PI0009960 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CCCCACCCAACTTCTTCCCATTTCTTCTACTCACCAACACCATCCGTCAGACCTACGCCCGTCGCCGCCGCGCCTCAACCTCGCTGCAGCCTCTCCACCCACCATCCCCGCGCCACTCAGCCTTGCCCTTGCCTTGCCGCCACCACCGGTCAGTTTCAAAGCTCTCTGGCTCATATACTTTTTTGTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCACTCTTCCTGAGACCTCCTTTAGTTTTAATTTGAATATTTAGGTAGCTAGTTAACTAATATGTCATCTTCATCCTCAAGCCAAAGTCAATTCTCAAATCCTTCCATATAAATTCAACTTCCTCCATTGTTGAAGATGATTCTAAACCCTTTTGGCGAATCATTCTTAAACAAAGTGTATTTTATGCTTTGGTGGATTACAGTTATGTTTATGTTAAATTTATATATACAAGAAAATGTAAAAAAAAAATATATAAAAAATTACGTATCCTCGATATATTCTTATTTTAGTTTTTAATCGCTGTATCTGATCGTATTCGTATAGCATATCTTTATCCATGTACGTGCTTCTTAAGATATGGGTATGGAATAATTTTTGTTTTTATTCATTTGTTTTATCTGACCTCGAATACAGATTTTCTCTTTGGGTGGTAAACCCCCTGAAAAAGCGATTGAAGGAGAAACAAATTTTCCTTCATTTCTACCGGTGCCAGAAGCTACCCAAAACCCCAAAGAACAAGCTGAGAAATTTCTTTCAGTAGGGTGATCGGAGATGAAGGTGGTGGCATTGGTGAGCGGTGGCAAAGACAGTTGCTTTGCCATGATGAAGTCTATTCAATATGGCCATGAGGTTTTGTCTTCTCTTTTGATTTCTCATCTTTACTCTTCTTCTTCTTCTTTTGTCTGGCTTCGAGAACATTGTTGATTGGCTGCTCTGTTTTACTTCTTTTTTCAATTTATGTTTGTTTGATTTTTAATTTCTTGTAAACTTATGCCTGTGCTTGGTTGTGTTCTTCTATGTTTGGTTTAGATTGTAGCGTTAGCTAATTTGATGCCTGCCGATGATTCTGTGGATGAGCTTGATAGTTACATGTATCAAACTGTAAGTCTTCCTGCCCTCTTCCTTATGCAAAATATTGTGCACTCGTTCACTTACATTTTTGAAGTCAATGGTTGATTTGGATCGTTGTCCTTAATCATGAAAGTGTTTACTTTTTTGGTGCATGTTTCACTCATGCATTCCACTAATGTGAAAGTATATTGTATTTTTGTTGTTAGTATGAAGCAACATTATTTTGTCTACCTCAAGTACAACAGTTAACTCAGTCCTTTGAGTTGAGCCTTGAGTTACCTCACTCCTTTTAGGTTTATACATAATTAGTATCCTCACTCCTTTGGGTTTCTATAATCTATATATCTTTTCATTTGAAAGGTAATTGAAGACCTGTAATCCATGATTGCTAATTTGGGTTATTGGCTATAAATCTTCAGGTTGGACATCAAATTATTGTTAGCTACGCAGAATGCATGGGAATTCCATTGTTTAGAAGGCGAATTCAAGGATCCACCAGGCAAGCCTATTAAACAAAATAATTTATTTGATAAAAAAGAATACTGTTGGTGCGTGCATTTTCTTTTTTGAATAAGAAGCATGTCAATTTTCGTTAAAAAGTCGGGAAAAAACATTGAAAATTATATTTTGTTCAAATGTCTATATGGAGGATCTTGTCGGTCCACTGTGGAGGAAGTGGTATTTCATCACCATATTCTTCTGGCTGAGGGAACCTATTCGACAAGGGGTTATTGTTATTTATTTATTTAATATTATTATTGTTGCAATTTTACAAAACATTTTGCGTGAGAATTTTAGGAGTGGTTTTAGTGATGTGGATACTTGAAGAGTTGTTTGGTCCTTGGTTAGGTTCAACGTCTTCATTTGAGTTTTGGTAACATAGGAGTTAGGGGTTAGTGCTTTTCCTTTGTCAGAAGCTCTTTTTGTTATAACTAGTTGGTTCTTGTTTTTTTCCCCTGAATCTCATTTTCCTGGGCTTCCATTTTCTATATTGCAATTCTGTACTCCTATTTAATTGTATGGAAGCTAGTTTTTCATTGATGTTTGGCTGGCATCCTTAGCGCCTCTCTCTCTCTCTTTTTCCCACTCCTTGGGAGTTTGTATCATTGAACATATTTGTTTCTTTTTCAATAATCAAAAAGTTTCTATCTTGATACAGGAAAGATATATGCATTAGGTTTCCCTTCTTTCTTATGGTTATTATTTTCTGGATTATTCTAGGCATCAGAAGCTTAACTATAGAATAACTCCAGGTGATGAAGTGGAAGATATGTATATTTTGTTAAATGAAGTGAAGAGGCAATTACCTAGTGTCACCGCAGTATCCTCTGGTGCCATTGCATCTGATTATCAAAGATTGCGGGTAGAGAGTGTTTGTTCAAGGCTAGGACTTGTTTCTTTAGCATATTTGTGGAAACAGGATCAATCTTTGCTTCTACACGAAATGGTATATAACATTTATATGAGCTATGAAATGGACATGCAACATTTGGATTCTACTCATTTAAGTCTTCCCCCTCTTCTTTTGAACTAGATAAACAATGGAATTTTGGCCATCACGGTGAAGGTATAGTATAATTAATTCTCTCTCTCTCTGTCTTGCATTAAATTACACATGTACGGTCTGTCTAATTAGTCGTAAAGATTTTTCCATCATTAACCTATTTTGTGCTCTGGCTTGATGTGATAGAAAACTTAATTCATTTTGTAACGATAATGGATGCTTTAGCATGTTTATCTTCTTTTAACATGGATAGTGTTCGAAGGTTCAGAGCAATATTTTATACTAAAAGTTTGAATTGTGCTTTCACTATTTTATTCTAAAATTTTTAATTGTGCTTTATTATATTATATTTTTATTTTTACCTTTTTACCACTTAAAAATTTGAAGCGAGTAGGGATATGCATCCATTTGCAGATGCCCAGAATTAATTTCCGAACCAGTAGCTAAACATTTTTTTTCTCCGCTGCCTACTTGACCATCGAAGTTCTTTTTTTGTGAATGGTCGATATTTGTATGGGGGCATTGAAAAGATTTCAAGATGGAGAAGAGAGTTAGGAGCTCTCCTACCCTCCCAATCTCAACATACTGGAATGTTAATCAAATGTTTGCCAACCTCCCCAAGCCTCCTAGCCAGCACCATTTAAACCTCTTTCGGTACCATTACAAAATTTACTTCTTCCAAGATTTACTTCTTCCCGACCAATTCACCATTTCACCCTAATTGTCCCATATTATATTACACAATTTTTAGGATATACAAGGGAAGAACTTACCATAAGGAACATAGTGCGTAATTTTTAATAGGATTCTGATCATGAGAATGCAAGTAGGGATTTTGCATTGCAATATAAAAGAGAGGATATCTTGGGATAGCCCTTCGAGAGCCTTCTCATAATTATCATTTCCAAAAATTATGCTTGTGCCCCAAACTTCAAAATGATTTTAGCTTTTCAAAATGCTTAAGCTGTGATGAAATAGCATTGTTAGTGGGTACCTCCTAGGCATGCAACAACAACTCTCTAACACTTCTCCAAATAGAGATTGTGAACACCCAAATTCAAGAAGGGTACATGAATGAATCGAGACACATCTAAATGAGAGGTATCTTGAGAATATGAAAGTATAGTTAAGAAAGACTTTAAAAAATTGAAAGTTACTATCTATACCAATAAAGTGCACATTCCTTTTTAGTGTTGCAATCATAGGAATTCCAAAGTTAAATAGGCTTAGTGTCACGACCGACATAGTGGTGTATGCGTATAGTGGGTGTGTGGGAGGTTTGCAAAAGCGTGCGTTGGTTTGGTGTGCGGTTGGTACTCGTAGCCTGTGCGGTGTAAAGGCAAGCCTTGACCAACCTTTAACTACTCGGTCCAAAGGTAACTCACAGGTTAGTCCCTCATGTAAATGACACAATTCCTAGAATGGGATTGTCAGCTAAGGCTTCACACGTTTGAGAGTTTATGAAGAAGAAGAAGATAATCGTGGAAATATCTCTTTATTGATATGAAAATCACAAACAATATACAAGACTCAATCTCACAAAGAGAGTTACACTCACTCAACACTTCACTCGTGGAAATGAAGTAAGAATGCGTGTATCCTTTGACATCCCTAAAGGTACACTTACATAGTGAGAGAAGGAGTTACTTTAGGCTAAAGAAAAGGAAGGAGTGGCTTAGTGGATGGTTATAACTTCCCACGATTTATGCTTAGCCACTCCTTCATCCACTACCCTACGGTGCTTACCTTTTAGGCTATTCAAAAGGGATAGTGGCCCTTTGTCAGACCCCTAGACTAACATTAAGCACCACAAGAGGTTAGCTTCAAGTCCATTGACCACAAACACTATTGTCTCGCTTCTGCCCTGTGTCTGCTACATGCTTGAAGGTTGGCATGACTGCCTTAGTGTCGCCTGTCATGCTGTGCCCCATGTCTTCCTATATAGGCGCTTGTCCTGTCCGGCCTCCCTCAAAGTCGAGGCACTTGCCGCCTGTCTTGCCCACCTACCCACCATTAGGTGGGGCCATGGCATGCATTGACTTGGTCTCCTCCAAGTCCATTGATCAAGTCTTCATGCAGTCAACCATTGGTCAATTTTCAGTCTTCTCCTTGTGGATCCTAGCCACCAACTAACCGCCTGTGGTGCTCAATGTTAGTTCTAGGGGTTTGACACTTAACTTGGAGCAATTCTATGTTGGATGACCTCCTGGAAGATTTCCTAGGAAGCATGTGACTTAGGGCAAAGCATGTTGAAAGAGCTTGTGTTGGTTTGTGGGAATAGTCTTAACTCTTAGAAGCTCAAGACAAGCAAGGATGATGTTGTCGGGTTGCAGAGGAATGTTGAGGTCATCAGGTGTCGAATCAAGATTCCAATCCTGGTTTGAATGGTTACAATGCTTAATTTGTTTCATTTTAATTCAAACACTAA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ATGAAGGTGGTGGCATTGGTGAGCGGTGGCAAAGACAGTTGCTTTGCCATGATGAAGTCTATTCAATATGGCCATGAGATTGTAGCGTTAGCTAATTTGATGCCTGCCGATGATTCTGTGGATGAGCTTGATAGTTACATGTATCAAACTGTTGGACATCAAATTATTGTTAGCTACGCAGAATGCATGGGAATTCCATTGTTTAGAAGGCGAATTCAAGGATCCACCAGGCATCAGAAGCTTAACTATAGAATAACTCCAGGTGATGAAGTGGAAGATATGTATATTTTGTTAAATGAAGTGAAGAGGCAATTACCTAGTGTCACCGCAGTATCCTCTGGTGCCATTGCATCTGATTATCAAAGATTGCGGGTAGAGAGTGTTTGTTCAAGGCTAGGACTTGTTTCTTTAGCATATTTGTGGAAACAGGATCAATCTTTGCTTCTACACGAAATGATAAACAATGGAATTTTGGCCATCACGGTGAAGGTTGCAGCAATGGGATTGGATCCTGTGAAGCACTTGGGGAAAGAATTAACATCTTTGGATTCAGATCTACATAAGTTGAACAGATTATATGGGATCAATGTATGTGGTGAAGGTGGAGAATATGAAACGTTGACCCTTGATTGCCCTCTTTTTAAGAATGCTTGGATTGTCCTTGACGAATTCAAAGTTGTGATGCACTCATCAGATTCCATAGCACCAGTGGGGATCCTCCATCCTGTTTCCTTCCATTTGAAGTATAAGGCAAAAACCTCTTCTCTTGGTAGTATCTGTGACGACACCAATTTAGTTGACCATGAGAAAGGGGGTCTTCTATTCGAAATTCAAGGAGATTGCTTTCAAAATTGTGACATATTACAATCTGTTGCTGATGCATCTAGTGACAATCATATACTTGATGATGTTCCAGATGATAGACTTCAAATTTCATGTTCAAGGATGCAGACTACATTTTTGATCTCTTGCTGGTTGCAAAATTCATGCGGTACTTCTCCAGGTCTACAGGATGATCTGAAGACTGTTCTTAGGAAAATAGAATCAGAACTTCTTGCACGTGGTTGTGGATGGAAAAATGTGCTCTATATTCATCTCTATCTTGCTGATATGAATGGATTTGGTTTGGCTAACGAAACATATGTCAGTTTTATAACACAGGAAAAGTGCCCTTTTGGTGTTCCATCACGCAGTACAGTTGAACTGCCTCTACAGCAAGTGCAATTGGGAAATGCATATATTGAAGTTCTGGTGGCAAACGACCAAACGAAAAGAGTTCTTCATGTGCAGAGTATATCATCTTGGGCACCTAGTTGCATTGGACCATATAGCCAGGCAACTTTGCATAAGGAAATTCTTTACATGGCCGGACAATTGGGGCTTGACCCTCCCACTATGACGCTTTGTAGTGGGGGTGCTACACATGAGCTGGAACAAGCATTAAAAAATTGTGAAGCAGTGGCTGAATGTTTTAGATCTTCAGTATCTACTTCTTCTGTTATATTTGTCACATATTGTTCAACTCGGATACAACCAGAGGAGAGAAGGAGAATAGAGGACAAGTTCCATGGTGTACTTGAGGAAATGAGGCATTCCGATAAAGCTAGTTTGTCAAAACTGCTTGATTCCATTTTTTTGTATGTTAATGTACCCAATCTTCCTAAAGGAGCACTTGTTGAAGTAAAACCTATTCTTTATGTTCAAGAGAATTTAGATACAGTGGAACAAACTCCTCATGACTCACCAAGGTTATATATCCCTACAGACTGGGGTTTCCAGCATGAACACTGGCACAAGTCTTGCATTCAGAAATGCATTGTTAATGGAAAGATATGTGTGACCGTGTTGTCTATGACAAATGAACTTGCTCGGAATATTTCTTCTTGCTTGCTAGGAAATCAGATTACGGAGGAGCACTTGGAATTAGTTTCCAAATTCTGCATTTATCTTCTCAATGAAGTTCTCTTGGATAGTGCATTCTGTTGGGAAGATATAAAGAATCTAAGATTCTATTTTCCAACTAGCCTTAATATTACTCTGGAGGCTGCGTCAATCATATTCTCTCGTGCTTTCAATGAGCTTGCTGAGTCAAATCCAACAGTTCATGTTGATCGGTTCTTCAACCTCATACCAGTCATAGGTGCTGGACGGACACCAACATCCATGGATGATATATTGACGTGTGAATTATTTGCTCAAAAATCCTGA