
Sed0007400 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCATGAAAGTCATCTGTTGCAGCTTCTTTTGGGGATAATACAGTGGATCGATCCTCCTGATGCTGTTTTGAGATCAATTGAAAGTGGAAATAGTGAAAGGTTAACTTGCACTTTTGATTTTTTTTTTTTCACTTTTGATTTCTTGATCATCCTTTTGTTTTATATTTTCTCTTTTTTTATGTACATTAATTTTTTCTTTGGTTAAGTGAGATGCTTGATGGTTGTCGTGCATTGCTGTCTATTGCCACTGTAACAACTCCAGTTGTGTTTGACCAACTACTTAAATCAATCAGGCGAGTAAAAGAACGTTCAATGTGATTTAGTAATTTATTTACAATCATGCTTGGTTACTCTTCCATTTTCTTAATTTATATTACTATTCATGGTTTATCAAATTTGATTGGGTTCTTTTCCATTTATATTCAGGCCATTTGGCACTGTTCAACTGCTATCTAGTTTGATGGGTGAAGTTGTGAAGGTTCTTATGACCCATAACAGTGATGACGAGACGTGGAGTTGGCAAGCCCGTGATATATTACTAGACTCCTGGACTACCCTTCTCATAGTATGTAGCAAAGTTTAATAAATTAACTTGTAACTGAATAAAGTTTGAACTAGTCAATTTTCATTCTGAAGAACAATGTTGGTATGCTCCCTTGATTTTTCAAGATGGAAAAGTTAATATCTTAGATTGCATGCATAGACATTCTTTGTTCTTTTGGGGGGCTTTAGTGCTGCTCACTTTGTAGAGGGGGCATTGTTTGAAACAAGAAACACACTTTTCATTGAATGAAAAGAAGCTAAAACTTCATAAATAACTCTAAATGGGCTTTATTTGCTTAATTGGCTCTACCATGTACTGTTTTTTTTTTTAATTTTCTCTTCTTTCCATGTATTGTTCTTTTGTATCCTCCTTTGGGTTGTTTCTGTATTTTTTCTTTTCATTATCTCAATGAAAAGTTTATCTCTTGTTTAAATTTTTTTTTTAGAGAAACTCACCTTGTGGTGCAATTATCCCACATTGAAAAGGTGAGGAGTCTTCAACACATTTATAAGAGATATGAGTTACTCCCCTCATTGCCAATTGGTTTTGAGGTGGAACCCCATATTCTCTAATATGGTATCAATGCCCATAAAGCCCAAATGGATATCGGTCTAATAAAAATGAAATTGAGATCCTATTTAAGATTGGTGAGTGCAAAAGAGGCACCATCTTGAAGGGGCATGTTAGGATCTCACAAATGTCCCACATTGGAAAGTGGGAGAGTCCAACATAAATATAAAAGAGATATTAGTTACTCCCCTCATTGCCAATTAGTTTTGAGGTGGAACCCCATATTTTCTAACATGGTATCAAAGTCTCAAATTTTTCCTTTTGATCCGGGTAAACCGTAAACTCTTTCTCTTCTTCTCTTTCACTTTCTTTTCCATCTCCTTTTTCTAAAAACTTTTTCATCCTTCATCATCTTCTTCCTCTTTTTGAAAATAATAATAATAATTAAGAAAAAATAAAAATACTATTTTACTAAAATTAACATAAACAACACTCCCCCTTAAGCTGGATTGTATATGGAATACAAGCCAAGCTTTGAGTTAAATTAATCATAGTTGGATGATGATGCGCCAATTGTGATGATGATGCGCCAATAGTGATGATGATGCGTCAATTTGGATGATGATGATACTGATGTGATAGAATCTACCACACTATTTTATTAAACTACGATAATTCTCTCGAGAGAATCTCTCAAAGAGCCAAAGTACAAAGACGACAACTGAATTCAATTGGATGATTGACAATGACCTAACAACTTCTATTTATAACCCTAAACCCTAATTTGACCTAATTAATAAAAGACTAATAATAGGCTCAAGCCCAATACATTTAAAATAGCAATTAACTAATAATTAATAAATACTAATATTCCTAAAATGCCAAGGCCGGATCGTATCATGATGCCAGTGCCAATTGGGAATACTAAAATCCAATCAAACTCCCTATTAGTATTCCTAGTCATCAACATTCCCAATTTGTCCTTGGCATTAGTATTCCCAATTAGCCCTGACATCAGTATCATCATCATCCAAATTGACGCATAATCATCACAATTGGCGCATCATCATCCAACTCTAATTAATTTAACTCCAAGCTTGGCTTGTATTCCATATAAAATATAGCTTCTCCTCTTTCACTTTCTTTTCCATCTCCTTTTTCTAAAAACTTTTTCATCCTTCATCATCTTCTTCCTCTTTTTGAAAATAATAATAATAATAATTAATAATTGTAAAACAATATGATCCAAAACAGTATATCTTATTATTGAGAGGCAACCTCTTTATATAAGAGTTACAATGGGCCTAGCGGGCCTAACGGGCCTAGATCTATTACATAGTACATTATATACAATCACACATTTAGACTCTAACACTCCCCCTCAAGCTGGAGCAAATATATCTATCATGCCCAGCTTGTTACAAAGATAGTCTATCCGAGCTCCATTCAATGCTTTGGTGAAGATATCACCCAACCTGTTCTCCGATCTTCACATAACTCTCCGAAACCAACCCTTGTTGTATCTTCTCTCGGATAAAGTGGCAATCTATTTCAATATGTTTAGTTCTCTCGTGGAATACCGGATTAGAGGCAATATGAATTCTTTGCTTGATTGTCACACCATAGTTTAGCGTGTGTTGCGTTTTGATTCCAACTTCATTCAAAGAGATTGAACCGCCATACTATCTCACACGTTCCTTGGGACATAGCTCTGTATTCGACTCAACACTAGAACACGACACCACATTTTGCTTCTTACTCTTCCATGAAACCAAATTACCTCCCATAAACACACAAGATTATCGAGGTTGATCTCCTGTCTTCTTTAGAACACCGCTTGATCAAGATCGAAAAACATTCAATATCGGAATGTCCGTGGTTTCGGTACAAGACGCCCCTCCGAGAGCAAACTTAAGATAACTCGGGATCTGTTCCACACTCTCCAATGTTCAATCTGTAGGAGATGACATAAATCGACTCACGATACTCACGAGAATCACGAAATATATCGGCCTCGTGATGGTATCAAGTAGTTCAAATCCCAACTAGCTTCCTGTACCTTTCTCGGATCGGAAAAGCTTCACCGTCCCTTGATTTAATCTGTTGGTTTGGCACCATCGGGGCCCTACACGGTTTTACACCTAACTTTCCTACTTGATCAAGTGGGTCGAGAACATACTTTCGTTGGGACAAAAGATCCCTTTCTTACTTCTCATGACCTCAATACCCAAGAAATATTTCAAATTTCCAAGATCTTTAGTCTTTGAAATGGCTATGAAGGAAAACCTTTAGTGAGGCCATCCCTGAACTATCACTTCCGGTAATCACAATATCGTCGACATATACCACAAGTAACACAATCCCATGGTCAGACCGACGGAAGAAGACAAAATGATCTGAAGAGCATTTCTGCATTCCAAACTGCGCAAGAACTTGGCTGAACCTACCAAACCACGCTCGCGGGCTTTGTTTCAAGCCATCTGAGATTTACGAAGACGGCACACTTTGGCATTCTCCCGAGCAACAAACCCGGTGGTTGCTCCATATAGACCTCCTCAAGAAGATCACCATGCAAAAACGCATTCTTAATATCCAATGAAATAAAGGTCAATCATTCATTGCCGCAAGAGAAATAAAGCATAACGAGCGGACGACATCTTGGCAAGCAGGAGAGAAGGTCTCACTGTAATCAATCCCATATGTCCGAGCATACCCCTTAGCAACCAAGAGTGCTTTGAGGCGAGCAACGGACCCGCGAGAATTCACTTTGACAAAGAAACACCCACTTACAACCAATCGTCTGCTTTTTCATTCGGACGAGCTACCAGTTCCCAAGTACCATTCGCATCCAACGCAGCCACCTCCTCTACCATCGCTGGTGCCAACTGAATGGGACAAGGCTTCACGAGTACTTTTAGGGACGAGAGACGAGAATCAAGGGAAGTCGAAAGGAAAACGAAGTAGGGGATAATTGATGGTATGACACATATGTGGAGATAGGATACGTGCAAGAACGTTTACCTTTGCGAAGAGCAATGGGCAAGTCTAGATCATTACTAGCTTGCAAGTCGGATGACGAAGAATCTGCCAGGCATGGGACAGCCGCCGAGGGTCGTGATCGTAGGGTGTATACCGAGTAAGAGATGGACTAGGAGGAGGGGGTCGGACCCATCGGACGAGGACACAACCTCATAAACCAACAAATCATCCTCCACGGTGGGGACTAGACACAGGATCAAACGGAGTATCCTAAAAAAGGTAACATCGTAAGAGAGGCGACATAACGACCGTGCACTCGGGCAAAAACAACGATAACCCTTCCGGGCGAGAATACCCGAGGAAGATACATTTCAAAGACTTAGGATCAACTTGGTCCTTTGAGGACGAACATCGCGAACAAAGGACGTACATAACCAAAACCTTCGGGAAGGTGGAACATCTTCGTGGAGGATACAAAACACGGAATGGAATTTGATTACCCAAAATCGACGACGGCATTCGATTAATGAGAAAAGCAGTTGTAGACACAGCGTCAACCCAAAAATGTTTTGGAACATTCATCCGAAATGACAGGCACGAAATGTGTTTCCGGCAAATGCTCTGTTCTTACGCTTCGCCACACCGTTCGGGATGGTGTGTCCGCACACGCACGATTGATGAATAATACCCTTCTCACTAAGATAGGAACGAAGGGTGCCGAAAAATATTCGCCCCCATTATCAGTGCGTAAAATTTGAATGGAAGCTTTAAATTGATTACGAATCTCAGCATTAAAGGTACAAAAGTGAGAAAACAATTCAACACGATTTTTCATTAAATAGACCCAAGTAAATCGGGAAAAGTCATCAACAAACGTGACAAAATAGCGAAATCCCGTTTTAGACATAACAGGACTCGGACCCCAAACATCAGAGTGGACCAATTCAAAAGGGAGCGGT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ATGCATGAAAGTCATCTGTTGCAGCTTCTTTTGGGGATAATACAGTGGATCGATCCTCCTGATGCTGTTTTGAGATCAATTGAAAGTGGAAATAGTGAAAGTGAGATGCTTGATGGTTGTCGTGCATTGCTGTCTATTGCCACTGTAACAACTCCAGTTGTGTTTGACCAACTACTTAAATCAATCAGGCCATTTGGCACTGTTCAACTGCTATCTAGTTTGATGGGTGAAGTTGTGAAGGTTCTTATGACCCATAACAGTGATGACGAGACGTGGAGTTGGCAAGCCCGTGATATATTACTAGACTCCTGGACTACCCTTCTCATACCACTGGAGAGGTCTGGTCAGAGTTCATTGCTTCCACATGAAGGTACCAGCGCTGCAGCTAACCTGTTTGCTCTGATTGTGGAGTCAGAGCTAAAAGCCGCATCTGCCTCAGCATTGGATGAAAGCGGAGAATCTGAATATTTTCAAGCTTCCGTTTCTGCCATGGATGAAAGATTAAGTGCTTATGCTCTTATCGCAAGGGCAGCAATAAATGTCACAGTTCCCTTCCTCGTAGGAGTGTTTACAGAGCGTCTCTCTAAGCTTAATCAGGGCAGGGGCATCATCGATCTAACTGAAACCCTCGAAGAAGTTTACTCTCTTCTTTTAATAATTGGGCACGTGCTAGCTGATGAAGTGGAGGGAGAAACACCGTTGGTACCAAATGCTATACAGTCCCATTTTACTGATGTGATGGAAGCAAATAAGCATCCTGTTATTGCACTATCTAGCTTAATTATTAGGTTTTGTGAGCAATGTTTGGATCTACAAATCCAGGCATCAATTTTCAGCCCTCGACTTATGGAGTCAGTTGTATGGTTTCTATCAAGATGGTCGTCAACATATTTACTTCGTCCTGAAGAAATCATCACTAGCAACTGCAATAACGGTAAAGAATCTGATCGCGAGTTCCAATCACAGCGTACCAGGAAAGTCTTTTACAGCTACTTTGGAGAACATGGCCAAGGAATACCTATACTTGACATTATTATTCGCATATCAGCAACCACACTTTTGTCATATCCTGGGGAAAAACACTTGCATGCACTCACGTGTAACCAACTACTTCGAGCACTTGTTCGTCAGAAACATATTTGCAAACATCTTGCTTCCTTGGATTCCTGGCGTAATTTTACAAAAGCTTTTGATAATGAAAATAAATTATTCTTGTTAGATTCCACTCACCAGCGTTCACTTGCGCAAACATTAGTGCGTTCGGCTTCTAGGGTGAGAAATATAGAATCATCAAATCAGTACGTGAGGGACCTTATGGGTCATACAGCAACACATCTCATAGAAATGGCTAGCAGGAAGGATTTAACTAGTATTGCTCAACAGCCTGATGTCTTAATGATGATAAGTTGTTTGTTGGAGCGGCTTCGTGGAGCTGTTTGTGCTTCAGAACCTCGGACTCAGAGAGCAATTTATGAATTGGGATTTTCTGTTCTGAACCCTGTTTTGGTTCTTCTTGCAGTTTACAGAGATGAGTCTGCAGTTGTTTATATGCTACTGAAATTTGTGGTTCACTGGGTGGATGGACAAATTAATTATTTGGAAGCTCAAGAAACAGCTACTGTGGTTGAATTTTGCATGCGTTTGCTCCAACTGTATTCATCACATAACATTGGCAAAATATCAATAAGCCTTCTTAGTGAGGCAAAAAAAGAAAAATACAAGGATTTGCGTGCACTTCTTCAACTTCTGTCGAATCTTTGTTCAAAAGATCTGGTTGATTTTTCATCTGATAATTCTGATATGCCAGCAACCGATATTTCTCAGGTTGTGTACTTTGGTCTCCACATCATTAGTCCATTGATATCTTTGGATTTGTTGAAATACCCAAAGCTTTGCCGGGATTACTTCTCTTTGTTGTCGCATTTGCTGGAGGTTTATCCTGAAACAGTTGCCAAACTGAATCATGAAGCTTTTGCACAAGTGCTTAGGACTCTTGACTTTGGTCTCCGCAATCAGGACGTTGAAGTTGTCGATATGTGTCTCAAGGCCCTAAATTCGCTTGCTTCATACCACTTAAAGGAAGTTGCTGCAGGTAATCTTGGATTGGGCACCCTAGTAATTACCAGAAAGGATGCAGGTGAAGCTGTGCAGGAAAGTGTTCTGAGCGGGTTCCTCAAGTCTCTACTGCAGTTGCTTCTTTTTGAAGATTACAGCCCTGACTTGGTGGGGAATGCAGCTGACGCTCTCTTTCCTCTAATGCTCTGTGATCAAGGACTATACCAGAAATTAGCTACAGAGTTAATAGAAAGGCAGGAAAATCCAGCATTCAAGTCAAGGATTGCAAATGCCTTGCATACTCTTACCAGTGCAAACCAGCTTTCTTCCGTGCTTGATCGTAAAAATTCCCAGAGATTTAGGAAAAATTTACACAACTTCCTAATTGAAGTTCGGGGTTTTTTGCGGACGGTTTGA