Sed0013101 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAACTATCAAATTAGCAAAGATTGCAAATCAGCGAGGCAATTGCAGGATTCGCAGCAGCCGTCGCCACTTCAGAGAGCTCATCGGAACAATTGCGGAGATTTCCGTTGGGTAAGCCTTCTAATTCTCCGCCAATGCATCTCAGATTCCGATCCGCAACTCTCGTCTCACCATTTTCCGGCGGCTCTCGTCGGAATCCATGGATTTCGCTTCATTCATTAACTACTCTGACAATTTTCTTAGACTCATGGTTGCTCATTGTTTTATAAGGCCCTGATTGCGAAGAAAAGCCCCAAATGGCGTCCATGGAAGTGGACAGCGCTAATTCCAATGCTACTGACCCTGATAATCCTAGATTTTCCATTAACGGTATGCCCTTCTCAATTGATTTTGTTTCCTTCATTACTGTGTTCATTTTGCCCCATTGTATCAGGTGTGGCTAAATTATGTATCATTTAGACCCACTTTCATAACGATTTGTCTGTTGTTGTTTTTATTTGTTTTTGAAGTATTGCAGCTCTTGAAATCTGCCCAGATGCAGCATGGGTTACGCCATGGAGATTATACACGCTATCGGTTTGTGAAAATGCATTACGTGTATCATTTGATTTCATTGTTATGCTGTTTTAGTTTCTTACTTCCAATTATGCTTGTGTTAATAGTGTTGTGAATTTCTCCTGATTGGGTAGGCCGTTGATTGGTGGTAGATTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTATGGGTAGGAGGTATTGCACAGCTCGGCTGAGGAGACTGTATAAGTCTCTGAAGTTCACTCATGGCCGTGGAAAGTACACCAAACGAGCCATAACTCAAGCAACTGTTAGCGAAGTCAGGTTTGCCCCATTTAATAGTTTACATGCTGCATCTTTACTTGCCATTTTTTCGTTTTCGCTTCAAAGTATTTCCCTCCTGTTATTGACTAGAAAAGTACTCTAGAAATTGTTTACAAAATTGTCAATAATGTTTCCCCCTTAATTCACACCGATTCTATTGAAGTGGGAAAAGAAAAATGAAAGGTAAAGAAAATGGCGAAGTGTTAATTAATTCGAGCTCTTCCATGTCTGTGTTAACTAATTCAATAATCATCAACTTTCTGGATTTACATTAGGTTTCTCCATGTGGTCCTTTATACGGCGGAGAGAGCTTGGAGTCATGCCATGGAGAAAAGGCAATTACCAGATGGTCCAAATGCACGGCAGCGTATCTATTTGATTGGTAGGCTCAGAAAGGCAGTAAAATGGGCTACTCTCTTTTCACAATTGTGTGCAAGCAAGGGAGACTCAAGGACATCTTTGGAAGCAGAGGTTTGATCCTAGTGTTCTTATGTATATACCCTATATGATACTCTTTTCACTTTGAAATTTTAAAATTACATCTCAATGAAGAGTGACAATTGTAATCGTTTTGTAGGCTTATGGATCGTATATGACTGGGAACTTGCTGTTTGAACAAGATCGGAATTGGGACACAGCATTATTGAACTTCAAAAGAGCCAGGTGTTTCCTTATCTTTTAAATTGCTTGTTAAATGATCAACTAATTCTTGCTATATCTTCTTTATTGGGGTTAAGATTATTTTCATTTTTTTTTCTATCCTCTATAATAGAAAGGCCTAATTCCATTTGAGAGACAAGGCCACTCCACTTCTATTTTAGAAAAGTTTGAAAGACTCAGAGTCTACATTTTCTTTATGACAACGTGGTGCATTTAGAAGAGACATGGGATCGAATTAGGTTTAGTACCACTATCCAAGCTTTCAATTCCCATAAATTTGTATATCATCTTGTTTCGATTAAGGTGGCTATAAGCCTATAAGTACACTGGGTTGACATCCCTTCCTTCTGTCCTCTCTCTTTCGCTTAAAGTTCTATTTTGTTCCAATCATTTTTTTCCAAAATGGCCCAGAAGGCATTAAGTGATGGAGTCCTCATCTTGGAGTTCTCAAAAAAAGAAAGAGTCCTCATCTTGGATATGAAGGGTTTTGTTGATCCTTGAAGGTTTTGGGCAAGCTAACACCAAAATAATCATTAAAGCTTCAGTGTGAACTGCAACTGAGGAATAGGTGATTGACATTTTTATTCTTTCTGTTGAAGACCAGTAGACCACTATAAGATAAAAATAAGACAATTGTAATCTATCTATCATATCTACTGTTATCCATATGAATCTAAAATTTGTAATAATACATGATTTACTAAAGGCCCTGCATAATTTATCATCTCATTTTATGAGGCTTTGTGGAGACGAATTATTCTCTTATGGCCTTATGGGTGGGAAATGCTACCCTCAAGCAATCCTTCCCCTAACTTTATGCACTAACTCAGAAGAAGAAAAGAAGCATCGCTGATTTTTGGGATGATAGGAACACCTCATGGAACATATTGATGAGAAGGGATGTTAAAGATGATGAGATTGTGTCGTGAATTATTTTTTTTGAAACGGAAAACAAATCTTTCATTAGAAAATGAAGATAGTACAATGGTAACAAGAGAAACAAAAGAAAGAAGAAAGGAAGAATCAAAACATATGAAAATCAAAAGGACACAACAACAACAAAAGTAATGCAAATACAAATTAGAGAAAGGCCTCCCAATTGGAAGATAGTTGTTGAATGGAATAGTTGGCAAATTGTGTGTCGTGAATTATTGAATGTGCTGGATTCGCATAATCTTTCGGATGGAAAGGATCTGTGGTTGTGGCCTCTGGAAAAGGACAAGACTTTTTCATCAAAGTCTATGCTTCAATTAATATCCTCTTCCCGTGATCAATACTTAAAGGATTTTTATCTTGCCATTTGGAGAGGTCCTCAGCCTAAAAAATTGAACTCTCATTGGAAAAGCTTTTTATAACTTTGATAAGCATCCTCATGTACTTTTCATCTAATCATTGAAAGTTTTATCGTTTCCTATAAAAAAATATATCATCTCATTTTGATTTTTCAAATAACATGATTTACTAATGTTTTCTTTGCCTTTCAGAGCTGTTTATGAGGAACTCGGGAAAGTAGGTGACCTAGAGAATCAAGTTTTGTGTCGTCAACGTGTGGAGGAGCTAGAACCTAGTATACGATACTGCTTGCACAAGATTGGCAAATCAAATCTAGAGGCCTCTGAACTTCTACATATTGGGGAAATGGAAGGCCCTGCTCTAGACCTTTTCAAAGCTAAATTAGAGGTCTGTTTGCTTACCTTCTACTCTCAAGTTAATGAATTTATCATTTTTGTTCCAATTTTTTTTTTAAAGTTGATTTATAAGAAAGCATGTACAATGCATGTACGAGCACCATAAATTAAAATTTTGTTCAACTGACAGATGTCTGACACTCAAATTGGTTTTGACAGTTTATAAGAGTTCAATTCTCTTGTTGATTTCTGTGCTTCTTTTACTGCAAAGTTCTATTGTTTAGGAAGTTATATAATAATTTTCAAGAAAGCTTCGTTTGAGGCCTTGGTTTTATTGGTTGAAGAGCACCATTTTTTGCTGTAAAATGTTCTGGCATGGACAAATTTTTTTTCTTTTATTTAATTTGGAGAGCTTTTCGTCCACAAGGGGTTGTGCAGTGGTTGAAGACTTGAGCTTTGAGGGTATACTCCCCTTAAGGTCCCAGGTTTGAGACTCACCTATGACATTACTCCTTTGATGTCTTTGGTGCCTGGCCTAGGGACGGACGTGGTAACCCTTGTTTAAAAAAAAAGATTCAAAAAAAATTTGGAGAGCTTTTCACCCAAGGACACGTTCTAACTTTTAAATGAAATTGTCATGGGTGGTTTCTTTTAGTTATGTATTAGTTTTGTTTGGACAAGTTCTGACCTCAGTATAGGCATAGATGTTTGTGGTTAATGGTGGTGGACCTGTGGTTGTTATAACTTCTACCTTCATTTTCTCAAAGGAAATTGTCATGGGTGGTTTTTTTTTCCATTAGTTAGCATACTGACCGTTATCTGGCAGCCACTTGTGTAACTGTATGGATGTGCTACCCAAACCATGCTTAGCCATCATTTTCTTAGTTGGGATCAGCTATGCATGGAAGTGCTGCTAATAGTTTAGCAATCATGTATAAAAAAAAGTAGTAGGATCATTCGTTGTCTTGCCCCGTGAGAATTGTCGAGGTGCACATAAGTTGACCTATCATTCATAAATCATAACTGTCAAGTTTAGCAATCAGTTTCTTACCTTTATAATGTGTCTTGTCAAGATTGAGATGAAAAGATCAGGGTGATTGATAATCGTTGTATTGTGGATTGAAGAAATGCTCTTTCTAGTGTTCTTTGTGGAAGAACTGACTTCCTTGCTTTTTTTGCCAATGTTTTTTTAAAAAAATTATTTTACAGGGAACGAAATCTTTTAATTGATGTTGAATAAGCCTATCAAAACAAGAACAAAGTAAATGACAGGAAAGAACCCAGTAAAAAAGGGGAAAGAAGAAAAAAAAAACAAAAAAAAAACCGAAAACATAAACAATCCAAGCAGAGGGCCCAAAGAGGGGAAGCAAAACCAATAATAAAGAACCTAAAGAGTGATGACGAAGGCTGAAGAGGACCAGGGGATATAAGATGATTGGGGTTTTGTTGTGGAACATCTCTAGAGCAAGTGTGCCATATCAAAGCCTATTGTGAAACATCTGTTGATTAATTTTATCATTTGATCTTTGCAACATAGTTTCTTGAAGCTGACTTCATTTAAACTGTAGACTTACCCTTTTATACTACATTAGTTGAAGCTTAATGTCCAGTCTATTTCAATTGCAGATTTGAGACATAAGTTATCGAAAAGCTGTAGTATAATTGTTTTTTATGTCCGTCTATTTGTTATTAGGTAGACCGTAGACTTGAGGACACTGCTTGTTATAGAAAAGCATAAGAAAAAAGATAACTTAACCATCATGGGTTGGCTTAGTGGTCAAGAGGATCTTGAAAAACTAAGAAGTTATGAATTTAATCCACAGTGGTCACCTACCTAAGAATTAATATTT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BLAST of Sed0013101 vs. NCBI nr
Match: KAG6588218.1 (Signal recognition particle subunit SRP68, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1104.4 bits (2855), Expect = 0.0e+00 Identity = 560/593 (94.44%), Postives = 577/593 (97.30%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. NCBI nr
Match: XP_023531772.1 (signal recognition particle subunit SRP68-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1103.2 bits (2852), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/593 (94.27%), Postives = 577/593 (97.30%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. NCBI nr
Match: XP_022933753.1 (signal recognition particle subunit SRP68-like isoform X2 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1101.7 bits (2848), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/593 (94.10%), Postives = 576/593 (97.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. NCBI nr
Match: XP_022965818.1 (signal recognition particle subunit SRP68-like isoform X2 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1101.3 bits (2847), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/593 (94.10%), Postives = 577/593 (97.30%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. NCBI nr
