Pay0001851 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCAGATTTTCGTGAAAACCCTAACGGGGAAGACGATTACGTTGGAAGTTGAGTCCAGCGACACCATCGACAATGTCAAAGCTAAGATCCAGGATAAGGAAGGTTGGGTTTCTGGTTTCTGAAGCAATATTTCTTCCTTTTCTTCTGTTTTTATCCTTTGAAATACGCATGTTTTGGATTTTTACAATTCACGGTGCATGTTTCAGGTATTCCCCCTGACCAGCAGAGACTTATCTTTGCCGGGAAGCAGCTCGAGGATGGGCGAACGCTCGCTGACTACAATATCCAGAAAGGTTTGTACCATGCGTTTCATTGTCTTTTTTTCTTTCCCATTGAGAAAATTAAATTGGGCTAATGAAGTAAAATAAAAATAGTGTATTGTTTGTGGACGAGGTAATCTTATCTACTGGGTATGCTTTAATGGAAACTTTGAATAGGCATGGTTTAATCGTTAATGAGCGTTGTACGTTCATGTGGAAGAAACTGGATTTGAAGTTTCTCATACTATCAAGGAATGACTTCTAACGTTCAGCTATCTAGTTTTATTGAAAAAAAACTGAACTTCTCTGGTTGCGAAACAATAAGGAATTTGAGCTTGTTCGGTGTTTTAGCTATTGAATATTAAGCAGAGGATCTTTACGAATTGATAGGTCTCTAACTGATAATCTGTGCTTACATCTTAAATTTACGGTTTAGCTTACGTGATTTTTGGGAGTTCAATCACACTCTTGAGTTTTTATTAAGTGCATTGTTCTAAGAAGTGAAATTGAATCTCATTGCTTTGTTTTTGTAATTTTTTTTTGCAGAGTCGACACTACACCTGGTGCTCAGGCTTCGTGGTGGTATTATTGAGCCGTCTTTGATGGCATTGGCTAGGAAGTACAATCAGGACAAGATGATCTGCCGCAAGTAAGCTTCAATAATATGCTTAATTATTTGCGTAAGAATGTTCTGAAACTGGTTGTAACAGTCTTACAATTACATTGTACACGGAGTTGGATCATGGGTGGTTAAGTTTCAGTCTCCAAACCGTCTTCCTAGACATCCTATTTTTTTAGACCCTGAATCACTGAATGCCTTGGAGAACATCTAATTTATATTGTATATGCACTTACGGATGCTTACATAGTCGTTATCTGAAGTCAATCGGGTACAATTAAATTGCAGGTGCTATGCCCGCCTGCACCCTCGTGCTGTCAACTGCAGGAAAAAGAAGTGTGGACACAGCAACCAGGTGAATAAATTTTTAAAATTCTGCTAAAAATGTTTTTTGCCAATACAATTTGATACTTCAAATTTGCTGCAGAACTTAGCCTTTTTTTTGTTTATCGTTTGATTTGCAGTTGAGGCCAAAGAAGAAGATCAAGTAGACCGTTGATTTTGATCAGAGAGTATGCAAAAGTCTATGCTTTGATTTATTTTCAGGATTGCTTATGCTTAGAGCCATTTGGCTTATACTCATTAGGAGTTTGAACTGTTATGTTTTTCGCTTTTTAACATTCTCGAGAAACGGCATGTTTTGTTGTTGAACTGAGTACGAAATTTTCAGCTTCTTATTTCCCATTTCTTGGCTCTTTACTTTATCAACCAATATAACAACGCAAAATACTAAAAATAATTACAAGAGTTAAAATAAAAGTTTGATAAGTCCTAGAATCGAATACTACTTTGGAATGAAACTTAGAAGTTCATGTAAAATGTACCTTTTCGAACTTGATCAACTACTGATCTTAGTTAAAAGATGTTGCTCAGAAGTCATGACCCAGAAAGGAATGAAATTCAGCAATTTTGTGTGCATCGCCTTAGGCTCAGTGCTGATTGAGCTGTCTGCGTTATTTCTTGGATGCTACTAATGCATTTCAAAGTAATACAGTTCCTATATCACTTCGTGTAAATTGCACAAAGATAAGGATGGAAGGTACAAAGATAAGGCTGGAATGTACTTGCTAAAACAGCTAGCAGTCAAAAGTTCCTCGGTGTTTTTTTGAAAATGGCTAAAAAGGGTTCGATTACTTTTAGGATAACTTTTATGACAATTGATAGTGGAAAATTAATTTTGTCCTTAAATGAAAATTTTCAAACATGAAAGTCATTCAATATTAGATATTCAATATGCAATGTTATGGGTGAGACAAACCCTTTCCGTCAACACATATGCAATGTTGTTGGTGAGACAACAATGATAATGGTGAACGTATGCTGGCAATTACCATTTTAGGCATTTTAATTAGTTTATCCTTTATCCTTGCATCTAATTAATTTATCCTTTGTTACCATTTTGTGCATTTTAATTAGTTTATCCTTTGTCCTGACATCTGACTAATTTATCATTTGTTTTTGCTGTTTTTCATCTACGGCGACTTCTATTTCAAATCGGCATCTGACTAATTTATGGTTTGTTTTTGCTGTTTTCCATCTACGGTGACTTCTATTTCAAATCAATTTTTCTTTCCATCTTTTTCGAGGTCTTTTTCATTCTCCATCTTGAGTGCCCTCCATTTCAAACTTCTACCTGCAAAAACCTCCCATTTTCACCTACCTTTTCCCCACCTTATTCCCTTTTCTCGCCATTTCCATCTGTTTGTTATGAAGTTTGGAAATTATGTTGTCCGGTTGTGGTGGTATTGTTTGATTATAGATTAATTTGTTGTGGACACCATGTGTTCGTTAAAAGTCTCGAAGGAAGCTTTTGTTGGGTATTTGTAGAATTTTCATTTATGGCTTCAGACTTCAGTAGTTTACGCTTCGTCATCACAAAAGTCTTGGAGGGCTATCCACGTGGTTATGGAGCTATGTTGCTATTTATTTGTGTGAGATTTTATATCTTTTGCTTGCCAATGAATGCTGGTTTTTTGTTAAATGAGATGGTTTACTAAATTTAATTTTGATTGATTATAACAATTTGCCTATTTTATATACGCTAGTTGGTCATGCTTTTGACTTTTGAGGAGAAAAATATATCTGAGATGAAATTCAAGTTTTCTTGTGCTACTTGTACTAAAAACTAGCAATAATTTACATGAACCGGTAACACCATAATATATTGGGATGGAAAATATTGTATTTGATCATATTTACTACTTTGGAACTATGTGATATGGGAAATGAGAGATCGTCCCCCATTTAGTCATGATGCCATTTAGAAAATTGGCTATTGTTTTATTACACTAATGAAGTACTGAAATTAAGAGGGCCAACTTATTTGGAACACCATCATTTTTAGGTGCATTATCACTTTTAGGTACTTATATTTTATCTCGCACACATCTCGCACGTTCAAAACTTTCACTAGGTTTCAAAATCAAATTTATGTCTCTCTTAAGTCCTTTGGAGTGCTTTTGTGCATGTTTTGGAAGCCTTTTAGGTACTTATGTATCATCTCGCACACATCTCACACATATCGCACTTTTACTATGGGTTTTGAAATCAAAAATTTTACCTCTCTTATTTGTTCCTTTTTATTTCAGCCTTTCGTTATGACATCGACATCGATTAACACACCCATGTACACAATTAAGTTGTCCTATCATTTTCAGGCTCTAGTAAGTTGTTTGTCTCCTTTGGAAAACACAACACGTAATATTAAGGCTAAACTCAAACTAGATCAGTTAGCTTTATTTAGGAAAACAAGGTTCGGCCACTTTTTGGACCTTTAATGTACCACCCATTCATTACTTATTGTTAAGGGAGGTAGAAGATGAAATGAAAGATCGTATAAGTTTATTGTCAAGGGGTGTTGCTTGTACTTTTGGTAGAAGGGAGTTAAAATTGTAACCGGTCTACAGGGTCCCAAAAAAGGGTCATTTTAGTCTGTTGAAAATAATAGATTGTTGGAGAAGTTATTCAAAGACAAAAGTCTATTTATGTAGGCGAGTTAGAGCACACATTTTTGGAATACGATGGTGATGACGATGTTATGATCAAATAAACTTTGGTGTATTTTATAGAGCTATGCTTATTAGGAAAAGATAGAAGAACCAAAGTGGACAAATTTTTTTTAACAACTACTAATGCTAAGGACACATTTGATAATTATGATTGGGCAGGAATTGTGTTTTGACGCATGCTTAGTGGCTTAAAAAGAGCATTGGACATACAATATGCCAAGGGAAAGAGGAAGTCTACTAAGACAAAATATACTTTCTTAGGATTCCCGCATCCATTACATGTATGTTACTTTCTACTTTAAACTTTTTTTTTTTAATTTCGTACTACATGAACTTTATTTTTGTTTTTCAAATGTGAAATAGGCTTGAACATATGAGTCTATACTAACCATCATTGGATGTGGTGTAGAGAAAGTAAACGATGATGTGATAACACGTATGCTAAGGTGGGTGTGCCAACGACCACAGAAGTCTCATATTACACAAGACCAGGTGTTTGAGTCGCCGATGGTAAGTAAGCAGGTAACTAACTTGAGGATTATTTGTTCCTTTTTGTTTGCCCTAAATACATTTGCTTTTTCTCTGCCCTAAATATATTTGTTTTTTCTCTTTTTAGTTGATAATTAAGGTGGTCATTGAGATGACTCCTGCAAAGGAGTAGTTAAGAATTAGTTTAGGTGAAGTTTTTGACGAACTCTACCCATCTAACATTGTTGATACGAAGAATGACGGTTCAAAAAGAGTAAGAGAAGTTAGTAATGATAAAGGTGACTTAGAAAAGAGTAGAAAACAAAAGTGGAAGTTTGAGATGAACGAGGCTATTAGGAATCTTGACGATCAAGTAACAGTCATTGAAAATCAACTTATAATTCTAAAATTAGATATTGCAAAATTGAAGGGCATGATATCCACCATCTTCAAACACATTGAACTCCAAAAAAGGGTTATGAATTTAAGTCTTGCTTTTTAAAAACTGTTAATGCTTTTTTGATCTTTGTATCGAGTTTAGTTTCTATCATTATCCTTACTAATGCATGTTGAGCTTCCATAGGGTTCATATTGAGTTAGAGCAGCTAATCAACATGTCGAAGAAGGTTCATATTGGT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Match: Q58G87 (Polyubiquitin 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=UBQ3 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 263.5 bits (672), Expect = 1.9e-69 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CG85 (Polyubiquitin OS=Nicotiana sylvestris OX=4096 GN=UBI11 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 2.5e-69 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CH04 (Polyubiquitin OS=Petroselinum crispum OX=4043 GN=PCUBI4-1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 2.5e-69 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CH05 (Polyubiquitin OS=Petroselinum crispum OX=4043 GN=PCUBI4-2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 2.5e-69 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A3P5Z3I3 (Ubiquitin OS=Brassica campestris OX=3711 GN=BRAA05T19919Z PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 360.9 bits (925), Expect = 3.3e-96 Identity = 192/215 (89.30%), Postives = 193/215 (89.77%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3IAU6 (60S ribosomal protein L40 OS=Lingula unguis OX=7574 GN=LOC106162602 