
Sed0000238 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAACAAAACAAAACAAAGAATTTGATGAGGAATAATTTGTTGTTGAAATTTCAGGCGTCGATGGAGGTAAAATAAAAGTCGTCTCTGCTGCCCGCCACTTCCCGTCGACCGCTTTGCCAAATTTCCTCACTTCATCATCCATTTCTCCATTTCCCACTCTTCTTTGTCGATCAAATCTCCGATATCTGAATTGTATAATCCCGATTTTGAATTGGAGTTCGTCTTGTTTCCAGTAGCTCTGCTGCTTGGTTCCATCAGATCCGCTGAAGCGACTGTGTGTTTCCGGCTGGATCTGATCGGAGATGGCGTTGTCCGGCATGAGAGGCCTCTCCGTTTTCATCAGCGACGTTCGCAATTGCCAGAATAAGGAGCAGGAGAGGCTCCGAGTCGACAAGGAGCTTGGAAATGTTCGCACCAGGTTTAAGAACGAGAAGGTTAGGCTCACTTTTACTTGCATCCTATGTGATTGTTGTTACGTCCTTCTGTTCCCTCTTTTGCGAGTGCTTACAGTTTTGTGTTTACAAGAACTGTGGAAATCGCGCGATTACCTAATTACCGCCTTTGTGTTGCGTTCTAAATTGTTTCAAGAGAAAATGCAGATGCCGAATGTAGGGTGTAGTTATGAGCTGCAAGGAATACTGTATCAATGGATTATCCTTCCACTTTCTGGTCATTTAAGCATGCTCCGTAGTGTTTCAGAATTTATCTTATAGTACTTCTATAGTGAGTGAATTACGTTTTATTGCTCTACAAATGATGGAATAGTATTTTGATTGCAGCATAGCTTAAGTGTATGGCTTAATAACCAAGAGCTTTTGAATATATATATTTTTTGGATAGGAAACATATACTTGCATTCATACAAAAGGATTCAAAACATTTTACAAAAAGCTTTTCCAATGAAACAAAGAGAGTTAAGGCTATAATCCTTAAATGGGTAAGTAGTGTGAGCTCATGTAAGAGCAAGAACAGTGATGGATTCAAAGAGGTTTTCATTATCCTGAACTCCATCTGTAAAAAGCCCTGCATTCCTAGCTTTCCATAGAGACCACCAGAAAGCCGCCAAAAATAATTACCATAGCATCTTCTTTTCCTCTTTAAAGGGATGACCAGAGTATGCAAAAAGAACCACATCTCTGATATTACCGGGCATCGCCATCTGCCAATCAAAGATCTCTAAAAGATATATCCAGATATTATTGGCCTTTGGGCATGACCAGAAAAGGTGATAGTGAGACTCGAAATCATCCATACACAAAATGAAACATTGTGAGGAGATGAACAAGCCTGGTGCCCTTCTTTGAAGCTTGTCATTTGTGGTGAGGATACCATGGCTAAGCTCCCAAGAGAAAAGTTTTACTCTTTTAGGTTGAGGCCCTTTCCATATGCAGCCATTAAACTCTTTCTTATTCTGTGTAATAGTAGGGGCAAAGCTATCAATTAATGATTTAGATGAAAAATGGCTAGATGCTTCAAGATTCCAACTCCAAGAATCCTCCCTATTTGATAAAGGGTAACTGTTCAGTAAATTAGAGAGGGCAACCCACTCCTCAATCTCATCATCTTTTAGATTTCTCCTCACGTTGATGTTCCATGATTCCGAATCCTGGCTCCAGATGTCTGCGACAAAAGCATTCTTACTCAATGATAAGTTATGAAGAGGGTAGATAATTTTCAATTCATTGTTGCCACACCATCGATCATTCCAGAAGCTAGTACAAGAGCATTTCCAACCTTGACGGTAATATTATTGTAGATCAAATGCTTCCATTTATCAATGTCTCTCCAAGGGCGTCCAAGAGCTTTTGAATTCAAATTTCCATCCCAAATGTTGTTAAATTAAAAAAAAAAAGAAGCTAACATTTTATATGCATACAATACATTTTTCAGAAAGGTAAGTTTTTTTAATATTCGCGTGTGTTTGGAACAGCTAGCTTACGTGCATACCTCCATTATTTTCATGGAACAACCGACTGACCCTACTACATTTCGATTTGACGGAAACTCGTAAGAAATTAATTATTAGATCCGTGACTATCATAAATTAAACTCGTAATCTCTAAATTATCAAAGTCTTCATTTAAGCATTAGGCCAATCGAGGATGGTTTCTAGAAAGGTAAGTTTTTGATTATGTAGACTTTTGTGATCAATCTGAATTCATTAACTAACTATTTGATGTTGAGTCCTCAACCATTTACTTAAAAAGGGTCAGTGTAGTAAGGTTGAAGCAAGGACTCCGAGTCAGCAGTCTCTATGTGAGCTCCACACCACACTTAGCTAATAAAGTTTAAGGTGCCTATGCTTTGATGCACAATTTTTGTATTCAAGTAATGCCAGACTCCAAATTGGTGCGAGTGTGTAAAAAATATATTTTTTAAAGAACAATAACTTTTGTCTCCTTTCAAGTTGATGTGCGTTGCACACGATGATTAATTGGTCGATCTGTTTTTTTTTTCTTTAAATGTCCGTGAGTGTTTGGGTCAGCTTACGCCCACCTCAACTATTCTCACAAAACAACTGCTTTGTCCTACAATATTTGGTTGCCAAGGAAATATATAGAAAATTAATTCTTTTAAGTAGGCTACTATGTATTGAACCTTTATCCATAGATTCCCTTTTAGTCCCTTCTAAGTATAAAACCTTTGGTGGAGACTGCCACGTACTTTTGTATTGAACTTGCTGTGCCCAGAGGGATCAAGGACATACTATACTGATAGAATCTACCACACTTTTCTATTAAAATAAGATAAACCTCTCGAGAGAATCTCTCAAAGAGCCGCAATACAACAATGATAATTCGATAGCTAAAAGAGTAACCTAGTCCGCCTATTTATAGCCTTCCTAGGATTTAACCTAACTTCGTAAATAACTCTATTTAGGCCCATAGGCCCATTACAAACTAAATGTGCATAATAAAATATATTAAAATAGTAATTAAAGCATTTCTTCACTTCTTGCTTCTCGAATATACTTTTAATGATGCCGGATCGTATCAATACTTCCCCACAGAGCCACCTTGTCCTCAAGGTGAAAGTCCGAAATTGCAATTTCAAATCGGTGCGGACTCCCAAGTCGCATCCCTCCGTGCGTAGCCTTCCCATTGGACCAAAACTTGACGCGATCGCCGCGTGGAAATTCTCTTGGACGCCCAACACGGCCTTAGGGCGAACCACCATGCATGCAGATCATCTCCCACCAAGGACGGTGTAGACATGACAAGAACCGACGAGTCTCCCGCTTTACGCAGAATCGACACGTGAAAAACCGGTGAATCTTAATCGCCGGCGGAAGTTCCAAACGATAAGCAACAGGACCTACTCGAGCCAAAGACACGGTAGGGCCCAATAAAACCTCGGCGCCACTTCGGTGTTGAAATTTAGCCAAAGAAGATTGGCGGTATGGTCGAAGCTTGATATACACCAAATCATCAATATTAAATCGCACATCCCTACGCTTTTTTGCGTTTGCGCGATCCGCCATAGATTGTTGCGCGCAACAAACTAGCCTTTAATGTGGTCAAGATCCGATCGCGATCCTTCATTAATGAATCCACAGATGCCACCGGGCTAACTCGTGATCATAACCCAACAGGTAGGAGGGGTCCGCCATAAACGATCTCGAAGGGTGTCATACCCGTGGATGAGTGGAAAGAAGTGTTAAAGTCGACTCGCCCAGACAACCATTGGTACCACGCCTTAGGATGATGCATTACGAAACACCTCAAATAGGATTCCAGTAACGATTCACCACCTCGCCCGCCCATCACCGTGGATGGTAAGTGGTGCTCGACACGCTTTAGTACCGTAGCCTTGAACATCTCTTCCCAAAGCAAACTCGTAAAGACCTTATCGCGGTAAGATATAATACTTTTTGGAATTCCGCAACCGAACAATCTCCTTGATAAACACCTTTGACAATCGGACAAGGAAGAAAACGGGTGTCGAAGAGGTATAAAATGAGAATATTTGGACAAACGGTCAACCACCACCAAAGATAGTGTCATAACCCTCGGATCGCGAGAAACCTTCCACAAAGTCCATCGAAATATCTTCCTGCACTGCAGGGGATCCAAGCAAAGGTCAGAGCAACCCGCGCAGGAGATAAGGATAGATGTTTAGCTTGAACACGATAGAGCATTCGGCCACAAAGGAACGCACACGAGCCTTCATTCCTTGCCAATACACCTCAGCCAAGCTACCGTGATAAGTTTTAAGGACTCAGAAATGTCCCCAATAGCACCACAATGGAATTCAAGCAAAAGTAGAGGAATCGTTGGGGATGTCTGAGGCAAAACAAGCCGAATTCGATAAAGCAACACATCACCAACTATCGAGTATCCGGGGCCCCCTACCAACGGTCATCGACTTATAAATTTCCATCACCTTATCATCCTCTTTAACTGTTATGTAAATACGGCGGTGTTAATACCCGCCACCACACTCAACATGCCAAGCTCGCATTTCTCGGGCATTCGTGACAAGGCATCCGCAGCTCTATTTTCAAGGCCCTTCTTATATTCGATGTGAAACATAACCCATTAATTTCGCGATCCATCGCGATAGTCACCATCCACTACACGCTGCTCAAGAAGAAATTTCGGACTCTTTCGGTCAAGATTTAACAACAAAGTGATGCCCTAACAGATAGGCCCGCCAATACGCAGACCGCAAAAACGATTGCCATCAACTCACGCTCATACACCGGTTTCACCCGATGAGTAATTGGCAATGCCCCGCTAAAATATGCTATCGGTGACCGACTGTTGCATCGAATCGCTCCCACCCCGATGCTCAAGCATCGGTTTCACCACAAATATTTGGTCAAAATCGCAATCGCAGGACCTAACACTACTCATAGCATGTTTGATGTTGAAAGTCGTTTTCTAATGAAATTGGTCCCCATTCAAACTTCCCCTTCTTTAATAGCCGGGTCAACGGAAAAGCCATGGAACCGTAGTTAGCCACAAAACGTCGATAGTAACAAAGTTAA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MALSGMRGLSVFISDVRNCQNKEQERLRVDKELGNVRTRFKNEKGLTPYEKKKYVWKMLYIYMLGYDVDFGHMEAVSLISAPKYPEKQVGYIVTSCLLNENHDFLRLAINTVRNDIIGRNETFQCLALTMVGNIGGREFAESLAPDVQKLLISSSCRPLVRKKAALCLLRLYRKNPDVVNVDGWADRMAQLLDERDFGVLTSSMSLLVALVSNNHDSYWSCLPKCVKVLERLARNQDIPQEYTYYGIPSPWLQVKTMRALQYFPTIEDPNTRRSLFEVLQRILMGTDVVKNVNKNNASHAVLFEALALVMHLDAEKEMMSQCVALLGKFIAVREPNIRYLGLENMTRMLMVTDVQDIIKRHQAQIITSLKDPDISIRRRALDLLYGMCDVSNAKDIVEELLQYLSTAEFAMREELSLKAAILAEKFAPDLSWYVDVILQLIDKAGDFVSDDIWFRVVQFVTNNEDLQSYAAIKAREYLDKPAIHETMVKVSAYLLGEFGHLLAGRPGYSANELFKIIHEKLSTISTTTVPILLSTYAKILMHTQPPDQELQKQIWGIFNKYESCIDVEIQQRAVEYLALSKKGAALMDILAEMPKFPERQSALIKKAEETEVDTAEQSALKLRAQQQSSNALVLTDQRPVNGTPYSNQLTLVKVPTISTDSTDQELSQTNGTLNKADSSPPAPDLLGDLLGPLAIEGPPSVTVPASQNIMSEMDGFPNAVDGAIVPVGEQTNSVQPIGNTAERFLALCIKDSGVLYEDPYIQIGIKGEWRAHLGRLVLFLGNKNTSPLTSVKAIILPPSNLKMEFSLVPDTIPPRAQVQCPLEVINLHPSRDVAVLDFSYKFGNDLVNAKLRLPAVFNKFLQPISISAEEFFPQWRSLSGPPLKLQEVVRGVKPLLLLEMTNLLNSLRLMVCPGLDPNPNNLVASTTFYSESTQAMLCLVRIETDPSDRTQLRMTIATGDPSITYELKEFIKEQLISSIPVTSAAAAPPPVSHPTVATPSASTDPGAMLAGLL Homology
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BLAST of Sed0000238 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0000238 vs. NCBI nr
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BLAST of Sed0000238 vs. NCBI nr
Match: KAG7035965.1 (AP-2 complex subunit alpha-2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1849.7 bits (4790), Expect = 0.0e+00 Identity = 951/1029 (92.42%), Postives = 976/1029 (94.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. NCBI nr
Match: XP_022996297.1 (AP-2 complex subunit alpha-1-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1845.1 bits (4778), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1019 (92.84%), Postives = 972/1019 (95.39%), Query Frame = 0
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Match: Q8LPL6 (AP-2 complex subunit alpha-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALPHA-ADR PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1609.0 bits (4165), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/1021 (81.00%), Postives = 909/1021 (89.03%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8LPK4 (AP-2 complex subunit alpha-2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ALPHAC-AD PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1604.0 bits (4152), Expect = 0.0e+00 Identity = 823/1022 (80.53%), Postives = 908/1022 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q86KI1 (AP-2 complex subunit alpha-2 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=ap2a1-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 678.7 bits (1750), Expect = 1.0e-193 Identity = 395/988 (39.98%), Postives = 585/988 (59.21%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P91926 (AP-2 complex subunit alpha OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=AP-2alpha PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 651.4 bits (1679), Expect = 1.7e-185 Identity = 383/986 (38.84%), Postives = 581/986 (58.92%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P17426 (AP-2 complex subunit alpha-1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ap2a1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 647.5 bits (1669), Expect = 2.5e-184 Identity = 386/998 (38.68%), Postives = 583/998 (58.42%), Query Frame = 0
