Sed0014671 (gene) Chayote v1

Overview


Name	Sed0014671
Type	gene
Organism	Sechium edule (Chayote v1)
Description	Nuclear pore complex protein NUP98A-like
Location	LG05: 4676859 .. 4682065 (-)
RNA-Seq Expression	Sed0014671
Synteny	Sed0014671

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGTTAATCCTCTCGACCGTAAGTATTTACTTTCTTTTACATTTAATGGATTGATGATTGTTTTCACATTAGTTTGTTATCTTACTTGCACTATGTTTACTAAGCTGCTGATCTTTAAACAATGTTTAATCCCATGTTTCACTAAGCGGTTGAGGCGTATTGCTCGAGGCGAGACGGCAATATAAAGCCTCAGAGGATTACGCCTTGATGGTACAAAATGAGGCTTATGCCTCAGAGGTGCAAAGGCTTTCGTCCTTTGTTACTATATGGTCTACGGTCTTCATGGATTCTTCACATTAGTTTTGAATATATATAACTCACTGTTGTGAGCCCAAAGAATGATGAAAAAGTTATCTATTTGGTTGACCTAATAAATAAAAAGCCATCAGTTGACCTAAAAGACAAAAGATCCTAAAAGACAAAAAAATAAAAGATCCCACCTTAATTTAGTTGAAAGACACTGCTTGGAAAAGAAAAAAAACAAAAGAAAAACAGGTGTCTCTCTTCTACAGCCACACAAGGGTTTCATTTTTTGAGTTTTCAAGTTGAACTTTTCAATTTTTCTTTTCTTTCTTTTTTTCTTATTATTATTATTATTATTATTAGATTCGGTGTTAGTATTAGGAAATTTCTCCTTTTTTTTTTTTTTATTATTTCTGTTTCTATTCTAGTTTTTAATGTTATTTTTTAGTTACTTTTTATGATATGTTTTTTTTTCCTTTTTTCTTCCTATTAACTTTTTTAAACTCTTGATGTTTTATCATTCATATATGTTTTTTTTAAAACGAGGCTTAAGCTTCATACAGCTTCGGCCTTAAGCCTTTTAAAACATTGGTTTAATCTCATCTTTATATTTCCTTAAGTTCAAAAAGTGATGGGACTATGATGTTGCTTCCCAATTATGTGATAAGGTTGGGCCTAGGGCTCTATTTAGCTATTACTTGGAGAATAAGTTAGTATCTTGTTATAAATAGAGTGGGTTAGGTTAGGGTTTAGGCATTCAATTATTGAATGAGTTATTGAGTAATTTATTGTAGGGCTCAAGAGAATCTCTTGAGAGGGGAGGTTCCAAGACCTATCAAAACTTGGCTTATCTTGTATTATTTTATTTTATCTAGATTATATAAAAAAATAAAAGAATACAAGATAAGCCAAGTTTTGATAGGTCTTGGAACCTCCCCTCTCAAGAGAATCTCTTGAGCCCTACAATAAATTACTCAATAACTCATTTAACAATTGGATACCTAAACCCTAATCTAACCCACTCTATTTATAACCAAATTCCTAACTTACTCTCCAAGTTATTGCTCAACCAAGGCCTAGGCCCAACCTTATCATTATGTTGCACTTTTACAGTCTTACTTATTTAGACTATAGTCTTATTTTATAGGATTTTGTTTTATTTCTTTTGTCGACCTGTTGTTTCTCAGTTTTCTATTCGTGTGTGTTTGGGTATATTTACAGCTAAATTGTCATAGGCTTCACGTTTCTTTTCAAGCTTTAAGTTTATTTGAATTTGCAACTGTATACGTACTCAAGACCTAACTTATGAAAATCATTTGAACACATTGAAAATGTCAACTAATCAAACTCCCCATATCTTGTCTTTAACTTCCTTTATTTTTCAACTTTGTTTGACCTGATTGAAATTCGAAGTTGTATTTATTGAACTCATTTTGTCAATTTACTTGGCCTTCTTACAGATTTTGAGCAACAGTCTTGTAGCCATTCTTGTAGCCCTTTTGTATCTCTACCAGTTATTAGTCAAACTGCCAATGCTAATAATCATTTTGCACTTAAGCCCTTTGGCAATAATACATCCCCATTCGGCTCACAGACAGGAAATTTGGTGTTTGGTGGGGGTAAATCAATGGGTGTGTTTGGGGAAGCCCAGTCCTCTGCCCCCTTTCCTTCCACCACAACATTCTGTGATTTGTCATCACCGATGTTTGGATCTACTCTGTCCACTTTTGGGTCAACGCCAACTCCTGCCTTTGGTAGTTCATCATCTTCATCATTTGGAGGTACATTTATAAGTTATTATCCTTTGTTCTTTGTCCTCTTATCATCAGTTCTTCATTGACCCTATAAGAGCTTCAGCAATGCTAGTGCTTTTGCATGGATTAAATCAAATATGTGGTATTGTACATGCATTTTGTTTGGTTCTTCAACTATGATAAATATTCATCGTGTTCTTAAACAGTCTTTCTTTATTTTATTTTGAGTTGACCACTCATTCTGTGAACATTAGAGAGCTCATGCCAGTTTGTGAACAAATTTCTTCCATGGGCTGGTTACTTCATTCATGAAGGACTAAATAATAGAAATAACATGAAAGTCAAGTAACTTGCGAGTTTAGAAAAACATGGTCAAGTAACTTGAGCATCAATGGATTTTCAAAATTTTCCTAGTGGGAATATTAAATGTGTTAATTATAATGGTTTTTTTCCCTTCTACTTTTATGCATGTTTTTTATTATTGGGCGAAGGTTTTGTTTGATGACACATGGTTTCTTTTTTATTAGCAATTGTTTATCGCTTATATTTTATTATTCTGTGGGTTTATTTGATTTTCTCTCTTTTCTGGCAGGTTCTTCCATTTTTGGGCAGAACTCTAATGGAGGCTTTGGATATATTCCTACTCAAACAAATCCACTTGGAAGCACTAACCAACAATCTCAGCCAGCATTGGAAAGCAATGTCTTTTCATCACCTTTTGATTCCTCTAGTTACTCTGCATTGGGAGCTTCTAGCACTCCTTCCTTCAGCACCGCAAGCAGTACCCCAACATTTGCCGCCACAAACACCTCGACATTTGGTGCCACAAGCACCCCTGCTTTTGGCACCACGAGTAACCCAGTCATTGGCACGACAAGCACCCTAGCCTTTGGCACTACAAGCACTCCTGCCTTTGGTTCTTCAAGCACTCATGCATTTGGTAGTATTGGGAATGCATTAAGCACTCCTAGTTTTGGGGGTTGTTGTTGTTGCACTCCATCTTTTTGCCGACCAACTTCTGCATTTCGTAGCAGCACTTTTGGCAGTAGAGTAGCTCTATATGCATCAACAACTGAGCCAAATGATGTGCTTGGAAGGTCACCAAGTGGAGAGTTCCAGTCTATATCAGCCATGCCTGATTACAAATACAAGAGTCACGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCTATCGGGAGACAAAGGTACCTTTTTTTTGTATTTTAAAGAAAGTACATAGTTTGGTACCTTATATGATAAGTTCTGAATTATTGTGTTTGTTCTGCAGGTGGACGTCTTCCTGCTGGTCAGTCTACTGCTCAGCCTAACCTTCAAGGTTCTTCAACATTTAGTCAATCAAATTCGAGTCCTTTTTCTACAGCCGAATCAACCAACCCGCCTGCTAACAAACCTTCTAGTTTTGGTTTCTTTGGACTTAATCCTTCATCATTTGCTCCTTCCATTCCATCACACCACTTTGCAACAATGCCTGTCATTTCACGAAACCCCTTTGGATCGACGACAGCAGCATCGACATCATCTTTTCCTCCCATTTCATCAAACCACTTTGCAACAATGCCTGCCATTTCACGAAACCCCTCTGCATCAACGACGGCAGCAGCAACATCATCTTTTTCTTCCATTTCATTAAACCACTTTGCAACGACTCCTGCCGTTTCATCAAACCGCTTTGCATCGACAACATCAGCACCAACATTCTCTTTTCCTTCCCTTCCCAAACCAGAACCTCCTGTAAGTAGCCTTTTGTTGCCAAAATTACTGTGCATTTTTTAGCGAGACAATTAAGTGTATGATAATTTATATTTGGCAGTTAACTTGTTATTACTTTGGTAGGTGAGTTGTAAAATTCACACTTCATGAGTTTTGGGCACAGATATAAAATTGTTTTTTTCTAATTCTTTTCTTCTTTAAGATTAGTGAATTATGTAATGATTATTGTTTTTTATCAATAATTAACAGTTTCAATTTCATGCAACACTAGTAACTTGAAAGTTATTGGTTATTTTGTAGTATTTTATACTAACGGGTTTATAATCTTCTCGATACTGTAGGTCCCTTTCTCTATACCTAGCAACCATGGTCTGATTCAACCAAGTAAGCTCATTTTGTAAAAGTTGACCAATCATTTCATTGAACATTGTAATCTTTTGTATCAATGTACCTTCATAATTTGCACCCCTAGATGGTTCCTACTAGTTTTGCAGAAACTTCAAGCATTTTTGCTTCCTTGGTTATGAATATATGTGTTTCTTTTGAATTAAATACAGGTAGACATTCTACCAATACATCTTTTGATGGTCAGCTTGGTCGCATTGCATCGACAACTAAACCGTATGATGGAAGTGCACAAACTGTTTATGGTGGTCAGCATGGTGGCAGTAGAGTAGTTCGATATTCATCGACAACTCAGCCAAATGATGGAAGTTCAGTATTTACAAATTTGGTGTTGATGTCTATATCAGCCATGCCTAATTATGAAGATAAAAGTCACGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCAATCCGGCGGCAAAGGTAACCCTTTTTCTCAAAAAAGTACAAAGTTTAGGCCTTTTTTATTCAACAACATTTGGGGAAACAGGGATTCGAACCTTTATAACTCATGATTACTAAGGACCCGTTTGATACTCCTTTAATTTTTTGTTTTTTCGTTCTTGAAATTTAAGCTTATTTTCACTTTAATTCTCTACCAATATTTCATCTTCCCTTGAGAAAAAGTATGTGAATTCTAGCTAAATTTCAAAAGCCAAAGCAAGTTTATTAGAACTTACCTTCGTTAGTCTCCTAAGTTTTGGTATGATTTTAACCATTATGGTCCAGTGGTCAAAAGGGTCTTGGGAAACTAAGAAGTAAAGGGTTCAATCTATTGGGTCTGAAGGTCTTTACCTATGAATTAATTTCCTACTTATTTTTTTTACTTTCAAATGTTGTTGAGGTGCATACAAGCTGACCCGAACAGTCATGGATATCAAAAAAGAAAAACATAAGAGGTAGATATCTAAGTAAGAAAACTGTTAGAGTTTTGAATTATTATTGTGTTTGTTTTGTTGTGCAGGTGGACGTGTTTCGATTGGTGGTCAGTCGAATGGTGGTATTGTCTTTGGTGTTGGTACTGCACAGCCTAACCTTCAAGGTTCTTCAACATTTGGTCAATCAAGTTCAAATCCATCTTCTATAG

