PI0028754 (gene) Melon (PI 482460) v1

Overview
NamePI0028754
Typegene
OrganismCucumis metuliferus (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionCopper-binding family protein
Locationchr05: 905204 .. 909712 (+)
RNA-Seq ExpressionPI0028754
SyntenyPI0028754
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGCACACAATAATAGGCCAGCAAGTTAACCAGTACTATGCTAAACAAAATTATAAATTGAAAACAAAATCTGACATATTGGAAATAAAGTTTCACAATTATTAGAGGATAAAAATGGTATTATGGGTATATAAGTAAAGTCGGTTATCACTATTGGTGTGAGACATTTTAGGTGATTTATAAACTTAGTTGTGTTTTAAATAAGGATACTTACAACACACATGCTTCACATCACCCCTATTTAAGATATATATAGGTGTTCATCTTATATTGAGCTATATCTCTATATACAACTAATTGAAGACACGAAGTTCGATGCTTCAAATTAACAAATATTATATATGTGATACAACATAGCTCGTTAAAGAAAAAAATATCAATTTACAATGTTGACATTAGAAGTTTGATTCCCCACTTACATGTTAAAAAATTACCTAAAACTGACTTAATTATTTCAAGTTTAATAGACTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGTGTATTATATATTACACAAATTACAAATAATAGATTTTTAATGCATTCTTTTACATAATCTGTCCTAAAAGTCTGGTGTGCATTTGAGGGTACAAATTTTGCCCTAAAAAATGTGCAAGACAATGAAAAAAACCTCCACTAATGAACTTGATCTTCATTCTGCATTGCATGGCAATTATCCTCACGTGAATAGCACGTGCACTGACATGGCGTGGCATATTGCACATGCTCTCTTTTATTTTTATTTTTATTTCCATTTTCATTTATCTTTCTGAGCTTCTTAAAAAAATTAATAAAAAAATATACTTTTTGAGCATCTTTGAATTATAATAATATTACAAGCACATGGACCAAGCTGGCTGCTCTTTAAAATATTATTATTATTATTATTAAGAATTTTGAATCTTCCAATCATGTTCTAGAAACAGGCACCGGTGGGCCAGGATTTTGCTTTTCTTTTGGGGAACCAAAGATTTACGAACCCCACGACATTGTTACCGTTTTTTGGTTTAAATAATATTTTGATACTCAAATTTTGTATTTTGTTATATTTTGATCTTAAATTTCTTAAAACATCTATTTGAATTCTTAATCTTCTAAGAAAAGCTTACTTTTGTTATTGTCATTAGAATTTTGTTAACTTTTCAATAGAATAACAACGTGGCTTCTATATTTAGATGACTAAACTATAGATTCATCATGTTAGTTAAATTGATTAATAATTGTGAGAATATTTATTTCAAATTTTGTAGAGTTTGTTTTTTATATAGAGTTGTTTTTAATTTTATTTCATCTCGCTATAGATGTTAACACCAATATGCGAGTTCTATTTTTTTATCATACTCAATGTTCTTATGATTTGTTTCAAGATTCCATTTTTTAAAAAAATCAAGATAAAGTGCGTGACGGGACATGAGAGAAAAAAAAAACAAAATTAGTTTTTTTTTGTTTATTTGATTATGTTTTGGAGAGCTAGTTTTGTGTTGATTATGTTTTTTGGTTGGCATAAAAGATTTATAAATAAATTAGCAAGATTTGTTTTGTTACTATAAATACCACCTCGTCATTTCGTTAAAAAGTCAATAGAATCGTAACGACAATGACCAAAGTAAGATATTTTTTCAAAGTTCATAGACTAAAACAAACGTTTTTAAAAGTTTAAAGACCATAATATAACAATATACAAAATTTAGGAATCATAATAAGAATTAAATCCCGTTTTTATCTATAAATTTTGGAACTCTTTTCGGGGATAGAACTATCGACTCTTCTCAACAAATTTAAAGGTGTTTTTAGCTTATCCATATATTAAAATATATTTAACTTCTATTTTCTATTCATTTATGGCAAAATAATCAATTTATTTATAAATGTAGCAAAATGAAATAAAAAATCTATTTCATTGTTGTGTTATCTTCCTATGTTTATAAATATTTTAGTCAATCTTTTTATTTAAAGTAATTTTTCCTATTTCCATTTTGTCACTTAAACAACGTTGGAAGTTGGAAGTTTTTGATAGATAACATTTTTGATTTTCATCTATGCTTATATTTTCTTGTATTTTCTATTATGACAATTGTCCCCCTCAAGAAAACACTTAAATTTGTAATAAAATTTTCGAAAAAGAAAATAGTTTTCGAAAATTCTCTCCAATTTCCAAACTGTAAAATTCACATAGGTTAAAAACAAACTTGAGTTCACAATCAAATTTTAAAAATAAAAAATATTTTTGAAATGTTTTTTAATTCTAATAATGTTGGGTTGTCTCTTTTGAAAACATTAAAAAAAATAGATAACAAAACAACACTTATTTGTTGAATTAGTATTTATAAACTTCAAATTTAAAAATATGGAGAGAAATTAGTTTTTAAAACTTCACTTAAGACACAGAATAAAAAAATAAAAAAAAAGTCTTCAAATAATTAAACTTTAATAAAATTGAAATTGAAATTGACTTGTATACATCCCCAATTGTTGTTGATGGTCTGCTAAGGATATCAAATTATCAGTATTTATATATTAAGTTATTAACTTGTGTCTCTCTTTAAATGGTGTCAATTTTCATCAACTAAAAAAGAACTTTGAGATTATTCTAATTATGCAAAATCAGATTTATGAAGCTAGAGAGCCGACATTTATTGGATCAAGTGATGCATTAAATATATTATGAATATGCAGTAAAGTCTTGAAATTTTTTAATACTTGATCTGTCAACTCAAAACCAGCATGTGATTTCATCAAACCATTTTTTTTTTTTCAAATCGATATAATTAGTTTGAATTAAGTATTTTTATCATTAATTAGTACATCCTAAACAAATAATTAATATTATCAAAGTGTAGTCACATGAGAGGTTTAGGTTTATCCAATTTCAAGTCTAAATAATTGCATCAGTCAATTTATACTGTTGATTAGTGATGCATGAATGGCTATTTTCACTTGTTTCATTTTAAAATCAACTTCAAATTACTTCTATTAACAAATTTTTATCCCAAATAAATATTAAAATGATAAGAAAATTTCCACAAACAAGTGGGAAAAGATACAAAAAAATTAAAAATTAAAATTTAAAAATAAAAAATTAAGGAATTGTGAAAAGGCCACATAACAAACTTTTATATTTTATCAAAAATAGTTATCAATGTTTTATCAATATATGAATAAATGCTTATATAAGTTTATCAATGTCTATCATTGTCCTATCATTTATAAAATATGAAAAAAATTTATATTTTATAAATAGTTTGGTTTATTGTGCTATATTTGAAAATGATCTAATATTAGTGAATCTTTGCACTTAAAATAGGTTCACACATATATGAGAATTACTTAATGATACTGAATTTAAAATGAAACATATAAAAAAATTATATGGATTGATTTATGAAATAGTTTAATATATTTTATAAACGAAGTGTTAGTTTTAAGTTTAGTTGGATGGAAAATTTTAGATTTGAGATATGTATCTATTTAGTCCTTAAAATTCAAACTATTACAATAATCGACAGATTTACTATAGGCATAGCGGCACTTGCAATCAACCATATGCTTCATATATATATCATAATATGAATACCATTAGCTAAACTAAAAAAAATTTGGTTTTTAGTTCCATCTGAACCTAGTTTCAAGCTCTAATTTTTACATTTTTTCATTTTTTTAAAATTATTTTTATTGTATTATAAAGTTCCTATAATAAAATTTCTAAATCCACCATGACTAGCAAAGTTATTTCCTCCACAATTTAGATGATTTAATTATTTACTTTATCCGCAGACTTAACTTTTAAGTAAATCAATAATTTTATAAAAAAACAAAAGAAAACTCGTCATACGAACCTCGAAAATATAGATTTGATTCTCTACCTGGGTAAAAAAAATTTCTCATTGTCATGTATATACGTGTATTATAATAATATTTTAAAAAAACATAGTCGCATATTGTGTGATTAAACAGCACATATATAAATGTGCATCGATTCATTTGTAAGGACAGAGGACAGGGAGGGAGAGCTTTGGGAATGGGGAAACTGGTGATGAGCATTGGGAAAGTATTTTCATGTTTCATAAATACAACAGATTCTTCCACTTCCTGCTTATACAGATTGGAAATTGAAGACAGTAATTTTGATCAGAAACAGCCATTAATGGCTAAACAAACAACATCAACTCATCTTCTAGGATTCAAGGATGTGATTACTCGTCAAAACAAAACTCTGCCTCTTCAATTCAACCCCAAGGTCAGATCACATTCCTAACCCTTTTTCCTCCTCCTGAATCTGCTTCTATTATTTACTGTTGGTTTAAACTTTAAACCTGCTTCATTACACTCATTTTGTTTCTTATAACTTCAATTTTGATTTACTTTTGTCTCTGATTATTTTTTCTATAGGTTTGTTTTGGTTTTTAA

