Sed0000373 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTACAGGACATTGGCTACATCTGCGGCCACAGCTTCAACAACAGATAGCGTGGATTATGTGGTGAATTTGGATCAAATTCCACGCTGGAGTGATGCAGAACATAGGTCTTCAATGGAGTTCGTCAACGAAGACCCTTCTTTGTCTAATTCGTACTTTCCTGATCCTCTGACGTCTCCATCTGACGCCGAGAATGGTAGTTGTGGGCTCGTTTCGAGATTCCCGGTCGATCATGAGATTAATTCCAGAATATATCTGTGGCGGGGGAATCCTTGGAATCTTGAGGTCGATGCTGTCGTGAATTCTACAAACGAGGTGAGTGTTAATTTTCTTCCCCTTCTTCTTTCTGAAATAGAAACCTAAGAAAATAAACAAAGGGAAAGAAAGCGATACCGTGAACTTAATAATAGTTACTGTTGTTCAATTATGTTTAATTCTATCAACCAACACTCCCCCTCACTTGTGAGTTTTGAAATTTGAGAAATGCATTACAAGTTGAATTTAATTTTAATTGGAGAGGAAACAACTTGGCAGAGACTCGAACATGACCTCTTGCTTGTTAAACAAGTTTGATTTATTATGTTTTTATATGTTATTTTATTACCGTTGCATCTTTCTCTTGTCCTATCTATATAAGGTCTTTTTCTTGTAAGTGTTTTTAAGGAAAACTGTAATACAACTTTGTCTTGCAATTATTCTCTCAAGCTTTCAACTCCTTTCATGGTATCAGATTCAAGGTTTTAAATCAAAATGGTACAAAATACCTCATCCTTCTCATCCGGTCTGGGGAATTCACCCAACGAATCTCCTCAACCTCAACCAAATCCTCAACCTCATCTCTCCACAACAACAAATCTCCCCCCCCCCCCCTTTACTTCGCCACCTAACCCTCGGCCAATGCCCACTGGGCAACAAAATATTCCTCCAAATTTTGCATCTCCCTCCTTCTCAACTCCATGACCATTTTTTGGTTCTTATCAACAACCTGCCCAATATTCCATACCCCTTCCCCCACCACAAGTTCTACCTAATGTTTCTCACTCCTTTCCCATAAAACTCAAGGATTCTAACTATTTACTTTGGAAGAATCAAATACTCAACATCGCATACTCTTTCAGGCTTGAAGGGTTTCTTAATGGGTCCATTCCCTCTCCACCAAAGTATCTCGATAACCTTCAACTTCATCATAATCCTGAATTTATGGTGTGGGAACAATATAATAGGATTGTTATGTCCTGGTTTTACTCATCTCTCACTGAAGAAAAAGCGGCAGAAATTGTCTCTTTCAACACTGCTCGAGATATTTGGGAATCCTTGCGCCGCTCCTACGAATCCACCTCTTCATCTCGTGTTCTTAGTCTTAAATCTCAAATTCAAAGAATCAAGAAAGATGGCATGTCGGTGACTCAATTCTTGGCCAAAATCAAAGATGTTGCTGATAAGTTATCATCCATAGGTGAACCAGTTCCTCTCAAAGATCACATTTCTTACATATTGGAGGGTCTTGGGGTTGAATATAATGCATTTGTGATAGCCATACAACATCGATCTGAGTTGCCAACAATCGAAGACATTCGAGCACTGTTGTTAGCTTATGAGTATCGGTTAGAACAACAAAATTCGGTTGATTCTTTAAACTCTATTCAAGCTAACTTTGCAGGTATTAAGATTCAGGGCTCGTCTTCTTTTAAGCGTGGGACTCGGTCTCAAAATAACTATGTTCAACCTCCAAATAACTATGTTCAGCGTTCATCCCAAAATCAACCCGGTATTCTCAGCAAGCCATCACAACCTCCCCCTACCCATAATTCATCATTCTCTCCACCAGACAATACCCCTCCAGACACACCCCAATGTCAAATATGCAATAGAGTTGGTCACATTGCCCTTTCCTGCTATCATCGGGCAAACTTCATCAAACACCCACCAACTAAACCATAAAAAAAACCACACGCCATATTGACAAGTACTTCTGTCCAACCCCAACCCGCTAAAATTCAACCCTCTCTAATCCCGGATGACGCGTGGTACATGGACTCAGGTGCTACTCACCATCTCACTCCTGATTTCAACTCTTTGTCCAACCCTATACCTTACGGTGGAAATGAGCAAGTAACTGTTGGGAATGGTACGTCTCTTCCTATCTCTAATATTGGATCTATTCGTGTTCCTTGATTCATAATATTCCTCTTCACCTAAATCATATTCTTCATACTCCTTTTATAACCCATAAATTAATTAGTATATCAAAGTTGTGTCGGGATAATAAAGCGTCTGTTGAGTTTTATCCTACTTTTTCCTTGTGAAGGATCTTTTAACCAAGAGAACTTTACTCATGTGGCAATCTTGAAGGAGGTCTATACAAATTGTGTCCGTCCTCTTCCACATATCCGACACGTTCAACCTCCACTTTTGCTCTGCCCTTGTTTCAAGTGGACCATCGTCAATATGGCATGCACGCCTTGGTCACCCCTCTTTTGATGTCGTTAGGAAAGTTTTTGAAATATGTAAAATGGGTTATCCACCCAAGTTTGATTTAAATGTATGCTCTTCATGTCAAAAGGCGAAAAGTCATCGTTTACCTTTTTCTTTGAATTTTCGGAATGCTTCTCATCCTTTTGAAATTGTGCACTCAGATGTATGGGGACCCTCCCCAGTAGATGCTATTAATGGAGCTAAATATTTTGTATTGTTCATTGATGATTTTACGGATATACTTGGCTTTACCTTTTAAAAACAAAAGATCAAGTATTCCCAATTTTTCTTCAATTTCAAGCCATGGTTAATACACAATTTAATTATAAAATCAAAGCTCTCCAAACTGATTGGGGGGGTGAATTTAGATCCTTATCATCCTATTTGGCAAACCAAGGAATTTTACATAGAGTTTCTTGTCCTTATACTCCTCAACAAAATGGGAGAGTTGAACGTAAAAACCGACATATTGTAGAAGTTGGACTATCATTGTTAGCTCATTCAAATGTTGATCTTAAATTTTGGCCTTTTGCTTTTCAAACTGCCGTTTATTTAATTAATCGTTCCCCAATTTTGGTTTTATCTCATAAATCTCCTTATTTTGCTCTTTTCAATAAACACCCAGATTATTCTATTATTCGAATATTTGGTTGTTCGTGTTATCCCTTTCTTCGTCCCTACAATAGTCACAAATTGCAATTTAAATCAGTTGAGTGCATTCTTTTAGGATTTAGCTCCAATCATAAGGGGTATTTGTGTTTTGACCCCGAATCTGGGCGCTTGTATGTTTCTCGTCATGTGATTTTCAATGAATCTATTTTTCCTTCACAAGTTAAGTCTCAGTCGAACCCTCAATTTAAATATGATTGTCCAGATAATTTTTTAGCACCACCAATCCCTTTCCAAAATTCCCAACAATTTCAAAAAAAATCTTCATCTATTTTTCCCACTTTACATGTGTCCAATCTTAATTTCCATAAAAATAATAATTTAAATCCACAAATTTCTAATTCATTTTCTTCCGCGTCAGTCCCATTAACCATCATGTCGGCCTCGACCGATCCCAAAATATCCCTGCACCTCCCGGTTTTCCTCACCCCATCTACACCACTCATTTGCAACCCGTTAAACATGTGCCACACGTCTCCCATCCAACACTCCACCCATCAACACATCCCCTCATTTCCGATTATATTCCCACTTGCCCAACATCTCTCATCTAACGCCTCCCCATCCCATCTTTCGCCCAATAGTCACCCATGTGTCGATCCCCCACCATGTCTTGTCCACTGCATCCACTTCCATTCCAAAGAATTAATTCTACCACCCAAAGTATTTCTTTTTATCCAATGACTTATCTCAAACCATGACCATCTCTCCAATAGTAATTCAAATTCTTTAACCTCACAATTTAATTATTCCCTTCCCCAAGTCCCCCTCTCTGTCCAAACTCATTTGCCTCAATCAGAAACTAATATTCACCCAATGGTTACTCGGTCGAAAGTTGGGATTTTTAAACCAAAAGCTTGGACGTCATCTATGTCCATCAATCCTTCAATGACTGAGCCTACATCTTACAAAAAGGCTTTGCTATGTCCCGAATGGAAACATGCAATGAATTGTGAAATTGAAGCCTTGACACAAAATGCAACATGGACACTTGTTCCACCACCGAAAAATTGTCGACCTGTTGGATGCAAATGGGTCTTTCGCCTCAAGCTAAAACAAAATGGTGTAGTTGATAGACATAAGGCGAGATTGGTTGCAAGGGGTTTCACTCAAACATACGGTCTTGATTATTTTGATACATTCAGTCATGTTGTGAAGCCATCCACAGTTCGGATTATTCTATCTCTCGCAATCAATTATAATTGGTCAATTCGACAACTTGATGTGAACAATGCATTTTTGAATGGTGAATTAAAGGAAGAAGTATTCATGGAGCAACCACCGGCTTTATACATGCCGACTATCCGAGGTACGTTTGCAAACTCAATAAGGCTATTTATGGATTAAAACAAAGTCCTCGTCGCGTGGTTTTGAAGTTGAGTTCTTGTTTGTCTGAATGGGGATTCTTGGCTTCAAAATCAGATACATCACTATTTTTTTTTCGGCAAGGTACTCATATTGTGATTATTTTAATATATGTTGACGACATCATTGTCACCGGTAGCAGCAACGTTCTATTGTCATCCTTAATTAGTCGTTTGGGAACTGTATTTCAACTAAAGGATCTTGGTTCTTTATCATATTTTCTTGGAATTCAGGCTTCATTTTCATCTAATGGTCTTCATTTATCTCAAGAAAAATATATCAATGATCTGCTCTTGAAAGCCAATATGATGAATTGCAAACCAGTTGCAACTCCGATGGCATTCGGTGTTTCATTATCTCTACATGATGGTGCTCTTATGGATAATCCAACTGAATATCGTAGCCTTGTAGGAGCATTACAATATTGCACCATTACTCGTCCTGATATATCCTTTGCGGTGAATAAAGTTTGTCAATTCTTACAT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ATGTACAGGACATTGGCTACATCTGCGGCCACAGCTTCAACAACAGATAGCGTGGATTATGTGGTGAATTTGGATCAAATTCCACGCTGGAGTGATGCAGAACATAGGTCTTCAATGGAGTTCGTCAACGAAGACCCTTCTTTGTCTAATTCGTACTTTCCTGATCCTCTGACGTCTCCATCTGACGCCGAGAATGGTAGTTGTGGGCTCGTTTCGAGATTCCCGGTCGATCATGAGATTAATTCCAGAATATATCTGTGGCGGGGGAATCCTTGGAATCTTGAGGTCGATGCTGTCGTGAATTCTACAAACGAGAACTTGGATGAAGCGCACAGTAGCCCTGGTTTGCATGCTGCAGCAGGACCTGGTCTATCAGAAGAATGCGGAACACTTGGTGGTTGTCGCACTGGAATGGCAAAAGTCACTAATGCTTATGATCTTCCTGCTAGGAAGGTCATACATACTGTTGGTCCAAAATATGCAGTCAAATACCATACTGCTGCAGAGAATGCTCTCAGCCATTGCTACCGTTCTTGCCTTGAACTTCTTATTGAAAATGGGCTTCGGAGCATTGCTATGGGTTGTATATATACAGAGGCAAAAAACTATCCTCGTGAACCTGCTGCACATGTAGCAATAAGAACTGTGCGTCGTTTTCTTGAGAAGCAGAAAGATAAAATTGAAGCTGTTGTATTTTGTACAACGTCATCAGTAGATACTGAAATATATAAAAGGTTGCTTCCTCTGTACTTTCCCCGTGATAAACATGAGGAAGAAGTTGCATTGTCAAAGCTTCCTGCAGATGTTGGAGATGAGAATGGCGAGGCCATTATAGACGAGCGGAAAATCAGGATAAAACCTTTGCCCAAAAAGAATGTTCTGAAACCTTCCCAAGATCCCGAAGATCCTCCAGTCAGTGATGTAAGGTTGACGCGGAGGTTAGAACTCATCATATTTGGATTCATACCTGGATCCTGCTTTCTGGCTTTAATCAAAGATCCAGATCAAAGACGCAAGGAACAATGGGAAAAAACTGCCCAGGCTCAGACTGGATGGAATTATGGTAGAGTGCTTGGATTTGGTGACCTTGGTGGACCTCCTTTATCTGCGGCTGAAGAATACTCTCTTCATTCGAGATATCTTGCTAAAGCAAATTCTCTTAATCTCTCTGAAATTGGGGAGATGAAAATTGTTTACCGTGGTGGAGTTGATAGTGAGGGCCGTCCTGTTATGGTTGTTGTTGGAGCACATTTTCTACTACGTTGTCTTGACCTTGAGCGGTTTGTTCTCTATGTTGTAAAGGAATTTGAGCCTTTAATACAGAAGCCTTATACAATTGTGTACTTCCACTCTGCAGCATCTTTACAACCTCGGCCAGACATGGGATGGATGAAGAGATTGCAGCTGATTCTTGGACGAAGACACCGGCATAACCTTCATGCAATATATGTTCTTCACCCAACCTTCGGATTGAAATCTGCAGTATTTGCCATGCAATTGCTCGTGGATAATGTGGTATGGAACAAAGTTGTGTATATTGATCGACTTCTGCAGCTGTTCAAATATGTTCCTCGAGAGCAGTTGACAATCCCCGACTTTGTATTTCAGCACGACTTGGAAGTAAATGGAGGGAAGGGCCTGATTGTGGATCCTCGAACAAAATACGTATACCATCGACCTTAA MYRTLATSAATASTTDSVDYVVNLDQIPRWSDAEHRSSMEFVNEDPSLSNSYFPDPLTSPSDAENGSCGLVSRFPVDHEINSRIYLWRGNPWNLEVDAVVNSTNENLDEAHSSPGLHAAAGPGLSEECGTLGGCRTGMAKVTNAYDLPARKVIHTVGPKYAVKYHTAAENALSHCYRSCLELLIENGLRSIAMGCIYTEAKNYPREPAAHVAIRTVRRFLEKQKDKIEAVVFCTTSSVDTEIYKRLLPLYFPRDKHEEEVALSKLPADVGDENGEAIIDERKIRIKPLPKKNVLKPSQDPEDPPVSDVRLTRRLELIIFGFIPGSCFLALIKDPDQRRKEQWEKTAQAQTGWNYGRVLGFGDLGGPPLSAAEEYSLHSRYLAKANSLNLSEIGEMKIVYRGGVDSEGRPVMVVVGAHFLLRCLDLERFVLYVVKEFEPLIQKPYTIVYFHSAASLQPRPDMGWMKRLQLILGRRHRHNLHAIYVLHPTFGLKSAVFAMQLLVDNVVWNKVVYIDRLLQLFKYVPREQLTIPDFVFQHDLEVNGGKGLIVDPRTKYVYHRP Homology
BLAST of Sed0000373 vs. NCBI nr
Match: XP_038890071.1 (protein GDAP2 homolog [Benincasa hispida] >XP_038890072.1 protein GDAP2 homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1053.9 bits (2724), Expect = 4.9e-304 Identity = 517/560 (92.32%), Postives = 535/560 (95.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. NCBI nr
