Sed0000933 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGCAAAAGGGGAAAAATAATAAGTGAAAAAAAAATGGGGTTTGAAGGAATTATTGTGGCAAAGGTGCTTGTTCTTGTTGTGGTTTTTATTGTTGTTGGGGTAAGTGGAAAACCTAGCTATGGGGTTGAGTTCAATTTGAATAGGAGTAGTTTTCCTCAAGGGTTTATTTTTGGGGCAGGTTCATCGGCTTACCAAGTGAGTTTTTGAAATTAAAATTTGAATCCATTGCTGGAATTTGTGTGGTTTGTTTTGTTTAATTTTTTGTTGATCGGTTGTTTTTTTTTCTTTTTAGTTTGAAGGAGCTGCAAATGAAGATGGTCGAGGGCTTAGTATTTGGGATACCTTCACTCACAAATATCCCGGTACCATCTCTTTTTTCATTATTCGTCGTGTATTTTTTTATCAGTTTTAAAATTTATTCAATACAATTGTCATAATGTAGTTACTTTTTATGAAAAAATTTCTAATACTACGAAAACAATATATTCCTTTTATTAACATCGATATTGAGTTCAATCCTCATGGTATCCACCTAATTAGGAATTAATTTTTTATGGGTTTTCTTAGCATCCTAATGTTGTAGGAGGTGGTATGCCCCGTGAAAATAGTCGAGGTGTATGCAAAGTAATCCGGACAGTCACGGATATAAATATATATATATATATTGAGTTTATAAATAATCATAATAATATTGAGTTTATAACTAATCTTTTTGAAATACTAAAACAGTATTAGTAGAAGAATTTTCTCAAATTCAAAATCTATGTCTCTTAAATCCTTTCTTTTTTTCCCTCTCTCATTTCTTGCTTCCTTCTTTGTAGTTGATCTTTGCTCTCTATATCCATATAGTTTTGCTCTATGCTTTACCCTCTAGTTTCTCTTTTATTATCTTATTGTTCAACGTACCTATAGAACTATTGAGATCTCAATTTTATTTGGGATATAAATTTGGATGAGGTCAATGTTGGATGGTTATTGGTTATTGTTTTGTTTTGCTCTATGCTTTACCCTCTAATTTCATAATCTCTTAATTCTAAAACATATATTTATGTACTGATTCAAGAACATTAGTTATTTTACTCAAAAAAGAAAAGAAAAGAACATATTAATTATTAATTTATTTACTACAAAAAAAATAGTATAACTTTTGAGTATAATCGTTTAGCTCCCATTGATAATCATTTGGTTCTTTGTAACCAAACTTGAAAAATACAAATAAATATTTGGAAGTTTTTTTATTTCAAAATTTTGAATTGATTTCTAAAAATACAGGTAAGATATCTTAGTAAAAAAAAATATGGTAACATAGTTATTATTGGCTTAAATTTCAAAAAAAAAAAAATTTACAATAATTAAAAGAAGCCCAAATTATTATATTATAAATGTTAAAAGGACATAAAAGAACTGAATCGTTATTTGAAAGACATAGTACAAAAATGTTTTGAAGGTAGTGTTTTGAATCAAATAAATAAATATTAAAACATATTGGGACTATTGGCAGGCAAGATTGTAGACCGAAGCAATGGAGACGTAGCTAATGATGCTTATCATCGCTATAAGGTAAAGTGCATGTCATTACCTACAATAAATGTTCCAATAAATTAATTAGTTTATTATTATTGGTTGTTCTTAATTTAGATCAATTTTATTTTATATTTAGCTAGCTGCTAGGTTATAAAATATACAATTAATATTTATTAAAAAGTTATAACTAATCCAAAATATTGATCTTTTTTATAAGAAATTATCTTGTGATGTAACAGGAAGATGTTGGGATTATGAAGGAGATGAATTTAGATGCTTATAGATTTTCATTTTCTTGGTCCAGAATCTTGCCAAGTAAGTTTTTTCTTTTTATATAAAAAAAATTAATATTTCAATTGAGGGGTCATAACTAAATGTTGGTTGATATAATTAAATTTGTCTTAACCCACTAGTTTAAGCTTTTGGATTAATTTATGATTGAACATAATTCAACATGGTATCAATACATTTCTCAAATTTCAAAACCCACAAGTGAGGGAGAATGTTGGTGGATATAATTAAATTTACATCAATCCATTAGCTTAAGCTTTTGAGTTGATTGATGATTTAACATAATTCAACGTAAAACAAAATTAAGTTTGGATAGAAAATGTTGTGATTACCTCGGACCTATTCTTAGCATACATTGGTTATTTGATCAAGATTTAGCCAAATAGTGAGGTTTTATAGGCTTTTAATCTAGCTCATTTCGACACGGTTTATTTAAAATGGTTAGGGGCATAAGCCCTATTCCACTTTTCCCAATTAATAAACACTTTGAGCGCTTGAGGGAGTCAATATTATTAGAAAGGTTCATTACAAGAGTTCGATCTTAACAACAGTAAACAATAAATCTAAAGCTATTACAAGTTTTTTTGAAGAGAATACATCAAAGATAGCAAAATAACCATAAGCAAGGAAAAGGGATTTGACACAACCTTTAATGGCTTGAGAAGAAACTTGTATTTGTGCTCCGAACTTGCAAGAATCACTTTAATTCTTGTAAATCTTCCCTTGGAAAGTAAAACCCGACCCCCCCAAAAAAAAAGTAGCCTTCACACCAAGAACGAAACCGGAGATTCGCTTCACCTTAAAATACAAACAAGAACTCAAAGAACACTTCATGCAGACTGATCTGAGGGGGAGAAACAGTACGGTGGCGATGACCCCTCACGATTCCTGTGAGACGGCAACGGCGTTGCAAGGCTTCCCCTCTTGGGTAGCCACAGCTTGTGCGAGAAGATGAAGAAAAAAACCCTTTTTGGAGGGTTTCTACGATTTTTCACGCTAATGCAGCAAATGGGGAGAGAAAAAATTTCTCTCCTCTCTCAACCAAAATTCACAAAATACCTAATTCTAAAAAATGCTTAACTTTAATTCTCATTTAAATGTCATATTTATAGAATTAATTAAAGGGTTTTACATGGATTTAATGTGAATATACCTAATTAAATTATCTCATATGGTTAGATAACAAACCAACTAATCACTATTTAATTAATGAATCTTTTAATTAACCTAAACTATTTAATTAACCCAAATACATTTAAATTACTAATTTTATATCTAATTGTTATTAATTAAAGTTAAAGCCAATTAATTTTACAACAATATCCGTCTTGGCTTTAACTTTAATTAAAACCTTATAACATTCATATCATAAGAACTCATTAACTAATCTATATCAACCATAGCATAAACTCTAAACTCATTTAAACATAGTTTCATCAATATTTTTCTCTAAAACAATCAAGGTTAAAAAAAATTTTAACTCATGCAAAAGTTTACTTAATGCAAACATGCCATCCCAAGTACTACAATTTCCATGCATGTCTAATTTTAAGTAAAACCTTGATTTACAAACAATTAGAGACAAAAAATAAGTTGTTTACAACAAACCCCTTCTAATTTTAAGTAAAACCTTGATTTACAAACAATTAGAGACAAAAAATAAGTTGTTTACAACAAACCCCTTCTAATAATATTGATCCATAAAAAAACACATTTGCTTGCCAAAAAAAAAAAAAAAAATCTACACGTCAATCACTATTTCAAAAGAACACAATGCAAATCTTTAATGAAATATTGATATTTACATCTTTGACACAATGTCAAATAAAACAACCATAGACAAACAAATTTAAATAGAGATGCATATCAAACATAGAAAGAAAGAAAATCACATATAGTCAAAATATCATTTATACCAACCCAACATTTTCAAGATGGTTAAAACCATCCACCTCCACTAAGCTACCCTCCTTTTAAAACAAGTTTCTAGCTAGAGGAGTGTGGCAACAAATCTAAAATTCCCTTAGATTTAGGATGAAGGGTTAAATGGTGGTTCTATATATTTTCTAACTATGAAACCTAAACTAGGTTCAAACTAGCAACTCGAGTAATATGGATTTGAAGCATTTTGATTCAAAACATAACATTATAGCCTAATACTTAATAAACAAGGGCACTTTAAGAAAAGTCTCATTTTTTAGAAAACACAATCATATGTGGTAGGATGGGGAAACTAGAATGCCACAACTTACATATTGCATTCAAACAAATGACATACTTAAGGCACCTATTATCAACCATAATACTAACGCTCACTTCCAAAAGTTCGAGAACCCATTCTAGTCGACTTTACCCATGAGTTACAAAAAGTTCCTACATGATATATTGATCCACCAAACAAGCATACTAAATGAATGACATTTATTTCCACAAAAATAAAAGCAATCTTTTCTTGTAAACTTATCAATCACAAACACCAACCATGTAACTTCATAAATAGTAAACATATTAGAATGATTCAACAAAATAGAAAATCCACATTCTATTTCATGCAAAAGAAATTGACAAATTTCACTAAATCCTACTTTACCATTGATCACATAGACACAATATTAAAAAATATTAAGGTCAACACTTTTTAGATTGAGAAACAATTGTTGTTTAATCAACTCATTAATCCCTAGTTCACTAGCATATCTCATTCCTCTATGCCACAAAGTAGATTTATCTAAGTCAATTTCTTTACCTAGGATACTTAAGCATACATCAAACGAACTTTCAAGAGAGTACAAGTATTATTAAGGAAACCTTTCAATACTACCATATTTTCCTTCATGATACCCATTTCACCATTCTTAATCACATTGGTGAAACCTAGCCGATCAAGTACACTTAGAGATACTAAGTTCCTTCTAACATCGGGCACATAGCTTACCTCATTAAGAAGCATAATACTCCCATCATGAAGTCCTCTCACCTTCTACCTTACAAATTTTGCCATTACCTAATATGACTTTACTTTCTACACTCGTTCGAAAGTCTACAAGCCAATCCTTATTAGGTATCACATGGAAAGAACATCCCGAATCTAAAATCCAAGACATATCCTCACAAGTGGGGCTAACTAAGAGTACACCATTACATTCCTCACCAATATTAACTCCACTTCCTCATTC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MCKRGKIISEKKMGFEGIIVAKVLVLVVVFIVVGVSGKPSYGVEFNLNRSSFPQGFIFGAGSSAYQFEGAANEDGRGLSIWDTFTHKYPGKIVDRSNGDVANDAYHRYKEDVGIMKEMNLDAYRFSFSWSRILPKGKISGGVNQKGIQYYNNLINELLAKGIKPFVTLLHFDLPQALQDEYGGFLSPNIVDDFKEYAEICFKEFGDRVKHWVTLNEPWSYSIAPNVFAPNNCCGVNASTEPYIVTHYQILAHAAAVKLYRHKYQKSQKGMIGITLISNWIIPISKAIKQRNAANRALDFMLGWFMDPLTFGDYPKIMRSLVRKRIPKFTKKQSEMVKGSLDFLGLNYYTTDYAKYTPPPKANRETYFSDICAKPLIERNRVPIGPIPGSSWIAVYPRGIHDLLLHIKAKYNDPLIYITENGVNELNNATLPLKEALADNIRIDYHKAHLYFVQKAIEDGVRVKGYFTWSLLDAFEWTSGYTIRFGLNFVDFNDGMKRYPKNSAHWFKSFLKH Homology
