Pay0015574 (gene) Melon (Payzawat) v1

Overview
NamePay0015574
Typegene
OrganismCucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
DescriptionCACTA en-spm transposon protein
Locationchr10: 24959950 .. 24970179 (-)
RNA-Seq ExpressionPay0015574
SyntenyPay0015574
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSexon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGACGTCAATACAATGGATCTATAGTGGTGGAGGCAATATAGATCTACAGATGAAAGGTGGAGGAGTTACAAATCTACAGTGGTGGAACATATCTTCGCGACAATGGTCGTTTGGGTATAGAACAGAGGTGGAACGCATGGTGAAACAGTGGCTAAATGGTACAAAACAAGCGGAAGAATGGTGGTGGCACGATGAGCTACGCGATGGAACTGCGAAAGAACAAGCGATCACACAACGATGGTGTGTTGATGAGCTACGATGTTTGGTATGCTGAATGATTTACAAGCCCCAATTGAATAAGAAGAGGAAACAAAGGAAAGTCATTTGAAGGATGAAATGCCGAGGAATATTGGGATAGATATAGATAAAGATACAACAAACATATTTCATGACTTATTGGTGGGACGTGATGAGGATTGACACTAGCTCTGTGACCACTACATGAGCCATGCATTTTAGGTGAGCAACTAAACCCTTTGTCATGGTTAATTATAATTTCAACTTTTAATATATATAAGAAATAAACAGTATAATTGTTTTCACGCAGGAACAATCATGGACGAACAAGACTGCTAGACAGAAGAAGTCTTACAATCATAGCAGCAGGTCGAAGTTGTTTCTACAACAACAGCACGAGCTCACTAAGTAAAGAGGGGAGTCGATCGACCGTGTGAAGTTGTTCCAACAAACACACGCTCAAGATGGGATTTTTGTATTGTAGGCCGCGGAGGATGGGCATATAAGTTATCCAAGCAACACTTATGCTCTTATTTGTCCTCTTTAATATATAATATATTTTTTCCTTACTAAGATAGTTTCTAAATTTGTTGCATAATCAAATGCTAGAATTCCAGTCCCAGCCTACCCTAGAGGGTACTTAGCCACTCTCTGAGGATGAGATATGTGAGACGGTATGCAATAGACGATCGGGCTACTCAAAAGTCCTTGGTTGGAAACCCAAGTCCAAGGCTCACAGGACGGACAGTGGGAGCAGTGCCATGACCTCATGTTCGCAGTCCATGGTAGAACTCCAATTACAGGCTACGCTTGAAGAAGCTATGCTACGAATTGAAGAAAAGACAAGAAATTACAATGCATTGGTTTTAGAAGTGGAACAAATGCGGAAGTTCATAGAAGACATGACTCGGGCACAGCAAGGACCACTACATGATCCCTTGTTTGTGGTACATATTTATGTTTCCATTATTCTTAAGTTCTTGAAATGACAGTATCCAGTGATGATATGCATTATGTACTAAACTTAGCCACTTTTGTATCATTGTAGGACCTGCGGTGTAAAATGGCGTACGAGACTCGTTAGGAGACGTACGACTTTCTTTGCATTTTTTTTAACAATGAATATTTTTTATTTCTATTATGAATTTGTTACATTTTTTTAATTTCTTTGTATTATACACATTTAATTTACTAATTTATTTTGAATTTTCTTTAATTGAATCGAAAATGAATCGAATATTTCAGGAGGAATAATCTTACAGGAACTAAATCTTACAGGAAAATATTTTAGAAAAAAAATTTAAAATTACATATTTAAAATATTTCTCGACATAGTACATACGTCGAGAATATGGTGCAAATGTCACAATGGGGATGGTTATTGTCGACGCATGAATGATGTCAGATATACAAGCATTGAGAATAGTTATTTGTGACAAATAGCTGACGTCGGAACTGTGGACGTCGGGGATGGCTTGTCGCCGACGCATGGTAAACGTTGATAACGATAACGTCAGGAGAAGTGTATTCCTGACGCCTTGTTGGTGATGCATCGAGAATCTCTTTTCCAATGCATTTCTTCAACGGTCTTTCCAACATCACGTTCTGTGCCAAAAATTCAAGTCTCAACGTTATTAACACTTACGTCGACGTATTTATGCGTCGGAAGTCACCCCACTTTTTGTAGTGCGTCTAGGAAATGATACACGATCATGTAGTTTTTCTTAACGATGGGAAAAATGCTTCGTGTAATTCTTCTTCTAAACGGTCATGATACGCGATCGTCTAGGAAATGATACATGATCATGTAGTTCTTTTTAACAATGGAAAAAATGCTTCGTATAATTCTTTTTCTAAACGATCATGATACGCAATCGTGTAGGAAATGTTACACGATCGTGTAGGAAACGCTTCAAATCTAAACGTTCCTTTAGATCATATCAAAGTGATATTTAAATGATCTTGATATTCTGAAAGATGGGCTATAAGAAAGAAAGAGAAGATGAAGAAACAAAGAAAGAAAAAGAAGGATAGAAGAAAGAAAATCTTAAAAGAAATTTGTATTTTATTTACCCAAAAGAAGATGAACAGAGGAGTTGAAGAAATATGTATTTTATTTACTCAAAAGAAGATGAACGGAGGAGCTGAAGAAATCTGGAATAAAAATAAAAATAGAAGAAGAAAGAGCCGAAGAAATATGGAAAATGATGAATAAATCATAAAGAAAAAGAAGAAAGAGAAGTAACGAATCATCTGCAATTTTAAGGGCAAATCTAGAATTTATGAAAAATTTCTACTGGCTTCATGGGGTTTTTGATTTTGTTACACAAGTCATAACTATTTTGGTGTTTTGATATATTTATAAAAATCTATTTTCCACATTTAAATTGTCATTACTACTACAAAATCTGTATTTACTAATTGACATTTGCAACTTTTAATTACTTGACCTTTTGAGTAAAGTAAGATCATTTTTAATAGAAAAACATCAAGAAAAGTGTTAAAAAAGTAGGGATTCATGGAAATTTTTGAACTCTTTTACGTTAAATTTACTTGACGTTTAGCAATGCCAAGTTTAATAAACTTTTACTTTTTAAGTCACAAAAACCTTAATTTTTAAGTCACAGATATCTCCTTCACAATCACACGCCACTAGCCTCCAAACTGTGTGCCTCTCAAGTCGTGTGTTCATTCTCCAACCTTCCAAATCGATCGTACTGCTTAGCTCCAATGTTTCTAACTTGAAGTTGTATTCATCTCCACTAGTTTAAAGCTCCAAATCATGTTCAATAGTTCTCCAAATTTTGAACACGTTGTGCATCATGTTTTTTATGACTTGGTGTGTCTTGTAGCAGTGTTTTTTGGCTAGGGTAAATTTTCGATTGTTACCTTGATTTTTAGTGGCTTTAAATTAGATTACCCATATTGTTTAAGGTCTAGATTTATAGGTTCAAACACTTTCTTACACCAAAAAAACATTATTTGAAGCCTCTTTTAAGTAAGATTAGGTAAGGATGATAATTGGTTTTAGTGTTTGAATTATAATATGAACACTTGAAACTCATTTTGTGTTGAAAACTTGTATTGCACAGTAGGGACAATTGCCTAGACAGAATGTCTAAATGCACCATGTGATAGCTCTTCTTATAAATCTCTGTGTCGACAGAACGCCTAGATTATCCGCTTGATGTCTAGCCTTGTGTATCATCTGGTAGTTTGTAATACACTTTGTACATTGCTTGGTCAAGATTATGTGTATTAATCAGAATGCCTAAGGATCAACTTGCCTGGTCAAAACGTCTCTTGTCAAGACGCCTACTGTAAAATAGAAACTAGTTAGGAAAGAAAGGCTGAGTTACGAATCTCACTTTCTTTAAAACATTTCTCGACTCTATTCCTTTGTGCAAATAGAATTTTATTGCCTCGTCATCCCCAAGATAAAACAACCTCGTTCTTCAATTAGAATTTCACTGATACTTATTAGAATACCAACACTAAAATATACATTTTTTGTTTTGCTCAGAAAGCACACAGAAAGATAATATGTCAAAATGAAGAAGGAAAGGTGTTTATATAGTGGAGGAAAAGAAAAGGCACGTTAGCAATTAAATAAAGAAATATAATTATAGAAACATTGGTAATTAAAGTAAGAGAACATTGGAAATTAAATATAAAAATGAAATTAAACATTTCGTTCTTTTATGACTCGAAGCAGTCAGAAGGATTTTATATTAAAAAGCAAAGATAATATCATTGTTACATCTCATCACGCTTTTCCATCTCAACTAGGATGGCAGAGATTCTAGCAAATCGCCTAGCCATCTCGCCTAGGATGGCAGTTTATGTGTAAAGATTAGCAAATCTAATCTCCTTACCATCTTGCTTCAAATAGAAACACGCAACTTATTTACTTATCTTCTCTCCTTTCCAAATTCGCAACTGGATGAGTATTTTCTATAATGAAAATTTAAAAATTTTTCATCAATAATCCCCCACCTAAAAAGTTTTTACTACCAGTCCCCACTTGAAAATTTTAAAAACATTTTCATCGAGCAATGTCTATATGTATAATATTATGCTTAAGTAAAGGAGTCAAATGACTTAAACCTTTATATAGTAACTCATGGTTTTGAACTTTACCTCTAACAAGATTGCATACATAGCATTATTCGAGTGAAGTTCTAAAAAATTGCCCATGCTTTAAGGCCTTGCACGTATATCCAAGTTTAGTTGATGCTCTAGAGAATTTGCCTATAATTCCATAGGAAGAGGCCCTCACTTCCATATCGACAAAGATGAATCTATCAAGAGTACTTCTTTAGCTAGGTACCCTACATGATATCAAGTATAGAATTCATTAAGAACTAAGTTAAGCCTTTCCATACGCTTTAGGATGTCATGCTAATCACTCAATTATAAGAATGGAACTCCTAGGTATTTTAACATGATTCCCATCATATCACCTGTGATCAGCTATACCCATTGAACTTGTTTCTTAGAATCTCTAGTCTTTCAAGCTGGGTTTACCTTACAAGTAATTTAGTTTTCTATAGGCTTGAGTCCCATTCTTTTTTAGGTTTTAAAAACCTTCTCTCTAGCTAGTCATTTCGTCAAAGGATCAACCAAAGTTGCCATCAGATCGTATATAATCCACTATCACTGCACTAGTAATGAGAAATTCTCTAATGGTACTCTGTTTACGACATATCTGTCGTCTTTTACCGTTATACTAACTATTTTAAACTTTTACAATAGCTGCAG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GAATGATAACTCACTTTCGTTAATTATGAAATAGAGAAATATTTTTAAAGAAGAAAAAGGAAAGTGACGAACAACGACGTTGCAGAACCCTTTTATCAGAATTGTATTTATCAGTTCTTTTCTTTCGCAGGTTATCAAATGGCAGAGATAGAGGAGTAGATGAGTTAACCCACGTCTCTGGTATCTCCCATGTACATGTGGGAGTAAGTTATTTAATATCTATGTTGTGA

