
Sed0004685 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCGCTCCAAGGATAGGATTTCCTACTTTTATGATGGTACTATTTTGTTTTCTCCTTCCTGCTTACTAATCTAGTGCGCTAGAGTAGGCTTCGAATAACGAAATCTGGTGCTAAAGTCTATCCAGATTCAGCTTGGAACTGCTCTCTCTGCAATGATGAGAAATTTTATCAAATTAATATTCATTTGTTTTGTAGATCTGCTAGCCATATCCATTTATATGCTATTTTTACTTTTAATGGAGTTTGTACACATGAATCTGACATGTAGAAGAAGATGCATATAATCCCATTCAACCCACCAGACTATATGAAACCATGTTTAGAACAAAAAGGTAGGATTTGAGAAACCTTAAAATATTATATAAAAAAATAATTATTTGTTGTTTCTTCAATAGGGTGGGGGAATTTTTACCTCCAACCTTTTAAGCGTAAGTGATGCCTTGACTTGTTGATCTATGCTCATGTAGCATTAGTAAACTGCATATGTTTCCATTACCACTTTATATATCCATTGTATCTCCAACTATGTAAACCTTGTCAAAAGTAAAAACTTAGCTAAGGTTCTATGTCCTGCATATCTCTTGATTTTTAATTGCTGACCGTTTTGGAACCATGGAATGGAACTTAGTTCTCATCAAGATGAGGAAGTTGGTTAAACTTGAGCCTTATACAAAAGATGGTTTTTGCAGGGGATGTGGGAAGCGTTTACTTTGGTCCAAATCATCCAATGAAACCCCATCGACTTTGTATGACTCACCATCTCGTTCTCTCGTATGACCTCCATAAGAAGATGGAAATTTATGTTAGTCTCCTTAAGATTTTGCCTTACTATGAAGCTTTTAACATTTCGTTGCTTTATCGTTCTTTTTTGTTGATTTTTGCACTACCAACAATGTGTGGCTTTTTTTGTTTTGATGTATAATGCAGCGTCCCCACAAAGCATATCCGGTGGAGCTTGCTCAGTTTCATTCAGCTGATTATGTGGAATTTCTGCACCGAATAACCCCAGATACTCAACACTTGTTTTCTAATGAGCTGGCTAAGTGTATGAACTTTCTCCTCAATCTCCTTCAATTTTCACCATTTCTCTCGTTCATTGACATTTGTGAGTAGAGAAATTTGAGATAAATGTAGACAAAATTTTCACTTTATATCAGATAAACTTGGAGAGGATTGCCCAGTCTTTGAGAACTTGTTTGAATTCTGCCAAATATATGCGGGTGGAACAATAGGTAAGTTCAATGATGGAAATCGTGCGGTTAATGCCAAAGATATTACGTACTTAACTTGTTACTGACATTCTCCTTGCAGATGCTGCACGCAGACTGAACCATCAACTATGTGACATTGCAATAAATTGGGCAGGTGGCTTGCATCATGCTAAGAAGTGCGAGGCTTCTGGGTTTTGCTACATCAATGACTTGGTTTTGGGGATACTAGAACTTCTAAAATATCATTCTCGTGTCTTATACATTGACATAGATGTGCATCATGGTGATGGAGTGGAGGAAGCATTTTATTTCACTGACAGGTACAACATGGCCTGGACTTTCTAGTTCTACATGTATGAGCAAGCAGGAAAATGTTTCTATTAAGATAAGGAATTTTGTTAAAATTTGAAGTTGAACTTAGCTTTATGCTTGTAAATTCGTATTTCTAAATTATAGCTCACTGCCGACACAGACTTTGTTTTTCATTGTTAAATTTTTTTTTTAACAGAATTGTGTTTACTGATAGAATGAATTCAAATATATATATAAGGTGGCCAAACATGAGCAGTTGCTCAGCGGCACTAGTGTATGCCAAATGACTAGAGGTCTTGGGTTCAAGTCCTCCCACCCCCAATTTTTGTAATCTCAAAAAAAAAAAAAAATATAAGGTGAGAATCCAAAAATATCCTCTAGAATTAAAAAAGGGCTCCCCAGGGAGGTAGACTTACTCTTATTCAAGCAACGCTCTCTAAACTCTCCACATACTTTATGTCTATTTTTAAAATGTCCACCAAAGTTGCTAACGGGATGGAAAGACTCTATAGAAACTTTATATGGAAGGGTTCATCTGAATCTAAAGGAATGCACCTTGTGAATTGGGCCGCACCACTCTTCCAAAAGAACATGGAGGAGTGGGCATACAGAAATTAAAAGTTCGGAATGAGGCTCTTATGTCAAAGTGGATATGGAGGTTTTGTAATGAAAAATACACCTTATGGAGGAAGGTTATGATACGATCCGGACCTACCTTGGAGTTTTAGGAATAGTAGTATTCGTATTTATTATTGATTGATTAATTGTTATTTCAATTGTATTGGGCTTTTGGGCCTTATTAGAGATTATTATTTAATTAGGGGTTTACTTGGAGAACAAGTAAAAAGGCTAGGGTAGAGTCATTATAAATAGGAGAGGTTAGGTCTTTATTATTCATCCATTGAATTGTCGTATTTTGTACTCTGGCTCTTAGAGAGATCCTCTCGGGAGATTTATCTTAGATTAATAAAATAGTGTGGTAGATTCTATCATTTTGGTATCAGAGCCATTTGCCGATCCGGGAATGGTTACGACTAAGATGGAAACAAGGATGCTTGAGTGTGAAGAAAGAACGACCGACTTGGCGAGGAAGTTAGGAGGAGACGAACGCAAAGATGGAATTGATGGAGGAACGATTGGGAAGAAAGATAGATTTGCAGGATTTGAAGTTCGAGAGCATAAACCGGAAGCTAGAACTATTAATGGAGTCATTCCGAGCTTACAAAGGGAAGGGTTTAATGATCGAGGCCTCGGAGGGTGGTGTGGCAGCTAGGGTTTTTACACCGTCGCCGCCGCCACCTCCGACATCATTGCCGCCACCTCCGCCGTCATCGCCAAGTCGGTCGTTCTTTCTTCACACTCAAGCATCCTTGTTTCCATCTTAGTCGTAACCATTCCCGGATCGGCAAATGGCTCTGATACCAAAATGATAGAATCTACCACACTTTTCTATTAAAATAAGATAAATCTCCCGAGAGGATCTCTCTAAGAGCCAGAGTACCAAAATACGACAATTCAATGGATGAATAATAAAGACCTAACCTCTCCTATTTATAATGACTCTACCCTAGCCTTTTTACTTGTTCTCCTAGTAAACCCCTAATTAAATAATAATCTCTAATAAGGCCCAAAAGCCCAATACAATTGAAATAACAATTAATCAATCAATAATAAATACGAATACTACTATTCCTAAAACTCCAAGGTAGGTCCGGATCGTATCAGGTTATTGTTGCTAAATATGAGATTGATTCAATGGGCATTAAACCAAAGGAGTTCAAAACAACAGCTTACCGTGGGCCATGGAGGGATATTGGGAAACACATCTCTCGTACAATGGGCTGCATAACTCACAAAATTAGAAATGGAGCATTTACTCTATTATGGAAGGACAATTGGTTGAACAAAGCTCCTCTCTGCCAATAATTTCCCCTTCTCTTTGCTCTGTCAACTAAGAAAGATATGAGTGTGATATGATCCAGAATCTAGATTATATCAAAAGATAAAAGAATAAAGATAAACCCTATCAGAGTGTTAATGGAGGATGGAAGGAGAGCATCTCATCATGAAATTATTACTTTAGAAGGGGTCTCAGAGAAGAAGAGATTTGAGATATGTTCCCTTTCTAGTCTCCTAAATAGCATCCATATCATAGAAGGCGAGGACACCTGCATCTGGAATTTGGAGGCTTCTGGACTTTTCTCCAATCAATCCCTCATCAACGAACTAAATGGTATTAAAGCACAGCCTGTCATTTTCTCGGCTATATGGGAGGAAAAATTCCCCAAAAAAGTTAAGTTCTTCCTTTGGGAATTATTGAGAAAGGCCACAAACACACATGACATGTTACAAAGAAGAATTCCTTCACTGCACATCAATCCCAATTGGTGTGTGAACTGCAAAACAACCATGGAATCACAACAACATTTATTTATCAGCTGTACATACGCAACCAGATTCTGGGATTATGTGAGGGATAGTTTCTCTTGGCTTGTGGTCCTACTCGGTGACACTCACTCTCTTTTACAGGCTACACTATTGGGTCATCCTTTCAAAGAGAAAAAAAAGCTATTGTGTAATAATTTTATCAGAGCTTTTTGTTGGAATTTATGGAGAGAAAGGAACTGTAGGATTTTCCAAGATAAGAGCTCTAACTTCCCTTGCTTTATTGAAAATCTTACCATTACTGTTATTTCCTGGTGCAAACTATCACCTCTCTTCCATGATTATAGCTATTACATGCTTTTAAGTAATTGGAGATCTTTATTGTAATTGATATGTAACTGGTTTGAATTTGGGATGTACTTGGCCATGTGCCCTTTTGTAATTTCATATCTATAATGAAATTGTTTCTTATCCAAAAAAAAGAATAACGCAAGTTGCCAACTGCCAAATCAGTCAAGATGTAGCGCGCATGTTGCTTCTGTGCAGTCTTCTCATGCAATACTCTTTCACGCAAAGCACTCGCTCGACGCGCAATCATCACCAATGTTGCGGAGCAAGAGTGCCACATAGCTCTTCCTTGTTTTACTCTCAGCTTTTATGCGTGACTCACCAATCCATGAAGGCATTTTGTCCTGTTAGATCGAATTCAAACCCTTGAATTGAACTCAGAAGCTTGAAATAATGAGGACACAGATGGCAAACCGCACTTAAACCCGTGAGACTGAGTCAAACAACTTGGACATGTGAGGAAAACAAACATTAAGCCAGAAACAACTAGCTCAAACGCTCGTCTCGTTGAGAATTGAGCCTAGAAGCTCAGATCTGCAAGGACGAAGATGACGAACCCAAAATGATCACTCGTTCGATCTTCTAAAAGATAGCAGAGAAGGAGGTGAGGGAGAGCTGGTTAGCGATGTGAAAGGAGAGGCAGAGTCAGTGGTCCTCCTCCGGTGCCAGTGGAGAGTGTAACTCAATAATGGGACTCAAAGAAGTTGTGATTTTATTGATATGACTATGTCTATATA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ATGCGCTCCAAGGATAGGATTTCCTACTTTTATGATGGGGATGTGGGAAGCGTTTACTTTGGTCCAAATCATCCAATGAAACCCCATCGACTTTGTATGACTCACCATCTCGTTCTCTCGTATGACCTCCATAAGAAGATGGAAATTTATCGTCCCCACAAAGCATATCCGGTGGAGCTTGCTCAGTTTCATTCAGCTGATTATGTGGAATTTCTGCACCGAATAACCCCAGATACTCAACACTTGTTTTCTAATGAGCTGGCTAAGTATAAACTTGGAGAGGATTGCCCAGTCTTTGAGAACTTGTTTGAATTCTGCCAAATATATGCGGGTGGAACAATAGATGCTGCACGCAGACTGAACCATCAACTATGTGACATTGCAATAAATTGGGCAGGTGGCTTGCATCATGCTAAGAAGTGCGAGGCTTCTGGGTTTTGCTACATCAATGACTTGGTTTTGGGGATACTAGAACTTCTAAAATATCATTCTCGTGTCTTATACATTGACATAGATGTGCATCATGGTGATGGAGTGGAGGAAGCATTTTATTTCACTGACAGGGTGATGACCGTTAGCTTTCACAAGTTTGGAGACCTTTTTTTCCCTGGAACTGGTGATGTTAAGGAAATAGGAGAGAGAGAAGGCAAGTTTTATGCTATTAATGTCCCACTAAAGAATGGAATAGATGATGGTAGCTTCACCAGACTTTTCAGGACTGTCATCTCCAAGGTAGTTGAAATGTATCGACCTGGTGTCATTGTTCTCCAGTGTGGGGCTGATTCATTGGCTGGAGATCGCTTAGGCTGCTTCAATCTCTCTATTGATGGCCATTCTGAATGTGTTAGATTTGTCAAGAAATTCAACTTGCCTTTGTTGGTTACTGGAGGTGGAGGTTACACAAAAGAGAATGTAGCTAGATGTTGGACTGTCGAAACGGGAGTTCTTTTGGATACAGAATTGCCTAACGGTATAAAAAGTCTTATTATCTTCCTCCAGCTTTCGCTTTTGGAGAATTTAAATACGAAATCTTACCTTAGCACGATCAAAACACAAGTCTTGGAAAATCTCCGTTTCATCCAACATGCTCCAGGTGTACAGATGCAAGAGGTTCCTCCTGACTTCTATATTCCCGATTTCGATGAAGATGAGCAAAATCCTGATGAACGCATGGACAGGCACACCCAAGACAAGCAAATCCAGCGTGATGATGAATATTATGAAGGAGATAATGATAATGATCATGATATGGATGATGCTTGA