Sed0011549 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGAAAGCGCGCCATGTTATAATTCGTCATATTCTTATGGCGATTGTTTCTCCGAGAGCCAACAACGGCTTCATTTCTCGCATCAATGACCTAATCAAGCTTCAGGTTCAATCCCTCTCTCTCTCTTCCTATGTCGATTTCTTCTTCATTCCCATTGTTGTACTCAATTATTCCAACAGTTTCAGTGTATTCGTTCTAATTTTGCTTCCATAACTTGGAAATTTTGTATAATCAGAGGCTCAAACGCGATTTTACCAATGGAGAAGCTATTCGCGCTCCTATTTACCCAGCAATGGATTTTCATTCAGTGGGTCGTCAAGGTGTTCTTTCCCCCCCTCTTCTGTTCAAGTTTCATTTGCTTTCATCACCGATTGAAGGAATTTGTTAATGGAGTAGTATCTTATTGAATATAGAGATTTCTGTGCCGCTTCTGCTGTTGAAGTAGCTAATTTTGACCTATTTTTTGCGTTATGTACTTGTTGGTTGTTAAGTTGCTTAAGGTGTAACGTGTTTCGTTTATGTAGATGCATCCAACATTGACATGCCCAAATGGAATAAAATCCATGGACGGGAGTTCGGGATTAGTCGTTCGATGATCCCATCTTCACCATTGACGATATTGAAAATTCTTCAAAATAAAGGTAGCAAGTTTATTGCTTCTACCAGTATCTTTGCAGCCATCACATTGATATGTTCATGTCGTTTACTCAAAATTTGGTCCTGCTACAGTTGTTTGTTAACTTGGCTTGGATGAATTATCCTTGTTTTGTTATGGTAGTTAAATATGTTGCTATGGATAAAAATCTTCCATGGGTATAAGAAAATATTTACTCTATTTTAATTCTTAATCAGCTATAGTTTGAGCTTCTGAGATCTTGATGTGTCGTTTGCTGCCTATTTTTCAATTGTATTGCATCTTGTTTCATTAATTGGAATTCTGATTTATCACGGAAAAGGACTTCATTTCCTTGTAATGCATAGGGTTTGAAGCCTATTTGGTGGGTGGATGTGTGAGAGACTTACTCCTAAATAGAGTGCCGAAAGACTTTGATGTGATCACCACAGCTGGACTTAAACAGGTCTTTATGAGCATTGCATAACTTCTTCTAGTTGTAACTTTGTTTTTAATTTCCCTCTGCCACAAAGAATGAGATCAATGTATTTAATAATGACATAGTTGGTTCCCTTTGTCTCATGCAGATTCGCCAAATTTTTCATCGTGCTCAAATTGTTGGGCGTCGTTTTCCTATTTGTATGGTTAATATTAAAGGCTCTGTTATTGAGGTAGTGATGCATTTCTATTGGACTATTTATGACCTTCTTTTACATAAGTTTTCCCTTTTTTTTCCTTGATCTATTAAGTAATGTTCTAAAAGTTTAATAATGTAAGGTCGGGATTTGAACATCTGCCTCGACCTCGAGAACAAATTTGTAATGTTTTAGAGCAGCATCGTTGTTCACACTTCTATAAAAAAATAGTTCATCTCACATGAATCCTTTAGAGCTTTAAATAAATCTAATAAACATATCAATATTATTTTTATATTTTCATATTGTATACTATTTATAGTAGGTTCCTAAATTAATTCAATAAAATGAGGCTCGGTTATGTCGTTTCATGTTGGAACCAAAATTTGTTACATAGGGTTGGTGTGAGTGAGTACAACTCCATCTATGGGCCTCAAGACATGGCTCTAGAGGCATAACTAAAAGCCCTTGAAAAACTATCAATTTAGGAATTTTTTCTTGACTTTTTAGTTATGTGAATCGTCAGGTTGGGAATGGCTCAAGTACCCATTTTAGGCGGATTGTTGGCGGATTATTGTGCGATCTCCGATTGTCAGTTATTCCTATAATTTATATTATGGCGTAGCGAAGCTTAGCCTATTGACCTACTTTCCCTTCTGGGATCTTGTCTTTCCACCACCTGACATATATCTTTTCAAGGTTGCCATTTGATTCTTCGATAACCATCATGGAGGGGCCTTGTGGTCATAGAGGGCCTTTGGGGTGCAAAGGTGATGGGTTCAATCCATGGTTGCCACCTACCTAGGAATTAATTTCCTACGAGTTTCCTTGACATCCAAATGTTGTAGTGTCAGGCGGTATGTCCCGTGACATTAGTTGGGGTGCGCACAAGCTGGCCCGAACAGTCATGAATATAAAAAAAAAAAATTGTTTCTTCGATTATTTCTTCTAGGAGGCCTTTTTTTGTCAACTTTGGCTTTCGTAGACTTTTTTTATATAGAGTTTTTGAATGTTGATGCTCTAATCACTCTCTTGGACTCTACCAATCTCCATCCAAGGAATTGGGATCTTAGACTACTAATCCCTCAAAAGGTTTCTCTTTTGGTTCTTCTTTTAGGATTTTGTGTCGCACAAACCATAGTTCCTCTCTTGTCTTCTCATCATTATGGAAGGCGAATATTCCCAAGAAAGTGTAATTTTTTGCTTCACAGGTTCTTAATAGAGGTATTGACATTGTGGATCATATTTGGAGACACTCATTTGCTTTTAGTCCACAATGATCTATTCTTTGTAGGAAGGCGTTTGCGGACCAAAGCCATTTTCTGTGGGGTTACCAGTTTGCTCGCTTGCTTTGAGTCTTCCTTTTTGAGGTTTTCAAGTTGTGCTTTGTGTCACAATCATGAAATATGTTTTGACGATCCATGCCCATGATGCGTCATGATGTGACCGAGAAGGACGGTGTTTTATTCAACACACAAAGATGAGTGCCCAGAGTGCTGAGAGAAGGCATGAAGAATCGAGCTTCTATGTTGTCAACAAGATCAGTGTCAAGGCTTAGTGGGGGCATGATAGGCCCGATCCATACCAATGATGTCAAAGCTTGAGATGGAGTTTTGATGAGGGAATCTAGAGTTAAGTTCGTTTAAGTCTAAGATGTAAGCTCGCCAAGTTTGGTGTCCATCAAACACCTAACGGACTTTCCATGCTAGCTTATGATCTCTCGCCAAAATGAAAATGTATAGGTGCCACGTTGAAAATGCTCTAGAATATACTATAGGGGGAGACATGGTGTCTCCACTACCCCTGAGCCATTTGGTTTAAGTTAGGCAATACCCCATGGCGCACAAGTGTGCCATGGTGTGGGCGAGGGTTGCAAGATGAATGTCTTAGATGACTTCCTTTGGAATGGAGATTCGAGGACAATGTCGGGTGGCATGGCATGGGTGGGCCAACACTGCGCCTCTTCCTATGGGTCGTAGGTTCGACCCTATATTGACTGGTGACATGCCATATGGAAGTCAACAATCAGGGACTGAGTTGAATGCATGTGCATGCAACATGCATGACCAAGAGTATTTTCGTTGTTCATTTTAATGAAGCTTGATTGAGGACTGAAGAACCTCGCAAGGGCTGACGAAGCCACAAAGCATGGGCAAAGAGAGTCAAGGCCAGAGTTCCCTTAAAGGTGGCCATGATGAGCAAAAGATCATGATGATGCAAAATCTAGAAAGAGGAACTGTGAGCATGACGCCTTTATGATGACGCACATAATAAAGTTAGACTAATGACAAAAGCTGTCCTTTCACTCTCCCACTAGAGAGAGCAATAAAGTATTTGGTGAAAAAGAAATAATAGGATTTCATGGCCATGAGATGTTGGTAGGTTTGGTCCCTAGCTAGGTTTAATGCCTCACTTTGGAATTTTTGTCAAAGGACTTAGGCAATGGTTCGTTAAGTTTTATTTTTTAAACCTTTTGGATTAGAGCCTTCTTCTTAGCCTAGTTTGACTCTTTTTTTTTGGTGTCTTAACGTTTGCTTATTTTTTTCTGTTCGATTGGTTTGTGGTCTCTTTTTTATTTTCATTTTCATCTCAATTAAAGTTTGGCTTCTTGACAAAAAAAAAAGAACAAAGAAGGAATTACCATCATGGGTTGGCATAGTGGTCAAATAAGAGCCTTGGAATTCATAAAATGTAGAAAGGGAATGAGTTTAAGTTCAACATATGGTGACCACCTACTAAAGAATTAATTTCCTACTCCTTCCAGTTACCTTGACAACCAAATGTAGTGAGATCGGATAATTATCCCATGAAAATAGTTGAGGTGTGCGTAAGCAGTTCTAAACACCCTCAAATACTAAAAAAAAGATGGAAAAAAGAAAAATAAAAATGGAACATTGCTTTTTAAATTTGTCTCATTCTCAAGGCAGAACAAGTTTAAGAGTGAGTCTTATGCCTTTATGAGGTGCACCGAGGCTTTAAGTCTTTATGCCTTATGAAATGACTAGAAGAATATAATCAATTTTTCAATCTTCAATCATAAATATGACAATCGGGGCTAGAGTTCCCTTTAAGGCTGGCCATGTTGAGGGAAAGATTCATGACAATTCACAGTCTAGAGAGACCAATGGTGACCCTTAGCACATAATAGGGTTATCTTATGGAAAAATTTATCCTGTTTCACCCTCTCTTTAGAGGGGAGGGGAGTACTCTAGAGGGCAATTAAGTATTTGATCGAAAAGGAATAACAAGATTTACATGATTGCAAAAAGGTCGGGTTTTGTCCGTAGCTAGGTTTAATGTCTCACTTTGGAGTTTTTGTCAAAAGACTAATGATTCGTTAAGCTTTTTTTCCTTTCACATTTGGATTAGAGCCCTCTTCTTGAGTTTGACTCTTTTTTTGGTGTCTTATTGTTTGCTCAATTTTTTGTTTGATTGGTTTGTGGTCTTCTTTGTATTTTTCATTTTTATCTCAATTGAAGTTTTGTTTCTTGACAAAAAAAGAAAGAAAGAAGGAATAATCATCTTTGGTTGGCCCAGTGGTCAAATAAGAGCCTTGGATTTCATAAAGTGTTCAAAGGGAATGAGTTCAAGTTCATTCCATGGTGGCTATATGTTTAAAAATTAATGTCCTTCCGGTTACCTTGAAGCCAAATATAGGGGGTCAAACGGTTGTCCCTTGAAAATAGTCGAGGTATGTGTAAGTTGGCCCAAACACTTACAAACACAAAAATAAAGAAGGAAAAGTAG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ATGGCGATTGTTTCTCCGAGAGCCAACAACGGCTTCATTTCTCGCATCAATGACCTAATCAAGCTTCAGAGGCTCAAACGCGATTTTACCAATGGAGAAGCTATTCGCGCTCCTATTTACCCAGCAATGGATTTTCATTCAGTGGGTCGTCAAGATGCATCCAACATTGACATGCCCAAATGGAATAAAATCCATGGACGGGAGTTCGGGATTAGTCGTTCGATGATCCCATCTTCACCATTGACGATATTGAAAATTCTTCAAAATAAAGGGTTTGAAGCCTATTTGGTGGGTGGATGTGTGAGAGACTTACTCCTAAATAGAGTGCCGAAAGACTTTGATGTGATCACCACAGCTGGACTTAAACAGATTCGCCAAATTTTTCATCGTGCTCAAATTGTTGGGCGTCGTTTTCCTATTTGTATGGTTAATATTAAAGGCTCTGTTATTGAGGTTTCAAGTTTTGATACAGTTGCAAAACATTCTCATGAAAAAGAAACAACAACATCTTTTCAAATTCCAAGGAAATGTGATAAAATGGACTTAATCCGGTGGAGGAGCTCTATGCAACGGGATTTCACAATTAACAGTTTGTTCTTTGACCCCTTTCGGAACGTAATCTATGACTACACTGAAGGCATTGCAGACTTAAGGTTCTTGAAGCTGCGAACGCTAATTCCTGCATCTCGGTCATTCAAAGAGGACTGTGCTAGAATTCTGCGTGGCTTAAGAATTGCTGCTCGTTTGGGATTGTCACTATCGAAAGATACTGAGACCGCTATGCGTAAACTTTCTTTTTCCATCGCAAGCTTGGATAAGTCAAGGTTAATGATGGAATTGAACTTTATGCTATCTTATGGAGCTGCTGCTCCTTCTCTCTACTTGCTTCAGAGGTTCAACCTGCTTGAAATTCTGATGCCATTTCATGCTGCATATCTTGATAAACAGGGCACTAAAACATCTTCTCTCAATTCCACAATGTTGATGAATCTGTTTTCCAATTTGGATAAATTGGTTTCTTGTGATCGGCCTTCAGACTGCAACATATGGGTTGCATTGTTGGTATTTCACATGGCATTAGTTAACAACCCTCAGAATTCTCATATAGTTCTGGCTTTTGCTGCCACCTTGTACCATGGGGAGTGGAATGAAGCTGAGGACTATGCAAAAGAAAACTCTCTTGTGCAGATCAATTTTAGGCCGGAAATTAAGAGTTCTGCACAATTTAAATCAGAGGAGCTTGCTAAAAGTGTTACTCACTTTGCTCTGAAAGTACAGGATTGCATAGCTTCTTTAACTTCAGCAGATTGTCGCTTAGAAACCATGCCAACCTCTCCACATTCTAGTTTGGTGGTTGTGTCCAAGAAAGCTGCCAAAGATGTTGGTAAAATTTTTGAAGTGCTGGTGAATGATGTTAAATCCTACAAAAATAAGCGGGGGGATTTTGAAATTGACTATCGAATGCTTGGGAAGGGTATTTTGAGTGAGAGTAGATATGTCTTGGGAAAAATTATCTTGGAAACCCTCAAAGAAGCAATTGTTGATGTTACTACTGAGGAAAATTATAATTCACCAGTCTCTGATTTGGCGAAGGACCAGTTAGTTGATGATAGAAATAAGAAATTTCGAAAACTGCCATCAAGTTCTGAAGTTAAGTGGGAAGCCAATAAGAAACACAAGCTTGTTAGGAAGAACGGAAGTATTTCTGACAAGGTGGCGGATGGAAGCTGCATTAACATGACAGAGATAAACAAAAAGGGAGTAGAGGCATCTCGATTACCCCATGTCGGATTAAATTCAACCGAGCATTTGACTTTAGAGTCGAGCAAATGCCATCACTTTGAAGTGAGGGAGACTAAGAATATGCAAGAAAGTCTTGAAACCATGGACAATCAGGTTAAGATCCCTTCACAGGAAGCAGGCTATACGGTTACGAAGGAGCTACTTTGTGCTGTAGAGGTCAACCCGAGGAAGATGGACGACAGCAATGGGGAAGAAGGAAAGCCAGAGAAGAAAGATCACTGTTCGTTGTCCCAGGGAAAGGAGAATATTAAAAAGAAATGCAGACATGTAACCGATATCAAGCAGCACAAACGTCCACTTTCCAGCATCTTTAAGTAA MAIVSPRANNGFISRINDLIKLQRLKRDFTNGEAIRAPIYPAMDFHSVGRQDASNIDMPKWNKIHGREFGISRSMIPSSPLTILKILQNKGFEAYLVGGCVRDLLLNRVPKDFDVITTAGLKQIRQIFHRAQIVGRRFPICMVNIKGSVIEVSSFDTVAKHSHEKETTTSFQIPRKCDKMDLIRWRSSMQRDFTINSLFFDPFRNVIYDYTEGIADLRFLKLRTLIPASRSFKEDCARILRGLRIAARLGLSLSKDTETAMRKLSFSIASLDKSRLMMELNFMLSYGAAAPSLYLLQRFNLLEILMPFHAAYLDKQGTKTSSLNSTMLMNLFSNLDKLVSCDRPSDCNIWVALLVFHMALVNNPQNSHIVLAFAATLYHGEWNEAEDYAKENSLVQINFRPEIKSSAQFKSEELAKSVTHFALKVQDCIASLTSADCRLETMPTSPHSSLVVVSKKAAKDVGKIFEVLVNDVKSYKNKRGDFEIDYRMLGKGILSESRYVLGKIILETLKEAIVDVTTEENYNSPVSDLAKDQLVDDRNKKFRKLPSSSEVKWEANKKHKLVRKNGSISDKVADGSCINMTEINKKGVEASRLPHVGLNSTEHLTLESSKCHHFEVRETKNMQESLETMDNQVKIPSQEAGYTVTKELLCAVEVNPRKMDDSNGEEGKPEKKDHCSLSQGKENIKKKCRHVTDIKQHKRPLSSIFK Homology
BLAST of Sed0011549 vs. NCBI nr
