Pay0017690 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSexonpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTCACTCCTCAATCAACTCTTTAACAGAGGTGTCTTTGCCGGAAAATGGTCAGCTGCCGATTCTTCTAACTCTAAACCTTCTCACTATTTCATTGACTATTGTTCAATTTTGGTTTCGATCCTCAGCATTATTTTGAGTTCATTGGATTTGTTGTTCGTAGGTGATCTTTCCGTTTCGTTAACTTACAAAACCCAGTACGCACAAACCGAATTTGGTTTATGATCAGCACTCTCTTTCGTTCGCTCAAACTTTGACAAATTTATATAATAGAACTATTTTTCTAGTTTCTGTACAACTTCGTCATTTGAATATTGATTTATGGGCTTTGTTCTTTTCCATCACTAATTAGACTGGGCTATTCTGATTTAACAAATTTTTTTGTCGAAATCTCTAATAAAAACCTGTTTACGTCTTTTGCGTAATATTTATGTCCTGGTAAGCTAATAGCATCCTTGCATTTTTCTGGGAATGATAAGTGTTATGTAAAACTGGTGTTTTTGTAGCAAAACTTGCTTGAGCTTAGCAATCTCGCGGATCAAGTTGCTGCAGAATAAGAGGGATCTGCAACTGAAGCTTATGCGAAAGGAGATTGCACAATTCTTGCAGACAGGGCAGGAACAAATAGCTCGAATTCGGGTACCCTTTAGAATTTTGGTGTCAGTAATATCTGTACAAATGTTTGGTTTTACTATCTATTAAAATAAAATGTGTCGTTGTCTTCTCTCAAAATTCATTTTGTTTTGGTTTTTGACTTCTTAATGTGGTTTGTGAGCTCCTTTTCTTGTTTATTCAAATTTCTATTACTTTCATTCGAATAGGGAAGCGACAAATGTGGCCTCTCTTCTTTCTTTGCTCAAGAGGCACTCTTTATGTGTGGGAGAAGGGATGTGAGGGACTCTCCTTATGTTGTAGGAGAAGGGATGTGAGGGACTCTCCTTATGTGTGGGAAAAGGAATGTGAGGGACTCTCCTTGTATAAGTCTTTGTTTCGTAGTTTGGTCGATCCCTCTCCTTTGTGAGTGTTGATCTTTTTGGTGCTTTGGAAGATTAAGATTCCTAGGAAAGTGAGGTTCTTTACCGGGCAAGTTTTACACAGCTAACCCAATGGATTGGCTTGTGAAGACTTTGTCTTCACTTGTTGGACCATTCTACTGTATCCTCTTTTGGAAGGCAGAGATATTCTCTAGCTGTGAGTGCGAGTTTTGTTTGGGCCTTTTGCTTCTAGACGTTTGTTTCTAGCAACAAGGAGTTCCTTCCTTAATCCACCTTATCGGGAGAAGGGTCATTTTTTATGGTTTTGCTAGAGTGTGTGCACCCTTATGTGTTTTGTGGGGAGAGCAGAATGGTAGGGTGTTTAAAGAGGTGGAAAGGGACCCCAGTGAGGTTTTGGTCCCTTGTTGGCTTTCAAGTTTCTATGTGGCTGATTTCCATAACCTTTTGCAGTAATTTTATAGGCCTTATTTTGCATAATTCAATTATTTTTTTCTTTGTCAAGGGAGTTCCTTTAATTAGGTTTGGTTTTTAATTTGTCCTTGTATTCTTTTTTTTTTCTCAATGAAAGTTGATTAAAAAAAATACATAACATGTGTTGTTATCTATTTGGGCAGGTGGAGCATGTAATACGGGAACAAAACATATGGGATGCATATGAAATTTTAGAGCTGTTTTGTGAGTTTGTTCTTGCACGTGTCCCAATCATCGAAAGCCAGAGGTAATCTATAGCTACCATATTTGTTCTCGGTTGTGTTCTGAACAGTTGGAGTTTCTATTGACATTCAAATCAAACACACAACACCAACACCACAATTCACATTCAAATCCATGTCGATTATAAGATTTGGTTCCTATACCTTACCTGTTGGGATTACTGAATTTTAGCCAACCAAAGTAGCCAACAAACTGTAAATCTTTTCAGTGTTGGTTCCACTGAACTGGTAACTCAAGATTTTTAGGATTTTAATTTTCAACCCTTGGTGCAATGCTCGTCTGATGGATTACTTATGCTGATGGATTACTTATGTTTGGAAATTGTGATTGGCTCATATGCATCTCAATTTTCTGTTTTTCTATCCCATTAGAAGTTACGTAACCATGAAACTAACTTTGAACTCATATGTTAAGGCCATTTTGAGCTAGGCTTAGTATATAGCACAACAATTAGAATTACCTTAAAGTCGATAGTTTGATATCCCCCCTGCCAAAAGTTCGAAAGAAATGCAAAAGGATCCTATGTTATCGGGAACACAAAAGATGTTTCTAATAAGTATCAAAAAAATCTGATATAGTAGAAATATGGTATTATGGTCAAATCCTTATCTATTTGGATTAGGATCAGTTTATTTTATTTATTAAGATTAGAATTAGTTTCTTTTCTTAACTAGGATTAGGATTAGTTTCTTTGGTTTATTAGGATTAGGATTAGTTTCTTTTATTAATTAGAATTGGGATTAGTTTGCTACTTCTCTTCTTGTAGTCACAACTTTTAAACATTAATAAAATTCTTTCATTTGGTATACATCAATTTGTGTATTAGAGTAGCCGTCTAGGCCAACATTGACTGCCACTGGTGGAAAACTGAGAAACTCTTCGTGATATGGAAAAGGTAGCAGCATAATTCTGGGCTTGATTGTGGGCTGGAGTTGTTTGAAGGTCATTGTTACTTTCAAAGAAGATATAGGCGTAGGGGCCCAAAAGAATGACTTGAGTTTGGAGCAACCATGTAATCAAGGGGTTATGGGCCTAGCCCATTAGGGAAGAGATTGGTCAATTTGAACAACAATGCCAGTGAGGTGGAGATAGCCTCGTGGAAATATTAATTAAAGCTCAAATGTTAATAAAGCTGAAGAGGATGGGGCTGGTGGTCTGTTTAGTTTTTATACATTAGAAAAAAGAAGTAGCTCAATTTTGTGATTGTGTGTTGGAAGCACACATTGAGGACAAGGTGTGTTTGAAGGGTGGAGTGTTGTAAGACCTCTAGTTAGGAAATAATAGGATTATTAGTATGGTTATTTGAAGTGGCATATTAGTAATTTGATAGTAAGTTGGTTAAGGCTTTTTGGTTATAAATAGTAGGAGAGGGGTTGGGGTAAGGTGTGAAGAATTTTGTAGCAAATTTCCTTGGGTGGGAATTTGGGAGAGTCTAGCCCTCTCGAGAGGCTAGGGGTTACTTGAGCTTATGATATTATAGCTTATATTTCAATAGATTTTCCATATTTCCTCATTCTTGAGTTGTGTGTTCTTGAATCACTAGGTTGGGATCCTAACAGATTCCTGTTTATTACTTCTCCTTATTCAAAGCCCCTAACTCTATTTGCAAAAGAATCGAGAAGCTTATGAGAGATTTTCTTTGGGAAGTTATGGATGAGGGGAGGGGATCTCATTTGGTTAGCTGGCAGGTTGTTGGGCGCCCTATAAATCAGGGAAGGTTGGCACAGGATACCTCAAGGCTGAGTAACACAGTCTTGTTGGCTAAGTGGCTTTGGCGTTTAGCCCATGAGCTTGAATCTTTGTGGCAAAGGATCATTATGAGCAACAAGGCCTGTGAGAAATAGAATAGTTTGGTGAACGATAGAAGAGTAATACAAAGGAAGAAGAGGATGGTTAGAAGAAGAAGAAAAGTCGGGAGATACTTTAGAAAATACAGATCCAAAGAACAGAAAAGGCCGTAGAAGAAGAGTCTCATTTGAGACATCTGTGTTGCTGCATGAAATTGTACCACCGTAACTCTCATTTTTTTCTAAAATAGTTAAATTTTATATTAAAAAATAATTTTATGACATTCATATGCTAAGATTTGAGTATTTATTATTATTTTAAATATACTTCTCTGCATCCTTCGTTCAGCTATTGGTTGAAAGGCAATTGCAAAATAGCTTGATGTCACGAGTCCTGCCTTAAGGGATAATTATAGTCATTGGGAGCTTTGAGCCTTACGTCCATCCTTGATGGACCACTCACTCCTATGACTATGGTAATCCCTATGCTCAGCCATGGTATTACTATCACACGCGAGCCCCGGCTCACTTATTCTCTTCTTCCCCAATGGACAAGTTGTATTCTGTGCTATGGAAGTTTAGCAGCCCAAGGAGGGTTAACATTCTTATTTGGATAATGTTAAATGGTCATCTTAATGCATCCTCTGTCATGCAGCATAAACTTCCTACCAGTTGTCTTTCTTCTTCAATTTGCCCTTTATGTTATCGACATGGAGAAGATCCATTACATATCTTCTTCATGTGTTCGTACGCAAATCAGTGTTGGGAGAAGCTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAAACTTATTTTGGGTGTTTGGTGCTAACTTGCAAGGAAATATCCAGCAACTTTTAGCTAGTGTGCAATTAAAAAAAATCCCTTGACCACTTTTGGTACCTGTAGTAAAGTTGCTTTTGGCGGCATTATGGTTTGAGAGGAATCAAATGGTATTCCATGATAAATCCTTTGTTTGGTTGGATCGTTTTGAAATTGCCCGCAAGAATGCCTCCTCGTAGTGTTCTTTCTTCAAGCCTTTTGAGAGCTAAAACATTCAAGATATCTACTCAAATTGGAGATTTTTTATTTTCTCTACTCAATGTACTTTGTTTTGAGTTTAATTTCTTTTTGCACTTTTTGATTTAGGTCTTCTGTATGTTTCAATGTTGAAACCTTTGTAAGGCTAGTGATTTATCGTTTTTTTGTCCTTTCTGTAATGGCTGAATATATAAGTCGTGGGTCATGATTTTTGATGTTTGTTTGAAGGATATGACGAGGGCGCTAAGGGGTGGTCAACGAAGTTGAGATGTTCGGGTGTGCCTGTTGATTCTGTTTATGCTCTTTGTATAACCCTCATGTACTTAGAGCATTACTCGCTTTTAATTTATATCTATTTGAATAAAGAGACTCGTTTCCTTCTCAAAAAACTGATGCGGTTGGAAGACGAAGATCTCACTTAAGGCCACCACCTGAGGGGAGGAGCAGAGACAATGGAGGAGATCAAGTT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ATGTCACTCCTCAATCAACTCTTTAACAGAGGTGTCTTTGCCGGAAAATGCAAAACTTGCTTGAGCTTAGCAATCTCGCGGATCAAGTTGCTGCAGAATAAGAGGGATCTGCAACTGAAGCTTATGCGAAAGGAGATTGCACAATTCTTGCAGACAGGGCAGGAACAAATAGCTCGAATTCGGGTACCCTTTAGAATTTTGGTAGAATGTCCCGTTGAACTGCGAGAGGCTATTGCAAGCATAATATTTGCTGCTCCTAGATGTTCCGACCTTCCAGATTTGCTTCAGCTGAAGAATTTGTTTGCAGTGAAATATGGGAAAGAATTTGTCTCTGCTATTTCAGAGCTTCGTCCTGATTCTGGAGTTAATCGATCAATTATTGAAAAGCTTTCAGTCAGTGCTCCTCCTGGGGAACTAAAGCTCAAGGTCATGAAGGAGATTGCTAAACAACACGGACTCAACTGGGATTCTTCGAGCACAGTATCTGAATTTAGTAAAACCCACGAAGATCTGCTGGGCGGACCCAAGGGAGTACAAGGAGCAGCAGTCTCTCAAACTCCTCAACACAGCTTCTTGAATCCTTCCATTTCTTATGGGTCGGCACTTCTTGCTGCATCTCCCATGGGAAAGAAAGAACCCGAACACCACCATGCAGTCGGCCCAATTAACTATAATACGAATGAAATCAAACCAGAACCTAAAAGTTTTGATGTCAAACCAGAAGTTGCTGCTAAATTAGATACAAGACCACCACCATCTGACGTATTAGAGAAAGCCAAAGCTGCCATTGCTTCAGCTGAGCGTGCCACTGCAGCAGCCCGAGTAGCTGCAGAGCTAGCAAATGTCAACCTTGGAACAATGAAGTTCGAAGGAGGACAAACTTCGGAGTGCTGA