Sed0015440 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTAACTTGGATCCTTTCATCAAGGATATCATATTGCAATTCGCCTACCAAGAAGTTGGTCACTTGAGGTATGTTTCTAGTTGACTTTCGCTAACTTAAATTACTTTCGTGTTTGTAACGACAATGGAATGACTATGCTTTATTCTTCTGAAGGTGGGAGAAAAGATAAAACTTATTTAATTATTCAACAAAATTGAAGTTTGAAACTTATATAATTAACCTCTTTTGCTTAACTCGAGAAAAAAATTAATTGAATATATATTTAAATGAAAAGATAATGACGAGACGTCAAGACAAACCAAGTGTTAAATGCATATTATTTTTGAAGATCACTCTCAAGTCTTAGATCAATCATTCGCTCAATGTTTATGTATATGCTTATCTCTCTCCACCTTCTCTTATTTATAGTCTCATATCTTTATCCTATTCTTAATAGAATTGGATATACTTTATCATAACATTAATAGGATTGAATATTATATCAACCAATACTTCTTTCACTCACTGACGGATGTAACCGGGCCAATGACTTCCAAAATTTTGGAATTGGTCATTTTTTGAATGTAAAAGTAGACCCCCACGTATAATTTTATAGTATTTATTACATGCAAATAAATATAGATAAAAACAAATCTTACTTATATGTTGGCCCCTCAAAATCTTAGAATTTGTAATTCTTTAGTATGTATAAGTATATTTTCCAAAATAATTCAAATATAGATTCCTAAATTAGTTTTTCTCGATAGGGACATCAATATTAATTGGAGATGAAATGACTCTGTAATGGATAAAAGCAGAATCTCATATTCTGATACCAAGTTGAATTATATTAAAATACCAATCAATTTAAAAACTTAAATTGATGAATTGAGATAAATTTAATTATATCAACCAACAGTAAAGTTAAACATTCGTATCACTGAGGGCAATTAAAGATACAATGAAAGAGTTTCCAAGGCCATCAATGGACTTAAGTTCAACATCATTTTCCAAAGTGGTGGATAGAGCATTTGGTCAAAGGTTGAGCCCACCTTTTGACTCTTATGCTAATGACTTGAATTTCCTTCCACTACTACACAAAATGGATTAGATGACACTTATGAAAAACAAAATTCAAGAGAAAAAGGTAATTAAAGTGTCATAAAATAAAACAATCGTTTTATGACACTTTATTAGAATCATCTTATAATTATTAATTTAAATAAAATCACCATTACAAAAAAATGTCATAAATTAAAAAGACGCGTTTTATGACACTTTTTGAGAATCATAAATTTATAAAACTAATTTTCAGTCATATTTTAATTTAGAAAATAAGTATTATTTTGATATTTTTAAATGTTATATAAATATTTGTCGAAAGATCCTTTCCCTCGGGATTTTGTTTTTCCCTGTGTAGCCGCTCGAAAACTTTTGCAAATCACACTTGCAATTCATAAATTTTATTTTCAATTTAGCTTGTAACAAACTACCTAAACATGACTTGAACGAAAATGATATATTAAATTTCTTAAAAGGTATTCATCTAAAGAAACCATAAGCTTATAATTAATTTAAGAGTTAAAACTGAAGTTTTTAAAACATGGGGTTCTAAATGAAATTAAAAGAAAATATATGAGCCAACTAAAGAAACATGGGTAAAATTCTTAATTATAAAAGATTGGGGGGTATTTTGCAATTAAGTACAACTTAAGCTCTAGAATTCTTCCCCAATTGTGTCGACAACCCCTCGAGGTATAATTATTTTATTTCCCAAATTTTTTGATGTAAATGCTGGTTAGTTATGGTCTTTAAGATCATTTTTGTAATTTTATCCCTAAGGACCAATTTGCAATTGTTATTTGAATTTGGGTTAATTTTTGTAATTTTAGGCACTTAGAGAATTTTGTGGAAGAAAATAAAAAGAAGAAAGGAATTTTATTTTATTTAATAAGGCATAAAAAGAGAGTTTTTTTTTTTTTAAGGAAAAAGGGAATAAGTGGCTGGAAATTCTATTTAAGTAGACCCATTTTACTCATTTAAAGAAATAATAATAATGGTAAACAGGAAATAGGGAATTAAAAAAAAAAAAAAACTCAAATCCCTTCTTCTTCTTCCTTCATCTTCAACCCTAAGTTCCTTCCTCTCAAGCTGTCACTGTCGCACCGGCTCCACCAGCACCGCTACGCCGCTCCCATCGCGCGCACACACCCCTCCACCGTGAGCAGCAGCTCGTGTGCACCTTCTGTAACGGACCAACTGTAATTTTTATTTTTATTTTTAATTTTAATCATTCATTATTTACCAAGTTATATCTTTTCTCTAGTTTTTCAAATATGGATTTTATGGATAAATTAATGGAAAGGCCCATCTGAGTTGTTTTAAAATATTAATAAAAAGAAAAAAAAAGGATAAAAAAAGAAAAGGCTCCTTTTTCTCTTTCATTTTCATTTTCATTTTCCTTCTTTTTCTTTCTTCTTCTTCTTTTTTCTTCTTCCTCATTCCAACCCTAACCCACACCACCTGCCGCCGCCCATCCCTCCGTCTCGCCGCGCCGCCGACCTCCTTGCTGTCCCGCCCAGAACGCACCGCCGACCAGCCCGACGCCGCTGCAACCCCCTTCCTCCCTCACGTGCAGCCCCACGCGACACCACCTCCTCGACATCTCTGCCGTGCTCAGCCCGTCGCCGACCAACCACTACGCTCCGTCCCGTCACTCGTGCCTCCGACCAGCAGCCCCAACATGTGCATTTTCAACCATGCGTTGTGCTCGTACTGTGGGTATTTGTGGGTAAGTCCTCCTTCCCTGCTGTCGGTTTTGTTTGGTGTTGGTTGGTCAAACTATGGCCTGATTTATGTGGTTAATTGATTTGTGTTTGGGTTGGTTGTTGTTGTGAAGTTTTGATAACTTGTATCGTGGGTTCAACGCTCGATTTGATTCGTGCCTCGACTACTTTGGACAGCGGTGCTAAGTCGAATTTTGGGTAAGTTTGGGCTGATTTTTGTAGAGTAAAAGGCACTTGATGTAGCCCGTGGGTTGGTTTTAAATTATTGATATTTGTATATGTTGAGATTAATTTTTTTGCTATATTTTCTGGGTCGTTTCAATTTATTTGGTCGTTCTGTTGGCTGCTTCTCAGGGATAAAAAATTCCCTTGTTTGTCCTGTATTATTGTTAACAGGTATGTGTGCTTTCAGTTCCATGAGTGTTGTTCTAATTTTCTATGACTTGGGTAAGTATTGTTTTTCCGTTGTTGTTTTATTGTGGATTAATCGTTTTGGTTTGGTTTATTAATCATTGAGTTTTGTTTGGGTGTTTTGTGAAACCTTGTTCTTGTTGGATGTTAAGACGTGTCTTGTAGGTTCAGGTTGATTCCTATGTTTTGACAGTGTTGGACAACCGTGTTTGGGTAAGTTCCCTCAAGTTCCATAGAACATATTTGACCTATGTCTGAAATAATTTTTCAAGGGGACGCAGACGCTACATTTGTTTTTGTAATTTCTAGATTTGCACTCTTCTATTTTTATTTAATTATCATAATTTGTTGTATTATTTTTTGTCCACAAAATTGATATAGATTGAAGTCCACACATTGTAAGGTTAGTACAAAATATACTGATTTCACCATTTGAGAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCATGAGGTTAATAAAAGGCAACTCTATGAGGGGCTTGAGGATCTAGGGTTTGGAATTAAGAGATTTTAAGAGAGAAAAAAAAGTTATAGCTCCATCATTTTCTTTTTTCTCAATTTCATTCTTCTTCCTTTGATCGTATTCTTTTATCTTGGTATTTGTCAGATAAATTAGATGTTAGTCTCATGAAAGATGTTTAAATTTGTGTGCTAAATTTCATTACTTCTTTCATTAAGTTGTATGATGAATAATGATATTTAATTGGAGCTTATGATTGATTCTTTAGAATGCCAAAGTTGTATTTTATATTTCCATTAAGGTTGTTCTAAGACCTCCAAAGAGAAGAAAGGTCACAAGAAAGAAAAGGTTGTTCTTAGCTGACTACTTATTATTGAATTCGGTTAAACTTCTTTATAATACTAGAAATTTCCTTCATTGAAGCCTTATTGGTTTACTTTGTGTACACTATTGATTCTTCATTTTTTTTCTTTTCTTTCTTTAGAGTTGAATAACTGGTTATTTGGTTTATCAATAGGTTTGTCATCCTAAATATATGGTGTCTTTCCAAGGAGTTTCTTGAACCAGAATTTTGGACATTCCGTTCTTGGATTAGGAAATGATTTCATGTTGCAGGTTTTCTACTACACTTTTCCTTTCCTTGATATAATAATGTAGTTTCTATAAGCTTTTAATTCTTTATGTCTCACAAGTTAGGACAATATGAATTTATGGTCGGTAGTTAATTTATGTTTCAGTCTCATTAGCACAACCAAAGTATATTTTATTCTCCCATCCTTACTATCATTATTTGTTTAGGATGTAATACTCAAGTCAGTGTAAGATTTTTTTTTTTGAAAATAAATTTATGCTGACTAGCTAGTAATTTTCTCAATGCTTTGAGACAAATTTTAAGCTTTCTCATTTGGATTCCAATTATCACAAATGTTTGTTTGTTTTTTTTTTGAAAAAAAAATCCATGTAGACACGAACAGTGTTTTAAAAGGCGCGCCTGGGCACAAGTCGCACCTTTAACGCCTCGCTTGGGAAAAGCGACGCGCGGTTGATTAGGCGCGCGCCTTCCCCGTCCTAGTCATTCGAAGCGCGACATAACTGATTCAAGACATTTGAATGCCTTAAATAACTTAATTTTTTAACGCACAAAGACAACATTTGCTTAAAATGAAAGGTTAATAGTTGAATCTTATGTATGTTTTATATAGATTCTTTGTTAAACTTCATTTCTATTCATGAATGAAGGTTAATAGTTAAATGTAATGTATGTTTTATATATGATTCTTGGTTAAAACTTCATTTATCTCTATGGAAATGTTTTTATTGTGTATACACACACACATA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Homology
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Match: KAG6575138.1 (hypothetical protein SDJN03_25777, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 5.0e-40 Identity = 107/222 (48.20%), Postives = 120/222 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. NCBI nr
Match: XP_022959141.1 (desiccation-related protein PCC13-62-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 5.0e-40 Identity = 107/222 (48.20%), Postives = 120/222 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. NCBI nr
Match: KAG7013694.1 (hypothetical protein SDJN02_23861 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 5.0e-40 Identity = 107/222 (48.20%), Postives = 120/222 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. NCBI nr
