
Sed0016520 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTTCGTAGGACAAAAACCAATTCAGTAAATACGTGTGCCAATTACGCTAACGGTGCATTTTTTACATTTCTGCTCTTCATCTTCTCTCCCCTTCATTCTCCATTCACTGTGAATTTTTTTATCACTAATTGTTCAGATCAGGAGCTTCGTGTTCGAAAATGGCGAAATCCAGCGCTGATGACGGCGAGCTGAAGCGAGCTTGCGAGGCTGCCATTGAAGGCACCAAGCAGAAGGTCGTATTGTCCATTCGCGTCGCAAAGAGCCGAGGGATCTGGGGCAAATCTGGCATGTTAGGACGTCAACAAATGGCAAAACCTAGGGTTCTTGCTCTTTCCAGTACGCTCTCTATTTTAATTTCTCTGTTGATTGAATTGCGTTTTCGACTCATTATAATCTTGCTGGTCTCAAATCGGTATTCGAATTCCAGTTGATTCTTCGGAAATTATTAGCAACTATGCTTCTGTTGGATATACTTTTGGGATGCAAACAAAAAGTATCCCACATTGGTTACATGAGGGTAAGATCGTGATATATATAAGTGACGGCAAAGCATGAGGGTATAGGCCCAAAGTGGACAACATCTTACCAATGTCTAGATTCGGTTAGGGTTGTTATCCTTATCGTATATCCCATCTTGTCTCACATTGAATAGATAATGAGTCATCGACATCTTTATAAGACATATAGGCTACTCCTCTCAGTATCAACTAATGCTATTAGAGCTCTATTTGGATTATTGTTCTCCAAATTCTAGTCTTACTCAAGGTTAAAAACCTAAGTGGGTGATTTGGACCCCATCCAAGCGGGCATAAACTTAAGCGGTATTTGATCCCAAATGCGAGTAAGCCAAAGTTGTTATTTCGGTCCACAAATTTCAGATTTAATCCAAGACGATCTTCCTTATATGGCACCATTTTAAAGGGGCATATTGGAGATACTCATCTTTTCAAAATAAGAGATATTAGCTACTCCTCTCACTCTCAATTGGTTTTGAGGTGGATCTCCAAGCTATCTAATAGTTTCCATCATATCTAGCTGTCTAATATGATTATCGATTGCGCTTTCTGGTTTTGTGCGAATTTGGAACCAAATTTTTTTATATGCTTTGGTGCATTTGTGCACAATCGAAGCTCTCTGAATTTACTACTGCTCGTCCTTCACTGTAGCTTCTTACTGATATGGAGTAGTACCTCTCTCTCCCTCTTTTGTATGTATTTGTCGGTACAAATGCGATTGCTTAATTGTTTATGCACCGGAGGGAAATCACTAATTCAAATGATGATCAGACAAATCAAAGGCGTATTTAGTGGAAACTGTAAATAATATTTAAATGGTTGTACTGGAGATGGCTGACTTTTTTTGCCTCGGAATAGTACAATTAGAAAATACGAGCTATGTGGTGGGAAGAGGTAATTGTGCGACTGCACTCTGGATAGATGGGTGCATTGTATATGTTATATAAAATTGGGTTCCATCTTAAAGCCAAGGAAAATAGCTCATGCATCCTTATTAAGAATGCAAGGCCTCCCCATCTTTTCAACGTGGATCCTCAACATGCTCCTCAAGATGATGCCTCTATGAGTGCACCATTCTTGGATTTAATCTTGATTTTGTTGGCCGTATATCTATTTGGGCTTCATGAGCTTTGTTACTATATTAGATAAGCACGAGGTTCCATCTTAAACCAATTGACAATAAGAATGTGATATCTCCTCATCTTTTCTATAGGATTCTCAATAACTTCAATATTTGCTTGAAAACCGATATTCCAATAAAATGGATTTATGTTATTGGAGCAAACACTTTTGAAAGATTAGCTGTATATGGCATTTGAATTGTTGAATTTCAACATTCTAGAGCTATTGGAGTGTTAAGTTCTGTACCAGTGAAGGGAGAATGAGCTTACTTTGATAGGATCTATTATATAAGTTGTACTATGTGTCCTTGAGTTCTAATTATACGTCAAGGGACCTTGTTCTTTTTATCCTTGGAAATCTAACTCCATTGCAGTTCTTGCTCTGACAATATCTCTAGTTATAGCTACTCCATAAATTCTATCCTAGGAAGAATCATTGATATGTTTAAGTTATTACATCCATTGCCCATTCACTATTGTATCTTCATCATCATTATATTTAGATCCACTGACAAGATTGTATCGTGTCATCTTGGAAGCATGAAAGACTGTCATTTTTATCTGTGATTATCTGCAGCAAAAGACAAAGGTTCGCGAACTAAAGCATTTCTACGAGTCTTAAAGTATTCCACGGGTGGAGTTCTAGAGGTAATTTCAGAATCTCACTTTTTTCAGGTTTACAAAAGGAATTTCTTCTTTATAAAATTTTTTCCAAGGGCTTTCATGTCTAATGTTCATTTCATGACTTTTTGGCTGTTTTTATTGTATGTTCAAGCATTTTCTTGGTGGACAAAATTTAATCTTTTTTCTTCCTCTATTGATAATCGAATTCCACGTGCAGCCTGCAAAGTTATACAAACTAAAGCATCTTTCAAAGGTGGAGGTTATGACAAACGACCCCAGTGGATGCACATTTACCCTGGTAAGGCTCAGTTCAAAATATTTCTTATCAAAAAGTGCTCATTTGTCATTTCCATGTTAAGTACTATTTCATGTTGGTTTTCATGGTCTGTTTTTTGGACTTAGCACCACGATTATGTCTTTAATAAATGCAAATTGAATGCTACAATGCTACTTAACTTTTGCTCTTTCTTCTCTGCGAAACTGGATTTTGCAGGGATTCGATAACCTAAGAAGTCAAAGCGTTGCCCCACCCCAGTGGACTATGCGTAATATTGATGACCGGTAAGATTGTGGAGAGAGATTATTACTATTCCTTTGGTTTTTTTGTTTTTAGCTCATTGCACATAGTTTAAAAAAGGGATTGCACTGCACATGCTGCAGATTGTCATCTATTAGAAGTTTCTATGTATAGATTTATTTATAACATTAATTACTTATGAAGTAGAATTATTTTGGTTTTGTATTTTTTCAATCCAGGAACCGGCTTCTGTTTTGCATCTTAAACATATGCAAAGATGTACTGGAACGGTTTCCAAAAGTTGTTGGTATAGATGTTGTGGAGATGGCTCTTTGGGCGAAGGTGCATGTGGTTTTTCTTCTTTTATATTGAAACTTAACTTTAAGTTGCCGTTTGGTTGTTAACCTAAATATGATTATATTTTTAAATTTAATTTATAAAAAAATTATTATTCTTGATTTGTTGGCTTGATTTCTTTAGATAAATATAGATTACTATTGATTTCATGTTTCTTTTTCTTTTTCACTAGTGATGTTGTATTTGCTATATTTCTTTTATATAGAAAAGAAAAAAAATAATTCAAATGTGGTGAGAAGAGGATTGGGAGAGAAGAACGCAAAAGTATGAGTCATAATACAAAGGGCATATATAAAAGAAAACCAAAAGTTACGAGCTTATCACTAATAAGTAGAGAGATTGGATAAGACTCATGTTGATGTCATCACAAAAGAATTTATTGAGTAAATTTCCTTGAGTAAAAAACACCAGATTATTGCATGGTGATGAAACCCTAGGGTTTGCTAGAGAAGGATTGCCAAATGATTACCGAAAAAGTTTGAAGATAAGCCTCTTATTGTAAATGGTGTCGGTGGAGGAAAAACAACGCTTCGTCGAAGGCGGAGAGAAAACATAGCATCGATTGTGAAGAAAAAGAAAGTTGCATTGATAGAGGTGGAGATTGGCGTGTGAGAGAAACCTATGGCGCGCCAGATGATTCCCGAAAATGTTTAAAGATAAGCCTCTACGTTCCTCCTCCATGTCGAGTGTCGACGGAGCATTGCTGGAGAAATAGGGTAGAGAGAGATAGGGTGTTTAGAGAAAGGCGGAGAATATCGTTGGAGGAGAATCGATGCCGGAGGTAATGATGGAGACATTCGACGACAAAGAGGGAGTAGGAGGAGAGGAGCGCTGGTAGAAATAGTTGACTACTAGAGAGATAGGAGAGGGAGGTTGAGCAGCGACCAAATGGTTCCATCAACAATCGAGAGAGGGTAGGCTCCAATGACGATTGAGGACTGCATCGTCGATAGTGAGAAACCCTTCATCCTCCTGGCGCCAAAGGAGCACCTCTTGAGGAGAAAGAGGAGAGGAACACGTGAGTGTTTTAGCCAGAGTTTTTAAAGAGAAGGTAACCTACTAGTAGTTCATTAATCATTACTGAGAAATATGAGGAAAACCTGCATGTGCCACTTAGCTTTATACTCTCTTGATACTTTCAGCCTATATCCTTGTTAGAGGTTTTAACTGATTTTTGTTTACTTTTTTATTCTACTTATTAAGAGAATCTAATAAAGTAATTGGCTACAACAATGGCTTGTGCCACTTAGTTTTTTTTGCTGATGCTGGTATAGAAATTAATGTAGGAAAATACGCCTACAGTTCCTACCCAGAAGAGTTATCAAGATGGTCCTGTCGATGTTGTGGCTAGAGTAACAGAAAGTGACCTTAAAGTTACGGTTGGGAAGGAACTTGTTTCTCAAGCTGAGGAAGAAGACATGGAAGCACTTCTGGGCACGTGAGTTTGATTTCCCATATGTTCATGTGAATTTTTTTTTGAGACATTTTTTTATGTCAATTGGAGAGAGGCCATGTGCATAATGTTAGAATACAGCATTGTTTCTTGCGTGCTGCTGCTTGATTGATGATAACAAAGATTGTTGAGCTATTTATGATTATTGATATGCAGTTATGTGATGGGCATTGGTGAAGCTGAGGCCTTTTCTGAAAGGTTGAAGCGAGAGCTCCTTGCTTTGGAGGCAGCAAATGTCCATGCTATTTTGGAAAGTGAACCGTTGATTGATGAAGTAATTCCTTTTTTTTTTTGGCTAGCCCCGCACATATTCTGAACAATTTCAACTTTATTTAAGAAAACATGTAGGGCCTCTTATCTGCTTGGTCGTGATTTCCTAATTAAGCCTTAATATATGGATCATATG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MAKSSADDGELKRACEAAIEGTKQKVVLSIRVAKSRGIWGKSGMLGRQQMAKPRVLALSTKDKGSRTKAFLRVLKYSTGGVLEPAKLYKLKHLSKVEVMTNDPSGCTFTLGFDNLRSQSVAPPQWTMRNIDDRNRLLFCILNICKDVLERFPKVVGIDVVEMALWAKENTPTVPTQKSYQDGPVDVVARVTESDLKVTVGKELVSQAEEEDMEALLGTYVMGIGEAEAFSERLKRELLALEAANVHAILESEPLIDEVLQGLEAATNCVDDMDEWLGIFNVKLRHMREDIESIETRNNMLEMQSVNNKALIVELDKLIERFRVPSEYAACLTGGSFDEAHMIQNVEACEWLTGALRGLELSNLDPIFGNMRSVREKRAELEKLKSTFVRRASEFLRNYFASLVDFMISDKSYFSQRGQLKRPDHADLRYKCRTYARLLQHLKSLDKNCLGLLRKAYCSSLNLLLRREAREFATELRASTKASRNPTVWLEASSGSGQNVNASDTSTVSEAYGKMLTIFIPLLVDESSFFAHFMCFEVAALVPPGGVNGGKSGLGDDDDDLGILDIDENDSKSGKNSVELAALNESLQDLLDGIQEDFYAVVDWAYKIDPLRCISMHGITERYLSGQKADAAGFVRLLLGDLESRISMQFNRFVDEACHQIERNERNVRQMGVLSYIPRFAILATRMEQYIQGQSRDLVDQAYTKLVSIMFVTLEKIGQTDPKYAEIFLLENYAAFQNSLYDIANIVPTLAKFYHQASEAYEQACTRHISMIIYYQFERLFQFARRIEDLLYTIPPEEVPFQLGLSKMDLRKTLKSSLSGVDKSIGAMYKKLQKNLTSEELLPSLWDKCKKEFLDKYDSFAQLVTKIYPSETFFSVGEMRDLLASM Homology
