Sed0008647 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0008647
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 15762247 .. 15773959 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0008647
SyntenySed0008647
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
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mRNA sequence

ATGAGGAAAGTGAAAAAGTTGTTGCTTAAAAATGAGGTAGCTGAAAAAGATGTGGTCCAACCTGAGGAAAAGCAACAAGAGGAAGGTGTTGCGCAAGCTGAGGAGGATGAAGAGGAAAAGCAACAAGAGGAAGGTCTTGTGCAAGATGATGAAGGTGAAGAAATTATTGCCCAACCTATGGGAGTTGAAAAGGATATGGGCGAACTAGAGGATGACGACTACGTGATGGCAGTGTTACGTTGA

Coding sequence (CDS)

ATGAGGAAAGTGAAAAAGTTGTTGCTTAAAAATGAGGTAGCTGAAAAAGATGTGGTCCAACCTGAGGAAAAGCAACAAGAGGAAGGTGTTGCGCAAGCTGAGGAGGATGAAGAGGAAAAGCAACAAGAGGAAGGTCTTGTGCAAGATGATGAAGGTGAAGAAATTATTGCCCAACCTATGGGAGTTGAAAAGGATATGGGCGAACTAGAGGATGACGACTACGTGATGGCAGTGTTACGTTGA

Protein sequence

MRKVKKLLLKNEVAEKDVVQPEEKQQEEGVAQAEEDEEEKQQEEGLVQDDEGEEIIAQPMGVEKDMGELEDDDYVMAVLR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 23..53
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 29..51
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 15..53

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0008647.1Sed0008647.1mRNA