PI0016085 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGATACCCTCACTCGCATGTCACCTACACGAACGCGTTGGATCATTGCGTTTGTATCAAATACAAAGTGAGCCGTATCCACAGTGTTACCAGGATAAGGTACCCAACCTTATCCCTATACTATAGACCCTTTAAGTTTTATCTCGAACATTGATCCTTGTATGTCTCCACATACAGTTCAAGACTCATCAAACAACTTAGGATGTTAGTTTATTGGATTTAGGTTATTAAGACAAAACTAATATTATAATCAATAACGCTTTATTGAAATTATAATAATAACACTTTTATTAATCACAGTCAATAGATTACATTTACTATCCACGAGTTTTAGGACATAAAACCCAACAGTTGGATGAGTCCATCCTCCAATGATAGCCTTCCAGGTTCTGCTGTCAACCGATTTTAGAAAAGCAGTCATCCTTGCTTTCCAGTATGCATAATTTGATCCGTCCAGAACAGGTGGTCTGGTAGTAGATCCTCCTTTGGAAGGTGGTGTATAAAATCAGAGGGTGATCAATTAATGGATGTTAAGGGTCTCCTGTTGTCCAGGTTCATCCATTCATTCATGTTCCATTGCATCAGCTTATGAATTATGCTTTTTGGCCCTCTTTCTCAAGCTAAGTAACGCTGGTAATGAAAATATTGTTTATCAAATGCAGTACATCTTTATTGAAAGAAATAAGAAACCTGTAAGGCTGCAATCATATTAACAAAGCCCTACTACAAAATAAGACAATATATGAGTTCTCCCAAGCTGCAATAAAGCATACAAAAAAATGGTTCAGTTGGCAGTTATAAAATGCAAGTCAGAAGTCTTCTTCTTGATAGTATTCTAGCCTTTTATTGAAAAAAGTAAAAGAAAAACTAGCCCATAAGAGGAAGCATCCCTAAAGAAAGGGGCTTAGCAAACAAAATAAGACTTATGGAAGAAATTTTTTTTCTCCAAAGTAGGAAGGCTTACTTTGATAAGATTGGTGCTTAGTGGTATTCCCATGTATTTTTTCTCCCTCTTTAAGGCGCCTAGCTGGGTTTGCAAGTGCTTGGAGAAGTGTTTGAGAGACTTTCTCTGGGAAGGAGTGGAGGAAGGGAAGGATTCTCACTTGGTCAGTTGGGAGGCGTTGGGACGCTCTATTAACTAAGGAGGGTTGAAAATGGGCAACCTAAGGATTAGAAACAGAGCTTTGTTGGCTGAGTGGCTTTGGCGTTTTGCCCTTGAGCCCGAATCTTTGTTGCATCGGATTATGGCAAGTAAACATGGCAACCATCCTTTTGATTGGGTGAAGAAAGGGGTTAAAAGGCACACACCGGATTCTATGGAAAGACATTTCGCTTGAGCTGCCCACTTTTTCTCCTTTTGTTTGTTGTATTGTGGGGGATGGTAAGACACTTATTTTTGGGAAGATCATTGGGTGGGAGGCAATTCTCTTTCTTCGACTTTTTCGCATCTTTATCATTTGTCTTCCTTAAAAAACTGCCCGATCTCGAATTTTTGAGTTGGTCCAAGAGTTTCGTGTCTTTTTCTTTCGGGTTTCATCGTCATTTGACCAATAAGGAGACGACAAGGTTGCTACTCTCCTTTCTCTTCTGGAGGAGTCCACGTTTAGGTTGGGGAGGAGGGATGTTTGTATTTGGAGTCCAAACCTTAGTGAAGGCTTTTCTTGTAAACCCTATTTCAGATTGTTGTTGAATCCCACCCCATTTAAGGAGTCGGGCTTTGATGTGGTTTGGAGGATTAAGATTCCTAAGAAAGTTAGGTTCTTTATGTGGCAAGTCTTGCTAGGTTAGGTGAACACCTTAGAAAGGCTCGTTAGGAGAAGGACCTTGCGTGTAGGGCTTTTTTGATGTATTCTCTGACGGAAGGCGGAGGAAGCCCTTGATTATCTCCTATGGGGTTGTCAGTATGCCTAAGTGGTGTGGAGTTATTTTTTGCAGGAGTTCGAGGCTCAGTTAGCCGACCATCCTGACGTTTGTGTTGTGATTGTGGAACTCCTCCTCCATCCACCTTTTAAAGACAAATGTCGTTTTCTGTGGTTTGTGAGGGTGTGTGATGTGTTACGGGATTTTTGGGGGGAGATGAATAATAGAGTTTTTAGAAGGAGTTAGGGACCCTTATGAGGTTTGGTCCTTAGTTAATTTCATGTGCCCTTTTGGGCTTCGATTTTGAAACTTTTTTGTAACTATTCACTCGTAATATTTAACTTACTTGGAACCTCTTCCTTTAGTTGGGGTGTTTTGGTGCAATTTTTTTATGTCCTTGTATTCTTTCATTTTTTTCTCCATGAAAGTTGTTTTCATAAAAAAAAAAAAAGAAAAATTAATGAATAGTTACAAAAAACAATTGTCAGTAATGTCCAAACAACACTTGGAACTCTTTCCACTTTTCTAAAGATTCTATTTTTCTTCTCTCCCTATAAGATCCTACAACAACAAAACACATATTCCGACTTGACTGAACCTCCCCTTCTCCCGAAACAGTAGATGGGAAATGAACTCAATCATCTCATAGTAACTTTATGTCAAGATTCAAGATCACTGAAAGTCAAGCACCTCGAAAAAAAGGAAGGAAAAGAAAAAAAATAAGAAAACTCCCTATAGACCGTGCGAAGCCCCAACTCTAAAAAATATGATACAATTCTTTTTTTGTCCTTTGTTAAAGAATTTAACAAAAGGGCCCTACCAAAGAAGAAAACTTTTTCAAAAGTTGATCAAGAGTATTAAATCTTTCGCGAATAACTTAGTAGATGAAGAACTTAACCTCATTTGGGATTTCACCTTCCATAGTGCAGAGAAGAAAATTCCTAGAGAGGGTAGGGTCTAGCAAGTAGTGAGAGAAAGAGCTACAAGTGAAACCCGCAAAAGAGAAAGCTCAAAGTACATCTTAAAGATACAAATAACAATAATTCAAAAGGATCAACGAGTGTACTTGGGACATCTGAACTAGGCTACGACCTTACTTGAACTGGATCTGTTTTATAGGTTGTACATCTTTGTCCTTGAGTTCTAAAGACATCTGAGCTAGGCTCACAACCCCCTTAGCACTCTCATCATTTCCAACAAAATGGAACAAGCTGCTTTACAAGGCTTTGATTTGGATTCAAGGATAAATCCTTTAACAGGAGAGGATGATATAAACCGTCTAGATATCAAATTACTAATTAATTTTTTTAATATTTTTTATTAGTTTTAGTATTTTCCAATTTTATCCTTTTTATGACATTTAAGTAAGGTTAATTTTGTCATTTTACTATGTTGCATTAGAGTTTTTATTGGAAAACTATTTAAAATCTTGTCATTAGGTTGTTCAGAAGTTTTTAGGGTGAATTGAATTAGTTTTGAGCTTTTCTTTCAAGGTTAGCCTAGAGAGCTTCTTGAATTTTGCAATTCATGTATGCCACAACATTCAAGATCGATCATCCTATCGTGTGGAGTGTTCAAATCTTGGGCTAGGAAACTTGTTCTTTGTCTCAAGATAATTGATCTTAAAGCGATCCGTGTCTAACCCAATCCTTAGGGTTGAAATTGAGCTAATTTGAGAGTTTTAGTGATTCAGAATTAGGGGTTCCTTTCATTGATTTATATTAAATGAAATAATTCACTTCCATGGATTAATAGATTGAATTCTGCTCGTCTTATAGCATCACCCTGGTGCACACTTTCCAAGCTCTTCGTAGACTATTCAATTCAAAATATTTGCTTAATTGGATTGCTTTTATTCTCTCTGTAATATTTTCATAACATGTTGGTTATCTTTGACTTTCTGTATTAGGTTTTCTTATTTATATGTTTCTTGTACTTTGAGCATTAGTCTCTTTTCATTATTTCAATGAAGAGATTTGTTTCCTTGTCTAGTCATCAAACCATTGCAAGTTAATAAGGCTCTATTAGATTTTCTTTATTGCTTGACATTTATTTGAATTTCAAAATCAACTTGAATGGAATATTAAATTCAAAGATGATCTAATCAATGCTTCAGTTTGGGATCCCATAGTTTTAAAAATAGAAATTATAAAACTTTAACAAACTGTATATCTTCCAAAGAAGAAAACATAAAATTAAATGTGAAATAGTTCAAAGCAGAATTTAAGAACCAAGCTATCTTCCACGGCCCTTCAAACAAATTCTGTCATCTGCCTAAGTTGTTCTGTTTTTACCTGAAACAAACATCTAGAAAAGGATACGTATTGGCATACTTAGTAAGAGACCGGACTGTTGGGATCAGGACATGTACAGACAACCACCATGACTATGCAGGTATAAGTATGTGGAACCCAAACTTGCCTCCTCCCGATGCTCACTCCTCTTTAATAACTTGGGATGTGCATCTCTTTTGTACACATACGTATGTGTACATCTCTTTCATATATACAGAATCCATTGAACGTGCATCTCTTTCATATACACAACCCACCTGAGATGCAGTTTATGCAATGGTTGAAGGTGGAGCCATTTGGGTTTAATCTCAAGTTTGAACTGTGAAATGTGAAAGAAAACGGGAAAAATGAAGAAGGTGGCTAGTTATAGAGGATAAATAAAAGAAAGAAATTTACCTTTATTGCTTTGGAAGAAAGAGATTTTTGTGGCTCTAGGCGAAAATTGTAAGGGATTTTAAGGAAATCATCTAAATACCTTGGAGCCGTTAGATTTACAAGGCACTTATTAGAAGATACTGCGTTCTAGACTGGAAACATTTTTAATAAGATTCTGTGATTGCTCACATTAAGATACACATTACTTGAATGTAGTCTCTTTCACATTGTTAATGCTAGCTTGTAATAGTGGTATGAGTAATTATATACTCTGTTATGCGGTACATATGGGGAACAAATGATGAAAATAAATTATTAATTAAAAATCAAATGGATAGGGTTTTGTTTCTAATAATGCAACTAAAAAAGTTATAATACCTTTCGGGAATTTGTACATTGTACTAGTGAAAAACTGGAAAGTAGGCAAACTTGAAGAATTTGTTTGCATTTCCCCAACTTTTTT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BLAST of PI0016085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P73625 (Endonuclease MutS2 OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 254.2 bits (648), Expect = 3.7e-66 Identity = 196/580 (33.79%), Postives = 284/580 (48.97%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q38YN3 (Endonuclease MutS2 OS=Lactobacillus sakei subsp. sakei (strain 23K) OX=314315 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 231.5 bits (589), Expect = 2.6e-59 Identity = 151/385 (39.22%), Postives = 229/385 (59.48%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B8D298 (Endonuclease MutS2 OS=Halothermothrix orenii (strain H 168 / OCM 544 / DSM 9562) OX=373903 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 226.5 bits (576), Expect = 8.2e-58 Identity = 138/380 (36.32%), Postives = 218/380 (57.37%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9KYW4 (Endonuclease MutS2 OS=Thermomicrobium roseum (strain ATCC 27502 / DSM 5159 / P-2) OX=309801 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 226.1 bits (575), Expect = 1.1e-57 Identity = 144/380 (37.89%), Postives = 216/380 (56.84%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A5D0W6 (Endonuclease MutS2 OS=Pelotomaculum thermopropionicum (strain DSM 13744 / JCM 10971 / SI) OX=370438 GN=mutS2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 224.9 bits (572), Expect = 2.4e-57 Identity = 151/386 (39.12%), Postives = 208/386 (53.89%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BZK6 (Endonuclease MutS2 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold351G00060 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 2.3e-310 Identity = 561/579 (96.89%), Postives = 568/579 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CJJ8 (endonuclease MutS2 isoform X4 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501168 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 2.3e-310 Identity = 561/579 (96.89%), Postives = 568/579 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHZ5 (endonuclease MutS2 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501168 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 2.3e-310 Identity = 561/579 (96.89%), Postives = 568/579 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CHX9 (endonuclease MutS2 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501168 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1067.4 bits (2759), Expect = 2.2e-308 Identity = 560/579 (96.72%), Postives = 567/579 (97.93%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CIG3 (endonuclease MutS2 isoform X3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103501168 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1013.4 bits (2619), Expect = 3.8e-292 Identity = 538/579 (92.92%), Postives = 545/579 (94.13%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. NCBI nr
