Sed0009054 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0009054
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG10: 7866071 .. 7870783 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0009054
SyntenySed0009054
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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ATGGATTGCCACAATGAAAGCATGGAGAAATCAGACTCTAGCGGTTCCACTTTGGTTGAATGCACACATGCTCAAATAAATGAGTCGGATAATACATATCTCAAATTGAAGGAAAATATGGGGTTTGATAATTGTATTTCTCTTCAACACTCAGATTTAGATCAACAAAACAATGCATCTCTCTACAAAGGTATAATCCACCACTCCCCTAATTATCCTATTGTGCAGGATTCTGCAGCTGAGAATGATATAGCTATTGATTTAGTGAATTCCAATTCACAAGATTGGACCGAAAATGTCGTCTCTAGCCCAGATAATACAGAAAAAAATGAACAAAATTATCAAGAAGATATACAGGCCTCGACTCAAGAAGAAATTATTGAAGACAGTCTGGATATCCTATTCGCAACTGAGCAAGAGATGCATGAGCTTGAACACATTCCTGGAGAATCTGAAAAAGAAAGATTTAAAAGTCAGTTGTACAGATGGATGCTGACCAACAATTTTACCATTCTACCACAGAATGTGTTGAACGACAATTCATTTAAATATCTAGATACTGAACAAAGATCACAAGGGCAGCTGGACCAACATGGGCAGTGGGTTAATCCATGAAGATTCTGTCTTGGAATGTAAGAGGTATGAACTCCTCTTATAAACAAGTTCTTATTAAAACTGAACTTTTTAAAATTCATCCAGATATTGTTATTCTCACGGAAACGAAGCTGAAAGATCTCCCTCCTGATTCCTTCATCAAATCTCTGTGAAGTTCTATTGCTATTGGTTGGTCGTCGTTTGAAGCGGTGGGTGCCTCTGGAGGCATATTGATCATGTGAGACCTTCTTTCTTATCAAGCGATTGAAGTTGTTCAAGGCGAATACACCTTATCAATTAATTTTCAACTCTTGGATTCCTTTCAATGGTTTCTTACTGGTATTTATGGGCCAGCTAAATGCAAAAAACGCAAGAAATTTTGGCAGGAGCTCAATGCTATTAGCGGTTTTTGCAGTCCGATTTGGGCTCTTGGGGGAGATTTTAATGTTTACAGGTATAAGAATGAAACCACTTCTGATCGGCCAGCTGTAAGAAGTATGAAGGATTTCAATAATTTTATTGCCAAAGCTAACCTCATCGATCCTCCTTTATTGAATGCGCTTTTTACTTGGTCGAATCTCTGATCAAATCCGAGCCTTTGTAGATTGGATCGATTTCTCTTCACTGAGGATTGGCTCAACAAATTTAGTTTTCATCATTGTCGCCGTCTCAGTAAAACTACTTCTGATCACTTTCCCATTCTCCTTGAATCAAAGGAGCTGAAATGGGGTCCTGCTCCCTTCAAGTTCGACAACATTTGGCTTGATAATAGGAATTTTCAGATGAATTTGCCTATTTGGTGGTCGAATACAAAGGAGGAAGGCTTCCCTGGATATAAAATTATGAGAAATCTCAAGGAATTAGCTAAGAACTGCAAGAGCTGGAATGCCTCTGTTGTCAAAGCAAATGTCAACACTGAAAGTTTAATAATTCTTGATATTGATGCTATTGACAAAAAAGAATACAATGGTACCATCAACGAGGAAGACATCCAGCAACGGATTTTGCTCAAAACAAAGCTTTGTTTGCTAGTTTTGGAGGAAAATAAGAAACTTATACAAAGATACAAGTCTCAATGGTCGTTGGAGGGGGATGAAAACAATGCTTTTTTTCATAAAATGTGTTATGCTAGAAAACGATACTCATTTATCAGTGAAATCACCAACCATCTGGAGGAAAGCTATGTTATTGATAAAGATATTGAAGCGGAACTTATCCGTCACTTCTTAGAGGTGTATGATTCTAAAGGAAATTTTGCAGATAATAGAATGATTGTTCAAAATCTCCACTGGCAACCCATTAGCGAGGTTCTGTCTAATAAATTGACTAGCCCTTTTTCCCTAGATGAAGTCACTAGCTGCTTGAATTTGCTTGGATCGAATAAAGCTCCAGGCCCAGACGGTTATAACATTGAGTTTTTTTAAAAAAATTGGCACACCTTCTATTCTTCTATAATGAAGGTGTTTCACGATTTTTTTCAAACAAGTATTATGAACAAAGCAGTTAACAATACTTTCGTGGCTCTTATTCCGAAAGTTCCAAGGCCGGCCAAGGTTAGCGAGTATAGGCCCATTAGCTTAACTACAAGCATTTACAAGATCATATCCAAAGTTTTGGCGGAGAGATTGAAAGAGGTTTTGCTTGATACTATTGCTAAAAAACAATGTGCCTTCGTGAAAAATAGACAAATTATTGATGCTTCATTAATGGCTAATGAAGTTGTTGATTATTGGAGATGTGTTAAGATTAAATGGGTGATCATCAAGCTGGATGTGGAAAAAGCTTTTGACAAGATCAATTGGCAGTTCATTCTCTCCATCCTTCGTTTCAAAGGGTTTAATGAACAATGGATCCATGCGTGCATATCAACGGTTAACCTGTCTATTCTGATTAATGGGAAACCCCGTGGGAGAATTAATGCTAAAAGGGGAATTAGACAAGGCGATCCACTTTCTCCTTTTTTATTCGTCATTTCCATGGATTACCTTACTCGTCTTCTCGATGCTGCTAGAAAAAGGGACTTGATTCAAGGCTGTGTTTTGCCAAATGACAGTAACTTCCATTTAACCCACTTGTTATTTGCCGACGACGCGCTTCTTTTCTCCGTGGCAGATGAGAAAAAGTTGAACAATTTGCTTATTATGATAAAAGCATTTGAGGATGCGTCCGGTCTTAAAATCAACATACAAAAATCGGTGATTACAGGAACTAATATGGTAAACGATAACGTGCGATCAATTTATAGAGCTTGGGGCTGCACCTACTGTGAGCTTCCTATTTCTTATCTCAACCTCCCTTTGGGTGATAACCAAAGAAAGCAAGTTTTTTGGGACCTTATCTTAGAGAAGGTCCATACTAAATTCAATCAGTGGCAATATAGGTACCTGTCTAAAGGGGGGCGGCTCATGCTTATCCAGTCGGTATTGAACCATTTACCTACATATTATATGTCTGTTTTTAAAACGCCTATGAGCTTTCATAAAAGCTTGGACCGATTAATGCGCACATTTCTCTGGAAAGAAATCAATCTAACTAATGGATCAAACCTTGTGCGGTGGGACATTGTTTCTTTGCCTAAACAAAGAGGTGGACTAGGAATTGGAAAAGTCCAATATCAGAACGAGGCCCTTCTTAGTAAATGGATATGGAGGTATCATAATGAAGACCATACGCTTTGGAAGATGCTTATTAATGCTAAATATAAAGTTCTACCTACATTCTTTATTCCATCCAAATCCAATCGATGCAGCTTAAAATCCCCTTGGGTGAATATTGCACGAATGCAAGACATAATGCAGTGCAACATGAAGAAAGTCATTGTGAATGGTAAGGAGACTAGTTTTTGGTTTGATAGATGGAATGATGATGGCCCTTTATATGACAGTATCCCAAGATTTTTTGCTCTCGCAACCGACAAGCATAGTGTTGTGGCTGATTCTTGGAGCCAGAACGAGTCCTATTGGACTTTAGACTCCTTTCGTCCCCTTTACGACAGAGAAATGATTCATTGGGAAGAGATATCCAGCAATTGGCCTCACCCGCTTGATATCAATACTAATGAGAAAGATAGGTGGATATGGCTGGCCGAAAGTTGTAAGACTTTTACAGTTAAATCAATGAGAAATTTAGTCAATGATGAAGTCGTTAGCGGATTTCAAACTCATACATGAGATTCTTTTTGGAACACTTATATTCTGAAGAAGATCAAAGTTTTTTTATGGACTAGTTTTTATAATGGCCTGAACACTGCTGATATGGTCCAAAGAAGAAATCCTCATAATATGCTTAACCCTCAATGGTGCCATTTATGTAGAAAAAATGCTGAAAATGCTGCTCACATTTTTCTTTTCTGTGATTATGGGAGAATCATTCGACAGCAACTACCTTTGGCATTTCCGATTGAGGATGATAATACTTCTGTTCAAGTGGCTACTTTTCTGCATGCAATTATGGGAACCAACTCAAAAAGCGCTAGATCGGTGATGACTCAAAATATTATTGGTGCACTTTTTTGGTGGCTTTGGAGTGAAAGAAATGCTAGACTATTCAATGTCAACCACAAATACAAGACCGCCTCACAACTCTGGGATGATATTCTTTTTTCGGCGGCTTCTTGGTGTACTAAATCGCCTTTATACAAACATTATGACATTTCTAATATTACTCTTAATTGGAAGAACTTTCTGTAAGATCTCTTGGTAAATTTTCTTATATTTTGTGTATGTTTCTTGCTTTCATGAATAAAGTATCTTCTTCCAAAAAAAATATTTTTGCATTAAAAATACTCCAATAAAAAACTGGTTACAAAATAGGTGTGATTTTTGCAATTATTCCTGATTAAATAAAAGTAAACCCTAACACGCTGGTGTTTCTCTCTCTCACGTGCTGCACGACCCCTTCTTCTCCTTCGCGCTGTTCTCCATTTCAGCACCCGAGTGTGGCTGCCGCCTCTTTTCTTCCGATCAGCGCCGCCGCAACCGTTTATCTACTCTTCTTGCTACAGGTATTCTTCCGTTTGATTTTCTACTCTTGATCTGCGTTTGGCTGTTACGATTCAGACGAGGATGTTCCGCCATTTTTGATTTAGTGCTAACTCGATCGGCAAAGGAATTACTGTAA

mRNA sequence

ATGGATTGCCACAATGAAAGCATGGAGAAATCAGACTCTAGCGGTTCCACTTTGGTTGAATGCACACATGCTCAAATAAATGAGTCGGATAATACATATCTCAAATTGAAGGAAAATATGGGGTTTGATAATTGTATTTCTCTTCAACACTCAGATTTAGATCAACAAAACAATGCATCTCTCTACAAAGGTATAATCCACCACTCCCCTAATTATCCTATTGTGCAGGATTCTGCAGCTGAGAATGATATAGCTATTGATTTAGTGAATTCCAATTCACAAGATTGGACCGAAAATGTCGTCTCTAGCCCAGATAATACAGAAAAAAATGAACAAAATTATCAAGAAGATATACAGGCCTCGACTCAAGAAGAAATTATTGAAGACAGTCTGGATATCCTATTCGCAACTGAGCAAGAGATGCATGAGCTTGAACACATTCCTGGAGAATCTGAAAAAGAAAGATTTAAAACACCCGAGTGTGGCTGCCGCCTCTTTTCTTCCGATCAGCGCCGCCGCAACCGTTTATCTACTCTTCTTGCTACAGGTATTCTTCCGTTTGATTTTCTACTCTTGATCTGCGTTTGGCTGTTACGATTCAGACGAGGATGTTCCGCCATTTTTGATTTAGTGCTAACTCGATCGGCAAAGGAATTACTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGATTGCCACAATGAAAGCATGGAGAAATCAGACTCTAGCGGTTCCACTTTGGTTGAATGCACACATGCTCAAATAAATGAGTCGGATAATACATATCTCAAATTGAAGGAAAATATGGGGTTTGATAATTGTATTTCTCTTCAACACTCAGATTTAGATCAACAAAACAATGCATCTCTCTACAAAGGTATAATCCACCACTCCCCTAATTATCCTATTGTGCAGGATTCTGCAGCTGAGAATGATATAGCTATTGATTTAGTGAATTCCAATTCACAAGATTGGACCGAAAATGTCGTCTCTAGCCCAGATAATACAGAAAAAAATGAACAAAATTATCAAGAAGATATACAGGCCTCGACTCAAGAAGAAATTATTGAAGACAGTCTGGATATCCTATTCGCAACTGAGCAAGAGATGCATGAGCTTGAACACATTCCTGGAGAATCTGAAAAAGAAAGATTTAAAACACCCGAGTGTGGCTGCCGCCTCTTTTCTTCCGATCAGCGCCGCCGCAACCGTTTATCTACTCTTCTTGCTACAGGTATTCTTCCGTTTGATTTTCTACTCTTGATCTGCGTTTGGCTGTTACGATTCAGACGAGGATGTTCCGCCATTTTTGATTTAGTGCTAACTCGATCGGCAAAGGAATTACTGTAA

Protein sequence

MDCHNESMEKSDSSGSTLVECTHAQINESDNTYLKLKENMGFDNCISLQHSDLDQQNNASLYKGIIHHSPNYPIVQDSAAENDIAIDLVNSNSQDWTENVVSSPDNTEKNEQNYQEDIQASTQEEIIEDSLDILFATEQEMHELEHIPGESEKERFKTPECGCRLFSSDQRRRNRLSTLLATGILPFDFLLLICVWLLRFRRGCSAIFDLVLTRSAKELL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0009054.1Sed0009054.1mRNA