Sed0003185 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTATTTATCTTGGAACAAGTGCTTGGAAACAGGGGACGAGTTCCGTGTAAATTGTCTAGTTTTTAAAGGGGTTATTTTGAATGTTTTGTTTTAATTGGAATCCGAAATCATGTCTGTTTAAATGTCCTTTACTTTGAATGCATGCATTGGGGTAAGGGCCCATTTAGTGCCCCATTCGGGTCGGTCCCTTACACATGGTGACTAAACCTGGGGCAGCTTGCCACTAGACCCGGCACCCCCCATGGTTTGCAGTAGCATACGGTGCGCGCACACGCTCATTACAGCACCGACCGGAGAGCTCCTCGGGATCTTGAGTTCAGTGCACCTTTCGTATCGACAGTAGACAGGCTGAGGCCGAGACTTGTTTCTCGTATAGGTTCGTATCGTGTGGTGGATTTCCCGGAGTAAGACCTTGAGATGGCATCCGAGGTTTATGTGTGGATTAAGCTATGTGCTCTCTTCTGTGTTTATATTCATAGCTTGCATACCGTTCTGCTAGATGACCATGTATATCGTATTGTACCCCGGTTGGGGATTCTTACTGAGTAATTCGTTACTCCCCCTTATTCTGTGGTTTTCCACAGGTAACCATGGTGCGAGACATGATGGTTGGAGGAGGAGCTGTGATCATGGAAACCCGTTGTGTCGAACTCTGAGTTTATGTCTATGATTCTTTGTGTTTTATTTTCCTCTGAATGCATGTAGTTGGGCACGGAGCCCTAGGTTGTTTTCTGACTGCTTTTCCGGATTCTAGCACTGTTGTAACTATTGGAAATTTTTGAATGTTTTAAATAAATCTCTGATCATAGTGAGTTTTGGAAATGTATTTGTCTTGGAACAGGTGCTTGGAAACAGGGGATGTGTTTGTGAATTTTGTATTGACTTTTTAAATGGATGTTGTATGTTTTAGTTTTCACTTAGAATCCGAAAACCATTCTTGCATATTGTTTTAACTTTTGGATGCATGCATTGAGGTAGAGACCCATTTTAGGACCCCATTAGGGTCGGGTCTTTACAACTCAGCTTAACTTAATACCGACTAACTTAATCCTAATCCCTGCACCAAACACGCCCTAAGTAATTCAATTAAAATGATTTTTATAAAATTTAGACGTCTTTCTAAATTTGTTGAATGAATATAAAATTTATTATATTATTTTTAATTTAATATATATTATTTTTTTTGAAAGCTAATTTAATATAGATATTAAGTTAAAATTGAAATAAATAATAAAATATATATTGATAAGCATATATTTATTTTAAATGAATATTATATTGATACTATCTCAAATAAATATAATTTATTTATTTATCTATTCTCAAAATAAACAAATTAAAGAGTAGACATTTTTTTAAAAAATGTTAAATAAAAATTCAGATTATATGTTAATCCATATAGCAAACTACAGTCACCTTAACTTAATCTAACTTATTATAATATGTCCAACCAATTAACCTAATACTCAACTTAACTTAATATAGATTAACTAACACACCCTAATTGATTTTATTAGCAATGAACTTGGGTGGAATATGAGATTAGCACTGTACATATTGCGGTGGTGGGTAGGTGGGATTTTAGTCCATGGTGGTAGGTGGGAGGGAGCGCAAATGGCCGTGTCTTCCACTCTCCACTTTTCTGCTCTATTTCACTTTGCTTTTCAGATTCAAACCCCCCAATTTTAATCTACAATTTCGCCCTCACAATGGCGCAGCAAGTTGTTCATGTTAACCCAGATGAAGAGGTGATTTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTGTTTTAAATTTTATTTTAAAAATTAATCATTAGTTTTTATTATGCAAGTTTTATCACTAAATGTTTGATGAAATTAATGCTCAGGTTGTTCTGGGAGAAGAAGTTGGGGATGTTAGGTTGATCACGTTGAACCGCCCCAGACAATTGAATGTCATCTCATCCAAAGTGGTATGCGAACGCAACTCCTATTAACTGGAATGTTGAGATTTGTAAGGTTTTTTTTTTTGGAAACCAAGGAATCGGACCCTTGTCCTTAGACCAGGGATCGAGAGACACGTAGGAAATGGAAACATCGAAGGAATGTAGCTCTTTTTTTTTTTTTTAAAGTTTTGATGTGCTAGGATTTTCCCTTTTATCTTATTGTGTTTGTATGTAGGTTTCTTTGCTGGCTGGATACTTAGAAAAATGGGAAAAAGATGATGAAGCAAAACTTATAATCTTTAAGGTTAGTCAGTTCTATCATTTATGCTTTAACAAATATTAATTTATCATACTTTCTTTTCCAAAACTAAAATAAATAATAAATATTCGTTTACTGCAGACGATTTAGGTTTGATAGGACCATCCAAACAAATATGAATCTCAAGGATATGTAATCATTTCCTTTTTGAAGATTTAGCTGACAAACTACTTCCACACTTGCATTTCTTTGCTTCTGTTATGTACTTATTACAGATCTGAATAGGGCAAAATAGAATTGAATTTTATTCATAATACCCTTGGTGTATTTATACACTTGAAATGATAATAGCTTGAAGAATAACTAATAAAAAATCTTTAATCAATGAAAAACTTTTTCTTAAACCTCTAATACTCCCCCTCAAGATGGAGTGTGAATGCCAATTGAAGCTATGTATAAATGGATAATCTTATTCACCATGAAATGATTGCAAGATGAATACATTTATACTATAGGAGTTCTAACAAACCATCTATAAATAGAGTTATAACAAACAGTGTTTTAAAAGGCGCGCCTAGGCTCAAGTCCCACCTTTTGCGCCTCAATTGTCCCAAGCCAGGCGCGTATAATAAGGCGTGCGCCTTATGGCACCTTACGTGAAGCCCCAGGCGCCAAAAGGCGCGCGCCTCGTGGGCTTTTTAATTTTCCTTTGCGTTTTTTGTATTTCAGATCCCCGTACTAGGTCATTCGAAGCGCGTGAAGGTTGATAGTTGAATATTATGTATGTTTTTATATATTATTCTTGGTTAAAACTTCATTTATGTCCATGCAAAGTGTTTTTATTGTGTATACACACATATATATAATTTTTTTGTGTTTTTTTATATAGTGCGCCTTAAGTAAAAAAACCCTCGCCTTTTGGTGCCCCTTGTGCCTCAGGCTCCAGAGGGCCATTGCGTCTTAGTGCGCCTTGTCCTTTTTAAAACACTGCTAACAAACCATCTATAAATAGGGTTGTAACAAACTATCTAAATAGAATTCACTTAATTTAGAAATAGAGAAATAAGAGGAGAATCTCAACTTCCACAGCTTGACTTTCTACACTTCCCCTCAAGCTGGACGATATATACTTGTCATACAGAGTCTGAGAATTAACCCACACAAGCTGGGTTGATGTGGTGTTTTAGTTAAGACATCTGCAACTTGCTGCTGAGAGGGTACATACTTTAGGGTAATAACATCACCTTCAATTTTCTCACTAATAAAATGACGGTCTATCTCGACATGCTTCATCTTGTCATGATGTACTAGATTTCTTGCGATGGCTATAGCTGATTGATTATCACACAACATTTTTATAGGACCTTCTATCTTTACTCTTAGTTCAGTGAGGAGACGTTCTAGCCACATTCCTTCACATATTCCTTGAGCCAGTGAACGAAACGCAGCTTCCGCACTACTTCGCGCTACAACTTGTTGTTTCTTGCTGTGCCAGGTGACCAGATTACCCCACATATAAGAGCAATACCCAGATGTTGACTTACGGTCAACATGAGAGGCATCCCAGTCGGCATTAGTGAAGACTTCTAACGAGCGATTTGTGGTTTTTCTGAACATGAGGCCCTTCCCAGGATCATTCTTGAGATACCTCAAGATTCTATACACAGCTTCCATATGTTTTTTAGAGGGCTTCTTCAGAAATTGACTTACCACACTAACTGCAAAGCTGATATTTGGTCGAGTATGAGTTAGATAAATTAACTTTCCAACTAGTCGTTGATATTTGCCGCGATCAACAACTTCATCTTCTGAATTGATTCCCAATTTTGTATTTGCATCCACAGGTGTGCCTACTGGTTTACATCCACTCATCCCAGTTTCTTTCAAAAGGTCTAACGTATATTTTCGTTGAGTTACAGAAATTTCTTGACTTGACCTTGCTACCTCCATTCCTAGGAAGTATCTTAGATGACCCAAGTCTTGAATTTCAAATTCTCTTGAGAGCAGGTTCTTGAGATGAGTTATTTCTTCGGGCACGTTTCCTGTGAGAATAATATCATCTACATATACTATTAATACAACCATTTTATCATGTGAGAGATGCTTGATAAACAGGGTGTGATCTGACTGGCACTGAGTATAGTTATCTCGCTTTAAGACATTAGTAAATTTTCGAAACCAAGCTCGAGGTGATAGCTTTAGCCCGTAAAGAAACTTCTTGAGCTTACATACCTTTCCACTTGTATATCGATCTTCAAAGCCAGGAGGAACATCCATGTACACTTCTTCAACTAGGTCACCATTCAGAAAGGCATTCTTTACATCCAGCTGGAATAATGGCCAGTCTAAATTAGAAGTAATAGAGAGAAGTACTCGAATAGTGTGTAGCTTAGCAACAGGTGCAAATGTTTCCTGGTAGTCAATCCCATAGGCTTGAGTGAAACCTTTAGCTACCAAACGGGCTTTGAATCGTTCTATACTTCCATCTGGTTTGTGTTTAGTAGTGAAAACCCATTTACATCCCACTGTACGTTTTCCTGCAGGCAAATCACTCAAAATTCATGTACCATTTTTCTCAAGTGCTCTCGATTCTTCTAAGGTGGCTGCTTTCCATTCAGGCCTCTGTAAGGCCTCTTGTACAGTATTGGGTGTTTGTATCTGATCTAATGTCGTCACAAAAGCTTTAAACATTGGAGACAAATTACTGTAAGATAAATGATACCGTATCGGATGTCGAGTACACGATCGAACTCCTTTCCTCAAAGCAATTGGTATGTTCAGATTATCTTTTGTAGTGTCAGGTACTGAAGTGT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MYLSWNKCLETGDEFRVNCLVFKGVILNSMVVGGRERKWPCLPLSTFLLYFTLLFRFKPPNFNLQFRPHNGAAKEVGDVRLITLNRPRQLNVISSKVVSLLAGYLEKWEKDDEAKLIIFKGAGRAFSAGGDLKMFYDGRNTRDSCLEVVYRMYWLCYHIHTYKKIQVALVHGISMGGGASLMVPMKFSVVTEKTVFSTPEASIGFHTDCGFSYMLSRLPGHLEKRLISLDFHDENSVRSAIEEFSSEVQLDEDSVLKRQSVIDKCFSKETVAEIINSFEAEASAEGNSWILPVLKGLKRSSPTGLKITLKSIRVGRTQTLEECLKKEFRLTMNILRTLISGDVYEGIRALTIDKDNAPKWDPPSLEKISDQKINEVFEPFGEDFELRVPVNEEHRWSGKYEDSVYYANLK Homology
BLAST of Sed0003185 vs. NCBI nr
Match: XP_023525878.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 583.6 bits (1503), Expect = 1.4e-162 Identity = 296/366 (80.87%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. NCBI nr
Match: XP_022981106.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 582.4 bits (1500), Expect = 3.0e-162 Identity = 293/366 (80.05%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. NCBI nr
Match: KAG6607980.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 582.4 bits (1500), Expect = 3.0e-162 Identity = 294/366 (80.33%), Postives = 314/366 (85.79%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. NCBI nr
Match: XP_022142314.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 581.6 bits (1498), Expect = 5.2e-162 Identity = 292/366 (79.78%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. NCBI nr
Match: XP_022941436.1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 579.7 bits (1493), Expect = 2.0e-161 Identity = 291/366 (79.51%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9SHJ8 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g06550 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 1.2e-132 Identity = 241/367 (65.67%), Postives = 284/367 (77.