
Sed0013964 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACGACAATAATGCACTTATTCCCCTTGCTTCTTTCTCTTCTACTTCTTCGATCCTCGGCTTACTTTCCTCCTGATAAGTTCTTCCTCAACTGCGGATCGGAATCCGACGCAACCTTCGGAGTAGGACGGAAGTTCATCGGGGACGCCAAGCCCGGTCCTTGGTTGATCAACCCCGGAAAAAGCAAAATCTTTAAAAACGACACCATCCCAACGTCCATAAATGAAATCTACCACACAGCAAGAGCTTACAATAAGCCAACATGGTACGGATTCAAGGGCATCAATCAAAACGGCACGTACGTGGTTCGTCTCCATTTCTTTGCGCTTACGTCGTCTCAAAACTTCCCTCGAGCTCGGTTTAATGTCTCGGCCAGCTCGGGGTTCAAGTTGTTATCCAATTTCTCACTTGAAAACGACGATCATGCCACGCCGGTCGTAAAGGAGTTCGCTTTCGAGCTCAGTGAAGGGTTATTTGGCTTACAATTTTCTCCTCTCGAATCGTCTCTGGCTTTTGTAAATGCCATTGAAGTGTTTGTTGTTCCTGATGATTTCAAAAGACAATCGGCTTATGCTGTTTCCCCAGAAGTAAGGATCAATGGCAGCTTCAAGTATATGATGACTTCCAATGCATTCCAAGCGGTTTACAGGTGCTAATTAAAACACACTCACTCTTAATATCCTAGGGAAGATGCTTAATTTATATTTGATCTTCAACCTAATATTTCTACATGTCAACTAATTATTTTTATATCTACATTTTACTTGTTCTTTAAAAAACAAAACATATCTCCTACATGCTTGTAAAAATATTCCAAGTGACTGTGAGATGGCCTTACTTTTGTCTTATGTTCTCTTAATTAAAATCCCTCTTCTTTTAGGGAAAGTTATTGAATTTTATCCATATTTTTTTAAAAAAATAATAATAATTATGGTTTTGTTTGATAACCACTCTGTTTTTTTTTTTTTAAATGTAAGCCTACAACAACCATTCTATCACATATGTTTTTTTATTCTTTCTGGGATATTTACGTCGTATCTATAATTTTATAAATCAAACCAAAATTTGAAAATTAAAAAAAAAATAGCTTTCAAAAACCTATTTTTGTTTTTTAAATTTAGTTAGCATCCACATTTTTTTAAAGAAAGAGGGATACATTGTAGGAAAGATACAACATATGGTAATAAATTTAAGAAAAATAAACCTTAATTTTAAAAACCAAAAACTTAGGCCTCTGTTTAATAAGCATTTGGTTTTTTGTTTCTAGTTTTTGAAATTTAAGACTACAACAACTATCTTACCATATTTTTTTTTCTTACTTAAATATCTACATCTCACCTATATTTGTAGAAATTACGAAACCAAAATTTGAAAAGAAAAAAAAAATAACTTCAAAAAGTTTGTTTTTGTTTTTGAAAGCCGGTTAGAATTCACATACTTTGTTAAGGAAAGATGAATGAATACATTGTAGAAAATGTGGAATGCATCACAGGTAATTTGAGCAAGAATATACCTAAATTTAAAAAATCAAAAACCAAATAATTATCAAACTAAATGTTATGGAACGAGGCCTAAAAAAATAATCTTTATTTATTTATTTTCAAACTCTGACTTGATTTTTAAAAACATTGGCAAAAGTACATTTAAAAAAAACAATAAACCCATGAGTTGAAGTAGTATATTTATAGACTTTTAACATAAATTTGTACTTATGATGAATAAGTGACCAAATTGAATCTTCTTACCTAAAAATAGAAATTATAGCCTTAATTTAAATATATATATAAAAAAAGCCTTCAACTCAAGTAGTTATTAAATGGAATCAAAATTATGGTTGATTTAATTTTAATGTAAGGGAATTATCAAGAGCAGGGTCTTGATGGGGGGTTTCTTGATCACTCCTGACACGGACAAATTATGGAGAACTTGGATGCCAGATGATACATTCATGGCTCTTCCATCCATTGCAAAAAACATCATCTTCGAAGACAATATAAAATACGCGATGGTAACAAAACTTTACACAGCCCCACCTTATGTGTATAGTCATGCAAAAGCCTTGAATGCAACCGCCACTGAAACTACCTCAACAGATCCAAATATAACTTGGGTTTTCAAGGTCAACAAGAGAACCAAGTATTTTCTTCGCTTCCATTTTTGCGACATCATCGGACCGCAAGGCACCCCCTTTCAGTTCGATTACTTCCTCGGCGTGAATCGAACCGATGTCAATTCTGGAGGACGCCAAGAACAAACTGGTTTTATGTATGTTTTTCCAAAACCTACGCTTGATTATGCAAACCCATTCAGGTTTGAATACATCATTTTCACAGACAATTCAGGATTTTACGAAGTTGGCATAGCACATAATAAAGAGAATCCAACGTCAAGAGCCTTCTTGAATGGGCTTGAGATTATGGAGTTGATTGACAAATCTTTTGTGGGTGCTATTGAATTGGATGATTTGGAAGATGGGAATCAAAAGCAAAGGAGGGTTATTATTGGAATTTGTGTTGGTGGTGGTTTGGTTGTAGCTTTAATAATTGGGTTGGCTTTGTTTTGTTTTATGAAAAGAGGGAAACCAAAAAAGCATACTCCTTTTCCACTTCCTCAAAGTGACCCATCAGAGAAAGTTATGTCCATTACTGATCTTGCTCCTAATTTGAACATTGAATTGAAGATTTCATTTGGTGAAATAGTTGATGCAACTAATAATTTTGATGACAACAAATTAATTGGAGTTGGAGGATTTGGAAGGGTTTATGTTGCCACAATTGGTGATAAAGACGTGGCTGTGAAACGAAGTCGGCCTGGACATGGGCAGGGTATTAAGGAGTTTCAGACTGAGATCCTTATCCTGTCTCAAATTCGACATCGCTATCTCGTTTCATTTTACGGGTACGTCGAATAACACCTCCCAACTTTTTTTTATATTATAACAATTAACGATGAAGGGATTCGATTTATGACTTCTTTGTCAATGCTCTACATCGATATTATTGTGAGCTACTATTCATATCGACAATTAACACCTTTTAAATTTCTTTAACTTATCTTTTTATTTTAAAATTTTTTAATTCTTGTCTTTTAATTTTCAAAAAAGTTATATTTCAATTAATTTTTCAAATTTTAAAATTCCTCAGCTCCTATTTCTGTTTTTGTTTTTAAAAATAAAGTTTGCAGCAAATATAGGGGTACTAAAAAAATGATAGCGGAAGCAACATCCCTGGTAAAAGTTGTGCTGGATAATAATTTTATTTGGGTTGGATTGTGTTGAATTATGATTTTATGATTTTTATTGGGTTGAGTTTGGTTTTTGGTGAACCAATATTTGACACCTTTTAACCCAACCAAACCATCCAAAGAATAATATAAATGTGTGAGAGAAGAGAAATTAATTAATAAAATAAGTTTTTAACATATTAATAAATAACATGTACTAATAACATAGATGACTAACGCAATGAGTCAATGACACAATGTTTCATTATTTGGTTGTAACTCAGTTCAACACTACTATTACAGGTTCGATCTCAAGAATTGGTATTTGTCTCCCTCCCCTGATATGTATGCAAAAAAAAATAAGTCGAGAACCCTTTGGATTAAAAAAATTTCTAAGATTTGCTATCTACAACAAATTTCTTCTTCAATTTTTTTTTATTTTTAAATTTAATTAGTTTTCTAATACTTTCTAAAGGAAGATGAAACTATTTATAGAAAATTTGAATCAAAATATATTTAGATTTCAACAGTAAAAAATAAAATGGTAATTAAACATCCCTAATTTTTATTTGTCTTTTCTTGACATGGTTTTTATTTGTCCTCGTGTATGGGAGCATTCAAACAAGTATGAGATAATCAACTTAAGTACTAAAGCAATATAATAATTAGTAAAAATCAAACTATATAAAATATTTTAATTAGTAATTAACACAATAGCGCACATGCATTTGATCCTCAACAGGTATTGTGATGAAAATCAAGAAATGATCTTGGTTTACGAATACATGGAAGGGGGAACTTTAAGAGAGTATTTATATGGTTCAAGAACTCAGCAACATCTTTCATTATCCTGGAAACAAAGGCTCCATATCTGCATCGATGCAGCGAAAGGGCTCGATTACTTACACACCGGTTCGACCTTCGGTGTCATCATTCACCGAGACATCAAGACCACGAACATCTTGCTCGACAAAGATTCCAACGCCAAGGTTGCTGATTTTGGGATATCGAAAATCGGAGTACCCAACGCCAAAGGATTAGACACCACCATTAGAGGCACTTATGGGTACCTTGATCCAGAATACTTCAACACATGCCAGTTGACTGAGAAGTCTGATGTTTACGCCTTCGGCGTCGTACTTTTCGAAGTTCTCTCGGCCAGACCGCCGATCGTCATGTCGCTGCCGAGTGAAGAGGCCAACTTAGCTGAATGGGCAGTTCTTTGCAAGAGAAAAGGAGAGATTGAAAAGGTGATGGATCCCTTGCTTGTAGGCACTATCCAAGAAGAATCATTGAGAAAATTTGTTGAAGTTGCAGAGAAGTGTGTGGATGAAGTTGGGGCGAATCGGCCTTCGATGCGCGAGGTTGTGTATGATTTGGAATTGGCTCTATCGTATCAGTTCACTCCAATAGGAGGCGGGAAGGGGGTACGAGGAAAGCAAGATCATTGTTGATGCTCCGTGGGAGATTGACTTGGTGATTCTCGGCCGGAATCCATCGAGGGAGCTCAATGATTCGATCAAGATGTTTGAAGATAGCACGACAATGAATGCATGCAAGAGAATTGGTTTCATAGTTCAAGATTGATTGTGCTAGATGATGTGCAATAGAATATATATATACATGTGTGAGTTAATTGACTTCTCGTTCAATATTTCTGTAAGGTAGTTTGTATTGTTTTGTGTACTAATTTTATGTTGTGTGTTAGGTTATGGGTTTATTGTGTCAACAGGCCTTATTTTGTTGATGTGTGATTATTATGAGTTGAATG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MTTIMHLFPLLLSLLLLRSSAYFPPDKFFLNCGSESDATFGVGRKFIGDAKPGPWLINPGKSKIFKNDTIPTSINEIYHTARAYNKPTWYGFKGINQNGTYVVRLHFFALTSSQNFPRARFNVSASSGFKLLSNFSLENDDHATPVVKEFAFELSEGLFGLQFSPLESSLAFVNAIEVFVVPDDFKRQSAYAVSPEVRINGSFKYMMTSNAFQAVYRVLMGGFLITPDTDKLWRTWMPDDTFMALPSIAKNIIFEDNIKYAMVTKLYTAPPYVYSHAKALNATATETTSTDPNITWVFKVNKRTKYFLRFHFCDIIGPQGTPFQFDYFLGVNRTDVNSGGRQEQTGFMYVFPKPTLDYANPFRFEYIIFTDNSGFYEVGIAHNKENPTSRAFLNGLEIMELIDKSFVGAIELDDLEDGNQKQRRVIIGICVGGGLVVALIIGLALFCFMKRGKPKKHTPFPLPQSDPSEKVMSITDLAPNLNIELKISFGEIVDATNNFDDNKLIGVGGFGRVYVATIGDKDVAVKRSRPGHGQGIKEFQTEILILSQIRHRYLVSFYGYCDENQEMILVYEYMEGGTLREYLYGSRTQQHLSLSWKQRLHICIDAAKGLDYLHTGSTFGVIIHRDIKTTNILLDKDSNAKVADFGISKIGVPNAKGLDTTIRGTYGYLDPEYFNTCQLTEKSDVYAFGVVLFEVLSARPPIVMSLPSEEANLAEWAVLCKRKGEIEKVMDPLLVGTIQEESLRKFVEVAEKCVDEVGANRPSMREVVYDLELALSKFVEVAEKCVDEVGANRPSMREVVYDLELALSYQFAPVGGGKGYEGSTSIVDTPWEIDSVILDRIPSKKINDSVVLYEDSTTTNARELVADFKIDCAR Homology