mRNA sequence

ATGGTTAATCCTCTCGACCATTTTGAGCAACAGTCTTGTAGCCATTCTTGTAGCCCTTTTGTATCTCTACCAGTTATTAGTCAAACTGCCAATGCTAATAATCATTTTGCACTTAAGCCCTTTGGCAATAATACATCCCCATTCGGCTCACAGACAGGAAATTTGGTGTTTGGTGGGGGTAAATCAATGGGTGTGTTTGGGGAAGCCCAGTCCTCTGCCCCCTTTCCTTCCACCACAACATTCTGTGATTTGTCATCACCGATGTTTGGATCTACTCTGTCCACTTTTGGGTCAACGCCAACTCCTGCCTTTGGTAGTTCATCATCTTCATCATTTGGAGGTTCTTCCATTTTTGGGCAGAACTCTAATGGAGGCTTTGGATATATTCCTACTCAAACAAATCCACTTGGAAGCACTAACCAACAATCTCAGCCAGCATTGGAAAGCAATGTCTTTTCATCACCTTTTGATTCCTCTAGTTACTCTGCATTGGGAGCTTCTAGCACTCCTTCCTTCAGCACCGCAAGCAGTACCCCAACATTTGCCGCCACAAACACCTCGACATTTGGTGCCACAAGCACCCCTGCTTTTGGCACCACGAGTAACCCAGTCATTGGCACGACAAGCACCCTAGCCTTTGGCACTACAAGCACTCCTGCCTTTGGTTCTTCAAGCACTCATGCATTTGGTAGTATTGGGAATGCATTAAGCACTCCTAGTTTTGGGGGTTGTTGTTGTTGCACTCCATCTTTTTGCCGACCAACTTCTGCATTTCGTAGCAGCACTTTTGGCAGTAGAGTAGCTCTATATGCATCAACAACTGAGCCAAATGATGTGCTTGGAAGGTCACCAAGTGGAGAGTTCCAGTCTATATCAGCCATGCCTGATTACAAATACAAGAGTCACGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCTATCGGGAGACAAAGGTGGACGTCTTCCTGCTGGTCAGTCTACTGCTCAGCCTAACCTTCAAGGTTCTTCAACATTTAGTCAATCAAATTCGAGTCCTTTTTCTACAGCCGAATCAACCAACCCGCCTGCTAACAAACCTTCTAGTTTTGGTTTCTTTGGACTTAATCCTTCATCATTTGCTCCTTCCATTCCATCACACCACTTTGCAACAATGCCTGTCATTTCACGAAACCCCTTTGGATCGACGACAGCAGCATCGACATCATCTTTTCCTCCCATTTCATCAAACCACTTTGCAACAATGCCTGCCATTTCACGAAACCCCTCTGCATCAACGACGGCAGCAGCAACATCATCTTTTTCTTCCATTTCATTAAACCACTTTGCAACGACTCCTGCCGTTTCATCAAACCGCTTTGCATCGACAACATCAGCACCAACATTCTCTTTTCCTTCCCTTCCCAAACCAGAACCTCCTGTCCCTTTCTCTATACCTAGCAACCATGGTCTGATTCAACCAAGTAGACATTCTACCAATACATCTTTTGATGGTCAGCTTGGTCGCATTGCATCGACAACTAAACCGTATGATGGAAGTGCACAAACTGTGGACGTGTTTCGATTGGTGGTCAGTCGAATGGTGGTATTGTCTTTGGTGTTGGTACTGCACAGCCTAACCTTCAAGGTTCTTCAACATTTGGTCAATCAAGTTCAAATCCATCTTCTATAG

Coding sequence (CDS)