mRNA sequence

ATGGCACACAATAATAGGCCAGCAAACTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATTCTTCCACTTCCTGCTTATACAGATTGGAAATTGAAGACAGTAATTTTGATCAGAAACAGCCATTAATGGCTAAACAAACAACATCAACTCATCTTCTAGGATTCAAGGATGTGATTACTCGTCAAAACAAAACTCTGCCTCTTCAATTCAACCCCAAGGTTTGTTTTGGTTTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGCACACAATAATAGGCCAGCAAACTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGATTCTTCCACTTCCTGCTTATACAGATTGGAAATTGAAGACAGTAATTTTGATCAGAAACAGCCATTAATGGCTAAACAAACAACATCAACTCATCTTCTAGGATTCAAGGATGTGATTACTCGTCAAAACAAAACTCTGCCTCTTCAATTCAACCCCAAGGTTTGTTTTGGTTTTTAA

Protein sequence

MAHNNRPANWWWWWWWWGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGDSSTSCLYRLEIEDSNFDQKQPLMAKQTTSTHLLGFKDVITRQNKTLPLQFNPKVCFGF
Homology
[Close]
BLAST of PI0028754 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LIU8 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G005290 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 4.3e-16
Identity = 53/63 (84.13%), Postives = 54/63 (85.71%), Query Frame = 0 

Query: 52  DSSTSC-LYRLEIEDS-NFDQKQPLMAKQTTST--HLLGFKDVITRQNKTLPLQFNPKVC 111
           DSSTSC LYRLEIEDS NFDQKQPLM KQTTST   LLGFKDVIT QN+TLPLQFNPK  
Sbjct: 20  DSSTSCNLYRLEIEDSNNFDQKQPLMPKQTTSTTHDLLGFKDVITHQNETLPLQFNPK-- 79

[Close]
BLAST of PI0028754 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C8H9 (uncharacterized protein LOC103497691 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497691 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 1.8e-14
Identity = 48/58 (82.76%), Postives = 50/58 (86.21%), Query Frame = 0 

Query: 53  SSTSCLYRLEIEDS-NFDQKQPLMAKQTTST--HLLGFKDVITRQNKTL-PLQFNPKV 107
           S++ CLYR EIEDS NFDQKQPLMAKQTTST   LLGFKDVIT QNKTL PLQFNPKV
Sbjct: 23  STSCCLYRFEIEDSNNFDQKQPLMAKQTTSTTHDLLGFKDVITHQNKTLRPLQFNPKV 80

[Close]
BLAST of PI0028754 vs. NCBI nr
Match: XP_031736582.1 (uncharacterized protein LOC116402031 [Cucumis sativus] >KAE8651518.1 hypothetical protein Csa_019330 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 1.5e-15
Identity = 51/59 (86.44%), Postives = 52/59 (88.14%), Query Frame = 0 

Query: 52  DSSTSC-LYRLEIEDS-NFDQKQPLMAKQTTST--HLLGFKDVITRQNKTLPLQFNPKV 107
           DSSTSC LYRLEIEDS NFDQKQPLM KQTTST   LLGFKDVIT QN+TLPLQFNPKV
Sbjct: 20  DSSTSCNLYRLEIEDSNNFDQKQPLMPKQTTSTTHDLLGFKDVITHQNETLPLQFNPKV 78

[Close]
BLAST of PI0028754 vs. NCBI nr
Match: XP_008458177.1 (PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497691 [Cucumis melo] >KAA0061568.1 copper-binding family protein [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 88.6 bits (218), Expect = 3.7e-14
Identity = 48/58 (82.76%), Postives = 50/58 (86.21%), Query Frame = 0 

Query: 53  SSTSCLYRLEIEDS-NFDQKQPLMAKQTTST--HLLGFKDVITRQNKTL-PLQFNPKV 107
           S++ CLYR EIEDS NFDQKQPLMAKQTTST   LLGFKDVIT QNKTL PLQFNPKV
Sbjct: 23  STSCCLYRFEIEDSNNFDQKQPLMAKQTTSTTHDLLGFKDVITHQNKTLRPLQFNPKV 80

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of PI0028754 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0028754 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A0A0LIU84.3e-1684.13Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G005290 PE=4 SV=1[more]
A0A1S3C8H91.8e-1482.76uncharacterized protein LOC103497691 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103497691 PE=... [more]
BLAST of PI0028754 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_031736582.11.5e-1586.44uncharacterized protein LOC116402031 [Cucumis sativus] >KAE8651518.1 hypothetica... [more]
XP_008458177.13.7e-1482.76PREDICTED: uncharacterized protein LOC103497691 [Cucumis melo] >KAA0061568.1 cop... [more]
BLAST of PI0028754 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 17..52

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
PI0028754.1PI0028754.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
molecular_function GO:0046872 metal ion binding