Match: XP_023531771.1 (signal recognition particle subunit SRP68-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1098.6 bits (2840), Expect = 0.0e+00 Identity = 559/594 (94.11%), Postives = 577/594 (97.14%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BMA6 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Srp68 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 295.4 bits (755), Expect = 1.4e-78 Identity = 196/605 (32.40%), Postives = 322/605 (53.22%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q00004 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Canis lupus familiaris OX=9615 GN=SRP68 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 294.7 bits (753), Expect = 2.4e-78 Identity = 201/610 (32.95%), Postives = 328/610 (53.77%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9UHB9 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SRP68 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 288.9 bits (738), Expect = 1.3e-76 Identity = 199/610 (32.62%), Postives = 329/610 (53.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VSS2 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Srp68 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 242.7 bits (618), Expect = 1.1e-62 Identity = 179/592 (30.24%), Postives = 314/592 (53.04%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q20822 (Probable signal recognition particle subunit SRP68 OS=Caenorhabditis elegans OX=6239 GN=srpa-68 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 212.2 bits (539), Expect = 1.6e-53 Identity = 164/602 (27.24%), Postives = 296/602 (49.17%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F5Q6 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441075 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1101.7 bits (2848), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/593 (94.10%), Postives = 576/593 (97.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HQ31 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465584 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1101.3 bits (2847), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/593 (94.10%), Postives = 577/593 (97.30%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F0Q1 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111441075 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1097.0 bits (2836), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/594 (93.94%), Postives = 576/594 (96.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HMP5 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465584 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1096.6 bits (2835), Expect = 0.0e+00 Identity = 558/594 (93.94%), Postives = 577/594 (97.14%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0M2X1 (Signal recognition particle subunit SRP68 OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G627500 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1093.2 bits (2826), Expect = 0.0e+00 Identity = 555/594 (93.43%), Postives = 572/594 (96.30%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0013101 vs. TAIR 10
Match: AT5G61970.1 (signal recognition particle-related / SRP-related ) HSP 1 Score: 884.0 bits (2283), Expect = 6.6e-257 Identity = 451/599 (75.29%), Postives = 517/599 (86.31%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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