ATGGTTAATCCTCTCGACCATTTTGAGCAACAGTCTTGTAGCCATTCTTGTAGCCCTTTTGTATCTCTACCAGTTATTAGTCAAACTGCCAATGCTAATAATCATTTTGCACTTAAGCCCTTTGGCAATAATACATCCCCATTCGGCTCACAGACAGGAAATTTGGTGTTTGGTGGGGGTAAATCAATGGGTGTGTTTGGGGAAGCCCAGTCCTCTGCCCCCTTTCCTTCCACCACAACATTCTGTGATTTGTCATCACCGATGTTTGGATCTACTCTGTCCACTTTTGGGTCAACGCCAACTCCTGCCTTTGGTAGTTCATCATCTTCATCATTTGGAGGTTCTTCCATTTTTGGGCAGAACTCTAATGGAGGCTTTGGATATATTCCTACTCAAACAAATCCACTTGGAAGCACTAACCAACAATCTCAGCCAGCATTGGAAAGCAATGTCTTTTCATCACCTTTTGATTCCTCTAGTTACTCTGCATTGGGAGCTTCTAGCACTCCTTCCTTCAGCACCGCAAGCAGTACCCCAACATTTGCCGCCACAAACACCTCGACATTTGGTGCCACAAGCACCCCTGCTTTTGGCACCACGAGTAACCCAGTCATTGGCACGACAAGCACCCTAGCCTTTGGCACTACAAGCACTCCTGCCTTTGGTTCTTCAAGCACTCATGCATTTGGTAGTATTGGGAATGCATTAAGCACTCCTAGTTTTGGGGGTTGTTGTTGTTGCACTCCATCTTTTTGCCGACCAACTTCTGCATTTCGTAGCAGCACTTTTGGCAGTAGAGTAGCTCTATATGCATCAACAACTGAGCCAAATGATGTGCTTGGAAGGTCACCAAGTGGAGAGTTCCAGTCTATATCAGCCATGCCTGATTACAAATACAAGAGTCACGAAGAGTTGAGATGGGAGGATTATCTATCGGGAGACAAAGGTGGACGTCTTCCTGCTGGTCAGTCTACTGCTCAGCCTAACCTTCAAGGTTCTTCAACATTTAGTCAATCAAATTCGAGTCCTTTTTCTACAGCCGAATCAACCAACCCGCCTGCTAACAAACCTTCTAGTTTTGGTTTCTTTGGACTTAATCCTTCATCATTTGCTCCTTCCATTCCATCACACCACTTTGCAACAATGCCTGTCATTTCACGAAACCCCTTTGGATCGACGACAGCAGCATCGACATCATCTTTTCCTCCCATTTCATCAAACCACTTTGCAACAATGCCTGCCATTTCACGAAACCCCTCTGCATCAACGACGGCAGCAGCAACATCATCTTTTTCTTCCATTTCATTAAACCACTTTGCAACGACTCCTGCCGTTTCATCAAACCGCTTTGCATCGACAACATCAGCACCAACATTCTCTTTTCCTTCCCTTCCCAAACCAGAACCTCCTGTCCCTTTCTCTATACCTAGCAACCATGGTCTGATTCAACCAAGTAGACATTCTACCAATACATCTTTTGATGGTCAGCTTGGTCGCATTGCATCGACAACTAAACCGTATGATGGAAGTGCACAAACTGTGGACGTGTTTCGATTGGTGGTCAGTCGAATGGTGGTATTGTCTTTGGTGTTGGTACTGCACAGCCTAACCTTCAAGGTTCTTCAACATTTGGTCAATCAAGTTCAAATCCATCTTCTATAG

Protein sequence

MVNPLDHFEQQSCSHSCSPFVSLPVISQTANANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSAPTFSFPSLPKPEPPVPFSIPSNHGLIQPSRHSTNTSFDGQLGRIASTTKPYDGSAQTVDVFRLVVSRMVVLSLVLVLHSLTFKVLQHLVNQVQIHLL

Homology

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. NCBI nr
Match: XP_038902900.1 (nuclear pore complex protein NUP98A [Benincasa hispida] >XP_038902901.1 nuclear pore complex protein NUP98A [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 359.4 bits (921), Expect = 5.6e-95
Identity = 288/550 (52.36%), Postives = 322/550 (58.55%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPSTTTF   SSP FGSTLSTFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  PTQT
Sbjct: 72  FPSTTTFGGSSSPAFGSTLSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPTQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVFS--SPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAAT 195
           NP GSTNQQSQPA  SNVF   SPF + S SA GA+STP+F T       A+STP F AT
Sbjct: 132 NPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSPSPFGAPSQSAFGATSTPAFGTTSNPAFGAASTPAFGAT 191

Query: 196 NTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTT---------------------STPAFGS 255
           +T  FGA STPAFG TS+P  G+TST AFG+T                     STPAFG+
Sbjct: 192 STPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGA 251

Query: 256 SSTHAFGSIG----NALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTF---------------- 315
           SST AFG+       A STPSF      TP+F + TSAF SSTF                
Sbjct: 252 SSTPAFGASSAPAFGASSTPSFS--FGSTPAFGQSTSAFGSSTFGTSTSPFGAQSSPFGA 311

Query: 316 ---------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKS 375
                                GSRV  YA TTEP+   G +  +G+ +SISAMP YK KS
Sbjct: 312 QSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYAPTTEPDAGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKS 371

Query: 376 HEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ---------STAQPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNP 435
           HEELRWEDY  GDKGG LPAGQ         S+AQPN    STF QS+ +PFSTA STNP
Sbjct: 372 HEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSAGGAGFGVSSAQPNPLAPSTFGQSSPNPFSTATSTNP 431

Query: 436 PANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISS 463
            A KPS FG FG       N S+FAPS            S NPF STTAASTS+F   ++
Sbjct: 432 FAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPS-----------SSSNPFASTTAASTSAFLSSTT 491

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. NCBI nr
Match: XP_023512469.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023512470.1 nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 354.0 bits (907), Expect = 2.4e-93
Identity = 285/569 (50.09%), Postives = 321/569 (56.41%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPFVS PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFVSQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPS TTF   SSP FG+T STFG++ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  PTQT
Sbjct: 72  FPSNTTFGGSSSPAFGATPSTFGASSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPTQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------AS 195
           NP G+TNQQSQPA  SNVF  +SPF + S SA GA+STP+F                 A+
Sbjct: 132 NPFGNTNQQSQPAFGSNVFGSTSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 STPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL 255
           STP F AT+T  FGATSTPAFG TS P  G  ST AFG TSTPAFGS+ST AFGS GNA 
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSTPAFGSTSTPAFGSTGNAF 251

Query: 256 -------------------------STPSFGGCCC----------------------CTP 315
                                    STP+FG                           TP
Sbjct: 252 GSISTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTP 311

Query: 316 SFCRPTSAFRSSTF-------------------------------------GSRVALYAS 375
           +F + TSAF SSTF                                     GSRVA Y  
Sbjct: 312 AFGQSTSAFGSSTFGTNTSPFGAQTSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVAAYTP 371

Query: 376 TTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ-------- 435
           TTEP+   G S  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY SGDKGG LPAGQ        
Sbjct: 372 TTEPDAGSGSSQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQSGDKGGPLPAGQSASSGVGF 431

Query: 436 --STAQPNLQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSI 455
             S AQPN   SSTF+QS+S +PFSTA STNP A K S FG FG       N S+FAPS 
Sbjct: 432 GVSNAQPNPLASSTFNQSSSPNPFSTATSTNPFAPKSSGFGAFGPSTTFSFNSSAFAPS- 491

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. NCBI nr
Match: TYK01639.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 3.4e-92
Identity = 296/645 (45.89%), Postives = 338/645 (52.40%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPSTTTF   SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  P QT
Sbjct: 72  FPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPAQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------AS 195
           NP GSTNQQSQPA  SNVF  SSPF + S SA GA+STP+F                 A+
Sbjct: 132 NPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 STPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL 255
           STP F AT+T  FGATSTPAFG TS P  G  ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA 
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTPAFGSTGNAF 251