BLAST of Sed0000933 vs. NCBI nr
Match: XP_038878464.1 (beta-glucosidase 12-like [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 805.1 bits (2078), Expect = 3.6e-229 Identity = 379/511 (74.17%), Postives = 429/511 (83.95%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. NCBI nr
Match: KGN66450.1 (hypothetical protein Csa_006862 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 804.3 bits (2076), Expect = 6.1e-229 Identity = 380/524 (72.52%), Postives = 438/524 (83.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. NCBI nr
Match: XP_022967216.1 (beta-glucosidase 13-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 1.4e-228 Identity = 376/510 (73.73%), Postives = 433/510 (84.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. NCBI nr
Match: XP_023530952.1 (beta-glucosidase 12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] >XP_023530953.1 beta-glucosidase 12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 802.7 bits (2072), Expect = 1.8e-228 Identity = 376/506 (74.31%), Postives = 430/506 (84.98%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. NCBI nr
Match: XP_011660110.2 (beta-glucosidase 12 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 799.7 bits (2064), Expect = 1.5e-227 Identity = 379/522 (72.61%), Postives = 436/522 (83.52%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV2 (Beta-glucosidase 13 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU13 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 648.3 bits (1671), Expect = 7.4e-185 Identity = 302/510 (59.22%), Postives = 378/510 (74.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8AVF0 (Beta-glucosidase 12 OS=Oryza sativa subsp. indica OX=39946 GN=BGLU12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 642.9 bits (1657), Expect = 3.1e-183 Identity = 296/498 (59.44%), Postives = 373/498 (74.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV4 (Beta-glucosidase 12 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU12 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 641.7 bits (1654), Expect = 6.9e-183 Identity = 296/498 (59.44%), Postives = 373/498 (74.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7F9K4 (Beta-glucosidase 10 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU10 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.4e-175 Identity = 291/499 (58.32%), Postives = 357/499 (71.