
Sed0005794 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGATTTCAATTTCAATTCCAAGAAGTTCCAATTTCTGTTAGTCGTCATTTGCTTTATCTTCCTACGTTCCAAAGGTACGTTTGACTCAAACCCTAATTCTGATGTAAATCTGTTGAATTCAAGAAATGCGTTTGTGATTAATTATCGCCCTGTTTCTTTTCTTTTCTGGGTATTTGATTTTGTTTGTTTTCCAAGTAAGTAGAGAATGGTGAAGAAAGAAATAAGAGAAAAATCTTTGAATGGCTCTGTTGGGTTTTGTTGTATGTGTCTTGAAGAAGTGAAATACTAGTAATGTTCCCGAGGTAACCTCGTTGGTAGATGTTTGGGGTCTTCCCGTCTAGGTTTGGAAATCACGAGTGAGCTTAATTGTAAAATCTCTTGCTGTCTTTCAGCTATATTCCGAAAGACGGGTGTGAGTGCTCTCGGATATGTAGTGTGGTAATGCTCTGATTCCCGATCATCACAAAAAGAAAAAGAAAGAAATAAAAAATGCTAATTGTAATCTTGTTTAGGTTTCTTGTTTGTGGATGGAATATTAATATGTAAAGCTCTGTGGAGTGGGAGAATCTTAGTGGAGCAGAATTCTTGTGCTGCTTTGTCTTGATCTTGCTTGAGTTTATCATAGATTTTGTTTCAGAGTAATGAGACAAGTAAAAGAAGGCACATCTTAAAAACCCTTCTGATTATATGGTAAACTCCTGTTGTTTATTTGGTCAAATCATAGTTGACTTAGGGCACCTATGTTCCGCCAAAGTTCAGACTCGAGTGACAACAAGAGATTTTATTGATAAGCGTTTTTAAGAAAAGTTGAACAACTACAAACCTTTATGAAAAAATAGCTGTCATTGAGTTATTTGGATCCCAGTGATTGTTAGGAAAGTAATTTTAAAAATGTAGAACTGAGTATCAAAATGCCTTAATAAACACTTTCTATATAAGAAGAGCTTATAATTAATGTATTCTTCTACAAATACTTAGTTTAAAAAGCACTCTCAGGTTCATCTTTATACATATGTTCAATTTTAGATATTAAAAGAGAAATTGAGGGAAAGCATTAAAATCTCGGTTTTGTGATGCATATTTTTTTAATCCCTCTTTTGTTTGTGGTCTGCTATGCCTAGTTTACAATGATTATTGAATTCCCAAAGTGTACAATGTATTTTAATTGTTGATCTTGAAGATGAATTTTAATGCTGATTGGTGATGGAAGACTTAAGTACTATGCTGAGAAACAAAAATTTAAGTATTCAAATGATTGAAGTTTTTATGTCTTGGATGTGGGTTTATTTAGGGAACTGAATCTTATAGGCTGTTTATATTATTCAGTTACTAGGTTTTAATAAAAAGGAACATGTTTACCTATATGTTTAGTCATATTATATCTTTACATATACTTTTGTTCCTTAGTTTTTGTACAATACATATATTGTTGTATTTACAGTCTCTTTTTTCATATATATCTTTTTTATAGCGGATAATTATCGATTTTGGGTTGGGGAGGAAGCTTCATCCCAGAGTAGAAAGTTCACAAGGTTGAGTTGTTTTGACATGGGTTCTGGGTCTGTTACTTGTGTTGTGAAGAAGGGGGTACAACTATACTTCTACAGCTTCCATTCGATCCATGTCGAGATAGCACGGCGCAAAGCACTCGAAACTGCATTGGCCAATGCTGTGACTTGGGAAATGTCTACAAGAGAAGCAGCAATATATGCTCGGCAAGAGGGAGTCGTGGCAGCAAAGTTGGCAAAGCAACAAGTGCAACGCATCGTTGGGCCATTTGTCTCTTCGGAATGGGATTATTTTGAAGCTCGATACTATGGTGGTTCTGTCTTAGAAGCCTTCCTCACAGGCTCGGGGACTCTTTTCGGTGCCTATGGGGGAGGTATGATTGGCGAGCAATGGCTCGGTTGGTTTGGGTACCTTACAGGAGGTTATTTAGGTAGTTTGGTTGGAGGTAGAGTAGGACTTATGGCATATGATATTGTCAATGAAGTGCATTTCTTGCCCAATTTTGTTCGTGGTGAAGAAGAAAATGGAGTCCATGAAAACGCAGCCTACGTCGAAAATGAAGCTCCATATTCGAATTCGGACGACTCCCTTGTTGATGAAGCTCCTATATATACCACAAACGACTTCCTTGCTACGAAGCTCCTATATTTACACCAGCTTCGAAGGTTTTGAAGAATCATACAACTCTGGAACTTCTCGATCTGACATTTTGGTAGACTACGAAAACTCCGAGTTTAGATGATGAATACTTGTAATTATTTTAGATGCTTTGTTGAGTTAGAGTCAACAATATGAGCAAAATAGAGTTTTTTAGATATTCTTTCAGGTTATATGTTCATAAATGTAGAAAACTTTCATTTTAATACTCCAATTTCAAGTTTCCTCTGTGCCTTTGCATGGGCCTGTGGATGTTTGCAACTTAGAGAACCTCATAGAATTGGAAGTTTGGAAGAAATCTTTAATGGAAAGCAAGTTTTTTGAGTCATTTTGTTTTTTTGCTTGTAAAATTATATATATGTATTATTATATACTACTATTTGAGGATTTTAGGATTAAAAAAAATTAAGACTTTTTAGTTGGCTGTATAACAGTCTCTTAAAGGGTACTGAATTTTTATCTAAAATATATACCTATTGAGTTCGATAATAACTTAAATATGAATTGATATTAAAAAAAAATCAACTAAATACAACAAATGCATCAATTTCTTTAATTAACTTTGTAATTAAGGTTCCATTTGACTCTTAATTTTTGGTTTTTGAAAATTAAAGCTACAACTGAACTAAAATTTGAAAAAAAAAAAGAGGCTTTAAAGAATTTGTTTTGTTTTTTGGAATTTAATTAGAATTAAGATATTTTAAAGATAAAATTATCAAAATAAATTTAAATTTAAGAAACAAAAAATCAAATAGTTATGAAATATAATAACCTCAATTTTTTTTCAGTCACCAACTTCCAACTCTATTATTAATGAATTAAAAAAAAAAATTAATTGAATGTGAAGAAGAAGACAGAAAATTACAAATTCATAAAATTTGCCGAAATTCGCCAAATCTCATTCTCAATTCCCCAATTCCCCAATTTCCAAATTCAAACCCTAAAACGGCTTAGCTCACAGCCCCTTTTCGATTTGGGAAATGGGTTTCTGTTTTTTGGGAGGAATCTTTGTTGGGGTTTCGTTTTTGGCATTTGAAAACCCCTTGGAATAAGTCCTCTATTTCACTTCCATATATTTTCGGGTAAGTCCTCTATTTCAGTTCCTTCCAATTGTTCAAGTTTTTGGGTTGAATTCTTGTTGAGGAAAGAGTGATTATTGCTCATAGAATTAGAACTTTGTTGTTTAAAATGTGTTATCCTGTGCTGGGTAACTCCCTAATTGTGTTTGTACTCTTCCAAGTGTTTGATTCCTCTTTAGTTGAATTCAACCACAATTGAGCTATTGCCCTTGTTGGACTGTCCCTTTGTAGTTTGTACTTGCATCATAATTGGTGCATGATGCAGAAGTGCTTTCTTGCTTGAAAAGGCTATCCTTCAGATTGTATGGCATTTGTATAAATGCGTTCTAATCAAATTTGAAGAAAGAAGCACACAATTTCACGTCTGTGAAAACTATGTACGCCATCATTCGCCTCCGGTCGAGAGTTTCTCTGCCGAAAATTGCTTGGAAACTCAAGATTTCAACAACCCGACTGCCCTTCTGCACCTACAATTCAACCTCTACGGCTTCTACATCGAACGATTTCGATCCACAAATCATCTCCCACCTAATTTCCAGGCAACAATGGTCGAATCTCAAATCCCATTTCAAATCGAAATCTCCCATCGATTTTCTTCACCAATTGCTCGGTTCGGGAGCCGTTGATCCGTTGCTTGTGCTCAGGTACTTCAACTGGTCTCAAAAAGAGCTTAAAGTTAATTACAACATTGAACTATTTTGTAGACTCTTAAATTCCTTAGCCAATGCCAAATGTTACCCCAAAATTCGTTCGTTACTTGACTCTTTTGTTAAATCTGAAGAAAATTGCACGGTTTCTGTGTTTTTTCATACACTTTCGGTTTGTGGTGATCAATTTTGTGCTAATTCAATAATTGCTGATATGTTGGTGCTGGCTTTTGTGAAAAATTTGAAAACGGATTTGGGATTTGAGGCGTTTAAGCGAGCGGGTGATTATGGGTATAAGTTATCTGTGTTATCTTGTAATCCATTGTTGAGTGCTTTGGTGAAGGAGAAGGAATTTGGGGATGTGGAATTTGTGTATAAAGAGATGATTAGGAGGAAAGTTAGTGCTAATTTGATTACATTTAATGTTGTGATTAATGGGTTGTGTAAGGTTGGGAAATTGAGTAAAGCTGGTGATGTTATTGATGATATGAAAGTGTGGGGATTTTTGCCCAATGTGTTTAGTTATAACACTCTTATTGATGGGTACTGTAAAATGGGTAGGGTTGGGAGGATGCACAAAGCTGATGCTATTTTGAAGGAAATGGTGGCAAATAAAGTCAGCCCAAATGCTGTAACTTATACTATATTGATTGATGGGTTCTGTAAAGATGAAAACGTATTGACTGCGTTGAAGGTGTTCGAGGAAATGCGGAGTCAGGGTGTGAAGCCAACGGTAGTAACTTATAATTCCTTGATTAATGGTTTGTGCAATGAAGGGAAATTAGATGAGGCTAAAGTTTTGGTTGATGAAATGTTGGGTTTAAACTTGAATCCTAATGTCATTACTTATAATGCTTTGATTAATGGGTATTGTAAGAAGGGGTTGTTGAAAGAAGCTATAGAGTTGTTTGATAATATTGAAAGACAAGGGTTGGCTCCCAATGTTATAACATTCAATACATTACTTGATGGATTTTGCAAGTGTGGGAAGATGGAAGAGGCATTTTCGCTGCAAAGCGTAATGTTAGAGAAGGGATTGCTCCCCGATGTTTCGACGTACAATTGCCTTATCACCGGTTATTGTAGGGAGGGAAAAATGG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Match: XP_023536735.1 (uncharacterized protein LOC111798021 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 298.5 bits (763), Expect = 6.2e-77 Identity = 175/290 (60.34%), Postives = 202/290 (69.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. NCBI nr
Match: XP_022938246.1 (uncharacterized protein LOC111444389 [Cucurbita moschata] >KAG6586219.1 hypothetical protein SDJN03_18952, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7021051.1 hypothetical protein SDJN02_17739 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 295.4 bits (755), Expect = 5.3e-76 Identity = 174/290 (60.00%), Postives = 202/290 (69.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. NCBI nr
