PI0008316 (gene) Melon (PI 482460) v1

Overview
NamePI0008316
Typegene
OrganismCucumis metuliferus (Melon (PI 482460) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationchr06: 9385314 .. 9394948 (-)
RNA-Seq ExpressionPI0008316
SyntenyPI0008316
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
TCACTTTCTTCTCTCTTTTCTTTGGTAGATTCAATGTTTCTTATGAGGCTTTAAAGGTGAATCTTATTCTTGAAAAGAGATCGAAAAAGAAGAACACAAGAAATTTTGCGTGGTTCGACAAAAAAGATGCACTACTAGGTAAAGGGACTCTCTTGACGTTTGTGATTTTAAATACTTGACAGTTTCTAGAAAAAATGTCAAGAAATGGGAAATGGATGATTTCGAAGATAAAATGTCAAGGATTTTTATGAAAAGGCAGAGGTGAGCGAATTTTCGAAAAAAAATTCACGCTGGGACCTTTCTTGATATTTAAAAAATGTCAAGTGGTATGCACTTTTCCTTGACATTTTAAAAATGTCAAGTAGTATCTATTTTTTTTTTTTTTTTTGACGATTTGCAAATGTCAAGAATTTTTATGAAAATGCAGAGGTTGGCGAATTTTTGAAAAAAATTTCACGCTAGGACCTTTCTTGACATTTAAAAAACGTCGAGCGGTATGTACTTTTCCTTGATGTTTAGAAAATGTTAAATAGTATCTATTTCTTTCTTGACGTTTTGCAAACATCAAGATTTTTATGAAAAGGCGGAGGTGGTTGAATTTTTCGAAAATTTTTCATGGTGGCACCTTTCTTGACGTTTTAAATATACCAAGTGGTATCTATTTTTCTTGACGTTTTTTAAACGTCAATTAAATAAATATTATTATCTTTTATCCAACCCTAAATTAATTATTTTTTCCCTCTTTCTCTTTGCTTTCTCGTGTAGTTGCCCAACTCCTCATTCTCTCCACCATTGTTGAATCTCTCCTCCAAGTCCTTCCTTTTTCTTCTTTTTTTCAGATTTGTTTTCTCTTTTTTTCCTATATTTTTTACTCTTTTTCTCGTTATACAACCAATTCAAACTCCGTCCAGATATCTTTGAAGATATCGATCCTCTTTGCATCCGTTAGAAACTTTAAGAAGTTCGATGAATGCGGTTGTAGAGATGAGGAAGAAACAATATCATCTACCACTGCTAGCTAGTTTCTTCTTGACGCTAATCATTGGATTAACAAAGAAATCGAACATCAACAGATCTGCAGAAACGCTCTCGATCTTCTTCGCCGCTCGCATCTCTAGTCATTGGAGTTCATTTTTCAGCTAACCGACTCTTTGACCACCACGCATAGCAGCGCTGGTAAAGGCTTTTCTAATATCTTATTCTTATGGTTAAAATACTTGTGTAGTTTATGCTTAATTAATAATAAAATGTATCTTTTTATTGCCTTTTCTGTTGAAATTAAATTAATCTAGACTTCATACATGAATTTGCATTATTGCATATGCATGAATAGTTGAGCTATAAGGAATAGTTAATTACTAAATACATTGATGTATGTTTAATGGAGAGTCACGTGTATTTATATTTATTATTGATGTCTTTTAATGTACTTTCCTACTAGTATGAATACGTGTAAGGTTCTCATTTGTATGTAAGGAAGAAAGTAAGAAAAAAGAAAAACAAGTTTATAAGAAATATTATTCAAGTTCTTATTTCTTCTAAATTGTGTGAGTAAGAGAACAGTCTTCTTCTCTTGTCTCTTGATTTGTATTGTGAGGGTCTATTACGTTTCCAACATTTTCCACCTAATTTCTTCTTGCCCTTGTAAAATTTGTCTAAATTCAAAACTACATGTTTCCCATTTGCTTAGTTGTAAGGATTTTATTGTCTCTTCAGGTTTTTAATCTGTAATATCAGTATTGAAGCCAATGAACAGTCATCTTACCTTAAGCCAACGGCTGATAATCCCAAATGGAAATTTGGGTATGAACCTTAAAAGTATGTCTCCATATTATATTTCATCATTCCATAGACAACATATTATATAGACTAGAATGTCATTTATTGTTTTATTTTCTTTTTTATTTTGAAAATGCAACTTAGTTGAAACAAATTTAGGTGCTATGTCAAATAGGTTGAAACTAATTTTAACAATAATATAACCCATTTAATTAAATTAAATTAAACATTTTTTAGGAACTTTGTAGGTAAGTTTGACAAAACATTTGAAGTAACCGAGAGTGACACTTTTTAGAAACATTGTATGTGACTTTCATAATCAAAATGACTATTATCCACTTTTTTAAAACTTTGCAAGTGGCTTTAAGAGTCAAAACAATTTTTAGAAACTTTGTAGGTAAGTTTGAGAGTTAAGTGACACATACACTTTTTAGTTTATTTTGAGAGTCAAAGTGTGACTTGAAACTTTGGCATTTCTTGGGTTATCTTGAGAGTCAAAGTGTGACTTAGACGGGGTTTAGGTCGTTTGGAGAGTCATAATGTAACTTAGATACTTTTTGAAATTTTTTAGATGGTTTTCATAGTCAAAATGGGAAGATTTCACAAACTAGCTCGAAAAAGTAAAAACTTTTCTATGACTGACCCATTTCTATAAACTTATTCATCAGTGACCCTTTTGCCATGTGAAATGTCATTTTTACCCTTTAGTATTGAATGAAAGGTCACTTTATGGTCTTCAATATAGACCAATATTCCCAAAAAACTAAGAGAATGTAAGTTTTTATGTGTTCATAATAATAGGAAATAGATGATCTTTAAATAAAAACTAGGAGATCTCTTAATAAAAAAATGAGAAATCGCTTAATAAAAGATGAACGATCATTTAATAAAAGATGAGAGATCGCTTAATAAAAGTTGGGGGATCATTTAATAAAAGGTGGGAGATCTCTTAATAAAAGATGAGAGATCACTTAATAAAAGTTGAACGATCGTTTAATAAAAGATGAAAGATCATTTTGTTGGATAATCCCACTAACTCTTAGTGGGATATGTGGAGGCTTATGGTGATGACACCAAGCCCACTAAGAGATAGTGCATTATTGTTGCATAATTCCACTAACTCATTAGTGGGCTAAGTGGAAGTTCTTGGTGATGACACCAAGCCCACTATGAGTTAATGGAATGTGAGGTGTTGGGCTTTGGTGAGTTTAGACATGCAATAGTTGCATGTACATTGTCTATTTAAAGAATAGATTTTCAAATGTTTAAAGACTTTTGGCCCATTTTTATTACAATAGTTGCATGTACATTGTCTATTTAAAGAATAGATTTTCAAATGTTTAAAGACTTTTGGCCCATTTTTATTACTTGCTAAAATATTCACCAAAGTATTATTTCCCAAAATCTCTACACATTCCTCCAAATTTCCATCTCTCCCCCTCTCTCAAACCCTTAACTCATCGGATCCCACAACCCGGTTCTAAGTTTGGAGAATAGCAGGCCAACACTATTGGTGGTCCGAGTTCGTGTTCGGATGGAGAATCAAGCAATTACGGAGCTACGAAGGTATGGTCTTCTAAACCCTAATTTCAATTAAATAGGGTTATGCATGATAATTTCTAATAGAATTAGATGCTATTAGAGTATTATTGATCCTGTTTTCCGCTATGCATGTCTTCCGTTTCCACCATTATCTACTAGAGAGTCTTGAGTTTCATCTCCGTATGTCTTGTATCTAGTTAATGCATGTTGTTTGTCTATGTGTATAGAGCTACGTTTAGAGTAAGTTGAGGGTTGTTTAGAGTCAGTCTTTTAGGTTGTTCATTTTATGGTTTGTGTATACTGTCCATATCAAACTTGTTAGAACTTGGTTGTTTTTGTATAGGTTGCACTACTTCTTTTATAAAGTTTGTTGACTTTGAGTGTGTTTTGTATGCTTTTAGCATAGAGGTTAAGTTTTAGTTTCTAGTTAAGGGTCACCAGGAATCGTTTAAAGGAGAACGATATTTGATGGTATCATGCCGACTCTTGGGCTAAGAGAAGGTGGTCTGGGAGGGGTGTGATACACCATTTACCATTTCAACCCCTCTTACAATGAAAAAAAATCATTTACGTTCTCTCTAACCAAAATGACTTTAGAATCCAAAAGACTTCTAAACAACCATTTTTACCTTTATATTCATACCCTAGAGAGCCAAGCATTCCAAGGGAAATTAAATTTCTTTTGAGTTGTGGTACATGCCTGACATTCCTTAGAAGTTTCACAATTCCATCTTTTAATTTTTAATGAAACTAATCCAATCCCAACAATTTGGCATGCCTCATTATTTCCCATGTAAACCGACTCTCTATAGATTTCTTTGTAACTGTTGAATCAAAGATTGAAGGGAGTCATGTGATAGGTGCATCCAGAGTAAAAAACCCAATCGTGTTTTCTCAAAGGACTTACTTGGTTGGCTTGGTCTTGAGTTAGAGCTAAGGCATTTGTGTAAATATAGGAGTTGTCCACAATTAAAGCTCCAGGTTGCTTTCCCTTAAAGTCCTTCTCTTTTTCTTGATTTTTCCTTTTTATGATGAAACAATTTTGAATCGAGTGTCCTTTCTTTTTACAGTACTTCCATCTCAGTTTTTGTTTGGTTTTCTTTTCTTCATTTAGTTGTTTATGATTTTCCCCATGGCTAGTATTAAATTTGGCCTTCACAAAAAGACTTTCTCCACTGGGCAACTCTTTCTTTGTAGCTTGAAATTCAATTTCTCTGATTTTCAGGACTGATATAATTGAATTTGTGGTTACTGAATCTCTACCATATTTAAGTGCACTATTTACCTCTTTATAGGATTCAGGTAGAGAATTTAGAAGCACATAAGCCTCATTTTCATCACCAACTTTTTCACCAAGATTCTTGAATTTTGAAACTATTTTCTCGAACTCATCAATATTATCTGACAAGGACCTTGCAGAATCCATCTTGTAGGTGAAGAATCTTTCCCTTAGGTACATCTTATTAGGAAGATCTTTAGTGACATATAATTCCTTTAATTTTGTCCATATCTTGTAAGTTATGTTTTAATCAATGATTTGCCTTAGAACACTGTCACTAAGATTTAATATCAATGTTCATAAGTAGCTAACTTCATATCTTCTTTTTCTTATGCAGTCCCTGTTGCTGGAAGTTCTAATGGATCAATATATGAGGGCCTTGTGAGTTTTCTGCTACCCA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mRNA sequence

