Sed0006984 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0006984
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 15598634 .. 15602388 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0006984
SyntenySed0006984
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTTTGCTTGGCAACGAAATAATTAGATGTGAAATTTGCCAATATTATCGCATTTATTCCACCGCCTCTATTATTAATTCAACCACATCACTTAACATCAGTCGTCGATCTTTTTAGCTGCTCCCCAATCTTAGCCGTTCATTTCATCCGTTCCCTCCATAAAAGGATAAGCCCCTCTGCATCTTACCACGCCTTCTCTGCAAACCCTAGTTTTTCCGTTTCTTTGATTTAGTTTTTGGCAGATCTGGCTCCGTCGTCTTCTCCGGCGTCGTTTCGGTGGTTGTAGGTCGATAGATCTGGTGTGGATCTACGCGTTGATTGTGGTTTGTTGTCGATTCGGCTACCAGTGACGGATTCTGGAAGTTTTTCTTGATTCACTCAGGTTCAACGTCAGATCTGGTCTCTCATCCTCTATGTTCATATTCTAACACCGACTATTGGATTGTTCTACTGTTCTTTCTTTTGTTTTGTTTGGTGATTTCATATTTGCGACGAGCGTGGAGGTTCTGTTTCAATACTCTCCAATCCAGGGTTTGATTCTTGATCTGGATTTTAGCTTTGTTATTATTATGCAACGAAAGGCGTTTGTGTATATTCTAACAGGTATGGAATTAGAGTCGGCGTTGGAGTTCGGTGTAGGCAGTAGCGATCGGCATCACTGTTGGAGGATACGTTATATTGGACGATTAGGCTGTTATTGTAGCAGATCAAGGTGTATTCGGTAATTAGTTTCGTTATTATGATGAATCGAAGGATATATCGATCTGTTTTAGCAGGTTTGGAGGTAGAATCGACGTTGTGCAGCTATAACGCTAGGAAATCTCTTCTATTCGACGATCACTGGATCAGATGTCTCGGTAATTTGTTTGGTTATTATTATGCAACAAAAGACGTTTCGTTCTTTTCTAGCAGGTATGGAGTTGGAGTCTGCCGTTGAATCATTGGTTTCATTGGACGATGATGACGTTTATTGCAGCAGATCAAGATTATTTCAGTAATTTGATTGGCTATTATTATGAAGGACTTCGATTTATTTTATCAACAATGGAGTAACATTGGGCGTATGATGTTTGTGGAGGAAGTAAAGCTTGGCCGTAGCTGCTGGATTCGCTGTTTTATGAAGATGTGGCTGTTGGTGGCAGACGCTCAAAAGAAGCTGTTGGTTATATTATTGGATGAAAATTGTATCTTGTATCATAGTGCATCAGAAAGATTAGATGAGTGATTGTGGATGTAAAAGAAATCAGGATTTAACCTCCCTTTTAAGGAGGATGAATTCTGGTAGCTCTTTGTCATCCGGCCTTTGCCATGGCAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCATCCCATAATAAAAAATTACAATGTTTTGGTTTCGAGGGGAGATCGCACGGGGATTTCCCGGGGTCTCCCCTCTCTGGTCTGGTCTTTCTCTTGCTCTCTATTTCTCTCAGCTCATCAACCTCAACCGCCACAGAACGTCTTCTCTGGTCTTAGCTTTGACCCTATTGAACTCGCTACAATCGAAGGTACTTCTGCAAATTTTTATAATTAAGGTTAAAAACAATCCTTTAAAAGTTGGAAAAAAGAGCCAATAATTTGATCATCTTACATGCAAAACTTAATTTAATGTAGCATACGTTTTTTACAATTGGTATCGGCTATATTCATCTTATCCCTTCGATGGTTCAAAGTTTTCTAAACTCAACATGAATCAATAGTAACAATACCTCTCGGAATTTTCCAATGACAGTTTTTGCTCTAGGAGGAGTATCATCAATTTCAACCGTGTTTCCCAATGAAAAGTGAGATTTTCACCTGGTAATTTTGTTACATACATGTTAGTAATTACGGAGGGCTTGCATCCACCTTTCTTGTGACTATACAATTGTGTTAATTTCATCCCTCATTATCATATGTTTTGTTATTCTATAATAAGCTTGCTATTTCCACGCTTACTCCACAATTTATTCTTAAATTCATGGTTATTTAGGATTTTTATGGAATGAATATTTGGATTACCACGTTTATTTAACACGAATCGTAAATATTTTGGGCATCTTGAGATGTCTATTTGATAGGCATTTGGTTGGATGTCTGGCAACATGTGCTTTTAGGATTTCTATGTATAAGGCATCCTTAATGACATTTTTATCCTTTTTATTAAAATTATATATCATCCATTCATATCAACTTTTTTTTTTCCCATATTTTATGAGTAGTTTGTAGCTTAAAATAAAATAATATATTTTTTTTAGTATATGATTATTATGACTGTATTAACCACTAATCATATATAATTAATTTTATTTATATTTTTCAAATGTAATTGCCTACTTTTTTATATTTGGCGAATTTTATTGCTTATCAACTAAAGAATTATTTTAGGTTTTTTATTAAATAAATTTATTTCAAAAAATAATAATTAAATTAATAAAAAAAATATATGTTATATAAATTTTAATTATATAAATTAACTTGTAAATTAAGTTAGGAGGGTATTTAAATCATTTTTATAACTGTTTGTTCGATATCCATGAAATTATTTCTACAAAATAAACATGGTTATCTAAAAATGTCGGATATTTATTATTCTAGGATCTATGATTTTGAATATCCAAAGATTCCGGTTATCTAGATTACTAGAAAGTAAACGGTCTTAAGATTGGTTGACTTCAAACTACGTAAGAGTTGCCTGTTCTCTACATTTTCCTTTTGCATTGTTCGTAATTATGTTGGTTTTCTTTGTAGTACTTAATAATTTTAAACTATCCCCACTTATGGGTTGTACAATTTAGTTTAGTGTCATAGAATTCGTGTTTTGCATTGGCTGTATTCTATTATTAGACTTGAAGCAGTTTGAATGGCCTGCACTTGTATCCTGCCGTTGAAGACCCAATCTATTGGATAAGCGTGGACTGTTATGGTACTCCTGATGCTCGCGGCTATTAATCTACAGTTTTTGCGAGCTTTTATAAGGTTTGACTATAGTAGTTATCTTTTGCTATGCACCTTTATAATTAATGCTTGTTGCTTGTTTTCAGGGTGCAGTGAATTTTATGATGGCATCATTTCACACATTAGGTTCTAGGTTTTTTTTTTCTTAGTGTTATTATTTTTATTTACATACGGTTGTCGATAAGCAGCATTCTTAGTAACTATTTTCCACCAAGTTTCTATTAAATGACATGGATGTCGCTACTGACAACATTGCATTTGATATGTCGTTACTTTTTTTTATAACAATAACTTTTAGTGTTTTTTTAACAATGGTGAACTCTAGAAATCGAGTTGTTGCCTTCTTTTCCTTTTTATATAAGAGTTTAGTTGTCATCTTTTCCTTTTTAGATAAGAGTTTAGTTGTCATTACTACATTAAAGAAATTGAGTTCAGTTCTATTACAGAGGAGTTTAGTTGTTGTCATTACTACATTAAAGAAATTGAGTTCAATTCTATTATAGAACAGGTTAATTTTATCAGAGGTTTAAAAATGCAACGGTATGCCTGTCTAGTTCTCATCATTAGTCAGTTCATATAATTGGCATTCATCAAACCAATTCAAATTTTTATTCAAACGAAGTCAAATTTTAATTCAAATCAAAGAGAATAATTTAAATTTGAATTATGTTTTTTTTCTTTGAAGATGAATTGATCTCTATTTTTTGATTATAGAACATTAGTTATGTTTTTCGAAAGGAAAAGGAGAAAAATTTAGGTGCTGTTTGAATATGTGTTTATATTTAACACATTTTTTTATAAATGAC

mRNA sequence