MRSKDRISYFYDGDVGSVYFGPNHPMKPHRLCMTHHLVLSYDLHKKMEIYRPHKAYPVELAQFHSADYVEFLHRITPDTQHLFSNELAKYKLGEDCPVFENLFEFCQIYAGGTIDAARRLNHQLCDIAINWAGGLHHAKKCEASGFCYINDLVLGILELLKYHSRVLYIDIDVHHGDGVEEAFYFTDRVMTVSFHKFGDLFFPGTGDVKEIGEREGKFYAINVPLKNGIDDGSFTRLFRTVISKVVEMYRPGVIVLQCGADSLAGDRLGCFNLSIDGHSECVRFVKKFNLPLLVTGGGGYTKENVARCWTVETGVLLDTELPNGIKSLIIFLQLSLLENLNTKSYLSTIKTQVLENLRFIQHAPGVQMQEVPPDFYIPDFDEDEQNPDERMDRHTQDKQIQRDDEYYEGDNDNDHDMDDA Homology
BLAST of Sed0004685 vs. NCBI nr
Match: XP_022957984.1 (histone deacetylase 9 isoform X1 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 4.2e-236 Identity = 400/430 (93.02%), Postives = 408/430 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. NCBI nr
Match: XP_022996054.1 (histone deacetylase 9 isoform X1 [Cucurbita maxima] >KAG6606000.1 Histone deacetylase 9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 827.4 bits (2136), Expect = 5.6e-236 Identity = 400/430 (93.02%), Postives = 408/430 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. NCBI nr
Match: XP_038902058.1 (histone deacetylase 9 isoform X1 [Benincasa hispida] >XP_038902059.1 histone deacetylase 9 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 825.5 bits (2131), Expect = 2.1e-235 Identity = 398/430 (92.56%), Postives = 409/430 (95.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. NCBI nr
Match: XP_023534277.1 (histone deacetylase 9 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 825.5 bits (2131), Expect = 2.1e-235 Identity = 399/430 (92.79%), Postives = 407/430 (94.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. NCBI nr
Match: XP_022140458.1 (histone deacetylase 9 [Momordica charantia] >XP_022140459.1 histone deacetylase 9 [Momordica charantia] >XP_022140460.1 histone deacetylase 9 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 825.5 bits (2131), Expect = 2.1e-235 Identity = 397/429 (92.54%), Postives = 409/429 (95.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8H0W2 (Histone deacetylase 9 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HDA9 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 6.2e-214 Identity = 352/424 (83.02%), Postives = 386/424 (91.04%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q32PJ8 (Histone deacetylase 1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=HDAC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 1.3e-147 Identity = 244/424 (57.55%), Postives = 325/424 (76.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O09106 (Histone deacetylase 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Hdac1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 1.3e-147 Identity = 244/424 (57.55%), Postives = 325/424 (76.