Pay0022117 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAAACATCCAGCGGCAGCCGTCTCCGACCGTCCTTCTTTTGGGTTCCACGCGCACGGCCAGCCATCGGCTGTCTCTGCCTCGGTTGTGCAGCGTCGGCCGTCGTGCATCTAGCATCGACGTAAGTAACCGAGCAAACCTCCTCTGCCGCCACCGCCGTGTGTTTGCTGTCGTGTGGACATCAAATCGGCTCCAAGTCGGCTGAGTTGAGTCGAGCTAGCCGAGCCACCATCCTTACCTGAGCCGAACCGAGCCGTGAGCTAGCCAAGGCGAGCCTCGAGCCATGAGCTAGCCAAGCCGAGCCACGAGCCAGGAGTTCAGCCAAGCCGAGCCGCGAGCCGAGAGCCGAGCCAAGCCCAACCGCGAGCTGAGAACTGAGCCAAGCTGAGCCGCGAGGCGAGAATTGAGCCAAGCTGGGCTGCGAGTCGAGAGCCGAGCCGAATCGAGCCGCAAGAGCCACCTCCTAAGCCAAGTCGATTTTCCCCAAGCCAATCTCTTGACCCACCGGGCCATTTAAGTCGTGTCCATTCGTGCCGAGTCCCGGTGAGTCTTGGTAAGGACAATGTGAGGAATTTTCTAATGTTTTCAATATTCAGTGAGAGCCTAAATGTAAAATTAAAATGTTGAACTTAATGGTTGGGTTAATTGTTGATCTCCTGAAGGTGCTAGCGAGGTGACGCTCGAGTTCAAGAGTGTTGCGGCAAGGGTAGCTGGATCCAACTCTCCTTTATTGGGTAAGTCGGTGGAAGTTACTTGGAACGTTTGTAATGTGCATTTCGGTGATGTCGTTGTTAAACCTGTATGTTCGTGTTTAGGTGGATTCGTTTGGACGCAGACTTGAACAAGATTTTAGGTACATTCCAGGTAAGGGATTTCTTACTATTGGACCTCGGATCGAGGCTGGAAACATAGTAGTCCATATAGGATTATACGTTAGTAACTGTATTGAGTGGATTGACGTATGTTTAAGTAATACATGTCACTTATATGATCTTGACTTGTTAAAGGTAACGTGATTGTTAGTAGTAGCTTATGTGCTATCATTTGTAATGAGTTGTTTACAGATAGACACGGATGCTTGGATGTTCTGTGTATTGTAGTTATATTGGTGGGCTACGTTGTGAGCTGGAATAGTATGTCGATGGACTATAAAGTCTTAAGGTTATATAAGTAGAAGTCTGTTGTCGAGATATTGGTTATGGGGTTATGTTGTGGAAGGACTAAAAGTACGAGAACCTCTCGTGTACATTGAGTATACGCCGGTTAACTGTGCTATGAATTGATTATGATTGTCAGATATAATGTGGGCATTACGCATAGCGTAGATTACCTGGGGGATACACTAGAGTTTGAACTGAGTCAGAATATCGTCAGATAACTTTACAAGGCGAAGATTTGACTTATTGACTAGATTTTAAATTAATGTCACAATGATGTGTGAATTGGATATGCATATAGCAACTGAGGAGATAGTTGTTTAAAACTATATTGTCTGACTGGCTAAGCCTATGACTGAACTGTTAGTTTGAACGTTATCTGAAGGTGACTGTTGTAGATGGTTTTGTATAGGCTGTGGGGTAATGGTTAGCTTCATCTATGGGGTAGTGTACCTTACTGATATGTGTGTCCTTCGGGATCACTTGACTGATATGTGTATCCTTCGGGATCATTAGACTGATATGTGTGTCCTTTGGGATCACTAGACTGATATGTGCTTCCTTCGGATCACGAGACTGATGTGTGCGTTCTACGAAACCACTAGATTGTTTATGTAGGGTACCCCTAAATAGGAAGTTAACTGTTATTCCCTAACGTGCCCAGTAGTGGGTCCTTACTGGGTATATCTTATACTCACCCTTTTTCCTCTTTAATTTTTCAGGTAAGGGTACAGCGAGGAGCAGACTGACGAGGGCCAAGAAGGATGCGTGAAGGTCATATGGACGCGTCTGGTTTTCTTTATGCTTCCGCTGATGTATTTTGTTACTCGTTATTTTCATTGTCAGATGGAGTCATGGTTAGAATATTTGGTTTGTGATTTTTTGTTTGATGATTTGAGCACTGTATTTTGGAATTCTCGTGAATGTGATTTAAAATAGGGCCCGAAACTTCTTTTGTAATATTTTAAAATGTTTTTAATGAATCGTAACCGGTCCTTTATGAGTTTGTGTGTTTTATGGTCGAGTCTTAGTACTGAGTATTGACCTCAGCTTAGTCCGAAAAGTTGGGTCGTTACAGTTGGTATCAGAGCCTAAGTTTTTGGTTCTGTAGACTGACTTATGATGTGAGTCTGTTTTTTTGTGTTCTTATGGCTAAAAACGATCCTTGCCACTCATCAGGTACGCCCTCATGAAATTTATATGTATAACTCTATACGCATTACCTTACCTAAGTTAAACTGCGAAGTTAGGTATCACATGAGACTAAAGGAATCATTGGTGGTTGTTAGGGAAATGCCGCCAAGGAGAGGTGCACGTAGGGGTGGTCGAGGAGGCCGAGGATGGGGAGCAGGACGTGTTCAACCTGAGGTGTAGCCTGTAGCCCAAGCAACCGACCGGCTACGCCATTTACTCATGCGGACCTCGCTGCTATGGAGCAGAGGTTTAGGGATTTGATTATGCAGATGCCAGAGCAGCAGTAGCCTGCCCCACCAGCTCCTGCTCTAGTTCCAGTTGTGCCTCAAGTCGTGTCGGATCAGTTGTCGGTAGAGGCCAAGCACTTGAGGGATTTCAGGAAGTATAACCCCACGACATTCGATGGGTCTTTGGAGGACCCCAACAGAGCTCAGATGTGGTTATCTTCTTTGGAGACCATATTTCGATATATGAAGTGCCCTAAGGATTAGAAAGTTCAGTGCGTCGTTTTCATGTTGACAGACAGAGGTACTGCCTTGTGGGAGACAGCAGAGAGGATGCTAGGGGGTGACATGGGTCAAATCACTCGGGAACAGTTCAAGGAGAGTTTCTATGCGAAATTCTTTTCTGCCAGTTTGAGAGATGCCAAGCGGCAGGAGTTCCTGAATTTGGAGCAGGGCGACAGGACAGTAGAGCAGTATGATGCGGAGTTTGACATGTTATTCCGATTCGCTCTCGAGATGATAGCGACCGAGGCGGCCAGAGCTGATAAGTTTGTTAGGGGCCTCAGGCTTGACATCCAGGGTTTGGTTCGAGCCTTCCGACCCGCCACTCATGTCGATGCACTACGCCTGGCAGCGGATCTCAGTTTACAGAAGAGGGCTAACTCGTCCAAGGTTGCAGGTAGAGATTCGACCTCAGGACAGAAAAGGAAGGCTGAGCAGCAGTCTATTTCGGTGCCACAGCAGAACTTCAGATCAGGTGGTGAGTTTCGTCGTTTCCAACAGAAACCTTTTGAGGCAGGGGAAGATGCCAGAGGGAAGCCGTTGTGTACCACTTGCGGGAAGCACCATCTGGACCGTTGTTTATTTGGGACCAGGATTTTCTTCAAGTGTAGGCAAGAGGGGCATACAGCTGACAGATGCCCGGTGAGACTTACCGGGAATGCACAGAATCAGGGAGCAGGTGCTCCATATCAGGGTAAAGTCTTTGCTACCAATTAGACTGAGGCTGAGAGAGCAGGCACGGTGGTGACAGGTACGCTTCCAGTGTTGGGGCATTATGCCCTAGTTTTATTTGATTCGGGTTCGTCACATTCCTTTATCTCTTCTGCATTTGTGTTGCATGGTCGTTTAGAGGTAGAGCCCCTACACCATGTGTTATCAGTATCTACTCCTTCTGGGGAGTGTATGTTGTTGAAAGAAAAGGTGAAAGGATGTCATATTGAGATAACAAGTCATGTGATTGAAGTAACGTTGTTAGTCCTGGACATGCTCGACTTCGATGTAATTCTGGGTATGGATTGGCTAGCTGCTAACCATGCTAGCATAGATTGTTCCCCTAAGGAGGTAGCGTTTAACCCTCCCTCGATGGCCAGTTTTAAATTTAAGGGAGAAGGATCAAGGTCGTTACCTAAGGTAATCTCAGCCATAAGGGCCAGCAAACTGCTTAGTCAGGGTACTTGGTGTATCTTAGCGAGCGTGGTGGATACTAGAGAGATTGATGTATCCCTGTCATCAGAACCAGTAGTAAGGGACTATCCGGATGTCTTTCCTGAAGAACTTCTAGGGTTACTTCCTCACAGAGAGATTCAGTTTGCCATAGAGCTGGAGCCGGGCACGGTTCCTATATCCAAAGCCCCATACAGGATGGCCCCAGCAGAATTGAAAGAGCTGAAAGTGCAGCTACAGGAGTTGCTTGATAAAGGCTTCATTCGACCGAGTGTGTCACCTTGGGGTGCGCCAGTTTTATTTGTTAAGAAGAAGGATGAATCGATGCGCCTATGCATTGACTATAGGGAGTTGAATAAGGTAACCATTAAGACCAGATATCCCTTGCCCATAATCGACGATCTGTTTGACCAGTTACAGGGAGCTACAGTGTTTTCTAAGATTAATCTTCGATCAGGATATCATCAGCTGAGGATTAAGGATGGTGATGTACAGAAGACAGCCTTTCGTTCCAGATACGGACACTATGAGTTTATTGTAATGTCTTTTGGTTTGACGAATGCTCCGGCAGTGTTTATGGACTTGATGAACAGAGTGTTTAGGGAGTTCCTAGACACTTTTGTGATTGTGTTTATTGATGATATTTTGATATATTCCAAGACAGAGGCCGAGCATGAGGAGCATTTACGTATGGTTCTACAAACCCTTCGGGATAATAAATTGTATGCAAAGTTCTCGAAGTGTGAGTTTTGGTTGAGGCAAGTATCCTTTCTAGGCCATGTGGTTTCTAAGGCTGGAGTTTCTGTGGATCCAGCTAAGATAGAGGTCGTTACCAGTTGGCCCCAACTTTCCAGAGTCAGTGAGGTTCGTAGCTTTCTGGGTTTAGCAGGTTATTATCGATGGTTTGTGGAGAACTTTTCCCGTATAGCTACTCCTCTTACTCAGTTGACCAGGAATGGAGCTCCTTTTGT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Homology
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT41 (Transposon Tf2-12 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 1.1e-132 Identity = 289/894 (32.33%), Postives = 466/894 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT34 (Transposon Tf2-1 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 1.1e-132 Identity = 289/894 (32.33%), Postives = 466/894 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT35 (Transposon Tf2-2 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 1.1e-132 Identity = 289/894 (32.33%), Postives = 466/894 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT36 (Transposon Tf2-3 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 1.1e-132 Identity = 289/894 (32.33%), Postives = 466/894 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT37 (Transposon Tf2-4 