
Sed0015171 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCACATTTCCATATATAGAAGGAGACACCATCACCAACGAAAACCCAATGGCTATGGCTCTTCGAAGATTTGCCTTTGGCATCAAGAAACCCAATGTTCTTTTTGTCAATGGCCAATTTCTCCATCACAAGGTTTATTTTTATTTTTATTTATCTAGTTATATTTATTTAAAAAGTATATTATGAAAGTTGATAGATTCGAACAATGATATATTTGTTAACTAATAATATGTGTGTTTTTAGTTTATTCATTTAGATGTCGAAATCTTTTTATTCATGTTTTATGGTTTCAGTCTTCTGTGTGCCAGGCTACCATGGAGCAAACGGAAAGGCCTCTAGCTCCCGTAAGCATTCTATTTCTCTAATTTTCAAATTTATTAATTTTTTTGCCATTCAATATACCAATTGAATCTATCACCTTATGCACCCAAATTCTACTTTGACCACTTGAGCGATTTCAGGATGATCGTGAATTTATAACTAACAAAAAAACCATTAAAATGACATTTGAGTTTTTCTATACTTTTTGATTTGATTTATCTTCATCACCAAACTTTTAGGGCATGTTTGGGGTGAGTATTAAGTTAATCCGGATTAACTTAATCCTCCCAATTCGTGTTTGGTGGACGGATTAAGTTAATCCCTCAGATTAACTTAATCCTTCACGAAATCCAACAATAATCCTCATATATTCTTTCTCTGTCTCGTTTTCCGAAATCATCTTTAATTCTATTTTTCAAACAATTTATTCAACTTTAAAATTTAGATTTAAAAGTTTATTCAAATTATTTTTTATGTTTAATTTTTTTAGAATAAAATTATTTTTTTTATATTTTGTAGTTTATTTAATATATAATTGTATATTCTAAATTTAATGTTAAATGTTAAATAATTAAAGAAATAAATAATTCAAAAGAACAAAGACAACTATATTTGAATTTCAAAAGATAATTATTTGAATGTAACAAAATTTTATTATTAAGATATAGTATGAATCTATTTAAATTTGGAAGGAATAGATATTAACAATATAATTAACAAATAATTTGAAATAATAGATATTAACAATTGACTCTTTTTATTGGAGAAAACTAAGTTAACCAATCTTCAATTTATTTTGGAGAAAACTTTCGTAATCGTAAAATATAAAATGCATTTTTTTACATTTGTAAAATATAAATGCATACATCTAATAGAATGTCAAGAAATTTGTTTTGCTTTTTTTTTATGGTATTTAAAAATGGTTCGAACTCCCTTATCCTAGTTATTGTAAAAATAAATTTAAAACTATATTCATTTTAAAAGGTATTAATGAGTTTTATTAAATAAAAAATCAAATAAAACATGTTACATGTAAATTTTCATAAATAATTTGAATCCATTTGGATACTTTAGTTTAATTAATTGAAAAAACAACATTAAATATTTTAATTGACTATTTTAAAATTATGTTCAATTGAAATCAATGGTTGGTACATAAAATATCACAAAAATTGCTAAATTTTACTACTTAGAATGTAATTTGATTTATTATTATACACATAAGAAATTTTACTTGTGTTATTTGTTGACTTTTTTCTAAACATCTAAATAGGTTTTTATGTTTCTCAAAAGAAAGAAAAAACCTTTTTATTATATATACCCATATATGAATGTAATTTTGTTATTTCTATATTAACTACAACTTTAATTTGAATGAGTATTAGGTAAAATAATTTAAAAATACATGAAAATTAGGTTTACACTTTTATTATAACTTTCATCAACGTATTTGAAGTTAGAACTACTTTTAAATATGAGTAAAATTGAATTTCAACTTAAGGTGTACTAAATAAATTAAATTTTTTTAAAAAAAAATTAAATTTATACCAACCTTATAATTAAGCAATTAAATTAAAATGATTTTTACATAATTTAATGTCTTTCTAAAAAATTTTAATGAATATAAAATTTGTTATATATATTTTTAATTTAATATAGATATTAAGTTAAAATTGAAATAAATAATAAACATATTTTTTTGAATGAATATTATATTGTTACTATTTCTAAATAATGTCATTTTGTCATTTATTTATTATCAAGAGAAAACAATTTTTTAAAAATGTTAAATAAAAATTCAGTTTAACTTAATCTTTGCACCAAACAACAGTCAGCTTAACATAACATGTGCACCAAACACAGATTAACTTAATCCTCAGCTTAACTTAATACCGACTAACTTAATCATAATCCCTGCACCAAACACGCCCTTAAATATCTAATTTTAGTTCATGTATTAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAAAGTCTTTTAAGTAAATATTGTTAGTTTTTCATTTAAAAAAATGTACTATCTTACTCTATCAATTTTAAAACTATTTTCACATTTTATCATTCTTGTATTATAATTATTAATACTGTTAACAAATTTGAATAGTCTTAACTTTAAATTTAATTAACTTAGGGACTAATTTTAATTTATTTTTTAAGAAAACATTTTTGGTCTAAAATTGAATATCTAAAACTTCAAGAACCAAAATAAAATAAACCTCAAAATATATGGATCAAAATTATAGTAGCTTGATAAAAACATGATATATATATATATATATATATATATATAATCGAGCAAAATTCCAATTTCCTTTTCCAAAAAAATTCAAAATTATTTAATTTAATAAAACCATTAAAAAATTAATTATTAATTTAATATGTGACCTTTAATTTTACAAGAATGAGAGGTAAGAGAATTCAATTACATGGCTTCTGGTTGATTGTCTATGATAGTAAGTGACAACAATTTAAGCATGAATTTGTATAAATGTTTAGTTTAGTTTAATAACATTTAAGAGTTAGAAGATGACTTCTTAATTTAAGTTCATTTTTCGTGTCAGTTGAATTACATTTTTGTTAGTGTATAAATATCATTTTAAACTATATATTAATATTAGTTTGTTCAATTAAAAATGAAAACCGGACTAAAATGAGCATAACCTTGATCGAGAAGTAGAAGTTAGAAACTCTTATCTAGGGGTGCAACAAAAAACCGAAAAACCGAACCGAACCAATGGATCGGATCGGTTTTTTACCTCAAAATTGGATATATCGGTTTGTAATTTGAAAAAACCGAAAATATTGGATCGGTTCCGGTTTTCATTTTAAAAAACCGATCCAAACCGATATATATATATAGTCAATAATTCATATAGAGTAATCTTCTTTCCATTAATATTTCTTTAATTCACCCCTATTTCAAGTAAAAAATATCCTTAAATAAGTTAAAAATACTTCTAACCTTTAAAAAAATAGTTGTTTACGAGAATGTTGTTTTTATATGAGAAATATTATTTTTGATATATTAAAAAAAATTGGACATTGGATCGGATCGGATCCATTTTTGGACATTGAAAAACCGAACCAATGGTTCTATACTTTATTGGACATTGGATCGGATCCATTTTTTGAAAACCGAAGATATTGGTTCGGTTGTCGGTTTGGTACAAAACCGACAAAAACCGAACCGAAATCACCCCTACTCTTATCCGCCAATTAAATTCAAGTTTAACATGAGCGTAATCTTGATCGACAACAAAAAAAATTGTACTACTAAAATATTTTTTAAAAATTTATTTCATTTATATTAATAAATTCATTGTCTTTCATAAATATTTTAATTGATTAAAATATTTTTTAAATTTAATCTAATAGTCAAATGGTTTTTTTGTTTTTTAAATGATGGTTTTTTAAAATTTTAATTGCTCTTCCAAAAGGGTAAAATATGATTGTGGTTCTCTTTGAGATTTGTTGAATTTTTATGAGTGAACTTTTTGGAACTTTCACATGTATTCCATTTTAGCTTTTTAAAAAATGGTCTTTAGAATTTTATTTTTTTTTAATTAAATTACTTTTACCATAAATTTTAGAAATATGTTCACATTTTGTATTTGATTTTATTTATTAACATTATAAAACCAATTTTAGTTAATATTAACTTCAAATGACTTAAAATGACCATTAACTTAAAATGACCATTTCAAATGACTTAAATTACTTTTACCATAAATTTTATAAAACCAATTTTAGTTAATATTATTGATATTTAATTGTATTCGTAAAAGACAAATTTTACCTTTATATTTCGTAAAAGAATAACTATTTTTAAGTAAAGAATAATTTTTAAAGTTATTTTTAAAGGTTAATCGCACTCTTAAATAGAAGTGTAACATTTTTTATCCAAAATTTATGTCTACTAATTGTCAATTGATTCAATTTTCTCCAACATGAACAGTTGCTAGTGGCACTAATGCACCCAATGATCAAAGGTCTTGTGTTCAAGTCTCCCAACTCTAAAGTTGTAATCTAAAAAAAAAAATAGTTTTCAAGTTATAAATAATTAACTCAATTATTTAAATAAATTCAAGTTAAAAATCGATCCAACAAAATGAATTCTTTGAACTTTGAATATTTGAACAAATCTCTATCTCAAAAAAATTCATTTATATTTCAAAATTCATCTTAACAACAGTTTAGGCTCGAACTATTTTTTAAAAGTTTTTTCTTTTGAAATTCTTTATAGAGAATTAGAGTCAAATAAGCATAAATTTCCAAAACGAAAAATAAAAAATCAAATAATTATCAAAGTGGAACTTAGTTTTTTTTTAATGTCTTTAAAAAATTATGAACGATGGGTATGATTATATATTCTGAATTTTGGAACTTGTTTGGTCACATTTCAAATGTTAATAATATATTTATTTTCATTAGTTTTTACCGAAAAAATGCATATAAATACATATGAATATAGAAAAAGAAGAATTTTTAGAGAATTTACCATCAACAACACATTCTACCTCTTGTATTTTATTTCCAGCAGAATTTTTAAAATAATTCATCTATAACATATTTATTTCTATCACTCACCTAGTGATAGAACTCAATTTAGATTTCTATCACTGATAGAAAACTTAAGCAGTGATAGAATGAGTCTATCATTGATTGA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MAMALRRFAFGIKKPNVLFVNGQFLHHKSSVCQATMEQTERPLAPWVEQMNTPMKDLAPEVYDIIELEKAHQWKGLELIPSKNFCSAAVMEAVGSIMGNTITEGYPGARYYGGTQNVDAAENLCKKYALEAFRLDPAKWGVNVQPLSGSVANMETYTALLKPHDRIMSLDLPHGGHLSHGYQTETKRITTSSTFYEVMPYRLNESTGCIDYDQLESSASLFRPKLIVAGASAYSRLYDYARIRKICDKQKAILLADMAHIAGLVAADIIPSPFEYADIVTTTTKKTLRGPRAAMIFFRLGVKEINKKGQEVLYDYGEKINASVFPGLQGAPNNQTITGLIIALKQAKSPEFKAYQKQVLGNCSKFAQSLMEKGYELVSGGTENHLVLVNLKNKGIDGARVERILEWIQIRVNKNTVPGDSSAMVPSGVRMGTPAMTTRGLLEEDFVKVAEFFDEAVNLALKIKAAEPKGANKLKDFVATMQSNEEFQSEVSKLGHKVVEFAKQFPIIGYKKETMKYKE Homology
