Sed0012520 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0012520
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 39122206 .. 39125051 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0012520
SyntenySed0012520
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCATTGCATTCTCTTCCGACCCATCACGAACGGGTTTGGATTAGCCATTGTGCGGCGTTCGCTTTTGCTAAGCCATTTCAGTCCAGTTGCGAAAACAGTGTCGATAATTACCTTATTTTGCGTATCAGCTAATTTGAACTCATTATCAAGTAGAGATTATCAAGTTATAGAGCTCAGCTCTTATTGGCAAATTACTTGTATTATTTGTGAATTGGATAACTTCCATTTTTGCAGTCAACTTGGTTAGGAATATCAATGTTTACCCTGAAATTTGAATTCTATCAAATTGCGCTAAATATGAATGATTCTGCCCAAGTGATGCAAATTTTTTACTTTGTTATACATATTTTTACGAAGAAACATTGAGCTAAGTAACTAAAATGTACATTTTTTAGAATTACGAAATATGCCTTATTTTATTTTTTTATTTTTTATAATTAATGGGTGAGATAAATTTCATCCCTTTTATAATATGATTTGAAGACTAAGATTTTTTTCGATGAAATTGGAAGTTTAATGTGAAATTGAATAATTTAATCAATTTTTTATGCCTCGTTGGATGATTATTTTGTTTTTCGTTTTTTGTTTATAGAATTTAAGCCTCTAACAATTAACTTGTTATATCTTTTTTCTTATTTGGATATCTACATCTTACCTATATTTTAATTAATAAATCAAAATTTGGAAACAAAAAAAAATATGCTTTAAAAAATTTGTTTTTGTTTTTGAAATTTGGTTATTATTCCCTTACTTTCTTAGAAAAATATGGATATATTGTAGGAAAGATGAAGCACAAGTTAAGAAATTTGAGTAAAAATAATCTTAAATTTCATAAATCAAAATAAAAATCAAAATGGTTATCGAAACTTTAATATTTTATTGTATTGCTCCTGGCAAATGATTTGAATTAAAAATCAAAAGTTCACCTTGAAAATTGAGAGTTGCCCATATTTTTTATAATTAGTAATGATTGTAACTATAGACTATCTTTATCCTCGTTCACATAACTTTGTTGGTAAAGATAATGATTATCAATTATTGTAGACATTTTTTAACCATGTTTACATAGCATCAAAGAATGTGGTCTTAATTCGTTTGTGTATAGTTCTCGATTTGGTCGTGCATCTACCTTTGTTTCAATTCGTCTTTGAACAGTATACAGAAATCTTGTTCTATTTAGAATTTATTATTATTTTTTTTAATACATATTGGGAGAGGGGGATAAATACCGATTATCGGGCTTGAACCTGTGACACTGGTGTTAAACTGGTTTACAACAACATAATGAAACCATTGCGCCACTAACTCATTCGATTTCTATTTACAATTTCTAACTATTAGATAATTATGAGTTTTCATCTCAAAAACAAATTTAGAGTAGACATCTATCTTATAAATGGTAGAAAGCCAAAAAAAAAATTTAATGTGAGAAATGTGAGATCACGAACGTTAGTGTCACTTTGAATTAATATCTTGAATCGGACCTCAATTTTATTTTTGTTAGACTGGATGTTTATTTAAGGTTATGAGTTTTTATACCAATTTATATGATGTGAATTCTATTTCAAAATTAATTGACACTAAAGGACAATTTAGAAATATTTGTTGATATAGTTAAATTTACCACATCTCAAATTTTTGGGTTAATTGGGTTAATCAGTGATTTGACATAATTGAAGAAGTATCTTCACTTTGTCAGTATTGGGATCCTCTAACACTACCATTCCAAGCAAGATTTTGAATCTTAATCTGAATATTAAGCTTACAAACCACATAAAAATATTAGCTGTACTTATTTTTATAACTTACAATGATTTATGTTTAAAAATCAGGCATCTTTGACGAAGATTCTCTATTACGTTAGATAATCATTTTATTTTTTATTTTTATTTTTATTTTTTTGAAAATGAGTTTGTTTGATAACTAATTTTGGTTGTTTGAAAAAAAAAATAATTATCAAATATGTTTTTTGATTTTTAATATTTTAAAACATAAATTAAAGTTAGTTATAAAAAATATCTACCAAATTTATTTTTTAAAATAAAAAATAAAAAAATAGAAATAAAAAACAAAAAATGAACAATCTAATGCCTCGTTTGATAATTATTTGGTTTTAAAAACTTAAACTTATTTTTACTCAAATTTTCTTCCACGCTTCTTACATTGTATTCATATTTTCTTAAAAAAGTAGGTGAATACTAACCAACTTTTAAAAGTAAGAATAAACTTTTGGAAACAACTTTGTTTTATTTCCAAAATTTAGTTTGATTTCTACAAATATAGGTGAAAGGTTGATATCCAAGTAAGAAGAAAACATATGGTAAAATAGTAGTCGTAGACTTAAATTTAAAAAATAAAAAATAAAAAATAAAATGATTTATAAAAAAATAACTCTTTAAATGATTTATTATTATTATTGTTATTACCTTTTAAGTAAATACACAAAAAAGAAAAATCAAGCAAAGACTAATGAGTAGATTGGTAGGTTGATTAATTTAGCATCCCATCAAGACGACTGGTACTTCCATTTTTGTATATTAAACATTGTTAGATCCATCTCCGATTTCTCAGCCCAGGCGCCAAATTTCTCAATCCAATCCAAGCTTCCATTGCCGCAACTCCAATTCACACTTCAAATTTCGACTGCATAGCTCAAGGTATCAATGCGAGTTTCTCTCTCTCAAGCTTCCAATGGAATCTCTTTCAGTTTCATTCTCTAAACCAAGTTGGCTACTTCTGCACAGTTGCAGAATCGATTCGACGGAGTGTTTAATTGCTGAAAGCTTCTTCAATTTGCCGGATCCATTGGATTCTGCTGCTCAATCTTCTTACTTTGGGAATTGA