Query: 256 ---------------------------------STPSFGGCCC--------------CTP 315
                                            STP+FG                   TP
Sbjct: 252 GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTP 311

Query: 316 SFCRPTSAFRSSTF-------------------------------------GSRVALYAS 375
           +F + TS F SSTF                                     GSRV  YA 
Sbjct: 312 AFGQSTSGFGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYAP 371

Query: 376 TTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTA----- 435
           T EP+   G +  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY  GDKGG LPAGQS +     
Sbjct: 372 TPEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGFG 431

Query: 436 ----QPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPS 495
               QPN   SSTFSQS+ +PFST+  TNP A KPS FG FG       N S+FAPS PS
Sbjct: 432 VSGGQPNPVASSTFSQSSPNPFSTSTQTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTPS 491

Query: 496 HHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAA 500
                      NPF STTAASTS+F   +++ F          T P  S++  +STT+  
Sbjct: 492 -----------NPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQPLASQSAFSSTTSPG 551

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. NCBI nr
Match: XP_008462776.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo] >XP_016902936.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 3.4e-92
Identity = 296/645 (45.89%), Postives = 338/645 (52.40%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPSTTTF   SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  P QT
Sbjct: 72  FPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPAQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------AS 195
           NP GSTNQQSQPA  SNVF  SSPF + S SA GA+STP+F                 A+
Sbjct: 132 NPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 STPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL 255
           STP F AT+T  FGATSTPAFG TS P  G  ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA 
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTPAFGSTGNAF 251

Query: 256 ---------------------------------STPSFGGCCC--------------CTP 315
                                            STP+FG                   TP
Sbjct: 252 GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTP 311

Query: 316 SFCRPTSAFRSSTF-------------------------------------GSRVALYAS 375
           +F + TS F SSTF                                     GSRV  YA 
Sbjct: 312 AFGQSTSGFGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYAP 371

Query: 376 TTEPNDVLGRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTA----- 435
           T EP+   G +  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY  GDKGG LPAGQS +     
Sbjct: 372 TPEPDPGSGSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGFG 431

Query: 436 ----QPNLQGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPS 495
               QPN   SSTFSQS+ +PFST+  TNP A KPS FG FG       N S+FAPS PS
Sbjct: 432 VSGGQPNPVASSTFSQSSPNPFSTSTQTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTPS 491

Query: 496 HHFATMPVISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAA 500
                      NPF STTAASTS+F   +++ F          T P  S++  +STT+  
Sbjct: 492 -----------NPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQPLASQSAFSSTTSPG 551

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. NCBI nr
Match: KAA0043047.1 (nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 3.4e-92
Identity = 295/637 (46.31%), Postives = 337/637 (52.90%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPSTTTF   SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  P QT
Sbjct: 72  FPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPAQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------AS 195
           NP GSTNQQSQPA  SNVF  SSPF + S SA GA+STP+F                 A+
Sbjct: 132 NPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 STPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL 255
           STP F AT+T  FGATSTPAFG TS P  G  ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA 
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTPAFGSTGNAF 251

Query: 256 -------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA 315
                                    STP+FG                   TP+F + TS 
Sbjct: 252 GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTPAFGQSTSG 311

Query: 316 FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVL 375
           F SSTF                                     GSRV  YA T EP+   
Sbjct: 312 FGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYAPTPEPDPGS 371

Query: 376 GRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTA---------QPNL 435
           G +  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY  GDKGG LPAGQS +         QPN 
Sbjct: 372 GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGFGVSGGQPNP 431

Query: 436 QGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPV 495
             SSTFSQS+ +PFST+  TNP A KPS FG FG       N S+FAPS PS        
Sbjct: 432 VASSTFSQSSPNPFSTSTQTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTPS-------- 491

Query: 496 ISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAATSSFSSIS 500
              NPF STTAASTS+F   +++ F          T    S++  +STT+  T+     S
Sbjct: 492 ---NPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQSLASQSAFSSTTSPGTNLTFPSS 551

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4ID16 (Nuclear pore complex protein NUP98B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98B PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 200.3 bits (508), Expect = 5.7e-50
Identity = 217/596 (36.41%), Postives = 294/596 (49.33%), Query Frame = 0


Query: 8   FEQQSCSHSCSPF--VSLPVISQTAN--ANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSM 67
           F Q S S   SPF   +  +  QT N  +NN FA KPFG +T PFG+QTG+ +F GG S 
Sbjct: 10  FGQSSIS---SPFGTQTHSLFGQTNNNASNNPFATKPFGTST-PFGAQTGSSMF-GGTST 69

Query: 68  GVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNSN 127
           GVFG  Q+S+PF +       S   FGS+   FG++ TP+FG SS+S FGG+S FGQ S 
Sbjct: 70  GVFGAPQTSSPFGA-------SPQAFGSSTQAFGASSTPSFG-SSNSPFGGTSTFGQKS- 129

Query: 128 GGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST------- 187
             FG    Q++P GST QQSQPA  ++ F  S+PF +S+  A GASSTP+F         
Sbjct: 130 --FGLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAFGASSTPAFGVSNTSGFG 189

Query: 188 ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSST-------- 247
           A++TP F ATNT+ FG +STP FG +S P  G+T+T AFG +STP FGSSS+        
Sbjct: 190 ATNTPGFGATNTTGFGGSSTPGFGASSTPAFGSTNTPAFGASSTPLFGSSSSPAFGASPA 249

Query: 248 HAFGSIGNAL--------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSAF 307
            AFGS GNA               STP+FG                   +P+F + TSAF
Sbjct: 250 PAFGSSGNAFGNNTFSSGGAFGSSSTPTFGASNTSAFGASSSPSFNFGSSPAFGQSTSAF 309

Query: 308 RSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG------------------------------------R 367
            SS+FGS  +   ST  P    G                                     
Sbjct: 310 GSSSFGSTQSSLGSTPSPFGAQGAQASTSTFGGQSTIGGQQGGSRVIPYAPTTDTASGTE 369

Query: 368 SPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQS---------TAQPNLQGS 427
           S S   QSISAMP +K K+ EELRWEDY  GDKGG+   GQS          +QP++  +
Sbjct: 370 SKSERLQSISAMPAHKGKNMEELRWEDYQRGDKGGQRSTGQSPEGAGFGVTNSQPSIFST 429

Query: 428 S-TFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFA-PSIPSHHFATMPVISRNPFG 487
           S  FSQ+  +P +    T P +N   S  F      SF  P+ PS  F +    + + FG
Sbjct: 430 SPAFSQTPVNPTNPFSQTTPTSNTNFSPSFSQPTTPSFGQPTTPS--FRSTVSNTTSVFG 489

Query: 488 STTAASTSSFPPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRF- 505
           S+++ +T++  P+ S+ F + PA    P  S      S  S +    F + P+ + N   
Sbjct: 490 SSSSLTTNTSQPLGSSIFGSTPAHGSTPGFSIGGFNNSQSSPL----FGSNPSFAQNTTP 549

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RY25 (Nuclear pore complex protein NUP98A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98A PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 9.8e-50
Identity = 213/564 (37.77%), Postives = 277/564 (49.11%), Query Frame = 0


Query: 14  SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQ 73
           S   SPF S  +  QT+N  +NN FA   PFG  ++PF +Q+G+ +F G  S GVFG  Q
Sbjct: 11  SSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFG-TSAPFAAQSGSSIF-GSTSTGVFGAPQ 70

Query: 74  SSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYI 133
           +S+PF ST TF   SSP FG++        TPAFG+S +SS FGGSS FGQ      G+ 
Sbjct: 71  TSSPFASTPTFGASSSPAFGNS--------TPAFGASPASSPFGGSSGFGQKP---LGFS 130

