Sequences
The following sequences are available for this feature:
Gene sequence (with intron)
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTAAGAAACATCCTTCAAAATTCAAAGAGAAACCATAGACTCAAAAGTTGTTATCCACGTGGACGAAACGCGCCACCGCCGTTCGAGCTGCTGTCCAATCCCGTCTTCCTCCGTTCGCCTTCGTTGTCCGATCGATCTATTTATTTGCAAAAGGGCAAATGGGACATTTCAATTTTCATACCAATTTCCTCTAAAACCCCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCGACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACGGCCTTTTCCTTCGGATCGTCTCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCTTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACCTCCAATCCTCCTCCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCTCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGCTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACTCCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGAGCTCACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGCAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGAGCTCTTTCCTCCTCTGCTGGGACCTCCTCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGTAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTAGCACATCTGCATCCGCTACAAATTCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTACCTCTCTGTTTGGGACATTAGCTACATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTATCCAGTTCTCCGTTCCAGAACTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCAATTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCACTGCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGTGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCGCCAGCCTCTTTTGGTAAGTTCTTTCCTTTCTTTGTTTTACTTCGTGATACTTAGTTTATAATATTGCCTGTTCGAAATAAGTTTTGTGAGTCATGTTTTTAAGTGGGTTTTTCCTTCTTGAGGGGCATGTTAAGGATCCCAGGTTGGAAAAATCAAGGGAGCTTGTACTTATTTTGACATAGATGATTTACTCTTCTTATTGGCAATTGGTTTTGGGATGTAATCTGACGTTGTTTAATAGAACCTTTTAATCTGTCTTTTGATTCTTTAGTTTTTCTTTTTTTTGGATGTCTTGGTGTAAACAAGTACTCCTTTCAGAATGTTGCTACATTTTTATGTCCATATACCTAACGTATTTTGTGAGCGTGTCTGTTTCTACATAACTTTTGTTTATTCTTTGCAGGCTTCCCTTCTCTGGCATCTGCTTCCACTGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGGTAAGTATGTGATTCCGTTGCGTTCCTAGTATCTCTGCAATATAAGATAAAAACTTACCTGGTTTGTCTATTAATGGAGCCAGGATTATATTATTATTTTTCTGTTGATATATGATGTTCTATCATCTATGCTCTTACTTTTCTTTTAATTAAAAAACTATTATTTTCATTATCTTTAGACTTAGGTTGAATTTGGATTCTTTTCATCTTTTCGTCCGTTTGAATGTTATTTGAGAGTGTGCAATGTTATTTGAGCTATTATCTATTATGTTTTCTGTCTTTAAGACATTGAAACATTTATTCTCCTTGTTTCAAAGACATCTTTTTGGTCATTATTAGAAAATATATAAATTAGCACGACACATTTCTACAATGTATGTGTGTGTGTGTGTATTTATAGAGAAGCTCTCTTAACTCATTCCACTATACATTAGTACCTGCATGGATTGGTTATTATTCAATGGCTTATATTCTCCATTTGCTTTATTCTTCATTTATGCAGTGGTACAACTTCAACTCTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGGTATTTCTTTTTTCATGATCGGAGATCTGCACAGTACATTTGGGTTGCCTTTTTCCAGATAATTATCTATGTTTTTGTTACAAAAGTTTATATTGGGTCTAGAAAAGGAATGAACATGTGCCTCACTAACAAAAATCTAATCTCCTCTGCTCATATAAGCTTGGTGGATGCCCCTTCAAAACAAGGAGAAAAGGATGGTATGGGAGGACTTTATAAGAGTCTTTTACTGGAATTTATGGCAAGAAAGAAATAGAAGATTTTTCCAAGATAAAGAAATTCTCTTTAGATTTTCTGATGCAATGGTTAATATGATTGTGACTTGGTGTAAATGTTCCCCCTTATTTCACCTAGGTTGACCATGCTTCTTTCCAATTGAAAAAGTCTTTTGTAACTTCTCTATGGGGTCTCCCCCTACTTTTGTAATTTCATACCATCGATGGAGTGTTGTTTTTTTTTTAAATTTTTTTTTTAAAATGTGCCTCATTACTAGGGACAATCAATGTTCAAGAAATTGTAGTAATGCAGGAAATTAATTGATGACTTAATTACCCATGTAGTAATGAAAATGATAAAAAACTTTTGGTGTCATTGATTCATCCAATAAAGTATTTTTCTTTCAGCTTAAGTTGACTTCAAATAAAAATTTGGAAATATTCTTGCAAATCATGTCCTTGTGTTCATTATTCATGGAATCATCATAAATGTTTCTCCAACGTTGTTTAGTCTTTTTTTTTTTTTTTTCCTTTTTTGGTAATTAAATTGTTTTAAACTTCTGCTTCTTGCTTTTTTCTTCAATTTCATTATAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTTCTTAGACTTGAGGTGTTATGTCACTTCATTTCAAGATTTTTTAATCTTCAATGAGATATGAAATTTAATTTGCTATTTTATCTGTTCTAACAAACCATGTGCATATGATTATAAAATAGGATAATTCTAGTTAATGAATTTTTGGACCATCTATTTGGGGTTCTTGTACTATTCACCCTGTGTCTTTCATAGAATCCTAATCTGCAGGAGATGAACTCTGAGCATATTTGTTAGGAAGTCTTTAATTTAAGTGTTAACATCCCTTTATTTTTCTTCCCTGCTTTCTTTGGACAATGCTCAGTTCAAGTTTACCTCGATGTTTCTTCTCCCAACTGATTCTAATTTTTGTTATTTCAACGGTCATTTAAAGAATTGAAAAGCTGCAACAGAGAAACTAGCCAAAGGGACTAATGGAAAGGTAGGCGTAATCAGCATAAATGAGGAAAGGGAAATAATTACAAGAGTCTTTTTTGATAGGATCGACCACCCTGAAAGTAACCTAAACTACTAGATAAAAAGAATGTCAAACTCACCATCTCTCTTTTTAATTTCCTTTTATCTATTTATTTATTTATATTTATATTTTGCTCGGAACTACTTTTCTTAGGATTTTGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTAAAAAAAACAAAAAGAATATTTTTCAAATTCTTCAATGTGAGAGGAGGCGTCAAAGTACACACTAGACCTTGAGTGGCATATTTTGTCTTTGTCAGAATTTGTGTTGCATATTGGTGCTTTGGTTTCTTTTCTTACTAGTCCTCTTTACTCGATGAACTAGTGAGAATTCTTCATTAGGATGGCCTTCAAAGGGATTTGCTTTTTTATTATTTTTGCTGTTGCGTTTTTCAATCTTCAGGCTGCAGTCTTTTCCTGAGTTCTTAATTGGTTGTATTTTGTTGCATTTGTATTTGTTTCGTTTTTGTTTCATTGTACTTTGAGCATCAGTCTCTTTTTGTTTTATCGATGAAAAGTCTTGTTTTCTTTTTGGGAAAAATGTACACACTGGATTCTTTGTATCTTAATGACTCACTCAATTTTTTTCTTTATATCTTCATTGATCAAATGGGTTATCTTGAACTATTATTATGTGTTTATTTTTATTTAGAAGTTGTCTCTTTCCTTCTTAGTGAGACATTTATTGGTAAGATGAAACGTTCGGAAGAATGTGGAATCCCATCGTGGAACGTGGGTTCTCTCTATCTAAATGTCAAAAAGGAATAATGAGAAAGATTGATTCTAGATTGCTCTAATGCATTTATTTTGAATTTAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCATCAACAAGAGGTATTCACCTGCGACCTTGTTTGCCTTTTCCCTTAATATTTTCGTTTAGGTAAACATTTTACCTATGGCCTTGTGTTCCTATAGTAGGATCTTTGGAGGGGTAGAGAGATTTTGGTGAGATCTGAAAACTCTGTGTCTTTTGCTTTCGGGTTCCGTCGTAATTTGACCGATAGGAGACAACGGAGGTGGTCTCGCTTCTGTCCTTGTTTGAGGGTTCTTTTAGAGAGGGGAGAAGAGATGTTCGAGTTTGGAGTCCTAATCCTAGTCGGGTTTCTCTTGTAAGTCTATGTTTAGTCCGTTGATGGATCCCACTCCCCCTACTGAGTTGGTTTTTGATGTGGTGTGAAGGACTAAGGTTTCCAAGAAAGTCAGGTTCTTTATTTGGCAAGTTTTGCTTGGTCGGGTTAACACTGTTGATAGGCTCGTTAAGAGATGAACTTCGCTTGTTGGGCCTTTTTGTTGTATGATGTGTCGGAAGGCGGAGGAAGATCTTGATCATCTTTTCTGTGATTGCAAGTTTGCGAGGGCCGTTTGGAGCTCCTTCCTTCAGGAGTTTGGAGTTAGTTTTGTTGGTTTGCTAGCATCAGTGTGACGATCGAAGAGTTCCTCCTCCATCCGCCTTTTAGAGAGAAAGGGGGTTTCTTATGGCTTGCAGGAGTGTGCGCAATTATTTGGGACATTTGGGGTGAGAGGAATGAGAGGGTGTTCCAGGTGAGAGAGGGAGGGAGGTCAGTGAGATTTGGTCTTTGATTAGATATCATGTGTCGTTTTGGGCTTCGATTTTGAAGATCTTTTGTAACTATTCCATTGACAATATTTTACTTTGTTGGTCTCCCTTTTTGTAAGTGGGTGACTTGTTGGGCTGGTTTTTTTGTATGCCTGTGTATTCTTTCATTTTTTCTCAATGAAAGTTGTCGTTATCATAAAAAAAAAAAAATTGGGAGAAAGTTTGGGAGTTCATTGGATTAAAAGATCGTTAGAGGGGGTGGTGGGTCATTTTAGTAAGAATTCTCTTTGAGGATTTGGGAGAGAATAACCCTCTCGAATGTCTATGATATATTGTAACTTCTTTTGATATTTCAATATACATTTCTATTTTTAGTGTGTTTTGTGTTGTTCTTGAGTGTTCATGTTTGGTGGTAACCCAACACTCTCTTCCTCGTGCCTTTGCGTCCTTGAAGGAAGGGTTATTAACCAAATCAATCACCCAGCAGATCATTAGACAAATTCACTGTCTAGGGATTAAAGATCCTGAAGTTCAAGTATTGCACTGTCACAATTCTATACCATAGGAGTACAGGCTCTATCTTGTTATACTCAACTTTAGAGACTAAATTATAACTTCCATGGAAGTCCAATGATCAAATGTGAGTTCTAACCTAGAATAGGTGAAGTGCGCATAGGGAAAGCTGTAGAAAGGCTAGTCCCAGAGGTTCTTCTTATGACCTCATGTCTCAACTCAAATATTGGGAAAGTAGCACCTACCGTTGACTTTTCTTATTTGTCCATTTTGTTTTATTAACAAAACGTGCTTTAAGATGGCAAGTTTGCTTAATTGAAAGTGAGTTCACACCTTGAGAATTTATTAAGAAATTTTGAATTGCACATATTCTCATGTATCTTTAATAAACCCATTGGATTTATCTATATTCAATTATCAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTGAGTGGTAGATTTTACTTTAATTGCATGTTCTAGGGTACAATCTTTTATATTTAAGATATTCTTTTTGTTTTATCTTTATGTTCTTTGTAACAAGAAACTTATCATTGATAAAGTAAAAAGAGACTAATGCTTGAAAACTACAAACTGTACATGAGGAGTTTATTAAATGTGACTTTTGTTTGGACCTGAAAAGTTGGTATTCAATTCATAAATTGATAAGATCTTGCCAGCGATGATAGTTTAACACTAGTCTTTGGAACTTGGTGCTGGGCATTCAGGTTTGTTTGTTTGTTTTTTTTGAGTCTATTTGGCAAGTTATCTTCTTTAGATCTTTCATGCTTGATGGGGAAAGAAGCTCAAGTGAAATGTATCTGTTTGAATTTAGATGGAGGAACATTATGAAGAAAACAAGATGACATTTTTTTGGGGAATGTTTTTACATAGAAGCAATAGTTTTAAGCAATTTTCAACTTATTGGATAATGCTTTGCACTTCCTCATAGATATACTTAATTGGATAATAGAAACTCAAATGGAGGGATGATGATAGAACACCTTTCTAATAGGTCTACTAAATAGTAGATCTTCACCTTTCTGTTAGAACCCACTTCTTTTGGATGTTCTTAGAAAAGTGTAGTAATGATAGGACAATGCCCTTTAAACTTCTAGTGGGTCCTCCCTTGATTGAAGCCTTTCTCCCTAATTTTATGGTCCAATGCGGTCAAAGCTATTTTTTCTCTCTGAATTTTTGTTTGAAAGGAACCAACACATTTTTCAAGGCAAGTCTCTAGCATGGTCCAACCGTTTTGATCTTGCATCTATACACTTTGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGACACGCCTTTTTCACATGGGGAACTCAATCAAGTATTGAGTTAGAATTTTTTTTATTTTTATAGCTGAATTAGAAAGTATTGAGTTAGAATTTTTTTTATTTTTATAGCTGAATTAGAAAGTAGATTAATTTTTTGGCATTGTACCAAAGGTTCAATTTTCTCTCTTGTTTTCAATCTAATCATGTTGTAGGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGTAAAGGAAAACAGCTAAATATATTTGCCTTGGATTTTCCTCTTCGTGGTAATGGATAAATCATACATCTACTTATTTATTTTTATCTAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGATAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGTTAGTGCTTCTTGTATACATAGCTTATCCATTTGTAAAACCTCTTTTAACCATGACGGTAGTAAAATAGATTTCTAAGTATAAAAACATTTCATTATTCTCTATGTTATTAGACCTTCATCAGACTGGAATTCTCTGACTGAAATCTTTAAATTCATTTCTGAGATGCAGTAGTATTTTTTGGTTTATTTTAGTACTGTAGAATCATGATTAGAAGAACCATAATAAGTTGTCTTAAATTATTGAGCAATTTTTTTTTTATACACTTGTTAGCTTTATCAACTATCAACTGATGTGTTGTGAACATTTTATATGATTAATTTATGATGAATGTGATTAGCAATGTTTTAAAAGGCTATTGAGTCTTACACCTGGAGACTTGCATATCCTTTGAACTACAAGAGAAGAGGCTTACACCTTTGTGAAAATACATTGAGGAGTAAAATGTTTATGCCTGATGTAATTTACGATTAGAAGTAGTAATTTGTCTCATTCTTCAAAAATGTAAAAGTTTAAGTTGTGACAATATAAAAATTGATGTTCTTACAAGCCAAGAGAATGAGCAAGTAATTTTCCGATGATCTACAAGATATGGTTGGAGGAGAAGAGCTTTTGTATGGTTTAGCTTTTGATTGATCTTTTGTGGAGTTCTTTAATAATTCAGGAGACCATTTAAGTGGATGGTTCTTAGTTTTATTTTTTGAGATACATAGGAAATTTATGAGAGTTTGGTCATATCTTCCTTGTAGTTGTACGGTACCTCTCTGAAAACAGTCACAATAGCATAGCCTACCATGAAAAAACGCCTTTAAATTCATTAGTATCATATTTTTTTTTTAGTTCCCATTAAAGCATTGAGCTCTAACATTAAAGCTTTGTCAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGAATTGTAAGCTGGTTTTAGTTTTATTTGTTGTGAAGCTGAACTGGAAATCTTTTTGTCCAAAAGGATATATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATATAGGGTGGGCAATCGAATTTTCGACGATTTAGATGAGGTAGAGATACTTTAATCGATAAACTAGGCTCAAGCCTCAAGTTGGTGCATAAAACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCTTTTACAA
mRNA sequence
CTAAGAAACATCCTTCAAAATTCAAAGAGAAACCATAGACTCAAAAGTTGTTATCCACGTGGACGAAACGCGCCACCGCCGTTCGAGCTGCTGTCCAATCCCGTCTTCCTCCGTTCGCCTTCGTTGTCCGATCGATCTATTTATTTGCAAAAGGGCAAATGGGACATTTCAATTTTCATACCAATTTCCTCTAAAACCCCTAAAACCCTTCACTTCACAGTCTCTTCCACCGGAGATCGATCGAGATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCGACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACGGCCTTTTCCTTCGGATCGTCTCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCTTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACCTCCAATCCTCCTCCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCTCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGCTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACTCCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGAGCTCACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGCAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGAGCTCTTTCCTCCTCTGCTGGGACCTCCTCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGTAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTAGCACATCTGCATCCGCTACAAATTCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTACCTCTCTGTTTGGGACATTAGCTACATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTATCCAGTTCTCCGTTCCAGAACTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCAATTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCACTGCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGTGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCGCCAGCCTCTTTTGGCTTCCCTTCTCTGGCATCTGCTTCCACTGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTCTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTTCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCATCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGATAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGAATTGTAAGCTGGTTTTAGTTTTATTTGTTGTGAAGCTGAACTGGAAATCTTTTTGTCCAAAAGGATATATTCATTTTTTCTGTTTTTCTTTTGGAAAACATGAATATAGGGTGGGCAATCGAATTTTCGACGATTTAGATGAGGTAGAGATACTTTAATCGATAAACTAGGCTCAAGCCTCAAGTTGGTGCATAAAACTTTAGTTGTCCATTCATGGATCTTTTACAA
Coding sequence (CDS)
ATGTCGGGTTTCGGCTTTGGATCTTCCACCTCTCAATCTTCTTCTTCTTCTTCTCCATTTTCCTCGACCACTGGTTTCTCCTTCGGATCCACGGCCTTTTCCTTCGGATCGTCTCCTTCCCCTTTATCTCTTTCATCTTCCTCCTCCTCCTCAAACCCTACTTCTTCTTCCTCCCCATTTCCCAATCCAACCTCCAATCCTCCTCCTTCTTCTTCCTTTGGCTTTGGCTCTTCCTCTTTCTCCTCCTCTACTTCCTCTCCCTTCTCTTTCTCCCTCGCCTCCGCTTCCACCGGAGCATCTTCCTCTAGCGCCCCTTCTTCCTCAGCAACTTCAGCTTCGTCCTTGTTTGGGGTTTCTTCATCCTCAGCTGGATTCAATTCTTTCGGATTCGGGGCTTCATCTTCATCAGCAAACTCCTCTGCTCCCTTGTTTGGGGCTGCTTCCTCCTCCGGGAGCTCACCTGCGCCTTCGTTTGGGGCTGCTCCCTCCTCTGGCAGCTCACTTGCGCCTTCCTTTGGAGCTCTTTCCTCCTCTGCTGGGACCTCCTCTGCGCCCTTGTTTGGGGCTGCTCCATCTGTAGGGGCATCATCGGCTCCGTCCTTGTTTGGAGGGGCGTCTTCTGCAACTACTTCCAGTGCACCATTGTTTAGCACATCTGCATCCGCTACAAATTCGGGATCAGCGTTGTTTGGCGCTTCTGCTGCCGCTTCAGGTTCTGGTACCTCTCTGTTTGGGACATTAGCTACATCTTCAGGAAGTACAGGTTCAGGTTTGTTTGGGTCTAGTCCCTTTGGTGCATCTTCTTCAGGCACTTTGTCATCGGTTTCCACTTCAAACTTGTTTGCGTCATCTTTATCCAGTTCTCCGTTCCAGAACTCCCTTTCTTCGAGTTCTTCCCAAAATTTGACTTCGTCTTCACCGTTTGCGGCTTCTCCTTCTGGGTTTTCATTTTCGACCAATTCTTTGTCTAAAACTACTAGTATTACCACTGCATCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTCTCACACTAGCCTCTACTAGTTCCTCGAGCTTCTCATTCGGAACACCTGCTTCGTCGTCATCTCAATCTTCTTTCGGATTTAGTATTAACAATGCAGCATCGACGGGTGGGTCTTCTGCTCCGAGCACTACAGCTACGAAGCCTACTTCTTTATCGTTATCAAATTCTGTGGCACCTTTGTTCTCTACGGTTACTACCACCAGTGCTTCTACTCCAGCTGCCAATAGCACAACTCAGCCATCCTTCTCCGTGCCAGCTTTTAGTTCGAGTTCTTCAGCTGCTACTACCTTGTCCATAGCGGCATCTTCCGCTCCCTCGGCTGCTTCGTCGGGTGCTGTGAGTTCATTTACTGGTTTTGGTGTCACAAGCACGGCTTCTTCATCAAGTGCAATTGGTTCCTTATCGTTGCCGACCAAAACATCAACTGCTGCTTCATCATCCCAAGCGCCAGCCTCTTTTGGCTTCCCTTCTCTGGCATCTGCTTCCACTGCTGCTACCACCACATCCGGTTTCAGTGCTTCAAGTCAGAGTCAGACTTCATCAACTCTTGTTGTAGCAAGCAGTAGTAGTGGTACAACTTCAACTCTTAGTGCAACAGTGTCTTCTACACCAAAATTACCATCTGAGATAACAGGGAAGACTGTTGAAGAGATCATAAAGGAATGGAATGCAGAGCTTCAAGAGCGTACCGGAAAGTTTCGAAAGCAGGCCAATGCTATTGCTGAGTGGGATAGGAGGATTATGCAAAATCGTGATATCCTTCTTAGACTTGAGATTGAAGTTGCAAAGGTGGTTGAGACCCAAGCTGAGTTGGAGAAGAAATTGGAGTTGATCGAAACTCATCAACAAGAGGTTGATAAGGCATTGCTAAGCGTGGAAGAAGATGCTGAGCGCATTTACAAGGATGAACGTGGTTTACTTCTTGACGATGAAGCTGCATCTACAAGGGATGCAATGTATGAGCAAGCTGAATATATAGAGCGGGAACTAGAGCAGATGACAGAACAGATCAAATCAATTATCCAGACCCTAAATGCAAACCAGGGAGGTGAACTTGATGTGATTGATGGGATGACGCCGATAGATGCTGTTGTTCGAATTTTAAACAATCAATTAAGTTCATTAATGTGGATCGATGAAAAGGCCGAAGAGTTTTCTTCACGTATTCAGAAGCTTGCTGCTACCGAGGGTCCGGCTGCAGATCGTGAATTGCTGGGTCAGAAGTTCTGGATGTCTTGA
Protein sequence
MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPFPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Homology
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
Q8L7F7 (Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 394.0 bits (1011), Expect = 3.7e-108
