Sed0011427 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0011427
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 8524512 .. 8533511 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0011427
SyntenySed0011427
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
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mRNA sequence

CTTTAAACGAACCGAGCGGTTCGGTTGGGAAGAATTGACGGGACCAACCGAACCAAACTTAACGGGTTCGCTCCGGTCGTTTACGAGGAAACTTTTCTGTGCCGTAAATAAGAACATCCGATTTTGAGGCTCAGAAATTCAATCGCCATTTCAAAGAACTCATTGGATCAAGATTTTGATCTTTCCGATTATCAAAGAAAATCATAGTTCATAAGAAAGTTTGGATCAATTGAGGTTTTTCTATTTCAAATGCCGAAGCCTGAAGCTGCTGCTGCTGAATCTCAAATGGCCAGAGACAACGACGCTACCAATCTATCTCCCACGTTTATGTACTTAATGGTTCATGTATAATAAAGCTTCAGCTTGTGCTTTTACGGTCTGATTTTTTGTGCTGGAATATGCTACAGCTACACAATTCTTTTCAAGAGCAGGTTTATGTTTTCGGGCGAGCATGCATGCGGGAAGAGTTAAGAGATAGATGCTGATTTCATTCCTGCTTTCCAGTAAACAACTTATACTTCTTTGGAAACTCTTGATTTGATTTTGCCAAGAAGCATAACTCAACTGGCATAAAGTGCATATTTATGATCAAGAGGTCTTATGAGTTAGAAGTCTCATTCTCAATTGTTGTTGAACTAAAAAGAAAGCTATGAATTTGGTGCTCTTGAATTAATTTTATATTATGCAGTAACAACGTTTGAGTTGAGGAAAATTCAAGGAGGTTACTAAAAGTAGCCTGGTTGAGTTTCCCACTTGGATTGGTATTACTCTTGCGGCATGTTATCAGGCCTAACATTTATGGCATTTGGTCCAAGTTATTCATATGGCCTGATGGTTGTTATATGGACAGAAATGGAGTGATGGAGAAGCACCAACAGCTCTCCGGTATTTTTGCGTATATCATTGTGCTGGCTATGAATGGACTTCAGAAGCATTCCTTCATGCTGTTGCAAATGAGAGCCAACTAAAGAAGTCAAATGACTCATTGCTTCTATTCTCATTGATCTATGTCATGCTAAATTTTCTGCTGATCCGGTCTTCTCGAGTAGAGACTTGATTTTTGCTAATTCTGTAAGTAGCCTTTTCCTATGATTGTGAAATAATTCGTTTGGCCTACCGATTTTATTTTTCACTTTTTTTTATTTATATGTTGGCAAATTTTGGTGTAATTTTGTGTTGTTGCCTCTCGGTTATGACTGAGGTGAACGCAGTTTCCCATGTTGTTTGACAATTTTAGGGTTTGAAAAAGAGAATTTACTTTTGTTCTCTCAGAGTCTCGTCTTTGATAAGCATTTAATTTACTTTGCAAGTCAATATTAGATAAAAGCAGGTATATGATTTTTAGAAAGTCTAGTGGTTTCATCATAAGAAATGCTAATATAAATTGATTAGTCGCTCAAGTTGAATGTTCCTACATACAGAGGAATTATTTTTAAACTTCATCTTAGATTTCACTCCATGCAACATAGATGTGTGTTGTATTAACTTTAATCAGCACTTGTTCTTGTGGTAATTTCCTGATATTTCTTCAGCAGATGATTACTACCTTACATTCTATCACACAGGATATTTAGAAAGAGTTTATGAAATCGAATGGGTCAGTGGCACGATTGGTTATCTTGTTTTGTGTTAATCTATTTCAACTCCACGGTCACAAGTTCGAGCCCGGAAATCGGTATTTGGCTCTCATATTATTTTAGAGCAGTTGTGTCATTTATGTAAGGTTTGTTGTTCCCCCTTCCCCCAATATATGTACTAAAAAAAAGCAAGAGTTTATGAATACTCAAATGTTCATTGAAGCATGTAACTTTTGTAGCATATAATTTTCTTGACTATTACAAAAGATATGATTTTTTAGGATAACATACACAGCCATATTCATCAAACGTTACTTCAAGGTATGCTTTGGTTATAAGCGTAACTTTCTTTTTATCAGATTATCATTATTAATAATGTTAGTTTTTCTTCTCTACAGAACTCTTCATTCTCCTTCAGTAGCTGCTTGCCTTCAGGATGGACATTTTTATTATTCTCAGGGGTTTTCACTCTTATTTCGGAGGGATTATTTCTGGACCAGCAAAAAATTTGGTCAACGTTTTTGCACCATTTTTCGATTGGTTTGGTTTGCTTCCTTATGTCATTATTCGTCATCTATCGCCGTGAGGGATCCTTTATCAACAAAATCACTTGCTTCCGTCAACATTCAGATTGACAAGCACTCTCCTGGGGAACTGCATGTTATATTTAAATAGAGCAATATTTGCCTATTTGCCTCGTTGTGACTAAGGAGGCAAGTCCTCCTTAAAGGCACAAAATCCCATTGGAAATTTGGACTTGATCGAATAAATTGTGGAAAGGCAATGAGGATAATATCCAGAACACATCCATGACAGGAGTCACAAGTGAACACTGCTTAGCTACGGTAACCTTTTAAAAATATCTCAGTAAACTAATTACTGATCAATAATCTATGTATTGTAATTTATTTTCATTATCCTCTCAAGTTTTATGATATATTTGATATCTTGACATAAGTACATTATATCTGGAAACTTCAAAGAGGTAGAATAGTCATCGTATATTATTCACGAGAGTAATCACATATATAGGAATACAAGAATTCCTAATCCTACTAGGAAACCCAAACAAAGCCCTAATCCTTAAAGAAAACCCTAAACAAAGTCCTAACCTACCAGGAAACTATAACTTAAAATACACAATTACAATAAAGGACAAAACTCTAATATACTACTAAACAACTAATAATCTCTAACAATATCATCTATCAGTTTTTCTATCTTAATTTCATTTTTCTTGCAATTTGATTCCAATATTTCTTTTTTCGAAGATATCTCATTTCTGATATTTGCTTGTAATCCTTATACATAGAAATATATGGACTCATGAGTTGCCAACAAGAGTAGTTGCTTAGCAGCATTAGTCTACACCCAATGACCAAGAGGTCATAGGTTCAATACCCCCACTCCAATTGTTATAATCTCAAAAAAATATATATATGGACATCATGTGTAAGGTCCGAGGCATATTACCTGAATCATTTTACATGAATGAGAATGATTGAGTTCATACTAAAATTAATCTCTGTATGAGATGCAAGTTCCAATGTTAAGAATTGATCTCACTTCTACATGAGGGTCGAAGTTTGAATGAGTAGGAGTATTTGCTGTCATGTGCAATGGTAATTACATTAATTCTTGATTCCAATTATAATGATTGTGCTGTGTGATATTAGATTTCATCACTTTCCTCTTTCAACCATAAGTTTGATAATCAATCCTTGTATGGGCTGTAGTTGATATTTCCTTTTTACCATGTAGACATGAGTTTTTAAGCATCATCTAGTGTTTGGTTATTAGGAATAGCACAGATTAACAGAAGTTTGCAAGTGGCCATGCTTCCTTTATGTAAAACTCTTCCAGCAATCATTTCTTGAGTTTCTGAGTTGTTCTGATTAACAGCCAAATTTTGCAGGAGATTAAAATTTATCCATCCTGAGTATTATTTTTTGGTGGTTTAATCTTATTAATTCTGCTGACTTTTTTTTCCCTTCATTTAGGATCTCTCTATCAGATATGTTTTTCATTGATAGAAATGCACAGATACCTAGTTTTCTCTCGGGAACTCCCTTTATTTTTATCAGGTTCCAGACTCACCTGTGACATTATTCCTTTGATGTCTCCTAGTGTCTGGCTTAGGGACGGACATGGGTACCCTTGTTTTAAAAAAGAAACTCTCTTTATTTTTATCTGACCAAAAAGTGAGGATTTCCCCATCTTTCAGAGAATCGTATGCATACCCGGTCTTCCGTACTCTTTTTGGACTTCAAAATGGGAGACCGAGGATTTGGACTTCTAACCTCTTGGTCGAATGTGTATGCGTTAACAGGTTAGCTTTCTCTGGATTTAGTTTCAACAAAAATAATTGCCATGCCCTGTGAAGAGGCACAGTAGGTAGAAACATTAGAGCTAAAACTAACAAAAGTCATTGTTCAGGCCACTCTAAAAAGACACTTTTTTTCCTTTTTTTTTTCCCAAGATCTTTTCTAAAAGCCTTCCATATCACTAATTATCCAATAACATACTTTCTAGGCTCTTCCATCTGTCAACAAGTCGTAGTTGTTGACAACATTAAAAAAACCCCTAAACCCTAAACTTCCACATTGATAAGACAATATACTGCTGGTTTTCCCCCCTTTTCTTATATTTTTAACTGTGTTCTTCACACAATCATGTTTCAAGGATGCCCTTTTTCTTTCTGCACTTCCACCAGCAAGTAAAATGGAAAATTACCCTCAATTATCATCCTTTAGTATTACACTTGTAAAAGAAAAGACATAGTATGATATCCCACTATTTATGCCCCTTCTCAAGTTAGTTATTATGACACCAAACGTAGCAATATGAATACCAAAAGCAAAGTGTTCATTTGAATTGTGGGATTCAAGTTGAACTCTTCATCATACTATACAAAGAGCAAGACATGATAGACTTTTTGAGCTGTGCTGTTTTATATTCCTCCATTTCTCTTATAAAATGCCTAGTTTATTTAATCAAGCACCAATTGGGAGGAGTAAGGAAGAAGATGATGAGCATAGGAGCCGTAAATCTATACGGCGTTTTATGTGTTTCATTTTTCTCGATGAAAGCTCGATTTCTAGATCGAAAAACCAGGCACCAACAAGAGAGGAAAGGAAGAAGAGGATGGGCAAAGGAGGACAGCATCCATGATTACCAGAACTACATCAAGGGGGCACAAATTTATTCAAAAATATGTTTGTTTTCATAAATGTCATAGGGAATTTATAGATTAAACCTATAAATCACTAGTCTAGCATACAAACCACTCGAAAAAAGAAGCATCGGAATGAATGTTGAATGCGAATTTTCGTCCTTTGGATAATCCTCATGTTTAACCTTTTAAGAGATGTTTGGTTCGTAGTTCTGGTAAAATTGAATTTGTAGCCTTTTTTTTAGTACAAG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Coding sequence (CDS)

ATGATAGACTTTTTGAGCTGTGCTGTTTTATATTCCTCCATTTCTCTTATAAAATGCCTAGTTTATTTAATCAAGCACCAATTGGGAGGAGTAAGGAAGAAGATGATGAGCATAGGAGCCGTAAATCTATACGGCGTTTTATGTGTTTCATTTTTCTCGATGAAAGCTCGATTTCTAGATCGAAAAACCAGGCACCAACAAGAGAGGAAAGGAAGAAGAGGATGGGCAAAGGAGGACAGCATCCATGATTACCAGAACTACATCAAGGGGGCACAAATTTATTCAAAAATATGTTTGTTTTCATAA

Protein sequence

MIDFLSCAVLYSSISLIKCLVYLIKHQLGGVRKKMMSIGAVNLYGVLCVSFFSMKARFLDRKTRHQQERKGRRGWAKEDSIHDYQNYIKGAQIYSKICLFS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Sed0011427 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Sed0011427 vs.
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BLAST of Sed0011427 vs.
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Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0011427.1Sed0011427.1mRNA