MKVVALVSGGKDSCFAMMKSIQYGHEIVALANLMPADDSVDELDSYMYQTVGHQIIVSYAECMGIPLFRRRIQGSTRHQKLNYRITPGDEVEDMYILLNEVKRQLPSVTAVSSGAIASDYQRLRVESVCSRLGLVSLAYLWKQDQSLLLHEMINNGILAITVKVAAMGLDPVKHLGKELTSLDSDLHKLNRLYGINVCGEGGEYETLTLDCPLFKNAWIVLDEFKVVMHSSDSIAPVGILHPVSFHLKYKAKTSSLGSICDDTNLVDHEKGGLLFEIQGDCFQNCDILQSVADASSDNHILDDVPDDRLQISCSRMQTTFLISCWLQNSCGTSPGLQDDLKTVLRKIESELLARGCGWKNVLYIHLYLADMNGFGLANETYVSFITQEKCPFGVPSRSTVELPLQQVQLGNAYIEVLVANDQTKRVLHVQSISSWAPSCIGPYSQATLHKEILYMAGQLGLDPPTMTLCSGGATHELEQALKNCEAVAECFRSSVSTSSVIFVTYCSTRIQPEERRRIEDKFHGVLEEMRHSDKASLSKLLDSIFLYVNVPNLPKGALVEVKPILYVQENLDTVEQTPHDSPRLYIPTDWGFQHEHWHKSCIQKCIVNGKICVTVLSMTNELARNISSCLLGNQITEEHLELVSKFCIYLLNEVLLDSAFCWEDIKNLRFYFPTSLNITLEAASIIFSRAFNELAESNPTVHVDRFFNLIPVIGAGRTPTSMDDILTCELFAQKS Homology
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USQ7 (Diphthine--ammonia ligase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=mug71 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 310.8 bits (795), Expect = 4.0e-83 Identity = 193/512 (37.70%), Postives = 281/512 (54.88%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2RV01 (Diphthine--ammonia ligase OS=Danio rerio OX=7955 GN=dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 292.7 bits (748), Expect = 1.1e-77 Identity = 147/257 (57.20%), Postives = 186/257 (72.37%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7L8W6 (Diphthine--ammonia ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPH6 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 277.7 bits (709), Expect = 3.8e-73 Identity = 143/255 (56.08%), Postives = 184/255 (72.16%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HJF5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Bos taurus OX=9913 GN=DPH6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 275.0 bits (702), Expect = 2.4e-72 Identity = 143/252 (56.75%), Postives = 181/252 (71.83%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M9F5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 273.1 bits (697), Expect = 9.3e-72 Identity = 144/255 (56.47%), Postives = 179/255 (70.20%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKJ7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G075360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1459.9 bits (3778), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/735 (97.55%), Postives = 728/735 (99.05%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z6 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1458.0 bits (3773), Expect = 0.0e+00 Identity = 716/734 (97.55%), Postives = 726/734 