Identity = 406/782 (51.92%), Postives = 522/782 (66.75%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSF------GSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPT 60
+ GF FGSS++ +SSS+S +S FSF ST F FGSS S SS++ S
Sbjct: 12 VGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFG 71
Query: 61 SSSSP-FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSAS 120
+SS+P F +S + SFGFGSS+ + S+ SF + A+SSSAP+ S S
Sbjct: 72 ASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFGSSASVTPASTTPSFGFGT----AASSSAPAPS-LFGS 131
Query: 121 SLFGVSSSSAGFNSFGF--GASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPS-FGAAPSSGSS--- 180
S SS++ G + FGF ++SS+A S+ LFGA +SS ++P+ S FGAAP+SGS+
Sbjct: 132 STTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLF 191
Query: 181 -LAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSG 240
+PS + SSA S++ LFGA+ S S++P LFG SSA T + P FS ++SA S
Sbjct: 192 GSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSP-LFGAPSSA-TGATPSFSVASSAPGSS 251
Query: 241 SALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASS 300
S++FG A+GS S F +++SGS+ S G GSSPF SSS S+ ST +LFASS
Sbjct: 252 SSIFG----ATGSSPS-FSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASS 311
Query: 301 LSS------SPFQNSLSSSSSQNLT---SSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSS 360
S SPF S +SSS + T S+SPF+AS +GFSF ++ S TTS TT S+
Sbjct: 312 SSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPP 371
Query: 361 SSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLS 420
++S SSSSFSFGT A+S GF++ STG S+AP++ S
Sbjct: 372 QTAS----------SSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS--------S 431
Query: 421 LSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGA 480
S +V + +T TTTS+STPAA T+ P+ S PA + + + S A ++ P ASS A
Sbjct: 432 TSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAA 491
Query: 481 VSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSG 540
S TGFG+ S+ ++ + S + KTST ASSSQ + P+ + + ++T+T+
Sbjct: 492 TFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTA 551
Query: 541 FSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT 600
+ SS + T +TLVV SSS TST A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERT
Sbjct: 552 PATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGSPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERT 611
Query: 601 GKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALL 660
G+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL
Sbjct: 612 GRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQ 671
Query: 661 SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGG 720
S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGG
Sbjct: 672 SMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQSELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGG 731
Query: 721 ELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFW 756
EL+ IDGM+P+D VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G DREL+ K W
Sbjct: 732 ELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI-ALQGSGGDRELMAPKHW 739
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match:
G0SBQ3 (Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI 039719) OX=759272 GN=NSP1 PE=1 SV=1)
HSP 1 Score: 47.4 bits (111), Expect = 8.5e-04
Identity = 202/699 (28.90%), Postives = 349/699 (49.93%), Query Frame = 0
Query: 69 PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSS--SAPSSSATSASSLFGVSSSSAGFN 128
PS+S G+S S+++++P S L ++TG+S+ S ++S T + SLFG +++ +
Sbjct: 8 PSTS---GASGQSNTSTAPASGGLFGSTTGSSTPAFSFGNTSGTQSGSLFGGATTGQKTS 67
Query: 129 SFGFGASSSSANSSA-PLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAP 188
FG +S++ A + A LFG ++SS S P+ A+ SG+ FG S+SA SS P
Sbjct: 68 LFGNTSSTTPAGTPATSLFGQSTSSSSGPSLFGNASKPSGN----LFGNTSTSAAGSSTP 127
Query: 189 LFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFG 248
+ PSLFG S T+SA ST+ +AT +LFG++ A
Sbjct: 128 ----------AGTPSLFG--SKTATTSAGASSTTPAATAGSGSLFGSTTA---------- 187
Query: 249 TLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSPFQNSLSSSSSQNLTSS 308
T SS T +GLFG S +S S +T S ++P + S S+
Sbjct: 188 TTQGSSTPTSTGLFGGS--STASKSLFGSTTTPATGTSGSQTTPAKPLFGS-----FGST 247
Query: 309 SPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQ 368
+P A P+ + + + T +S+ + S+S T SS+ PA +S+
Sbjct: 248 TPAGAPPTDATKTAGLFGNLSKPATTGTSTPTLFGSTSATTQGQSSTPLFGAKPAETSTT 307
Query: 369 SSFGFSINNAASTGGSSAP-STTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPS 428
++ + A+T +SAP STT T +L++S ++ +T +ASTPAA T+P
Sbjct: 308 TA-----ASGAATPATSAPASTTPTLFGGATLTSSAPAASTSTSTATASTPAA---TKPL 367
Query: 429 FSVPAFSSSSSAATTLS----IAASSAPSAASSGAVSSFTGFG----VTSTASSSSAIGS 488
F A +S+ ++TT + + + A +AA+ + ++ T FG T+ A++SS +
Sbjct: 368 FGATATTSAPGSSTTTATPGLFSTTPATTAAAGSSTATSTLFGTKPATTTAAAASSTPAA 427
Query: 489 LSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASA---STAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSS 548
S P+ + +S+ APAS G P+ +A ++A TT+ S S T+ST +
Sbjct: 428 TSTPSLFGSKPASTTAPAS-GTPTTTTAPASTSAPATTTAAPTSGASATASTTTAGQDAK 487
Query: 549 GTTSTLSA-TVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQ 608
TT+ L A TV +LP + KT++EII W +L + +F++QA + EWDR +++
Sbjct: 488 TTTAGLGASTVGPQSQLP-RLKNKTMDEIITRWATDLAKYQKEFKEQAAKVMEWDRLLVE 547
Query: 609 NRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLD 668
N + + +L + E+E++L +E+ Q+E+ L E + + +Y + G
Sbjct: 548 NGEKIQKLYTSTYEAERASNEIERQLSNVESQQEELTAWLDRYERELDELYAKQMGSAAG 607
Query: 669 DEAA---STRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLN-----ANQGGELDVIDGMTPI 728
++AA R+ Y+ AE + +L++M + + +I+ +N ++G + D P+
Sbjct: 608 EQAAGPDQERERTYKLAEKLTDQLDEMGKDLAKMIKEINDMSNTLSKGSKPD-----DPL 655
Query: 729 DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRI---QKLAATEG 741
+VR+LN L+ L WID A +++ QK A + G
Sbjct: 668 TQIVRVLNGHLAQLQWIDTNAAALQAKVAAAQKAAGSMG 655
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A1S3CAD4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 1083.2 bits (2800), Expect = 0.0e+00
Identity = 719/766 (93.86%), Postives = 730/766 (95.30%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF 60
MSGFGFGSSTSQ SSSSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF 60
Query: 61 PNPTSNPP-PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
PNPTSNPP SSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSS PSSSA SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS----------GSSPAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSS GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS GSSPAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSAL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF T+ASA +SGSAL
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 241 FGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSP 300
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SSVSTSNLFASSLSSSP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 301 FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLAST 360
