
Sed0013788 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGCATTTTGATTAAAGAGGAAAATAGAAAAAAAATTGAAAGAAAAACAATGTGCTTTCTTCATCTTCGCGAAAAAACCCCATTTGATTTTCCCAATCTCCTTTGCCGCCATACACCGTAACTCCGTCAGATTTTTTTTTATTATTGTGGTTGCGCCGGATTTCTTCCCGAGTGGTACCTGAGTAGTGCAACATTGTTTGCGTGAGAAAATGGCCAAACCCACTTTCAATTTCACAATACTCAGTTCGATTACCGTTGATCCATGCCGAAGGCGTTCATTTTTTCATCCAACTCAGCCTTGGATCTGTCGATCTTCACAAACCAGCGCCGATTTGGGAAGATTCTACAACAACTTCGCAAAAAGGAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAATGCACAGTACGTTCTTTCTGTAAGAGCAGACCTGCGACCCGCGAACCCGACCCGCCTGCTACCACTTAGACCCGCCTGTCCGACCCGGTTCACCACCCAACTGGAGGTATTAAGCTGCTATTTAGTTTTGTCTTGAGCCTGCATTTATTTGCTATTTGGGTTTGGATGATTTGGTATTTAAAAATGGGAAATACTAGTAAATGTCTACATTTTCTAAACTAATTAAGGGCATGTATACAATATTTTTAACTTTAAATTTTTGTCTAAACCAAAATCCTAGGAAGAAAGATAATATTTTCATTCCCAAACTGCCCTATTTTAGCTTTTCAATTTTTTTTTTAAAAAAGAAAAAAACTTACTATACTAATTCTCATCCTTGATTCAAGGAATTAACAACCACCAACTAATCCTAACCATTTAAATTTTTTATTTTTATTAATGTATATTTCAAAAGATCTTTTACTCAAATATTTTAAATAAATATCTAAATATTTAAATCTTGTTATGATATTCAGATCACAATTAATATCATCGTTTATTTTTTCATACTCTCAGATCATCTTCTTCATAAGAATGATTTCTTTCGTCTCCTCCCAAATACAATTTTACTATTTATTTCATCTCTCTCTCAAATACATATTTACGATTTCTTTCATCTCTCTCCTAACTACAATGTTACGATTTCTTTCATCTCCTTCCCAAATACAATTTCTTTTTCCATTGTTTGTTGCAAGCTACGTAATCCAGAACACGATGTGTGATTTCTTCTTTCATTCCAAATGCATTTTCGTTCTGTGATCATTGCCAGAAGTCTGAGGATTTGACGAAGTTGCGTTTTTTATCTCCATGTCGTGCACTCCCTTAGTCGATTTTTTTTTCTGCGCCATTGATTTATATTTTGGAGTTCTTCTAGGGTAAAATGATTCATACTGTCAATGGAACGTATTGGTACGTAATCAGAAACTTCTAGGGCAAAGTGGCTCATTCTGTTAATTGTACGTACTGGTACGTATTCAGAAACAAAAGGTTCTTAAATAGAAGATGCAATGATAGTGAGTGTACACATGGGTCATCAAGAAAATAAATGTATGTGCACAAATTGTACATAATGGTAAACCAAAAAATAGATGTATGGGTACACAGACAAGAACAACCATAGTTGAACATGGTATTAAGAGACACAAAAAATCGAAGGGATATAGGAGTTGAATCGAAGGTTTATACGATGATGGGAGTATTTTAAGGTTTTTTTTGTTTAACTGTTCATCCTCAGTTTTATTAGTGCTAATTATCTCTACACACCCCAATGTAGCAATCATCGCAACTGGATGAAGGTGGCAGGTGGGTTTTCTTTTTTTTCTTCTTTTAATTGTAGTTTGTATCAAAGGAAATCGTAGATGAGTTATTTCATTTAGTTTTTTTGTTTAGTTTATGTATGATTACGTAGGTACCTCATATTTTAAGAAAATATGAAATTAACCACAACAATTTTTTCTTTGTAAAATAATATTTTATTTTTTTATCATCTTAGTAAAAAAATTAGGAATTTTTTCTACAAAGATCTTTTGCCCGGGTTGTTGCAAAAATCCCATTTCAAATTAATTATAGAAAATAAAACAAAAATAAAATTTAGGGGTATAACCGTCCATTTTATTTTTACAGATTAATAATTTGTTTTTCTAATTTAGAAGTAGATATTAATTTAAACTCCAAAATATTGTAGACGCTCTCTTACTATTTTTTTCAATTTTAGACATTTACCTAGTTTTCCCTTTAAAAATTGTGTTTAAAATGAATTGTTGGGTTGTTGTGGGTTTCATTTCAAATGAAATTTTATTGTTGTGTAGACCTCTGTTAAGTTTTAATTGAATTTAAATTAGGCTGGGTTCTTTTTAATAATAAAAGTTATTAGGTTGCAGAGTTCAATTGATGTTTGTTTAGCTGTAATGAGATTTTAAATTGAGCCATGGGTATTTGTAAATTTCAGCAAAAAAAATAATAGTAATAATAAATAATAATAAAATAAAAGTTGAATTTAATTGGGTTGTTTTGGTCGGAATAAATTGGACCTTGGTTTATTTTCAAATATCTAGAAGTTTGCCTATTTAAGTTAAAACACCAAGTTTAAGGCATGAGTTTTAGTTGTCAAGAATTAAAGAACTTAAGAGAATATTTAATATCATTTTAATGGTAATTTATAAAGTAAGTTTACATATAGTTTTTTTTTTGGGCTGCTCCATTGCAAAAATTAAAATGAGTTTGAGTTTTAAATTGTCAATTTATGCCATGAGTTTATTTTTAATTGTATATTTTTAATGGACCATGAATGGATATTTTGTTAAGTATTGAGCCATGGGTTATTTTTCAAGTATCTAATAATTAACACGTTAAAACTTTAAGTTTGGGACGTGTTTTTTTTAGTGGACAAATTAAGGAATCAAAAGAGTACTTTAATATTCTTTTAATGGGTTTTTAATTGTATAATTATTTATAATCTATTAAGACAAGAATTTTTTTACAAGATATTATGTATCCTTTATTTATGGGTTTTAGTTTTGGGAACCAAGATTAGTGCTAGGTCCTAATTTCATGGTTTGACTGTTAGGATCGTTTGGTTGACTAGCCCAAGGCTATTTAGACTCGTTCTCGATGAGTTCTGTAACTGCAAGAGGTAAGGACTTTTACCTAGAGTTGTGTGGTCCTTAAATGCATTGTTTGCTTAATATTTGATTGATAATTTGCTAGATTATCTATAAGATGCATGGATTTAATCTTTGAGCTAAGTTTGACCTCGTTGACTTCTATGTTTATTGTTTGAGCTACTGATTGATTGTTTATCATACTTTTTATACAAATATTCCTTGTGTTTGATACTGCTCAGTAGTATGGGATGCTGAGTGGTAAATAATTTGATGTAACTTCTCGGACCAATTGTGTTTCTCATAAGTTGTATCAGGACCAGTTGTGTTCCTGACCTTTATTAGGGACAGTTGTGTTCCCTAATTGTGTAGGACCAGTGGGGTTCCTACCTCCTTATAGGACCAGTTACGTTTCCTATAAGTTATAGCAGGACCAGTTGTGTTCCTGATTTGTTGATTTGATGTAATTTATGGGACCAGTTGTGTTTCTCATAAGTTGTAGCAGGACCAGTTGTGTTCCTGACCTTTATTAGGGCCAGTTGTATTCCCTAATTGTGTAGGATCAGTAGCATTCCTACCGCCTTATAGGACCAGTTGCGTTTCCTATAAGTTATAGCAGGACTAGTTGTGTTCCTGATTTTGTGATAGGGCCAGTTGCATCCTTAACTAGCCAGTTGTTGTAGAGTTACTTTTATAGGGTCAGTTGCGTTTCCTATAAGCTATAGCAGGATCAGTTGTGTTTCCTGTTAGTAATCACTTGGACCAGTTGAGCTCCTTACGTAAATAGGCCAGACAAGTACCTTAATGGGGTGGACCAGTTGTGCTTCCCCAATTAGTTGAGCCTAGAGGTTCTCAGCTTAGAGCTCTGAGTCTGAGCGTATTGTAGATATTGAGGGCAGTTGTTGGTTAGATGTTGAGCTGATGTATGCATTTTTGTACTCTGGGTGAGAGTTCTTACTGAGTAATTCCCATTACTCACCTTTATCATTTTTCCCCTCCAAGTGTTGAGGTATACCGAGACAGATGTGTTGGATCACGTGTCCTGTTATTTATTAACTGTCTTTCTATTCCGCATGAACTATTTAATAAATCTTTATTTCAATTCAGAAAGTTGTATTTATATTTTGAATCATTCCTAGCCAGAAGAATGTTTTACTAGCTCTGAGTTTCGTGACAAAGGGACACAGTTTTGAGACACACATTTGTTTTGAGACACACACTTCCCAATATGTGGTGAAGGAATGATTTCGATTTTCACAAAAGGAAAGAATTTTGAGCTTTTGACCTAGATTAAGACTATAGTTAAAAAAAAAAAAAATCCTCTAAAGATTATAAAGGAAAATATTCAAGTAAAAATCTTTTAAGTTCGTTCAAGTAAGTATAAAAATTATTTTAAGGATTTATGGTAATGTATTTTATTTAGGCGAAATCGAAGAAATAACTACCTCTTATTTAATTTTAAAAATGCAAGAGGTTAATTTACCTCATAGTCATTTATGTATATACTTGATTGATGAGGTGTTTGGGTGGAGGAAAATAGAAAGAAGAATGATCATGTAGAGAATGATTATTTGTGTTTGAGGTGAAACGAATGATTATGTCGAGAACGATTATTTGAGATTATTTGGGTTTGAGGTAAATGAAATGATTGTGGAGAAAATAAAACAATAAGTATGATGAGAGTGAAAAATAGTTATGAGATGATAAAAAGTTGGTATGAGAAGAATAACAAATAGTTAGGAAGAGAATAGAAATGTCATTTTAGGAAAATGTGATTATGGAAGAATGATTTTCAGTGACTCAAACAACGAGAATCATCTCTTTTCCATCCTCTCCATTTCATCATTTACCATAAACACCCCTAAGAAGGTGTTTGGATGTTGAATTAAAAAGTGAATATTTTAAGTGATTATAAATGATGAATTATCTTGAGTAATTATAAATTATAGTTTTAGTAATAGCTAA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MNYLLGAFKPSCNISIAFSDGKTRKQVPLKKENGQTVLVPLFQSQENISGKITIDPLQGKKVDHNGVKIELLGQIEMYFDRGNFYDFTSLVRELDVPGEIYERKTYPFEFSTVEMPYETYNGVNVRLRYVLKVTISRGYAGSIVEYQDFVVRNYSPLPSINNGIKMEVGIEDCLHIEFEYNKSKYHLKDVIIGKIYFLLVRIKIKNMDLEIRRRESTGSGANTHVETETLAKYELMDGAPVRGESIPVRLFLSPYELTPTHRNINNKFSVKYYLNLVLVDEEDRRYFKQQEITIYRLQETPDSSSPNAVR Homology
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BLAST of Sed0013788 vs. NCBI nr
Match: KAA0041222.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 26A-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK16025.1 vacuolar protein sorting-associated protein 26A-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 603.6 bits (1555), Expect = 9.6e-169 Identity = 297/299 (99.33%), Postives = 299/299 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. NCBI nr
Match: KAA0039997.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 26A-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 2.1e-168 Identity = 296/300 (98.67%), Postives = 299/300 (99.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. NCBI nr
Match: XP_022149429.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 26A [Momordica charantia] >XP_022149430.1 vacuolar protein sorting-associated protein 26A [Momordica charantia] >XP_022149432.1 vacuolar protein sorting-associated protein 26A [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 2.8e-168 Identity = 297/300 (99.00%), Postives = 298/300 (99.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. NCBI nr
Match: XP_022928718.1 (vacuolar protein sorting-associated protein 26A [Cucurbita moschata] >XP_022967864.1 vacuolar protein sorting-associated protein 26A [Cucurbita maxima] >XP_023543589.1 vacuolar protein sorting-associated protein 26A [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 601.3 bits (1549), Expect = 4.8e-168 Identity = 296/300 (98.67%), Postives = 298/300 (99.