
Pay0008083 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGAACCAAGTATGTGCATAAGAGTGCTAAGTACAAGACCTCAGTTAAGGATCCTGGCACACCCGGAGTTTTGGAAATGGTATTGGTCTGAAGTGATTTAAAATTCTTTGTTAATCTACTTAGTATAATAGGGTGCCCTGATGTCTACGCTATTTATTACGTTCGTTTTGCTTGTTTCTCTTCTATTTAACTTATGTACTGAATAGATCTAATTGTATTTGATGCCTATCTCCTTAGCCTATTGTCTTATATAGGTTAATATTGTTTAATGTATTTTCTTTGACACCTGAGTTTTCGTGTCATGTTTGGCTTTGTCTTCTAAATCGTATGTGTGGAATTTAGTAGGTTGCATGTCTAAGATCAGAGTGTCTCCCCATCATAAATTCCATTAGTGCTTACTACAATAAGAAGGAGTGTTTCGCATACCAAGCTAAAGAAAAATTGAAAAGAGGCTCTGATATTCCACTAGGTTCATTTTTCTAACTTTGTATGCGAAACATCTTCTTATGTTGTTGCTAGGAAGTATGGACACATGTTAGACACAGGTATCTTAAAAATGCTTAAGACAAGTGTTCAACATGCAGAAATTTGTGTTCTTCGGTCTCTTTTATCGATAAACTAATAATGTGACTAAAACTCATAGTAGAAAAGGAGTTACAACAAGCAAATAAAACAAGGAACAAGAGGTACACCTGTGCATCTTAACTAGGTTGACACCTACTTAGCGCCCTCATCATGTCCAAACAATCTATAAGAAAGAAGGATAAAAAAACTTTTTTTTTGAAAGAGGTAAGTTCTCTCCCCTCTCTTCTCTCTCCTCTCCTTTCTCCTCTTCTTTCTCCTCTCTCCTTTCTCCTCCCCTTTCCGGTAGCTGGGTTCTTCAGCACACCTTTCCGACAAGTTTCAAAACTCAACATGGAGGTTGTCAATTGCAAAATCGATTAGTCACACTACTGCATTTGGAAAGAGGATGATTGTTGTTTTATTGAAGATGTAGAAGCCTGTAAAAGCATTTCTCTTTTCGATAGCCAACTTATATGGACTTAGTAATAACTGGCTTACTCAAAACTCAAATTGACGGTCATTTTAGAAAATTCGGGGACATTGACAGAGGAAGATTGAGAATATTGAAGTTTCTAACTAAGTCCGGATGGGTTCTAAGTTGCGATCACTGGCCATATTTAGGGGTCTTTTCAATATAAGATTGTGCTCGGGAAAAGACCAACAAGGATGGTTGTTGTTATGGAAGATGTTGGGAAAAATTTGTTGAAAAATTGGATTATGTTAGATGGTGTTCGGGTAATATCTCCAGGATTCCTTCTCTGCATTTGGTAGAAAAAATAAGTTATGTCGAAAAGATAAAGTCTAGTCATTCTAATTCTCTAGCCCCAAGGTCCAAGACTAAGGAAGTCGGTTAGGATCTTAGTCAAAAAAGAAAGTTTCAAGTGCCCAACCATTCTTCCCCTCCATAACAAAAGCAGTGGTTGATCAAGAACCATGAAGTTACTAAGGTCAAATTTGAAAACCTATGGATTACATCAAAATTATTTGCTTCAAATGACTGGAGACTGATCCGTAAGAGGTTGGAAGTTCTTTTCCAAACGAAAATTGTTATATATCCTTTATTTGATGAGAACGCCCTCATTAGTATCGGTCAAGATCAATCTTAGACTTTATCCGTGAGGAAGGAAAATGGCAGGCTTGGGGAATTTCCACCTCAAATTCGAAAGATGGGATAACCTCAAACACAGACGACCACTTGTTCTAAAAGGCTACGGTGGTTGGCTCAAAATAAAAAACCTTCCTCTAGATTACTGGTGTAGAAGTACCTTTGAGGCTACTGGGGATCACTTTGGAGGTCTTATAGACATAGCCAATGAAACTCTGAACTTAACAAATGTTAGTGATTTCCAAATTTAGGTAAAGAACTTATGTGGCTTTGTGTCGTCAACGATTAAAATTACTCACATAAAAACCTGGTAAGATAGGTTTAACGACTGTTACAGGTTTTTGTTTATCTTTGTATGAAATTCTAAAATCCCTCCAGACTTCCGAAGTTTCCTATGTGTGTGGCTTTGAGATAAATTGTTAGGAGAGAAGTTTTGCGTAGCACCTTCTTCAGATTTTGAGAGATTGGATGTATTTTTGTGTCTATGAGTGAAGTATTTGTTGCGATCCTTCCCGGTGACTAGTCGCCCTTCCATCAACGTATAGAGGGCAAGATTGTGATATTGCGCACAATGAACAGTTGTTTGCCTGAACCTCTCCTCCGTCCAGTAACAAGTAAGAGACACTACTGCGCGCGATGAATTTGAAAAAATTTGTAGAATGGCAACTATTTTCTGTCTCACTAGTCCCACTTGACGTAGAAGAAAACAGAGGCCAACAATCAGGTTGAAAGTGAATTAATTGCACGGGCAACTAAAACGGTGCCTTCTTCAATACTGCCGAACCCAAGATAAACAGCTGTTGCAAAATGGCAGTGGGGCCCACTTCTATAGATTTTGCTTTCAAAATTCCAGTAGCCGAAGAGTCATTAATTGAGAGGATTAAATAAAATACGGCCCACTTCATTATCATTATGAGTAATTACAAAATTTGCTCAAATTTACTATTGACAACTCGGCACATTTAAAGCAAAAAACATTACAGAATGCTTCAGCAAAAGAAATTTCACACTCTGTTAGTATAGGAGCCCAACTTTCTCTAGGTTTTGGAATTTCCAACCGTTTCAAGTTTGCGAAAGCAAGTAAACCCACCCATGCTCCAAAAATTCTCAAGCATTACATCCGGAAGCAAACCTCTTTCAATAATGTTTCGACTGCCCTACTAAAGTCAGAATTAAATGGGGTTTGTGACCTTAAAGTCCCCCTTCAGACTCTTTTCGGAATCACTCCCTCAAACACTCCAATTCTGATAAAAACCCGGATCTCCTGGAAGTGTACAGCTTTAAAGCTCAGGCCCTGAATGCTTCTCTAGGTTAGTAAACGCAGATTCTCCATCTAAGCTTTCTAATTTTTCTAAATCCACCATGGCTTCTATACTGCGAGGCTCCCCCTGCAAAGTTGACAATTCTTTTAAGAAGCAGTTTGATTTATTATTTTCTATTAGTGTTAGTAGTGAAGAATCAGCCGGTACTCTCAATGCGTATGACCTTAAATTGGACTCAGAAACTGAAGGGGTAGATCTTAATGTTCTGTTTAATGATGATGGCTTCCCTCCAAATAAAGTTTCCTTGGATCTGCCAAAGGATTTGACGTCAATAGTTAATGTGGAATTATTTTGGCTTAAATTAGCAGGCCAACCTTCCTATTCCTTCTACCTTTCTCAAAGATTGTCTCGAGGTATTCGTCAAGGGGACCCTCTTTCCCCCTTTTTATTTCTCTTAGTAAGTGAAGTTCTAGTAGCAATCATAAACAAACTCTACATTAATGGGCAGTTCGAAGGTTTTCTTGTTGGCAAGGACGATCGATCTCCTTTGCTCCAATTCGCCGATCGCACTCTTCTGTTCTATAAGTATGATGAGAAGATGCTACTTAAGCTTAAGGATGCCATTAGGTTATTCGAATGGTGTTCGGGCTGAAAGTAAATTGGGAGAAATCAGCCCTTAGCGGTATTAATGTGGGTGAGGATGACTTGGTACAAACAGTGAATCGTCTAGGTTGCAAGGCAGAAAAGCTACCGTTTCTATGTTTAGGTCTACCGTTAGGAGGCTATCTTTGGCAAAAGGAGCTTTGGCAACCAGTTATAGATCGAATCTACGAGAATTTAGATTGATGGAAAAGATATAACATCTCTAGAGGAGGTATGTCCTTATGCAACTCAGTACTAGTTAGTCTTCCTACCTATTATCTATCTTTATTTTCAATCCCTGAAAATGTGGCTGCCTCTTTGGAGAAAATCATGTGGAACTTCTTTTGGGAAGGTTATGCTGGTAGCAAAATTAACCACCTTGTCAATTGGAACAAGGTCTCATCACCTCTAAAAAATGAGGTCTCGGCTTAGGTGGAATTAAAGTTCATAACTGCTTTGCTCGCTAAGTGGGGGTGGAGATTCTCAAAGGAAGAGTTAGCTCTTTGGAGATAAATAATTAGAAGCATCTATGGTAAAAAGCCTGGTTTACAAAAGGAAAATCCAGTAACAGTCTAAGGAGTTCTGGGTAAGCATTGCTAGAGTTTGGAGGTCGGTAGACTCATTAGCCCTATTTAAACTTGGTAATGGTCATAGAATCGGTTTTCCGACAGATCTTTGGGTTGGTAACGCCCCTCTTAAGGAGCAATTCTTCAAGCTCTTTAAAATTGCTCTTTTGCCCAACGGTTCAGTTGCAGCACATTGGGACTTTGAAACTTCATCTTGGTCCTTGTCCTTTAGAAGATGTTTGAAAGATGATGAAATTGCAGAATTTCAATCATTTCTATCCCTCCTCTAAACGGAAAAAGTGGTTAATTCTGATGATTATAGATCATGGTCCATTGATCACCATGATCGGTTCACTGTTAAGTTTCGGCTCACCTAAAATCTGCCTCTCCGATGAATAAACACCTTTTTACAGCTATATGGAAATCAAGCAGCCCATGGAGAATTAACATCTTGATTTCGATTATGGTTTTTGGGTCCCTCAACTGTTTAGAAATCATGTAAAAGAAATCCCCTAACAAATGCCTCCTTCCTTCGATTTGTCCTCTATGTATGAAGGCTAATGAGGATATTCCTCATCTTTTTATGACCTGCCCCATTTCATCCTCCGGTTAGGATATTTTTCTTGTTCAATTTTGATTGGGTCTTTGATCGTTCACTAAGCACTAGTGTGATTCAAGTACTGTCGGGTCCAAAGTTACCCAAAAAGCCCTGTATAATGTGGGAAAATTTGTCAAAAGCCATACTTTTAGAATTATGGTTTGAACGAAATCAACGTATCTTCCATGATAAAGCAAGACCAAGGGCAGAAATTATGCATGTAGCAGATCTTAATGTTGCAGCTTGGTGCTCCTT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MGTKYVHKSAKYKTSVKDPGTPGVLEMTECKFVFRPSDPTSASKLDVEFRFIKGHKNTKEGSNKPPWLNLTKDQGGSYIFEFKNFSDLHVCREFVGSALAKLGDAAQAPSERPVVAFPHEQLSKSEMELRMRCLQEDSELQKLHKQFVIGGVLTESEFWAARKKLLERDSSKKSKQLIGFKSSMVLDTKPMSDGRTNKVTFNLTPEIKYQIFALKPAVHQAFLNHVPNKMSEKDFWTKYFRAEYLHSTKNSIAAAAEAAEDEELALFLKDDEILAADTRKKIRHVDPTLDLEADLGDDYTHLPDHGIFRDGGKEITESQNEHYRRTLSQDLNRQGAVVLEGRTIDVDLEDPRTVAEALVRSRHAVEGNERQTALDRISRMTAIEDLQAPHSHPFAPLCIKDPRDYFDAQQANAIKTLDDTRAGMQQTKCSLSTTEAYCSLRESISEIKSSGFNHPIIKPEVALMVYNGLTQNISSTKYQLGKNPQESILESLPNPTKEELLHHWISIQELLKHFWSSYPITTSYLYTKVSSYSYCSINKTIFHLILSIQSPHHIFIHLFLY Homology