FQ+SLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSF T++LSKTTSIT SSSSSSSLTLAST
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNV----PSSSSSSSLTLAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT 420
SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT 420
Query: 421 TSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTAS 480
TSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTS+AS
Sbjct: 421 TSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSAS 480
Query: 481 SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVA 540
SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVA
Sbjct: 481 SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVA 540
Query: 541 SSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR 600
SSSSGTTST+SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR
Sbjct: 541 SSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR 600
Query: 601 IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGL 660
IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE+DAERIYKDERGL
Sbjct: 601 IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGL 660
Query: 661 LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVR 720
LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVR
Sbjct: 661 LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVR 720
Query: 721 ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 756
ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Sbjct: 721 ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A0A0KA27 (Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 989.2 bits (2556), Expect = 9.6e-285
Identity = 705/921 (76.55%), Postives = 719/921 (78.07%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSL-SSSSSSSNPTSSSSP 60
MSGFGFGSSTSQ SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSSPSPLSL SSSSSSSNPTSSSSP
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSP 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
FPNPTSN P SSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSSAPSS+ATSASSLFGVS
Sbjct: 61 FPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGSS----------PAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSS GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSG+S PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSAL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF TSASA +SGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
Query: 241 FGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSP 300
FGASAAASGSG SLFGT ATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
Query: 301 FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSIT-------------------- 360
FQ++LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSF T SLSKTTSIT
Sbjct: 301 FQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNVSSSSSSSSSSSSSSSSSS 360
Query: 361 ------------------------------------------------------------ 420
Sbjct: 361 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 420
Query: 421 ------------------------------------------------------------ 480
Sbjct: 421 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS 480
Query: 481 ---------------TASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINN 540
++SSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINN
Sbjct: 481 SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINN 540
Query: 541 AASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSS 600
AASTGGSSAPSTTATKPTSL SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSS
Sbjct: 541 AASTGGSSAPSTTATKPTSL----------------SASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSS 600
Query: 601 SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA 660
SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTS+ASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA
Sbjct: 601 SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA 660
Query: 661 SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEIT 720
SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVASSSSGTTST+SATVSSTPKLPSEIT
Sbjct: 661 SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVASSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEIT 720
Query: 721 GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAEL 756
GKTVEEII EWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAEL
Sbjct: 721 GKTVEEIINEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAEL 780
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1L2D4 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 867.1 bits (2239), Expect = 5.5e-248
Identity = 628/808 (77.72%), Postives = 668/808 (82.67%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP 60
MSGF FGSS+SQSSSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFGS SPLSL SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS--SPLSL-SSSSSSNPSSSSSA 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSS-------SAPSSSATSA 120
F N TSNPP S+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTGASS +A SSS +
Sbjct: 61 FSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGISGSALFAASSSSGGLS 120
Query: 121 SSLFGVSSSSAGFN--SFG------------FGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSF 180
S FGVSSSS G + SFG FGA+S+S S APLFG+A SSGSSP PSF
Sbjct: 121 SFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSF 180
Query: 181 GAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSSAPLFGAAP 240
GAAP+SGSS+AP FG+ +SS+G+SS+P FGAAP
Sbjct: 181 GAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAP 240
Query: 241 SVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATS 300
SVG +SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA + GS++FGASAAASGS +S
Sbjct: 241 SVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSS-------- 300
Query: 301 SGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSP 360
LFGS+ F +SSSGTLSSVSTSNLF SS SS +PFQNS SSSSSQNL+SSSP
Sbjct: 301 -------LFGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSP 360
Query: 361 FAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSS 420
FAAS SGFSFST SLSKTTSIT A SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSS
Sbjct: 361 FAASSSGFSFSTTSLSKTTSITVA-------SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSS 420
Query: 421 FGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSV 480
FGF+I+NAAS GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+
Sbjct: 421 FGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSM 480
Query: 481 PAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAA 540
PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAA
Sbjct: 481 PAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAA 540
Query: 541 SSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTP 600
SSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTST+SATVS+TP
Sbjct: 541 SSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATP 600