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9T091 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS26B PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 561.2 bits (1445), Expect = 7.2e-159 Identity = 268/303 (88.45%), Postives = 288/303 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FJD0 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=VPS26A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 3.6e-158 Identity = 267/299 (89.30%), Postives = 288/299 (96.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AY86 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Vps26a PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 362.8 bits (930), Expect = 3.7e-99 Identity = 175/297 (58.92%), Postives = 230/297 (77.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55CA0 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=vps26 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 362.1 bits (928), Expect = 6.4e-99 Identity = 172/297 (57.91%), Postives = 230/297 (77.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P40336 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Vps26a PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 361.7 bits (927), Expect = 8.3e-99 Identity = 174/297 (58.59%), Postives = 230/297 (77.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L3Y1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G538580 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 605.5 bits (1560), Expect = 1.2e-169 Identity = 298/300 (99.33%), Postives = 300/300 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4N9 (vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486118 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 605.5 bits (1560), Expect = 1.2e-169 Identity = 298/300 (99.33%), Postives = 300/300 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CX27 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26A-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold32G00190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 603.6 bits (1555), Expect = 4.7e-169 Identity = 297/299 (99.33%), Postives = 299/299 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TEN7 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26A-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold122G002800 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 1.0e-168 Identity = 296/300 (98.67%), Postives = 299/300 (99.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D5P3 (vacuolar protein sorting-associated protein 26A OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111017859 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 602.1 bits (1551), Expect = 1.4e-168 Identity = 297/300 (99.00%), Postives = 298/300 (99.33%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. TAIR 10
Match: AT4G27690.1 (vacuolar protein sorting 26B ) HSP 1 Score: 561.2 bits (1445), Expect = 5.1e-160 Identity = 268/303 (88.45%), Postives = 288/303 (95.05%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. TAIR 10
Match: AT5G53530.1 (vacuolar protein sorting 26A ) HSP 1 Score: 558.9 bits (1439), Expect = 2.5e-159 Identity = 267/299 (89.30%), Postives = 288/299 (96.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. TAIR 10
Match: AT4G27690.2 (vacuolar protein sorting 26B ) HSP 1 Score: 507.7 bits (1306), Expect = 6.7e-144 Identity = 243/275 (88.36%), Postives = 262/275 (95.27%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013788 vs. TAIR 10
Match: AT1G48550.1 (Vacuolar protein sorting-associated protein 26 ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 2.6e-07 Identity = 50/256 (19.53%), Postives = 104/256 (40.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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