Sed0004798 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AGAATAGGAAGAAATGAAGAGTAAAGAAGACGCAAAAGCCTAGTCGAAGGGGGAGAGAACTCCCATCTCGGTGTGAGTTTTTCTGCACAACTTAGGTTTTCGTCTTCCATTGATTTTCATACGAATTTCAATTTCCTATCTGCGTTTGATCTTGCTCTGGAAGATTTTGGGGGTTGATTGGAGTAATCAACCGTATTGTGACCGATGAGGCCGATTCTGCTGCAGGAGCCGCCTAGCCCCACCGTGCCCAAACCAGACATTTTTGAAGGCGGCGTCTACGGCGTTATTCGGCGGGCGGTTGTCATCGGCAACGGCTCTTCTCGTTCTGAGAATCAGTGTATCGGTTTGGTTCAGGCGCTTGGTTTGGCTGACAAGCATGTGATCTATGTAAGTTGTTTGGATTCATCTTTTTCTAGGGTTTTAATTTGTTTACTTGTTTCGGTAGTGGAAGTTATGAAGTTTACTGTTTAATTGGGCGGGTTTTGGTCGTGCTTATGTGCTTTGCGTTACCGCGATTCTGGGAATGGGTGTTGTTAAGGATCCCACCTCGGATAGAGGGTAGAACTTGTAACAATGTTTAAGAGATATAGGTTATTCCCCTTGTTGCCAATTGGTTTTGAAAAGAAACTCCATATTATCTAATAGGGTGACACTGTGGTTGAAGGCTTTCAAATGTGCTCCACCCAATTGGTTTTGAGGAATTGGTTTTGAGGTGGAACTCAATATTCCTTCAATGTCTCTCGGTCCCTGGCCTGGGACCCCGGATATAATGGAGCAAAACTCCAATTTACCAGTTTTGAAAAAAAAAAAAGAAAATAGTGAGAAACAACTTTCGTATATCCCCGTTTGATGAGCTTAGCAAAGCCATAAACTAGAACTTCTGAACGTTTTTTTTTTCCTTCAATATTTGAGGGCTTGTATAGTAAAATCCCGAGACTAATAATTGGTATTTTCTTTGTGTTACCATCACATTCAGCGGGTTACAAGGCCTCGAGGAGGAATTAATGATTGGCTCCACTGGCTTCCAGTTTCTCTGCACAAAAAGTTAGATTATATCATGACCCTGTTAGGTGCTTACACTCGGATTTTGTTGCGATCCAAAGGGAGGAAACTTGTGCCTCTATCTTCAGAAAATGGTGGAAGGTTGGGTTTGTCTTGCGTTTTAGAAGCTGACATGAAACATATTGTATCGATGGCTCGGGAGACTTACGAAAAGTAAATATGTTTTCCAAATATTTTTACCGAGAATTGGATTATTGGACTTGATTTATGATATGTGCTTGTATAATTTTCAGGGATGGACCTTTATTGGTGGTTTCCTCTGGTCGGGATACGATAACTATTGCAAGTTCCATTAGACGCTTGGCATCGGAGAACGTTTTTGTTGTGCAAGTAAGATATTTATCCTTTGTCATATTTCATTTGGCCAAGTGATATGCTTGATAACCATTTTAGAGTTTGGATACTTTTCTTTTGGATTATTAACGTGGAAATTTATAAAAACAAAGAGTAGGTGCACAGCTCATAGTGGAAGGGAGCTCCCTTGTCCTGATTTAATTAGTACATTAGCTCTTTCAGATGGTCTAACATTTAGAATTTGGGGTTATAGATATGTGTCGCTTTCTTGTAAATCTTTTTCTTTTTGTGGGTGTATATCTCATCTCTCTTGGATTATATTTTCTTTACGGGTCTTTTTCTTTTTAATATCTTTGTAAACCTAATTATTTCTTAATATTTTAAGAAATAGGGTTTGAATGGGCTGAAATTCAATGAATTGGTAGAGAACTGATTCCGATGGTTTCATTAGAGAGTGCTAGAATCAATATAATGTTAGGATCTTAAATTTCTTGGTGTCCCTCAATTCTTTCTATAGGATTAGGAACTATTGTACATGTTTCTAAGAAAGGAAGTACATCTTGCTTAGTTGGCGTGACTCATGAGAGAACTGAATCGTATGGTTTCGTGCAGAGGAGATTTCTCTCTTGTGTTTTTGGTTTAGGCTTCATTTTTCTATTACATTTTTATAATATCTCTAGAGAAATGTCCCCTAGGGGTGGCGTAGTGGTTGAAGACTAGGGCTTTGAGGGTATGCTCCCCTCAAGGTCCCAAATTCGAGACTCACCTATGGCATTACTTCTTCGATGTCTCCCATGCCTAGCCTAGGGATGAGTGTGGTTACCTTGTTTCAAAAAAAAATATATATCTCCAGAGAAATGTTTGATCTCTCTTCCTTTGTTGGGAAAGATAAAGTGCTTCATCAAGCTGCGTTATTGCTGTATGTTTTGTAGGAAGTAGTATGTTATTGGATGAAAAATTAACCTGGCGCTCTGTAGATCAATATTTCTTTTTGCCTCTCTCAACTGTTAATGCATCCTTTTTTAAAACAATTTTGTTCTTTACTAGTTAGGGGAGTTACTTGCTTACTAGCTGAGTTTTGTATGATTGATTCTGGTGGTTTTTTGAGTTTCACTATCTTTTGCTGTCTTTTTGCATCTCTTCATACCTGATATTTACTTCAACACGAAGCCATGCTTGAAGCACACTCCGGCATATCTATTATCCAGCTTGACAAAATTTTGCAATTTGCTCAATTTGTTTTATGTAGCTGTATCAGTTGTTCATTTTGGTTTTTGTGTATTTTGATTAGTGGGATTTTAAAGGAATACTTAAGTTGTGAGTTCTTATATTTGCGTTTTCTCCATGAGGTAAGATACAACATCCAAGATTGCATTTGAATCGGTTTGACATGGTCATCACTCCTCGTCATGATTATTATCCGTTAACTCCTCAAGCCCAAGAGCAAGTTCCTCGATTTATAAGGAAGTGGATAACTCCACGTGAACCACCAGATCAGCATGTGGTAAGTGTGCTGCCTTAAACATCTCTTATTATTCTTTGATAAAATTTTTTTGCTTATAATGTCGTGTTCCCTTCATTCCCTTGACAAACTACAGTCTGTTCTTAAATTTTCAAAATTCAGGTCTTGACTGTAGGAGCGCTGCATCAGATTGATTTTGCTGCATTACGTAGTGCAGCTAGTGCGTGGCATGATGAGTTTGCTCCTCTTCCAAAACCGTTATTGGTGGTCAACATAGGAGGGCCTACAAGTGAGTTTCTCAATATATTGGGCTGTCATACTCATTTTTTATTTTTGTATCATTCGCATTGTTTTTGAAACATTAAGGCCTCGTTTGATAACCATTTTGTTTTTCATTTTTTGTTTATGAAATTTAAGCCTACAACAACTACCTTACTATACCTTTTTCCTTATTTGGATATCTACCCTTACTTATATTTTAATAAACAAAACCAAAATTTGTAAACAAAAAAAGTAGCTTCCAAAAACTTGTTTATGTTTTTGAAATTTGGTTAGTATTCTCCTACTTTCTTAAGGAAAGATGGATACATTATAGGAAAGATGGAGCACATGGTAGGAAATTTGAATAGAAATAGGCTTAAATTTCATAAACAAAAAGCAAAATGGTTATCAAACGGGGCCTAAGTATACCTTGTTGATTATCATTTCTTTCTGCAAAGATGATTCCTTGTTTATTAGTTATTGCAATATCATTTTCCTAGCGTACGAGTTTATCTTTCTTTCTTTCTTTTTTCTTTTTTTTGTATTATGATGTATGAGTAGATTTTGTTGTTGGTTGTGTGTTTCTAATTGAATTTTTTTTTTATCCGTAAGTGTTTGTGCCAGTTACGTGAACAACTGTCTAACCCTATAACATTTGGTCGTTAAGGAAATTCGTAAGAAATTAATTTCAAGTAGGTGATCACCATTGATTGTACGCATAATTTAATTGTTATCCAAGATCCTCTTAACCATTAGGATGGTTTGACTGGATTAGGTGTTGACATTATATTAATTGCACCATTTTTGGATAACATTTTGAAGAGTTGCTAGGTTCGAGATATGGTTTTTATTTTTATTTTTAAACCGGGAAATCAGAGCTTCGCTCTACTATACCCAGGGTAACCACGCTCGTCCCTAAGCCAGGCACTGGAAGACATCGAAGGATAAAGACACGAGAGATGTTTACAAATTAATGTCATAGGTGAGTTTCGAACCTAGGACCTTGAGGGAAGCACACCTTCAAAGCCCAAGTTTTTCAACAACTGTGCCACGACGAAAGAACCGGTATATTATATTCAATAATTCAATATTTTGAAACTAACTACAGATAATCGATCCCTTTTTTCGTATAAGAAACAACTTCATCGATGTATGAAATTACAAAAGAAGGAAGCCCGTAATGAGGTAGTTACAAAAGACATCCCCAATTAGATAGGAGGGCCGTGTAGCATAAGAATGATGAAGCAGAGAGCATTTACACCAAAAAAAAAATTCATACGAACAATATATTCAAAGAAATTAAAGGTGTTTCTTTATCTCAAAAGATTCTTCTGTTCCGTTCTTGCTAGACTTTTCAAAAGAAAGCCTGAATGAAGTATTCCCGTAAAATCTTCTTCTCCTCTTTGACTGGATGGCCACCAAGCTTATGAGCTAGAAGGAGTAGGGGGCCAAAGGAAAGCCCGAATGAAGTTTTCTCACAATACCTCCTCCTACTCTTTGAATGGCTAAAACAGTAGGTCATTATGTAATGTCGTCTGCCATTTAAATGCCTCAAGGATGATGGCCAAAAAGTGGCTTGGAAAGGGGTAGCTGCTGATGATATGAGACTGTGACTCGACACTTTTTTTACATGAAGCACACCATTGAGGGAAGAGATACAAGTGAGGCATCCTCCTCTCAAGCTTGTCATGGTTATTTATGGCCTTGTGAGCAATCTCCCAAAGGAAGAATTTAATCTTGTGGGAGCATGGTTTCTTCCAAGTCAGATTGTTAAGAGGAATGTAGGAGGCGCATTTAGAATTGTAGGCATGTCATGGCAAGAGATTTGGTAGAAAAGGCACCATGAGATTCCAACTTCCACTAAACCAAGTCGTCTCTATCAGTGATCTCAGCCATGGTTAGTGACTGCAGGAGA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Match: XP_023520710.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 815.8 bits (2106), Expect = 1.7e-232 Identity = 388/425 (91.29%), Postives = 406/425 (95.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. NCBI nr
Match: XP_022927352.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita moschata] >KAG6583715.1 Mitochondrial fission protein ELM1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] >KAG7019362.1 Mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 3.8e-232 Identity = 387/425 (91.06%), Postives = 406/425 (95.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. NCBI nr
Match: XP_038894297.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 3.8e-232 Identity = 390/425 (91.76%), Postives = 404/425 (95.06%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. NCBI nr
Match: XP_022973136.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 812.4 bits (2097), Expect = 1.9e-231 Identity = 387/425 (91.06%), Postives = 405/425 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. NCBI nr
