
Sed0007647 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AATATCAAAATAGTTATTTGAAGTAGTTTTAATTATTTATTATTATTATTAAATAATTAAACTTTCTACAGTGCCAATGGCACTCCATTCCTCTTCCATTCTTCTTCTGCAGCATTTTCTGTACCTTACAGTCACCTCCGCCGTTTCCCGGAGCAATGAGACTGCCGGCGGTGTCAAGATATGGCCGTTGCCGGCGTCGGTAACTCACGGCGGCGGCCACCGCCGGTTGAATGTTGCAAAGAATTTTCGCCTCAACACTCGGGGCTCCAACTTCAGCGATGCTTCCGGGATGCTTAAGGAGGGATTCTCGCGGCTGCTTGATGCGGTTCGTGTTGCGCATGTTTTCGATGCTAACCTCTCTCGCTTGGACTCCTCTTCTCTGCTCCACGGGATCCACATTCTTGTCTCTTCGCCTTCCGATGAGGTTTGATTCTGTTTCTATCTGTCGATGTTTGTTTTCGATTTCTGGTTGATTTTCACTTTTGAAATTGTGTGAATCTGGTTCTACGTTTTGGAAATGCATTGGAGTTTCTGTTCATGTTTCTTGGATTTGATTATGCATTTGGAGTTCTTAACGTGCTTTTTTTACTTTTGAACGATTACGGTTCCGATTTTCTTGATTCTGGAGGTTTCCTTTGATCAAAATGAATTGTGATTGAACTCTTTTGAAATTGTGTGAAATGCATTGGAGTTTCTGTTTAAGTTCAATTCATGTTTCTTGGATCTTTCGTATACGATATGATGATGCATTTGGAGTTCTTAACGTACTTTTGAACGACTACGGTTCTTTCTTGGTTTCGATTTTCTTGATTCTGGAGGTTTCTTTCTATCAAATGAACTGTGATTTGTTCACACTGATTATTGTTTGATTTGTGTGAAATATGTATGTGGATGGAGCAGTTACAATATGATGTGGATGAATCCTACAGATTATCAGTTCCTGCACGCGCACCTGGAAAGCCTGCCTATGCCTTTCTTCAGGTGTGTGAAACCAATTAAACTCTTACCTACTTGCTTTACATGATAATCAGTCATTCCATTTTTCATTTTAGTACCAATCGCTCAAAAGTCCGAAGGGGAAATCCTTATCCATGTTTCAAAAGGCTATTGAGGCTTATGCCTTGAGGCTCGCCTCATGGCGAGGCTCTAACTTTTAGCCTCGAGTCTTACGCCTCTGTTGGATCATAAGAGGCTTACACCTCGATGATAACGCACTGAGGCTTAAAATTCATATGCCTCGTAGAATAACTAGAAGAATAGTATTAATATTTTCCATTCTTATAATATAAGAGTTTGAACCATAACAATATAGATTTTCTCTTATGGATTTTTTTGTTAGAAAGACACAATTGTTTAAAAATTGTCAATTTTGATAATTTGTTGGCTTATTTTCCTCTAGCATCTCTTTTTGGAGTTCTTTGTTGTATTCACTATAGTTGCTAGCGAATTCACTTATATTTCATTCATCAATGAAATTGTTTATTCTAAAAAAACTCTATCCTATTATTGCTACTGTTGGTACTATGTTTTATGTATTTTAATGTAAATTTTATGTTTTACCAAACATTTTTACACAATTTTAGAATTTTTATAATATTTTTAATTAAAATTGAGGCTTACGCCTCATACCGACTCGAGGCTTATGCCTCGCCTCTTCAAAAGAAAAAGCCTCGAGGCCGCCTTTAGCCTTTTAAAACATTGATCCTTATTCATATTGGTTACATACAGTCGATCAGTGTGGAAAAAAGTTGTTAAGTTTTAGCTGGCTTGTGCATTTTGATTCAAACATGGACTTTTGTTGCAAATATTTTGAATAATGCGTGTTATACCTACTTTATCACGAGATTCACAAGTATATTTTGGTTCAAATCCATTTGGTAATGGTCTTAAATTGAGTTCTTGAATAGATTTTTTTTTTAGTTAGGTAACTACTTCCGTCCCTAAGCCAGGCACCAAAGACATCGAATAAGTACTGTTACAGGTGAGTCTCAAACCTGGAACCTTAAAGGGAGCATACCCTCAAAGCCCAAGTCTTCAACCACTGCGCCACCCTTTGGAGACGAGTTCTTGAATAGATTGAAAATCAAGCTATCTTTGGATTATATTTTTAAATTTAAAAAATGCATTGCCTGAAACAACTTGGTAGTAGTTTCAAAATCTGTTAAGTGTTATATAATTTTTTTTAATAAATAACTTTATGTATAAAAATGTGAGCTATAAAGTTCAATGGTTGGCTTAATTTAAATTTCCGGGATTTTTGTGTGTGCGTGTGCGTTTAAACTTGAATCATTAAATTATTATCATGTAGACTGGAGTTTTTTTTTTATTTAATCAAGTTCTTTCCATAAACTGGCATGGCGTTTTTTTTAGTTCAACAACTGTCATGGTTAAGTTGTTTGATTTTTGGAGATAAGATGACCATGTTCATGATACTCAATCTTTGTATCCACCACAATCGGACTGTACTAACACCGTGTTTTATATACTTAGTCTGATGGTTGAGCTGAGTGTCTGAAAATGTACTGTTTGATTGATCGAATCCAATTTTTAAGAAGTTCCTGTATCGGGAGTTCACCCAAACTAGATGCTGTTGGTGATGCCACCATCTGAAAACTGAAACCCATTAGTAAAAATGAAAGAAATATGAATCTGCGGTCATCTTCATCAACGGCCAATTTTCTTCACTTATATATATTTTGCTTAAGTATAATTTTCTTGTATTTTACTTAAATGGTTTGCACCAAAGTAAACGTTGGTATGTGGTAATTGACATGCACTTTAGGTTGGAGGTTGAAGTCCCCTACCCCATTTTCTGCTAATGATGTCAATGCCATTAGAGAGCTCTTCAGAGTTGTTTAATAATTTCAAAAAGGAGCAGAAACTATTATGGGAGAACTTTATTCGGGCATTCATATGAAATTTATGGTTGGAGCGAAGTTGAAGGATCTTTAGAGACAAAGGGAAGTCCTTATCATCTCGCAGCTTAACTCTTTGACTTGGTGTAAATCTTCCCCTTTCTTTTCTCACTATTCCACAGCCTCCCTATTAGCCAATTGTAGTGCTCTTTTGTAGTATGTTTTATGGGCTTTTTCCATTTTTGTAATGTCATGTCCCAATGAAATTGTTTCTTATTAAAAAAATAAGATGGGCTAAAAAAGAATACTATTAATAGTTTTGCTTTGCCTAATTTTTTCTTGTAGCTTTGGTCCCCTAACAGTAAGTTCTTTCTCAAACTCTGCAGGCTCGTACAGTTTATGGGGCTTTGCATGGTCTTCAGGTTATATTCTAAGACTTATACATCTGAAGGTTATAATTCTTGGAGTCTAAGGGAATATATAAGATATTGAAAATGTCTTTGTAATGTGAAATCTTGCAGACCTTCAGTCAATTATGCTCTTTCAATTTTGATACAAGGATAATTGAAGTTCGCATGGTACCATGGAATATTATTGATCAGCCAAGGTTCTCCTATCGAGGGCTTTTAATTGGTGAGATGCTTTTGAGTTTTGTCTTATCAATTTTTGTTTTAATGACAATCCTTGAGCAAGAACTTGGCATGATAAAAACGCTTGCTTGGTTTCCTTGCTCTCTGTTAGATGTTTTTGTGGTGCTATTTATCCTGTTCCATTTCCTTTTTATTTTTTGATGCTGTACTTCGTTTGCCATTAACTTATATCGTTTTTTTTTAATAACATTAGCTTATATCGTTTCTTTCTTTGTCATGAAATATAATTTACTTTTCATAAAGAATGCCCGCCTATACTGCTGCTAAAAACTTTGGGTTCATGTTTTCCTAGCTTTTATTATATATTAGTTATTTAATGTAATTTTTCTATTGATTTAAACAAGCAGTTTATGGTTGAGGTTGTTTCTTTACCTAAGATGGTAGGTTCAATTTTATGGAAGACAAACGACTATTGTTGGTTGATCTGATTAAATTTATCTCAATCCATCAGCTTAGCCTTTTGGATTGATTGATGGTTTAACATAATTCAACATGACATTAGAATCCCTGCCAAATCATTTCCTTCCCAATTAAAATTAAATTCCACTTGTAGGGCATTTCTCAAATTTCAAAGCCCACAAATGAGGGGGAGTGTTTGATATAATTAAATTTACTCCAATCCATGAGCTTAGGCTTTTGAATTGATTGGTGGTTTAACATAATTCAACAACTATGCATGATAATTAGGAAAAAAGTACGTTTTGTGCTGCTTGGATTGCAAATAAGTAACGATCGAGGAAAGTAGCAAAGTCTATATATTTGTTATATATGATTTATTGGTTGAAACTTAGATTGGACTCAAGGTGTGCTTAGGCTTAGAGGAAGGTTTTCCTTTCTTGTGTTTGAAGAGTGTCTCTGAATGTGTCGTATTTGTTGGGAATTGAACTTTCTGAATTATTTCATAATTTCAGCATTGAAGTTTAAAACATATTGGATAAGGTGGTTTTTTTTTAATTTTTAATTTTTAATTTTTTTTTATTTGTTATACTTTCATGGCTAAGGTGGCTAACTCCAATCATGACTTGTAATCTGACCTGCAAATAATTTCGCGCAGATACTTCTCGACATTATCAGCCATTGCCAATTATAAAGAAAGTGATTGATTCTATGGCATATGCAAAGATGGTATATAATTCATCAAGTAATGCGTTATTATGTGATAGTAGTTTGCTGGCAATGCTTTGCTCACTAGCTCAAAACATGGTTTGGATAACTGTTGGCTGCTTTCAGTGTCCAACTACTCTTGCCCAGTTGATCATATAAAATATATGTTTATGTTTTTGGGTAAAAAGTTCAAAATAAGAAAACGCTTTAATGCTATTAAATAAAAAGGCATCCGGCACTTGCATACAGTGTTTTAAAAAGCCCAAGGTGCACTAAGGTGCAATGGGCCTCTGGGGCTTGAGACGCAAGGTGCACCAAAAGGGGCGAACTTTTTTACATTAGGCACACTATATTTAAAAGTACAAAAAATTTATATATATATATA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ATGGCACTCCATTCCTCTTCCATTCTTCTTCTGCAGCATTTTCTGTACCTTACAGTCACCTCCGCCGTTTCCCGGAGCAATGAGACTGCCGGCGGTGTCAAGATATGGCCGTTGCCGGCGTCGGTAACTCACGGCGGCGGCCACCGCCGGTTGAATGTTGCAAAGAATTTTCGCCTCAACACTCGGGGCTCCAACTTCAGCGATGCTTCCGGGATGCTTAAGGAGGGATTCTCGCGGCTGCTTGATGCGGTTCGTGTTGCGCATGTTTTCGATGCTAACCTCTCTCGCTTGGACTCCTCTTCTCTGCTCCACGGGATCCACATTCTTGTCTCTTCGCCTTCCGATGAGTTACAATATGATGTGGATGAATCCTACAGATTATCAGTTCCTGCACGCGCACCTGGAAAGCCTGCCTATGCCTTTCTTCAGGCTCGTACAGTTTATGGGGCTTTGCATGGTCTTCAGACCTTCAGTCAATTATGCTCTTTCAATTTTGATACAAGGATAATTGAAGTTCGCATGGTACCATGGAATATTATTGATCAGCCAAGGTTCTCCTATCGAGGGCTTTTAATTGATACTTCTCGACATTATCAGCCATTGCCAATTATAAAGAAAGTGATTGATTCTATGGCATATGCAAAGATGAATGTGTTGCACTGGCATATTGTTGATACACAATCGTTTCCATTGGAGACACCTTCATTCCCAAACCTTTGGCTTGGTGCTTATTCAAAACAAGAACGGTATACAACTGCGGATGCTGCAGAAATTGTGAGATATGCACAACGACGTGGAGTAAGTGTATTAGCTGAACTTGATGTTCCTGGACATGCTTTATCATGGGGAGTTGGCTATCCTGCTCTGTGGCCGTCGAAGGATTGTAAGGAGCCACTTGATGTCAGTAATGAGTTCACTTTTAGAGTAATAGATGGAATACTATCGGATTTCAGCAAGATCTTTAAATACAGATTTGTTCACTTGGGAGGCGATGAAGTTAACACAACTTGCTGGAGAGTGACTCCTCATATAAGAAAATGGTTAATGAAAAGGGGTATGAATGAATCCGATGCTTACAAGTACTTTGTCCTGCGAGCACAAAAAATAGCTTTGTCACACAGATATGAACTTGTAAACTGGGAAGAGACTTTTAACCATTTTGGTCGTGAATTGAGTCGAAAGACTATTGTGCATACCTGGCTAGGAATTGGCGTTGCTGCTAAGGTTGTTGCAGCCGGTTTAAGATGCATTGTTAGCAACCAATGGTATTTGGACCACACAGACACAAGCTGGGAGAAGTTCTATTTAAACGAGCCGCTTAAAAATATCACAGATCCACAGCAACAACAATTAGTCATTGGCGGAGAGGTATGCATGTGGGGTGAAAGCATCGATGGTTCAAATATCGAGCAAACTATTTGGCCTCGTGCTGCAGCCGCTGCAGAGCGCCTTTGGACACCATACGACAATCTAGCTAAAGACCCCAAACAAGTTCTTGGAAGGTTTTCACACTTCAGGTGTTTGCTGAATCAGAGAGGGATAGACGCAGCTCCGGTATCGGGACTCGACACATCTGCTCCTTCGGGTCCGGGCTCTTGCTTTGTGCAATGA 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BLAST of Sed0007647 vs. NCBI nr
Match: XP_038890397.1 (beta-hexosaminidase 3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 969.5 bits (2505), Expect = 1.2e-278 Identity = 463/538 (86.06%), Postives = 497/538 (92.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. NCBI nr
Match: KAG7029880.1 (Beta-hexosaminidase 3 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 965.3 bits (2494), Expect = 2.2e-277 Identity = 463/538 (86.06%), Postives = 492/538 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. NCBI nr
Match: XP_022929603.1 (beta-hexosaminidase 3-like [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 965.3 bits (2494), Expect = 2.2e-277 Identity = 463/538 (86.06%), Postives = 492/538 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. NCBI nr
Match: XP_023546394.1 (beta-hexosaminidase 3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 964.9 bits (2493), Expect = 2.8e-277 Identity = 463/538 (86.06%), Postives = 492/538 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. NCBI nr
Match: XP_022997517.1 (beta-hexosaminidase 3-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 7.0e-276 Identity = 460/538 (85.50%), Postives = 489/538 (90.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8L7S6 (Beta-hexosaminidase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HEXO3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 748.0 bits (1930), Expect = 7.2e-215 Identity = 349/526 (66.35%), Postives = 417/526 (79.28%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7WM73 (Beta-hexosaminidase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HEXO1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 557.8 bits (1436), Expect = 1.4e-157 Identity = 276/545 (50.64%), Postives = 365/545 (66.