Match: KAG6596268.1 (hypothetical protein SDJN03_09448, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1071.6 bits (2770), Expect = 2.7e-309 Identity = 573/728 (78.71%), Postives = 611/728 (83.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. NCBI nr
Match: XP_022947617.1 (uncharacterized protein LOC111451426 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1070.1 bits (2766), Expect = 8.1e-309 Identity = 572/728 (78.57%), Postives = 611/728 (83.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. NCBI nr
Match: XP_023540398.1 (uncharacterized protein LOC111800784 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1069.7 bits (2765), Expect = 1.1e-308 Identity = 569/729 (78.05%), Postives = 611/729 (83.81%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. NCBI nr
Match: XP_022971476.1 (uncharacterized protein LOC111470184 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1069.3 bits (2764), Expect = 1.4e-308 Identity = 569/728 (78.16%), Postives = 611/728 (83.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. NCBI nr
Match: KAG7027820.1 (pcnB [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1029.2 bits (2660), Expect = 1.6e-296 Identity = 564/767 (73.53%), Postives = 603/767 (78.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P44439 (Poly(A) polymerase I OS=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) OX=71421 GN=pcnB PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 154.8 bits (390), Expect = 3.5e-36 Identity = 99/283 (34.98%), Postives = 159/283 (56.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0ABF3 (Poly(A) polymerase I OS=Escherichia coli O157:H7 OX=83334 GN=pcnB PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.2e-29 Identity = 84/266 (31.58%), Postives = 136/266 (51.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0ABF2 (Poly(A) polymerase I OS=Escherichia coli O6:H1 (strain CFT073 / ATCC 700928 / UPEC) OX=199310 GN=pcnB PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.2e-29 Identity = 84/266 (31.58%), Postives = 136/266 (51.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0ABF1 (Poly(A) polymerase I OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=pcnB PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 131.3 bits (329), Expect = 4.2e-29 Identity = 84/266 (31.58%), Postives = 136/266 (51.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8Z9C3 (Poly(A) polymerase I OS=Salmonella typhi OX=90370 GN=pcnB PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 131.0 bits (328), Expect = 5.5e-29 Identity = 91/284 (32.04%), Postives = 142/284 (50.00%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G6Y5 (uncharacterized protein LOC111451426 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451426 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1070.1 bits (2766), Expect = 3.9e-309 Identity = 572/728 (78.57%), Postives = 611/728 (83.