Match: XP_008465697.1 (PREDICTED: protein GDAP2 homolog [Cucumis melo] >XP_016903466.1 PREDICTED: protein GDAP2 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1049.3 bits (2712), Expect = 1.2e-302 Identity = 515/560 (91.96%), Postives = 534/560 (95.36%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. NCBI nr
Match: XP_022999322.1 (protein GDAP2 homolog [Cucurbita maxima] >XP_022999324.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1047.7 bits (2708), Expect = 3.5e-302 Identity = 516/561 (91.98%), Postives = 536/561 (95.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. NCBI nr
Match: XP_022946371.1 (protein GDAP2 homolog [Cucurbita moschata] >XP_022946372.1 protein GDAP2 homolog [Cucurbita moschata] >KAG7029988.1 Protein GDAP2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1046.2 bits (2704), Expect = 1.0e-301 Identity = 516/561 (91.98%), Postives = 535/561 (95.37%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. NCBI nr
Match: XP_004143794.1 (protein GDAP2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031741405.1 protein GDAP2 homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN51197.1 hypothetical protein Csa_008053 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 1.7e-301 Identity = 514/560 (91.79%), Postives = 533/560 (95.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A7T167 (Protein GDAP2 homolog OS=Nematostella vectensis OX=45351 GN=gdap2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 323.2 bits (827), Expect = 5.9e-87 Identity = 183/504 (36.31%), Postives = 282/504 (55.95%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5CZL1 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 299.3 bits (765), Expect = 9.2e-80 Identity = 185/523 (35.37%), Postives = 279/523 (53.35%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q66HX8 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Danio rerio OX=7955 GN=gdap2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 293.9 bits (751), Expect = 3.9e-78 Identity = 188/528 (35.61%), Postives = 278/528 (52.65%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9NXN4 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GDAP2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 291.6 bits (745), Expect = 1.9e-77 Identity = 177/523 (33.84%), Postives = 282/523 (53.