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XF59 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 1, mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At3g60510 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 1.2e-60 Identity = 134/355 (37.75%), Postives = 198/355 (55.77%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LKJ1 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CHY1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 230.7 bits (587), Expect = 2.9e-59 Identity = 130/352 (36.93%), Postives = 194/352 (55.11%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NMB0 (Probable 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g30660 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 2.3e-56 Identity = 130/359 (36.21%), Postives = 189/359 (52.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q1PEY5 (Probable 3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At2g30650 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 220.3 bits (560), Expect = 4.0e-56 Identity = 126/343 (36.73%), Postives = 191/343 (55.69%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IVL4 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111480354 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 582.4 bits (1500), Expect = 1.5e-162 Identity = 293/366 (80.05%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CL87 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012459 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 581.6 bits (1498), Expect = 2.5e-162 Identity = 292/366 (79.78%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FL39 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111446730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 579.7 bits (1493), Expect = 9.5e-162 Identity = 291/366 (79.51%), Postives = 315/366 (86.07%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UF77 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold504G00450 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 6.2e-161 Identity = 291/371 (78.44%), Postives = 316/371 (85.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CNX2 (3-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase-like protein 5 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503054 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 577.0 bits (1486), Expect = 6.2e-161 Identity = 291/371 (78.44%), Postives = 316/371 (85.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. TAIR 10
Match: AT1G06550.1 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 474.6 bits (1220), Expect = 8.3e-134 Identity = 241/367 (65.67%), Postives = 284/367 (77.38%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. TAIR 10
Match: AT3G60510.1 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 8.5e-62 Identity = 134/355 (37.75%), Postives = 198/355 (55.77%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. TAIR 10
Match: AT5G65940.1 (beta-hydroxyisobutyryl-CoA hydrolase 1 ) HSP 1 Score: 230.7 bits (587), Expect = 2.1e-60 Identity = 130/352 (36.93%), Postives = 194/352 (55.11%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. TAIR 10
Match: AT3G60510.3 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 221.5 bits (563), Expect = 1.3e-57 Identity = 134/380 (35.26%), Postives = 198/380 (52.11%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0003185 vs. TAIR 10
Match: AT2G30660.1 (ATP-dependent caseinolytic (Clp) protease/crotonase family protein ) HSP 1 Score: 221.1 bits (562), Expect = 1.7e-57 Identity = 130/359 (36.21%), Postives = 189/359 (52.65%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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