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XKV5 (Beta-glucosidase 11 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=BGLU11 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 617.5 bits (1591), Expect = 1.4e-175 Identity = 296/503 (58.85%), Postives = 368/503 (73.16%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LX61 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_1G611270 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 804.3 bits (2076), Expect = 3.0e-229 Identity = 380/524 (72.52%), Postives = 438/524 (83.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HRE5 (beta-glucosidase 13-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466814 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 6.6e-229 Identity = 376/510 (73.73%), Postives = 433/510 (84.90%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BPX7 (beta-glucosidase 12-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492053 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 797.3 bits (2058), Expect = 3.6e-227 Identity = 374/511 (73.19%), Postives = 432/511 (84.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EIY3 (beta-glucosidase 12-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434571 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 1.4e-226 Identity = 376/510 (73.73%), Postives = 429/510 (84.12%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DMP4 (beta-glucosidase 12-like OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111021432 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 789.3 bits (2037), Expect = 9.9e-225 Identity = 371/513 (72.32%), Postives = 434/513 (84.60%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. TAIR 10
Match: AT5G44640.1 (beta glucosidase 13 ) HSP 1 Score: 556.2 bits (1432), Expect = 2.7e-158 Identity = 273/499 (54.71%), Postives = 344/499 (68.94%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. TAIR 10
Match: AT5G42260.1 (beta glucosidase 12 ) HSP 1 Score: 555.8 bits (1431), Expect = 3.5e-158 Identity = 277/504 (54.96%), Postives = 343/504 (68.06%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. TAIR 10
Match: AT3G60130.1 (beta glucosidase 16 ) HSP 1 Score: 550.8 bits (1418), Expect = 1.1e-156 Identity = 271/501 (54.09%), Postives = 350/501 (69.86%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. TAIR 10
Match: AT2G44450.1 (beta glucosidase 15 ) HSP 1 Score: 546.2 bits (1406), Expect = 2.8e-155 Identity = 263/475 (55.37%), Postives = 331/475 (69.68%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000933 vs. TAIR 10
Match: AT2G44480.1 (beta glucosidase 17 ) HSP 1 Score: 545.8 bits (1405), Expect = 3.7e-155 Identity = 265/508 (52.17%), Postives = 351/508 (69.09%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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