Query: 134 PTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPT 193
             Q+NP G++ QQSQPA  +  F  S+PF +++  A GA STPSF         ASSTP 
Sbjct: 131 TPQSNPFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFGAPSTPSFGATSTPSFGASSTPA 190

Query: 194 FAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFG 253
           F ATNT  FGA+++P+FG T+ P  G + T AFG+T                  +TPAFG
Sbjct: 191 FGATNTPAFGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAFGASNTPAFG 250

Query: 254 SSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT 313
           +S T AFG+ G                     A STP+FGG                  +
Sbjct: 251 ASGTPAFGASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASNTSSFSFGSS 310

Query: 314 PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEP 373
           P+F + TSAF SS F                                GSR   YA T E 
Sbjct: 311 PAFGQSTSAFGSSAFGSTPSPFGGAQASTPTFGGSGFGQSTFGGQQGGSRAVPYAPTVEA 370

Query: 374 NDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ---------STAQ 433
           +   G  P+G+ +SISAMP YK K++EELRWEDY  GDKGG LPAGQ         S +Q
Sbjct: 371 DTGTGTQPAGKLESISAMPAYKEKNYEELRWEDYQRGDKGGPLPAGQSPGNAGFGISPSQ 430

Query: 434 PN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFAT 466
           PN    S  F Q++   ++PFS++ STNP  P     +   FG   S+F     S  F  
Sbjct: 431 PNPFSPSPAFGQTSANPTNPFSSSTSTNPFAPQTPTIASSSFGTATSNFG----SSPFGV 490

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: G0SBQ3 (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) OX=759272 GN=NSP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 56.6 bits (135), Expect = 1.0e-06
Identity = 140/433 (32.33%), Postives = 200/433 (46.19%), Query Frame = 0


Query: 48  FGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLST--FGSTPTPAFG 107
           FGS TG+       S G     QS + F   TT     + +FG+T ST   G+  T  FG
Sbjct: 29  FGSTTGSST--PAFSFGNTSGTQSGSLFGGATT--GQKTSLFGNTSSTTPAGTPATSLFG 88

Query: 108 SSSSSSFGGSSIFGQNSN-GGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSAL 167
            S+SSS  G S+FG  S   G  +  T T+  GS    S PA   ++F S    ++ ++ 
Sbjct: 89  QSTSSS-SGPSLFGNASKPSGNLFGNTSTSAAGS----STPAGTPSLFGS---KTATTSA 148

Query: 168 GASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGA---TSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAF 227
           GASST   +TA S   F +T  +T G+   TST  FG +S     T S   FG+T+TPA 
Sbjct: 149 GASSTTPAATAGSGSLFGSTTATTQGSSTPTSTGLFGGSS-----TASKSLFGSTTTPAT 208

Query: 228 GSSSTHAFGSIGNALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG 287
           G+S +          + P FG     TP+   PT A +++     ++  A+T      L 
Sbjct: 209 GTSGSQ------TTPAKPLFGSFGSTTPAGAPPTDATKTAGLFGNLSKPATTGTSTPTLF 268

Query: 288 RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQ--PNLQGSSTFSQS 347
            S S   Q  S+ P +  K  E        +   G   PA  + A   P L G +T + S
Sbjct: 269 GSTSATTQGQSSTPLFGAKPAE----TSTTTAASGAATPATSAPASTTPTLFGGATLTSS 328

Query: 348 ---NSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAA 407
               S+  STA ++ P A KP     FG   ++ AP   S   AT  + S  P  +TTAA
Sbjct: 329 APAASTSTSTATASTPAATKP----LFGATATTSAPG-SSTTTATPGLFSTTP--ATTAA 388

Query: 408 STSSFPPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRFASTTSA 467
           + SS    +S  F T PA +   +AS+T AATS+  S+  +  A+T A +S    +TT+ 
Sbjct: 389 AGSS--TATSTLFGTKPATTTAAAASSTPAATST-PSLFGSKPASTTAPASGTPTTTTAP 424

Query: 468 PTFSFPSLPKPEP 470
            + S P+     P
Sbjct: 449 ASTSAPATTTAAP 424

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q555D2 (Nuclear pore complex protein DDB_G0274915 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0274915 PE=4 SV=2)

HSP 1 Score: 55.8 bits (133), Expect = 1.7e-06
Identity = 117/382 (30.63%), Postives = 178/382 (46.60%), Query Frame = 0


Query: 41   FGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTP 100
            FG+++S   S   +      +  G+FG    S     +TT  + S+ +FGST +T  +T 
Sbjct: 1479 FGSSSSSTSSSLSSSSTTATQPTGLFGSTAPSTGLFGSTTATNPSTGLFGSTTTT-STTT 1538

Query: 101  TPAFG--SSSSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVFSSPFDS 160
            TP+ G   SSSS+   + +FG +S+         T   GS    +     S+ FS P  S
Sbjct: 1539 TPSTGLFGSSSSTPSSTGLFGSSSSTTSSTTTPSTGLFGSAAPST-----SSPFSIPTSS 1598

Query: 161  SSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIG--TTSTLAFGTT 220
            +  ++    S P F T+S T   +  +++ FGA S  +  T+S+ + G  TTST A   T
Sbjct: 1599 TPATSNPFGSNP-FPTSSPTTVSSTPSSNPFGAPSL-SNSTSSSSLFGAPTTSTAA---T 1658

Query: 221  STPAFGSSSTHAFGSIGNALSTP----SFGG-CCCCTPSFCRPTSAFRSSTFGSRVALYA 280
            +TP+FGSS    FG+  +  STP     FG      +P F  PTSA  S+ FG   A   
Sbjct: 1659 TTPSFGSS---PFGAPSSTSSTPFGASPFGAPTSTSSPPFGAPTSA-SSTPFG---APQI 1718

Query: 281  STTEPNDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTAQPNLQ 340
            ST+   ++ G + S      +A P              ++S   G  + +  S++  +L 
Sbjct: 1719 STSSSTNLFGGASSS-----TAAP-------------SFVSSPFGAPITSSSSSSSSSLP 1778

Query: 341  -GSSTFSQSNSSPF-------STAESTNP---PANKPSSFGFFGLNPSSF-APSIPSHHF 400
             G+ T S S+S+PF       S A +T+P   PA  PS FG    +PS F AP+     F
Sbjct: 1779 FGAPTTSSSSSTPFGASPFGNSMASTTSPFGAPAASPSPFGIQAASPSPFGAPAASPSPF 1824

Query: 401  ATMPVISRNPFGSTTAASTSSF 402
             + P  + NPFG+  A   + F
Sbjct: 1839 GSTPSTAPNPFGNFGAVPANGF 1824

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TMM6 (Nuclear pore complex protein NUP98A-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold75G001300 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 350.1 bits (897), Expect = 1.7e-92
Identity = 295/637 (46.31%), Postives = 337/637 (52.90%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPSTTTF   SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  P QT
Sbjct: 72  FPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPAQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------AS 195
           NP GSTNQQSQPA  SNVF  SSPF + S SA GA+STP+F                 A+
Sbjct: 132 NPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 STPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL 255
           STP F AT+T  FGATSTPAFG TS P  G  ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA 
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTPAFGSTGNAF 251

Query: 256 -------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA 315
                                    STP+FG                   TP+F + TS 
Sbjct: 252 GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTPAFGQSTSG 311

Query: 316 FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVL 375
           F SSTF                                     GSRV  YA T EP+   
Sbjct: 312 FGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSTFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYAPTPEPDPGS 371