CTTTGCTTGGCAACGAAATAATTAGATGTGAAATTTGCCAATATTATCGCATTTATTCCACCGCCTCTATTATTAATTCAACCACATCACTTAACATCAGTCGTCGATCTTTTTAGCTGCTCCCCAATCTTAGCCGTTCATTTCATCCGTTCCCTCCATAAAAGGATAAGCCCCTCTGCATCTTACCACGCCTTCTCTGCAAACCCTAGTTTTTCCGTTTCTTTGATTTAGTTTTTGGCAGATCTGGCTCCGTCGTCTTCTCCGGCGTCGTTTCGGTGGTTGTAGGTCGATAGATCTGGTGTGGATCTACGCGTTGATTGTGGTTTGTTGTCGATTCGGCTACCAGTGACGGATTCTGGAAGTTTTTCTTGATTCACTCAGGTTCAACGTCAGATCTGGTCTCTCATCCTCTATGTTCATATTCTAACACCGACTATTGGATTGTTCTACTGTTCTTTCTTTTGTTTTGTTTGGTGATTTCATATTTGCGACGAGCGTGGAGGTTCTGTTTCAATACTCTCCAATCCAGGGTTTGATTCTTGATCTGGATTTTAGCTTTGTTATTATTATGCAACGAAAGGCGTTTGTGTATATTCTAACAGGTATGGAATTAGAGTCGGCGTTGGAGTTCGGTGTAGGCAGTAGCGATCGGCATCACTGTTGGAGGATACGTTATATTGGACGATTAGGCTGTTATTGTAGCAGATCAAGGTGTATTCGGTAATTAGTTTCGTTATTATGATGAATCGAAGGATATATCGATCTGTTTTAGCAGGTTTGGAGGTAGAATCGACGTTGTGCAGCTATAACGCTAGGAAATCTCTTCTATTCGACGATCACTGGATCAGATGTCTCGGTAATTTGTTTGGTTATTATTATGCAACAAAAGACGTTTCGTTCTTTTCTAGCAGGTATGGAGTTGGAGTCTGCCGTTGAATCATTGGTTTCATTGGACGATGATGACGTTTATTGCAGCAGATCAAGATTATTTCAGTAATTTGATTGGCTATTATTATGAAGGACTTCGATTTATTTTATCAACAATGGAGTAACATTGGGCGTATGATGTTTGTGGAGGAAGTAAAGCTTGGCCGTAGCTGCTGGATTCGCTGTTTTATGAAGATGTGGCTGTTGGTGGCAGACGCTCAAAAGAAGCTGTTGGTTATATTATTGGATGAAAATTGTATCTTGTATCATAGTGCATCAGAAAGATTAGATGAGTGATTGTGGATGTAAAAGAAATCAGGATTTAACCTCCCTTTTAAGGAGGATGAATTCTGGTAGCTCTTTGTCATCCGGCCTTTGCCATGGCAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCATCCCATAATAAAAAATTACAATGTTTTGGTTTCGAGGGGAGATCGCACGGGGATTTCCCGGGGTCTCCCCTCTCTGGTCTGGTCTTTCTCTTGCTCTCTATTTCTCTCAGCTCATCAACCTCAACCGCCACAGAACGTCTTCTCTGGTCTTAGCTTTGACCCTATTGAACTCGCTACAATCGAAGTTTTTGCTCTAGGAGGAGTATCATCAATTTCAACCGTGTTTCCCAATGAAAAGTGAGATTTTCACCTGGTAATTTTGTTACATACATGTTAGTAATTACGGAGGGCTTGCATCCACCTTTCTTGTGACTATACAATTGTGTTAATTTCATCCCTCATTATCATATGTTTTGTTATTCTATAATAAGCTTGCTATTTCCACGCTTACTCCACAATTTATTCTTAAATTCATGGTTATTTAGGATTTTTATGGAATGAATATTTGGATTACCACGTTTATTTAACACGAATCGTAAATATTTTGGGCATCTTGAGATGTCTATTTGATAGGCATTTGGTTGGATGTCTGGCAACATGTGCTTTTAGGATTTCTATGTATAAGGCATCCTTAATGACATTTTTATCCTTTTTATTAAAATTATATATCATCCATTCATATCAACTTTTTTTTTTCCCATATTTTATGAGTAGTTTGTAGCTTAAAATAAAATAATATATTTTTTTTAGTATATGATTATTATGACTGTATTAACCACTAATCATATATAATTAATTTTATTTATATTTTTCAAATGTAATTGCCTACTTTTTTATATTTGGCGAATTTTATTGCTTATCAACTAAAGAATTATTTTAGGTTTTTTATTAAATAAATTTATTTCAAAAAATAATAATTAAATTAATAAAAAAAATATATGTTATATAAATTTTAATTATATAAATTAACTTGTAAATTAAGTTAGGAGGGTATTTAAATCATTTTTATAACTGTTTGTTCGATATCCATGAAATTATTTCTACAAAATAAACATGGTTATCTAAAAATGTCGGATATTTATTATTCTAGGATCTATGATTTTGAATATCCAAAGATTCCGGTTATCTAGATTACTAGAAAGTAAACGGTCTTAAGATTGGTTGACTTCAAACTACGTAAGAGTTGCCTGTTCTCTACATTTTCCTTTTGCATTGTTCGTAATTATGTTGGTTTTCTTTGTAGTACTTAATAATTTTAAACTATCCCCACTTATGGGTTGTACAATTTAGTTTAGTGTCATAGAATTCGTGTTTTGCATTGGCTGTATTCTATTATTAGACTTGAAGCAGTTTGAATGGCCTGCACTTGTATCCTGCCGTTGAAGACCCAATCTATTGGATAAGCGTGGACTGTTATGGTACTCCTGATGCTCGCGGCTATTAATCTACAGTTTTTGCGAGCTTTTATAAGGTTTGACTATAGTAGTTATCTTTTGCTATGCACCTTTATAATTAATGCTTGTTGCTTGTTTTCAGGGTGCAGTGAATTTTATGATGGCATCATTTCACACATTAGGTTCTAGGTTTTTTTTTTCTTAGTGTTATTATTTTTATTTACATACGGTTGTCGATAAGCAGCATTCTTAGTAACTATTTTCCACCAAGTTTCTATTAAATGACATGGATGTCGCTACTGACAACATTGCATTTGATATGTCGTTACTTTTTTTTATAACAATAACTTTTAGTGTTTTTTTAACAATGGTGAACTCTAGAAATCGAGTTGTTGCCTTCTTTTCCTTTTTATATAAGAGTTTAGTTGTCATCTTTTCCTTTTTAGATAAGAGTTTAGTTGTCATTACTACATTAAAGAAATTGAGTTCAGTTCTATTACAGAGGAGTTTAGTTGTTGTCATTACTACATTAAAGAAATTGAGTTCAATTCTATTATAGAACAGGTTAATTTTATCAGAGGTTTAAAAATGCAACGGTATGCCTGTCTAGTTCTCATCATTAGTCAGTTCATATAATTGGCATTCATCAAACCAATTCAAATTTTTATTCAAACGAAGTCAAATTTTAATTCAAATCAAAGAGAATAATTTAAATTTGAATTATGTTTTTTTTCTTTGAAGATGAATTGATCTCTATTTTTTGATTATAGAACATTAGTTATGTTTTTCGAAAGGAAAAGGAGAAAAATTTAGGTGCTGTTTGAATATGTGTTTATATTTAACACATTTTTTTATAAATGAC

Coding sequence (CDS)

ATGAGTGATTGTGGATGTAAAAGAAATCAGGATTTAACCTCCCTTTTAAGGAGGATGAATTCTGGTAGCTCTTTGTCATCCGGCCTTTGCCATGGCAGGTGCGCTTGCATGGCAGGTCATCCCATAATAAAAAATTACAATGTTTTGGTTTCGAGGGGAGATCGCACGGGGATTTCCCGGGGTCTCCCCTCTCTGGTCTGGTCTTTCTCTTGCTCTCTATTTCTCTCAGCTCATCAACCTCAACCGCCACAGAACGTCTTCTCTGGTCTTAGCTTTGACCCTATTGAACTCGCTACAATCGAAGTTTTTGCTCTAGGAGGAGTATCATCAATTTCAACCGTGTTTCCCAATGAAAAGTGA

Protein sequence

MSDCGCKRNQDLTSLLRRMNSGSSLSSGLCHGRCACMAGHPIIKNYNVLVSRGDRTGISRGLPSLVWSFSCSLFLSAHQPQPPQNVFSGLSFDPIELATIEVFALGGVSSISTVFPNEK
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0006984.1Sed0006984.1mRNA