Sed0002416 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0002416
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG04: 6150452 .. 6154816 (-)
RNA-Seq ExpressionSed0002416
SyntenySed0002416
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCCTCCACCTAACCCTAACCCCACCGCCACTTGACCTAGCCTCTGCCGCTGCTCGCCACGCCACCATCGATCAACCCAAGCGCCGCCCTGCCCTGCCCTTGAACGTGCAGACCCCACGCACGCCCCCACGTCCCACCGAGTGTACCTCGCAAAGATGAGCCCCACGCGCGCCAGCTGCTTCTCGAAAATGTCGTCATCTCCTGCGCGCGTTTCAGCCGCCGCAGCTCACGTGCACGCACCGTTCGTAACTCCTCTGCCTCACAGTCTCAAGCAGCCGCTGTCTCAAACGCCTTGCAACACCTCAGCCGCCCAGCATCGCTTCAATCGCCTTGCTCGTGTCGTTTCGACCTGCTCGATTTTGGGTAAGTTTACCCATAATTTAAAAAGTTGTTCTATAAAATTTCTTAGTAACTTTTCTTCCTTATTCTTGATTTTTTGTTGTTATTCCCCACTCTGAATTTTCTTTATTTTCCCTCTCCCCTTCTTCTCCCCGTTCATAAAATTCAAATTCTCAGTGTAACACCCCTAGCTCTAAATTCAAACTCTCGCCTAGCTAAGCACCTTGCTTTATAGTAATTTCAATAAACAATTACATCTAAAGCTTAGAAGTAGATCATAAAGCTCTTCTATAAGCACAAGTACTACAAAATGCAAGTTTGCCCACCTGTATAACACATATAGTCTTAAAAAAACTACATGTACATCATATTTTTCATTTCCTTTAGTCCATGCCTCATAGTCAAGGATGATTATCTTGCTTGTCGCCTATCCGCTTCGTTGGTGTCCAACCTAAGTGTCTGGAATAAGACCACATAAAAAGAATTAAACACGAGGTCAACAAGGTACCTAAATGCACCAACCCTTGTTTGACGATGTTGAAAGATTAAACTCCCCCTTGCACCACTTTATTCAACTAACCCCATAATCTTTTTCACATTCACACTCGCGTGCACCAACTTGCTCTTGAGACACATCGTGCTACCTTTAAACTTCCACCTCAACTATCAATGTAACAAAAAAGAACAAACTCACCTTTACTAACCTGCACACCTAGCCCAGCTGCATTCATAATTTAATTGAGTTAGCCATTTATAAATATATAACTCATTAAGCTAACATTTTATTCCCACCGAGTAAGTACTCACTTAACATTTAGCTACAAGATTATTAAACCCCTACATTGTTCAACCACCCTTCTCACCACCTATCCTAGTCCCGTTTCATTTTACACTTCATTCACAAGCATTAAATATCCCATACCAACATCTTCAGGTTCACGATTTACCCTTTACCTACTGAATAACATTTAGCTCTTCATCACCCAAATAACAACAATATAGATCTCCTACAAGAATATAACTATAACTAACTCTCGGCCAACACACTCCACACTTCAATCTAAATGCTAAGTCGCTCCTAGATTTCAATCTCATTAGTAGCAACATCACATGTAATTATTATCTTTCAACAACTTCGAGTTTCTTCATTCACTAAGAAGAAGTTGTTAGTAATTCTCAACATATATATCATTAAGTTTTTCTTGATTTTTTACTAATGTTGATTTTATTGTTCATGATGATTGAACTTCGAAGTACGCTCATTTTTTTAGAAGATAAGAAAGTTTTTCCACATCTCTATATTTTGAGCTAGTATTCTAAATGCAAGTGATAAGAAAGTTTTTTACTGTGATTAAGAAGTAATTCTGGGTTTCTTATAACCAATTGAGATGTTTTTCTTATATGGGTCTTGGCTGCTTCCACCATATGTGCAAGTTCTTGATTAATTTCTGGAGGTGAGTTGCTCAATCCATAATTTTAGTATCTTCCTATAATGATTATCTAAAAAAATTAATTACTTATATTTGAAAGTTCATAGTCTCGTCTTTCCTCTTTTTCTTATAAATTATCAGGTCATTTCATTATTTTTATTGTTAATTATGGGCTCTCTGTTCTGCGAAACCAAAGTCCAACAGAAAGAATTTAGAAACATCAAGATCTCTCTCATTTTGGCTGAACAAAAGGTACATTTTGTCCGAGGAAATTGTTATGGACTGAATCAAAAGGATCTACTTTAATTTTTTTTTTCTCATCTCTCATGCACTCACAAATCTTAGTGCCACTCAATTCTTCATTGTAATCATGTAAGTTAATTTATCACCAACTTTATGTCATATATGATTGTACAAATGATTATGTAAACTGTAAAACTCTTTTTATCATTTTATATATAAAGGGGTTGCTCCAACTTTATCACCAACTCTTTTTATCAATTTATCACTAACGCGCACGCACACCTCGCCCGAACGAGCAGCGAACTCTGCTGCTTAATCCCGCGCTAGCAGCCGCTCGGCGTTGCTCCAACTGCACGCACCAAACCCCACCGACAACAACCCATGGCCGCACAGCGCCTTGACGACCCCTGCGCACATGTCCCCTACCTGCGAGCAGCCCCCAATCGCATCCCAGATCTGCCCCAATGGCTGTCCGTGCCACCCCTCACAACCTGCTAGTGTTTTCGTTGGTTTTTTCGGGATGGTGTGAGTTTCGGTAAGATTTCTAACCTGGTCCCATGATTAATTACTTGTGGGTTGTAGTTGTTGATTAATGGTGGTCCTGGTTGGGTTGTTGTTTGGATTTTGTTGATAGGTTGGTATGTATTGTTCTTCGAGCCTTGCAAGATTGGGACAGCCGTGGTTACTCTTAGTTTTGGGAAAGTTTCGAAGTCGAAAATCGTTGGTTTAAGGTTCGATATTGTTGTTGAACTTGGATTTAAGTGGCTTATTTTGGAGGTTAATTGCTAGGTTGAAACTTGCTTATGGATTAATCTATTGTATGCAACTCAAGGAGTGTTTTCTTAGTTGTTCTATACTATTGAAACAGGTAAGGATTCTCAAGGAGCTTGTAGAGAAAGAGATGAGTTGCTTGTTGTTAATTAGAAAGTGTTGATTTAATGCCCGGGTTTATAAAAAACCCAAAGTTTAGAGATTTATAATGGTTAAAAAAATTTGTTAAACAAGTGGTTTGTTCTGAAATTACTCTTATTTGTAGTACTCTTGTATGTAGGAGGTTCGAGACAGGGCGGTATTGGGCTACACAACAAGTGATCCTCTCAACGATAGGTGGGTGGATTTAATTTGGTAAGGTTTATTGGGTGTTTTTCTATGTTGGCTGCTAATTGCAGGTTGTGGAATGAAGTTTCTAAATGAATTTATAGCTTATGATTGGGGTATTTAGGAAACGTGTTGGCTATGGATGTTAATTAATGTATATGAGGAGTGTGTGTGAAGATGTTGTAATGGTTGTTAGTTAAACTTCAAATGTGCAGGTTATGTTGATATTAATAAATGTTGAGAAGAGGGATTCTTCTTGAGTAGGAGGCAAAGAAATGTGTACATATTATAGGGATTTAAGAAAGAGTTGGATTGTTGTAAATGCTCGAGATTTGGGAAAAACTCTAGAGGAACTATTTTGCCAACTTTTTCAAAAAATGCTATTGTAATGGGGTGTGATATTTGGTTTTCTAACGTTTTGTGGTGGTAGGTTCTTGTCCATTTCGAAGAAACGCCAATGGGGAGCTTAAAGATTTCTAGCACAACGTATTATTTTCTATGATCTAGTTGTTACTCCACGATTTCATATTTAGCAAGGTTGAGAAACTTATAATTCTTTTTTTTTTGTAGGTTGATACAATGAACTCTATGAAGTAATGGATTTTTTGGGAGGTGTTAACACCCGCAACAACGTATCAAGTAAGTTTAATTTCCTACTTCTAAAATAATGTCTCACTCATACTTTAAATAGTGTTTATGCGGCTATCTTGCATGTATGATAACCTATAATGAAGATTGAGGTAATTATTAGGGGTTCGTAACTTTTTTTGTTTTTAGAATTTCATCGACCATGGTTTTGTATCTTGAAGTTTTGATACTATTAATTTTGGTCTTCAATAATTTCATCGACCATGATCTTGTACATGTTTAGTGTTAGTTTATAGTCTTCTCTATTTGAGTATACTCTTAGTGACATTGTATTTATATTGGGAAATTTACATAATAATATATTTGGTAACATTTTGTTTTTATTTACTTAAAGTTTTATAATTATATTGTGTAGGTATTTTATTCAAGGTGATGATCGAAGTCGTGAGTTATCGTACAAGTTGCCAAAGTATTTGATTTTCGTCCTAGGCTTCATGAAACATTAAGTGTAATTTCACTTACAACTTTTATATAAACTACTTTGTAAAGAACTTGTTAGGATTTTATTTGTATTGTGATGAATGAAATCTATTTGGCATTTATGTGGATTGTGACATTATTTATTAAAT

mRNA sequence

CTTTTTTCTTTTTTTCTTTCTCTTCTTCTTTCTTCTTCTTCCTCCACCTAACCCTAACCCCACCGCCACTTGACCTAGCCTCTGCCGCTGCTCGCCACGCCACCATCGATCAACCCAAGCGCCGCCCTGCCCTGCCCTTGAACGTGCAGACCCCACGCACGCCCCCACGTCCCACCGAGTGTACCTCGCAAAGATGAGCCCCACGCGCGCCAGCTGCTTCTCGAAAATGTCGTCATCTCCTGCGCGCGTTTCAGCCGCCGCAGCTCACGTGCACGCACCGTTCGTAACTCCTCTGCCTCACAGTCTCAAGCAGCCGCTGTCTCAAACGCCTTGCAACACCTCAGCCGCCCAGCATCGCTTCAATCGCCTTGCTCGTGTCGTTTCGACCTGCTCGATTTTGGGTAAGTTTACCCATAATTTAAAAAGTTGTTCTATAAAATTTCTTAGTAACTTTTCTTCCTTATTCTTGATTTTTTGTTGTTATTCCCCACTCTGAATTTTCTTTATTTTCCCTCTCCCCTTCTTCTCCCCGTTCATAAAATTCAAATTCTCAGTGTAACACCCCTAGCTCTAAATTCAAACTCTCGCCTAGCTAAGCACCTTGCTTTATAGTAATTTCAATAAACAATTACATCTAAAGCTTAGAAGTAGATCATAAAGCTCTTCTATAAGCACAAGTACTACAAAATGCAAGTTTGCCCACCTGTATAACACATATAGTCTTAAAAAAACTACATGTACATCATATTTTTCATTTCCTTTAGTCCATGCCTCATAGTCAAGGATGATTATCTTGCTTGTCGCCTATCCGCTTCGTTGGTGTCCAACCTAAGTGTCTGGAATAAGACCACATAAAAAGAATTAAACACGAGGTCAACAAGGTACCTAAATGCACCAACCCTTGTTTGACGATGTTGAAAGATTAAACTCCCCCTTGCACCACTTTATTCAACTAACCCCATAATCTTTTTCACATTCACACTCGCGTGCACCAACTTGCTCTTGAGACACATCGTGCTACCTTTAAACTTCCACCTCAACTATCAATGTAACAAAAAAGAACAAACTCACCTTTACTAACCTGCACACCTAGCCCAGCTGCATTCATAATTTAATTGAGTTAGCCATTTATAAATATATAACTCATTAAGCTAACATTTTATTCCCACCGAGTAAGTACTCACTTAACATTTAGCTACAAGATTATTAAACCCCTACATTGTTCAACCACCCTTCTCACCACCTATCCTAGTCCCGTTTCATTTTACACTTCATTCACAAGCATTAAATATCCCATACCAACATCTTCAGGTTCACGATTTACCCTTTACCTACTGAATAACATTTAGCTCTTCATCACCCAAATAACAACAATATAGATCTCCTACAAGAATATAACTATAACTAACTCTCGGCCAACACACTCCACACTTCAATCTAAATGCTAAGTCGCTCCTAGATTTCAATCTCATTAGTAGCAACATCACATGTAATTATTATCTTTCAACAACTTCGAGTTTCTTCATTCACTAAGAAGAAGTTGTTAGTAATTCTCAACATATATATCATTAAGTTTTTCTTGATTTTTTACTAATGTTGATTTTATTGTTCATGATGATTGAACTTCGAAGTACGCTCATTTTTTTAGAAGATAAGAAAGTTTTTCCACATCTCTATATTTTGAGCTAGTATTCTAAATGCAAGTGATAAGAAAGTTTTTTACTGTGATTAAGAAGTAATTCTGGGTTTCTTATAACCAATTGAGATGTTTTTCTTATATGGGTCTTGGCTGCTTCCACCATATGTGCAAGTTCTTGATTAATTTCTGGAGGTCATTTCATTATTTTTATTGTTAATTATGGGCTCTCTGTTCTGCGAAACCAAAGTCCAACAGAAAGAATTTAGAAACATCAAGATCTCTCTCATTTTGGCTGAACAAAAGCGAACTCTGCTGCTTAATCCCGCGCTAGCAGCCGCTCGGCGTTGCTCCAACTGCACGCACCAAACCCCACCGACAACAACCCATGGCCGCACAGCGCCTTGACGACCCCTGCGCACATGTCCCCTACCTGCGAGCAGCCCCCAATCGCATCCCAGATCTGCCCCAATGGCTGTCCGTGCCACCCCTCACAACCTGCTAGTGTTTTCGTTGGTTTTTTCGGGATGGTGTGAGTTTCGGTTGGTATGTATTGTTCTTCGAGCCTTGCAAGATTGGGACAGCCGTGGTTACTCTTAGTTTTGGGAAAGTTTCGAAGTCGAAAATCGTTGGTTTAAGGTTCGAGACAGGGCGGTATTGGGCTACACAACAAGTGATCCTCTCAACGATAGGTTCTTGTCCATTTCGAAGAAACGCCAATGGGGAGCTTAAAGATTTCTAGCACAACGTTGATACAATGAACTCTATGAAGTAATGGATTTTTTGGGAGGTGTTAACACCCGCAACAACGTATCAAGTATTTTATTCAAGGTGATGATCGAAGTCGTGAGTTATCGTACAAGTTGCCAAAGTATTTGATTTTCGTCCTAGGCTTCATGAAACATTAAGTGTAATTTCACTTACAACTTTTATATAAACTACTTTGTAAAGAACTTGTTAGGATTTTATTTGTATTGTGATGAATGAAATCTATTTGGCATTTATGTGGATTGTGACATTATTTATTAAAT

Coding sequence (CDS)

ATGAGCCCCACGCGCGCCAGCTGCTTCTCGAAAATGTCGTCATCTCCTGCGCGCGTTTCAGCCGCCGCAGCTCACGTGCACGCACCGTTCGTAACTCCTCTGCCTCACAGTCTCAAGCAGCCGCTGTCTCAAACGCCTTGCAACACCTCAGCCGCCCAGCATCGCTTCAATCGCCTTGCTCGTGTCGTTTCGACCTGCTCGATTTTGGGTAAGTTTACCCATAATTTAAAAAGTTGTTCTATAAAATTTCTTAGTAACTTTTCTTCCTTATTCTTGATTTTTTGTTGTTATTCCCCACTCTGA

Protein sequence

MSPTRASCFSKMSSSPARVSAAAAHVHAPFVTPLPHSLKQPLSQTPCNTSAAQHRFNRLARVVSTCSILGKFTHNLKSCSIKFLSNFSSLFLIFCCYSPL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0002416.1Sed0002416.1mRNA
Sed0002416.2Sed0002416.2mRNA