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 476.5 bits (1225), Expect = 1.1e-132 Identity = 289/894 (32.33%), Postives = 466/894 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VJE2 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold21G005560 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2635.9 bits (6831), Expect = 0.0e+00 Identity = 1354/1504 (90.03%), Postives = 1369/1504 (91.02%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U330 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold4358G00040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2586.6 bits (6703), Expect = 0.0e+00 Identity = 1340/1528 (87.70%), Postives = 1355/1528 (88.68%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UAA8 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold55G00800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2566.2 bits (6650), Expect = 0.0e+00 Identity = 1333/1528 (87.24%), Postives = 1346/1528 (88.09%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V8L8 (Pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold679G00080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2527.7 bits (6550), Expect = 0.0e+00 Identity = 1319/1516 (87.01%), Postives = 1334/1516 (87.99%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TB42 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold118G00260 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2510.7 bits (6506), Expect = 0.0e+00 Identity = 1304/1477 (88.29%), Postives = 1330/1477 (90.05%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. NCBI nr
Match: KAA0066456.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2635.9 bits (6831), Expect = 0.0e+00 Identity = 1354/1504 (90.03%), Postives = 1369/1504 (91.02%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. NCBI nr
Match: KAA0048687.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2586.6 bits (6703), Expect = 0.0e+00 Identity = 1340/1528 (87.70%), Postives = 1355/1528 (88.68%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. NCBI nr
Match: KAA0051357.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2566.2 bits (6650), Expect = 0.0e+00 Identity = 1333/1528 (87.24%), Postives = 1346/1528 (88.09%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. NCBI nr
Match: KAA0062245.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2527.7 bits (6550), Expect = 0.0e+00 Identity = 1319/1516 (87.01%), Postives = 1334/1516 (87.99%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. NCBI nr
Match: KAA0040188.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2510.7 bits (6506), Expect = 0.0e+00 Identity = 1304/1477 (88.29%), Postives = 1330/1477 (90.05%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022117 vs. TAIR 10
Match: ATMG00860.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein ) HSP 1 Score: 120.6 bits (301), Expect = 1.1e-26 Identity = 59/131 (45.04%), Postives = 83/131 (63.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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