Homology
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q9CAF4 (Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 401.4 bits (1030), Expect = 4.0e-110
Identity = 508/1392 (36.49%), Postives = 686/1392 (49.28%), Query Frame = 0
Query: 13 GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRL 72
G GGKF+K RRS TPYDRP T++RN+ GWLSKLVDPAQ+LIT SA RL
Sbjct: 18 GTGGKFRKPTARRSQKTPYDRPTTSVRNAGLGGGDVRGGGWLSKLVDPAQRLITYSAQRL 77
Query: 73 FSTVFRKRL--------PPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVA--ADPSG--TQEGTNVG 132
F ++ RKRL P R N+E + ++E+V+ + +G E TN
Sbjct: 78 FGSLSRKRLGSGETPLQSPEQQKQLPERGVNQETKVGHKEDVSNLSMKNGLIRMEDTNAS 137
Query: 133 FVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTP 192
P G +DLEKIL+ KTF+R E+DRLT LL+S+ AD + E ++ E
Sbjct: 138 VDPP-----KDGFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRNE---VGM 197
Query: 193 VTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP 252
V H + T +G + T + LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP
Sbjct: 198 VVRH--PPSHERDRTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGSRPSEVTP 257
Query: 253 --LSMAGN--------------PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSM 312
L + G P KS T+SLV + P +ENGFVTPRSRGRSA+YSM
Sbjct: 258 SMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTK-PSGQRPLENGFVTPRSRGRSAVYSM 317
Query: 313 ARVPYSRVRATPSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQG---ALKRRNSVLD 372
AR PYSR +++ I + +S S WE+ GS+QG LKRR+SVLD
Sbjct: 318 ARTPYSRPQSSVKI-----------GSLFQASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLKRRSSVLD 377
Query: 373 DDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGK 432
+D+GSVGP+RR RQKSN L L+LP S + + +NGG
Sbjct: 378 NDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSV-------------------RANGG- 437
Query: 433 PLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELK 492
E + SK SAE P SSF +P +SSEMASKIL+QLD K
Sbjct: 438 -----EKTTHTSKDSAED----IPGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------------K 497
Query: 493 LLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESS 552
L+S R SP KLSPSML GPAL+SL+NV++ K+L N+ ++N D + QK + ES
Sbjct: 498 LVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKANSP-DSSYQKQEISRESV 557
Query: 553 PSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIG-SGSGMQVSFVGPSVQ---TKCAFQMSAHEDF 612
+ ++K+ DG + +KD G G+ + + K +F+MSAHEDF
Sbjct: 558 SREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTNSLEEHPPKKRSFRMSAHEDF 617
Query: 613 VDMDEE-GFSNGP--VADK--SFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSV 672
+++D++ G ++ P VA+K +FE+ + +S P + +T PS EA PS
Sbjct: 618 LELDDDLGAASTPCEVAEKQNAFEVEKS------HISMPIGEKPLT-----PS-EAMPST 677
Query: 673 VSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFP-------TTSSPSSTANVKGPE----SSLRP- 732
+ N QG S+ TE++ +FP +S ++ ++G E SS +P
Sbjct: 678 SYISNGDASQGTSNGSLETERNKFVAFPIEAVQQSNMASEPTSKFIQGTEKSSISSGKPT 737
Query: 733 --EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTS 792
EK E PK AA P F SP L+Q + K T ++ S
Sbjct: 738 SEEKRIPLEEPKKPAAVFPNISF---SPPATGLLNQNSGASADIKLEKT---SSTAFGVS 797
Query: 793 EANTEPTKHASTPTTFKFGDKAS-----------FSIPANAAT-ENGNKSAGSLFKFTSP 852
EA +PT+ T + G ++S FS ANA T N S S F
Sbjct: 798 EAWAKPTESKKTFSNSASGAESSTSAAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSNGSLTSSPSFPPS 857
Query: 853 LVNEKEGANVGGSASV---FKAENSSSSIPSFGV-----PKESMSEKAGDKSSSPGLIFG 912
+ N +VG S F A ++SSSI FG S S A SS+ FG
Sbjct: 858 ISNIPSDNSVGDMPSTVQSFAATHNSSSI--FGKLPTSNDSNSQSTSASPLSSTSPFKFG 917
Query: 913 TSGNLFSS-SVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNN---GSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT 972
FS+ +VS S+ S + +T N + G + S ST + N +
Sbjct: 918 QPAAPFSAPAVSESSGQISKETEVKNATFGNTSTFKFGGMASADQSTGIVFGAKSAENKS 977
Query: 973 SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSG 1032
SS+ S P T+ ++ P S + IF SSS P T S +SA S
Sbjct: 978 RPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTA-----AASAPESSGSLIFGVTSSSTPGTETSKISASSA 1037
Query: 1033 VGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1092
+ ++F S S ASTGSSVF F A S+ S ++ + A
Sbjct: 1038 ATNTGNSVFGTSSFAFTSS--GSSMVGGVSASTGSSVFGFNAVSSAS----ATSSQSQAS 1097
Query: 1093 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQFSSS---TSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPAS 1152
N A A + SG +STQS P QF SS SFGL+GN+ LAS SS FG S
Sbjct: 1098 NLFGAGNAQTGNTGSGTTTSTQSIP-FQFGSSPSAPSFGLSGNSSLASNSSPFGFSKSEP 1157
Query: 1153 NPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGF 1212
FTS +T L+S++SSA++S + S+ GTS N P+S P FS+ F SSTP+ F
Sbjct: 1158 AVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMSSPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSSSFTTSSTPT-TF 1217
Query: 1213 SFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA-SPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGS 1272
SFG SS+++ S++ +FG+S+ SP+ +F F S T QP FGNS + FG+
Sbjct: 1218 SFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNTPSPSPIFGFGSTPPTTPQQPVFGNSGTPSQSLFGN 1277
Query: 1273 TPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTVQ---TASPMPSFGQQPLT-PPPSSGFM 1289
+ P NNN+Q SMEDSMAEDT Q + P FGQ ++ P P+ F
Sbjct: 1278 STPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSMEDSMAEDTDQANRASMVAPMFGQAAVSMPQPNFAFG 1309
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q555D2 (Nuclear pore complex protein DDB_G0274915 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=DDB_G0274915 PE=4 SV=2)
HSP 1 Score: 52.0 bits (123), Expect = 5.9e-05
Identity = 177/669 (26.46%), Postives = 300/669 (44.84%), Query Frame = 0
Query: 640 VPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSR 699
+PTT++K I P+T++ ++T ++ G T+ +F +PS
Sbjct: 1057 IPTTSKKEKIDDKPSTTTTTTTTSLFG----------------STTTSGLF----SNPST 1116
Query: 700 KETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFG----DKASFSI 759
T S + GS A+T++ A + ++ T +TPTT FG +S S
Sbjct: 1117 TSTGSLFSSNPLGSTASTSSLFGASTLASTATTT------ATPTTSLFGSTTPSSSSSSS 1176
Query: 760 PANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSE 819
++++T + + SLF +S ++ S+S+F + S+++ S + S+
Sbjct: 1177 SSSSSTTSTTTPSNSLFGTSS--------SSSSTSSSLFGSTTSATTPSSLFGTTTTSSD 1236
Query: 820 KAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSS--PSTNSNLNNGSLVSITPSTL 879
+ ++P L +SG LFS++ ++ PS S S STN + + + T +T
Sbjct: 1237 SKSETKTTPSL---SSGGLFSTTSASPFSIPSSTSSSGLFGSTNQTESKVATTTTTAATT 1296
Query: 880 PTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVP 939
TP+T+ + T+ ++S SS+ T P T SS PS FGS++ P
Sbjct: 1297 ATPSTSLFGSTTTPSTSSSTSSLTTT----PSTGLFGASSSTTPSTGL-----FGSATTP 1356
Query: 940 STSASALSAPSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDT-------AAVKVASTGSSVFQFG 999
ST S+ S S+ + + TT +GL S T + A+T S FG
Sbjct: 1357 STGLFGASSSSSSSSISSSSTTSTTTTPSTGLFGSTTPSTGLFGSTTTAATTTPSTGLFG 1416
Query: 1000 AA-STTSDANKGPANSTFAQN--NIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPAL-QFSSSTS--- 1059
+ S+T+ P N F + FG ++S L +ST +TP+ F SS+S
Sbjct: 1417 STPSSTTSTTTTPPNGLFGSTTPSTALFGTSTPATTSTLTTSTSTTPSTGLFGSSSSIAT 1476
Query: 1060 -------FGLTGN--TGLASGSSLFGS--SAPASNPFTSGAT------FGLASSSSSANN 1119
FG T + T A + LFGS ++ + PF S ++ FG +SSS+S++
Sbjct: 1477 TTPSTGLFGSTSSSTTNTAPSTGLFGSTTTSTTATPFGSSSSTPSTGLFGSSSSSTSSSL 1536
Query: 1120 SVSSSAGTS-SSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTG 1179
S SS+ T + F ST F + ++ PS G +++S+ + + +FGSSS+
Sbjct: 1537 SSSSTTATQPTGLFGSTAPSTGLFGSTTATNPSTGLFGSTTTTSTTTTPSTGLFGSSSST 1596
Query: 1180 ASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTP--------PANNNEQASMEDSMAED 1239
S +F +S+ +++T+ P+ G +A S+P PA +N S +
Sbjct: 1597 PSSTGLFGSSSSTTSSTTTPSTGLFGSAAPSTSSPFSIPTSSTPATSNPFGSNPFPTSSP 1656
Query: 1240 TVQTASPMPS-FGQQPLTPPPSSGFMFG--------STAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQN 1254
T +++P + FG L+ SS +FG +T PS G++PF S + P
