Sed0008126 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0008126
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 13655995 .. 13661499 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0008126
SyntenySed0008126
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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ATGACAAAAGGTGGAGATGAGGATGGACATTGCTTGGATATGGTTCAAGCTGGTATTAAATTAGTCTTGAAGCATCTTGTCATTTCGCCGCACATGCCTTTTAGGATGTTCAAAGAACCCGACAACCTGAATAATATGAACCAACCAAATTCCAAATTCAATTAAACGAATTGGGTTTGGGTTAAAAATATTTTTGAGTTGGATTGGATCTAGAGCAATGAAATTTTCATGAGTTGAGTTGGTCAAGAGTTGACTTAAAATTAACCGAGCTAACCTGGCTTATTCGAATTGATTATTAAGTTTAAAAAATAATTTATTTTTACCTATAACATAATTATATATACATTTATTTATTTTATTTTATTATTATTTATAGATTTTTTATTTTTCATTATTCTATCAAATATTTTTAAATATTTAGAATGTATATATATTATGATAAAAATATATAGACAAATTATGTCATTTAATTTTGTTGGTTTTAATTATTTATTTTCTTTATGAAAGTCGAATTGTATCATTTACTTTTATTGTTTTAATTATTCATTTGGTTTATGGAAGTCGAATGGATTTGTTGTTTTGTTTTATAGTTGTGATCTTCCATATGAATGTATTATAGGATTAATGGTGAATGTCTTATGATAAAATATTTTGCATATTTAATATTCATATTAATTTCATTACATTGATATTAATTATAGTTGGAGGATAAAATATTTTGCATATTTAATATTCATATTCATATTCATTTTTCATTACATTGATATTAATTATAGTTGGAGATTGTATTTTGTTATCGTATAGTGTGTATGACTAATTTGATGAATTTTTTTTTTATATTTGCAATGTATTGATGAACTCGATGATTCAACTTAACCAAACCCGAAAATATATAAAAGTTGGGATCATGAGTTTTCTATTTAATTAGGTTGGGTTAAAAAAGTGACCAACCAAATTCTTAGGTTCGTCCAAAAATTTCCTTCAACCAAACTGAACCAATCCATGTGTAATAACAAATCCATATCTATACTCATAATCCAAGAGCAAACAAACATAGAGATGAATCAAAGCATAAACAAAGAAAAGGATCAAAGGAGTAGAGATTGCACATCAGAATTAAGTGGTTTGGACTATACCTACTCCACTATCACACTGTGTGTTGATCTATTTTGATCATAACACTCATAATGTCATTGATATACTCAAAGGTGGCTAGGGTTCTAAACTCTCTCTCTAAGGAAGGAGAAACCCCAAATGGTGCTTTATATGCTAGCATTTAATTAATTACACACACTCACATGGTTCGTTAACCAACCCCCAAATTAACCCAAGTTAATATAACTCATCTTATGGGCTAAAACATCATGAGTAATTCACCTAATAACAAAATACCCTCTTGAAGTACATATTATAAAACAAAATAGCAATCAAAATATCAGAATTGATTTCTTAATCATATCAAAAGCTCTAGACACACCTGGATCAGAACCTATTCAAATTGAACAATCATAATATCAAAATTTCAGACTCGCTTGGATCAGAAGCTACTCAAACAAAGTAGCTCAAATCAGAATGCCAAAAAAACTTGGCTAAGAATTCGCCCAGGCAGAGAAAATCACACAAATGCTCAAATCTTTCATAAGACAAAGTTTTTGTCAAAACATCTGCAAAGATTGTGAATCGTGTTCACCTTCAACAATGACAACCTGTTCTTAACAATAACATCTTTAACAAAGTAGAATCTAACATCAATATGTTTGGTTCGATTATGAAAAGAAGGACTTTTAGACAATGCTAGAGCACTCTGGCTATCACAATGCAATGCAATCAAACAGTTTAAATCAAGAATTTCAAAAATCAAACCTTTGAGCCACAAAGACTCTTTAACTGCATCAGTCAAAGCAATATATTCTGCTTCAACCGAAGAAAAAGCAACAATTGACTGCAAACTAGACTTCCAACTAATCACATTGCCGAACAACATGAAAACATATCTTGTAAGCAATCTACACCTATCGGCGTCAGCAACATAATTGAAATCAACATAACCTGTCAGGATGGATTCTTCAAAACTATCATATTTCATATACACAAAAGACCCTTCGCGACGGAACCTTTAATATACCTCAACATCCACTTAGCTGCTTCCCACTGAGGCTCACTAGGATTGCTCATGTACTTGCTAACCACACTTATCGAGTGTCATCCCAAATCAGGCCTACACTATATCAGACATACATAATACTCCCTTCAAGATTAGAATAAGGAACACCTTTCATATTTTGAATTTCATCATAAAAAAATGGTGACTGATTTGATGATAATTTGCAATGCTAAGCTAATGAAGTTTTTACCGTCTTAAACTTTCCATGTGAAAACGTTTCACAATACCAGCCAAATACACAGGTTGACTGATACTCAAACTGTGATTATCACGGTTTTTGCTCAACTCCTTCTCAAAACAGTGATAATGAAGTGGCTCTAATACCATGTTAAATTTGAAAAGTAATGGCCAAAAAACTCTTCTTTGTAATTTCTCTTATAATTCTCAACACATAGCTATGATAAGGATGGAATTCAAAACAAAGACAAGATTCTTATAAAAAACTTCAAAGTAAAAAAGACCAATTAAATTTTGGAAAAAGAAGAGACAATATTATCACTGATATGAAAGATAAATAAACTCGAGCCATTTCCAAGACGATTTTGTACTTGGCCACTATTGTATTCTAAATTATTTGGGATGTTCGAATACTCATTAATTATAATACAATTCATATTATAGATAGTATGATCACAAAAAATATAAAGAGTTTCAATGTTTACAAATTATGTGAAAGTTCTGTGAACCTTGGAGAAAGTTTGAGTAGGTAGGAGGATAGTATAGAAAGGATTGAGCATTATGCCAAAGTGATAGAAGCAACGACTTGCAAGACGTCTTATATTTTGAGCGACCATTGTTGTTGTTTTAAGAGCCACGTCCCTAAAATCCACGACATCCCTTTTTTCCTTTGTTGTACCCTTGTCAAGAATTCATGTTTTTGTTGAACGGAGAACCTTTCTGAGAATCAGTTTGATTCAATATTGGCGATATTGAGCAATATTGAGTTTGAGAAAGAAGATGCAAAGATTTTGCTTTCAACAAAGTCTATGTTCCTAGAAAAAGTGAGTAAATCACTTAAACTAGTTTAGGCTTGCCTTTTGAAGCAATCATTGAGACTATTGACTAATCATTTAACCTTCAAACTTAGAAATAATATACACTATTCTTTGTATTTTTAGGATTATTAGTTTGTATATTTATATTTCTCCAAGGAAGAGATATGATCAACACATTATTATTCTCTAAATTATTAAATTATTATGGTATCATACAATTAGGTTTTTTCTCCACTTCAATATGAATTTTTGTTAACTCAAAATTTTTTCTTCGACTAAATTCTTCCCATTATTTTGGGAAGCCCATTTGCACCAATTCATCAAAAGTTAAGAGATAACGAATCTCAAATGTGTTTGGCAGTCGAGCATCCATACATCTGACTAAGAAATTTTCAAATACTCTGGAATTAGAGTATTTTCGACTTCTTTCTTTTTGGAGAAATTCTAAAGAACTACAAGATCACCTTTTATACGACCTTCTAATCCATACTCACTTGATTGATAATAAAACTTGAAATTTCCATGATAGGTAATTTTCATTTATGAGTTTGATAATTGGTGCTCTAATTCTCACCAAAGATTTCGTAAGAGAAAAATCCAGAGCCATAGAACCCAAATGACTTGATTTGCCTTTTGTGAAGTATTCTCTGAGTGATCGGTATTTGGGTTGTAAAATCTCTTGAGACTAGCATAAACCATCTTAAGAGTGGCCCAATAGTAGATGAAAGGAACAAGAAAACTTGTAAAGGTGTGCTTGGGCCCCGGTTTATGTAAACAGCCGAGTTGGTCACAACCACAAAACTAGGATTAGATGACGCTTATGTTAAACAAAATTTAATAGGGAGAAGCAATTAAGTGTCATAAATCAAAACATGCGTTTTATGACACTTTATTATAATGATTTATGACACTTTATTATAATCATAAACTAACCAATAATTAAAATAAAATTATCATCATAAAAAAGTGTCATAAATTAAAAATGCGCGTTTTATGACACTTTTATAGAATCATAAATTTATGAGACTAATTTTCAATTATATTCTTTTTTTAATTTAATTAAATTGGAAGAGAGAATCACAAAACCTACATAGAAAGTACTGCTCTCGATTTTTCTGATCCAACACGTGATCGTAGGGTTGAATGGATTACCACTAAATAAGATAATCAACTGATTCAGTAATTTTGAGTCATATTCAAAAAAATTTAAAAAAAAAATTTAATTTTGATATTTTAAGACATTATTTATTATTTTACAATTTTCTTTTTGGCTACTTCTAAACAATTTTATATATATTTGTAACAATTAACCCCTAAGTTTGTTTTATATATAGTCTATAATTTTATTTTTATTTTTTAGTTTAATTGTTTCCGGTGGAGCATGTATTTGCTAAGTGTCCTTATTTCCATTTCCGTCCCAACCATGATATAGAGCATGGAGTTTTCCTTTTCTTTGTTTAGGATTTAATGTGACAATGAAGTATGTTTTAATTTTCATTGTAATTAATCAATTTAACTAATTGACTTCAATTCATTGCATTTATTATTTTTCAATTAATTTTACTTGATTAATTTTAATCTGTTTAATAGATTGACTTCAATAAGTTTTATTGAATTGAAGTTGTGCGCGTTTTCGATATAGAGCTCAAAGATAATTTTAATATTAATTTTGAAGTTGTGCGCCTTCTCTTTTTAATTTTGCTTGTTATTGTTTGAAAATCTAAGATACTTCTTTATTAAAAAGATAAGTTATAGAAATTAAAATGGTTAGTGTTATTTTTTTTCAAAAAAAATATTTGATTTATTTATTTTTTAATTTTTTAGAATTTAAAAGAAAGGAG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mRNA sequence