Match: XP_004139495.1 (mitochondrial fission protein ELM1 [Cucumis sativus] >KAE8652813.1 hypothetical protein Csa_022781 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 809.7 bits (2090), Expect = 1.2e-230 Identity = 388/425 (91.29%), Postives = 403/425 (94.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93YN4 (Mitochondrial fission protein ELM1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ELM1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 4.1e-189 Identity = 313/426 (73.47%), Postives = 363/426 (85.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZE28 (Uncharacterized protein RP120 OS=Rickettsia prowazekii (strain Madrid E) OX=272947 GN=RP120 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 102.8 bits (255), Expect = 9.6e-21 Identity = 87/294 (29.59%), Postives = 143/294 (48.64%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EGX7 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434204 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 814.7 bits (2103), Expect = 1.8e-232 Identity = 387/425 (91.06%), Postives = 406/425 (95.53%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I7V0 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471654 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 812.4 bits (2097), Expect = 9.1e-232 Identity = 387/425 (91.06%), Postives = 405/425 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E536 (Mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold455G002590 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 806.6 bits (2082), Expect = 5.0e-230 Identity = 385/425 (90.59%), Postives = 403/425 (94.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CFB0 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499828 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 806.6 bits (2082), Expect = 5.0e-230 Identity = 385/425 (90.59%), Postives = 403/425 (94.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CLF3 (mitochondrial fission protein ELM1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012690 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 5.5e-229 Identity = 386/427 (90.40%), Postives = 405/427 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. TAIR 10
Match: AT5G22350.1 (Protein of unknown function (DUF1022) ) HSP 1 Score: 662.1 bits (1707), Expect = 2.9e-190 Identity = 313/426 (73.47%), Postives = 363/426 (85.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. TAIR 10
Match: AT5G06180.1 (Protein of unknown function (DUF1022) ) HSP 1 Score: 493.4 bits (1269), Expect = 1.8e-139 Identity = 237/404 (58.66%), Postives = 297/404 (73.51%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004798 vs. TAIR 10
Match: AT5G06180.2 (Protein of unknown function (DUF1022) ) HSP 1 Score: 493.4 bits (1269), Expect = 1.8e-139 Identity = 237/404 (58.66%), Postives = 297/404 (73.51%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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