
Sed0013871 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTGGGAGAGTAACTTAATCCCAAAACCCCTCACCCAAAACCCCTATTTTCTTTGGCGCCTCGGTTCCTTCTCAAACTGTGTTCATCGTCCTCTTTCTCTCCATACTCGAATGTGAAAATCGCAGCGCAGAGAAGCTTGGAACCTAACATGGCGGCGAATTGATACCGTCGAGGCAATGAGCCAGCTACAGAGGAGCTTGTTCTTGGCCACTCCTCCCAGTAACGCCATTTCTTCCTCTGTATTTTCATCTAATCCCTTTGCTTCATCCTCGCGACTCGCTCCTTTCATGGATAAGGTTTTCGTGTTCTTCCGATTGTTCTTCGCAGTTACGATTGTTTTTTGTTTTTGAAGTTTTCCTAAAACGCGACTCTGTTTAGAGAATTGTGAAAATCATGAAACCTATCGGGAAAATGATCAATTGTATATTTATAGGAATAGCGTTCCGTGAGTTGCAATTTTATACCGGTTTGATGTTTTGTTTGCGACACGCAAACTTCTGGTGTTGGACATTTTGGTTACTTCGGCTCATTTTTTCGTTTTCTAAAGCCCATTTGATTTTTTGTTTTTGAAATTTAAACCTGCAACTACTATTGCAACGTATAGTTTTCATAACTTTGTTATCCCCATTTTACTTGGTTTGTAGATTTTGGTTAGGATTCACATATTTCTTTGAGGGGAGACGAAACAAAAGGTAGAGAATTTGAGTAAATACAAGCTTAAATTTCAAAATCAAAAAACAAAAAATCAAGGCCCCGTTTGGGTTTTGAAATTTAAGCCTATTCTTACTCAATTTTTTTAATGTGTTCCACCTTTCCTATAATATATCAATCTTTCCTTAAGAAAGTATGTGAATGCTAGCTAACCAACTTTCAAAAACAAAAACAAGCTTTTGGGAGCTACTTTTTTTTGTTTCCAAATTTTGGTTTGATTTCTACAAATATAGGTAAGTTGTAGATATCCTAGTAAGGAAAAACATGTGGTAAGATAGTTGTTGTAGGCTTAGATTTTAAAAATCAAAAACAAAAAACCAAATGGTTATCAAACGGGGTTCAAATGATTGTCAAATGGAGCCTAAATGTTTTCGAGTGTGATTGCTACCAATCTCTTTTAGTAGTTTCGTAGGTTGTTTTTGAGTTATTTAATTCACACTCTTAAATTCTGATTAGATTGAAAAAATAGATTTGTTTTGCTGCAAATATTAGAAAGGAACGGTATGAAAAGTTGGAAATTTATGTGATAACGATCAATACAATCTTCCCCAGATTGGAAGAGTTTCAATTTTCGTACATGCTTGAATTTTTGTTAAGAACGCCTTGTAAACTTCTGGTATTTATTATTTTAGTTACTTTAGCATAGTGAATTTATGGTTTTATGGCAGTGAGATAATGTGATTTCGATTAATCTCTTTTTGCTGTTTGATTGGTTGTTTTGAGTTTTTAACCTTCAGACTCGTAGAATCCTGTTTATGGATTTGTTATGCAGAAAATATTAGAAAGAATTGCATGATCATTTTTAAAACTTAACTTGTATGTCTCCTTAGGAAAACATATGAATTTTTGTTATTTGTTAATGCCATGCATATTTCTGCCATTAGACTAATTTGGTTACTTACGTTCACTTGTTATTTTTCTTAATATTTTGGAGTTGCCTATCGATTTTGTACCATTATTCTGGTGATAATATGTTTTTTTTTTAAATTTGGTGCTCCTGTTACAGTTGCAGAGCAGAACTCTTCCAAATTATACTAGCAAATCCATACGTGCTTTACCTCTTACCTCTGCTTGTAGTTACGCCAGATGCTCTCAGCTTGTTTTTCGAAAAGCTGGAGCCACATTTTCTATCAAGACTCAACGTGCAAGGGCTGGTCAATATCGTACATGTGATGGCCCAAATTGTGTTTTCACCCTATATTCCCGCTTAACATCGAGATTTCCTCATTCTGTTGCATTATCAAATGCTTCTAACAGCAAGCTGTTACATGGCAGTTTTACACCTAAACTTCCTAATTATGGAACTTTTGGAAAGTTCTTTTCGCAATCTAGGGAAGATCCGAACATAACTGACAATAAGAATGTTAAGGATGAAAAAAATGGGACAGGAACATTCCCATTTGAAGGATTGAATACAAAATGGAAGAGTGCAAGGCCTGTTGCTACATCCAGGGCAAAGAGAACTAGTGCTACAGGGTCCTCAGGCCCCACTAATATTGATGGGACAATTTCAAGCGAGCACCTGGTTGGGGCTAGGAAGGAGGCAGATCTAGTTCCATCTAATCCTTCTTCATCCAGTAAGAAAGCATCTAAGGGTTTTAAAGAAAAAAATTCACGGAGCAAGAAAAAAAAGGAAGCTATATCTTCAGCCAATCCTGCAGGTGTTCAAGTAGTATGCAATGATGGTCAGTCAAAGAGCTTACATAGTAGCGACAATGATCTGAATCGTGTACAAGATCCACAGGTTAGCAAATAGTAATTGATGGTTGTTTTTAATCTCCCATCCCCCTCTTGTTGCATTATTTAAGTAACAGTGTAGTTTTTTTTTTTCCAGAAAAAATCAATTGGGGATACTTCCGAAGGTTCTGCTTCAACAAAAAAACAATCCAATAATAAAAAAGGTACCTCTAACAGAAAAAGAGAAGCTAAGAAAGATGCTATTAAGATGCCACAGAAGCAAAACCTTGTATTGGATGCAAAGGGGTCTCAGGGACAAGCAACTTTGAAGCCGCTATATCCCCCCTTGGGAAAGTCTGTAATGGTGGTAGAATCTGTTACGAAGGCGAAGGTTATTCAAAATTATCTTGGTGATATGTTTGAGGTGCTACCTAGCCATGGCCATGTTAGAGACTTGGCTGCAAGATCAGGATCTGTAAGACCTGATGATGACTTCAGTATGTTGTGGGAGGTTCCATCTCCTGCATGGACTCATCTCAAGAGCATAAAAGTTTCCTTAAATGGGTATGCTTCTAGCTTTTGTGCTAGCCTGGCCTGCATGCAACTGTATTTTTTGCTAGCTTGATAATGATCGTTAAGTTTACACACACACACTTGAATTTGTGATGTCTACTATGCCTTCTTTCTCTTTCTCCAATTCCTTCAGATTTAATAAGAATCTTCTTTTGCTTTGTATTATTCCTCAGAGCAGAGAACCTTATTCTTGCATCCGATCCTGATCGTGAAGGTGAGGCTATCGCTTGGCATATAATTGAGATGTTGCAGCAGCAGGATGCCCTACACGAAGGTATTAGCATATCAAGAGTTGTGTTTCACGAAATAACTGAGGCTTCTATCAAGAGTGCCCTGCAATCTCCTAGAGGAATTGATGCAAACTTGGTACAAGCTTACCTTGCACGGCGTGCTTTAGATTATTTGATTGGATTTAATATTTCACCATTATTATGGAGGAAATTACCTAGTTGCCAATCGGCTGGGCGTGTTCAATCAGCTGCACTTGCTCTAATATGTGATAGAGAAACGGAAATTGATGAATTTCAACCACAAGAATATTGGACTGTTGGGATTGAGTTGAACCAAAAAGATCCTCGTTCTTCGGTGGAAGAATTTCCAGTTCCCGCACATTTAACCCATTTTGATTCTAAGAAGTTAAATCAGTTTTCAATTAGCTCTAATACAGAGGCAAAAAATATAGAAACAACACTGATATCAGCAAATTTTCAAGTGCTTAGCTCTAAAAGGAATAAAGTAAGGAGAAACCCTCCAATGCCATATATAACATCTACACTTCAGCAAGATGGAGCAAACAAACATAGTTTTCCTCCAACTTATACAATGAAGGTACATTGTAATTTTGTTTCCCTTCATCATGAAGTTCCACATGATAGAAGATAATACAGTCATGTTGAGTTAAAATTTTTCTTATGATCAGTAGTAATATAATTGTTCTTTCCCCCTGTTAATACATGGTAGCTACTAATGAAGTAATGAGTTACTGGATTTTAGTACTTATGCTAATTGTAAGACCTCAGTTGACTAACCAGTTGTAAGAGTCTTGTGGGCTAGATAATTATGAGAAAGTGCTATCTTTCTAACTTTTTTTTTCTCCAAATCATACATAAGGAAACCCTAGTTCACTTTCACCCCTTCCTCCGGTGTCGTTTTCTTCACCGGTGTTGGAGGGGGGTCTCCGTCCATCTTTCGCTCTTGACCAGCGAACCTTTCCTTTTCATTCTCCTTTTTGACCAACATTGTCAAAGCGTGGTTTATCTTCCTCTTCTTTTCTCTCTTTTCTTTTCTCTCCTCGATTGTTCGTATCAACTCATGGATCTTCAATTGCCGTCGTTTCAGTAAAAACTTCTCATTCGCAAATTCAGAGTTGTTCATCATCTTCTCTTGGAAGTTTGCCAACCTTAGTGTAACGACATCATCTTCTTCCCCTCTTGAAATTTGCGGACCTCATTGTATTGACTCCATTCTTCATCACTTGCAGTAGAACAATTGGGTAGACCTGTGTTTGCCAACAAGCAGCAATCACTTCTCCTTTCTTTGGTGGTCAGCAACGATCATAGCTTTCCAACCCTTGTCTTTCCTCCCTTTATGTGTATGGATTTGCTCATCGACAGAGTGCTCTTCTCACCGACAAGCCTGATAAGGTTTGTGGTGGCTCATAATGGATACTTGGAACAAGTGGCGACACAAGCTTTCTTGAGTAAGAGACGAAAGGGAAACCCTATTTTTGGACTTGTTTGGTCTATTTTGATTTCGAGTGGATCGAACTAGGCCGGTTCGAACAGGTTTGGCATACAGAACCATATCGTCTCACCAGACCGGTTTGGGTTATTCAAACCAATTTTGGTTTATTAAGAGTTCACTCTCTCTTCTTCTTTTCTTCTTGGTATGGTTGGTTTTGCACATTTTATTTCTTTAGCTTCAACAACAATGTAATTGGACCTCTTCTTTGCAACTTTTTCATTCTATCAATGAAATAGTTTCGTTTCTTATAAAAAAAGAGCCTTGTGAGTTGTGTGGTTAGTTGCCAAAACT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Homology
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BLAST of Sed0013871 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0013871 vs. NCBI nr
Match: XP_022936881.1 (uncharacterized protein LOC111443338 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1848.6 bits (4787), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1162 (81.41%), Postives = 1029/1162 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. NCBI nr
Match: XP_023536595.1 (uncharacterized protein LOC111797719 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1846.6 bits (4782), Expect = 0.0e+00 Identity = 947/1162 (81.50%), Postives = 1028/1162 (88.47%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. NCBI nr
Match: KAG7024522.1 (topA [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1841.6 bits (4769), Expect = 0.0e+00 Identity = 944/1162 (81.24%), Postives = 1026/1162 (88.30%), Query Frame = 0