mRNA sequence

ATGCATTGCATTCTCTTCCGACCCATCACGAACGGGTTTGGATTAGCCATTGTGCGGCGTTCGCTTTTGCTAAGCCATTTCAGTCCAGTTGCGAAAACAGTGTCGATAATTACCTTATTTTGCGTATCAGCTAATTTGAACTCATTATCAAGTAGAGATTATCAAGTTATAGAGCTCAGCTCTTATTGGCAAATTACTTATCCATCTCCGATTTCTCAGCCCAGGCGCCAAATTTCTCAATCCAATCCAAGCTTCCATTGCCGCAACTCCAATTCACACTTCAAATTTCGACTGCATAGCTCAAGTTGCAGAATCGATTCGACGGAGTGTTTAATTGCTGAAAGCTTCTTCAATTTGCCGGATCCATTGGATTCTGCTGCTCAATCTTCTTACTTTGGGAATTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCATTGCATTCTCTTCCGACCCATCACGAACGGGTTTGGATTAGCCATTGTGCGGCGTTCGCTTTTGCTAAGCCATTTCAGTCCAGTTGCGAAAACAGTGTCGATAATTACCTTATTTTGCGTATCAGCTAATTTGAACTCATTATCAAGTAGAGATTATCAAGTTATAGAGCTCAGCTCTTATTGGCAAATTACTTATCCATCTCCGATTTCTCAGCCCAGGCGCCAAATTTCTCAATCCAATCCAAGCTTCCATTGCCGCAACTCCAATTCACACTTCAAATTTCGACTGCATAGCTCAAGTTGCAGAATCGATTCGACGGAGTGTTTAATTGCTGAAAGCTTCTTCAATTTGCCGGATCCATTGGATTCTGCTGCTCAATCTTCTTACTTTGGGAATTGA

Protein sequence

MHCILFRPITNGFGLAIVRRSLLLSHFSPVAKTVSIITLFCVSANLNSLSSRDYQVIELSSYWQITYPSPISQPRRQISQSNPSFHCRNSNSHFKFRLHSSSCRIDSTECLIAESFFNLPDPLDSAAQSSYFGN
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0012520.1Sed0012520.1mRNA