mRNA sequence

ATGACGTCAATACAATGGATCTATAGTGGTGGAGGCAATATAGATCTACAGATGAAAGGTGGAGGAGTTACAAATCTACAGTGGTGGAACATATCTTCGCGACAATGGTCGTTTGGGTATAGAACAGAGGTGGAACGCATGGTGAAACAGTGGCTAAATGGTACAAAACAAGCGGAAGAATGGTGGTGGCACGATGAGCTACGCGATGGAACTGCGAAAGAACAAGCGATCACACAACGATGGTTATCAAATGGCAGAGATAGAGGAGTAGATGAGTTAACCCACGTCTCTGGTATCTCCCATGTACATGTGGGAGTAAGTTATTTAATATCTATGTTGTGA

Coding sequence (CDS)

ATGACGTCAATACAATGGATCTATAGTGGTGGAGGCAATATAGATCTACAGATGAAAGGTGGAGGAGTTACAAATCTACAGTGGTGGAACATATCTTCGCGACAATGGTCGTTTGGGTATAGAACAGAGGTGGAACGCATGGTGAAACAGTGGCTAAATGGTACAAAACAAGCGGAAGAATGGTGGTGGCACGATGAGCTACGCGATGGAACTGCGAAAGAACAAGCGATCACACAACGATGGTTATCAAATGGCAGAGATAGAGGAGTAGATGAGTTAACCCACGTCTCTGGTATCTCCCATGTACATGTGGGAGTAAGTTATTTAATATCTATGTTGTGA

Protein sequence

MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQWSFGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEEWWWHDELRDGTAKEQAITQRWLSNGRDRGVDELTHVSGISHVHVGVSYLISML
Homology
[Close]
BLAST of Pay0015574 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3E0X6 (CACTA en-spm transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2277G00040 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 179.1 bits (453), Expect = 1.0e-41
Identity = 80/81 (98.77%), Postives = 80/81 (98.77%), Query Frame = 0 

Query: 1  MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQWSFGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEE 60
          MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQW FGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEE
Sbjct: 1  MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQWWFGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEE 60

Query: 61 WWWHDELRDGTAKEQAITQRW 82
          WWWHDELRDGTAKEQAITQRW
Sbjct: 61 WWWHDELRDGTAKEQAITQRW 81

[Close]
BLAST of Pay0015574 vs. NCBI nr
Match: KAA0054098.1 (CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK29388.1 CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 179.1 bits (453), Expect = 2.1e-41
Identity = 80/81 (98.77%), Postives = 80/81 (98.77%), Query Frame = 0 

Query: 1  MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQWSFGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEE 60
          MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQW FGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEE
Sbjct: 1  MTSIQWIYSGGGNIDLQMKGGGVTNLQWWNISSRQWWFGYRTEVERMVKQWLNGTKQAEE 60

Query: 61 WWWHDELRDGTAKEQAITQRW 82
          WWWHDELRDGTAKEQAITQRW
Sbjct: 61 WWWHDELRDGTAKEQAITQRW 81

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Pay0015574 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Pay0015574 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5D3E0X61.0e-4198.77CACTA en-spm transposon protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_... [more]
BLAST of Pay0015574 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
KAA0054098.12.1e-4198.77CACTA en-spm transposon protein [Cucumis melo var. makuwa] >TYK29388.1 CACTA en-... [more]
BLAST of Pay0015574 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Pay0015574.1Pay0015574.1mRNA