Query: 376 GRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTA---------QPNL 435
           G +  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY  GDKGG LPAGQS +         QPN 
Sbjct: 372 GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGFGVSGGQPNP 431

Query: 436 QGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPV 495
             SSTFSQS+ +PFST+  TNP A KPS FG FG       N S+FAPS PS        
Sbjct: 432 VASSTFSQSSPNPFSTSTQTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTPS-------- 491

Query: 496 ISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAATSSFSSIS 500
              NPF STTAASTS+F   +++ F          T    S++  +STT+  T+     S
Sbjct: 492 ---NPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQSLASQSAFSSTTSPGTNLTFPSS 551

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LN95 (Peptidase S59 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G433410 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 2.2e-92
Identity = 294/637 (46.15%), Postives = 337/637 (52.90%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFG QTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGPQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPSTTTF   SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  P QT
Sbjct: 72  FPSTTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPAQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST---------------AS 195
           NP GSTNQQSQPA  SNVF  SSPF + S SA GA+STP+F +               A+
Sbjct: 132 NPFGSTNQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSTPAFGSTSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 STPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL 255
           STP F AT+T  FGATSTPAFG  S P  G  ST AFG TS+PAFGS+ST AFGS GNA 
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGAASTPAFGAASTPAFGATSSPAFGSTSTPAFGSTGNAF 251

Query: 256 -------------------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSA 315
                                    STP+FG                   TP+F + TS 
Sbjct: 252 GSLSTPVFGSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTPAFGQSTSG 311

Query: 316 FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVL 375
           F SSTF                                     GSRV  YA T EP+   
Sbjct: 312 FGSSTFGTNTSPFGAQSSPFGAQSTSSFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVTPYAPTPEPDPGS 371

Query: 376 GRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQSTA---------QPNL 435
           G +  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY  GDKGG LPAGQS +         QPN 
Sbjct: 372 GSTQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSASGVGFGVPGGQPNP 431

Query: 436 QGSSTFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATMPV 495
             SSTFSQS+ +PFST+  TNP A KPS FG FG       N S+FAPS PS        
Sbjct: 432 VASSTFSQSSPNPFSTSTPTNPFAPKPSGFGTFGPSTTFSFNSSAFAPSTPS-------- 491

Query: 496 ISRNPFGSTTAASTSSFPPISSNHFA---------TMPAISRNPSASTTAAATSSFSSIS 500
              NPF STTAASTS+F   +++ F          T P  S++  +STT+  T+     S
Sbjct: 492 ---NPFASTTAASTSAFLSSTTSQFGSSSLFSSSNTQPLASQSAFSSTTSPGTNLTFPSS 551

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DUF9 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024117 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 340.5 bits (872), Expect = 1.3e-89
Identity = 281/542 (51.85%), Postives = 313/542 (57.75%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  QTANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  SSSPFASQPVFGQTANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           F S+TTF   SSP FG+T STFGS+ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG   TQT
Sbjct: 72  F-SSTTFGGSSSPAFGATPSTFGSSSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTTTQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAAT 195
           NP GS NQQSQPA  SNVF  SSPF + S SA GA+S P+F         A+STP F AT
Sbjct: 132 NPFGSANQQSQPAFGSNVFGSSSPFGAPSQSAFGATSAPAFGATSTPAFGATSTPAFGAT 191

Query: 196 NTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------- 255
           +T  FGATSTPAFG TS P  G TST AFG +STPAFGS+ST AFGS GNA         
Sbjct: 192 STPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGASSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVF 251

Query: 256 -----------------STPSFGGC------CCCTPSFC--------RPTSAFRSSTF-- 315
                            STP+FG           TPSF         + TSAF SS F  
Sbjct: 252 GSGGGFGASSTPAFGVSSTPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTSAFGQSTSAFGSSNFGS 311

Query: 316 -----------------------------------GSRVALYASTTEPNDVLGRS-PSGE 375
                                              GSR A YA TTEP+   G +  +G+
Sbjct: 312 NTSPFGAQSSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRAAAYAPTTEPDPGSGSTQAAGK 371

Query: 376 FQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQST---------AQPNLQGSSTFSQ 435
            +SISAMP YK KSHEELRWEDY  GDKGG LPAGQST         AQPNL  +STFSQ
Sbjct: 372 LESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQLGDKGGPLPAGQSTGGVGFGVSNAQPNLLATSTFSQ 431

Query: 436 SNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFATMPVISRNPFGSTTAAST 460
            +S+PFSTA S+NP A KPS FG FG    S   S  S  FAT    S N F STT+AST
Sbjct: 432 PSSNPFSTATSSNPFAPKPSGFGTFG---PSTTFSFNSSAFATSS--SSNLFPSTTSAST 491

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXG3 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448468 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 5.0e-89
Identity = 278/561 (49.55%), Postives = 313/561 (55.79%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  Q ANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 12  STSPFASQPVFGQAANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 71

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPS TTF   SSP        FG++ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  PTQT
Sbjct: 72  FPSNTTFGGSSSP-------AFGASSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPTQT 131

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAAT 195
           NP G+TNQQSQPA  SNVF  +SPF + S SA GA+STP+F         A+STP F A 
Sbjct: 132 NPFGNTNQQSQPAFGSNVFGSTSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 191

Query: 196 NTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------- 255
           +T  FGATSTPAFG TS P  G TST AFG TSTPAFGS+ST AFGS GNA         
Sbjct: 192 STLAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVF 251

Query: 256 -----------------STPSFGGCCC----------------------CTPSFCRPTSA 315
                            STP+FG                           TP+F + TSA
Sbjct: 252 GSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTPAFGQSTSA 311

Query: 316 FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVL 375
           F SSTF                                     GSRVA Y  TTEP+   
Sbjct: 312 FGSSTFGTNTSPFGAQTSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVAAYTPTTEPDAGS 371

Query: 376 GRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ----------STAQPN 435
           G S  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY SGDKGG LPAGQ          S AQPN
Sbjct: 372 GSSQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQSGDKGGPLPAGQSASSGVGFGGSNAQPN 431

Query: 436 LQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATM 455
              SSTF+QS+S +PFSTA STNP A K S FG FG       N S+FAPS         
Sbjct: 432 PLASSTFNQSSSPNPFSTATSTNPFAPKSSGFGAFGPSTTFSFNSSAFAPS--------- 491

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FU81 (nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448468 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 338.6 bits (867), Expect = 5.0e-89
Identity = 278/561 (49.55%), Postives = 313/561 (55.79%), Query Frame = 0


Query: 16  SCSPFVSLPVISQTANA-NNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQSSAP 75
           S SPF S PV  Q ANA NN FA KPFG +TSPFGSQTGN VF GG S GVFG AQSS+P
Sbjct: 75  STSPFASQPVFGQAANASNNPFAPKPFG-STSPFGSQTGNTVF-GGTSTGVFGAAQSSSP 134

Query: 76  FPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNS-NGGFGYIPTQT 135
           FPS TTF   SSP        FG++ TPAFGSSSSSSFGGSSIFGQ    GGFG  PTQT
Sbjct: 135 FPSNTTFGGSSSP-------AFGASSTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQKPLFGGFGSTPTQT 194

Query: 136 NPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPTFAAT 195
           NP G+TNQQSQPA  SNVF  +SPF + S SA GA+STP+F         A+STP F A 
Sbjct: 195 NPFGNTNQQSQPAFGSNVFGSTSPFGAPSQSAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGAA 254

Query: 196 NTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNAL-------- 255
           +T  FGATSTPAFG TS P  G TST AFG TSTPAFGS+ST AFGS GNA         
Sbjct: 255 STLAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGATSTPAFGSTSTPAFGSTGNAFGSLSTPVF 314