BLAST of Sed0016520 vs. NCBI nr
Match: XP_008466633.1 (PREDICTED: exocyst complex component SEC3A [Cucumis melo] >KAA0051698.1 exocyst complex component SEC3A [Cucumis melo var. makuwa] >TYK31604.1 exocyst complex component SEC3A [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1643.2 bits (4254), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/885 (95.03%), Postives = 857/885 (96.84%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. NCBI nr
Match: XP_004147798.1 (exocyst complex component SEC3A [Cucumis sativus] >KGN60067.2 hypothetical protein Csa_000953 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1639.8 bits (4245), Expect = 0.0e+00 Identity = 838/885 (94.69%), Postives = 857/885 (96.84%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. NCBI nr
Match: XP_022982202.1 (exocyst complex component SEC3A [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1637.9 bits (4240), Expect = 0.0e+00 Identity = 838/885 (94.69%), Postives = 855/885 (96.61%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. NCBI nr
Match: XP_022940989.1 (exocyst complex component SEC3A [Cucurbita moschata] >KAG6608512.1 Exocyst complex component SEC3A, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1636.3 bits (4236), Expect = 0.0e+00 Identity = 837/885 (94.58%), Postives = 855/885 (96.61%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. NCBI nr
Match: XP_023523917.1 (exocyst complex component SEC3A [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1635.2 bits (4233), Expect = 0.0e+00 Identity = 837/885 (94.58%), Postives = 854/885 (96.50%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SX85 (Exocyst complex component SEC3A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SEC3A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1493.0 bits (3864), Expect = 0.0e+00 Identity = 766/890 (86.07%), Postives = 808/890 (90.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SX86 (Exocyst complex component SEC3B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SEC3B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1442.6 bits (3733), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/890 (83.60%), Postives = 795/890 (89.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NV70 (Exocyst complex component 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=EXOC1 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 174.1 bits (440), Expect = 7.0e-42 Identity = 197/877 (22.46%), Postives = 365/877 (41.