Sed0010241 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAACTCTTCAATTTTCTTAAAGCTCTTAGCCATGATCGGTTGGGAAGAGGTTTTTAAGGTCGTAGCGGCCATGGCGCCGCTGTACTTCGCTTTGATCTTAGGCTACGGCTCGGTAAAATGGTGGAAAATTTTTAGCACTGAACAGTGCGACGCCATCAACAAACTTGTTTGCTACTTCACTCTTCCTCTCTTCACCTTCGATTTCACTTCCCACATCGACCCTTTTCACCTCAACTTCCCGTTCCTCGCCGCCGACGCCATCTCCAAGGTCGTTACCATTCTCGTCCTTGCCATTTGGGCTAAGTGCAGTAGTAAAGGCAGCTATTGTTGGTCCATCACTAGCTTCTCTCTTTCGAGCCTCACGAATGCGCTCGTCATCGGCGTGCCACTCGTGAAAGTCATGTACGGCGACATGGCGGTTGATCTCGTTGTACAGGTAGGTTTCATCAAAGAAAATGTTAGGTTTTAGTTTTTTAGAAATATACATAAATAGTTCTAAAATTGGTTCAAAATCGACTGATAATTTTAATCGTAAAATCTTTATTGTCTGGTACGTGTGAAACTTGAGACATGCAATTTTATTTACAATATGTAATGGGGTCAACCATTAAAGTTAAATGATTATTTATAAGTGAGTGATGCTGATGCCAACAAGAGTAGTAACTTAGCGAGATCAATGTATATTTAATGACCATAAAGTCATGAGTTCGAATCCTCCCCTTTCAAAGTACTCACGTTCGTCTCAAGATTTGAATTCCGAAATATATGGAGTTTTTATTGTTAAGCTCATCTCCACAAGTTTAGAACATAAACTTTCAAGTGAGCATATTTTGAACACTTCAAGTTTCTATTAACCAAGCCGTCATTCAGATTTTTTAGTACGAGTGTCTAGTTCATGTAACTTATATCCTTTGTCGATAAATATGTGGATATTTTAAATTTTCCATACAGGGTTCGGTGATTCAAGCCATTGTTTGGCTTACGATACTATTGTTCGTGTTGGAATTTCGACGGACGAGGTTAAATTTAGTAGCTGCCAAAGGTTCTTCAAGCTTCGACGGGGACGAGCCGGGAAAAGCTGTTCAATTGTCTGGAGAGGGAGGTAAGGATTTGGAGGGAGGAGCCATGGAGGTTGAGAAAAGAAGCAACAGCAAAGAGCCTTCTTTTAAGCTTTTGATGAAGAAAGTTTGGCTCAAGTTGGTTGCAAATCCCAACTCTTATGCTTGTACCATTGGTTTTGCTTGGGCATTTGTTGCAAAAAGGTACTTCCATTATGTTTCAAAAACTAAAAAGAAAAAGTAGTTGTTGTTTTATTTGTATTTTATTCCATAAACTAATTCAATCAATTTAACTTTGTGATCCTTAAACTTTTTGCAACTTTAGTCCCTATAAATTTTTAAATATTCTCTTAGATTCTCAACTCTTAAATTTAATGTTCTAAATTTGTTTTTTCTTCTTATATATAACTTTTTTTAATTAAAAAATATTGTAATTGAAGATTCAAATTCAAGACATTTTCTTTGATGAGTTATATATAGTGTTTGTTGAACTTTGTTTTCATTGGCTTAAATTAAACTTCCAACAACTATTCAACATAAATCCAAATTTGTTTTTGAAATTCACACGTATATTTTGCATGTGATTTATAAATTATAGGAGGAAAGTACATTCTATAATAGTGGCTTACATTGCACATAATTAATTAATTGAATGTCTAAGCACTAAAAGAATATTTTTCTACGAAACTGAGAAACTAAATTCTATAGAATATTGGATTATTATCTAAATCGAGGTGATAATTTAAATCAAAAGTGAAAAACAAAATAGACAATCTGGATTAGATTTTTAGAATGTTATTATTATTGATTAGTATAGTAATGTTTTCTATTTAATTAATGTGTTACTTGTAAGATGTTTTGTTCATGTTATATTATATAATTTTATTTTGAAATTTATGCAGATGGCATATTGAAATGCCAAGCATTATGGAAGGATCTATTTTAATCATGTCAAAAGCTGGGACAGGCACTGCAATGTTTAATATGGGTAAAATTACTTCTTTCAATTTTCCTTTAATCAATTTTAGAGCTGATTTTATCCCATTATTTTAAAAATATTTTTTTGAAATACGACAAAAGTCTCACATTAATAAGATCATAGCATAAAATAAAATTATATTTATAGAAAAAAATTTAATTTATTTCTACAGTATGCTTCTATAATGAGTGGACCTGATTAAGAAAGTGTTCAATCTCCTAACAAATACCATGTGGTTTGAAGAGTCAAATTGATTTTATAGATAAATTAATTATTTGTCCTAACTATTGAATATTTAAATCATATCAATATGATTTGATTTGTTATGATTGGTGCTTAAGGTTTTTAAATTGTAGTAAAATTTAAAATTCTTTAACCCTTTAATTCTTTTTTATAGAGAGAAATTAAATGGTTCTAGTTGAAGATTGCGTGGAATCTATTAAACAGTTGCATGACATAAGCCGGAAAGAAATCGAAGAGTAAAAAGAATATAAGTGGCTTTGTTAGTTAAATTTATTTACAATTAACAAAAGTTAGAATTAAAACATAATACATTAAAGATATTATGTAGTATAGTATACTAGTTTTCAACATTATTTTCAAAAAATGGAAAATAAATTGGGAGAAAGAGAATTATAAATACCGACTATAAGGATTGAACCTATGATCGTGAGTAAAAAAGATTTACAATAAACCAGATAATCAATCACATCACTAGACCTATTTCGTAGTTCAAAATGAATTTAAGGGGAACATTTTGGTTTTGGTTGAGATTTTCCATTTACTATAAATGATTTATTTTTTCAAAATTCTGCTCATCATCAATTTTTTTGTTTTTTTTAAACATGGAAAATCCCAAATATATATAATTTTCAAAAAAACAATAAAATATAAATTAAGATCTCGTTTGATAAATATATAATTTATTATTTTTATTTTTAAATTTAAGCTTGTTTTTATTTAAGTTCTACGTAAATAATTTTATCTTATTTGAAAAAAATGTATTTGTGAATCTTAATCAATTTTTTTTAAAAAAAATTAAAAGGATTTTATTTAAAGTTTTTAAAATATAAATAGTGTTAAGATTTCACATCGAAAATGGCACAGATGTCACAATACATATATAAAAAAGGTGGTTAACTCCTTACATAATTAATTAATTTTGAGATGATGAAATTTATTCTATATAATATTACATCATAGTTCATTAAATTTGAATGGATATTAGTCTTATAAAAATGAAATTGAAAGGGCATGCTAGAATTTTACTTTGGTAAGAGTTGAAAATCTTATAATAATATATAAGAAAGAGTTTTTTGCTTCCTTCTCAAAATTTATGCTTAAAAAATAATTAATTAACATTCAAAACAAAAGTTAAATGAACATTTAAAAGTTACGTGGAAGAAAACCAACACAGTAGCTAAGAAGAAATAAATTTATGTTTAATAATTTACATTTAAAATTGAGATGATCATTTCCAAAATTCTCTAAACTGAGGCCAAGGGAATCAAATCAGGTGATGGGGAATTAATTCTCGCATCGATACTTTGAGGTCACTAATAATTATCGATAACAATAATTTATATGAATCTCTGAATTAGCATAATATTGTTCACTTGAAATATACATCCAGTTTCAAATATTTTTATTCTAAACCGAGACCAATTTATTGATATTATTCAACTATCATGAGATGACTCAATTGGTCAAGGAAGGTTTTGAATGCATAAATGGATGGGTTCAATCCCCGTAGAGATTACCAACCTAGAAGTTAATGTTTTATAAAAAATTCAAATGTTGTAGGGTTAGACGGTATGTCCCTAAAAACCAATTTATTGATACTAGAATTTTAAGCACCCGATAATTTTTTAAATAATAAATTATATATATATATAATTATAAATGATTTCCTACATTTTTATACTAAATTTAAATCATCAAATAATAATTTCAATATAATATTGAATTTTATAACTATTTTTTCATGTTAATTAAATTTATTAAAAATCACATTTATGTTAAAAAACAGTTAATATTTTATTTTGAGCTTAAAAAAAATAGGTGTTATTATTTTAACAAAACTTAATAGAATTTATCGCATTAAAATTAAATTTTAACTCTGAATTTTAAAAATCGATTCTCTTTAATTTTTTTCTCAATTTATCTATTAATAGACCAATTACTATTGAAATATAAACTTTATAAGAGTTATATCATTATTATAATTATAAATATAAATAAGCTAAATATATTTATTAATATACATCTATGAACTTACCTTTAACCTCAAATGACAATTTTATAATTATTCAAAATTTATTTTTCTACATCTCCAAGTCAACAATTGAGCAACAAAAGATCCTTAAGAAGTAAAATCGTCCAAAAATGATTTACCTTTTAAGCCACACTTTAAGGTAGTATGATTATCCAAGTTGAATATATGTACTCTCATGACTTTACTTTTTAATTTCACCCAAAAGATCTCATACTAGTGGACATTGTTGTTATCACTTAAATATTTATAATCTTCTCCTCGTCTAACTAATGTGAGATACTATATTTACATCCCAATAACTTTTCGTTTTTTATAATTAATATTTTATTCATTTATAATTGCTCACTACACATTAATCATATGCAATTGTTTCTTTAATCAATCTTTCCAATCAAACTCAAGTACTAATAATTTTATGAGATAGATATTTTTATCCCAAACAAAAATACTCATTCCTCAATGTTCTTATTCTCTATAATTATTTCATTCCTCTTGTCTCAAACGCTAAGTAAAGAATAATTTTGTAACCATGAAAAGAGAATATTATTTTTGTGTTCATAATGGATGTTGGTTGCTCAAGTGCAGGAATCTTCATGGCTTTGCAAGAGAAATTGATAGCTTGTGGACCAACACTTACCATAATAGGAATGGTTTTAAAGTTTATTGCTGGACCAGCTGCCAT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GAACTCTTCAATTTTCTTAAAGCTCTTAGCCATGATCGGTTGGGAAGAGGTTTTTAAGGTCGTAGCGGCCATGGCGCCGCTGTACTTCGCTTTGATCTTAGGCTACGGCTCGGTAAAATGGTGGAAAATTTTTAGCACTGAACAGTGCGACGCCATCAACAAACTTGTTTGCTACTTCACTCTTCCTCTCTTCACCTTCGATTTCACTTCCCACATCGACCCTTTTCACCTCAACTTCCCGTTCCTCGCCGCCGACGCCATCTCCAAGGTCGTTACCATTCTCGTCCTTGCCATTTGGGCTAAGTGCAGTAGTAAAGGCAGCTATTGTTGGTCCATCACTAGCTTCTCTCTTTCGAGCCTCACGAATGCGCTCGTCATCGGCGTGCCACTCGTGAAAGTCATGTACGGCGACATGGCGGTTGATCTCGTTGTACAGGGTTCGGTGATTCAAGCCATTGTTTGGCTTACGATACTATTGTTCGTGTTGGAATTTCGACGGACGAGGTTAAATTTAGTAGCTGCCAAAGGTTCTTCAAGCTTCGACGGGGACGAGCCGGGAAAAGCTGTTCAATTGTCTGGAGAGGGAGGTAAGGATTTGGAGGGAGGAGCCATGGAGGTTGAGAAAAGAAGCAACAGCAAAGAGCCTTCTTTTAAGCTTTTGATGAAGAAAGTTTGGCTCAAGTTGGTTGCAAATCCCAACTCTTATGCTTGTACCATTGGTTTTGCTTGGGCATTTGTTGCAAAAAGATGGCATATTGAAATGCCAAGCATTATGGAAGGATCTATTTTAATCATGTCAAAAGCTGGGACAGGCACTGCAATGTTTAATATGGGAATCTTCATGGCTTTGCAAGAGAAATTGATAGCTTGTGGACCAACACTTACCATAATAGGAATGGTTTTAAAGTTTATTGCTGGACCAGCTGCCATGGCCCTTGGCTCCATTGCCATGGGCTTACGTGGTGATGTTCTTTGTGTAGCTATCATCCAGGCAGCTGTACCACAATCCATTACATCGTTTATTTATGCCAAAGAATATGAGTTGCATGCAGAAGTTCTTAGCACAGCGGTGATCTTTGGGGCAATAGTTTCTCTTCCTATATTGGTTGCTTATTATGCAGCTTTGGAGTTTATTACACATTAACCTTTTAAGACGGGACATTTTTCTAAAGAATGAAAAAAAAAGGGAG ATGATCGGTTGGGAAGAGGTTTTTAAGGTCGTAGCGGCCATGGCGCCGCTGTACTTCGCTTTGATCTTAGGCTACGGCTCGGTAAAATGGTGGAAAATTTTTAGCACTGAACAGTGCGACGCCATCAACAAACTTGTTTGCTACTTCACTCTTCCTCTCTTCACCTTCGATTTCACTTCCCACATCGACCCTTTTCACCTCAACTTCCCGTTCCTCGCCGCCGACGCCATCTCCAAGGTCGTTACCATTCTCGTCCTTGCCATTTGGGCTAAGTGCAGTAGTAAAGGCAGCTATTGTTGGTCCATCACTAGCTTCTCTCTTTCGAGCCTCACGAATGCGCTCGTCATCGGCGTGCCACTCGTGAAAGTCATGTACGGCGACATGGCGGTTGATCTCGTTGTACAGGGTTCGGTGATTCAAGCCATTGTTTGGCTTACGATACTATTGTTCGTGTTGGAATTTCGACGGACGAGGTTAAATTTAGTAGCTGCCAAAGGTTCTTCAAGCTTCGACGGGGACGAGCCGGGAAAAGCTGTTCAATTGTCTGGAGAGGGAGGTAAGGATTTGGAGGGAGGAGCCATGGAGGTTGAGAAAAGAAGCAACAGCAAAGAGCCTTCTTTTAAGCTTTTGATGAAGAAAGTTTGGCTCAAGTTGGTTGCAAATCCCAACTCTTATGCTTGTACCATTGGTTTTGCTTGGGCATTTGTTGCAAAAAGATGGCATATTGAAATGCCAAGCATTATGGAAGGATCTATTTTAATCATGTCAAAAGCTGGGACAGGCACTGCAATGTTTAATATGGGAATCTTCATGGCTTTGCAAGAGAAATTGATAGCTTGTGGACCAACACTTACCATAATAGGAATGGTTTTAAAGTTTATTGCTGGACCAGCTGCCATGGCCCTTGGCTCCATTGCCATGGGCTTACGTGGTGATGTTCTTTGTGTAGCTATCATCCAGGCAGCTGTACCACAATCCATTACATCGTTTATTTATGCCAAAGAATATGAGTTGCATGCAGAAGTTCTTAGCACAGCGGTGATCTTTGGGGCAATAGTTTCTCTTCCTATATTGGTTGCTTATTATGCAGCTTTGGAGTTTATTACACATTAA MIGWEEVFKVVAAMAPLYFALILGYGSVKWWKIFSTEQCDAINKLVCYFTLPLFTFDFTSHIDPFHLNFPFLAADAISKVVTILVLAIWAKCSSKGSYCWSITSFSLSSLTNALVIGVPLVKVMYGDMAVDLVVQGSVIQAIVWLTILLFVLEFRRTRLNLVAAKGSSSFDGDEPGKAVQLSGEGGKDLEGGAMEVEKRSNSKEPSFKLLMKKVWLKLVANPNSYACTIGFAWAFVAKRWHIEMPSIMEGSILIMSKAGTGTAMFNMGIFMALQEKLIACGPTLTIIGMVLKFIAGPAAMALGSIAMGLRGDVLCVAIIQAAVPQSITSFIYAKEYELHAEVLSTAVIFGAIVSLPILVAYYAALEFITH Homology
BLAST of Sed0010241 vs. NCBI nr
Match: XP_022937707.1 (auxin efflux carrier component 5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 1.3e-175 Identity = 326/371 (87.87%), Postives = 345/371 (92.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. NCBI nr
