Pay0010808 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTCTTTGGAGGACCCCACTAGGGCTCAGATGTGGTTATCGTCCTTGGAAACCATATTCCGTTACATGAAATGCCCTGAGGATCAGAAGGTTCAGTGTGCTGTTTTTATGTTGACTGACAGAGGTACTGCATGGTGGGAGACTACAGAGAGGATGCTAGGTGGTGATGTGAGTCAGATCACGTGGCAGCAGTTCAAGGAGAGTTTCTATGCGAAATTCTTCTCTGCCAGTTTGAGAGATGCTAAGCGGCAGGAGTTCCTGAACCTAGAGCAGGGTGACATGACAGTGGAGCAGTATGATGCGGAGTTTGACATGTTATCCCGCTTCGCTCCAGAGATGATAGCGACCGAGGCGGCCAGAGCTGATAAGTTTGTTAGAGGCCTCAGACTGGACATTCAGGGTTTGGTCCGAGCTTTCAGACCCGCTACTCATGCCGATGCACTGCGCCTGGCAGTGGATCTCAGTTTACAGGAGAGGGCCAACTCGTCTAAGACCGCTGGTAGAGGTTCGACATCGGGACAGAAGAGGAAGGCTGAGCAGCAGCCTGTTCCAGTGCCACAGCGGAATTTCAGACCAGGTGGTGAGTTTCGCAGCTTCCAGCAGAAACCTTTTGAGGCAGGGGAGGCTGCCAGAGGAAAGCCGTTGTGTACCACTTGTGGGAAGCACCATCTGGCCGTTGCTTATTCGGGACCAGGACCTGCTTTAAGTGCAGGCAAGAGGGTCATACAGCTGATAGATGCCCGTTGAGACTCACGGGATCGCGCAGAATCAGGGAGCAGGTGCTCCACATCAGGGTAGAGTCTTTGCTACCAACAGGACTGAGGCTGAGAAGGCAAGCACAGTAGTGACAGGTACGCTCCCAGTGTTGGGGCATTACGCCTTAGTTTTGTTTGATTCGGGTTCGTCACATTCTTTTATCTCTTCCGCATTTGTGTCGCATGCCCGCTTAGAGGTAGAGCCCTTACACCATGTTCTATCAGTATCTACTCCTTCCGGGGAATGTATGTTGTCGAAGGAAAAGGTGAAAGCATGTCAGATTGAGATAGCAGGCCATGTGATTGAGGTAACGCTGATAGTCCTGGATATGCTGGACTTTGATGTAATCCTGGGTATGGATTGGTTGGCCGCTAACCACGCCAGCATAGATTGTTCACGTAAGGAGGTAACGTTTAACCCTCCCTCGATGGCCAGTTTTAAATTTAAGGGAGGAGGGTCAAAGTCGTTGCCTCAGGTAATCTCAGCCATCAGGGCCAGTAAACTGCTCAGTCAGGGTACTTGGGGTATCTTAGCGAGCGTGGTGGATACTAGAGAGGCGGATGTATCCCTGTCATCAGAACCAGTAGTGAGGGACTATCCGGACGTTTTTCCTGAGGAACTTCCAGGGTTACCTCCGCACAGAGAGGTTGAGTTTGCCATAGAGTTGGAGCCGGGCACGGTTCCTATATCCAGAGCCCCTTACAGAATGGCCCCCGCAGAACTGAAAGAACTGAAGGTACAGTTACAGGAATTGCTTGATAAGGGATTCATTCGACCGAGCGTGTCACCTTGGGGTGCGCCAGTCTTATTCGTTAAGAAGAAGGACGGATCGATGCGTCTGTGCATTGACTATAGGGAGTTGAACAAAGTAACAGTAAAGAACAGATATCCCTTACCCAGGATTGACGATCTATTTGACCAGTTACAGGGAGCCACAGTGTTCTCTAAGATTGATCTTCGGTCGGGGTACCATCAGCTGAGAATTAAGGATGAGGATGTACCGAAGACAGCATTTCGTTCCAGATATGGACACTACGAGTTTATTGTGATGTCTTTTGGTTTGACGAATGCTCCGGCAGTGTTTATGGACTTGATGAACAGAGTGTTTAGGGAGTTTCTAGACACTTTTGTGATTGTGTTTATCGACGATATCTTGATATACTCCAAGACGGAGGCCGAACACGAGGAGCATTTACGTATGGTTTTGCAAACACTTCGGGATAATAGGTTGTATGCAAAGTTCCCGAAATGCGAGTTTTGGCTGAAACAGGTGTCCTTTCTGGGCCACGTGGTTTCTAAGGCTGGAGTCTCTGTAGATCCAGCTAAGATAGAGGCAGTCACCGGTTGGACCCGACCTTCCACAGTCAGTGAGGTTCGTAGTTTTCTGGGTTTAGCAGGCTATTATCGACGGTTTGTGGAGAACTTTTCTCGTATAGCTACTCCTCTTACTCAGTTGACCAGAAAGGGAGCTCCTTTTGTTTGGAGCAAGGCATGTGAGGACAGTTTCCAGACCCTTAAACAGAAGTTAGTTACCGCACCGGTTCTTACGGTACCTGATGGTTCTGGCAATTTCGTGATTTATAGTGATGCTTCCAAGAAGGGTCTGGGTTGTGTTTTGATGCAGCAGGGTAAGGTGGTCGCTTATGTGTCTCGTCAGTTGAAGAGTCATGAGCAGAACTACCCTACGCATGACCTAGAGTTGGCAGCAGTGGTTTTTGCTTTGAAAATATGGAGGCATTATTTATATGGTGAAAAGATACAGATATTCACAGATCATAAGAGCTTGAAATACTTCTTTACTCAGAAGGAATTGAATATGAGACAGCGAAGGTGGCTTGAGTTAGTGAAGGATTACGATTGTGAGATACTGTATCATCCAGGCAAGGCAAATGTGGTAGCTGATGCTCTTAGTAGGAAAGTATCACATTCAGCAGCACTCATTACCCGAGCCCCCATTGCATCGGGATCTCGAGCGGGCTGAGATTGCAGTGTCAGTGGGGCAGTTACTATGCAGTTAGCCCAGTTGACGGACGCAGCCGACTTTGAGACAGAGGATCATTGATGCTCAGAGTAACGATCCTTATCTGGTTGAGAAACGTGGCCTAGCAGAGGAGGGGAAAGGAGAGTCTCGTTATCCTATCCTGATGGTGGACTGTGTTTGAGAGACGCCTCTGTGGTCCGTCAGATGGAGTGGCGGTTAAGACAGAATTATTATCTGAGGCGCACAGTTCCCCATTTTCCATGCACCCAGGTAGTACGAAGATGTATCAGGACCTGAAGCGGTTTATTGGTGGCGTAACATGAAGAGGAAGTAGCAGAATTTGTTAGTAAATGCTTGGTGTGTCACCAGGTTAAGCACCAAGGCAGAAACCAGCGGGTTTATTACAACCCTTGAGCATACCGGAATGGAAGTGGGAAACGTGTCCATGGATTTCATTACAGGGCTACCGAGAACTCTGAGGTTTTACAGTGATTTGGGTGTGGTGGACCGACTTAACTAAATCAGCGCACTTCATTCCGGGTAAATCCACCTATACTGCTAGTAAGTGGGCACAGTTGTACATGTCTGAGATAGTGAGATTACATGGAGGCCAGTGTCGATTGTTTCTGATAGGGATGCCCGTTTCACTTCCAAATTTGGAAGGGTTTGCAGACTGCTATGGGCACGAGGTTGGATTTAGTACGGCTTTCCATCCACAGACTGACGGTCAGACTGAGCGTCTGAACCAGTTTTAGAGATATGTTGCGAGCGTGTGCATTGGAATTTCCAGTACAGCAGGGTAAGGTGGTCGCTTATGCGTCTCGTCAGTTGAAGAGTCATGAGCAGAACTACCCTACACATGATCTAGAGTTGGCAGCAGTGGTATTCGCTTTGAAGATATGGAGGCATTATTTATATGGTGAAAAGATACAGATATTCACGGATCATAAGAGCTTGAAATACTTCTTTACTCAGAAAGAACTGAATATGAGACAGCGAAGGTGGCTTGAGTTAGTGAAGGATTACGATTGTGAGATACTGTATCATCCGGGCAAGGCAAATGTGGTAGCTGATGCTCTTAGTAGGAAGGTGTCACATTCAGCAGCACTTATTACCCGGCAGGCCCCATTGCATCGGGATCTCGAGCGGGCTAAGATTGCAGTGTCAGTGGGGGCAGTTACTATGCAGTTAGCCCAGTTGACGGTACAGCCGACTTTGAGGCAAAGGATCATCGATGCTCAGAGTAACGATCCTTATCTGGTTGAGAAACGTGGCCTAACAGAGGCAGGGCAAGCGGCTGAGTTCTCGTTATCCTCTGACGGTGGACTGTTGTTTGAAAGACGCCTCTGTGTTCCGTCAGATAGTGCGGTTAAGACAGAATTATTAGCTGAGGCTCACAGTTCCCCATTTTCTATGCACCCAGGTAGTACGAAGATGTATCAGGACCTAAAGCGGGTTTATTGGTGGCGTAACATGAAGAGAGAAGTAGCAGGATTTGTTAGTAAATGCTTGGTGTGTCAGCAGGTTAAGGCACCAAGGCAGAAACCAGCGGGTTTATTACAACCCTTGAGCATACCGGAATGGAAGTGGGAGAACGTGTCCATGAATTTCATTACAGGGCTACCGAGAACTCTGAGGGGATTTACAGTGATTTGGGTTGTGGTGGACAGACTTACTAAATCAGCGCACTTCGTTCCGGGTAAATCCACCTATACTGCTAGTAAGTGGGCACAGTTGTACATGTCTGAGATAGTGAGATTAACGGAGTGCCAGTGTCGATTGTTTCTGATAGAGATGCCCGTTTCACTTCCAAATTTTGGAAGGGTTTGCAGACTGCTATGGGCACGAGGTTGGACTTTAGTACGGCTTTCCATCCACAGACTGACGGTCAGACTGAGCGTCTGAACCAGGTTTTAGAGGATATGTTGCGAGCGTGTGCATTGGAATTTCCAGGTAGCTGGGACTCCCACTTACATTTGATGGAATTTGCTTATAATAACAGTTATCAGGCTACTATTGGCATGGCACCGTTTGAGGCTCTGTACGGCAAATGTTGTAGATCCCGGTTTGCTGGGGTGAGGTAGGTGAGCAGAGATTGATGGGTCCTGAGTTAGTTCAGTCTACTAACGAAGCGATTCAGAAGATTAGATCACGCATGCATACCGCTCAGAGTAGACAGAAGAGTTATGCAGATGTGAGGCGGAAGGACCTTGAGTTTGAGATAGGGGATAAGGTGTTCTTAAGGTAGCACCTAT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BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT34 (Transposon Tf2-1 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 1.8e-101 Identity = 248/853 (29.07%), Postives = 413/853 (48.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT35 (Transposon Tf2-2 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 1.8e-101 Identity = 248/853 (29.07%), Postives = 413/853 (48.