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q4QQW4 (Histone deacetylase 1 OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Hdac1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 524.2 bits (1349), Expect = 1.3e-147 Identity = 244/424 (57.55%), Postives = 325/424 (76.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P56517 (Histone deacetylase 1 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=HDAC1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 523.9 bits (1348), Expect = 1.7e-147 Identity = 242/423 (57.21%), Postives = 323/423 (76.36%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1H3P4 (Histone deacetylase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459351 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 827.8 bits (2137), Expect = 2.1e-236 Identity = 400/430 (93.02%), Postives = 408/430 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7N1 (Histone deacetylase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491376 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 827.4 bits (2136), Expect = 2.7e-236 Identity = 400/430 (93.02%), Postives = 408/430 (94.88%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CI19 (Histone deacetylase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011128 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 825.5 bits (2131), Expect = 1.0e-235 Identity = 397/429 (92.54%), Postives = 409/429 (95.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JCR5 (Histone deacetylase OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111483852 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 822.4 bits (2123), Expect = 8.6e-235 Identity = 396/430 (92.09%), Postives = 409/430 (95.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXT9 (Histone deacetylase OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448213 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 822.4 bits (2123), Expect = 8.6e-235 Identity = 396/430 (92.09%), Postives = 409/430 (95.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. TAIR 10
Match: AT3G44680.1 (histone deacetylase 9 ) HSP 1 Score: 744.6 bits (1921), Expect = 4.4e-215 Identity = 352/424 (83.02%), Postives = 386/424 (91.04%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. TAIR 10
Match: AT4G38130.1 (histone deacetylase 1 ) HSP 1 Score: 488.8 bits (1257), Expect = 4.4e-138 Identity = 230/412 (55.83%), Postives = 300/412 (72.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. TAIR 10
Match: AT4G38130.2 (histone deacetylase 1 ) HSP 1 Score: 488.8 bits (1257), Expect = 4.4e-138 Identity = 230/412 (55.83%), Postives = 300/412 (72.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. TAIR 10
Match: AT5G63110.1 (histone deacetylase 6 ) HSP 1 Score: 456.1 bits (1172), Expect = 3.1e-128 Identity = 226/424 (53.30%), Postives = 294/424 (69.34%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0004685 vs. TAIR 10
Match: AT5G35600.1 (histone deacetylase7 ) HSP 1 Score: 386.3 bits (991), Expect = 3.0e-107 Identity = 196/385 (50.91%), Postives = 257/385 (66.75%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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