Pay0013089 (gene) Melon (Payzawat) v1

Overview


Name	Pay0013089
Type	gene
Organism	Cucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	RING-type domain-containing protein
Location	chr04: 20975396 .. 21017908 (+)
RNA-Seq Expression	Pay0013089
Synteny	Pay0013089

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

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Protein sequence

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Homology

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BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy Swiss-Prot
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Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPD 174
           R RSQSC FCR SLKRVN GDLW++T + +I D+  + +ENLKRL  YIDKLP +  D
Sbjct: 174 RARSQSCPFCRGSLKRVNSGDLWIYTCSAEIADLPAIYKENLKRLLIYIDKLPLVTSD 231

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CPM3 (RING finger protein 141 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold255G007380 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 2.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 179 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 237

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KLG2 (RING-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G517250 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 2.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 179 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 237

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AZR9 (uncharacterized protein LOC103484529 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484529 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 2.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 179 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 237

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3AZT3 (uncharacterized protein LOC103484529 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484529 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 2.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 194 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 252

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GEU4 (uncharacterized protein LOC111453288 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111453288 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 118.6 bits (296), Expect = 2.6e-23
Identity = 55/59 (93.22%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKY+DKLPTIVPDS
Sbjct: 169 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYVDKLPTIVPDS 227

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. NCBI nr
Match: XP_031743680.1 (E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 isoform X3 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 4.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 175 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 233

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. NCBI nr
Match: XP_031743679.1 (E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 isoform X2 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 4.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 178 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 236

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. NCBI nr
Match: XP_008439874.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484529 isoform X2 [Cucumis melo] >KAA0052696.1 RING finger protein 141 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK13128.1 RING finger protein 141 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 4.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 179 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 237

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. NCBI nr
Match: XP_008439873.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484529 isoform X1 [Cucumis melo])

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 4.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 194 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 252

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. NCBI nr
Match: XP_004134714.1 (E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN49217.1 hypothetical protein Csa_002951 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 119.0 bits (297), Expect = 4.0e-23
Identity = 56/59 (94.92%), Postives = 56/59 (94.92%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 175
           RTRSQSC FCRDSLKRVN GDLWVFTDNRDIVDMA VTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS
Sbjct: 179 RTRSQSCPFCRDSLKRVNSGDLWVFTDNRDIVDMATVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPDS 237

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. TAIR 10
Match: AT5G58787.1 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 1.6e-17
Identity = 38/58 (65.52%), Postives = 45/58 (77.59%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPD 174
           R RSQSC FCRDSLKRV+ GDLW+F D  D V++  + REN KRLF YI+KLP +VPD
Sbjct: 172 RGRSQSCPFCRDSLKRVDSGDLWMFLDQNDTVNLTAIARENQKRLFMYIEKLPLVVPD 229

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. TAIR 10
Match: AT5G58787.2 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 1.6e-17
Identity = 38/58 (65.52%), Postives = 45/58 (77.59%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPD 174
           R RSQSC FCRDSLKRV+ GDLW+F D  D V++  + REN KRLF YI+KLP +VPD
Sbjct: 157 RGRSQSCPFCRDSLKRVDSGDLWMFLDQNDTVNLTAIARENQKRLFMYIEKLPLVVPD 214

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. TAIR 10
Match: AT3G47160.1 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 5.1e-16
Identity = 36/56 (64.29%), Postives = 43/56 (76.79%), Query Frame = 0


Query: 118 RSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPD 174
           RS+SC FCRDSLKRVN GDLW+  +  D V+M  + REN KRLF YI+KLP +VPD
Sbjct: 177 RSESCPFCRDSLKRVNSGDLWMLMEKSDTVNMYTIERENKKRLFVYIEKLPLVVPD 232

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. TAIR 10
Match: AT3G47160.2 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 82.0 bits (201), Expect = 5.1e-16
Identity = 36/56 (64.29%), Postives = 43/56 (76.79%), Query Frame = 0


Query: 118 RSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPD 174
           RS+SC FCRDSLKRVN GDLW+  +  D V+M  + REN KRLF YI+KLP +VPD
Sbjct: 189 RSESCPFCRDSLKRVNSGDLWMLMEKSDTVNMYTIERENKKRLFVYIEKLPLVVPD 244

[Close]

BLAST of Pay0013089 vs. TAIR 10
Match: AT5G01520.1 (RING/U-box superfamily protein )

HSP 1 Score: 80.1 bits (196), Expect = 1.9e-15
Identity = 35/58 (60.34%), Postives = 43/58 (74.14%), Query Frame = 0


Query: 116 RTRSQSCMFCRDSLKRVNPGDLWVFTDNRDIVDMAMVTRENLKRLFKYIDKLPTIVPD 174
           R RSQSC FCR SLKRVN GDLW++T + +I D+  + +ENLKRL  YIDKLP +  D
Sbjct: 174 RARSQSCPFCRGSLKRVNSGDLWIYTCSAEIADLPAIYKENLKRLLIYIDKLPLVTSD 231

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
Q9M022	2.7e-14	60.34	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=AIRP2 PE=1 ...	[more]

BLAST of Pay0013089 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3CPM3	2.0e-23	94.92	RING finger protein 141 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold...	[more]
A0A0A0KLG2	2.0e-23	94.92	RING-type domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G517250 P...	[more]
A0A1S3AZR9	2.0e-23	94.92	uncharacterized protein LOC103484529 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A1S3AZT3	2.0e-23	94.92	uncharacterized protein LOC103484529 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC10...	[more]
A0A6J1GEU4	2.6e-23	93.22	uncharacterized protein LOC111453288 isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN...	[more]

BLAST of Pay0013089 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_031743680.1	4.0e-23	94.92	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 isoform X3 [Cucumis sativus]	[more]
XP_031743679.1	4.0e-23	94.92	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 isoform X2 [Cucumis sativus]	[more]
XP_008439874.1	4.0e-23	94.92	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484529 isoform X2 [Cucumis melo] >KAA00...	[more]
XP_008439873.1	4.0e-23	94.92	PREDICTED: uncharacterized protein LOC103484529 isoform X1 [Cucumis melo]	[more]
XP_004134714.1	4.0e-23	94.92	E3 ubiquitin-protein ligase AIRP2 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN49217.1 hypot...	[more]

BLAST of Pay0013089 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT5G58787.1	1.6e-17	65.52	RING/U-box superfamily protein	[more]
AT5G58787.2	1.6e-17	65.52	RING/U-box superfamily protein	[more]
AT3G47160.1	5.1e-16	64.29	RING/U-box superfamily protein	[more]
AT3G47160.2	5.1e-16	64.29	RING/U-box superfamily protein	[more]
AT5G01520.1	1.9e-15	60.34	RING/U-box superfamily protein	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	PANTHER	PTHR15315:SF88	OS07G0661600 PROTEIN	coord: 116..174
None	No IPR available	PANTHER	PTHR15315	RING FINGER PROTEIN 41, 151	coord: 116..174

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Pay0013089.1	Pay0013089.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
biological_process	GO:0016567	protein ubiquitination
molecular_function	GO:0004386	helicase activity
molecular_function	GO:0046872	metal ion binding
molecular_function	GO:0061630	ubiquitin protein ligase activity