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XGM5 (Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2 OS=Xenopus laevis OX=8355 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 290.0 bits (741), Expect = 5.6e-77 Identity = 179/523 (34.23%), Postives = 277/523 (52.96%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4E5F4 (protein GDAP2 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503322 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1049.3 bits (2712), Expect = 5.8e-303 Identity = 515/560 (91.96%), Postives = 534/560 (95.36%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KAK4 (protein GDAP2 homolog OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111493730 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1047.7 bits (2708), Expect = 1.7e-302 Identity = 516/561 (91.98%), Postives = 536/561 (95.54%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G3J6 (protein GDAP2 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450452 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1046.2 bits (2704), Expect = 4.9e-302 Identity = 516/561 (91.98%), Postives = 535/561 (95.37%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KS03 (Macro domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G487740 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1045.4 bits (2702), Expect = 8.4e-302 Identity = 514/560 (91.79%), Postives = 533/560 (95.18%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GJF0 (protein GDAP2 homolog OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111454405 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1036.6 bits (2679), Expect = 3.9e-299 Identity = 511/563 (90.76%), Postives = 532/563 (94.49%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. TAIR 10
Match: AT1G69340.1 (appr-1-p processing enzyme family protein ) HSP 1 Score: 892.5 bits (2305), Expect = 1.7e-259 Identity = 438/562 (77.94%), Postives = 489/562 (87.01%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. TAIR 10
Match: AT2G40600.1 (appr-1-p processing enzyme family protein ) HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 1.3e-12 Identity = 45/130 (34.62%), Postives = 70/130 (53.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. TAIR 10
Match: AT4G35750.1 (SEC14 cytosolic factor family protein / phosphoglyceride transfer family protein ) HSP 1 Score: 67.4 bits (163), Expect = 4.2e-11 Identity = 43/152 (28.29%), Postives = 80/152 (52.63%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000373 vs. TAIR 10
Match: AT3G10210.1 (SEC14 cytosolic factor family protein / phosphoglyceride transfer family protein ) HSP 1 Score: 55.5 bits (132), Expect = 1.6e-07 Identity = 41/157 (26.11%), Postives = 73/157 (46.50%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
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