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3V7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1443.3 bits (3735), Expect = 0.0e+00 Identity = 712/734 (97.00%), Postives = 722/734 (98.37%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U6Y7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold105G00870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1406.3 bits (3639), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/708 (97.46%), Postives = 700/708 (98.87%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9W6 (Diphthamide synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018223 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1316.2 bits (3405), Expect = 0.0e+00 Identity = 646/735 (87.89%), Postives = 685/735 (93.20%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. NCBI nr
Match: XP_004152819.2 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1459.9 bits (3778), Expect = 0.0e+00 Identity = 717/735 (97.55%), Postives = 728/735 (99.05%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. NCBI nr
Match: XP_008441829.1 (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1458.0 bits (3773), Expect = 0.0e+00 Identity = 716/734 (97.55%), Postives = 726/734 (98.91%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. NCBI nr
Match: XP_011649008.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1445.3 bits (3740), Expect = 0.0e+00 Identity = 713/735 (97.01%), Postives = 724/735 (98.50%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. NCBI nr
Match: XP_008441831.1 (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1443.3 bits (3735), Expect = 0.0e+00 Identity = 712/734 (97.00%), Postives = 722/734 (98.37%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. NCBI nr
Match: KAA0049946.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK07678.1 diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1406.3 bits (3639), Expect = 0.0e+00 Identity = 690/708 (97.46%), Postives = 700/708 (98.87%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. TAIR 10
Match: AT3G04480.1 (endoribonucleases ) HSP 1 Score: 879.4 bits (2271), Expect = 2.0e-255 Identity = 446/741 (60.19%), Postives = 559/741 (75.44%), Query Frame = 0
BLAST of PI0009960 vs. TAIR 10
Match: AT3G20390.1 (endoribonuclease L-PSP family protein ) HSP 1 Score: 45.1 bits (105), Expect = 2.9e-04 Identity = 25/69 (36.23%), Postives = 36/69 (52.17%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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