Sed0002417 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0002417
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG07: 34766824 .. 34773000 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0002417
SyntenySed0002417
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
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ATGAAATTCTTGGTCAATTGGGCCACAATCACCGTCTCTCCGCCGGAATTCTGCCTTTCGCCACCACACACCGTTACCGACCTTTGCCGCCATCGAACCTCCTTCACCGCTGCATCGACCCTAGCGCAGATCCGCGACACTCCTCGTCGGAAACCGTAAGGCCCCGCGCAATTTTCTGAGCGTAAAGAGGTGACCCGCGAACCCGCTGCCTCGATCTGACCCGGTTCCCCTTCCTGACCCGCTACCCACTTGGATAGTCTTGGCAATGGGCTGTCCGAGCTTCTGATTTCATTTTAAAAGAGAAAGCTACCTAAATGTCTAAAATTAGAAATTATTTCAAGGAGTTTGTTTACACATTTTTAGACTTTAAATAAATGTTTATTCTTTAATTTAAAAAATAAATTTTAAATAACTAAAGGTAAAATGGACAGTTATACTCTTGAAATTTATATCAATTTCTTTTTTACGTATTATTCCAAACCTTGACTCTTTGTAACAACCATTCAAAAAAAATTTCACCAAATCTAAACAAAAATCTTCAACAGAATTTCACCAAATCTAAAAAAAATTGCTCATATTTAAATATGAAATATTTTTTAACAAAATTTTACCAAATCTAAACAAAAATCTAAAAATTGATTTAAACAAAAAATTTTAAAAAAAGATGAAATAAACCAATTTAAATTTGATTTTTTAACCAACATTAAAAATTTTTTACTGTATATAAACATACATAATACTACATACGAAACCTCCCACCGAAAATTTGTTGGTCGCAGCATGTATTTAAAAAGAGAAAATAAAAAACAAAGAAAGACGACTCATTTGATGCAACTGCATCCTTTGGCCGTGTGTAACTGTTCATACGACTACACATAATATTATATGCGTCAAACTTGGATCAGAGAATGCACATGGATTTATATACGACTGTCTGTACCCGTACTCAATCACATCAGCCGGTGTGTATTTATTTGTTTTTTTTTTTAATCTCATGTTCTTGGATATATACTCATGTGTACCAATACATACTGCCGTGATTTTAGCCGAAACACATCAGTCACTATATACACTTGCAAACCCATTGAACACCCACTGTACGTCTCTATCTCCTTGGTGATGTAGGTGTATGCTACTATGTAGGTTTATTTACATGTATTGTTCCCTCTTTTTTGCATCTCTTGTTCCTGGTTATATGTTCATGTGTACTAATGTATACTGTCATGATTTTAGCTAGAATGCACTATTTGCAACCCCATAAAATATCCATCCCACGCCTCTATCTTTTGTTACTAGTATGTTCTTTGCTTTGTTATTCCCGTATTTGTAATGAAAAAGACTAGATACTTGAACTTCCATCCAATTCGAGATATGCAGTGATGATGGAGATATTGTTGGATCCTTGAACGATGTCAAAACATATTGTGTTTTCATTGGAATATACATTCGCATCGTCTCAAATTTTGTTAAAAACAATTGTAATCGGCGTTGCTTCCATTAACAAAAAATCGAAGAAAAAAAAAACCTTGTGAATATCTTAGCTGAATGAAAGTGAGATCCAACAAATCACGATCAAAAGTGGGAGCATGAGTGAGATCAATTGAAGAATGTGGCAAGTATGAGATAGAGTGCTGCAAAATGAATAAAATGATAAAAAAAAAAAATCAATGGTCGAGATTGAGTGTTGAATGATATATTTATTATTTATTTGATTCAAAAATTGAAGGGAGTAGATATTTAGAGTATAAAGAGCAAAAGCAATTTAAAAAGTAATATATATATATATATATATATATATTGGTAGTTAGATATATCTCTTAAATTTGGGGAGACTTTCCAACGTATGTTTTTTTTTATTCCTTAATTAAGTTAAGGGGATGGTTCACAATAGGAGTTATTATTTTGTTATATCTTTTTAATATTAAAAAATGTAAAATAAGAGCATATGGGAATGTAAATATTCTCTCTCTTCACCTAATTTTGATTTAGACAAAAATTTAAAGTAAAAAAAATTAATAAACATTCTCTTGAGATAATTTCTAATTTTAGACGTTGATTACTGTTTCTCTTTTAAAACCAATTGAGGTGCTATGTTTATGTTTGGGAAATGGTAGAAAATGACTAAGTTTAGGGAAAAAATAGAGGTTATAACTTTTATGTATTGTTCTTTAAATGCATGGCTAAAAAAAATCAGGGAGGAGAGATAAATATTTTCATCTCCAAATTACCCTTATTTTTCCATTTAGGACTTTCACGTAAAAACAAAAAAGAAAAAACTAAAATATCCCTAAATCTAAGCCTAACCAATTTCTTCATAAATCCAAGCATATCCAATTTGATAATATTTCAAATTTAAAAACATTAAGATTTGGGGAGGGGATTAAAAAAAAAAAATTAAAAAATGGAAATCACGTTCGACTATACCATGAACACAAAAAATAATTGAAGATCACGATCAATCAAGAGTTGCTGGCAAACATTTCAGTCGTTCCACATAAATATTTATCTAGTAAAACTCAATCCTGATCCAGGTAAAAGTCTTGGTCATTCTGATTTGTAGTAAAAATTCAATCTTTCTTCCACCTTCGTTCAAGAACAATACAATCGGACTATGGATCTCATACTCGTAACTGTTGCGTTCAACGGTACTTGGGATGATAGGGACCATTGAATTGAGTCTTTAATTGAAGCTTCGAACTTATCACTTTATCACGATGGGGCTGATAAATCAAAAGGTATAGGTTCTAAAACTAGATCACGATGTACAGTGGTTATACAATGAGTTTGCGAGTGGGTTGTATAATGGATGTTTCATCATGTAGATCACGAGGTATAGTAGCTGTACGATTGAGCGTGGATGAAATCTATAGTTGGTATATTCGCTCGTCTGTCTACAAGGGAAGTAAATTATGAGTTATTAGAAAGTTGTGGATACACACACATGCCCTGTGGATGTAGTGGAGAATGACCATAGATAGATCACACCAATATTAGTGGTTGGGTATGCTGAATTCGCGATCTGGTCTTTTTTGCAGCCTGAAGTGGTTTCAAATCGGAGCTCGTGTGGGGGGTAGGGTTTTCGATGTGTTTGTTCAAAGGAAGAAAAATGGGAGATGAATTTTTCCTCTTCCAACAAAATGCACATTTAAGGCAATCTGAGGTACTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTTCTTTCTTTTCTTACCAAAAAGCTCATACACCATTTCAAAAAATTTGAATTTACTAATATACAACATATGTGAAGGGGATGTAATTTCACCCTATATTTTCAAAAGTTGAATTGTCAACTTCAATTATTTGACTAAGGTTTGTTATAATTATTTATTCTATTTTAGATTTTTTTTTATATTCAAAAGTAGTTACACAATATCTTATTTAAAATAGATTGAAAAACAAATACTAGAAAATGTAGGAGGGGTACAATAGTCAATCAATCACTCTATTAAAAATAAAAAAGTATCCAGATTTTAAAAAAGAACATAAATTTAAAGTCTAACGATTAATAACTAGAGTTTTCGTTATTTTCCAATATTTAGCCATTTCCTTAGTTGTCCTTGGGTTAACTAGGTAAATGTCTAAAGGGACAACTAGGCAAATATCTACTTTTTCAAAATATATTTAGCTAATGTCTACCCTTTTAAATAGTTAAAATAAATGTCTAAAACATAAAATCTGGTAGAAATAAAATAAATACTTATAATGCAAATGATGGTTTTGACCTTTTACATTATTTAGTTTTATTTTAATATCGTCAATATATGATTTTAGATTTTTTCAACAAACTCTCCTGGATTTGATAAAAATAAAAGAAAAAGATATTAAAGATATATATTTTTTATTTAGTTTGATAAAATAAACAATATTTAGATTTGATTAAAAATAATTTTAACAAAAAAAATCATCTAATGCATCATTCCTCTCCTGCTGTCATCAAACTCTCTAAAGCGTCTTTGCGTTCCAGACCTAAACCCTAACAACGTAGAAGTATCATTGTTGGAGCGATTTCGTCATAGATGAAATTTCATTATCCTTTTTTATCATACGTATGTATACACTCCTATAAACAATCAAATAGTGTTTCGATGTTGTGTATAATAGTATATACGGAAGTGGATAAAACACAAAATCTTGGTTTCGAAATCAGCAAAAAGAAATATGGCATCCATAAATAGACATATGATTCTGGAGAAACGAAAAATACAAGCTAAAGAAAAATTATCACAATACCTAGATAACCAAACATTGTGTTGTACGATCAGAAAAAATTCCATAAACTCTAAATTGGATTTTTGTAAGTTCTTTTCTTTTGGCTTGATCTACCACACCTACTGCACGTCACCTTGGCTAGCGCTTCGTTGTAAAATCAGATTCTCTTCTTGCGAAGTCTTCTTACTAATCTTCTTACATTGGGTTGTTGGACTACTGGTATCAATAACTCATGGTTTTGTCTAGGGTATCTACGTGATGAAACTTGCTAGTATTGACAAGCCATGCAATCTGTTACAAAATACATCATCATTACTAGTATATCCCTGGACTCCATCTCGATGCAACCCCATAAATTTGTACATACCTTTAACATCGGATTAGTGTATTCATGAGTTGGATTAAATTGCTCTAATATATAAAATTTGAGGAGATGATGACTAACCCCAAATTTAAGTTTGTCCAAATTTTTTTTTATAACTCAGTTCAATCCAGACCATGAACACCATAGTGTCCATAATGAATTTGAACCATTCATCTTCCATTATTATTGAAGTAAAAGAAGACAAACTTAGATTATTGTACACAAAGGGTGTGCATTTTTTGGTAGAATAAAAGTGGAGATGGTTAGGATTGAACCAACCTCTTGTTTGCTTTTATTTTGAAAGGAAATCAACTTTATTAAACATAAAGACCAGTATAACCATTTCTCCATATGATACCACATATTGATCCATCTCCACAGATCAGAGTGTGACCACACAAACAAAAAAAGCTAA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mRNA sequence

ATGAAATTCTTGGTCAATTGGGCCACAATCACCGTCTCTCCGCCGGAATTCTGCCTTTCGCCACCACACACCGTTACCGACCTTTGCCGCCATCGAACCTCCTTCACCGCTGCATCGACCCTAGCGCAGATCCGCGACACTCCTCGTCGGAAACCAGAACAAATTGGGCTTCGACCAAAACCCAACGGACAAAAGGTTCAATCCTTCTTCTCCGGTGATGCAGCCATTGGCACTGTAAAATCTGGCGACAAACCTTGTCTTAGGCCACGAACCTCCATCGACGTTCCCTCCCTGTCCATAGAGGATTCTTCTCTCACTAGAACAAACCTCATTGTTTTGACTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGAAATTCTTGGTCAATTGGGCCACAATCACCGTCTCTCCGCCGGAATTCTGCCTTTCGCCACCACACACCGTTACCGACCTTTGCCGCCATCGAACCTCCTTCACCGCTGCATCGACCCTAGCGCAGATCCGCGACACTCCTCGTCGGAAACCAGAACAAATTGGGCTTCGACCAAAACCCAACGGACAAAAGGTTCAATCCTTCTTCTCCGGTGATGCAGCCATTGGCACTGTAAAATCTGGCGACAAACCTTGTCTTAGGCCACGAACCTCCATCGACGTTCCCTCCCTGTCCATAGAGGATTCTTCTCTCACTAGAACAAACCTCATTGTTTTGACTTAA

Protein sequence

MKFLVNWATITVSPPEFCLSPPHTVTDLCRHRTSFTAASTLAQIRDTPRRKPEQIGLRPKPNGQKVQSFFSGDAAIGTVKSGDKPCLRPRTSIDVPSLSIEDSSLTRTNLIVLT
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 44..63

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0002417.1Sed0002417.1mRNA