Sbjct: 1657 TTVSSTPSSNPFGAPSLSNSTSSSSLFGAPTTSTAATTTPS-FGSSPFGAPSSTSSTPFG 1678
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S3C4Z3 (nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496528 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 2339.3 bits (6061), Expect = 0.0e+00
Identity = 1286/1290 (99.69%), Postives = 1287/1290 (99.77%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ
Sbjct: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP
Sbjct: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
Query: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA
Sbjct: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
Query: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL
Sbjct: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
Query: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS
Sbjct: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
Query: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE
Sbjct: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
Query: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD
Sbjct: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
Query: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS
Sbjct: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
Query: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS
Sbjct: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
Query: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+KETLSQPPTFAFGSKATTTNE
Sbjct: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
Query: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN
Sbjct: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
Query: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS--S 840
EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS S
Sbjct: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSDS 840
Query: 841 VSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
Sbjct: 841 TSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
Query: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT
Sbjct: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
Query: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS
Sbjct: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
Query: 1021 SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS 1080
SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS
Sbjct: 1021 SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS 1080
Query: 1081 SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS 1140
SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS
Sbjct: 1081 SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS 1140
Query: 1141 STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA 1200
STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA
Sbjct: 1141 STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA 1200
Query: 1201 SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA 1260
SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA
Sbjct: 1201 SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA 1260
Query: 1261 SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A5A7SNY9 (Nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold304G001170 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 2339.3 bits (6061), Expect = 0.0e+00
Identity = 1286/1290 (99.69%), Postives = 1287/1290 (99.77%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ
Sbjct: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP
Sbjct: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
Query: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA
Sbjct: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
Query: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL
Sbjct: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
Query: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS
Sbjct: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
Query: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE
Sbjct: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
Query: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD
Sbjct: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
Query: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS
Sbjct: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
Query: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS
Sbjct: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
Query: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+KETLSQPPTFAFGSKATTTNE
Sbjct: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
Query: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN
Sbjct: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
Query: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS--S 840
EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS S
Sbjct: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSDS 840
Query: 841 VSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
Sbjct: 841 TSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
Query: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT
Sbjct: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
Query: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS
Sbjct: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
Query: 1021 SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS 1080
SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS
Sbjct: 1021 SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS 1080
Query: 1081 SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS 1140
SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS
Sbjct: 1081 SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS 1140
Query: 1141 STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA 1200
STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA
Sbjct: 1141 STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA 1200
Query: 1201 SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA 1260
SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA
Sbjct: 1201 SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA 1260
Query: 1261 SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0K9E4 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G046360 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 2159.8 bits (5595), Expect = 0.0e+00
Identity = 1201/1291 (93.03%), Postives = 1227/1291 (95.04%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATERE+VQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLS LVDPA KLI S
Sbjct: 1 MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
+AH LFSTVFRKRLPPPPPSF LSREAN+EMEHRNQEEVAADPSGTQEGTN+GFVPSINS
Sbjct: 61 TAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNIGFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+NTQGLSDLEKIL EKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQVPSTPVTSHG+Q
Sbjct: 121 NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPRGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
EGSPK PTQSQDGVSPHMA THVV ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP
Sbjct: 181 EGSPKLPTQSQDGVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
Query: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIAT DA
Sbjct: 241 LKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA 300
Query: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
YR+TT SSSQSAWEQG LLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLF T L L
Sbjct: 301 YRSTTPSSSQSAWEQGRLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGL 360
Query: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
PSSSTSI ASGI SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYS+E QRNFSK +AESKNAMTPSS
Sbjct: 361 PSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSS 420
Query: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
SFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE
Sbjct: 421 SFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