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I3F4 (uncharacterized protein LOC111470184 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470184 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1069.3 bits (2764), Expect = 6.8e-309 Identity = 569/728 (78.16%), Postives = 611/728 (83.93%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CVT5 (uncharacterized protein LOC111014843 isoform X4 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014843 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 896.3 bits (2315), Expect = 7.9e-257 Identity = 503/738 (68.16%), Postives = 565/738 (76.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CWE8 (uncharacterized protein LOC111014843 isoform X3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014843 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 891.3 bits (2302), Expect = 2.5e-255 Identity = 503/740 (67.97%), Postives = 565/740 (76.35%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CW57 (uncharacterized protein LOC111014843 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014843 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 887.9 bits (2293), Expect = 2.8e-254 Identity = 503/749 (67.16%), Postives = 565/749 (75.43%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. TAIR 10
Match: AT2G17580.1 (Polynucleotide adenylyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 485.3 bits (1248), Expect = 8.1e-137 Identity = 257/484 (53.10%), Postives = 348/484 (71.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. TAIR 10
Match: AT1G28090.1 (Polynucleotide adenylyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 1.5e-98 Identity = 202/462 (43.72%), Postives = 286/462 (61.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. TAIR 10
Match: AT1G28090.2 (Polynucleotide adenylyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 1.5e-98 Identity = 202/462 (43.72%), Postives = 286/462 (61.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. TAIR 10
Match: AT1G28090.3 (Polynucleotide adenylyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 358.2 bits (918), Expect = 1.5e-98 Identity = 202/462 (43.72%), Postives = 286/462 (61.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0011549 vs. TAIR 10
Match: AT5G23690.1 (Polynucleotide adenylyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 334.3 bits (856), Expect = 2.3e-91 Identity = 184/463 (39.74%), Postives = 282/463 (60.91%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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