Query: 601 KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKV 660
KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKV
Sbjct: 601 KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKV 660
Query: 661 VETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE 720
VETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE
Sbjct: 661 VETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE 720
Query: 721 YIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEE 756
YIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEE
Sbjct: 721 YIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEE 780
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1H5C8 (nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111460276 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 865.9 bits (2236), Expect = 1.2e-247
Identity = 622/801 (77.65%), Postives = 655/801 (81.77%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP 60
MSGF FGSS+SQ+SSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFGS SPLSL SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQASSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS--SPLSL-SSSSSSNPSSSSSA 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
F N TSNPP S+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTGASS S S SSLF S
Sbjct: 61 FSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGS-------SGSSLFAAS 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSS----------------------------APLFGAASSSG 180
SSS G +SFGFG SSSS SS APLFG+A SSG
Sbjct: 121 SSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSG 180
Query: 181 SSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSS-------------SAGTSSAPLFGAAPSVGASSA 240
SSP PSFGAAP SGSS+AP FG+ S SAG+SS+P FGAAPS G +SA
Sbjct: 181 SSPVPSFGAAPGSGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSSSPFFGAAPSAG-TSA 240
Query: 241 PSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSG 300
PSLFGG SS ATTSSAPLF TSA + GS++FGAS AASGS +S
Sbjct: 241 PSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASTAASGSSSS--------------- 300
Query: 301 LFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSG 360
LFGS+PF +S SSVSTSNLF SS SS +PFQNS SSSSSQNL+SSSPFAAS SG
Sbjct: 301 LFGSNPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSPFAASSSG 360
Query: 361 FSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINN 420
FSFST SLSKTTSIT A SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+N
Sbjct: 361 FSFSTTSLSKTTSITAA-------SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSISN 420
Query: 421 AASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSS 480
AASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+PAFS SS
Sbjct: 421 AASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSMPAFSLSS 480
Query: 481 SAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPA 540
SAATTLSIAASS PS SSGA SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAASSSQAPA
Sbjct: 481 SAATTLSIAASSVPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAASSSQAPA 540
Query: 541 SFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEIT 600
SFGF SLA ASTAATTTSG +ASSQSQTSSTLV+ASSSSGTTST+S TVS+TPKLPSEIT
Sbjct: 541 SFGFSSLAPASTAATTTSGSNASSQSQTSSTLVIASSSSGTTSTVSTTVSATPKLPSEIT 600
Query: 601 GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAEL 660
GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQ EL
Sbjct: 601 GKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQTEL 660
Query: 661 EKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELE 720
EKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELE
Sbjct: 661 EKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELE 720
Query: 721 QMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK 756
QMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK
Sbjct: 721 QMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK 763
BLAST of PI0024463 vs. ExPASy TrEMBL
Match:
A0A6J1DSI7 (nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023501 PE=3 SV=1)
HSP 1 Score: 733.8 bits (1893), Expect = 7.3e-208
Identity = 505/620 (81.45%), Postives = 537/620 (86.61%), Query Frame = 0
Query: 144 FGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFG 203
FGAA ++GSS FGAAPS G+ +SSAG+SS LFGAAPS GA SAPSLFG
Sbjct: 1 FGAALAAGSSSGSVFGAAPS---------GSSASSAGSSSFSLFGAAPSAGA-SAPSLFG 60
Query: 204 GASSATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFG--- 263
G SSAT+SS PLF +SA GSAL GAS AASG SLFGT A+SSGS GS LFG
Sbjct: 61 GVSSATSSSTPLFGSSAPTATPGSALPGASVAASG---SLFGT-ASSSGSAGSALFGAPL 120
Query: 264 -SSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSPFAA-SPSGF 323
++ FG+++ GT S+S LFASS+SS S FQNS SSSSSQ+L+SSSPFAA S SGF
Sbjct: 121 STNSFGSNTFGT----SSSGLFASSISSASTSSFQNSFSSSSSQSLSSSSPFAASSSSGF 180
Query: 324 SFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNA 383
SF T SLSKTT+ TA SSSSS LT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSSFGFS +NA
Sbjct: 181 SFPTTSLSKTTNSVTA------SSSSSPLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSSFGFSFSNA 240
Query: 384 ASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSS 443
AST S+AP TTATKPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTP A+STTQPSFSVPAFS SSS
Sbjct: 241 ASTAASAAPGTTATKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPVASSTTQPSFSVPAFSLSSS 300
Query: 444 AATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPAS 503
AATT+S AASS PSAASSGA SSFTGFGVT+TASSSS I SLSLPTKT TAASSSQ PAS
Sbjct: 301 AATTISTAASSTPSAASSGAASSFTGFGVTNTASSSSPIVSLSLPTKTLTAASSSQPPAS 360
Query: 504 FGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITG 563
FGFPSL SASTAATT+SGFSA SQSQTSSTLVVASSSSGTTST+SA VS+TPKLPSEITG
Sbjct: 361 FGFPSLPSASTAATTSSGFSAPSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSAAVSTTPKLPSEITG 420
Query: 564 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE 623
KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE
Sbjct: 421 KTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELE 480
Query: 624 KKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ 683
+KLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ
Sbjct: 481 RKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQ 540
Query: 684 MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKL 743
MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+
Sbjct: 541 MTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI 596
Query: 744 AATEGPAADRELLGQKFWMS 756
AAT+GPAADRELLGQKFWMS
Sbjct: 601 AATQGPAADRELLGQKFWMS 596
BLAST of PI0024463 vs. NCBI nr
Match:
XP_008459731.1 (PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo])
HSP 1 Score: 1083.2 bits (2800), Expect = 0.0e+00
Identity = 719/766 (93.86%), Postives = 730/766 (95.30%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF 60
MSGFGFGSSTSQ SSSSSPFSSTTGFSFGST FSFGSS SPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQ-SSSSSPFSSTTGFSFGSTTFSFGSSASPLSLSSSSSSSNPTSSSSPF 60