Match: TYJ96470.1 (uncharacterized protein E5676_scaffold546G001140 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 295.4 bits (755), Expect = 5.3e-76 Identity = 173/291 (59.45%), Postives = 205/291 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. NCBI nr
Match: XP_008453600.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103494253 [Cucumis melo] >KAA0048066.1 uncharacterized protein E6C27_scaffold385G001360 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 293.5 bits (750), Expect = 2.0e-75 Identity = 172/291 (59.11%), Postives = 205/291 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. NCBI nr
Match: XP_038889164.1 (uncharacterized protein LOC120079047 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 291.6 bits (745), Expect = 7.6e-75 Identity = 170/290 (58.62%), Postives = 201/290 (69.31%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3B9C7 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold546G001140 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 295.4 bits (755), Expect = 2.5e-76 Identity = 173/291 (59.45%), Postives = 205/291 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FCL6 (uncharacterized protein LOC111444389 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444389 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 295.4 bits (755), Expect = 2.5e-76 Identity = 174/290 (60.00%), Postives = 202/290 (69.66%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U1F4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold385G001360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 293.5 bits (750), Expect = 9.7e-76 Identity = 172/291 (59.11%), Postives = 205/291 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BXT9 (uncharacterized protein LOC103494253 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103494253 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 293.5 bits (750), Expect = 9.7e-76 Identity = 172/291 (59.11%), Postives = 205/291 (70.45%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LK00 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G034500 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 289.3 bits (739), Expect = 1.8e-74 Identity = 168/291 (57.73%), Postives = 204/291 (70.10%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0005794 vs. TAIR 10
Match: AT1G56423.1 (unknown protein; FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: endomembrane system; Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 191.4 bits (485), Expect = 1.0e-48 Identity = 118/274 (43.07%), Postives = 166/274 (60.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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