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54K56 (Beta-hexosaminidase subunit B2 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=hexb2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 328.2 bits (840), Expect = 1.8e-88 Identity = 182/539 (33.77%), Postives = 294/539 (54.55%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54K55 (Beta-hexosaminidase subunit B1 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=hexb1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 307.4 bits (786), Expect = 3.2e-82 Identity = 186/543 (34.25%), Postives = 280/543 (51.57%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P13723 (Beta-hexosaminidase subunit A1 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=hexa1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 292.4 bits (747), Expect = 1.1e-77 Identity = 148/430 (34.42%), Postives = 233/430 (54.19%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ESM1 (Beta-hexosaminidase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436138 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 965.3 bits (2494), Expect = 1.1e-277 Identity = 463/538 (86.06%), Postives = 492/538 (91.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K594 (Beta-hexosaminidase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492411 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 960.3 bits (2481), Expect = 3.4e-276 Identity = 460/538 (85.50%), Postives = 489/538 (90.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TXH7 (Beta-hexosaminidase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold648G001400 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 954.5 bits (2466), Expect = 1.9e-274 Identity = 457/535 (85.42%), Postives = 485/535 (90.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4H3 (Beta-hexosaminidase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485909 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 954.5 bits (2466), Expect = 1.9e-274 Identity = 457/535 (85.42%), Postives = 485/535 (90.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FBS3 (Beta-hexosaminidase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444179 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 949.9 bits (2454), Expect = 4.6e-273 Identity = 461/540 (85.37%), Postives = 489/540 (90.56%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. TAIR 10
Match: AT1G65590.1 (beta-hexosaminidase 3 ) HSP 1 Score: 748.0 bits (1930), Expect = 5.1e-216 Identity = 349/526 (66.35%), Postives = 417/526 (79.28%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. TAIR 10
Match: AT3G55260.1 (beta-hexosaminidase 1 ) HSP 1 Score: 557.8 bits (1436), Expect = 9.8e-159 Identity = 276/545 (50.64%), Postives = 365/545 (66.97%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007647 vs. TAIR 10
Match: AT1G05590.1 (beta-hexosaminidase 2 ) HSP 1 Score: 225.3 bits (573), Expect = 1.1e-58 Identity = 170/587 (28.96%), Postives = 269/587 (45.83%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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