
Pay0013974 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCAACGATTCCCAAAAGCCCTTAGGGTTTTAGCTTTTAACCTAACTCTCCTCTGCGCTGTTCGTCTTCTCCGAACACTCCATCAAATAGCTAATGCAATCCTTGCGACCCATCGTCTAGCTGTAGCAAAAAGTTTCTCAGTCTCTTCCTTCCAGCTCTTCCATGGCGTCTTCTTCTGGACTCCGTATCTCTTACCTACTTCGCCATCAGCTCGCTCCACCTCTCGTGTCCAATCGTTTCACTAGAACCTGCCGTGGGTTGTCAGAACTTCGCTTTTTACCTACCAGGAATTTTACAGCTTCCAGGTCCCTGCGGTTGGCGAAATCCGGGCGCAGAGACGAGCTTGTGAAAGATGAAGGGGAAGAGGGGCAGGATGGAAATGGTAGTGTAGCTGTGAAGAAGGATGGAGGTGGGAGTGATGGAAGGATTGTTCATGCCGCGCTTCACAAGGAGGCTACTGATGCTTACATGGCTTATGCAATGTCCGTGTTGCTCGGCCGTGCCTTGCCAGATGTTCGTGATGGTTTGAAACCTGTCCACCGCCGGATTTTGTTAGTCATTTCCCCTTAAACTTTTTTTTTCATTGCATTATTTTCTAGAATGAGGGCAATGTACTTTATCCGAGACACTCCTCTCTTAAATTTCATCGGTCTGTTTTGTTGAGTACAACAGCCGTGGGGTGCAGGGTGGGGGATGGGACATCGAACCTCTGATCTGACAGAGGTCACGTAAATACCACTAAGCCAAGCTCAGTTTGTCTCATCGGTCTTTTTTTGAAGTATCATATTACATTTTACCAATTTACCGGCAGTTTATGTTTCTCTTATTCATTACCCGAGTAGGCACGAAACTATATTAGTTTGAGATTATGGTATCTGCTGATATCTCAAACGGATGGTTCTTGAAACTATTTACATAGACTCAAGGACCTTCGAGATGTCCTTAGAGTTGTCGAATGGGGAGATTAGAGACTTTGTGATCAAGATACCACTTCTCTCACAGTGTTAGGTACGCAGTGGGTGTTATGTTAGTTGGGCATATATGGAGAGGAGGTTTTGTTTTCTCTCCAGAGAGAGCGAGAGGCGAAGGAAATTTTCAAAACATCATACCGGTATTTATTTTATTTTTTTGAAACAGGCCAACAAAAGCTTTATTTGATAGATAAATAAATTATAAAAGAAAACGGATTGTACCCACTTTTAGTTTTTCGGTAAGGACACACTTTCTCTACAGAAGATATGCCACCATAAGAATTATTTGATTGATAAATAAATTAAAAAAAAAAGGATTATACCCACTTTTAGTTTTTGGGTAAGGTCACACTTTCTCTACAGAAGATATGCCACCATAAGCATTGATTTCACTGACATTTCTCTCTTGTGTATGATAGCCTCTCAAATCTATAATTGATAAAAAGTATAGCGTGTAGTCAAACCCTCTGCAAAACTACAACCGCTTGTACGCTCTCAAGTAAATATTGGACCAATACTGCTATGACTGACCTCCAACAGAAACAAATATTTTTTGGGATGTGGCCTTCCCTATTGTTTTTCAAGAAGGCTCCTTGGATTGTGTTTGCTCTAAGTTGGTGCGTCCTTTTACATAAATGTGGCAAATCCATTATGCACATTTTGGTGTTTTGCAAACATGCCCGATCATGTTGGATGTGAATCGTGTTCTACTTTAACTGTTGTGCAGCTATTGACCCACTCATCCTTCTGAATACGCTTCTTATTGGCTATCCGTTCAAAAATGATAAAGCTATTATGCGGTCCTTCACCATCAAAGCCTACTTTTGGCTCATTTAGAATGAGAAATCACCATATCTTTGAAGACGGAGAATAGGATTTCACGCAATTGTTTGATCACCTATTGTATACCTCTCTTTCATGGTGTAAATTCACTTTTTTTTTTTTTGTGTGTGATTACAACCTCAATCTCTTACATCTCAATGGAAATGCATTATGTAATCACTTATGGCGCATGTAGCCCCTTTTATAATTTCATACAATCAATGAAATTACGGTTGATTGTTTAGCATAGAAAAGTAAATATTGTAGCAAGAATAATCAATAGTCACCTTGACCTACATGTAGTTGTATTCACATGTGGTGGGAAATAATATCTCTGTAGATCTGCTGCATATAGTTTAAGTAAGAATAATCAATAGCCTTATTTGACATGCGATAGAATTTTGGCTACAGGTTTGCCATGCATGAATTGGGCCTTTCATCAAGAAAACCATTTAAGAAATGTGCCAGAGTTGTTGGAGAGGTTAAATATCCATTTACTCCGTGAATAGTTGAGTTTATTTCTCCCTTTAGTCATATTTTATTACCTCTATATCCAACTAGACTTTTTTTTATTCTCGTAACAGGTTTTAGGTAAATTTCATCCGCATGGAGATACTGCTGTGTATGATTCCCTTGTTAGAATGGCCCAGGTAACATGAAATATTTAATCAATTTGATATTCATTAAGTTAAAAGAAATTTTGTAGTAATGAAAAGTATATACAATAGACGAGGGAGTGTGAAGGTATCACTCAACTTAAAGCAATCACGAGTTACAAATAGCTACCTAATCAACAACAATAGTTTAATTTTTAGGAGAAACAATTTCATTGATGTAACATTGAACTATAGTTTACTTTTGTTATTTATTTATTTTTTAAAAGGATAAACAATTTCATTAATGTAACATCATTGAGTGTTTTGAGGTTGGGAGTAACATTGTACCCTTTCTCACTTTGATTCATTGATGATACTATATTTCTTTTTGCCACAAAAGGTGGAGTCCTTTCTCGGCGTGAACAACATTTTAGCCTTTCTTGAGGCCATGTTGAGACTTAAAATCATTAGAGATAAATGTTAGAACTTTTAGTTTTGATCCTGGTAAGTGAATAGTTGGGCCTTTCTTGTTGGTTACGAGGTTGTTCTTTTTCCCTCATCCTACCTTGGCCTCTCCCTTGTATATAATTTGGGGACACTCTCTTTGGAACCTTGTGATAGACAAGGTGAGAAAGAGACAGGCTTCATGGAAAATCTTCTCTCTAAGAGAAGTAGGACGACCCTCATTCGCGTGGTGTTGAGTCAGATCCCTAATCCACTTCTTGTCTCACTTATGAGCTCTGTGTTATGTGTGCAAAAATCTTGAGATGCTTATGAGAGACCTTTGGAATGGGTTGACAAGGTTAAAGGAGCACAGGTGAGGTGGTGGGGAAGCCTTGGGGTTTGATTTTTAGGATTAGTGATTTTAAGGAATTGTAAAAAGCCTTGTTAGAAAGAAATCGATGGTTTTTATATTATAAGGATAAGTCTCTTCCATTGGATTGATTGCGTTCATTCTGCCTGGGTTTAAGCTTCTTCATGCTGCTCCATTTCTAAGTATTTTGTAAATTTTTCTATTCGAGAATTTTGTTTGAACTCGGATGCTTTTACTTCTTTTCCTTAGTCTTTTTCTATGCTTTTACTTCTTTTCCTTAGTCTTTTTCTATGCTTTTACTTCTTTTCCTTAGTCTTTATCTATTGCATCCTTTATAGTAGTTTTTTCTTGGTTTCTTTGTGCTTTGAGCATTAGTTTCTTTTCATTATATCAATGAAAAGTTTTGTTTCTTTGCAAAAATAAAATAAAGAACAAAACAAAAAGCTCATTTAGCTATAAAATTTCCTCTCAAGTCCATTAGCCTTTGGCATATGATTATAGCAAAGAAGCATGCTTCTCATTCTTATGAGTGGATGCTAGGTGGAGTCGAAGACACTTGCATAATTCTTGGAGAAGAATTTTAAATGAGCTCCCTTGTTCTTTTCACCTTATTTCTTGCTTTGTCGGTATGTTTGGGAGGATAGATGAATGGGGATAGACCTTAATGCTTTACATAATTTTTATCTACGAAAACCACTTTGTGGCCAATGTCTTGGTTAATTACGTGAGCTCTTTTTTTTTTGCACAATTTTGGTGCTTTTTGTCCAATAGGGAAATTTTAGTGGTCACAACTCTTATCTTTATTCTTTGATTGGGGAGTTTTAGTTTTTAAGTTGGGGGGGGGGGTGATTGTTTTTGGGGTCATAAGCCTACTGCAGGCTTTTCTTGTAGTTTGTTCTTTTACTGCTTGTTGGACTATTTTCCCTTTAGTGACGTCGTCTTTTATGCTATTTGGAATGTGAACCTTCCAAAGAAGGTAAGTTCTTCCACGGAAGAGTTAATTCTCTTGATTGGCTGTCGAGAAAGTTACCTTTTTTGGTTGGACCTTTTCATTGCATTCTTTGTCAAATGGTGGAGTACTTGGATCATATCCTTTGGATTTGTTCGTTTGCTTGGGTAATGAAATTGATTTTTTTTGTTTTTGTTTTTTTCTAACGAGAAACAAACTTTTCATTGATGTAATTAAAAAATACTAATGTTCAATAGATGTTTATTTTTTATTTTTAATATGTGTTTGGATTCCTCTAGTGAGCTGAATATAATGTCTTCAAAGAGATGATCAAGGAGGTTCTCCTCCATCCGCCGTACTAGGAGAGGGGGTGGTTTTTGTGGCATGTCAAGTACGAGTGGCATGTGGTTCCCCTAGGTTAAGGCAAAGCAACCTTAATAAGGCATGTATTTAGTTTCGCGATCTGAGATGTTAGTATGACAAATGCAGGCTTGGAGACACCTTAACAGAACAAGATTCCAAGTCAAAGTTGGGGTCATTTGACCAAGTCCATGATGTTCATTGAATTTAACTTTTTTGTTTAGTTTTTGCCATGTTTTCCCCCTCTCTATACAAGTCATTCTCTGGGCTTTTTGGATGGCTTTAGGTCACGTTTTATTTTCCTCATTTTTTTAAGGAGCACAAACAATTTCATTGATGAAATAAAATTACAAAAGGGAGACTATCCTTCATTATTATATTTTCGTGACTTTTGTTCAGTTTTAGTTCTAACTCTCATAGTCTCATGCTTTGTTCAGGATTTCTCTTTAAGGAGCCCACTTATCCAAGGCCATGGAAATTTT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BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5YLB5 (DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial OS=Nicotiana benthamiana OX=4100 GN=GYRA PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1385.2 bits (3584), Expect = 0.0e+00 Identity = 715/913 (78.31%), Postives = 807/913 (88.39%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CAF6 (DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GYRA PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 1334.7 bits (3453), Expect = 0.0e+00 Identity = 700/923 (75.84%), Postives = 789/923 (85.48%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XZF7 (Probable DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=GYRA PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 1251.5 bits (3237), Expect = 0.0e+00 Identity = 648/910 (71.21%), Postives = 766/910 (84.18%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55738 (DNA gyrase subunit A OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=gyrA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 842.4 bits (2175), Expect = 4.8e-243 Identity = 438/855 (51.23%), Postives = 598/855 (69.94%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P94605 (DNA gyrase subunit A OS=Clostridium acetobutylicum (strain ATCC 824 / DSM 792 / JCM 1419 / LMG 5710 / VKM B-1787) OX=272562 GN=gyrA PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 709.1 bits (1829), Expect = 6.3e-203 Identity = 375/837 (44.80%), Postives = 552/837 (65.95%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BDB8 (DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103488432 