Query: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
+VDSAKYLENVEGI+SNDA D TSQKNDKFEESSPSK NVPNDKSIST DGVGSSV TKD
Sbjct: 481 DVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKD 540
Query: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
GSGSGMQVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEM+ KVDDSLVS
Sbjct: 541 AGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS 600
Query: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
VSKPKNTE ITV KSK SIEAKP VVSVMNKINDQGKSDVP+TTEKSPIFSFPT SSPS
Sbjct: 601 VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSI 660
Query: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
TANVKG ESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+KE S PPTFAFGSKATTTNE
Sbjct: 661 TANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATTTNE 720
Query: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
QN I VVTSEAN EPT+ AS PTTFKFGDKASF IPANAATENGNKSAGSLFKF SPLVN
Sbjct: 721 QNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVN 780
Query: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSV- 840
EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSSPGLIFGTSGN FSSSV
Sbjct: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGNFFSSSVS 840
Query: 841 -STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
STSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVS TPSTLPTPATTFSNNVTSQNSS+KPS AA
Sbjct: 841 TSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA 900
Query: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
TSNSEPV+STSPP SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPS VGSVE KTKPETT
Sbjct: 901 TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETT 960
Query: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
FGNLSG P SDT+AVKVASTG+SVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS
Sbjct: 961 FGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
Query: 1021 SSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSS 1080
SSGLA STQSTPALQF SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSS
Sbjct: 1021 SSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSS 1080
Query: 1081 SSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGS 1140
SSA+NSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGS
Sbjct: 1081 SSASNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGS 1140
Query: 1141 SSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQT 1200
SSTGA ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDT+QT
Sbjct: 1141 SSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT 1200
Query: 1201 ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFN 1260
ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+PQNPSPFQASGSLDFN
Sbjct: 1201 ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFN 1260
Query: 1261 ASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
ASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 ASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1291
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1FKS9 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 1766.5 bits (4574), Expect = 0.0e+00
Identity = 1035/1310 (79.01%), Postives = 1122/1310 (85.65%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS +SREAN+EME +NQEEVAADP GTQEGTN FVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+N G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ +Q
Sbjct: 121 NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240
EGSPKFP +Q+GV PHM PTHV+NANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM
Sbjct: 181 EGSPKFP--AQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHS 240
Query: 241 ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241 QKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300
Query: 301 PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360
PSIKNS+ATTD+YRAT +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R
Sbjct: 301 PSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRH 360
Query: 361 KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420
KSN LFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPFSS GK YSSET+RN SK
Sbjct: 361 KSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKM 420
Query: 421 SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480
SAES+N TPSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLD LTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSP
Sbjct: 421 SAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSP 480
Query: 481 SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540
SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVE I+SND D TS+K DKFE+SS KS VP+DKSIST
Sbjct: 481 SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST 540
Query: 541 SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600
GVGSSVP+KD S SG+QVSFVGPS TKCAFQMS EDFVDMD+E +SNGPV+ KSF
Sbjct: 541 GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSF 600
Query: 601 EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660
E REKVDDSLV+V KP +TEAITV K + SI+AKPS VS M KINDQ KSDVP TTEKS
Sbjct: 601 ERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSS 660
Query: 661 IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPT 720
IFSFPT S S+TANV PES+ RPEK+AS E+PKAA APIFGFGEK PS+K+ + PT
Sbjct: 661 IFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPT 720
Query: 721 FAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780
F FG+K TT TNEQNA+P VTSE N PT AS PTTFKFGDKA+F IPA+ ATENGN
Sbjct: 721 FTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSE 780
Query: 781 AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGD-KSSSPGL 840
AGS FKF S LVNEKEGA GSASVFK+E+SSSS SFGVPKESMSEKAGD KSSS GL
Sbjct: 781 AGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSSSAGL 840
Query: 841 IFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTS 900
GTSGNL SSVS STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL S TPST P+P+ TF +N+T+
Sbjct: 841 SVGTSGNLLLSSVS-STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGS-TPSTFPSPSNTFPSNITN 900
Query: 901 QNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGV 960
QNSSIKPS AATSNSEPVT+TS SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+ SAPSGV
Sbjct: 901 QNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SAPSGV 960
Query: 961 GSVEAKTKPETT-FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020
GSVE KTK ETT FGN+SG+ PSDT+A KV STGSSVFQFGAASTTSD+NK P STFA
Sbjct: 961 GSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAP 1020
Query: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080
++P+FGAPV +SSG+ASSTQSTP F SSSTSFGLTGNTGLASG+SL GSSAPASN
Sbjct: 1021 VSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNL 1080
Query: 1081 FTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140
FTSGATFG SSSSANNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFGL+SS
Sbjct: 1081 FTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASS 1140
Query: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTG-ASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQ 1200
S+AS+S+PM+FGSS+TG AS SMFSFTSAA+A SQPAFG SN+ FTFGSTPPA NN+
Sbjct: 1141 SAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPA-NNDH 1200
Query: 1201 ASMEDSMAEDTVQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQN 1260
A+MEDSMAEDTVQT +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGGSQQN
Sbjct: 1201 ANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQN 1260
Query: 1261 V--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
V PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 VPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1297
BLAST of Pay0003132 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1FF52 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)
HSP 1 Score: 1761.5 bits (4561), Expect = 0.0e+00
