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Pay0012684 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATTAATTCAAATAATTGAATTGCGGGACCTTTAAATTTATTTTTTTATGATATTTTTAACTTTCGAGCATATATTAACTCATATATCTTTTTCGGTCATTTCAATTGTCATTACAATTCAGTTAATAACCTTATTAATCAATGAAACCGTAGGACTCTATGTTTCGTCAGAAAAGGGCATGATAGTTACTTTTTTCTGTATAACAGGATTATTAGTTACTCGTTGGATTTATTTGAGGCATTTACCATTAAGTGATTTATATGAATCATTACTATTTCTTTCATGGGCTTTATCCATTATTCATCTATTTGCTTATTTAAAAAAATATAAAAACCATTTAAGTGTAAGCGCAATAACCGCGCCAAGTACTATTTTTACACAAGGTTTTGCTACTTCAGGTTTTTTAACTGAAATGCATCAATCCCCACTATTAGTTCCCGCTCTCCAATCTCATTGGTTAATGATGCACGTAAGTATGATGGTATTAGGTTATGCAGCTCTTTTATGTGGATCATTATTTTCAGTAGCTCTTATAGTGATTACATTTCAAAAAGCTATAAGAATTTTTGGTAAAAACAATAATTTATTAAATGCGTTATTTTCCTTTGATGAGATCCAATACATCAACGAAGGGAACTATTTTGTAAGAAACACTTCCTTTTTTTCTTCGAAGAATTATTATAAGTCTCAACTGATTCAACAATTAGATCATTGGAGTTATCGTATTATTAGTCTAGGGTTTATCTTTTTAAGCATAGGTATTCTTTCAGGGGCAGTATGGGCTAATGAGACATGGGGATCGTATTGGAATTGGGACCCAAAGGAAACTTGGGCATTTATTACTTGGACGATATTTGCAATTTATTTACATACGCGAACAAATAAAAATTTTGAAGGTGTAAATTCCGCAATTGTGGCCTCTATGGGTTTTCTTATAATTTGGATATGCTATTTTGGGGTCAATCTATTAGGGATAGGGCTACATAGTTATGGTTCATTTACATTAACATCTAATTGAATTCATTCAAGAAAGGGCCTGACGAACACAAACATGGAGGGGTATAGATAAGAAAATTGTGTGTAAGACATCGAGAACCCTTTGAATCACTACATTACTTGATTCAAATGGTTCTCACAAAAGCCAAATGTATGAGGAAGTCCAATTCATTTTTTTATTTAACTTAAGAAAAAAGACTTCTTTTTTTTATTGTGCAACGAATGATTAAAAAAAATTATTATAGTATTGCTGTTTCATTTTTTTATGAAAACTATCTAGCAAAATAATTAGATAAAATAGCTTCGACCTTGTCAACTGATAGTGAGAAAACAAAATCTGGATAAATACCAATACCTATGACAGGTATAAGGATAGAGATCGCAACAAACAACTCTCGTGGTCCCGAATCAAAAAAATAAGAATTTTTAGCATTAAAAAGCTTGTATCCATAGAACATCTGGCGTAACATAGATAATAAATAAATGGGAGTTAATATAATTCCAATTGCCATTACCAAAGTAATTACTATTTTTGCCATTAAAAGATATTTTTGGCTAGTAATTATTCCAAAAAAGACTATTAATTCTGCAACAAAACCGCTCATACCAGGCAATGCAAGGGAAGCCATCGATAAGATACTGAAAGTCATAAATATTTTTGGAATTGGGATAGCCAGTCCTCCCATTTCATCGAGATAAACCAGACGTATTCTATCATAACTTGTTCCTGCCAAGAAAAAAAGTGCAGCGCCAATAAATCCATGAGAGATTATTTGTAAAATAGCTCCATTCAGTCCCGTATCGCTTATAGAACCAATTCCTATAATTATGAAACCCATATGAGAGACGGAGGAATAAGCTATTCTTTTTTTTAAATTGCGTTGACCCGAAGATGTTGAAGCTGCATAGATTATTTGAATTATGCCTAATATGATCAACCAGGGTGAAAAGATAGAATGGGCGTGGGGTAATAATTCCATATTGATCCGAACCAATCCATATGCTCCCATTTTTAATAAGATTCCGGCTAGAAGCATACAAGTACTGTAATGTGCCTCTCCGTGGGTATCTGGTAACCATGTATGTAAGGGTATAATCGGTGATTTGACAGCAAAAGCAATAAGAAATCCGATATAGAATAGTATTTCTAGTGCTATAGGATACGATTGATTAGCTGATGTTTCAAAATTTAAAGTTGGTTCATTAGAACCATATAAACCGATACCCAGAACTCCCATTAACAAAAAAATGGAACCTCCCGCAGTGTACAAAATAAACTTTGTAGCTGAATACAACCGTTTCTTTCCGCCCCACATCGATAGAAGTAGATAAACGGGAATTAATTCTAACTCCCACATGATAAAAAAGAGTAAGAGGTCTCGAGCAGAAAATGATCCTATTTGACCACTATACATTGCTAACATTAGAAAATGGAATAATCGGGAATCTCGAGTAACTGGCCAAGCCGCTAAAGTAGCTAAAGTGGTGATAAACCCCGTCAGTAAAATGGGTCCTATGGAAAGTCCATCGATTCCCAATCTCCAGTAAAAATCCAAAAAAGGGATCCATTTATAATCCTCCATCAATTGGATTAATGGATCGTCTAATTCGAAATGATAACAAAACGCATAGGTTGTTAGAAGCAGCTCGAGTACACAGATACATATAGTATACCATCTCATTACTTTATTTCCTCTATGAGGGAAAAAGAAAAGTAATAAACCCGCAAATATTGGAAAAACTACAACTGTTGTTAACCAAGGAAAATAATTCGTAGTAAAAACAAGATACACTTGGACTAAAAAAACCCATGTTCGAAAATAAAATAAAAAAAAATATATATATGTATATTTATTTTCGAGCACGAGTTTTTGTCGGTAAAAAAGAAATCAAATGTATTCAAGGGGGCTTTTAGAGAACGTATCAATAAGCTAGACCCATGCTTCGAGTTGTTTCATGCCATAAATAAACGCGAACACTCAAAAAATCTGTCGGACAGGCAGATTCACATCTCTTACAACCAACACAGTCTTCCGTTCGTGGAGCCGAAGCTATTTGCTTAGCTTTACATCCGCCCCAAGGTATCATTTCTAATACATCTGTGGGGCAAGCTCGGACACATTGAGTACACCCTATACATGTATCATAAATCTTTACTGAATGTGACATTGGATCTATAATTTTTTTTTAAGACTATAAATTTTCGATCGAGTAAATTTGTAAATGAATTATATATTTAGATACCAGATGAGTCAATAATTTATCAGAATTTTGATAATCAATCTACTTTCAGATTAACTCATGCGATAGGGCCAAGATACTTTGATTTTTTACGTTTTCGCAAACATTATCATGGATTACGTATGATACATATAATTTTACTTGATGAATATCATAATTTATCTCATAAATAAATATTACTTATTCAACAAATTCGATTGATTGATACGAGTGGATTTTCTGTTACGATAAATTGACGAAAGAATAGCTGGGCCAATAGCTGCTTCAGCGGCTGCAATAGCTATAACAAAAATTGAGAAAATATTCCCTTTTAATTGGCGACTATCAAAAAAATCAGAAAATGTTACGAAATTCATATTAACTGCATTCAGTATAAGCTCAAGACACATAAGGGCCCTAACCATATTTCGGCTTGTGATCAATCCATAGATACCGATAGAAAATAAATAGGCACTTATAATAAGTACATGTTCGAGCATGATTGACCAACTCCTTATCAATTCCGATTCATTTCAATATGAACAAAAATGTAATAGATTCAATTCAATTGACAAAAAAAAAGTACAGAACAAGAGAATATATTCGTAATCGATCGAATAAAAGAATTTTGAGTTTAGACCAAAAAATCTTCAAATAGAATTGAAGGGGAATGTGTGTGATAACATACAACAAAGTTTAAATTATGCTATTTCTAACTAAAGATTTATTACTGGCGAGCCACGGAAATTGCGCCGATCAAAGCAGCTAAAAGAATGATCGAAATGAGTTCAAATGGAAGAAAAAAATATGTTGATAAATAAATTCCAATTTGTTGACTATTACTTATTAAATCTTGCTCTAGAATCTGATTTGATCTTGTAGTCCAAATAATCCCATACCATGACGTATCTACAATAGTAGTCATTAGTGAAACAAAAATACTTGTACAAACCAGAAAAGTAACTCCATTCCCAACGGTCCAAAGATTAAAATCTTTGGAATATTCTGAACCCTTCATGAACATCACAGCAAATATGATTAAAACATTTATAGCTCCCACGTAAATAAGGAGTTGCGCAGCAGCTACAAACTGGGCGTTTGCTAGAATATAGAATAAGGATATAGAAACAAGAACCAGTCCCAACGAAAAAGCAGAATAAATGGAGTTGTTAAATAATAGTACTCCCATACTTCCTAATATAAGACCTGATCCCAACAAGACTACAAGAAAATCATGTATCGGTCCAGGCAAATCCATTATATGTAGTAAAAAAAGAGATAAATAAATCTAAATGTTTTTCATGACCTTATTGATCTGACCAGGAAAAAAAATGTATAATCAATTCCTAATTAAATATTAAGGGGTGTGAATTAATGTAGGTACAGTTATTCTATTAATCTTAGTCTTGATCTGAAAGAGTAAAGTAGATTGAAACTATATATTTCGAAATATATAGTTTCAATCTAAATTAAGCTACAATTCTCATGAATCAATAGTTTGGATTTGTAGGTAGTGACCAAACAAACAAAACGAAAGAAACCTCATGTCTTTAGATCAAAACAGAACCTTAGTAATTGTAAATTACTCTTTAATCAACAGATTGACTTATTTTAGACTTCAATTTGAGGCGAATTCGAATTCAAAATTGTTCTAATTGTATAATCATCAACTACTGACATTGGTAAACGACCCAAAGAAATTTGATTATAATTCAATTCGTGACGATCATAAGTAGAAAGTTCATATTCTTCAGTCATTGATAAACAATTTGTTGGAC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MIFLTFEHILTHISFSVISIVITIQLITLLINETVGLYVSSEKGMIVTFFCITGLLVTRWIYLRHLPLSDLYESLLFLSWALSIIHLFAYLKKYKNHLSVSAITAPSTIFTQGFATSGFLTEMHQSPLLVPALQSHWLMMHVSMMVLGYAALLCGSLFSVALIVITFQKAIRIFGKNNNLLNALFSFDEIQYINEGNYFVRNTSFFSSKNYYKSQLIQQLDHWSYRIISLGFIFLSIGILSGAVWANETWGSYWNWDPKETWAFITWTIFAIYLHTRTNKNFEGVNSAIVASMGFLIIWICYFGVNLLGIGLHSYGSFTLTSN Homology
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2QD41 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 615.1 bits (1585), Expect = 4.4e-175 Identity = 316/323 (97.83%), Postives = 317/323 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0ZIW9 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 514.2 bits (1323), Expect = 1.0e-144 Identity = 262/323 (81.11%), Postives = 287/323 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q09WW9 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Morus indica OX=248361 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 513.1 bits (1320), Expect = 2.3e-144 Identity = 262/323 (81.11%), Postives = 287/323 (88.85%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q09FZ7 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Platanus occidentalis OX=4403 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 498.8 bits (1283), Expect = 4.6e-140 Identity = 254/323 (78.64%), Postives = 281/323 (87.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A4GYW5 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Populus trichocarpa OX=3694 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 495.7 bits (1275), Expect = 3.9e-139 Identity = 251/323 (77.71%), Postives = 279/323 (86.38%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4EU63 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Cucumis melo OX=3656 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 1.1e-176 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A286NFL3 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Cucumis