MHESHLLQLLLGIIQWIDPPDAVLRSIESGNSESEMLDGCRALLSIATVTTPVVFDQLLKSIRPFGTVQLLSSLMGEVVKVLMTHNSDDETWSWQARDILLDSWTTLLIPLERSGQSSLLPHEGTSAAANLFALIVESELKAASASALDESGESEYFQASVSAMDERLSAYALIARAAINVTVPFLVGVFTERLSKLNQGRGIIDLTETLEEVYSLLLIIGHVLADEVEGETPLVPNAIQSHFTDVMEANKHPVIALSSLIIRFCEQCLDLQIQASIFSPRLMESVVWFLSRWSSTYLLRPEEIITSNCNNGKESDREFQSQRTRKVFYSYFGEHGQGIPILDIIIRISATTLLSYPGEKHLHALTCNQLLRALVRQKHICKHLASLDSWRNFTKAFDNENKLFLLDSTHQRSLAQTLVRSASRVRNIESSNQYVRDLMGHTATHLIEMASRKDLTSIAQQPDVLMMISCLLERLRGAVCASEPRTQRAIYELGFSVLNPVLVLLAVYRDESAVVYMLLKFVVHWVDGQINYLEAQETATVVEFCMRLLQLYSSHNIGKISISLLSEAKKEKYKDLRALLQLLSNLCSKDLVDFSSDNSDMPATDISQVVYFGLHIISPLISLDLLKYPKLCRDYFSLLSHLLEVYPETVAKLNHEAFAQVLRTLDFGLRNQDVEVVDMCLKALNSLASYHLKEVAAGNLGLGTLVITRKDAGEAVQESVLSGFLKSLLQLLLFEDYSPDLVGNAADALFPLMLCDQGLYQKLATELIERQENPAFKSRIANALHTLTSANQLSSVLDRKNSQRFRKNLHNFLIEVRGFLRTV Homology
BLAST of Sed0007400 vs. NCBI nr
Match: KAG6588304.1 (Exportin-4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1435.6 bits (3715), Expect = 0.0e+00 Identity = 741/827 (89.60%), Postives = 780/827 (94.32%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. NCBI nr
Match: XP_022966402.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1433.7 bits (3710), Expect = 0.0e+00 Identity = 740/827 (89.48%), Postives = 779/827 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. NCBI nr
Match: XP_023530569.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1431.4 bits (3704), Expect = 0.0e+00 Identity = 738/827 (89.24%), Postives = 779/827 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. NCBI nr
Match: XP_022933418.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1430.2 bits (3701), Expect = 0.0e+00 Identity = 738/827 (89.24%), Postives = 779/827 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. NCBI nr
Match: XP_011660267.1 (exportin-4 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1419.1 bits (3672), Expect = 0.0e+00 Identity = 740/829 (89.26%), Postives = 776/829 (93.61%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C0E2 (Exportin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 245.4 bits (625), Expect = 2.3e-63 Identity = 212/801 (26.47%), Postives = 373/801 (46.57%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZMR9 (Exportin-4 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=XPO4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 245.0 bits (624), Expect = 3.0e-63 Identity = 209/801 (26.09%), Postives = 373/801 (46.57%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ESJ0 (Exportin-4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Xpo4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 243.0 bits (619), Expect = 1.1e-62 Identity = 203/790 (25.70%), Postives = 365/790 (46.