Sed0016270 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTTTCCATCAATTCTCTCTCTTCAAGCCATTGGAGGAGTTTCCAAGTAATGGTATCTTGTTGTCTGAAAGCCTCTTCAAGCTTGTCAGTAATAAACCTCAAAAGCAAAAGCACAATAATATTAACACCACAAATAAAAAAAAAAACAAGAAGAACAAGAAGGAGATCACTCAAAGCTTTACAAGCCCTTCTTCTCTAGTAATGTTCCAAATCTCTCTTCTTTATTCCTCTCTATTTTTCTGTGAAAAAAAAACAGTTTTTGCACCAAATCTGTGGTGGGTTTTTGTTGTTTTTGTGGTTGAATTTCACCCACTTTTTTTTTTACAGAAATTGTTCTTCATTTTCTTTCATTTTCACTTTGCTTTAAGTTTATACATCACAAATTTGTAGACAATTTTTTTTTCTTTCTCAATCTCAAAGTTTGGAGCTTTGTTCCTATTTGGATCTGTACTGAATTCAAGATCCAAAAAAAAAAGAAAAAAAAACCCCCATTTTTATCACAAAGATCAAATCTTTTTCCTATTCTTGTATTTAAATTTTTATTTCATTAATTATCATTATGATTAATTTTTGATATTTTTTAGGAGAGGGGATTTGAAGTAAAAAGATGACTAGGAAGAAAATTCAGATAAAGAAGATTGAAAATATAGCAGCAAGGCAAGTGGCATTTTCAAAGAGAAGAAAAGGGCTTTTCAAGAAGGCTAAAGAGCTTGCAGTTCTTTGTGATGCTGAGATTGGCCTTTTGGTTTTTTCTGCTTCTGGCAAGCTCTTTGATTTTGCAAGTTCAAGGTTATTTTTTACTTACTTATTTATTTATTATTATTTCATTTTTTTTAATTCAATAATATTTGAGTGTGAGGGTTTTGAATCTAAACAATCTCATATTGAGTAGATAGTAGATAGTAGATCTAACTTCATCCTATTCTTGTTTTTGCATTCACCCTTTTTTATAGAGAGAAATTCAGCTTGAATTTGTTTGAAAAAAATTGTTTTAAAACTTATTAAATTAATAAATACAGTTGATAAGGCAAGTACACAAATCCTAGTCAAAAGAAACCATTAGCAACATGGGGGGATGTGAAATCTAATATCTAAAATCTAGGCTTGTTTAGTTTGGATTTGAAAGACTTCGATTTGTGCAACTTTCTTTGGTTCATAATGTTTCCATAAAATATAGGCATGGTTTGTTTTCTTACATACGATATGTTTGAAATTTTGAGGTGGATTTCATGAAAGGGGCAGAGTTTTCTAGTTTTGAGAGATTGGGTTTGGTCCAAAATTTGATTTCAAATTTGAGTTTTCTTGGAATTTAATACTTGTATATGATTATATATTATGTACTATGAGAAGTAATTTTCAATATTTTGCATTATTTTGTGATTGTTTGCATCCATTTTTATATGATATTGGGTATTTTCTTTTAAAGAAGAGGATGGCCTTCCAATAAGATTCAAGAATGCAATTATAAAATTAGAAAACAAAGAAAGAAAAGAAAAGGAACATTGAGGGTAAATTACAATGAAGCTTTTGTTGAATATTTGGAACATAGAGGTTTTGTTCAAGGTAGATTTTCAAGTATATATGAGATTTAAAACCTAAAAAGATTTAGCTTTTGCCCTCTTTTTGAACCAATTAGTACATATAGGCTCAAAAGACACATTTTGACCAAATGGGTTTTCTTATTATCTCTTAAATAAAGAATAGAAATAAGGGTAAAGCTTAAAACCTCAGTGTTATTAACAAATGAAACATGAAATATACACAATTTCCCATTGGAAAATTAAGCCAAATCTACTCAAAGGACTTGATCAATAAATAAAGAGATTGACATTGTACCCTAAAAATATGCACAACTCTCCTCATCTTTCACTATTCATGCACAAGTTCCTCTCTAAAACTCTCATATCTTTTTCTCTTCCTATAATATACTATTTTTTGTTTGAATTCAAGAACAATTAGTTGGAGGATTCCAATTCATGATTTCTAAATCTTATGAACACATTCAATTTATACCAACATCTTGTTGACCTCACTATAATGTACCTAAAATTTTATATTTTTTTAAGTTTTATTTCAATATCTACCTCATATAATTATGATGATAATGTACTTTCTGTGCTATCTGTGGCTCTTAAATATCTTCTCCTATTTCATGTTTATGTATGCACGAATATATTTAACTTCCTTTTCTTTTTATGAAAACACCATTTGTAGACTTTAATTTCTTTTTATAATAACCTTCATACATATGCCTCATAACATGTATGATATGCTTTAAAGTGTAGAATACTTATGGGGTGTTGCATAATTAGGAATTTTCCTTGATTTTCATCCAACATCTTTGTTATAATATAGATGAGGTTCAATATCTTTGTTATAAGATATTATATCATCTACAATATATTAATATTAGAGAATTTACCATCAGCAGCACATTCTACCTCTTGTATTATATTTGCAGCAGAATTTTTAAAATAATTCATCTATAACATATTTATTTCTATCACTCACCTAGTGATAGAACTCAATTTAGATTTCTATCACCGATAGAAAACTCAATTTAGATTACTGATTATTCTTTAAGAAAAGATTTTCCTAAATGCTTAGTCCTATGCTTTGTGGACAAATGTGTAGACATATAAAAAAAATGATATCAGTAATTTTTAAGCATAGCTTGCAGAAAAGAAATTAAAAATAAATTATGTTTCTATTCGAAATAGTTGAAATGAAATGAAACTAACATAGTGCCATAGTTTCTGCTATAATAAGACATGTTAAAAGAATATTGTCATGAACATAATATTTCAAGAATATTGTCTAATTGAAAATATAAAAAATTGGCTGAACCCTAGTTTGGGAGGTTTTTAGCAACCTCTCTTTCAACTTCCTCTTTCTCTAAAAGTTACAAAGTTAAAACCCTAAAGTTTTCTGTCCTCCTCATCCGGCGTTGCGCCCCTTCGAAGACGTGACGTTGGGAGAAAACAAGGCTCGTCCATTCTAGTGTTGCATCTTAACTGTTCTTTTCTTCTCACTTTCGTTGAGTTTTCTTACATTCGTGAGTGTCTAGTCAGTTTATGCAAACTTCAACTATTACCATGAGACATACTGATTGATTCTACAATATTTGGATGAGGAATCCCTTTGAAGTTAATTCCTAGGGAGGGATTTTCTAATTTTCCTCTCAACCTTAATTGGTTGCACATGCCCTCTTTGCCTTCTCGTATCCCTCCGAGCACTTCACTCTCTCAGATTTCATTTTTGTTTAGGATCCCATATCAAAATGAGTGGAGACTTCATAATAATATATAAGAAATATGTGTTATTCCCCTAATTTTGAATTGGTTTTGTGGTGAAATCCTACATATTATCTAATATAGTATTAGAGTCCATAAGCCAAAACGAGTATTCAGTCCAATAAAAATGAAAATTGAGATTCGATTAAAGATTTATGAACCCAAAATAGGCATTGTCTTGAGAAAGCATGTTAAGGATGCCACATCAGAAAGAGTTGGTTTTGAAGTGGAACCTCATATTATTTAATATGGTATTAGAGCCATCCTAAATTAGGGTTTTGGTCAGGGGTTTCATCTCCAACGTGATCAACAACAATTTTTTTATTCGTATAATCAGTGTGATTCGTTTGATGCAATAACACATCCTATTGTGGTATATTATGTTTGATGGTGAAATCGACAATAGAAGGAGTATTCGTGTGTGTAGTGTCAATAACTTTGTTTTGAAGATTTATTTTCAAGTTGGTCATGTGTATTTACATGCTTCAATTTGAAGGGCAGTGTTAGGAATAAATATCATTAAGATATTCTATAGAATTGGATAGGTTTAATATTTAAATATTGTATATTCCGTAGGATTTGTTATTATATTTATTAGATATTATTAGTAATTGTCAGGAGATCTTTTGATATTTGTACTATATTTGTGAAAATTCAGAAGGTTTAAACCTTTCTCACAATTTATCAGTTTTCCTCTCCTTCGATCACGTGTGACCTTATGCCCACTCCAATGCTTCACTCTCGCGAACTCTCACTGGTTCCGTAAAGCATTATTAATGCCCGATTTTCTCCTCTTTCTTCACCGAAGCAACATACATCCCTCTCCTCTTCGATGAATGCTTGTGTTGTGTTGTACACACGCCTCTTCCCGTTGTTTTTCTCCACTACAATATGTTATTTTCCCTCTAGTTTCGTTCGAGAGATTTAATTGTCGTCAATCTTCCGCTTGCTAGCATGCTTCATCACCACTGATCTTCCATGAACCCGTGTCTCGTCCTTCATACTCAATTTCCCTTGTGTTACTCCTCTTCACCAACATCATTTACAACCTCTATTAACACCAAGTCTATGTCGACACCTATCGACTATTGCAATACTTTGTCTCCTTCGAGCATTGACGGTCTCACTTGCCTTTTATTTGTCGAGCACAAGAACGATTACTTTCACCAACCACGAGAATGTGGGTAGAGCTCTAGTGACATCAACCCACCAAACGGCTATAATTTTCCTTTGAAAGGGGATTATAAGGCCTATGAGTTTATCCTCTTCAATACCACCAACTATACATCTTCATGAAATTTTTCGGCCATGTCTTGCTAAAATTTATCCATCCTTGCTAAAATATTTTTTGTATTCAATAACATTTAGGGATTGAAGGATTTCAACATGTAAAATCTTTTGATTACTAAAAGGGTACATGATACCACTAGAATTATACTCTTGTTGTTCCTTCTTCCTATATTTATTCTTTACAAAATAATAATAACAATAATAAATAAATAGTTAGATATAAATATGGAAAATTTTTAAGATTTATTTTTTTCTTTCATATAATACTTTACCTATCTTTTTCTTTATCAAGCAATTTTATATCTCTATACTTTTTGGATATATAGTGGAAAGTTTAAACTTATGACCTCTTAAGATGAGTTATTATTGTTGACCTTATGTTTTTATCTAAAGTCATGAGATTTTCTTTTT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BLAST of Sed0016270 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0016270 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0016270 vs. NCBI nr
Match: XP_022141961.1 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 6.9e-81 Identity = 176/216 (81.48%), Postives = 199/216 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. NCBI nr
Match: XP_004136891.2 (MADS-box protein SVP isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011658821.1 MADS-box protein SVP isoform X1 [Cucumis sativus] >KAE8645819.1 hypothetical protein Csa_017269 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 2.6e-80 Identity = 170/219 (77.63%), Postives = 204/219 (93.15%), Query Frame = 0
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Match: Q9FVC1 (MADS-box protein SVP OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SVP PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 167.9 bits (424), Expect = 1.2e-40 Identity = 108/238 (45.38%), Postives = 157/238 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9XJ66 (MADS-box transcription factor 22 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS22 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 159.1 