Query: 256 -----------------STPSFGGCCC----------------------CTPSFCRPTSA 315
                            STP+FG                           TP+F + TSA
Sbjct: 315 GSGGGFGASSTPAFGASSTPAFGASSAPAFGASSAPAFGASSTPSFSFGSTPAFGQSTSA 374

Query: 316 FRSSTF-------------------------------------GSRVALYASTTEPNDVL 375
           F SSTF                                     GSRVA Y  TTEP+   
Sbjct: 375 FGSSTFGTNTSPFGAQTSPFGAQSTSAFGTSGFGQAGFGGQRGGSRVAAYTPTTEPDAGS 434

Query: 376 GRS-PSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ----------STAQPN 435
           G S  +G+ +SISAMP YK KSHEELRWEDY SGDKGG LPAGQ          S AQPN
Sbjct: 435 GSSQAAGKLESISAMPVYKDKSHEELRWEDYQSGDKGGPLPAGQSASSGVGFGGSNAQPN 494

Query: 436 LQGSSTFSQSNS-SPFSTAESTNPPANKPSSFGFFG------LNPSSFAPSIPSHHFATM 455
              SSTF+QS+S +PFSTA STNP A K S FG FG       N S+FAPS         
Sbjct: 495 PLASSTFNQSSSPNPFSTATSTNPFAPKSSGFGAFGPSTTFSFNSSAFAPS--------- 554

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. TAIR 10
Match: AT1G59660.1 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 200.3 bits (508), Expect = 4.1e-51
Identity = 217/596 (36.41%), Postives = 294/596 (49.33%), Query Frame = 0


Query: 8   FEQQSCSHSCSPF--VSLPVISQTAN--ANNHFALKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSM 67
           F Q S S   SPF   +  +  QT N  +NN FA KPFG +T PFG+QTG+ +F GG S 
Sbjct: 10  FGQSSIS---SPFGTQTHSLFGQTNNNASNNPFATKPFGTST-PFGAQTGSSMF-GGTST 69

Query: 68  GVFGEAQSSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSSIFGQNSN 127
           GVFG  Q+S+PF +       S   FGS+   FG++ TP+FG SS+S FGG+S FGQ S 
Sbjct: 70  GVFGAPQTSSPFGA-------SPQAFGSSTQAFGASSTPSFG-SSNSPFGGTSTFGQKS- 129

Query: 128 GGFGYIPTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST------- 187
             FG    Q++P GST QQSQPA  ++ F  S+PF +S+  A GASSTP+F         
Sbjct: 130 --FGLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAFGASSTPAFGVSNTSGFG 189

Query: 188 ASSTPTFAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSST-------- 247
           A++TP F ATNT+ FG +STP FG +S P  G+T+T AFG +STP FGSSS+        
Sbjct: 190 ATNTPGFGATNTTGFGGSSTPGFGASSTPAFGSTNTPAFGASSTPLFGSSSSPAFGASPA 249

Query: 248 HAFGSIGNAL--------------STPSFGGCCC--------------CTPSFCRPTSAF 307
            AFGS GNA               STP+FG                   +P+F + TSAF
Sbjct: 250 PAFGSSGNAFGNNTFSSGGAFGSSSTPTFGASNTSAFGASSSPSFNFGSSPAFGQSTSAF 309

Query: 308 RSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG------------------------------------R 367
            SS+FGS  +   ST  P    G                                     
Sbjct: 310 GSSSFGSTQSSLGSTPSPFGAQGAQASTSTFGGQSTIGGQQGGSRVIPYAPTTDTASGTE 369

Query: 368 SPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQS---------TAQPNLQGS 427
           S S   QSISAMP +K K+ EELRWEDY  GDKGG+   GQS          +QP++  +
Sbjct: 370 SKSERLQSISAMPAHKGKNMEELRWEDYQRGDKGGQRSTGQSPEGAGFGVTNSQPSIFST 429

Query: 428 S-TFSQSNSSPFSTAESTNPPANKPSSFGFFGLNPSSFA-PSIPSHHFATMPVISRNPFG 487
           S  FSQ+  +P +    T P +N   S  F      SF  P+ PS  F +    + + FG
Sbjct: 430 SPAFSQTPVNPTNPFSQTTPTSNTNFSPSFSQPTTPSFGQPTTPS--FRSTVSNTTSVFG 489

Query: 488 STTAASTSSFPPISSNHFATMPAISRNPSASTTAAATSSFSSISLNHFATTPAVSSNRF- 505
           S+++ +T++  P+ S+ F + PA    P  S      S  S +    F + P+ + N   
Sbjct: 490 SSSSLTTNTSQPLGSSIFGSTPAHGSTPGFSIGGFNNSQSSPL----FGSNPSFAQNTTP 549

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.1 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 7.0e-51
Identity = 213/564 (37.77%), Postives = 277/564 (49.11%), Query Frame = 0


Query: 14  SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQ 73
           S   SPF S  +  QT+N  +NN FA   PFG  ++PF +Q+G+ +F G  S GVFG  Q
Sbjct: 11  SSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFG-TSAPFAAQSGSSIF-GSTSTGVFGAPQ 70

Query: 74  SSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYI 133
           +S+PF ST TF   SSP FG++        TPAFG+S +SS FGGSS FGQ      G+ 
Sbjct: 71  TSSPFASTPTFGASSSPAFGNS--------TPAFGASPASSPFGGSSGFGQKP---LGFS 130

Query: 134 PTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPT 193
             Q+NP G++ QQSQPA  +  F  S+PF +++  A GA STPSF         ASSTP 
Sbjct: 131 TPQSNPFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFGAPSTPSFGATSTPSFGASSTPA 190

Query: 194 FAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFG 253
           F ATNT  FGA+++P+FG T+ P  G + T AFG+T                  +TPAFG
Sbjct: 191 FGATNTPAFGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAFGASNTPAFG 250

Query: 254 SSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT 313
           +S T AFG+ G                     A STP+FGG                  +
Sbjct: 251 ASGTPAFGASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASNTSSFSFGSS 310

Query: 314 PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEP 373
           P+F + TSAF SS F                                GSR   YA T E 
Sbjct: 311 PAFGQSTSAFGSSAFGSTPSPFGGAQASTPTFGGSGFGQSTFGGQQGGSRAVPYAPTVEA 370

Query: 374 NDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ---------STAQ 433
           +   G  P+G+ +SISAMP YK K++EELRWEDY  GDKGG LPAGQ         S +Q
Sbjct: 371 DTGTGTQPAGKLESISAMPAYKEKNYEELRWEDYQRGDKGGPLPAGQSPGNAGFGISPSQ 430

Query: 434 PN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFAT 466
           PN    S  F Q++   ++PFS++ STNP  P     +   FG   S+F     S  F  
Sbjct: 431 PNPFSPSPAFGQTSANPTNPFSSSTSTNPFAPQTPTIASSSFGTATSNFG----SSPFGV 490

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.2 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 199.5 bits (506), Expect = 7.0e-51
Identity = 213/564 (37.77%), Postives = 277/564 (49.11%), Query Frame = 0


Query: 14  SHSCSPFVSLPVISQTAN--ANNHFA-LKPFGNNTSPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFGEAQ 73
           S   SPF S  +  QT+N  +NN FA   PFG  ++PF +Q+G+ +F G  S GVFG  Q
Sbjct: 11  SSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFG-TSAPFAAQSGSSIF-GSTSTGVFGAPQ 70

Query: 74  SSAPFPSTTTFCDLSSPMFGSTLSTFGSTPTPAFGSS-SSSSFGGSSIFGQNSNGGFGYI 133
           +S+PF ST TF   SSP FG++        TPAFG+S +SS FGGSS FGQ      G+ 
Sbjct: 71  TSSPFASTPTFGASSSPAFGNS--------TPAFGASPASSPFGGSSGFGQKP---LGFS 130

