Pay0022540 (gene) Melon (Payzawat) v1

Overview
NamePay0022540
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr11: 16268976 .. 16270484 (-)
RNA-Seq ExpressionPay0022540
SyntenyPay0022540
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTTTAAATTAGATGATAATGAAACTTACATAGGCATGATACTCATTTAGATTGACAGAAAGTTTCAAAAAAAAAAAAAAAGTCATCTAAGTGACGAAAAATGAAATTTTTTACTAATTGAAAAATGTAACGTATAACTATTTGCGAGCTAAGAACCATAAAATCCATAAATGAACATTCCGTCTCAAATTTTTATAATAATAATAATCATAATAAGAATAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAAGAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAATAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACACGACAACAACAACAACAACGACAACAACACCAACAACGACAACGACAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAAAACCAACAACAAAACAACAACAAACAAACGACAAACGACAACAACAACACCAACGACCAACAAATAAAAACACAAACAACAAACAACAACAACAACAACAAAACCAACAACAACAAACAACAACAACAACAAAACCAACAACGACAAAAACAACAACGACAACAACAACAACAAAGTAGTAGTAGTAATAATAACAACAACAAGAACAAAACAACGAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACGAACAGTAACAAACAACAAACAACAAACAACAACAACAACAACAACCAAGAACAACAACAAGAACAACGAACAAGAAAACAACAAACAACAATAACAAAACAACAACAACAACAGACAAACAAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACACAACAACGACGACGACGACGACGACAACAAAAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACACCAACAACGACAACGACAACAACAACGACAATAACAACAACGACAACAACAACAAAAACAACAACCAAACAACAAAACCAACAACAACAAACACAACAACAACAAAACGCAACAACAAAAAACGGACAACAACAACAACGACACAACAACCGAACAACAACAACAAAACCAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAACGACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACGACGACATATAA

mRNA sequence

ATGTTTAAATTAGATGATAATGAAACTTACATAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACACGACAACAACAACAACAACGACAACAACACCAACAACGACAACGACAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAAAACCAACAACAAAACAACAACAAACAAACGACAAACGACAACAACAACACCAACGACCAACAAATAAAAACACAAACAACAAACAACAACAACAACAACAAAACCAACAACAACAAACAACAACAACAACAAAACCAACAACGACAAAAACAACAACGACAACAACAACAACAAATAACAAACAACAAACAACAAACAACAACAACAACAACAACCAAGAACAACAACAAGAACAACGAACAAGAAAACAACAAACAACAATAACAAAACAACAACAACAACAGACAAACAAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACACAACAACGACGACGACGACGACGACAACAAAAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACACCAACAACGACAACGACAACAACAACGACAATAACAACAACGACAACAACAACAAAAACAACAACCAAACAACAAAACCAACAACAACAAACACAACAACAACAAAACGCAACAACAAAAAACGGACAACAACAACAACGACACAACAACCGAACAACAACAACAAAACCAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAACGACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACGACGACATATAA

Coding sequence (CDS)

ATGTTTAAATTAGATGATAATGAAACTTACATAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACACGACAACAACAACAACAACGACAACAACACCAACAACGACAACGACAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACAACAACAACAAAAAACCAACAACAAAACAACAACAAACAAACGACAAACGACAACAACAACACCAACGACCAACAAATAAAAACACAAACAACAAACAACAACAACAACAACAAAACCAACAACAACAAACAACAACAACAACAAAACCAACAACGACAAAAACAACAACGACAACAACAACAACAAATAACAAACAACAAACAACAAACAACAACAACAACAACAACCAAGAACAACAACAAGAACAACGAACAAGAAAACAACAAACAACAATAACAAAACAACAACAACAACAGACAAACAAACAACAACAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAACACAACAACGACGACGACGACGACGACAACAAAAACAACAACGACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACACCAACAACGACAACGACAACAACAACGACAATAACAACAACGACAACAACAACAAAAACAACAACCAAACAACAAAACCAACAACAACAAACACAACAACAACAAAACGCAACAACAAAAAACGGACAACAACAACAACGACACAACAACCGAACAACAACAACAAAACCAACAACAACAACAACAAGAACAACAACAACGACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACAACGACAACAACAACAACGACGACATATAA

Protein sequence

MFKLDDNETYIEQQQQEQQQQEQQQQQQQQQQQQEQQQEQQQEQQQEQQEQQQEQQQEQQQEQQQQEQQQQEQQQQEQQQQQQQQQQQQQQQQQQQRQQQQQQRQQQQQQQQHDNNNNNDNNTNNDNDNNNDNNNNDNNNNDNNNNNNNNKKPTTKQQQTNDKRQQQHQRPTNKNTNNKQQQQQQNQQQQTTTTTKPTTTKTTTTTTTTNNKQQTTNNNNNNNQEQQQEQRTRKQQTTITKQQQQQTNKQQQEQQQQQQQQHNNDDDDDDNKNNNDNNNNDNNNNNDNNTNNDNDNNNDNNNNDNNNKNNNQTTKPTTTNTTTTKRNNKKRTTTTTTQQPNNNNKTNNNNNKNNNNDNNDNNNNNDNNNNNDNNNNDDI
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 4..112
NoneNo IPR availableCOILSCoilCoilcoord: 234..261
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 101..379
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 49..72
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 276..379
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 101..261

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Pay0022540.1Pay0022540.1mRNA