bits (401), Expect = 5.8e-38 Identity = 105/223 (47.09%), Postives = 156/223 (69.96%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5K4R0 (MADS-box transcription factor 47 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=MADS47 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 153.3 bits (386), Expect = 3.2e-36 Identity = 100/228 (43.86%), Postives = 147/228 (64.47%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O82794 (MADS-box protein AGL24 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AGL24 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 151.4 bits (381), Expect = 1.2e-35 Identity = 100/218 (45.87%), Postives = 150/218 (68.81%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CLA0 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 315.8 bits (808), Expect = 1.4e-82 Identity = 176/215 (81.86%), Postives = 199/215 (92.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CKS2 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012209 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 311.2 bits (796), Expect = 3.4e-81 Identity = 176/216 (81.48%), Postives = 199/216 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C1G2 (MADS-box protein SVP-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103495384 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 305.4 bits (781), Expect = 1.8e-79 Identity = 168/220 (76.36%), Postives = 203/220 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8F3 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470617 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 300.1 bits (767), Expect = 7.7e-78 Identity = 169/218 (77.52%), Postives = 191/218 (87.61%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJY0 (MADS-box protein JOINTLESS-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454957 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 298.5 bits (763), Expect = 2.3e-77 Identity = 168/218 (77.06%), Postives = 190/218 (87.16%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. TAIR 10
Match: AT2G22540.1 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 167.9 bits (424), Expect = 8.8e-42 Identity = 108/238 (45.38%), Postives = 157/238 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. TAIR 10
Match: AT2G22540.2 (K-box region and MADS-box transcription factor family protein ) HSP 1 Score: 156.8 bits (395), Expect = 2.0e-38 Identity = 105/238 (44.12%), Postives = 153/238 (64.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. TAIR 10
Match: AT4G24540.1 (AGAMOUS-like 24 ) HSP 1 Score: 151.4 bits (381), Expect = 8.6e-37 Identity = 100/218 (45.87%), Postives = 150/218 (68.81%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. TAIR 10
Match: AT4G37940.1 (AGAMOUS-like 21 ) HSP 1 Score: 117.1 bits (292), Expect = 1.8e-26 Identity = 71/169 (42.01%), Postives = 109/169 (64.50%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0016270 vs. TAIR 10
Match: AT3G57230.1 (AGAMOUS-like 16 ) HSP 1 Score: 112.8 bits (281), Expect = 3.4e-25 Identity = 80/211 (37.91%), Postives = 122/211 (57.82%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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