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Match: Q3ECP0 (General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TFB1-1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 603.2 bits (1554), Expect = 3.0e-171 Identity = 315/530 (59.43%), Postives = 393/530 (74.15%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9M322 (General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=TFB1-3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 592.8 bits (1527), Expect = 4.0e-168 Identity = 312/530 (58.87%), Postives = 385/530 (72.64%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P32780 (General transcription factor IIH subunit 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=GTF2H1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 121.3 bits (303), Expect = 3.4e-26 Identity = 132/488 (27.05%), Postives = 214/488 (43.85%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9DBA9 (General transcription factor IIH subunit 1 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Gtf2h1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 116.3 bits (290), Expect = 1.1e-24 Identity = 129/497 (25.96%), Postives = 210/497 (42.25%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55FP1 (General transcription factor IIH subunit 1 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=gtf2h1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 107.5 bits (267), Expect = 5.1e-22 Identity = 66/224 (29.46%), Postives = 128/224 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C6E8 (probable RNA polymerase II transcription factor B subunit 1-1 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497008 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1054.3 bits (2725), Expect = 1.8e-304 Identity = 528/530 (99.62%), Postives = 529/530 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EXP7 (probable RNA polymerase II transcription factor B subunit 1-1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439158 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1004.6 bits (2596), Expect = 1.6e-289 Identity = 505/530 (95.28%), Postives = 514/530 (96.98%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IB04 (probable RNA polymerase II transcription factor B subunit 1-1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470852 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1000.3 bits (2585), Expect = 3.1e-288 Identity = 503/530 (94.91%), Postives = 513/530 (96.79%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DNY2 (probable RNA polymerase II transcription factor B subunit 1-1 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022945 