MSLLNQLFNRGVFAGKCKTCLSLAISRIKLLQNKRDLQLKLMRKEIAQFLQTGQEQIARIRVPFRILVECPVELREAIASIIFAAPRCSDLPDLLQLKNLFAVKYGKEFVSAISELRPDSGVNRSIIEKLSVSAPPGELKLKVMKEIAKQHGLNWDSSSTVSEFSKTHEDLLGGPKGVQGAAVSQTPQHSFLNPSISYGSALLAASPMGKKEPEHHHAVGPINYNTNEIKPEPKSFDVKPEVAAKLDTRPPPSDVLEKAKAAIASAERATAAARVAAELANVNLGTMKFEGGQTSEC Homology
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54I39 (IST1-like protein OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0289029 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 68.2 bits (165), Expect = 1.8e-10 Identity = 49/171 (28.65%), Postives = 88/171 (51.46%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q3ZBV1 (IST1 homolog OS=Bos taurus OX=9913 GN=IST1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 67.8 bits (164), Expect = 2.4e-10 Identity = 54/184 (29.35%), Postives = 89/184 (48.37%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P53990 (IST1 homolog OS=Homo sapiens OX=9606 GN=IST1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 6.9e-10 Identity = 54/184 (29.35%), Postives = 88/184 (47.83%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CX00 (IST1 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ist1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 6.9e-10 Identity = 54/184 (29.35%), Postives = 88/184 (47.83%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q568Z6 (IST1 homolog OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Ist1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 66.2 bits (160), Expect = 6.9e-10 Identity = 54/184 (29.35%), Postives = 88/184 (47.83%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CPN2 (IST1 homolog OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103503383 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 541.6 bits (1394), Expect = 2.1e-150 Identity = 293/325 (90.15%), Postives = 294/325 (90.46%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KMU2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G367190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 1.0e-141 Identity = 283/325 (87.08%), Postives = 289/325 (88.92%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BWK9 (IST1-like protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2119G00620 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 447.2 bits (1149), Expect = 5.3e-122 Identity = 229/234 (97.86%), Postives = 233/234 (99.57%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E6L9 (IST1 homolog isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111429884 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 3.2e-119 Identity = 249/327 (76.15%), Postives = 265/327 (81.04%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I9L3 (IST1 homolog isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470489 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 4.7e-118 Identity = 248/327 (75.84%), Postives = 264/327 (80.73%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. NCBI nr