Identity = 1035/1314 (78.77%), Postives = 1122/1314 (85.39%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATERE V YEGGRGGKFQKRP+RRSHTTPYDRPP ALRNS KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREGVHYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPIALRNSNGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS +SREAN+EME +NQEEVAADP GTQEGTN FVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPISREANDEMEIKNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+N G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFE V STPV S+ +Q
Sbjct: 121 NNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240
EGSPKFP +Q+GV PHM PTHV+NANV DEDVASPAEIAKA+MGSRPPKATPLSM
Sbjct: 181 EGSPKFP--AQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHS 240
Query: 241 ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
GNPSKSSTLSLVPRSPGNFD VEN FVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241 QKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFD-VENDFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300
Query: 301 PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360
PSIKNS+ATTD+YRAT +SSSQSAWEQG LL S QGALKRR+SVLDD++GSVGPIRR R
Sbjct: 301 PSIKNSVATTDSYRATVTSSSQSAWEQGRLLESNQGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRH 360
Query: 361 KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420
KSN LFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPFSS GK YSSET+RN SK
Sbjct: 361 KSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKM 420
Query: 421 SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480
SAES+N TPSSSFP+IPLRSSEMA KILEQLD LTPPKEKSSELKL SVRNNSPMKLSP
Sbjct: 421 SAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDKLTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSP 480
Query: 481 SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540
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Sbjct: 481 SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDLTSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSIST 540
Query: 541 SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600
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Sbjct: 541 GGGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCAFQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSF 600
Query: 601 EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660
E REKVDDSLV+V KP +TEAITV K + SI+AKPS VS M KINDQ KSDVP TTEKS
Sbjct: 601 ERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITVDKPQASIQAKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSS 660
Query: 661 IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPT 720
IFSFPT S S+TANV PES+ RPEK+AS E+PKAA APIFGFGEK PS+K+ + PT
Sbjct: 661 IFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSEVPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPT 720
Query: 721 FAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780
F FG+K TT TNEQNA+P VTSE N PT AS PTTFKFGDKA+F IPA+ ATENGN
Sbjct: 721 FTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQASAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSE 780
Query: 781 AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIP----SFGVPKESMSEKAGD-KSS 840
AGS FKF S LVNEKEGA GSASVFK+E+SSSS SFGVPKESMSEKAGD KSS
Sbjct: 781 AGSPFKFASSLVNEKEGAK-AGSASVFKSESSSSSFNCSTLSFGVPKESMSEKAGDKKSS 840
Query: 841 SPGLIFGTSGNLFSSSVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSN 900
S GL GTSGNL SSVS STPTPSLFSFSSP+TNSNL NGSL S TPST P+P+ TF +
Sbjct: 841 SAGLSVGTSGNLLLSSVS-STPTPSLFSFSSPTTNSNLINGSLGS-TPSTFPSPSNTFPS 900
Query: 901 NVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSA 960
N+T+QNSSIKPS AATSNSEPVT+TS SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPS+ SA
Sbjct: 901 NITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SA 960
Query: 961 PSGVGSVEAKTKPETT-FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANS 1020
PSGVGSVE KTK ETT FGN+SG+ PSDT+A KV STGSSVFQFGAASTTSD+NK P S
Sbjct: 961 PSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKS 1020
Query: 1021 TFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP 1080
TFA ++P+FGAPV +SSG+ASSTQSTP F SSSTSFGLTGNTGLASG+SL GSSAP
Sbjct: 1021 TFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAP 1080
Query: 1081 ASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFG 1140
ASN FTSGATFG SSSSANNSVSS AGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STP+GGFSFG
Sbjct: 1081 ASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFG 1140
Query: 1141 LSSSSSASNSAPMVFGSSSTG-ASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPAN 1200
L+SSS+AS+S+PM+FGSS+TG AS SMFSFTSAA+A SQPAFG SN+ FTFGSTPPA
Sbjct: 1141 LASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTSAATAAPSQPAFGTSNHGFTFGSTPPA- 1200
Query: 1201 NNEQASMEDSMAEDTVQTA---SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGG 1260
NN+ A+MEDSMAEDTVQT +PMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAPSPLGANPFQFGG
Sbjct: 1201 NNDHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGG 1260
Query: 1261 SQQNV--PQNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
SQQNV PQNP+PFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 SQQNVPTPQNPNPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1301
BLAST of Pay0003132 vs. NCBI nr
Match:
XP_008456625.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >XP_008456626.1 PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >KAA0031726.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK11787.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo var. makuwa])
HSP 1 Score: 2339.3 bits (6061), Expect = 0.0e+00
Identity = 1286/1290 (99.69%), Postives = 1287/1290 (99.77%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ
Sbjct: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP
Sbjct: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
Query: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA
Sbjct: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
Query: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL
Sbjct: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
Query: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS
Sbjct: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
Query: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE
Sbjct: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
Query: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD
Sbjct: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
Query: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS
Sbjct: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
Query: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS
Sbjct: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
Query: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+KETLSQPPTFAFGSKATTTNE
Sbjct: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
Query: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN
Sbjct: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
Query: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS--S 840
EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSS S
Sbjct: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSDS 840
Query: 841 VSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA
Sbjct: 841 TSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
Query: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT
Sbjct: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
Query: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS
Sbjct: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
Query: 1021 SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS 1080
SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS
Sbjct: 1021 SSGLASSTQSTPALQFSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSSS 1080
Query: 1081 SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS 1140
SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS
Sbjct: 1081 SANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGSS 1140