TCACTTTCTTCTCTCTTTTCTTTGGTAGATTCAATGTTTCTTATGAGGCTTTAAAGGTGAATCTTATTCTTGAAAAGAGATCGAAAAAGAAGAACACAAGAAATTTTGCGTGGTTCGACAAAAAAGATGCACTACTAGTTGCCCAACTCCTCATTCTCTCCACCATTGTTGAATCTCTCCTCCAAGTCCTTCCTTTTTCTTCTTTTTTTCAGATTTGTTTTCTCTTTTTTTCCTATATTTTTTACTCTTTTTCTCGTTATACAACCAATTCAAACTCCGTCCAGATATCTTTGAAGATATCGATCCTCTTTGCATCCGTTAGAAACTTTAAGAAGTTCGATGAATGCGGTTGTAGAGATGAGGAAGAAACAATATCATCTACCACTGCTAGCTAGTTTCTTCTTGACGCTAATCATTGGATTAACAAAGAAATCGAACATCAACAGATCTGCAGAAACGCTCTCGATCTTCTTCGCCGCTCGCATCTCTAGTCATTGGATATTGAAGCCAATGAACAGTCATCTTACCTTAAGCCAACGGCTGATAATCCCAAATGGAAATTTGGGTATGAACCTTAAAATTTGGAGAATAGCAGGCCAACACTATTGGTGGTCCGAGTTCGTGTTCGGATGGAGAATCAAGCAATTACGGAGCTACGAAGTCCCTGTTGCTGGAAGTTCTAATGGATCAATATATGAGGGCCTTGTTGATGAAGGTCCAGGTCCTTCTTCATCGAAGCTTCAGTTGAGTTACAGACTGTTTGAAGACAACCATGTTCCTGATATTGTTCACAACATTAGACCACCATCTGCTACTGACTTACCCCTTCCTGATGATCTTCGAACTCCGGATGGTGGGTTGTTGCTTCCACCCATTATTGAGAATGAGGAAGCCTCTACTTCTACTGGTGTTGATCCTTCAGCCTCTTAGGCTCTTTTCTTACCAACTCAAAGGGGGAGATGAATGGTTGAAGTTTGCTGGTGGTTTGTTGTGCCAGGGGTTGTGTTGTTTTCTGGCCATAAAAGAATTTTTGTTTTCAGCCAAATGGGGAGTTTGTTATTACTTATTGGCTGTGAAAAATATTCTTGGATTGTTTCCTTTTGTGTTTTCTTTCCTTTTCTCCAACTCAAAGATTTTTGTATTAATTGTGACTGGATCTTTT

Coding sequence (CDS)

