PI0006025 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAAAAATGAATGAAGAAAGTGAAAGAAAACCTAAGCAGTTCGTGAAATAAAACAATTCCTTCGTCTGTGACGGCGCCACTTCGTCATTTCTCCACCTTCTTCTCGCCGTCTCCTCCTCCGTTTCAGCAACCCAGTGTCACCGCCGCTCTCTCCCTTTCATTGCCACCGCCATCTTTCTTCGTTCGTGACGTCATAGCCTCCCTTTCCCTTACCGGTTCTGCACCCATTTTGTACTCCATTTCTGTTACAGGTATTCTCTCAATCTCCATCTATGTCTTCCTTCTCATTTGAAAAACACAAATTGCCACTTGTCTAATGAAAGAATGGAGGAGTTCTTTGATTATATATATATAAATATAATAACAATAGCTAAATAGCAACCATAAAAAACAGTCTTTACGGCAAATTAATTTTTAATCAGTCATCCAATTCTCTTGTAATTCCTACCTGGATTGATTGACCCGACTACTTCAACTTTGTTTCTATTTGTATATTTGTCTATTATAATTGGGAGGATACAATTTTTTTTTTCCGTTTAAAATGGAAATTTTCTCCCTCAATTAAACAATACAGTAACTAATTATACTTAAAATTTATGGAAATAAGAGCATGAATCCATAAGTATTTCTGATTGGAACGCGAATCAGTTACTGCGAGGGGGAAGTTCAAACCGTGTGGCCAGACATAATTTTCAATTATTAAATAGGAGTAGACGTTTAACCCATTGGTAATGAAACAATCACTGTGTTCTATGAATGTGGATTATTTTTATTCCGTATTTTGCCTTGTATACATTCTTCACAAGTCCATTTTGTTCATCTCTTCCCTCTGTTCTACTGCCTGCATGAGCTCAAGCAATTCCGATACTCATATGTGCGTACATATGTTTCTAGATATATGTATTATTCTGGTGAATTGTTTTTGATTCCTGATATTTCAACTTGCACGTTTTAATCCATTTTATTTTAAAGGATCAAATGCCTAAATTGTTGGTAGGTTTGCTTTAGTGAAAGGGGTTTCTGTGCTGATCTCTATTTTTTTTTGTAGGCATGGATAACAATTCCGTTGGGAACTCAGAAATGGTGACTGAAGCTGGATGGTATATTCTTGGTGAAAATCAGCAACATGTTGGTCCATATGCATTTTCTGAATTGCGTGGTGAGTTATGAGAACTGAACAAAACATATCTGTATGTAGTAGCTGATTGATATTGTTCCAAGTATCACTTGTGGTTTTTGTTATTCGTGAGGGAAATAGATGAGTAACGTACTGGAATTGGAATGTACCTTGGTACCTCGATTCGTGACAACTATTCGTTATATCTTTTGAACTGCCGGTTATTCCTCAAATTTACTTTCAATCTTTCTTTCTTGAATTTCAGTTGTACAAGTAAACAATAGCACGCAGTATCATGTTCAATTGGTATAAGAGCTATTGAAACATCTATTGAGTTATTTATTCGCCCTGGGCAGAGCATTTTCTAAATGGGTATCTCCTGGAGAGTACACTGGCCTGGTCTGAAGGACAAAGTGAATGGCAGCCATTATCGTCCATTCCTGGGTTGACAGCAACAGTATATGAACAAGACTCTAATTTGTCAACTGCAGGTGAAGTCATGTTTGTGTCTCATTAATTTTTTATGAGTAACTGGTCTAGTCAAATAATCGTGTAATGATCATTGACTGTTTTAGTTCCTACCAACAACAATGACGATGATGAGCTTGAGAAATATCAGAAAGAAGTTGGAGAAACAGAAGTCACAACGGAAGTGTCTAGTCCTTCTGGCAGCAGGAATTTTGGTATGGTAGAAGGTGATCTTGAGAGACCTACTACACCACCAGAGGGTGAGGAGGAATTCACTGATGATGATGGGACTACATACAAGTGGGACAGGGCTCTTAGGGCTTGGGTACCTCAGGTATTATTCCTAGGAACCTTGTTCATGATGTAGGATTTGATTTTGTAGTGTCTTATGTTTAACCTAAAAGTTATAAAGTTTGAAACAGGAAATCAGTTGCCATGGCACTATAGATCAAAGTCTTCTTCTCTCGCCTTTCTATTTTTCTTTTATTTTTGTTTCTTTTATGCACAGAAAGTTATGAGGTGGAATGGTGAGAAATACAACCACGAACAGCAGTCTTTTCTTTTATATTTACATTTCACATAACAGCAGTTTTTCTTTTTTTTCTTCTTTTTCTTTTTCCCCTTGTAGTTTCTATTTCCTCTCCTCTTATGGATTCATGCCCGATCGTGATCTTAGTGTACTTCTTTGTAGTTTGTAATCAATCAAAGTTGCAATGAACAGGAAAATTTGTGGCAGAAACTGGTTCTGAGTGTTTCTGGGAAAGATGTTATAGGGTGGTAGGGGAGTAGGCAGTGTTAGGAGACCTTGGGATGTGCACATGTTTGGAATTGAAACAAGCTTTTCATTAAACTAGTGAAAAGTTACAAAGTATGACGCTCCCACTAGGAGAAAGTATATAAATTAACCCTGGACAATTGGAATATCGAAACCCCACAATTGTTGCAAACATTCTAAGTAAAAAGTGGTTCCATATAATTAGAGGAACTTCTTATAGAAATGATCTACAGTTACACCCAATATCATGAAAAACAAATGTTACTGAATAGTGAAAACGATGAACACCAAAAAGTGCTTTATATTTAGCTTCATGTCTCTCTCAAGTCTCATCACATTTAGTGAATTTTTCTTCAAATGGTCTTTGATTTCTCTTAAACTGTAATTTTGAAGTTTTTGCTTTGACTACATTTAATCAAATCAATTTAACTTAGCATTTGAATTTGAGTCCTCCAGTAAATAAGAGAAATAATCAAATAATTTGCTAGATAAGAGTTGGGCAATTTGATAGCTATTTCGGAAGTCTTGAATTCTTGGGCTCCTCAGAGTGGGGGTGACCGCCTTAAATGGAATTTAGATGCCTCGGGAAAGTTTACCACGAAAGCTACCTTTTTGAATATTGCTAAGAGAACCTCTTTCTTCACTTTTCCTTTGGTGAGAATTGTTTGGAAGCTTAAAATTCCTAAAAAGGTGAGGTTGGTTTACTCTTATGGTACTCAAAAGAATAAATAAATATGAGCAAAACTTGTTTTGGTGCAAAGAGATGAAAAGCAATTGCTCAAAATGTAACCTGACTATATTGAAGAATAGAAAAAATGCTCTCCTCTCTCCTCCTATCCCCTCTCCTCTTTGACATTCCGTAACTGTCCCTCCACCATGGCCTCCGCTGGATTTTCGCCACTGGCGGCCTTCCCCACCCTTTCCAACCACATTGATTGAAAGGTCTTCACTCTTAAATGTGATAAATCAACAAACAAAGAATCTATCATTATCATAGAATAGAGTAAATCATCAACACACTCTCCATTTATCTCACAAAGCTTTGGATTTGAATTCCTGGTAATGCCTTGGCCACCTTTCAAACTTTTATGAACCAAGTATTTCGACCTTTCCTTCGTTGTTTTGTGCTAGTATTCTTTGATGATACCTTGGTGTACAATACTGACATAACAACACACGAAAAGCACTTGGGAGTAGTATTCAGTATTTTGAGAGATAATAAGCTATTTGCCAATTGGAAGAAGTGTGTTATAGGTCACTTGAGGATACAATATCTAGGACACTGGATTTCAAGCAAATGGGTAGAAGTAGATGGGGAGAAGGTGTGTTAGAACTCCGGGGTTTTCTGGGTTTTATAGGACATTGTAGACGTTTTCTAAAGGGATATGGTGATATTGCAGCTCCCCTCACTAAATTACTTCAGAAAAATGCTCTTAACTGGAATGAGGAAGCCACTTGGGCTTTTGAAGAACTCAAACAAGCAATGGTTTTGGTTCCTGTATTAGCTCTTCTAGATTTTTCACTACCGTTTGGATTCGGAGCAGTGTTATCCCAAAACTCTAGACCAATCGCTTATTTCAACCAAAAATGTGCACAACGAGCTTAAGTGAAGTCCATTTACGAGAGGCAGATAATGGCAGTTGTGATGGTTGTTCAGAAATGGAGACATTATGTGCTAGGAAGGAAATTTACGGTTATATCAGATCAGAAGGCATTAAAGTTATTGATTGAGCAAAGGCATTAAAGTTACTTCGATTGTATGAGCCTTCATCTCCTCTAGGTTTAGTTTCATTCGCCACCGTTTCTCCTTCAACATTACTTTCTACCGATTTTCCCTCACTCAACAATTCTTCAAATACTTCCAGTGGTAGTCGGACGACCTTTCGTCAATCCTTACACGTATATCATCAACAACTGTTGATGTTTCTCTCCCTGAACTCCTAACCTTTAGATGCTCTTTGCCAATGATAAGAGATTCTCCTCAATTGCCAGCAACTTATGTAATATTCTATTCACATTCCCGAAATCTCTTGATCGAACGCTTCCAACTTCTCCTCAAAACGCTTCTATGGAATTTTCTTACATTTTTCCAGGTTAATGATGCTCTGATACCAATATGATAGAACACCAACTTTGGATGATTCTTACTCAATGGAATAACAAGAACGATTACAAGGAATTGGCAGAATACCAAATCCTGAACAAGAACAAAGACAATTAAGAAGAACGAAATGGAAACCTTACCCTTCTCTCTGCCTTTCCTATTTCTCAAGGAATAGACAAATGCCTCACACAATTTTCATATCCTCACTCAATGACCCCCTCACTGTTTGAACCTTCCCCCATTCCTAACTAACTGTGGGTCCCAGCCTTGGCAGCTATACTACCCATTACATGTGCACTCCCCTTAATCCCTCTCCTACGGTATTGCCACATAATAGGTGGCCTGACAGAAGTATAGTGTTATGGGGATTGACTGTGACACGGAGAAGCTTAGTAGATGGGTTGAGTTGGTAGGGTGTGATGTTGGCCATCTTTCCTCTTCTTACCTTGGTCTCCTTCTTGGGATCAATCCTAAGAATGCTTGATCTCATCAGTCTTGAGTGCCATTCTTGTCCATTTCTTTTCCCTTTT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MDNNSVGNSEMVTEAGWYILGENQQHVGPYAFSELREHFLNGYLLESTLAWSEGQSEWQPLSSIPGLTATVYEQDSNLSTAVPTNNNDDDELEKYQKEVGETEVTTEVSSPSGSRNFGMVEGDLERPTTPPEGEEEFTDDDGTTYKWDRALRAWVPQDDAFFKHGEYGPEEMTFMQEEEVFPQLEADAPCTSIKEEGDSVPSTSIEADHATKETNGKSEEIETKKNGKRKLSGNQVEKKEANKGPDGWFELKINTHVYVTGLPEDATIDEVVEVFSKCGIIKEDPETKKPRVKLYVDRETGKKKGDALVSYMKEPSVALAMQILDGTPLRPGGKMLMSVTLAKFEQKGDKFVSKKVDNKKKKKLKKVEDKILGWGGRDDAKVSIPATVILRFMFTPAEMRADENLASEIETDVKEESTKFGPVDSVKVCENHPQGVVLIRFKDRRDAQKCIELMNGRWFGGRQIHASEDDGLVNHAMVRDLEADAVRLEQFGSELEAD Homology
