Sed0014706 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGTTCCAATCCCGACCTTTTAAAAAATAAAAAACAAAAACTGTACGTTTAAATTTACCCTACACGGATTAAACGACCCAACCTAACCCTGATATCCCAAGTGCTTTCATAAATTACTCCCGGCGGAACAGAAAAGAAGCGGTCTGTTCTGTCCGTCCCTTGCTTTCCTCTCATTGAATTTTATCCTCCAACCTGCCCAGCATGTCTACACTCGAAATCGAAGCTAGAGAGTACGTTTCCCCCTTTTCGCTGTTTCTTAGCTCTATCTCTTTCTCCTTGGTTATCAAGAAATTTCGATTATAGAAGTAGGGTCGACGACTCACTGTACGTGCTACTTCTGAGCGGCTTGTATTTTATATTCAGTTCTCCCCTTTCAATTTTATTTTTTTGGGTTTTCAAACTTCTTGCAACGTGTTATATTACGCGCTTTCACACTTGTACAGCTGAAATTTTGTAAGTTTTCCATGGTTCGTCATTCATCTTATTTCCAGTTGCTTTCCTTACATAGTTTAGAATAGATATAAAGAGTGGAATAATAACAACGAAGTTTAAATTTGACATTTTTAAAGTGAGACGGCTGTCACTCTATTATTTTACACATACAGGTTTGTCAAATGTTCTTATCGCTGGAAACCATCACGTATTGATTTAGTGGTAAAGTAAGAGCATGGTGAATCGTAAAACTCATAGAAGTTTTGAGTTATTGAACACTAGGTTATTCGACAACTAAATCTAGTAGGATCATACATTTGTTCCTTGAGAATAGTTGAGCATCAAGTTTTGCATAGACACTCACAAATATCATTTTTAAAAAATAAGAAACGAAAATATTTTTATTGATAAAAATGCAAATGTTACCCAGGTTTTGGGCCTAGTTACGAGTAGTCTTTTTAAAAACGACCCAAAAGGTGCGTTAGACTAAAAAAGACTCCATGTTCAATGTTGGCACCTCGCCTTAGATAAAAAAAGTGCTTCAATGCAGCAAACTCATGCGAATCTCCCACACACCGTAAGGCATTCAACAATGTCATCGATACACAAACATCTAAGTGATACCTGCTCGCCAACATCAAGGGATTTAGCTTCACAATATATACTCACACGGTTTTCACTATATACATGAAAAATGTTCGACATCTAACCAATGTTTTAAAAGGCTTAAGGCGTTTTCTCATCTCGAGGCGAGGCGTAAGCCTCGAGGCGGTATGAGGCATAAGCCTCATTTTAGATTGAAAAATACATATTTAAAGCATAAAACATAAACTTTTTTTAAATTCTATAAGTTATAACATAATAATACCCCTTAAAAGTACACAAAAAAATAGAATTTGTGTAAAAATAATAATAAGAAGAAGAAAACAAAAAATACATTGAACAAAAATTTAAAAAAGTACAAAAAAAAACTGGAGAAGACATAATAAATGGGGTGTTCTATTAATTAAAAAACAGAAAAGAAAATGAACTGATTTTAAACATAAATGATTATAAAAAGAATTAAGTGAAAACTAATAGTAATAATAATAATGAGAAAAAAAACAAAGAAGAAAGAATTGAACATCATTGGTAAAATAGAATAACAGAATAATAATAAATGAAGAGAAAATTAAAAAAAAAAATCATAAAGGAAAGACAAAATATGTTGATTTTGTACAAAAAAAAAAAGACAGAAAAAGAAGTGAATAAGAAAAGAAAGGTGGCGTTGTCAAAGACTCAAAGGAAAGAAGACACCTCCATCTCGTTTTGATAGGTGATGGCTTGGGTTTCAATCCACTGATATAAGTGGCAACCTTTTGTTTTTTAGATTAACGAATGGTATTTATCCTTTAAAACAACTTAATTGATACGTTTTTTTGTCAATATTTGGGTCATAAAGTGGCCCACCTTCTTCATTAAGGTAGATACTTTAAATTATTCACACAAAATGTAAAGAACAAAAGGCTTACGCCTTTAAGCCTCAGAGGCATAAGCCTTGAGGCGTACGCCTCTGTTCAAAGAGGTGTAAGCCTCATTTTTCACTATCAAGGCGTAAGCCTCGACCGATTTTTAAAACATTGCATCTAACCGTCATCAAAGTCAAGGAACATCTGCCACTGAAGCTACAACTAAATTGCCAACACTATCCAATATCGATGCCTTAAAAAGATAAATCAATTCGGTCCATGAGAACTGAGTTGGATCCGACGGATTGGTTCGGTTCGTCAAAGACTAAATCAGTTGCGAAAATAGGGCTTCAATTGTCGTCGACAACGTTTTACTCAAACCATCGAAGAAGCTGACCGTCCGACCATCTCTGACGAATGCAAGGTTGAAGGGCCCAACGACGGTAGACGATTATCGACTTGGGTGTTTAAGATTTGGTGAAAGACTGGGTGAAGTTTCCATCTTGTAGAAAACCACTCAAGGTTAACATGTTTGGTAAAAAAGTTTCACTAGAAGTATAGTTGGGAGAGGAAAGATTACTGGATATAGCTCTGGGAGCTTTTCGGTGTTGGCGAAGACGACCAGAAGAGTAAATCTGGTGGATTTGAGGAAGGTAAGAGGCATAATTTTTCATTCCCATTGAGGTTGAAAGACGAAAGAGGAGAAGGGGGTAGCATCTCTTAGTTGGATGAGCTTGCCGATGGTCCTCCTCTTGCTCAAGTGAGGAGCGCCGCTGGAAAGAGAAGGGGAAGGTTTTGGGGTTTTTTTTGGGAGAGATTTTAGAGAGGGAGAGAGAGTTTAGAGAGAGACCGTTTTACTTTCCACTACAATAAGTATTGCTCTTTTTGCTTGCTAACCAATTAACATACATTTTGATTTTATTGTTGCTGCATTTCAGATGATTTATTGTTCAATTTCATATTGATATGGTGCTATCTCTAAATAGTAATTCCCATATTCAATGTCAACCTCGATTATTGATCATCATGTTGGCATATTCTCCCGCTCTCTCTCTCGTTATGTAATGTAGATATGTAGTTAGTTTTTATTTATTTTTTGACAAGAAAACAACATTTGTGAAATGAAAAAAGATCAATTCTCAAATAAAATCTTTAAAAAAGCAAAAAAATTAACAAAAGAAAAATAAAGAAAAGGAAAGCAACAAAAATACAAGAATACAAGAAAAAATGAGAACATAGTCTTAAGAATATAAACAATAAAAAACTAATGAAAGTCAAGAAAGTAGTTTATTTTCAAGATGTGATTAGATATGATGAATTGTCTTTTATCTTCTCAAGAGAAAAAAAAGTTATGGTATGCTTCATTTTTTAGTGTCATCAAGATCGTGCTCCAGTTTTGTAAGGAAAATTCATTACACCAAACATTCCAGACGTTACAGAATGAGTGTCAGGTTTCTTTAAATACAGTAGATAGCATTGAAACTTTTGTTGCTGATATCAACTCTGGACGGTGGGATGCCATATTGCCTCAAGTGTCTCAACTTAAGCTTCCAAGAAATAATTTGGAGGACTTATATGAACAGGTAGAGACAAACTATACAATAATTCGATTTTTCATTTACCTTTTCAAATCAATTTAATATTCTATACTTATGACAAAATGTTACATTTATGAAGACAAAACTTGATTCTCTACCCAATAAGGAGCTTCCCAACCATTTATGCAATATTTTATACTTATGATAAGGTTGTTTCTTGTTTTTAAAAAAAGTTAGAAGGGTAAGTTTATTTATGGTTGAGATAAAATCATCTTTTACACTATTCAACATGTTGTCAAGAAAGATATCTCTTTTGTAAGTTCATTTTTATTTATTGTACTTCAAATGGGATCTTTCTATAAAAACCTCTTGAAAGCTATCTCTTTTGGTTTTTCCCTTTTTTCTTTTAGTTTGTCAGTTGCTTTGTTGGGTAAGACTCAAAAGTTCATTTTCGGAGGGACCATTAGGTGGGAGATAAACGGTAGAAATTCAAGTAGGAAGATTATGTCTTTGTTAGTTTTTTTTTTGAAATGGAAACTTCTCATTCATTAAGAAAATGAAAAAGAGAGAACAAAAGTGGATACAAAAGACAAAACAAAAAAGCAAAAATACAACCAAAGCCAAATAAAAAAAATGGAGCAGAAGAGAACAAACAGAAACAAAAACAAGAACTCAAAACCTTAATGTAGGGATTAAAGAAAAACTTCCCAATTAGAAGACAACTGCTGGAGCACATGATTGCTGGATTCCAAGGAAGAGAAACATAAAAAACATCAGGACACATCAGGACATAGTTGAGTTATGGTCTTCTTGATTGTTATACACTTTGAGTAGTCCCCCAACCCGCTGGTGTTCCATGACAATAACGTCATATCAAGGAGTGCTCGATTGTTTTAAAAAGAAGTCCACTAGATTGCACGATTTCGCCAAGATTGGCTGGCACATCCGCAGGTGAAGATGTAGATTCAACACTATTTATGTTTAGATCTACTAGAAAATATGCCTTAGCTTGAGTGATGGTCTGATCTTCAGTTTCATATAAAAATGAGTCAATTGAACTGGCACTAAAGACTGATTCAGAATCAGTATCATCTTGAGGAGCAGAATGTTCAATAAGAGAATCTGTAACCTTCAAAGGTTCTCTAGTTGGTGCAAGTACAGGAAATGGATAACACCCTTTACTGCTTAGGATGCAAGTAGGCTTAAAGGAGAAAGATATTGGTGGAGGATCCTTTTGCTTGTGGAGGTTATTGGTTATAAGGGTGTTGCATTCCTCCAAATGATCTGGATTTAGAGCTAACTTTAAAGAGGCCACAATGTTTCTTTTACGTCTTCGAGTATAGTGAAAGGGTAATGCTTTAATTGGATATTTGTATAAGGAGGGGGAGAGCGGCTCAGGGTGGACTTTAGAAGGGGGAGTAGAAAAAGTTGAAGAAACATGGTTGGATGGGATGACGTGTTTTGATGGGGGATTAATTGATAGGCCCAGAATTACACTAGCAGAGAAGTCAAAAGGTTGTTTAAAAGGCAGAGGCATGGTTCTATGAATGGGCTGGCCAATGTCAAATTGATGATTT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ATGTCTACACTCGAAATCGAAGCTAGAGATGTCATCAAGATCGTGCTCCAGTTTTGTAAGGAAAATTCATTACACCAAACATTCCAGACGTTACAGAATGAGTGTCAGGTTTCTTTAAATACAGTAGATAGCATTGAAACTTTTGTTGCTGATATCAACTCTGGACGGTGGGATGCCATATTGCCTCAAGTGTCTCAACTTAAGCTTCCAAGAAATAATTTGGAGGACTTATATGAACAGATTGTATTAGAAATGATTGAGCTTCGTGAGTTGGATACTGCTCGTGCTATTCTAAGGCAAACCCAAGTGATGGGTGTCATGAAGCAGGAGCAACCGGAAAGATACTTGCGGCTTGAGCATCTCTTAGTCCGAACCTACTTTGATCAAAACGAGGCTTATCAAGATTCATCAAAAGAGAAACGCCGAGCACAAATTGCCCAAGCCATCGCAGCTGAAGTTACTGTGGTTGCACCTTCTCGATTAATGGCTCTAATTGGCCAGGCTCTAAAGTGGCAACAACACCAAGGTTTACTTCCTCCAGGAACGCAATTTGACTTATTTCGTGGAACTGCTGCAATGAAACAGGATGTGGAGGATGTTTATCCAACAACTCTTTCTCACACAATAAAGTTTGGTACAAAAAGTCATGCAGAATGTGCTCGGTTCTCACCAGATGGGCAGTTTCTCGTTTCTTGCTCTGTGGATGGATTTATTGAGGTCTGGGATTATATAAGCGGTAAACTGAAGAAGGATCTTCAGTACCAAGCTGATGAAACTTTTATGATGCATGATGATCCAGTTCTTTGTGTTGATTTTAGTAGAGACTCAGAGATGATTGCTTCTGGTTCACAAGATGGGAAAATCAAAGTATGGCGTATAAGGACTGGCCAATGCTTGCGGCGTCTTGAACGTGCTCATACTCAGGGAGTTACGAGTGTTGTTTTCTCTCGTGATGGAACTCAGTTGTTGAGTACATCTTTTGACACCACAGCAAGAATTCATGGTCTGAAGTCTGGGAAGCTATTGAAGGAATTCCGTGGCCATTCATCATATGTGAATGATGCCGTCTTTACTAATGATGGAGCTCGGGTCATTACTGCATCTAGTGATTGCACAGTCAAGGTATGGGATGTGAAGACAGCCGATTGTCTACATACATTCAAGCCACCGCCTCCATTAAGGGGAGGAGATGCCTCGGTGAACTCAGTTCATATTTCTCCCAAAAATGCAGATCATATTGTTGTTTGTAATAAGACATCGTCAATATACATCATGACATTGCAAGGGCAGGTTGTAAAGAGCTTCTCATCTGGTAAAAGGGAAGGGGGAGACTTTGTTGCAGCTTGTGTATCACCAAAAGGCGAATGGATATACTCCATTGGTGAAGATAGGAATATGTATTGCTTCAGCCACCAATCCGGTAAGCTGGAGCATCTCATGAAGGTTCATGAGAAGGACGTGATAGGTGTGAGCCATCATCCTCATAGAAATCTCGTTGCCACTTATAGTGAAGACAGCACTATGAAACTATGGAAGCCTTGA MSTLEIEARDVIKIVLQFCKENSLHQTFQTLQNECQVSLNTVDSIETFVADINSGRWDAILPQVSQLKLPRNNLEDLYEQIVLEMIELRELDTARAILRQTQVMGVMKQEQPERYLRLEHLLVRTYFDQNEAYQDSSKEKRRAQIAQAIAAEVTVVAPSRLMALIGQALKWQQHQGLLPPGTQFDLFRGTAAMKQDVEDVYPTTLSHTIKFGTKSHAECARFSPDGQFLVSCSVDGFIEVWDYISGKLKKDLQYQADETFMMHDDPVLCVDFSRDSEMIASGSQDGKIKVWRIRTGQCLRRLERAHTQGVTSVVFSRDGTQLLSTSFDTTARIHGLKSGKLLKEFRGHSSYVNDAVFTNDGARVITASSDCTVKVWDVKTADCLHTFKPPPPLRGGDASVNSVHISPKNADHIVVCNKTSSIYIMTLQGQVVKSFSSGKREGGDFVAACVSPKGEWIYSIGEDRNMYCFSHQSGKLEHLMKVHEKDVIGVSHHPHRNLVATYSEDSTMKLWKP Homology
BLAST of Sed0014706 vs. NCBI nr
Match: XP_004138672.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Cucumis sativus] >KGN63274.2 hypothetical protein Csa_022473 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1018.1 bits (2631), Expect = 2.7e-293 Identity = 504/513 (98.25%), Postives = 508/513 (99.03%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. NCBI nr
Match: XP_038886288.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1014.6 bits (2622), Expect = 3.0e-292 Identity = 502/513 (97.86%), Postives = 506/513 (98.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. NCBI nr
Match: XP_008441151.1 (PREDICTED: suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1014.2 bits (2621), Expect = 3.9e-292 Identity = 502/513 (97.86%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. NCBI nr
Match: XP_022152482.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1011.5 bits (2614), Expect = 2.5e-291 Identity = 499/513 (97.27%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. NCBI nr
Match: KAG7033424.1 (Suppressor of mec-8 and unc-52 protein-like 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1011.1 bits (2613), Expect = 3.3e-291 Identity = 500/513 (97.47%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W117 (Suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SMU1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 905.6 bits (2339), Expect = 2.6e-262 Identity = 437/510 (85.69%), Postives = 479/510 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZME8 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=SMU1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 701.4 bits (1809), Expect = 7.4e-201 Identity = 338/512 (66.02%), Postives = 417/512 (81.