Match: XP_022966048.1 (auxin efflux carrier component 5 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 2.8e-175 Identity = 325/371 (87.60%), Postives = 345/371 (92.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. NCBI nr
Match: XP_023536981.1 (auxin efflux carrier component 5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 621.3 bits (1601), Expect = 5.3e-174 Identity = 324/371 (87.33%), Postives = 344/371 (92.72%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. NCBI nr
Match: XP_038889666.1 (auxin efflux carrier component 5 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 615.5 bits (1586), Expect = 2.9e-172 Identity = 321/370 (86.76%), Postives = 343/370 (92.70%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. NCBI nr
Match: XP_004152830.1 (auxin efflux carrier component 5 [Cucumis sativus] >KAE8651707.1 hypothetical protein Csa_006543 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 602.4 bits (1552), Expect = 2.6e-168 Identity = 313/373 (83.91%), Postives = 338/373 (90.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFD0 (Auxin efflux carrier component 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PIN5 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 7.6e-131 Identity = 248/368 (67.39%), Postives = 294/368 (79.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5JLM1 (Probable auxin efflux carrier component 5a OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PIN5A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 400.2 bits (1027), Expect = 2.5e-110 Identity = 221/375 (58.93%), Postives = 272/375 (72.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: D5A7J3 (Probable auxin efflux carrier component 5b OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PIN5B PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 369.8 bits (948), Expect = 3.7e-101 Identity = 199/381 (52.23%), Postives = 259/381 (67.98%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6ZIB5 (Probable auxin efflux carrier component 5c OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PIN5C PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 354.4 bits (908), Expect = 1.6e-96 Identity = 191/379 (50.40%), Postives = 250/379 (65.96%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0JJV0 (Probable auxin efflux carrier component 8 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=PIN8 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 248.4 bits (633), Expect = 1.2e-64 Identity = 136/365 (37.26%), Postives = 205/365 (56.16%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FBZ5 (Auxin efflux carrier component OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444027 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 626.7 bits (1615), Expect = 6.1e-176 Identity = 326/371 (87.87%), Postives = 345/371 (92.