATACATACATACTGTTGGTTATTTGATGATTATTCTCAAATTATTTGTTTCCATATTTATTGGATTAGTATCTTGTATTTATAATATTATTGATTTGTAGAGGATATTATCCTAATGTATTATTTGTTTCCTTATTTGTAAAGTAAGGGTTTCTCTATTTAAGAAACACCTATTATCAAAGAATAAAACAGAAAATATTCCTCTCATTATATTTTGTACATGGTATCAGAGCCAAACAAAGAAAAAGAGAAATAAAAATATTTTTTCAAAACCCTATAACAGCTTGTTGTCAATTCAGCCGCCACGCTTTGTCTACCTCCACCGCGCCGAGCGAAACATCGGTCCACTCTTATCCGGTGATGAGAACTTCGCCACGCCCGAGAACCAGTTGTTTACTAACTGCTGCTGTCCGTTGAAAAAAACCCATTCCTAAGCGTTTTTTTAACTCGCGCTACCTGCTGTCCATCGGTGTCGATTTACATTCATCGGTGATCGCTTTTTTCCGGGGAGAACTTCGCGCTACCTGTCCATTCAACTTTGTCGCAGCTCCGAGGAAACCTTGCTGCTTTGCTTGTTTCTCAAGTTTGGGTTATTTTTTCAAGTTTTTTGGCCAACTGATTGGGTTTTTCAACTGTTGTTTTTTTTTTTCTGCTGCAGTTTACTATATTTAAACTGCTGTTTTTTTAGTTATCTAGCCTTAAAATCTTGTTTTTTGTTGAAGAATAATGTCTGAAGACAAGATATCAGTTGCTAAAATTCTAACCCATAGCCCTACTATCCAAATCACAACCATTCGACTTAATGGTGACAATTTTCTTCGGTGGTCACAAAGTGTTCGAATGTATTCGTGGACAAGGAAAGATTGGGTACCTTACTGGAGACAAGGTAGTACCTTCCAAAGATGATTCATCTTTTGCTACATGGGATGCCGAAAACTCCATGGTGATGACCTGGCTAGTAAATTCCATGGTGGAAGACATTAGTAGCAACTATATGTGTTACTCTCTGGCTAAGGAATTATGGGATAGTGTCACGAGATGTATTGCGACTTAGAAAATCAGTCACAAGTGTTTGAACTAAATCTCAAACTAAGTGACATAAAACAAGGGAAGTAATTCATACTCAAGACTTTCACTTCATCAAGCAAATTTGGCGGGACCTTGATTTGTTTGATAAATATGAATGGAAGTCCACCAAGATCAAAAGCACTATAAGAAAATTGTTCAGAATGGTCGAATTTACAAATTCTTGGTTGGACTTAATGTTGAGTTTGATGTTCGAGGCAGAATAATAGGTAAAGCTAACCTTCCTAATATCAACGAAGTGTTTTACAAATCTGCGAGGAAGAAAGTCGGCAACATGTGATGATGGGTAAAAAACAGGTTGATACGTAAGAAAGCTCTGCGTTAGTTGTTGAAGCCACTCGCAAACAAGGCATCCGATCGGACCAATAAGCCTCGTGTGTGTGTGTGATCATCGCAAAAACCGAGACATACTCGGGAGACATGTTGGAAGATCCATGGAAAACCTGCCAATCATAAAAGTAATAGATAAGGTGAAAAGAGTATTCGTCCACCAGCTTCTAGTGCCAATAGTGCTGAATCAACTCCATTCAATAAAGTGCAAATTGATCAAATCCTGAAGCTGCTCAAGACCACTACGACTTATGGTAATCCTAGTGTATCCGTGGCACAAACAGGTAATTGCCCTCATGCCTTCTCCTGTCTTACTTCAGCTTCGTGGATTATAGATTCTGGAGCTTCTGACCATATGACTAGTTCCTCAAAACTCTTCGAGTCATGCTCTCCATTATATTGTAATGAACAAATTAGAATAGCAGATGGTAGTTTCAATTCTATTTCTGGAAAAGGAACTATTAAGTTATCTCCACACCTTACCTTACAATCCGTCCTTCATGTTCCCAAATTAGCTTGCAATTTGCTTTCAGTTAGCAAGATTTCTATAGATTCTAACTGTCGTGTTATTTTCTATGACTCACATTGTGTCTTTTAGGAACAGGAGTCGGGGAAGACGATTGGACGTGCTAGGATGCTTGATGGCCTTTACTATTTTGAGGAAGCTTCAACTAGTCATAAAAAGGTTCAGGGTTTAAGTAATGTTAGTTCTCCGTCTGTTAGGGAAACTTTGATGCTTTGGCATTATAGATTAGGACATCCCAGTTTTTTCTATTTAAAGTATTTGTTTCTAGAACTCTTTAAAGGAATTGATTGTTCTACCTTTCATTGCGAATATTGTTCCTTTGCAAAAACTCATCGCACTTCTTATTTACCTCAAAGTTATAAGGCTTCTGCACATTTTTATTTAATTCATAGCGATGTCTGGGGTCCATCTAAGGTAGTAACTCGAAGTGGGAAACGGTGGTTCGTTACCTTTATCGATGATCACACCCGTGTAACTTGGGTGTATCTTTTAACTCACAAGTTTGATGTTAAGGAGGTATTTATCCGTTTCTATAACATGATTGAAACCTAATTTAAAACCAAAATCAGTATCTTACATTCTGACAATGGCACTGAATATTTCAATACCTATCTAACTGAGTTCTTACACACCAAAGGAGTCTATCACCAATCAACCTGTAGAAATACTCCTCAACAAAATGGCATTGCAGAACGAAAGAATAGACATTTATTGGAAGTTTCTAGGGCCATTATGTTCTCTATGAATGTCCTTCAGTATTTATGGGGTGACACGATTCTTACCGCCACTTACCTCATAAATCGAATGCCTACTAAGGTTTTAGGTTTTCAAACTCCTCTAGAATACCTAAGAACCACCTTTCCTACAATTCGAATTTTCTCAGATCTACCAATCAAGGTTTTTGGATGTATTGCCTTTGTTTATGTGTCCAACCCTTCACAATCCAAACTAGATCCTCGGGTAAATGCATATTCTTAGGCTATACCTCCCATAAAAAGGCCTATAGATGTTATGATCCTGTAACAAAGAGATTTTTTGAAAGTATGGATGTGTCATTTGTAGAACACCAATCCTTTTTTAAACCTCATTCCCTTCAGGGGGAGACATCTACATTTGAAGGAAATTTTTG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MGSQSQDELITQKKMLSPQPGRFEDREDLIKYVRDFGADQGYVVTIKKSRKDRRVILGCDRGGVYRNRRKIDESRRKRKASSRLINCPFEAVGKKEDDTWILTIKNGDHNHEPLNDMSEHPYSRRFTEDEVRQIKMMTEAGIKPRQVLKALKQHNPDLQSTPRHLYNLKAKIRQGNLSETNFKSWSPNSSVPANSSHVIEDAVKQKHQLVPNLIGGEFLDSRDCPVVEVTNPATQEVVSHVPLTTYEEFKAAVNAAKRAFPSWKNTPISTRQHVMFKFQELIIRDMDKLVMNIVSEQGKPLKDAQDDIICGLEVVKYACGLATMQMGEFIRNASDGIDYHCIREPIGVCAGICSFNHSATISLWMFPIAVTCGNTFVLKPCEKNPGASLLLAALAVEAGLPDGVLNIVHGTHDMINFICDDEDIKAISIASSSSAEKNIYARAAATGKKVQSNLGGKSHAIIMPDANMEAALNALVDAGFGTARQTCMAINIVISVGSSVLWEEKLVEYAKALKVNVGTDPLAYLGPVITKEVKDHLCRLVRSGIDSGARLLLDGRDIVVPGYENGNFVGPTILSDVTTDMECYKEEFFGPVLLCMQQADNLEEAIAIVNRNKNRNGASIFTTSGVYARKFQSEVEVGMVGINVAVPVPLPSSFNDKAGLEFYTQLKRVAQQWKNLPDIGVSMAIPSPSERHLRARATPSMLLSTSEKDSPGGQHRSLHPLPSTSDAVLLANPQISQTDLVNERATASPPTPERDLHGRGLSLISNLSSAGDISNHDLSPAMPSTGDRDLASQAMSSERLYIPQKSHWSEVQRADSFPSTSERTHVPSSLTNSIIAQTSRTTHPALVLPAEALYAPTSSDSICQIIPGNDSTVPSRRIDSKCHSSERGHMLATSHLNDSMNQTLQATETSLFSSSARQYMAPAHRSQLSLASHIDISSQLTSDRLYISPLSHRNECMPLKSEWLCIPTSAVTQRMYLQDSIVSADEFQGQEASLTLHASQRI Homology
BLAST of Sed0017008 vs. NCBI nr
Match: XP_023543659.1 (uncharacterized protein LOC111803473 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1552.7 bits (4019), Expect = 0.0e+00 Identity = 816/1038 (78.61%), Postives = 882/1038 (84.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. NCBI nr
Match: XP_022978818.1 (uncharacterized protein LOC111478665 isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1550.4 bits (4013), Expect = 0.0e+00 Identity = 811/1032 (78.59%), Postives = 878/1032 (85.08%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. NCBI nr
Match: XP_023543654.1 (uncharacterized protein LOC111803473 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023543655.1 uncharacterized protein LOC111803473 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023543656.1 uncharacterized protein LOC111803473 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023543657.1 uncharacterized protein LOC111803473 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1548.1 bits (4007), Expect = 0.0e+00 Identity = 816/1039 (78.54%), Postives = 882/1039 (84.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. NCBI nr
Match: XP_038880953.1 (uncharacterized protein LOC120072618 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1547.7 bits (4006), Expect = 0.0e+00 Identity = 804/1025 (78.44%), Postives = 876/1025 (85.46%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. NCBI nr
Match: XP_022978814.1 (uncharacterized protein LOC111478665 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022978815.1 uncharacterized protein LOC111478665 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022978816.1 uncharacterized protein LOC111478665 isoform X1 [Cucurbita maxima] >XP_022978817.1 uncharacterized protein LOC111478665 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1545.8 bits (4001), Expect = 0.0e+00 Identity = 811/1033 (78.51%), Postives = 878/1033 (85.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0WM29 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALDH6B2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 650.6 bits (1677), Expect = 2.9e-185 Identity = 313/496 (63.10%), Postives = 400/496 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P52713 (Probable methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=alh-8 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 487.6 bits (1254), Expect = 3.3e-136 Identity = 250/488 (51.23%), Postives = 326/488 (66.80%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q02252 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial OS=Homo sapiens OX=9606 GN=ALDH6A1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 482.6 bits (1241), Expect = 1.0e-134 Identity = 236/490 (48.16%), Postives = 328/490 (66.94%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q07536 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial OS=Bos taurus OX=9913 GN=ALDH6A1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 481.9 bits (1239), Expect = 1.8e-134 Identity = 244/521 (46.83%), Postives = 341/521 (65.