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O43719 (HIV Tat-specific factor 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=HTATSF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 158.7 bits (400), Expect = 1.7e-37 Identity = 116/361 (32.13%), Postives = 179/361 (49.58%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5RB63 (HIV Tat-specific factor 1 homolog OS=Pongo abelii OX=9601 GN=HTATSF1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 2.9e-37 Identity = 116/361 (32.13%), Postives = 179/361 (49.58%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BGC0 (HIV Tat-specific factor 1 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Htatsf1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 157.5 bits (397), Expect = 3.8e-37 Identity = 123/385 (31.95%), Postives = 190/385 (49.35%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O43120 (Splicing factor U2AF-associated protein 2 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=uap2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 146.7 bits (369), Expect = 6.8e-34 Identity = 109/346 (31.50%), Postives = 167/346 (48.27%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q61545 (RNA-binding protein EWS OS=Mus musculus OX=10090 GN=Ewsr1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 75.5 bits (184), Expect = 1.9e-12 Identity = 34/90 (37.78%), Postives = 58/90 (64.44%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BUE8 (Splicing factor U2AF-associated protein 2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold145G00040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 957.2 bits (2473), Expect = 2.7e-275 Identity = 480/498 (96.39%), Postives = 484/498 (97.19%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B523 (splicing factor U2AF-associated protein 2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486099 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 957.2 bits (2473), Expect = 2.7e-275 Identity = 480/498 (96.39%), Postives = 484/498 (97.19%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KZ32 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G491190 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 943.0 bits (2436), Expect = 5.2e-271 Identity = 473/498 (94.98%), Postives = 479/498 (96.18%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G3U1 (HIV Tat-specific factor 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111450511 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 871.3 bits (2250), Expect = 1.9e-249 Identity = 438/500 (87.60%), Postives = 462/500 (92.40%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I789 (HIV Tat-specific factor 1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111471892 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 859.8 bits (2220), Expect = 5.8e-246 Identity = 432/500 (86.40%), Postives = 460/500 (92.00%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. NCBI nr