Query: 1141 STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA 1200
STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA
Sbjct: 1141 STGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQTA 1200
Query: 1201 SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA 1260
SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA
Sbjct: 1201 SPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFNA 1260
Query: 1261 SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 SAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1290
BLAST of Pay0003132 vs. NCBI nr
Match:
XP_011656578.1 (nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >XP_031742754.1 nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >KGN46058.1 hypothetical protein Csa_005234 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 2159.8 bits (5595), Expect = 0.0e+00
Identity = 1201/1291 (93.03%), Postives = 1227/1291 (95.04%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATERE+VQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLS LVDPA KLI S
Sbjct: 1 MATEREDVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSNLVDPAHKLINS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
+AH LFSTVFRKRLPPPPPSF LSREAN+EMEHRNQEEVAADPSGTQEGTN+GFVPSINS
Sbjct: 61 TAHWLFSTVFRKRLPPPPPSFPLSREANDEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNIGFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+NTQGLSDLEKIL EKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVP GVESRKFEQVPSTPVTSHG+Q
Sbjct: 121 NNTQGLSDLEKILNEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPRGVESRKFEQVPSTPVTSHGIQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
EGSPK PTQSQDGVSPHMA THVV ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP
Sbjct: 181 EGSPKLPTQSQDGVSPHMATTHVVTANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMAGNP 240
Query: 241 SKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATTDA 300
KSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIAT DA
Sbjct: 241 LKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIATADA 300
Query: 301 YRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSL 360
YR+TT SSSQSAWEQG LLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLF T L L
Sbjct: 301 YRSTTPSSSQSAWEQGRLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFSTSLGL 360
Query: 361 PSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSS 420
PSSSTSI ASGI SETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYS+E QRNFSK +AESKNAMTPSS
Sbjct: 361 PSSSTSIRASGIGSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSNEIQRNFSKMTAESKNAMTPSS 420
Query: 421 SFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
SFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE
Sbjct: 421 SFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLE 480
Query: 481 NVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKD 540
+VDSAKYLENVEGI+SNDA D TSQKNDKFEESSPSK NVPNDKSIST DGVGSSV TKD
Sbjct: 481 DVDSAKYLENVEGIRSNDARDLTSQKNDKFEESSPSKFNVPNDKSISTGDGVGSSVSTKD 540
Query: 541 IGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVS 600
GSGSGMQVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEM+ KVDDSLVS
Sbjct: 541 AGSGSGMQVSFVGPSIQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMQGKVDDSLVS 600
Query: 601 VSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSS 660
VSKPKNTE ITV KSK SIEAKP VVSVMNKINDQGKSDVP+TTEKSPIFSFPT SSPS
Sbjct: 601 VSKPKNTEVITVDKSKASIEAKPFVVSVMNKINDQGKSDVPSTTEKSPIFSFPTASSPSI 660
Query: 661 TANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNE 720
TANVKG ESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPS+KE S PPTFAFGSKATTTNE
Sbjct: 661 TANVKGTESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSQKEAGSHPPTFAFGSKATTTNE 720
Query: 721 QNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKSAGSLFKFTSPLVN 780
QN I VVTSEAN EPT+ AS PTTFKFGDKASF IPANAATENGNKSAGSLFKF SPLVN
Sbjct: 721 QNTIHVVTSEANVEPTQQASPPTTFKFGDKASFPIPANAATENGNKSAGSLFKFASPLVN 780
Query: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLIFGTSGNLFSSSV- 840
EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKES+SEKAGDKSSSPGLIFGTSGN FSSSV
Sbjct: 781 EKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESISEKAGDKSSSPGLIFGTSGNFFSSSVS 840
Query: 841 -STSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSIKPSSIAA 900
STSTPTPSLFSFS+PSTNSNLNNGSLVS TPSTLPTPATTFSNNVTSQNSS+KPS AA
Sbjct: 841 TSTSTPTPSLFSFSTPSTNSNLNNGSLVSTTPSTLPTPATTFSNNVTSQNSSVKPSFSAA 900
Query: 901 TSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSGVGSVEAKTKPETT 960
TSNSEPV+STSPP SSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSA ALSAPS VGSVE KTKPETT
Sbjct: 901 TSNSEPVSSTSPPTSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSAPALSAPSVVGSVETKTKPETT 960
Query: 961 FGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
FGNLSG P SDT+AVKVASTG+SVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS
Sbjct: 961 FGNLSGFPASDTSAVKVASTGNSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQNNIPAFGAPVSFS 1020
Query: 1021 SSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSS 1080
SSGLA STQSTPALQF SSSTSFGLT NTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSS
Sbjct: 1021 SSGLALSTQSTPALQFSSSSTSFGLTRNTGLASGSSLFGSSAPASNPFTSGATFGLASSS 1080
Query: 1081 SSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGS 1140
SSA+NSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGS
Sbjct: 1081 SSASNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSSSSASNSAPMVFGS 1140
Query: 1141 SSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTVQT 1200
SSTGA ASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDT+QT
Sbjct: 1141 SSTGAPSASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQASMEDSMAEDTIQT 1200
Query: 1201 ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVPQNPSPFQASGSLDFN 1260
ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQF GSQQN+PQNPSPFQASGSLDFN
Sbjct: 1201 ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFSGSQQNLPQNPSPFQASGSLDFN 1260
Query: 1261 ASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
ASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 ASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1291
BLAST of Pay0003132 vs. NCBI nr
Match:
XP_038884354.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 1919.1 bits (4970), Expect = 0.0e+00
Identity = 1105/1308 (84.48%), Postives = 1171/1308 (89.53%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS LSREAN+EME+RNQEEVAADP TQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121 NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240
EG PKFP QSQDGVSPHM THVV+ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA
Sbjct: 181 EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHS 240
Query: 241 ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241 QKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300
Query: 301 PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360
PSIKNS+ATTDAYRA TSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRRNSVLDD+MGSVGPIRR R
Sbjct: 301 PSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRH 360
Query: 361 KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420
KSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPFSS GGK LYSSET+RN SK
Sbjct: 361 KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKM 420
Query: 421 SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480
SAES+N M PSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421 SAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSP 480
Query: 481 SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540
SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDACD TS+KNDKFEESSP K VPNDKSIST
Sbjct: 481 SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSIST 540
Query: 541 SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600