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q02253 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Aldh6a1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 481.1 bits (1237), Expect = 3.1e-134 Identity = 243/520 (46.73%), Postives = 337/520 (64.81%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IUC7 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (CoA acylating) OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111478665 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1550.4 bits (4013), Expect = 0.0e+00 Identity = 811/1032 (78.59%), Postives = 878/1032 (85.08%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IV39 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (CoA acylating) OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111478665 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1545.8 bits (4001), Expect = 0.0e+00 Identity = 811/1033 (78.51%), Postives = 878/1033 (85.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BWY1 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (CoA acylating) OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005478 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1540.8 bits (3988), Expect = 0.0e+00 Identity = 809/1042 (77.64%), Postives = 878/1042 (84.26%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GG15 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (CoA acylating) OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453599 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1535.0 bits (3973), Expect = 0.0e+00 Identity = 809/1040 (77.79%), Postives = 878/1040 (84.42%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IRA8 (Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (CoA acylating) OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111478665 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1534.2 bits (3971), Expect = 0.0e+00 Identity = 808/1033 (78.22%), Postives = 875/1033 (84.70%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. TAIR 10
Match: AT2G14170.1 (aldehyde dehydrogenase 6B2 ) HSP 1 Score: 650.6 bits (1677), Expect = 2.1e-186 Identity = 313/496 (63.10%), Postives = 400/496 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. TAIR 10
Match: AT2G14170.2 (aldehyde dehydrogenase 6B2 ) HSP 1 Score: 650.6 bits (1677), Expect = 2.1e-186 Identity = 313/496 (63.10%), Postives = 400/496 (80.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. TAIR 10
Match: AT2G14170.3 (aldehyde dehydrogenase 6B2 ) HSP 1 Score: 624.4 bits (1609), Expect = 1.6e-178 Identity = 303/471 (64.33%), Postives = 382/471 (81.10%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. TAIR 10
Match: AT1G79440.1 (aldehyde dehydrogenase 5F1 ) HSP 1 Score: 192.2 bits (487), Expect = 2.0e-48 Identity = 130/433 (30.02%), Postives = 213/433 (49.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0017008 vs. TAIR 10
Match: AT1G23800.1 (aldehyde dehydrogenase 2B7 ) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 6.7e-44 Identity = 155/513 (30.21%), Postives = 233/513 (45.42%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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