Query: 61 PNPTSNPP-PSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
PNPTSNPP SSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSS PSSSA SASSLFGVS
Sbjct: 61 PNPTSNPPSSSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSVPSSSAPSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS----------GSSPAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSS GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSS GSSPAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSASLFGAGSSPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSAL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF T+ASA +SGSAL
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTAASAASSGSAL 240
Query: 241 FGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSP 300
FGASA ASGSG SLFGT A SSGSTGSGLFGSSPFGASSSGT SSVSTSNLFASSLSSSP
Sbjct: 241 FGASAPASGSGASLFGTSAPSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTSSSVSTSNLFASSLSSSP 300
Query: 301 FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLAST 360
FQ+SLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSF T++LSKTTSIT SSSSSSSLTLAST
Sbjct: 301 FQSSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFPTSTLSKTTSITNV----PSSSSSSSLTLAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT 420
SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT 420
Query: 421 TSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTAS 480
TSASTPAA+STTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSG VSSFTGFGVTS+AS
Sbjct: 421 TSASTPAASSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGTVSSFTGFGVTSSAS 480
Query: 481 SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVA 540
SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVA
Sbjct: 481 SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVA 540
Query: 541 SSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR 600
SSSSGTTST+SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR
Sbjct: 541 SSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR 600
Query: 601 IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGL 660
IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVE+DAERIYKDERGL
Sbjct: 601 IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEDDAERIYKDERGL 660
Query: 661 LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVR 720
LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVR
Sbjct: 661 LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVR 720
Query: 721 ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 756
ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Sbjct: 721 ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 761
BLAST of PI0024463 vs. NCBI nr
Match:
XP_031743587.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical protein Csa_005518 [Cucumis sativus])
HSP 1 Score: 1079.7 bits (2791), Expect = 0.0e+00
Identity = 717/766 (93.60%), Postives = 729/766 (95.17%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTAFSFGSSPSPLSL-SSSSSSSNPTSSSSP 60
MSGFGFGSSTSQ SSSPFSSTTGFSFGST FSFGSSPSPLSL SSSSSSSNPTSSSSP
Sbjct: 1 MSGFGFGSSTSQ---SSSPFSSTTGFSFGSTNFSFGSSPSPLSLSSSSSSSSNPTSSSSP 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
FPNPTSN P SSSFGFGSSSFS+STSSPFSFSLASASTGASSSSAPSS+ATSASSLFGVS
Sbjct: 61 FPNPTSN-PSSSSFGFGSSSFSTSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSAATSASSLFGVS 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGSS----------PAPSFGAAPSSGSSLA 180
SSS GFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSG+S PAPSFGAAPSSGSS+A
Sbjct: 121 SSSTGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGTSSTSLFGAGSLPAPSFGAAPSSGSSVA 180
Query: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSGSAL 240
PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPS GASSAPSLFGGASSATTSSAPLF TSASA +SGS L
Sbjct: 181 PSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSAGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFGTSASAASSGSGL 240
Query: 241 FGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSSSP 300
FGASAAASGSG SLFGT ATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSS STSNLFASSLS+SP
Sbjct: 241 FGASAAASGSGVSLFGTPATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSASTSNLFASSLSTSP 300
Query: 301 FQNSLSSSSSQNLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLAST 360
FQ++LSSSSSQNLTSSSPF ASPSGFSF T SLSKTTSIT SSSSSSSLTLAST
Sbjct: 301 FQSTLSSSSSQNLTSSSPFVASPSGFSFPTGSLSKTTSITNV-----SSSSSSSLTLAST 360
Query: 361 SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT 420
SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT
Sbjct: 361 SSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTT 420
Query: 421 TSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTAS 480
TSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTS+AS
Sbjct: 421 TSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSSAS 480
Query: 481 SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVA 540
SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSS LVVA
Sbjct: 481 SSSAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSALVVA 540
Query: 541 SSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR 600
SSSSGTTST+SATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR
Sbjct: 541 SSSSGTTSTVSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRR 600
Query: 601 IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGL 660
IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKAL+SVEEDAERIYKDERGL
Sbjct: 601 IMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALVSVEEDAERIYKDERGL 660
Query: 661 LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVR 720
LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVR
Sbjct: 661 LLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVR 720
Query: 721 ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 756
ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQK WMS
Sbjct: 721 ILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKLWMS 757
BLAST of PI0024463 vs. NCBI nr
Match:
XP_038874708.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida])
HSP 1 Score: 906.4 bits (2341), Expect = 1.7e-259
Identity = 638/764 (83.51%), Postives = 660/764 (86.39%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP 60
MSG G GSS+SQ SSSSSPFSS+TGFSFGST AFSFGSS +PLSL SSSSSSNPTSSSSP
Sbjct: 1 MSGSGSGSSSSQWSSSSSPFSSSTGFSFGSTSAFSFGSSSTPLSL-SSSSSSNPTSSSSP 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
F N T NP SSS GFGSSSF SS SSPFSFSL
Sbjct: 61 FSNQTPNPASSSSSGFGSSSFPSSASSPFSFSLPL------------------------- 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGALSSSA 180
FG++ SS SSAPLFG+ASSSGSSPAPSFG A SSGSSL PSFGAL SS
Sbjct: 121 ----------FGSAPSSGTSSAPLFGSASSSGSSPAPSFGPASSSGSSLVPSFGALPSS- 180
Query: 181 GTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLF-STSASATNSGSALFGASAAASG 240
G+SSAPLFGA PS GA SAPSLFGG SSATTSSAPLF +TSAS + GSALFGAS AASG
Sbjct: 181 GSSSAPLFGATPSAGA-SAPSLFGGVSSATTSSAPLFGTTSASTASPGSALFGASVAASG 240
Query: 241 SGTSLFGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLS 300
S +SLFGT +T+SGS+GS LFGSSPFGAS SS+STSNLFASS SS SPFQNS S
Sbjct: 241 SSSSLFGT-STTSGSSGSALFGSSPFGAS-----SSLSTSNLFASSSSSTSTSPFQNSFS 300
Query: 301 SSSSQNLTSSSPFAA----SPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSS 360
SSSSQNL SSS FAA S SGFSFST SLSKTTSITTA SSSSSLT ASTSS
Sbjct: 301 SSSSQNLNSSSLFAASSSSSSSGFSFSTVSLSKTTSITTA-------SSSSSLTTASTSS 360
Query: 361 SSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTS 420
SSFSFGTPASS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLS+SVAPLFSTVTTTS
Sbjct: 361 SSFSFGTPASSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSSSVAPLFSTVTTTS 420
Query: 421 ASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSS 480
STPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASS PSA+SSGAVSSFTGFGVTS ASSS
Sbjct: 421 GSTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSVPSASSSGAVSSFTGFGVTSMASSS 480
Query: 481 SAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASS 540
SAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSL SA T ATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASS
Sbjct: 481 SAIGSLSLPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLTSAPTPATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASS 540
Query: 541 SSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIM 600
SSGTTST++ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIM
Sbjct: 541 SSGTTSTVNATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIM 600
Query: 601 QNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLL 660
QNRDILLRLEIEVAKVVE+QAELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLL
Sbjct: 601 QNRDILLRLEIEVAKVVESQAELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLL 660
Query: 661 DDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRIL 720
DDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTP+DAVVRIL
Sbjct: 661 DDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPLDAVVRIL 713
Query: 721 NNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 756
NNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS
Sbjct: 721 NNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFWMS 713
BLAST of PI0024463 vs. NCBI nr
Match:
XP_023006514.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima])
HSP 1 Score: 867.1 bits (2239), Expect = 1.1e-247
Identity = 628/808 (77.72%), Postives = 668/808 (82.67%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP 60
MSGF FGSS+SQSSSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFGS SPLSL SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS--SPLSL-SSSSSSNPSSSSSA 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSS-------SAPSSSATSA 120
F N TSNPP S+ FGF SSSF SS SSPFSFSL +ASTGASS +A SSS +
Sbjct: 61 FSNQTSNPPSSTPFGFASSSFPSSASSPFSFSLPAASTGASSGISGSALFAASSSSGGLS 120
Query: 121 SSLFGVSSSSAGFN--SFG------------FGASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPSF 180
S FGVSSSS G + SFG FGA+S+S S APLFG+A SSGSSP PSF
Sbjct: 121 SFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSGSSPVPSF 180
Query: 181 GAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSSAPLFGAAP 240
GAAP+SGSS+AP FG+ +SS+G+SS+P FGAAP
Sbjct: 181 GAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGASPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSSPFFGAAP 240
Query: 241 SVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSLFGTLATS 300
SVG +SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA + GS++FGASAAASGS +S
Sbjct: 241 SVG-TSAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSS-------- 300
Query: 301 SGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQNLTSSSP 360
LFGS+ F +SSSGTLSSVSTSNLF SS SS +PFQNS SSSSSQNL+SSSP
Sbjct: 301 -------LFGSNSFASSSSGTLSSVSTSNLFGSSSSSASTTPFQNSFSSSSSQNLSSSSP 360
Query: 361 FAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSS 420
FAAS SGFSFST SLSKTTSIT A SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPASS+SQSS
Sbjct: 361 FAASSSGFSFSTTSLSKTTSITVA-------SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPASSASQSS 420
Query: 421 FGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSV 480
FGF+I+NAAS GSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST QPSFS+
Sbjct: 421 FGFNISNAASLEGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATSTAQPSFSM 480
Query: 481 PAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLPTKTSTAA 540
PAFS SSSAATTLSIAASSAPSA SSGA SSFTGFG+TSTA+SSSAI SLSLPTK+ TAA
Sbjct: 481 PAFSLSSSAATTLSIAASSAPSATSSGAASSFTGFGITSTAASSSAIVSLSLPTKSLTAA 540
Query: 541 SSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTP 600
SSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTST+SATVS+TP
Sbjct: 541 SSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVSATVSATP 600
Query: 601 KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKV 660
KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRLEIEVAKV
Sbjct: 601 KLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRLEIEVAKV 660
Query: 661 VETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE 720
VETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE
Sbjct: 661 VETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAE 720
Query: 721 YIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEE 756
YIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEE
Sbjct: 721 YIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEE 780
BLAST of PI0024463 vs. NCBI nr
Match:
XP_023548092.1 (nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo])
HSP 1 Score: 866.7 bits (2238), Expect = 1.5e-247
Identity = 627/815 (76.93%), Postives = 658/815 (80.74%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSFGST-AFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPTSSSSP 60
MSGF FGSS+SQSSSSSSPFSSTTGFSFGST AFSFGS SPLSL SSSSSSNP+SSSS
Sbjct: 1 MSGFSFGSSSSQSSSSSSPFSSTTGFSFGSTSAFSFGS--SPLSL-SSSSSSNPSSSSSA 60
Query: 61 FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSASSLFGVS 120
F N TSNPP S+ FGF SS F SS SSPFSFSL +ASTG SS S S SSLF S
Sbjct: 61 FSNQTSNPPSSTPFGFASSPFPSSASSPFSFSLPAASTGVSSGS-------SGSSLFAAS 120
Query: 121 SSSAGFNSFGFGASSSSANSS----------------------------APLFGAASSSG 180
SSS G +SFGFG SSSS SS APLFG+A SSG
Sbjct: 121 SSSGGLSSFGFGVSSSSGGSSAPSFGAAPTSGSSPVPSFGAASASGTSFAPLFGSAPSSG 180
Query: 181 SSPAPSFGAAPSSGSSLAPSFGA---------------------------LSSSAGTSSA 240
SSP PSFGAAP+SGSS+AP FG+ +SS+G+SS+
Sbjct: 181 SSPVPSFGAAPASGSSVAPLFGSAPSSGSSPLPSFGAAPSAGSSPLPSFGAASSSGSSSS 240
Query: 241 PLFGAAPSVGASSAPSLFGGASS-ATTSSAPLFSTSASATNSGSALFGASAAASGSGTSL 300
P FGAAPS GA SAPSLFGG SS ATTSSAPLF TSA + GS++FGASAAASGS +S
Sbjct: 241 PFFGAAPSAGA-SAPSLFGGVSSAATTSSAPLFGTSAPTASPGSSIFGASAAASGSSSS- 300
Query: 301 FGTLATSSGSTGSGLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASSLSS---SPFQNSLSSSSSQ 360
LFGSSPF +S SSVSTSNLF SS SS SPFQNS SSSSSQ
Sbjct: 301 --------------LFGSSPFASS-----SSVSTSNLFGSSSSSASTSPFQNSFSSSSSQ 360