Match: XP_008442163.1 (PREDICTED: splicing factor U2AF-associated protein 2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 957.2 bits (2473), Expect = 5.5e-275 Identity = 480/498 (96.39%), Postives = 484/498 (97.19%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. NCBI nr
Match: TYK02750.1 (splicing factor U2AF-associated protein 2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 957.2 bits (2473), Expect = 5.5e-275 Identity = 480/498 (96.39%), Postives = 484/498 (97.19%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. NCBI nr
Match: XP_038882575.1 (splicing factor U2AF-associated protein 2 isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 8.2e-271 Identity = 476/500 (95.20%), Postives = 485/500 (97.00%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. NCBI nr
Match: XP_038882576.1 (splicing factor U2AF-associated protein 2 isoform X4 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 943.3 bits (2437), Expect = 8.2e-271 Identity = 476/500 (95.20%), Postives = 485/500 (97.00%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. NCBI nr
Match: XP_011653887.1 (splicing factor U2AF-associated protein 2 isoform X2 [Cucumis sativus] >XP_011653888.1 splicing factor U2AF-associated protein 2 isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8649734.1 hypothetical protein Csa_012481 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 943.0 bits (2436), Expect = 1.1e-270 Identity = 473/498 (94.98%), Postives = 479/498 (96.18%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. TAIR 10
Match: AT5G16260.1 (RNA binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein ) HSP 1 Score: 573.2 bits (1476), Expect = 2.1e-163 Identity = 302/514 (58.75%), Postives = 369/514 (71.79%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. TAIR 10
Match: AT1G50300.1 (TBP-associated factor 15 ) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 1.2e-06 Identity = 28/67 (41.79%), Postives = 40/67 (59.70%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. TAIR 10
Match: AT2G16940.1 (Splicing factor, CC1-like ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 2.1e-06 Identity = 28/87 (32.18%), Postives = 53/87 (60.92%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. TAIR 10
Match: AT2G16940.3 (Splicing factor, CC1-like ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 2.1e-06 Identity = 28/87 (32.18%), Postives = 53/87 (60.92%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006025 vs. TAIR 10
Match: AT2G16940.2 (Splicing factor, CC1-like ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 2.1e-06 Identity = 28/87 (32.18%), Postives = 53/87 (60.92%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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