BLAST of Sed0015171 vs. NCBI nr
Match: KAA0065075.1 (serine hydroxymethyltransferase 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 785.8 bits (2028), Expect = 2.3e-223 Identity = 380/518 (73.36%), Postives = 447/518 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_038885497.1 (serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 785.0 bits (2026), Expect = 3.9e-223 Identity = 382/518 (73.75%), Postives = 446/518 (86.10%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_022951277.1 (serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial [Cucurbita moschata] >XP_022951278.1 serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 783.1 bits (2021), Expect = 1.5e-222 Identity = 382/518 (73.75%), Postives = 447/518 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_008444959.1 (PREDICTED: serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 2.5e-222 Identity = 379/518 (73.17%), Postives = 445/518 (85.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. NCBI nr
Match: XP_023001927.1 (serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial [Cucurbita maxima] >XP_023001928.1 serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 781.2 bits (2016), Expect = 5.6e-222 Identity = 383/518 (73.94%), Postives = 445/518 (85.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94C74 (Serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SHM2 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 7.7e-214 Identity = 363/519 (69.94%), Postives = 441/519 (84.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P34899 (Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial OS=Pisum sativum OX=3888 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 740.0 bits (1909), Expect = 1.9e-212 Identity = 360/518 (69.50%), Postives = 434/518 (83.78%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P50433 (Serine hydroxymethyltransferase, mitochondrial OS=Solanum tuberosum OX=4113 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 733.0 bits (1891), Expect = 2.3e-210 Identity = 358/517 (69.25%), Postives = 433/517 (83.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49357 (Serine hydroxymethyltransferase 1, mitochondrial OS=Flaveria pringlei OX=4226 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 728.4 bits (1879), Expect = 5.7e-209 Identity = 360/517 (69.63%), Postives = 427/517 (82.