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BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68X45 (DNA topoisomerase 1 OS=Rickettsia typhi (strain ATCC VR-144 / Wilmington) OX=257363 GN=topA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 618.2 bits (1593), Expect = 1.9e-175 Identity = 330/789 (41.83%), Postives = 482/789 (61.09%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1RIM1 (DNA topoisomerase 1 OS=Rickettsia bellii (strain RML369-C) OX=336407 GN=topA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 616.3 bits (1588), Expect = 7.0e-175 Identity = 330/785 (42.04%), Postives = 483/785 (61.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZDK2 (DNA topoisomerase 1 OS=Rickettsia prowazekii (strain Madrid E) OX=272947 GN=topA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 612.1 bits (1577), Expect = 1.3e-173 Identity = 328/789 (41.57%), Postives = 475/789 (60.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q92IH1 (DNA topoisomerase 1 OS=Rickettsia conorii (strain ATCC VR-613 / Malish 7) OX=272944 GN=topA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 605.1 bits (1559), Expect = 1.6e-171 Identity = 324/789 (41.06%), Postives = 474/789 (60.08%), Query Frame = 0
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Match: A0A6J1IF86 (Omega-protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476696 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1862.0 bits (4822), Expect = 0.0e+00 Identity = 950/1162 (81.76%), Postives = 1030/1162 (88.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CSY4 (Omega-protein OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111013976 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1860.9 bits (4819), Expect = 0.0e+00 Identity = 955/1158 (82.47%), Postives = 1021/1158 (88.17%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F8P8 (Omega-protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443338 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1848.6 bits (4787), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1162 (81.41%), Postives = 1029/1162 (88.55%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IMZ7 (Omega-protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111476696 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1812.3 bits (4693), Expect = 0.0e+00 Identity = 932/1162 (80.21%), Postives = 1008/1162 (86.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F9K7 (Omega-protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111443338 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1798.1 bits (4656), Expect = 0.0e+00 Identity = 928/1162 (79.86%), Postives = 1007/1162 (86.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013871 vs. TAIR 10
Match: AT4G31210.1 (DNA topoisomerase, type IA, core ) HSP 1 Score: 1158.7 bits (2996), Expect = 0.0e+00 Identity = 605/1007 (60.08%), Postives = 747/1007 (74.18%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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