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499Y0 (Exportin-4 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 240.7 bits (613), Expect = 5.7e-62 Identity = 203/800 (25.37%), Postives = 373/800 (46.62%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q802D3 (Exportin-4 OS=Danio rerio OX=7955 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 8.2e-61 Identity = 211/882 (23.92%), Postives = 404/882 (45.80%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HMV7 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466059 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1433.7 bits (3710), Expect = 0.0e+00 Identity = 740/827 (89.48%), Postives = 779/827 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4P1 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440841 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1430.2 bits (3701), Expect = 0.0e+00 Identity = 738/827 (89.24%), Postives = 779/827 (94.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DVW5 (exportin-4 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1414.8 bits (3661), Expect = 0.0e+00 Identity = 732/827 (88.51%), Postives = 773/827 (93.47%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ73 (exportin-4 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1414.8 bits (3661), Expect = 0.0e+00 Identity = 732/827 (88.51%), Postives = 773/827 (93.47%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9M8 (exportin-4 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487293 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1414.1 bits (3659), Expect = 0.0e+00 Identity = 737/829 (88.90%), Postives = 774/829 (93.37%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0007400 vs. TAIR 10
Match: AT3G04490.1 (unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT4G38092.1); Has 75 Blast hits to 64 proteins in 20 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 36; Fungi - 0; Plants - 22; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 17 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 953.7 bits (2464), Expect = 9.4e-278 Identity = 502/822 (61.07%), Postives = 623/822 (75.79%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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