+GVGSSVP K+ SGSG QVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S
Sbjct: 541 GNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISI 600
Query: 601 EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660
E +EKV +SLV+VSKP NTEAITV K + SIEAKP VS MNKINDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601 ERQEKV-NSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSP 660
Query: 661 IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPT 720
IFSFPTTSSPS TANV GPES++RPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PS+KE +S PT
Sbjct: 661 IFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPT 720
Query: 721 FAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780
FAF +K TT TNEQNAIPVVTSE N +PT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+
Sbjct: 721 FAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
Query: 781 AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSPGLI 840
GS F SPLVNEKEGA GGSASVFKAE+SSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS G
Sbjct: 781 EGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSSAGFA 840
Query: 841 FGTSGNLFSSSVST--STPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT 900
GTSG+LFSSSVST STPT LFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPS PTPATTFSNN+T
Sbjct: 841 VGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFSNNIT 900
Query: 901 SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSG 960
+QNSSIKPS AA SNSEPVT+TS P SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSA ALSAPSG
Sbjct: 901 NQNSSIKPSFNAAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALSAPSG 960
Query: 961 VGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1020
VGS+E+KTK ETTFGNLSG+PPSD +AVKV+STGSSVFQFGAAST SD+NK PANSTF
Sbjct: 961 VGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANSTFTP 1020
Query: 1021 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNP 1080
+N+P FGA S SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASN
Sbjct: 1021 SNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNL 1080
Query: 1081 FTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFGLSSS 1140
F SG TFGLASSSSS NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFGLSSS
Sbjct: 1081 FASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGLSSS 1140
Query: 1141 SSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANNNEQA 1200
S+ASNSAP++FGSSSTG+ SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA NN+QA
Sbjct: 1141 SAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-NNDQA 1200
Query: 1201 SMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVP- 1260
+MEDSMAEDTVQT SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFGGSQQNVP
Sbjct: 1201 NMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQNVPT 1260
Query: 1261 --QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 PQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1300
BLAST of Pay0003132 vs. NCBI nr
Match:
XP_038884353.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 1913.3 bits (4955), Expect = 0.0e+00
Identity = 1105/1312 (84.22%), Postives = 1171/1312 (89.25%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS LSREAN+EME+RNQEEVAADP TQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121 NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240
EG PKFP QSQDGVSPHM THVV+ANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA
Sbjct: 181 EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHS 240
Query: 241 ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241 QKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300
Query: 301 PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360
PSIKNS+ATTDAYRA TSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRRNSVLDD+MGSVGPIRR R
Sbjct: 301 PSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRH 360
Query: 361 KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420
KSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPFSS GGK LYSSET+RN SK
Sbjct: 361 KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKM 420
Query: 421 SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480
SAES+N M PSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421 SAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSP 480
Query: 481 SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540
SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDACD TS+KNDKFEESSP K VPNDKSIST
Sbjct: 481 SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSIST 540
Query: 541 SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600
+GVGSSVP K+ SGSG QVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S
Sbjct: 541 GNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISI 600
Query: 601 EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660
E +EKV +SLV+VSKP NTEAITV K + SIEAKP VS MNKINDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601 ERQEKV-NSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSP 660
Query: 661 IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPT 720
IFSFPTTSSPS TANV GPES++RPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PS+KE +S PT
Sbjct: 661 IFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPT 720
Query: 721 FAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780
FAF +K TT TNEQNAIPVVTSE N +PT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+
Sbjct: 721 FAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
Query: 781 AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
GS F SPLVNEKEGA GGSASVFKAE+SSS SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS
Sbjct: 781 EGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSFNCSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
Query: 841 PGLIFGTSGNLFSSSVST--STPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFS 900
G GTSG+LFSSSVST STPT LFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPS PTPATTFS
Sbjct: 841 AGFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFS 900
Query: 901 NNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALS 960
NN+T+QNSSIKPS AA SNSEPVT+TS P SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSA ALS
Sbjct: 901 NNITNQNSSIKPSFNAAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALS 960
Query: 961 APSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANS 1020
APSGVGS+E+KTK ETTFGNLSG+PPSD +AVKV+STGSSVFQFGAAST SD+NK PANS
Sbjct: 961 APSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANS 1020
Query: 1021 TFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP 1080
TF +N+P FGA S SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP
Sbjct: 1021 TFTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP 1080
Query: 1081 ASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFG 1140
ASN F SG TFGLASSSSS NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFG
Sbjct: 1081 ASNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFG 1140
Query: 1141 LSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN 1200
LSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+ SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA N
Sbjct: 1141 LSSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-N 1200
Query: 1201 NEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQ 1260
N+QA+MEDSMAEDTVQT SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFGGSQQ
Sbjct: 1201 NDQANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQ 1260
Query: 1261 NVP---QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
NVP NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 NVPTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1304
BLAST of Pay0003132 vs. NCBI nr
Match:
XP_038884355.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 1901.7 bits (4925), Expect = 0.0e+00
Identity = 1102/1312 (83.99%), Postives = 1167/1312 (88.95%), Query Frame = 0
Query: 1 MATEREEVQYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITS 60