BLAST of Sed0013964 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0013964 vs. NCBI nr
Match: KAG6605194.1 (putative receptor-like protein kinase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1172.5 bits (3032), Expect = 0.0e+00 Identity = 587/877 (66.93%), Postives = 698/877 (79.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. NCBI nr
Match: XP_022947967.1 (probable receptor-like protein kinase At2g23200 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1167.9 bits (3020), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/880 (66.59%), Postives = 693/880 (78.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. NCBI nr
Match: XP_022149529.1 (probable receptor-like protein kinase At2g23200 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1084.7 bits (2804), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/879 (63.82%), Postives = 657/879 (74.74%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. NCBI nr
Match: XP_038901428.1 (probable receptor-like protein kinase At2g23200 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1053.9 bits (2724), Expect = 7.6e-304 Identity = 551/877 (62.83%), Postives = 651/877 (74.23%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22187 (Probable receptor-like protein kinase At2g23200 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g23200 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 554.3 bits (1427), Expect = 2.5e-156 Identity = 344/796 (43.22%), Postives = 459/796 (57.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LK35 (Receptor-like protein kinase THESEUS 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=THE1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 2.4e-135 Identity = 309/789 (39.16%), Postives = 438/789 (55.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T020 (Probable receptor-like protein kinase At4g39110 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At4g39110 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 468.8 bits (1205), Expect = 1.4e-130 Identity = 297/783 (37.93%), Postives = 430/783 (54.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LX66 (Receptor-like protein kinase HERK 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HERK1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 468.0 bits (1203), Expect = 2.3e-130 Identity = 300/782 (38.36%), Postives = 435/782 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FN92 (Probable receptor-like protein kinase At5g59700 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At5g59700 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 6.8e-130 Identity = 308/782 (39.39%), Postives = 437/782 (55.