Match: XP_008462895.1 (PREDICTED: endonuclease MutS2 isoform X1 [Cucumis melo] >TYK04605.1 endonuclease MutS2 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 4.7e-310 Identity = 561/579 (96.89%), Postives = 568/579 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. NCBI nr
Match: XP_008462898.1 (PREDICTED: endonuclease MutS2 isoform X4 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1073.5 bits (2775), Expect = 4.7e-310 Identity = 561/579 (96.89%), Postives = 568/579 (98.10%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. NCBI nr
Match: XP_008462896.1 (PREDICTED: endonuclease MutS2 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1067.4 bits (2759), Expect = 4.6e-308 Identity = 560/579 (96.72%), Postives = 567/579 (97.93%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. NCBI nr
Match: XP_004137269.1 (uncharacterized protein LOC101220812 isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN53757.2 hypothetical protein Csa_015319 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1055.0 bits (2727), Expect = 2.4e-304 Identity = 552/578 (95.50%), Postives = 560/578 (96.89%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. NCBI nr
Match: XP_011653396.1 (uncharacterized protein LOC101220812 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1048.9 bits (2711), Expect = 1.7e-302 Identity = 551/578 (95.33%), Postives = 559/578 (96.71%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. TAIR 10
Match: AT5G54090.1 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 510.0 bits (1312), Expect = 2.7e-144 Identity = 298/590 (50.51%), Postives = 397/590 (67.29%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. TAIR 10
Match: AT1G65070.1 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 2.2e-53 Identity = 177/599 (29.55%), Postives = 283/599 (47.25%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. TAIR 10
Match: AT1G65070.2 (DNA mismatch repair protein MutS, type 2 ) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 2.2e-53 Identity = 177/599 (29.55%), Postives = 283/599 (47.25%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. TAIR 10
Match: AT3G24320.1 (MUTL protein homolog 1 ) HSP 1 Score: 92.4 bits (228), Expect = 1.3e-18 Identity = 78/232 (33.62%), Postives = 117/232 (50.43%), Query Frame = 0
BLAST of PI0016085 vs. TAIR 10
Match: AT3G18524.1 (MUTS homolog 2 ) HSP 1 Score: 78.2 bits (191), Expect = 2.6e-14 Identity = 56/190 (29.47%), Postives = 94/190 (49.47%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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