MATEREEV+YEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA KGWLSKLVDPAQKLITS
Sbjct: 1 MATEREEVRYEGGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAGKGWLSKLVDPAQKLITS 60
Query: 61 SAHRLFSTVFRKRLPPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVAADPSGTQEGTNVGFVPSINS 120
SAHRLFS+VFRKRLPPPPPS LSREAN+EME+RNQEEVAADP TQEGTNV FVPSINS
Sbjct: 61 SAHRLFSSVFRKRLPPPPPSLPLSREANDEMENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINS 120
Query: 121 SNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTPVTSHGLQ 180
+NT G+SDLEKILKEKTF+RFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES K EQVPSTPV S+G Q
Sbjct: 121 NNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQ 180
Query: 181 EGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA--- 240
EG PKFP QSQDGVSPHM THV VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMA
Sbjct: 181 EGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHV----VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHS 240
Query: 241 ---------GNPSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSMARVPYSRVRAT 300
GNPSKS TLSL+PRSPGNFD VENGFVTPRSRGRSALYSMAR+PYSRVRAT
Sbjct: 241 QKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFD-VENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRAT 300
Query: 301 PSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQ 360
PSIKNS+ATTDAYRA TSSSSQSAW QG LLGS+QGALKRRNSVLDD+MGSVGPIRR R
Sbjct: 301 PSIKNSVATTDAYRA-TSSSSQSAWGQGRLLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRH 360
Query: 361 KSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQRNFSKT 420
KSNHLFP GLSLPSSSTSIP SGI SET++HLQSTKVHPFSS GGK LYSSET+RN SK
Sbjct: 361 KSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKM 420
Query: 421 SAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSP 480
SAES+N M PSSSFP+IPLRSSEMASKILEQLD LTPPKEKSSELKLLSVRNNSP KLSP
Sbjct: 421 SAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKILEQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSP 480
Query: 481 SMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPNDKSIST 540
SMLHGPALRSLE+VDSAKYLENVEGI+SNDACD TS+KNDKFEESSP K VPNDKSIST
Sbjct: 481 SMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSNDACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSIST 540
Query: 541 SDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVSFVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSF 600
+GVGSSVP K+ SGSG QVSFVGPS+QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEG+SNGPVAD S
Sbjct: 541 GNGVGSSVP-KETVSGSGQQVSFVGPSLQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISI 600
Query: 601 EMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSVVSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSP 660
E +EKV +SLV+VSKP NTEAITV K + SIEAKP VS MNKINDQGKSDVP TTEKSP
Sbjct: 601 ERQEKV-NSLVAVSKPNNTEAITVDKPQASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSP 660
Query: 661 IFSFPTTSSPSSTANVKGPESSLRPEKVASPELPKAATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPT 720
IFSFPTTSSPS TANV GPES++RPEK+AS E+PKAAT PIFGFGEK PS+KE +S PT
Sbjct: 661 IFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKIASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPT 720
Query: 721 FAFGSKATT-TNEQNAIPVVTSEANTEPTKHASTPTTFKFGDKASFSIPANAATENGNKS 780
FAF +K TT TNEQNAIPVVTSE N +PT+ AS PTTFKFGDKA+F IPANAATENGNK+
Sbjct: 721 FAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQPTQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKN 780
Query: 781 AGSLFKFTSPLVNEKEGANVGGSASVFKAENSSS----SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
GS F SPLVNEKEGA GGSASVFKAE+SSS SIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS
Sbjct: 781 EGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFKAESSSSSFNCSIPSFGVPKESMSEKAGDKSSS 840
Query: 841 PGLIFGTSGNLFSSSVST--STPTPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSITPSTLPTPATTFS 900
G GTSG+LFSSSVST STPT LFSFSSPSTNSNLNNGSLVS TPS PTPATTFS
Sbjct: 841 AGFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTTPS-FPTPATTFS 900
Query: 901 NNVTSQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALS 960
NN+T+QNSSIKPS AA SNSEPVT+TS P SS MPSFSAAPI KFGSSSVPSTSA ALS
Sbjct: 901 NNITNQNSSIKPSFNAAASNSEPVTTTSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALS 960
Query: 961 APSGVGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANS 1020
APSGVGS+E+KTK ETTFGNLSG+PPSD +AVKV+STGSSVFQFGAAST SD+NK PANS
Sbjct: 961 APSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPPSDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANS 1020
Query: 1021 TFAQNNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQF-SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP 1080
TF +N+P FGA S SSGLASSTQSTP LQF SSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP
Sbjct: 1021 TFTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQSTPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAP 1080
Query: 1081 ASNPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPSGGFSFG 1140
ASN F SG TFGLASSSSS NNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTP+GGFSFG
Sbjct: 1081 ASNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSSSAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFG 1140
Query: 1141 LSSSSSASNSAPMVFGSSSTGASPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSNNAFTFGSTPPANN 1200
LSSSS+ASNSAP++FGSSSTG+ SMFSFTSAA+ATTSQPAFGNSN+ FTFGSTPPA N
Sbjct: 1141 LSSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPSMFSFTSAATATTSQPAFGNSNHGFTFGSTPPA-N 1200
Query: 1201 NEQASMEDSMAEDTVQT-ASPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQ 1260
N+QA+MEDSMAEDTVQT SPMPSFGQQPLTPPPSSGF+FGSTAP PLGA+PFQFGGSQQ
Sbjct: 1201 NDQANMEDSMAEDTVQTVTSPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGGSQQ 1260
Query: 1261 NVP---QNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKYVKVKSKSRKK 1289
NVP NPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRK+VKVKSKSRKK
Sbjct: 1261 NVPTPQNNPSPFQASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVKSKSRKK 1300
BLAST of Pay0003132 vs. TAIR 10
Match:
AT3G10650.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1); Has 61042 Blast hits to 31782 proteins in 2093 species: Archae - 202; Bacteria - 16480; Metazoa - 16017; Fungi - 12552; Plants - 1653; Viruses - 629; Other Eukaryotes - 13509 (source: NCBI BLink). )
HSP 1 Score: 401.4 bits (1030), Expect = 2.8e-111
Identity = 508/1392 (36.49%), Postives = 686/1392 (49.28%), Query Frame = 0
Query: 13 GRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------AKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRL 72
G GGKF+K RRS TPYDRP T++RN+ GWLSKLVDPAQ+LIT SA RL
Sbjct: 18 GTGGKFRKPTARRSQKTPYDRPTTSVRNAGLGGGDVRGGGWLSKLVDPAQRLITYSAQRL 77
Query: 73 FSTVFRKRL--------PPPPPSFSLSREANEEMEHRNQEEVA--ADPSG--TQEGTNVG 132
F ++ RKRL P R N+E + ++E+V+ + +G E TN
Sbjct: 78 FGSLSRKRLGSGETPLQSPEQQKQLPERGVNQETKVGHKEDVSNLSMKNGLIRMEDTNAS 137
Query: 133 FVPSINSSNTQGLSDLEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVESRKFEQVPSTP 192
P G +DLEKIL+ KTF+R E+DRLT LL+S+ AD + E ++ E
Sbjct: 138 VDPP-----KDGFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRNE---VGM 197
Query: 193 VTSHGLQEGSPKFPTQSQDGVSPHMAPTHVVNANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATP 252
V H + T +G + T + LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP
Sbjct: 198 VVRH--PPSHERDRTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGSRPSEVTP 257
Query: 253 --LSMAGN--------------PSKSSTLSLVPRSPGNFDVVENGFVTPRSRGRSALYSM 312
L + G P KS T+SLV + P +ENGFVTPRSRGRSA+YSM
Sbjct: 258 SMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTK-PSGQRPLENGFVTPRSRGRSAVYSM 317
Query: 313 ARVPYSRVRATPSIKNSIATTDAYRATTSSSSQSAWEQGGLLGSKQG---ALKRRNSVLD 372
AR PYSR +++ I + +S S WE+ GS+QG LKRR+SVLD
Sbjct: 318 ARTPYSRPQSSVKI-----------GSLFQASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLKRRSSVLD 377