Query: 134 PTQTNPLGSTNQQSQPALESNVF--SSPFDSSSYSALGASSTPSFST-------ASSTPT 193
             Q+NP G++ QQSQPA  +  F  S+PF +++  A GA STPSF         ASSTP 
Sbjct: 131 TPQSNPFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFGAPSTPSFGATSTPSFGASSTPA 190

Query: 194 FAATNTSTFGATSTPAFGTTSNPVIGTTSTLAFGTT------------------STPAFG 253
           F ATNT  FGA+++P+FG T+ P  G + T AFG+T                  +TPAFG
Sbjct: 191 FGATNTPAFGASNSPSFGATNTPAFGASPTPAFGSTGTTFGNTGFGSGGAFGASNTPAFG 250

Query: 254 SSSTHAFGSIG--------------------NALSTPSFGGCCC--------------CT 313
           +S T AFG+ G                     A STP+FGG                  +
Sbjct: 251 ASGTPAFGASGTPAFGASSTPAFGASSTPAFGASSTPAFGGSSTPSFGASNTSSFSFGSS 310

Query: 314 PSFCRPTSAFRSSTF--------------------------------GSRVALYASTTEP 373
           P+F + TSAF SS F                                GSR   YA T E 
Sbjct: 311 PAFGQSTSAFGSSAFGSTPSPFGGAQASTPTFGGSGFGQSTFGGQQGGSRAVPYAPTVEA 370

Query: 374 NDVLGRSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLSGDKGGRLPAGQ---------STAQ 433
           +   G  P+G+ +SISAMP YK K++EELRWEDY  GDKGG LPAGQ         S +Q
Sbjct: 371 DTGTGTQPAGKLESISAMPAYKEKNYEELRWEDYQRGDKGGPLPAGQSPGNAGFGISPSQ 430

Query: 434 PN-LQGSSTFSQSN---SSPFSTAESTNP--PANKPSSFGFFGLNPSSFAPSIPSHHFAT 466
           PN    S  F Q++   ++PFS++ STNP  P     +   FG   S+F     S  F  
Sbjct: 431 PNPFSPSPAFGQTSANPTNPFSSSTSTNPFAPQTPTIASSSFGTATSNFG----SSPFGV 490

[Close]

BLAST of Sed0014671 vs. TAIR 10
Match: AT1G63540.1 (hydroxyproline-rich glycoprotein family protein )

HSP 1 Score: 45.4 bits (106), Expect = 1.7e-04
Identity = 121/398 (30.40%), Postives = 153/398 (38.44%), Query Frame = 0


Query: 40  PFGNNT---------SPFGSQTGNLVFGGGKSMGVFG-----EAQSSAPFPSTTTF---- 99
           PFGNN          SP  S + +    G     +F      +A   A   ST+TF    
Sbjct: 276 PFGNNVAFARPDVGISPVASSSTSTEIFGATPASLFSPFGPMQAPVQASASSTSTFPPFG 335

Query: 100 CDLSSPMFGSTL--STFGSTPTPAFGSSSSSSFGGSS--IFGQN-SNGGFGYIPTQTNPL 159
           C   SP  GS+L  S FGS P P    SSS+ FG SS  + GQN S  G GY+P      
Sbjct: 336 CVPPSPSSGSSLFNSAFGSLPAP----SSSNFFGQSSSNLLGQNPSTTGVGYLP------ 395

Query: 160 GSTNQQSQPALESNVFSSPFDSSSYSALGASSTPSFSTASSTPTFAATNTSTFGATSTPA 219
                            SP  +SS+   G    P      S+     +N   FG  S  A
Sbjct: 396 ----------------GSPL-NSSFPGFGVGYLP-----GSSSNLFRSNPPNFGGGSIGA 455

Query: 220 FGTTSNPVIGTTSTLAFGTTSTPAFGSSSTHAFGSIGNALSTPSFGGCCCCTPSFCRPTS 279
            G       G  S L       P+   S + AF S  N  S P        +  + RPT 
Sbjct: 456 -GPQHFGFNGDASVL-------PSTPFSLSPAFSSNTNTGSYP------FASHEWSRPTE 515

Query: 280 AFRSSTFGSRVALYASTTEPNDVLG----RSPSGEFQSISAMPDYKYKSHEELRWEDYLS 339
                  GS    YA T E ++  G     S    + SISA   Y +KSHEELRWEDY  
Sbjct: 516 Q------GSMNPGYAPTHEGDNSSGWSFPTSKGNIYISISASKPYLHKSHEELRWEDYKQ 575

Query: 340 GDKGGRLPAGQS--------------TAQPNLQG----SSTFSQSNSSPFSTAESTNPPA 390
           GDKGG  PA  +              T  P   G     +T S S S  F+   +T+PP+
Sbjct: 576 GDKGGPFPAAPASTIGSRPNAAFSPPTVSPPAHGCTACGATSSSSASRHFTFNGATSPPS 620

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Sed0014671 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_038902900.1	5.6e-95	52.36	nuclear pore complex protein NUP98A [Benincasa hispida] >XP_038902901.1 nuclear ...	[more]
XP_023512469.1	2.4e-93	50.09	nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023512...	[more]
TYK01639.1	3.4e-92	45.89	nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
XP_008462776.1	3.4e-92	45.89	PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo] >XP_016902936...	[more]
KAA0043047.1	3.4e-92	46.31	nuclear pore complex protein NUP98A-like [Cucumis melo var. makuwa]	[more]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
F4ID16	5.7e-50	36.41	Nuclear pore complex protein NUP98B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98B PE...	[more]
Q8RY25	9.8e-50	37.77	Nuclear pore complex protein NUP98A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP98A PE...	[more]
G0SBQ3	1.0e-06	32.33	Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ...	[more]
Q555D2	1.7e-06	30.63	Nuclear pore complex protein DDB_G0274915 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 G...	[more]

BLAST of Sed0014671 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5A7TMM6	1.7e-92	46.31	Nuclear pore complex protein NUP98A-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 ...	[more]
A0A0A0LN95	2.2e-92	46.15	Peptidase S59 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G4334...	[more]
A0A6J1DUF9	1.3e-89	51.85	nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 OS=Momordica charantia OX=36...	[more]
A0A6J1FXG3	5.0e-89	49.55	nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=366...	[more]
A0A6J1FU81	5.0e-89	49.55	nuclear pore complex protein NUP98A-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=366...	[more]

BLAST of Sed0014671 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT1G59660.1	4.1e-51	36.41	Nucleoporin autopeptidase	[more]
AT1G10390.1	7.0e-51	37.77	Nucleoporin autopeptidase	[more]
AT1G10390.2	7.0e-51	37.77	Nucleoporin autopeptidase	[more]
AT1G63540.1	1.7e-04	30.40	hydroxyproline-rich glycoprotein family protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	GENE3D	1.10.10.2360		coord: 267..315 e-value: 1.6E-15 score: 59.0
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 311..355
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 322..355
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 132..151
None	No IPR available	PANTHER	PTHR23198:SF22	BNAC05G07920D PROTEIN	coord: 263..459 coord: 14..261
IPR037665	Nucleoporin peptidase S59-like	PANTHER	PTHR23198	NUCLEOPORIN	coord: 263..459 coord: 14..261

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Sed0014671.1	Sed0014671.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0009987	cellular process
biological_process	GO:0033036	macromolecule localization
biological_process	GO:0071705	nitrogen compound transport
biological_process	GO:0071702	organic substance transport
cellular_component	GO:0005643	nuclear pore