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8R3S6 (Exocyst complex component 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Exoc1 PE=1 SV=4) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 8.6e-40 Identity = 193/877 (22.01%), Postives = 356/877 (40.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VVG4 (Exocyst complex component 1 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Sec3 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 6.8e-37 Identity = 164/715 (22.94%), Postives = 312/715 (43.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U8U1 (Exocyst complex component SEC3A OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2376G00020 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1643.2 bits (4254), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/885 (95.03%), Postives = 857/885 (96.84%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CT05 (exocyst complex component SEC3A OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503987 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1643.2 bits (4254), Expect = 0.0e+00 Identity = 841/885 (95.03%), Postives = 857/885 (96.84%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IW12 (exocyst complex component SEC3A OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481101 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1637.9 bits (4240), Expect = 0.0e+00 Identity = 838/885 (94.69%), Postives = 855/885 (96.61%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FLW6 (exocyst complex component SEC3A OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446407 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1636.3 bits (4236), Expect = 0.0e+00 Identity = 837/885 (94.58%), Postives = 855/885 (96.61%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIT4 (Sec3-PIP2_bind domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G854220 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1629.8 bits (4219), Expect = 0.0e+00 Identity = 838/900 (93.11%), Postives = 857/900 (95.22%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. TAIR 10
Match: AT1G47550.1 (exocyst complex component sec3A ) HSP 1 Score: 1493.0 bits (3864), Expect = 0.0e+00 Identity = 766/890 (86.07%), Postives = 808/890 (90.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. TAIR 10
Match: AT1G47550.2 (exocyst complex component sec3A ) HSP 1 Score: 1488.4 bits (3852), Expect = 0.0e+00 Identity = 766/891 (85.97%), Postives = 808/891 (90.68%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016520 vs. TAIR 10
Match: AT1G47560.1 (exocyst complex component sec3B ) HSP 1 Score: 1442.6 bits (3733), Expect = 0.0e+00 Identity = 744/890 (83.60%), Postives = 795/890 (89.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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