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HQQ5 (Auxin efflux carrier component OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111465776 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 625.5 bits (1612), Expect = 1.4e-175 Identity = 325/371 (87.60%), Postives = 345/371 (92.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D820 (Auxin efflux carrier component OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018220 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 599.0 bits (1543), Expect = 1.4e-167 Identity = 312/370 (84.32%), Postives = 338/370 (91.35%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LH23 (Auxin efflux carrier component OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G074170 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 594.3 bits (1531), Expect = 3.4e-166 Identity = 311/373 (83.38%), Postives = 336/373 (90.08%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. ExPASy TrEMBL
Match: D7SPS3 (Auxin efflux carrier component OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VIT_04s0023g00320 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 508.4 bits (1308), Expect = 2.4e-140 Identity = 259/368 (70.38%), Postives = 305/368 (82.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. TAIR 10
Match: AT5G16530.1 (Auxin efflux carrier family protein ) HSP 1 Score: 468.4 bits (1204), Expect = 5.4e-132 Identity = 248/368 (67.39%), Postives = 294/368 (79.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. TAIR 10
Match: AT2G01420.1 (Auxin efflux carrier family protein ) HSP 1 Score: 246.1 bits (627), Expect = 4.3e-65 Identity = 184/610 (30.16%), Postives = 257/610 (42.13%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. TAIR 10
Match: AT2G01420.2 (Auxin efflux carrier family protein ) HSP 1 Score: 245.4 bits (625), Expect = 7.4e-65 Identity = 184/614 (29.97%), Postives = 255/614 (41.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. TAIR 10
Match: AT5G15100.1 (Auxin efflux carrier family protein ) HSP 1 Score: 243.8 bits (621), Expect = 2.2e-64 Identity = 144/372 (38.71%), Postives = 226/372 (60.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0010241 vs. TAIR 10
Match: AT5G57090.1 (Auxin efflux carrier family protein ) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 2.6e-62 Identity = 182/646 (28.17%), Postives = 267/646 (41.33%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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