Query: 361 NLTSSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSSSSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPA 420
NL+SSSPFAAS SGFSFST SLSKTTSIT A SSSSSLT ASTSSSSFSFGTPA
Sbjct: 361 NLSSSSPFAASSSGFSFSTTSLSKTTSITAA-------SSSSSLTSASTSSSSFSFGTPA 420
Query: 421 SSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLSLSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANST 480
SS+SQSSFGFSI+NAASTGGSSAP TTA KPTSLS S SVAPLFSTVTTTSASTPAA ST
Sbjct: 421 SSASQSSFGFSISNAASTGGSSAPGTTAAKPTSLSFSTSVAPLFSTVTTTSASTPAATST 480
Query: 481 TQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGAVSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLSLP 540
QPSFS+PAFS SSSAATTLSIAASSAPS SSGA SSFTGFGVTSTA+SSSAI SLSLP
Sbjct: 481 AQPSFSMPAFSLSSSAATTLSIAASSAPSTTSSGAASSFTGFGVTSTAASSSAIVSLSLP 540
Query: 541 TKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSGFSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLS 600
TK+ TAASSSQAPASFGF SLASAS AATTTSG +ASSQSQTSSTLVVASSSSGTTST+S
Sbjct: 541 TKSLTAASSSQAPASFGFSSLASASAAATTTSGSNASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTVS 600
Query: 601 ATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRL 660
ATVS+TPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRI+QNRDILLRL
Sbjct: 601 ATVSATPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERTGKFRKQANAIAEWDRRILQNRDILLRL 660
Query: 661 EIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALLSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD 720
EIEVAKVVETQ ELEKKLELIETHQQEVDKAL SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD
Sbjct: 661 EIEVAKVVETQTELEKKLELIETHQQEVDKALQSVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRD 720
Query: 721 AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGGELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMW 756
AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNA+QGGELDVIDGMTP+DAVVRILNNQLSSLMW
Sbjct: 721 AMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNASQGGELDVIDGMTPLDAVVRILNNQLSSLMW 777
BLAST of PI0024463 vs. TAIR 10
Match:
AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )
HSP 1 Score: 394.0 bits (1011), Expect = 2.6e-109
Identity = 406/782 (51.92%), Postives = 522/782 (66.75%), Query Frame = 0
Query: 1 MSGFGFGSSTSQSSSSSSPFSSTTGFSF------GSTAFSFGSSPSPLSLSSSSSSSNPT 60
+ GF FGSS++ +SSS+S +S FSF ST F FGSS S SS++ S
Sbjct: 12 VGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGFGSSVSSTPASSTTPSFGFG 71
Query: 61 SSSSP-FPNPTSNPPPSSSFGFGSSSFSSSTSSPFSFSLASASTGASSSSAPSSSATSAS 120
+SS+P F +S + SFGFGSS+ + S+ SF + A+SSSAP+ S S
Sbjct: 72 ASSTPSFGFGSSASSSTPSFGFGSSASVTPASTTPSFGFGT----AASSSAPAPS-LFGS 131
Query: 121 SLFGVSSSSAGFNSFGF--GASSSSANSSAPLFGAASSSGSSPAPS-FGAAPSSGSS--- 180
S SS++ G + FGF ++SS+A S+ LFGA +SS ++P+ S FGAAP+SGS+
Sbjct: 132 STTNASSAAPGSSPFGFVTSSASSTATPSSSLFGAPASSAATPSSSPFGAAPASGSTPLF 191
Query: 181 -LAPSFGALSSSAGTSSAPLFGAAPSVGASSAPSLFGGASSATTSSAPLFSTSASATNSG 240
+PS + SSA S++ LFGA+ S S++P LFG SSA T + P FS ++SA S
Sbjct: 192 GSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSSAATSTSP-LFGAPSSA-TGATPSFSVASSAPGSS 251
Query: 241 SALFGASAAASGSGTSLFGTLATSSGSTGS--GLFGSSPFGASSSGTLSSVSTSNLFASS 300
S++FG A+GS S F +++SGS+ S G GSSPF SSS S+ ST +LFASS
Sbjct: 252 SSIFG----ATGSSPS-FSVASSASGSSPSIFGATGSSPFFGSSS---SAGSTPSLFASS 311
Query: 301 LSS------SPFQNSLSSSSSQNLT---SSSPFAASPSGFSFSTNSLSKTTSITTASSSS 360
S SPF S +SSS + T S+SPF+AS +GFSF ++ S TTS TT S+
Sbjct: 312 SSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSAS-TGFSFLKSTASSTTSSTTPSAPP 371
Query: 361 SSSSSSSSLTLASTSSSSFSFGTPASSSSQSSFGFSINNAASTGGSSAPSTTATKPTSLS 420
++S SSSSFSFGT A+S GF++ STG S+AP++ S
Sbjct: 372 QTAS----------SSSSFSFGTSANS------GFNL----STGSSAAPAS--------S 431
Query: 421 LSNSVAPLFSTVTTTSASTPAANSTTQPSFSVPAFSSSSSAATTLSIAASSAPSAASSGA 480
S +V + +T TTTS+STPAA T+ P+ S PA + + + S A ++ P ASS A
Sbjct: 432 TSGAVFSI-ATTTTTSSSTPAA--TSAPASSAPASTMAFPSFGVTSSATNTTP--ASSAA 491
Query: 481 VSSFTGFGVTSTASSSSAIGSLS--LPTKTSTAASSSQAPASFGFPSLASASTAATTTSG 540
S TGFG+ S+ ++ + S + KTST ASSSQ + P+ + + ++T+T+
Sbjct: 492 TFSTTGFGLASSTPATGSTNSFTGFAVPKTSTPASSSQPQTT--SPAFSFSLPSSTSTTA 551
Query: 541 FSASSQSQTSSTLVVASSSSGTTSTLSATVSSTPKLPSEITGKTVEEIIKEWNAELQERT 600
+ SS + T +TLVV SSS TST A V+ +PKLPSEITGKTVEEIIKEWN ELQERT
Sbjct: 552 PATSSATTTQTTLVVPSSSG--TSTAVAPVAGSPKLPSEITGKTVEEIIKEWNTELQERT 611
Query: 601 GKFRKQANAIAEWDRRIMQNRDILLRLEIEVAKVVETQAELEKKLELIETHQQEVDKALL 660
G+FRKQANAIAEWD+RI+QNRD+LLRLEIEVAKVVETQ+ LE++LELIETHQQEVDKAL
Sbjct: 612 GRFRKQANAIAEWDKRILQNRDVLLRLEIEVAKVVETQSSLERQLELIETHQQEVDKALQ 671
Query: 661 SVEEDAERIYKDERGLLLDDEAASTRDAMYEQAEYIERELEQMTEQIKSIIQTLNANQGG 720
S+EE+AERIY DER LLDDEAASTRDAMYEQ+E +ERELE MTEQI+SIIQ++NANQGG
Sbjct: 672 SMEEEAERIYNDERKSLLDDEAASTRDAMYEQSELVERELEHMTEQIRSIIQSVNANQGG 731
Query: 721 ELDVIDGMTPIDAVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKLAATEGPAADRELLGQKFW 756
EL+ IDGM+P+D VVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQK+ A +G DREL+ K W
Sbjct: 732 ELEAIDGMSPLDVVVRILNNQLSSLMWIDEKAEEFSSRIQKI-ALQGSGGDRELMAPKHW 739
The following BLAST results are available for this feature:
Match Name | E-value | Identity | Description | |
Q8L7F7 | 3.7e-108 | 51.92 | Nuclear pore complex protein NUP62 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP62 PE=1... | [more] |
G0SBQ3 | 8.5e-04 | 28.90 | Nucleoporin NSP1 OS=Chaetomium thermophilum (strain DSM 1495 / CBS 144.50 / IMI ... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
A0A1S3CAD4 | 0.0e+00 | 93.86 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103498773 PE=3 ... | [more] |
A0A0A0KA27 | 9.6e-285 | 76.55 | Nsp1_C domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G108530 PE=3... | [more] |
A0A6J1L2D4 | 5.5e-248 | 77.72 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499220 P... | [more] |
A0A6J1H5C8 | 1.2e-247 | 77.65 | nuclear pore complex protein NUP62 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=L... | [more] |
A0A6J1DSI7 | 7.3e-208 | 81.45 | nuclear pore complex protein NUP62 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC11102350... | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
XP_008459731.1 | 0.0e+00 | 93.86 | PREDICTED: nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis melo] | [more] |
XP_031743587.1 | 0.0e+00 | 93.60 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucumis sativus] >KGN46560.2 hypothetical pr... | [more] |
XP_038874708.1 | 1.7e-259 | 83.51 | nuclear pore complex protein NUP62 [Benincasa hispida] | [more] |
XP_023006514.1 | 1.1e-247 | 77.72 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita maxima] | [more] |
XP_023548092.1 | 1.5e-247 | 76.93 | nuclear pore complex protein NUP62 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | [more] |
Match Name | E-value | Identity | Description | |
AT2G45000.1 | 2.6e-109 | 51.92 | structural constituent of nuclear pore | [more] |