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 999.6 bits (2583), Expect = 5.3e-288 Identity = 499/530 (94.15%), Postives = 514/530 (96.98%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DRT9 (probable RNA polymerase II transcription factor B subunit 1-1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022945 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 999.6 bits (2583), Expect = 5.3e-288 Identity = 499/530 (94.15%), Postives = 514/530 (96.98%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. NCBI nr
Match: XP_008457278.1 (PREDICTED: probable RNA polymerase II transcription factor B subunit 1-1 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1054.3 bits (2725), Expect = 3.7e-304 Identity = 528/530 (99.62%), Postives = 529/530 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. NCBI nr
Match: XP_011653743.1 (general transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1034.6 bits (2674), Expect = 3.1e-298 Identity = 518/530 (97.74%), Postives = 525/530 (99.06%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. NCBI nr
Match: KGN54745.2 (hypothetical protein Csa_012761 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1034.6 bits (2674), Expect = 3.1e-298 Identity = 518/530 (97.74%), Postives = 525/530 (99.06%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. NCBI nr
Match: XP_031739948.1 (general transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031739949.1 general transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031739950.1 general transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031739951.1 general transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1033.1 bits (2670), Expect = 8.9e-298 Identity = 519/538 (96.47%), Postives = 527/538 (97.96%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. NCBI nr
Match: XP_038894194.1 (general transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB1-1-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1027.7 bits (2656), Expect = 3.7e-296 Identity = 513/530 (96.79%), Postives = 522/530 (98.49%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. TAIR 10
Match: AT1G55750.1 (BSD domain (BTF2-like transcription factors, Synapse-associated proteins and DOS2-like proteins) ) HSP 1 Score: 603.2 bits (1554), Expect = 2.1e-172 Identity = 315/530 (59.43%), Postives = 393/530 (74.15%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008083 vs. TAIR 10
Match: AT3G61420.1 (BSD domain (BTF2-like transcription factors, Synapse-associated proteins and DOS2-like proteins) ) HSP 1 Score: 592.8 bits (1527), Expect = 2.9e-169 Identity = 312/530 (58.87%), Postives = 385/530 (72.64%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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