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KZH7 (probable receptor-like protein kinase At2g23200 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499674 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1192.9 bits (3085), Expect = 0.0e+00 Identity = 596/880 (67.73%), Postives = 707/880 (80.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G7V9 (probable receptor-like protein kinase At2g23200 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451689 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1167.9 bits (3020), Expect = 0.0e+00 Identity = 586/880 (66.59%), Postives = 693/880 (78.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D7A4 (probable receptor-like protein kinase At2g23200 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017940 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1084.7 bits (2804), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/879 (63.82%), Postives = 657/879 (74.74%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VGM6 (Putative receptor-like protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold21G005650 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1053.5 bits (2723), Expect = 4.8e-304 Identity = 543/877 (61.92%), Postives = 649/877 (74.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BH61 (Putative receptor-like protein kinase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold232G001190 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1050.8 bits (2716), Expect = 3.1e-303 Identity = 545/877 (62.14%), Postives = 650/877 (74.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. TAIR 10
Match: AT2G23200.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 554.3 bits (1427), Expect = 1.8e-157 Identity = 344/796 (43.22%), Postives = 459/796 (57.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. TAIR 10
Match: AT5G54380.1 (protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 484.6 bits (1246), Expect = 1.7e-136 Identity = 309/789 (39.16%), Postives = 438/789 (55.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. TAIR 10
Match: AT4G39110.1 (Malectin/receptor-like protein kinase family protein ) HSP 1 Score: 468.8 bits (1205), Expect = 9.7e-132 Identity = 297/783 (37.93%), Postives = 430/783 (54.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. TAIR 10
Match: AT3G46290.1 (hercules receptor kinase 1 ) HSP 1 Score: 468.0 bits (1203), Expect = 1.7e-131 Identity = 300/782 (38.36%), Postives = 435/782 (55.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013964 vs. TAIR 10
Match: AT5G59700.1 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 466.5 bits (1199), Expect = 4.8e-131 Identity = 308/782 (39.39%), Postives = 437/782 (55.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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