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P49358 (Serine hydroxymethyltransferase 2, mitochondrial OS=Flaveria pringlei OX=4226 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 728.0 bits (1878), Expect = 7.4e-209 Identity = 364/517 (70.41%), Postives = 426/517 (82.40%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VGP9 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold82G004050 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 785.8 bits (2028), Expect = 1.1e-223 Identity = 380/518 (73.36%), Postives = 447/518 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GHA4 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454162 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 783.1 bits (2021), Expect = 7.2e-223 Identity = 382/518 (73.75%), Postives = 447/518 (86.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BBK2 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488144 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 782.3 bits (2019), Expect = 1.2e-222 Identity = 379/518 (73.17%), Postives = 445/518 (85.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KI05 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495957 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 781.2 bits (2016), Expect = 2.7e-222 Identity = 383/518 (73.94%), Postives = 445/518 (85.91%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BS86 (Serine hydroxymethyltransferase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004911 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 774.6 bits (1999), Expect = 2.5e-220 Identity = 377/515 (73.20%), Postives = 440/515 (85.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. TAIR 10
Match: AT5G26780.1 (serine hydroxymethyltransferase 2 ) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 5.4e-215 Identity = 363/519 (69.94%), Postives = 441/519 (84.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. TAIR 10
Match: AT5G26780.3 (serine hydroxymethyltransferase 2 ) HSP 1 Score: 735.3 bits (1897), Expect = 3.3e-212 Identity = 364/535 (68.04%), Postives = 441/535 (82.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. TAIR 10
Match: AT5G26780.2 (serine hydroxymethyltransferase 2 ) HSP 1 Score: 735.3 bits (1897), Expect = 3.3e-212 Identity = 364/535 (68.04%), Postives = 441/535 (82.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. TAIR 10
Match: AT4G37930.1 (serine transhydroxymethyltransferase 1 ) HSP 1 Score: 726.9 bits (1875), Expect = 1.2e-209 Identity = 355/517 (68.67%), Postives = 433/517 (83.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0015171 vs. TAIR 10
Match: AT4G32520.1 (serine hydroxymethyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 513.8 bits (1322), Expect = 1.6e-145 Identity = 261/454 (57.49%), Postives = 325/454 (71.59%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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