Match: XP_008465781.1 (PREDICTED: IST1 homolog [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 541.6 bits (1394), Expect = 4.3e-150 Identity = 293/325 (90.15%), Postives = 294/325 (90.46%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. NCBI nr
Match: XP_004140335.1 (IST1 homolog isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN50955.1 hypothetical protein Csa_009341 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 512.7 bits (1319), Expect = 2.1e-141 Identity = 283/325 (87.08%), Postives = 289/325 (88.92%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. NCBI nr
Match: XP_038875452.1 (IST1 homolog [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 470.7 bits (1210), Expect = 9.3e-129 Identity = 262/325 (80.62%), Postives = 270/325 (83.08%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. NCBI nr
Match: TYK04123.1 (IST1-like protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 447.2 bits (1149), Expect = 1.1e-121 Identity = 229/234 (97.86%), Postives = 233/234 (99.57%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. NCBI nr
Match: XP_023538831.1 (IST1 homolog isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 441.8 bits (1135), Expect = 4.6e-120 Identity = 250/327 (76.45%), Postives = 265/327 (81.04%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. TAIR 10
Match: AT1G25420.1 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 267.3 bits (682), Expect = 1.5e-71 Identity = 167/316 (52.85%), Postives = 207/316 (65.51%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. TAIR 10
Match: AT1G34220.2 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 198.0 bits (502), Expect = 1.1e-50 Identity = 121/273 (44.32%), Postives = 165/273 (60.44%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. TAIR 10
Match: AT1G25420.2 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 3.5e-49 Identity = 116/220 (52.73%), Postives = 149/220 (67.73%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. TAIR 10
Match: AT1G25420.3 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 193.0 bits (489), Expect = 3.5e-49 Identity = 116/220 (52.73%), Postives = 149/220 (67.73%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0017690 vs. TAIR 10
Match: AT1G34220.1 (Regulator of Vps4 activity in the MVB pathway protein ) HSP 1 Score: 182.2 bits (461), Expect = 6.2e-46 Identity = 121/303 (39.93%), Postives = 165/303 (54.46%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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