Query: 373 DDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSETARHLQSTKVHPFSSNGGK 432
+D+GSVGP+RR RQKSN L L+LP S + + +NGG
Sbjct: 378 NDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSV-------------------RANGG- 437
Query: 433 PLYSSETQRNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASKILEQLDILTPPKEKSSELK 492
E + SK SAE P SSF +P +SSEMASKIL+QLD K
Sbjct: 438 -----EKTTHTSKDSAED----IPGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------------K 497
Query: 493 LLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVEGIQSNDACDPTSQKNDKFEESS 552
L+S R SP KLSPSML GPAL+SL+NV++ K+L N+ ++N D + QK + ES
Sbjct: 498 LVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKANSP-DSSYQKQEISRESV 557
Query: 553 PSKSNVPNDKSISTSDGVGSSVPTKDIG-SGSGMQVSFVGPSVQ---TKCAFQMSAHEDF 612
+ ++K+ DG + +KD G G+ + + K +F+MSAHEDF
Sbjct: 558 SREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTNSLEEHPPKKRSFRMSAHEDF 617
Query: 613 VDMDEE-GFSNGP--VADK--SFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAITVVKSKPSIEAKPSV 672
+++D++ G ++ P VA+K +FE+ + +S P + +T PS EA PS
Sbjct: 618 LELDDDLGAASTPCEVAEKQNAFEVEKS------HISMPIGEKPLT-----PS-EAMPST 677
Query: 673 VSVMNKINDQGKSDVPTTTEKSPIFSFP-------TTSSPSSTANVKGPE----SSLRP- 732
+ N QG S+ TE++ +FP +S ++ ++G E SS +P
Sbjct: 678 SYISNGDASQGTSNGSLETERNKFVAFPIEAVQQSNMASEPTSKFIQGTEKSSISSGKPT 737
Query: 733 --EKVASPELPK--AATAPIFGFGEKSPSRKETLSQPPTFAFGSKATTTNEQNAIPVVTS 792
EK E PK AA P F SP L+Q + K T ++ S
Sbjct: 738 SEEKRIPLEEPKKPAAVFPNISF---SPPATGLLNQNSGASADIKLEKT---SSTAFGVS 797
Query: 793 EANTEPTKHASTPTTFKFGDKAS-----------FSIPANAAT-ENGNKSAGSLFKFTSP 852
EA +PT+ T + G ++S FS ANA T N S S F
Sbjct: 798 EAWAKPTESKKTFSNSASGAESSTSAAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSNGSLTSSPSFPPS 857
Query: 853 LVNEKEGANVGGSASV---FKAENSSSSIPSFGV-----PKESMSEKAGDKSSSPGLIFG 912
+ N +VG S F A ++SSSI FG S S A SS+ FG
Sbjct: 858 ISNIPSDNSVGDMPSTVQSFAATHNSSSI--FGKLPTSNDSNSQSTSASPLSSTSPFKFG 917
Query: 913 TSGNLFSS-SVSTSTPTPSLFSFSSPSTNSNLNN---GSLVSITPSTLPTPATTFSNNVT 972
FS+ +VS S+ S + +T N + G + S ST + N +
Sbjct: 918 QPAAPFSAPAVSESSGQISKETEVKNATFGNTSTFKFGGMASADQSTGIVFGAKSAENKS 977
Query: 973 SQNSSIKPSSIAATSNSEPVTSTSPPMSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSTSASALSAPSG 1032
SS+ S P T+ ++ P S + IF SSS P T S +SA S
Sbjct: 978 RPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTA-----AASAPESSGSLIFGVTSSSTPGTETSKISASSA 1037
Query: 1033 VGSVEAKTKPETTFGNLSGLPPSDTAAVKVASTGSSVFQFGAASTTSDANKGPANSTFAQ 1092
+ ++F S S ASTGSSVF F A S+ S ++ + A
Sbjct: 1038 ATNTGNSVFGTSSFAFTSS--GSSMVGGVSASTGSSVFGFNAVSSAS----ATSSQSQAS 1097
Query: 1093 NNIPAFGAPVSFSSSGLASSTQSTPALQFSSS---TSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPAS 1152
N A A + SG +STQS P QF SS SFGL+GN+ LAS SS FG S
Sbjct: 1098 NLFGAGNAQTGNTGSGTTTSTQSIP-FQFGSSPSAPSFGLSGNSSLASNSSPFGFSKSEP 1157
Query: 1153 NPFTSGATFGLASSSSSANNSVSSSA---GTSSSFFNWQPSSTPSFSTGF--SSTPSGGF 1212
FTS +T L+S++SSA++S + S+ GTS N P+S P FS+ F SSTP+ F
Sbjct: 1158 AVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMSSPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSSSFTTSSTPT-TF 1217
Query: 1213 SFGLSSSSSASNSAPMVFGSSSTGA-SPASMFSFTSAASATTSQPAFGNSN--NAFTFGS 1272
SFG SS+++ S++ +FG+S+ SP+ +F F S T QP FGNS + FG+
Sbjct: 1218 SFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNTPSPSPIFGFGSTPPTTPQQPVFGNSGTPSQSLFGN 1277
Query: 1273 TPPA------------NNNEQASMEDSMAEDTVQ---TASPMPSFGQQPLT-PPPSSGFM 1289
+ P NNN+Q SMEDSMAEDT Q + P FGQ ++ P P+ F
Sbjct: 1278 STPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSMEDSMAEDTDQANRASMVAPMFGQAAVSMPQPNFAFG 1309
BLAST of Pay0003132 vs. TAIR 10
Match:
AT5G20200.1 (nucleoporin-related )
HSP 1 Score: 83.6 bits (205), Expect = 1.3e-15
Identity = 195/785 (24.84%), Postives = 314/785 (40.00%), Query Frame = 0
Query: 12 GGRGGKFQKRPIRRSHTTPYDRPPTALRNSAAKGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSTVFR 71
GG GGK +++ RR TPY RP + W+S++VDPA ++I+ A R+ F
Sbjct: 22 GGVGGKLKRQSARRHAATPYSRP--TQNQVQRRPWISRIVDPAYRIISGGATRILPYFFS 81
Query: 72 KRLPPPPPSFSLSREANEEMEHR------------------NQEEVAA----DPSGTQEG 131
P +L+ ++ +H+ N+ E A+ PSGT
Sbjct: 82 NAASAP----ALAAPPEDQNQHQGELQNNPQDNDPSVTPISNKPEPASIEVGGPSGTANV 141
Query: 132 TNVGFVPSINSSNTQGLSD------LEKILKEKTFSRFEIDRLTELLKSRVADVPSGVES 191
F S L+D LE++++ KTFS+ EIDRL E++ SR D+P
Sbjct: 142 NEGNFSISAQRRGKAALNDDVAISELERLMEGKTFSQAEIDRLIEMISSRAIDLPDVKRD 201
Query: 192 RKFEQVPSTPVTSHGLQ-EGSPKFPTQSQDGVSPHMA-PTHVVNANVLDEDV------AS 251
+ ++P + K P +D S A PT + + +LD D S
Sbjct: 202 ERNLEIPLREGAKKNMSLFDKAKEPIGGKDANSEIWATPTPLAKSIILDGDKIRDEVGLS 261
Query: 252 PAEIAKAYMGSRPPKAT-------------PLSMAGNPSKSSTLSLVPRS--PGNFDVVE 311
PAE+AKAYMG + ++ SM S ++ S P + PG +
Sbjct: 262 PAELAKAYMGGQTSSSSSQGFVARNEKDCLDRSMLVGKSSLASPSSKPSACWPGIKSSEQ 321
Query: 312 NGFVTPRSRGRS-ALYSMARVPYSRVRATPSIKNSIA---TTDAYRATTSSSSQSAWEQG 371
+GF TP+SR S L + R PYSR + S + + + + S SQS +
Sbjct: 322 SGFATPQSRRESYGLQNFPRTPYSRTILSNSKSKLMQLQNDSSKHLSNLQSPSQSVERRY 381
Query: 372 GLLGSKQGALKRRNSVLDDDMGSVGPIRRTRQKSNHLFPTGLSLPSSSTSIPASGIRSET 431
G L + D G GP RRTRQ + + S PS S R E
Sbjct: 382 GQLSKGR------------DGGLFGPSRRTRQSATPSMVSPYSRPSRGAS------RFEN 441
Query: 432 ARHLQSTKVHPFSSNGGKPLYSSETQ-RNFSKTSAESKNAMTPSSSFPRIPLRSSEMASK 491
+ ++ SS G+ Y S +Q + K +T +P SS++A
Sbjct: 442 SAIMK-------SSEAGESSYLSRSQITTYGKHKEAEVGTLT-------VPTHSSQIART 501
Query: 492 ILEQLD---ILTPPKEKSSELKLLSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLENVDSAKYLENVE 551
IL+ L+ + PK K++ELKL + + P + +++ SAK E+++
Sbjct: 502 ILDHLERTQSQSTPKNKTAELKLATSWRH-PQSSKTVEKSSSDVTNVKKDGSAKLHEDIQ 561
Query: 552 GIQSNDACDPTSQKNDKFEESSPSKSNVPN--DKSISTSDGVGSSVPTKDIGSGSGMQVS 611
I S +Q + + + + ++ N +K+ S ++G+ G G+ +Q
Sbjct: 562 NIFSQ------NQPSSVLKPPATTTGDIQNGMNKTASATNGIFRGTQAASSG-GNALQYE 621
Query: 612 FVGPSVQTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGFSNGPVADKSFEMREKVDDSLVSVSKPKNTEAI 671
F P K + S H DE G S+ D + + ++ KP +
Sbjct: 622 FGKP----KGSLSRSMH------DELGTSS---QDAAKAVPYSFGGETANLPKPPSHSLG 681
Query: 672 TVVKSKPSIE-AKPSVVSVMNKINDQG------KSDVPTTTEKSPIFSFPTTSSPSSTAN 722
PSI AKP + ++ G SD T++E + P T+SP A+
Sbjct: 682 NNKPVLPSISVAKPFQKWAVPSGSNAGFTFPVSSSDGTTSSEPTTPSIMPFTTSP-PVAS 741
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q9CAF4 | 4.0e-110 | 36.49 | Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 S... | [more] |
Q555D2 | 5.9e-05 | 26.46 | Nuclear pore complex protein DDB_G0274915 OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 G... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A1S3C4Z3 | 0.0e+00 | 99.69 | nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496528 P... | [more] |
A0A5A7SNY9 | 0.0e+00 | 99.69 | Nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN... | [more] |
A0A0A0K9E4 | 0.0e+00 | 93.03 | Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G046360 PE=4 SV=1 | [more] |
A0A6J1FKS9 | 0.0e+00 | 79.01 | nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... | [more] |
A0A6J1FF52 | 0.0e+00 | 78.77 | nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
XP_008456625.1 | 0.0e+00 | 99.69 | PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucumis melo] >XP_008456626.1... | [more] |
XP_011656578.1 | 0.0e+00 | 93.03 | nuclear pore complex protein NUP1 [Cucumis sativus] >XP_031742754.1 nuclear pore... | [more] |
XP_038884354.1 | 0.0e+00 | 84.48 | nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida] | [more] |
XP_038884353.1 | 0.0e+00 | 84.22 | nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 [Benincasa hispida] | [more] |
XP_038884355.1 | 0.0e+00 | 83.99 | nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X3 [Benincasa hispida] | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
AT3G10650.1 | 2.8e-111 | 36.49 | BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.... | [more] |
AT5G20200.1 | 1.3e-15 | 24.84 | nucleoporin-related | [more] |