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TBS9 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=SMU1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 699.9 bits (1805), Expect = 2.1e-200 Identity = 336/512 (65.62%), Postives = 417/512 (81.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q76B40 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Cricetulus griseus OX=10029 GN=SMU1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 699.9 bits (1805), Expect = 2.1e-200 Identity = 336/512 (65.62%), Postives = 417/512 (81.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TAY7 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMU1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 699.9 bits (1805), Expect = 2.1e-200 Identity = 336/512 (65.62%), Postives = 417/512 (81.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3I2 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485374 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1014.2 bits (2621), Expect = 1.9e-292 Identity = 502/513 (97.86%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGD4 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1011.5 bits (2614), Expect = 1.2e-291 Identity = 499/513 (97.27%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HHA4 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463533 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1010.0 bits (2610), Expect = 3.6e-291 Identity = 499/513 (97.27%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JTQ7 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487429 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1009.6 bits (2609), Expect = 4.7e-291 Identity = 499/513 (97.27%), Postives = 507/513 (98.83%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FGH2 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445274 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1005.0 bits (2597), Expect = 1.1e-289 Identity = 498/513 (97.08%), Postives = 505/513 (98.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. TAIR 10
Match: AT1G73720.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 905.6 bits (2339), Expect = 1.8e-263 Identity = 437/510 (85.69%), Postives = 479/510 (93.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 123.6 bits (309), Expect = 4.5e-28 Identity = 85/305 (27.87%), Postives = 144/305 (47.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 120.2 bits (300), Expect = 5.0e-27 Identity = 86/296 (29.05%), Postives = 140/296 (47.30%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. TAIR 10
Match: AT1G62020.1 (Coatomer, alpha subunit ) HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 8.5e-19 Identity = 81/305 (26.56%), Postives = 132/305 (43.28%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0014706 vs. TAIR 10
Match: AT5G08390.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 1.9e-18 Identity = 63/255 (24.71%), Postives = 100/255 (39.22%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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