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT36 (Transposon Tf2-3 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 1.8e-101 Identity = 248/853 (29.07%), Postives = 413/853 (48.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT37 (Transposon Tf2-4 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-4 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 372.1 bits (954), Expect = 1.8e-101 Identity = 248/853 (29.07%), Postives = 413/853 (48.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy TrEMBL
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BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UAA8 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold55G00800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1253.0 bits (3241), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/901 (74.03%), Postives = 708/901 (78.58%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VCI9 (Pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold538G00440 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1248.4 bits (3229), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/900 (73.00%), Postives = 705/900 (78.33%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SPZ2 (Pol protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold19G002730 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1247.6 bits (3227), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/915 (72.79%), Postives = 712/915 (77.81%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. NCBI nr
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BLAST of Pay0010808 vs. NCBI nr
Match: KAA0057672.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1257.3 bits (3252), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/910 (73.30%), Postives = 709/910 (77.91%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. NCBI nr
Match: KAA0051357.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1253.0 bits (3241), Expect = 0.0e+00 Identity = 667/901 (74.03%), Postives = 708/901 (78.58%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. NCBI nr
Match: KAA0065873.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1248.4 bits (3229), Expect = 0.0e+00 Identity = 657/900 (73.00%), Postives = 705/900 (78.33%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. NCBI nr
Match: KAA0026271.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1247.6 bits (3227), Expect = 0.0e+00 Identity = 666/915 (72.79%), Postives = 712/915 (77.81%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010808 vs. TAIR 10
Match: ATMG00860.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein ) HSP 1 Score: 122.5 bits (306), Expect = 1.8e-27 Identity = 58/125 (46.40%), Postives = 81/125 (64.80%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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