Match: KAG6575126.1 (hypothetical protein SDJN03_25765, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 173.7 bits (439), Expect = 1.1e-39 Identity = 106/219 (48.40%), Postives = 119/219 (54.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P22242 (Desiccation-related protein PCC13-62 OS=Craterostigma plantagineum OX=4153 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 109.8 bits (273), Expect = 2.6e-23 Identity = 70/182 (38.46%), Postives = 84/182 (46.15%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1L2P1 (desiccation-related protein PCC13-62-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499294 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 177.2 bits (448), Expect = 4.9e-41 Identity = 108/222 (48.65%), Postives = 120/222 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H409 (desiccation-related protein PCC13-62-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460222 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 174.9 bits (442), Expect = 2.4e-40 Identity = 107/222 (48.20%), Postives = 120/222 (54.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A498HQX3 (Uncharacterized protein OS=Malus domestica OX=3750 GN=DVH24_025338 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 170.2 bits (430), Expect = 6.0e-39 Identity = 92/171 (53.80%), Postives = 110/171 (64.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DMF6 (desiccation-related protein PCC13-62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022379 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 6.6e-38 Identity = 102/218 (46.79%), Postives = 117/218 (53.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BXK9 (Desiccation-related protein PCC13-62-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold46G00500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 163.7 bits (413), Expect = 5.6e-37 Identity = 100/219 (45.66%), Postives = 115/219 (52.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. TAIR 10
Match: AT1G47980.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: 4 anthesis, F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT3G62730.1); Has 169 Blast hits to 169 proteins in 41 species: Archae - 0; Bacteria - 68; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 101; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 147.1 bits (370), Expect = 1.0e-35 Identity = 96/218 (44.04%), Postives = 107/218 (49.08%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015440 vs. TAIR 10
Match: AT3G62730.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: LP.04 four leaves visible, 4 anthesis, LP.02 two leaves visible, petal differentiation and expansion stage; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT1G47980.1); Has 172 Blast hits to 172 proteins in 41 species: Archae - 0; Bacteria - 73; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 99; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 7.5e-26 Identity = 63/122 (51.64%), Postives = 81/122 (66.39%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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