ATGACAAAAGGTGGAGATGAGGATGGACATTGCTTGGATATGGTTCAAGCTGCTCTAATTTTCCTTTCCACCTCTCCCTCCTCCTTCTTCTTCATCTCCTTCCTTCCTCTTGCTACGCCACCACCCTACTTCCCGCCGTCGACCTTCATCTTCGTCGACACTCGCTGCTGCGAAAACTTCCCCGCTGACATCGCCTGCGACCAACCGACGCAACCCCCTCCCACACGCACGAGTCGAAAGCCAACCATCCCGTGCCCGACGCCTTGCCAGCACGTAGTCCGCTCGCTGCCAGCCGACTACCCAGACCCGCCTCCGCCGTGTGAAGATCGCCCGATACCTCCCCTCGCGCAGATCTCTGCATGTGCAGAAGCCCCTGCACGTGCGCGCGCACGTCCTTCGCCTTCCCTCCGCGCAGCTCCGTCCGGCTCGCGCAAGTCTCGATCGGAGCAGCTGTGCATGTCTTCAGCCAGTCAGCGCTGA

Coding sequence (CDS)

ATGACAAAAGGTGGAGATGAGGATGGACATTGCTTGGATATGGTTCAAGCTGCTCTAATTTTCCTTTCCACCTCTCCCTCCTCCTTCTTCTTCATCTCCTTCCTTCCTCTTGCTACGCCACCACCCTACTTCCCGCCGTCGACCTTCATCTTCGTCGACACTCGCTGCTGCGAAAACTTCCCCGCTGACATCGCCTGCGACCAACCGACGCAACCCCCTCCCACACGCACGAGTCGAAAGCCAACCATCCCGTGCCCGACGCCTTGCCAGCACGTAGTCCGCTCGCTGCCAGCCGACTACCCAGACCCGCCTCCGCCGTGTGAAGATCGCCCGATACCTCCCCTCGCGCAGATCTCTGCATGTGCAGAAGCCCCTGCACGTGCGCGCGCACGTCCTTCGCCTTCCCTCCGCGCAGCTCCGTCCGGCTCGCGCAAGTCTCGATCGGAGCAGCTGTGCATGTCTTCAGCCAGTCAGCGCTGA

Protein sequence

MTKGGDEDGHCLDMVQAALIFLSTSPSSFFFISFLPLATPPPYFPPSTFIFVDTRCCENFPADIACDQPTQPPPTRTSRKPTIPCPTPCQHVVRSLPADYPDPPPPCEDRPIPPLAQISACAEAPARARARPSPSLRAAPSGSRKSRSEQLCMSSASQR
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 121..159
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 139..159

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0008126.1Sed0008126.1mRNA