melo var. cantalupensis OX=3658 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 1.1e-176 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A249RXM9 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Cucumis melo subsp. agrestis OX=217619 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 1.1e-176 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A286NFV0 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Cucumis melo var. flexuosus OX=1120798 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 1.1e-176 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A249RZ47 (Cytochrome c biogenesis protein CcsA OS=Cucumis melo var. dudaim OX=2034236 GN=ccsA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 1.1e-176 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. NCBI nr
Match: YP_004841834.1 (cytochrome c heme attachment protein [Cucumis melo subsp. melo] >YP_009860124.1 cytochrome c heme attachment protein [Cucumis melo subsp. agrestis] >ASY96642.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. conomon] >ASY96730.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. makuwa] >ASY96817.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. momordica] >ASY96904.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. dudaim] >ASY96991.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. cantalupo] >ASY97165.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. inodorus] >ASY97339.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo var. flexuosus] >QJF46435.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 629.0 bits (1621), Expect = 2.2e-176 Identity = 323/323 (100.00%), Postives = 323/323 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. NCBI nr
Match: YP_009346527.1 (cytochrome c heme attachment protein [Cucumis x hytivus] >AOW71138.1 cytochrome c heme attachment protein [Cucumis x hytivus] >QCY72891.1 CcsA [Cucumis hystrix]) HSP 1 Score: 617.8 bits (1592), Expect = 5.1e-173 Identity = 317/323 (98.14%), Postives = 318/323 (98.45%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. NCBI nr
Match: YP_009004090.1 (cytochrome c heme attachment protein [Cucumis hystrix] >Q2QD41.1 RecName: Full=Cytochrome c biogenesis protein CcsA [Cucumis sativus] >ALF03350.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis sativus var. hardwickii] >AVE15381.1 CcsA [Cucumis sativus var. sativus] >AAZ94698.1 cytochrome c biogenesis protein [Cucumis sativus] >ABI97462.1 cytochrome c heme attachment protein [Cucumis sativus] >ABI98793.1 cytochrome c heme attachment protein [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 615.1 bits (1585), Expect = 3.3e-172 Identity = 316/323 (97.83%), Postives = 317/323 (98.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. NCBI nr
Match: QHB76014.1 (cytochrome c biogenesis protein [Cucumis melo subsp. melo]) HSP 1 Score: 607.8 bits (1566), Expect = 5.3e-170 Identity = 311/323 (96.28%), Postives = 314/323 (97.21%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. NCBI nr
Match: QZL38644.1 (cytochrome c biogenesis protein [Citrullus naudinianus]) HSP 1 Score: 605.9 bits (1561), Expect = 2.0e-169 Identity = 311/323 (96.28%), Postives = 313/323 (96.90%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0012684 vs. TAIR 10
Match: ATCG01040.1 (Cytochrome C assembly protein ) HSP 1 Score: 435.6 bits (1119), Expect = 3.4e-122 Identity = 229/327 (70.03%), Postives = 266/327 (81.35%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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