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Match: A0A6J1H1T0 (AP-2 complex subunit alpha OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111459650 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1852.0 bits (4796), Expect = 0.0e+00 Identity = 948/1019 (93.03%), Postives = 974/1019 (95.58%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K1I3 (AP-2 complex subunit alpha OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111491565 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1845.1 bits (4778), Expect = 0.0e+00 Identity = 946/1019 (92.84%), Postives = 972/1019 (95.39%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CEZ5 (AP-2 complex subunit alpha OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111011084 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1837.0 bits (4757), Expect = 0.0e+00 Identity = 940/1019 (92.25%), Postives = 971/1019 (95.29%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXU6 (AP-2 complex subunit alpha OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111448224 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1834.7 bits (4751), Expect = 0.0e+00 Identity = 940/1019 (92.25%), Postives = 972/1019 (95.39%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JAJ1 (AP-2 complex subunit alpha OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111484056 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1831.6 bits (4743), Expect = 0.0e+00 Identity = 939/1019 (92.15%), Postives = 972/1019 (95.39%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. TAIR 10
Match: AT5G22770.1 (alpha-adaptin ) HSP 1 Score: 1609.0 bits (4165), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/1021 (81.00%), Postives = 909/1021 (89.03%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. TAIR 10
Match: AT5G22770.3 (alpha-adaptin ) HSP 1 Score: 1609.0 bits (4165), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/1021 (81.00%), Postives = 909/1021 (89.03%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. TAIR 10
Match: AT5G22770.2 (alpha-adaptin ) HSP 1 Score: 1609.0 bits (4165), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/1021 (81.00%), Postives = 909/1021 (89.03%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. TAIR 10
Match: AT5G22780.1 (Adaptor protein complex AP-2, alpha subunit ) HSP 1 Score: 1604.0 bits (4152), Expect = 0.0e+00 Identity = 823/1022 (80.53%), Postives = 908/1022 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0000238 vs. TAIR 10
Match: AT1G23900.1 (gamma-adaptin 1 ) HSP 1 Score: 280.4 bits (716), Expect = 5.7e-75 Identity = 206/760 (27.11%), Postives = 371/760 (48.82%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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