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1776.5 bits (4600), Expect = 0.0e+00 Identity = 923/923 (100.00%), Postives = 923/923 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HB61 (DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111462414 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1595.1 bits (4129), Expect = 0.0e+00 Identity = 829/927 (89.43%), Postives = 872/927 (94.07%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K6F5 (DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492096 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1581.2 bits (4093), Expect = 0.0e+00 Identity = 827/927 (89.21%), Postives = 866/927 (93.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BTL3 (DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004692 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1568.9 bits (4061), Expect = 0.0e+00 Identity = 823/927 (88.78%), Postives = 857/927 (92.45%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BR81 (DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing) OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111004692 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1567.0 bits (4056), Expect = 0.0e+00 Identity = 823/932 (88.30%), Postives = 857/932 (91.95%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. NCBI nr
Match: XP_008445382.1 (PREDICTED: DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1776.5 bits (4600), Expect = 0.0e+00 Identity = 923/923 (100.00%), Postives = 923/923 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. NCBI nr
Match: XP_004146774.1 (DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN48012.2 hypothetical protein Csa_002754 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1714.5 bits (4439), Expect = 0.0e+00 Identity = 887/923 (96.10%), Postives = 904/923 (97.94%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. NCBI nr
Match: XP_031743870.1 (DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1702.6 bits (4408), Expect = 0.0e+00 Identity = 884/923 (95.77%), Postives = 900/923 (97.51%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. NCBI nr
Match: XP_038885119.1 (DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1642.9 bits (4253), Expect = 0.0e+00 Identity = 858/927 (92.56%), Postives = 883/927 (95.25%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. NCBI nr
Match: XP_022961731.1 (DNA gyrase subunit A, chloroplastic/mitochondrial [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 1595.1 bits (4129), Expect = 0.0e+00 Identity = 829/927 (89.43%), Postives = 872/927 (94.07%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. TAIR 10
Match: AT3G10690.1 (DNA GYRASE A ) HSP 1 Score: 1334.7 bits (3453), Expect = 0.0e+00 Identity = 700/923 (75.84%), Postives = 789/923 (85.48%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. TAIR 10
Match: AT3G23890.1 (topoisomerase II ) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 2.5e-13 Identity = 85/349 (24.36%), Postives = 157/349 (44.99%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0013974 vs. TAIR 10
Match: AT3G23890.2 (topoisomerase II ) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 2.5e-13 Identity = 85/349 (24.36%), Postives = 157/349 (44.99%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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