ATGAATGCGGTTGTAGAGATGAGGAAGAAACAATATCATCTACCACTGCTAGCTAGTTTCTTCTTGACGCTAATCATTGGATTAACAAAGAAATCGAACATCAACAGATCTGCAGAAACGCTCTCGATCTTCTTCGCCGCTCGCATCTCTAGTCATTGGATATTGAAGCCAATGAACAGTCATCTTACCTTAAGCCAACGGCTGATAATCCCAAATGGAAATTTGGGTATGAACCTTAAAATTTGGAGAATAGCAGGCCAACACTATTGGTGGTCCGAGTTCGTGTTCGGATGGAGAATCAAGCAATTACGGAGCTACGAAGTCCCTGTTGCTGGAAGTTCTAATGGATCAATATATGAGGGCCTTGTTGATGAAGGTCCAGGTCCTTCTTCATCGAAGCTTCAGTTGAGTTACAGACTGTTTGAAGACAACCATGTTCCTGATATTGTTCACAACATTAGACCACCATCTGCTACTGACTTACCCCTTCCTGATGATCTTCGAACTCCGGATGGTGGGTTGTTGCTTCCACCCATTATTGAGAATGAGGAAGCCTCTACTTCTACTGGTGTTGATCCTTCAGCCTCTTAG

Protein sequence

MNAVVEMRKKQYHLPLLASFFLTLIIGLTKKSNINRSAETLSIFFAARISSHWILKPMNSHLTLSQRLIIPNGNLGMNLKIWRIAGQHYWWSEFVFGWRIKQLRSYEVPVAGSSNGSIYEGLVDEGPGPSSSKLQLSYRLFEDNHVPDIVHNIRPPSATDLPLPDDLRTPDGGLLLPPIIENEEASTSTGVDPSAS
Homology
[Close]
BLAST of PI0008316 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TBV1 (Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold98G00290 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 4.2e-06
Identity = 32/81 (39.51%), Postives = 44/81 (54.32%), Query Frame = 0 

Query: 99  RIKQLRSYEVPVAGSSNGSIYEGLVDEGPGPSSS--KLQLSYRLFEDNHVPDIVHNIRPP 158
           R+   R  +  +    N   +  +   G   SSS   L LSY LF+ +HVP+I H +RPP
Sbjct: 35  RMTDGRGLQAALMAEGNWGYHLVIQSNGEASSSSPQTLYLSYNLFQGSHVPNITHQVRPP 94

Query: 159 SATDLPLPDDLRTPDGGLLLP 178
              D PL ++L T DGGLL+P
Sbjct: 95  PVDDFPLLNELCTSDGGLLIP 115

[Close]
BLAST of PI0008316 vs. NCBI nr
Match: XP_038904484.1 (uncharacterized protein LOC120090854 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 5.4e-08
Identity = 28/49 (57.14%), Postives = 38/49 (77.55%), Query Frame = 0 

Query: 129 PSSSKLQLSYRLFEDNHVPDIVHNIRPPSATDLPLPDDLRTPDGGLLLP 178
           P+   L LSY++F+   VPDIVHNI PP ++D+PLP+DL+ P GGLL+P
Sbjct: 334 PAPKFLNLSYKIFQGTRVPDIVHNIHPPKSSDIPLPEDLQVPKGGLLIP 382

[Close]
BLAST of PI0008316 vs. NCBI nr
Match: KAA0040543.1 (uncharacterized protein E6C27_scaffold262G00970 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK05585.1 uncharacterized protein E5676_scaffold98G00290 [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 61.6 bits (148), Expect = 8.6e-06
Identity = 32/81 (39.51%), Postives = 44/81 (54.32%), Query Frame = 0 

Query: 99  RIKQLRSYEVPVAGSSNGSIYEGLVDEGPGPSSS--KLQLSYRLFEDNHVPDIVHNIRPP 158
           R+   R  +  +    N   +  +   G   SSS   L LSY LF+ +HVP+I H +RPP
Sbjct: 35  RMTDGRGLQAALMAEGNWGYHLVIQSNGEASSSSPQTLYLSYNLFQGSHVPNITHQVRPP 94

Query: 159 SATDLPLPDDLRTPDGGLLLP 178
              D PL ++L T DGGLL+P
Sbjct: 95  PVDDFPLLNELCTSDGGLLIP 115

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of PI0008316 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of PI0008316 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5A7TBV14.2e-0639.51Uncharacterized protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold... [more]
BLAST of PI0008316 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_038904484.15.4e-0857.14uncharacterized protein LOC120090854 [Benincasa hispida][more]
KAA0040543.18.6e-0639.51uncharacterized protein E6C27_scaffold262G00970 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK0... [more]
BLAST of PI0008316 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
PI0008316.1PI0008316.1mRNA