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 3.9e-89 Identity = 175/211 (82.94%), Postives = 184/211 (87.20%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0K3AMU0 (Ubiquitin OS=Babesia microti (strain RI) OX=1133968 GN=BMR1_03g01340 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 334.7 bits (857), Expect = 2.5e-88 Identity = 173/204 (84.80%), Postives = 183/204 (89.71%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1J3CZC9 (Ubiquitin (Fragment) OS=Noccaea caerulescens OX=107243 GN=GA_TR19242_c0_g1_i1_g.61849 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 333.2 bits (853), Expect = 7.3e-88 Identity = 172/206 (83.50%), Postives = 184/206 (89.32%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6P5RUV1 (Ubiquitin OS=Prunus avium OX=42229 GN=LOC110749633 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 324.7 bits (831), Expect = 2.6e-85 Identity = 191/308 (62.01%), Postives = 193/308 (62.66%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. NCBI nr
Match: VDC70205.1 (unnamed protein product [Brassica rapa]) HSP 1 Score: 360.9 bits (925), Expect = 6.8e-96 Identity = 192/215 (89.30%), Postives = 193/215 (89.77%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. NCBI nr
Match: XP_040372175.1 (ubiquitin-60S ribosomal protein L40 [Rosa chinensis]) HSP 1 Score: 349.7 bits (896), Expect = 1.6e-92 Identity = 184/204 (90.20%), Postives = 187/204 (91.67%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. NCBI nr
Match: CAG7874465.1 (unnamed protein product [Brassica rapa]) HSP 1 Score: 348.2 bits (892), Expect = 4.5e-92 Identity = 184/208 (88.46%), Postives = 186/208 (89.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. NCBI nr
Match: XP_034506972.1 (ubiquitin-60S ribosomal protein L40-like isoform X1 [Ailuropoda melanoleuca]) HSP 1 Score: 345.5 bits (885), Expect = 2.9e-91 Identity = 179/204 (87.75%), Postives = 186/204 (91.18%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. NCBI nr
Match: WP_198586089.1 (hypothetical protein [Pararhizobium haloflavum]) HSP 1 Score: 339.0 bits (868), Expect = 2.8e-89 Identity = 176/204 (86.27%), Postives = 185/204 (90.69%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. TAIR 10
Match: AT4G05320.2 (polyubiquitin 10 ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.8e-70 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. TAIR 10
Match: AT4G02890.1 (Ubiquitin family protein ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.8e-70 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. TAIR 10
Match: AT4G05050.1 (ubiquitin 11 ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.8e-70 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. TAIR 10
Match: AT4G05320.3 (polyubiquitin 10 ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.8e-70 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0001851 vs. TAIR 10
Match: AT4G05320.4 (polyubiquitin 10 ) HSP 1 Score: 263.1 bits (671), Expect = 1.8e-70 Identity = 140/153 (91.50%), Postives = 141/153 (92.16%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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