PI0006013 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTGATTTTGGAGCCGTTACTTGGGAAATTATTCCCGGCAAAAAAATTAAGCCCTAATCTATACTCTCCCCCGCTTTCCTCTGGTTGAGTTTTACCCTCGAGCCTTCCCAGCATGTCTACACTCGAAATCGAAGCTAGGGAGTATGTTTGCTTTTTCATTCATCACTTGCCCGTTTCTTAGTGCAATCTGTGTCTCATTGGTACCCAGAAATTTCGATGATTGAAGGGAAAAACGACTTACTTTATGTGCTAATTCTGAGCTGCTTCTATTTTATTTTCACTTATCTATTTTGGTTTTTCGTTTCTTAGGTTTTCAAACTGCCGGCTATACGCTATAGTACGCATTGTTTTTACATTCCAAATTTCATTAGTTTTCCATTGTTCTTTGTTGTTCATATTTGTAGCTGCTTTCTTTATTTAGTTTATATCTAAAGATCGAAGAACATTGGCATTCTTTGGTTTTAAGTAAGAACGACTTTTACACTATTGTTTTACGTATACACGTTTGTCAGTTGCTCGTATGGCTTGCTAACCAATTTGAATGCATTTGCGATCGTTTACTGTTAAAAGTTATATTTACTCAACTTTCCATTGGGTGTGATCTCTAAGCAGCAATTCGCGCTAACCAATTTGAATGCATTTGCGATGATTTACTCTTAAAAGTTATATTTACTCAACTTTTCGTTGGGTGTGATCTCTAAGCAGCAATTCGCATATTCCACGTGGGCTCAATTATTGATCATAATGCTTTTCATTCAGTGTCATCAAGATCGTGCTTCAGTTTTGTAAAGAAAATTCATTGCACCAAACATTCCAGACGTTACAGAATGAGTGTCAGGTTTCTTTGAATACTGTAGACAGCATTGAAACTTTTGTTGCTGATATAAACTCTGGACGGTGGGATGCTATATTACCTCAAGTGTCTCAACTTAAGCTTCCAAGAAATAAATTGGAGGACTTGTATGAACAGGTAAAGTTAAACAAACTAATATTTTATACTTTAGGACAAAATGTTGCATTTTGCTGCTGGAAGAAAATTTGTACTCGACGAGTGGCAGAAAGATTTTGCAGTATAGATAATTTGACTATCTTTAAGCATGTAGTGCCCTTGTGGTCTGGGGTTGGGAACGTAGATGGAGGGGTTGACAAATGGCTTAGTGGCAACATTCTAGATGAGCATGGGATTCTAGAAATGTCTGGAACTCAAAATTTGAAGAAAGAGGACTCTATGGTAGCATTTATTTCATTATTTCATTTCATTTTTTACTTTTATAAGAAACCCGTATATATAGTAGCATTTAGAATATTACGTTCATTTGGGGTTGGGATAACACCATCTACTATACTATTCAACAAGTTCTCTTGTTGGCACAATTAAGATTTATCTTCTATCTGATTGTTTTTATTAATTATTTTTGTAAGAAACAGAGATGATTCACTTTTGGCAAGAGCTTGTAAGTCTTCACTCTTCTGGGTTTTTCTTTTTGCTGGTACATTATTTATTCTTTTTATCAAAATGAAGGTTGGAGAAGTCAACCAACTACCAAGAAAAACTTTCCTTGGAAGTGTAGAAAGGGAAATACCCAAAATACTAATATCAAAATGAAAGAGTTTATTTCATCTGATTTCGAGAATACATTCACAACATGAATTCTGTTTTGTTTTCCTTGTACAATGCCTGTTTTATAGCTCTAGTCCTTAATTTGAAACAAGAACACCATTGATGGCAAAATGTAAAAAAAATATAAAATTACGAAGAAGGAGATTAACTTAAAAAGGAACCTTTAGGAGGTGATTAGAAAGGATAATGTGAGTTGGTATCAAAAGTGTAAAATCAAGTGGGGCAAGGAAGGAGATTGTAACTCGGGTTTCTTCCATAGAATGGCTAATGGAAGAAGGAACAAGAATCATATTGGTCTTTTAGTTTTAGACAATGGGGTTTGTACTAGAGATAGGAAGGAAATTGAGGAGGAGATCTTAAATTCTTTCTCTAATCTGTATAGTCCTGTGGTGTTGGTTAAGCCATTTGTGGAGGGCATAGACTGGAGTCCTATATCGCCAAGGGAGGATGAGGAATTAGTGGCCCCGTTCTTGTTAGAGGAGATTAAAAAGGTTGTTTTCAGCTGTGATGGTAACAAGTCTCCTGGCGCGAATGGGTTCTCTATGGCGTTCTTTAGGAGAATTGGAATCTTATCAAAGGAGACTGGGGGGTTCAAGGAATTTTTTGAAAGAGGGATTTTGATCAGTTCGTTGACTGAAACCTTAGTTTGCTTGATTCCTAAAAAGGAAAATACGAATGGGGTGAAGGAGTTTCGGCCTATTAGCCTCATTACTAGCATCTACAAGATTTTGGCTAAAGCTCTTGCTAATCGTTTAAGGAAAGTGCTCCTGTCGACAATTTCTGATTCTCAGGGGGCCTTTTTGACTGGAAGGCAGATTTTGGACCAAGCTCTGATAGCTAATGAAGCTATTGAGGAGTATAGATCGAAGAATTTGGAGGGGTTTTTGTTAAAACTTGACTTTGAGAAAGCGTACGACCATGTGGATTGGGATTTTTTGGATAGGGTTATGATGATGAAAGGCTTTGGTTATAAATGGAGAATGTCGATGTGGGGCTGTGTTAGAAATGTTAAGTATTCCATTCTCATGAATGGAGTCCCAAAAGGGCTGATTCAAGCTTCTTGGGTTCTAAGACAAGGGGATCCACTGTCCCCGTTTCTGTTCTTGTGGTGGATGTCTTAAGCCGGATGATAAGCAAAGGGGTCGAGGGAAACATTATTGAGCCTTTTAAGATTGGTAGAGATGAAGTGGTCTTATTGCACCTTCAATCTGCTGATGATACAATGTTATTTTGTTCCGGAAAAGAGGAGTCTTTCCGCACTCTCAATCATATGGTTGAGTTCTTTGAAGAGATGTCGGGGCTAAAAATCACTAGAAGCAAGTGCACTATTTTTAGTATTAATTCTGATCAGGCTAAGATTCAGAGGTGGGTTCTTTCCCATCTTCTTATCTTGGGCTTCCTTTAGGGGGTAATATGAGATCTGTATCCTTTTGAAACCCAATATGTGAAAAAATCCTAAAGAGGTTGGCGGTGTGGAAAAATGATTCTTCTTGAAAGCTGGCAGATTAACTCTGATTAAATCCGTGTTAAGTGGTATCCTGGTGTATTATCTTTCGGCCCCTAGCTTGGTGTGTAAGAGTATTGAAAAGTACATGAAAGATTTCCTGTGGGAGGGGGTGGGGGAGGGTCATGGCTCCCATCTGGTTAATTGGGAGTTGGTGGGGCAACCCGTGAGTTAGGGGGGATTAGGGATTGGTAACCTTAGAATCCGTAACAGAGCTTTGTTGGCAAAGTGACTTTGGCGCTTCTACCTTGAATCTGGTTCTCTTTGGCATAGGATTATTGTGAGCAAGCATGATCCCCATCCTTTTGAGTGGACGACGTTAGGGGTTAAAAGACACTTTTCGAAATCCTTGGAAGGATATTTCTTTTGAGCTTCCTTCTTTTTCTTGGTTTTCTTGTTGTTTAGTGGGGATGGTAAGGACACTTACTTTTGGGAGGATCAGAGGGTGGGGGAGGATTCCCTTTGTTCGATTTTTTCGCATATGTATCATTTATCCTCTTCCAAAAATTGTACTATCTCGGTCTTCTGGTGAGATCTGAGAATTCCGTGTCTTTCTCTTTCAGGTTTCGTCGTAATTTGATCAATAGGAAAACGATGGAGGTGACTTTTTTTCTTTCCTTACTTGAGGGGTGCTCTTTTAGAGAGGGGAGAAGAGATGTTCGTGTTTGGAATCCTAATCCTAGTCGGGGTTTCTCCTGTAAGTCTATGTTTAGTTTGTTGTTGGATCCTGCTCCCCCTAAAGAGTCGGTTTTTGATGTGGTGTGGAGGACAAAGGTTCGTAAGAGAGTTAGGTTATTTATCTGGCAAGTCTTGCTTGGTTGGGTTATTACTGTTGATAGGCTTGTTAGGGGGAGGACTTCGCTTGTCGGGCCTTTTTGTTGCATGCTGTGTTGGAGGGTGGAGGAAGATCTTGATCATCTTTTTTGGGATTGCCAGTTTGCGAGGGCCCTGTGGTGCTCCTTCCTTCAGGAGTTTGGTGTTAGCTTTGTTGGTTTGCGGAGTGTTAGAGTGACGATCAAGGAGTTCTTCCTCCATCTGCCTTTCAGAGATAAAGGGGGTTTTTTATGGCTTGCCGGGGTGTGTGCGGTTATTTGGGACATATGGGGTGGGATGAGAGGAATGATAGGGTGTTCTGGGGTAAAGAGAGGGGTCTTAGTGAGATTTGGTCCTTGGTTAGATTTCATGTCTCTTTGAGCTTCGATTTCGAAGAACTTTTGTAACTATTCCATAGACAATATTTTATTTAGTTGGTCCCCCTTTTTGTAAGTGGGGTGGTTTTGGTGGGCCTTTTTTTTTTGTATGCCCTTGTATTCTTTCATTTTTTTCTCAATGAAAGTTGTTGTTTTCATTAAAAATTATGTAGATAAGTGTTAGAGGAAAGAGCTTCAGCTAGTTAATAGACAAGAAGAAAAGAACGAAATCTCAAATTCCACATTCTGAAATCACTAGTATATTGCCTCCTTTCCTCCAGTTCACAATCTTTTTCTTCATAAGCTTGGTGATAAAGTTTTTTTATTTTTTATTGATAAGAAACGGAGATAAAGTCTTAAACACTTTAAACTTTGGTTAGAATTGTAGATTATGTATATTTAATGTTTGATTGCACTTCTCTTAAGAAAGTTCATTAGTTTTGAGAATCTTGATGCATCTCATGATTTGAAACCTTCCTGTAATTCTGTTTTCAGATTGTATTAGAAATGATTGAGCTTCGTGAATTGGATACGGCTCGTGCTATTCTAAGGCAAACTCAAGTGATGGGTGTCATGAAGCAAGAGCAACCTGAAAGATACCTGCGACTTGAGCATTTATTAGTCCGAACATACTTTGATCCGAATGAGGTAAGGACTAGTTAATAAATCTGACAGACTT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MSTLEIEARDVIKIVLQFCKENSLHQTFQTLQNECQVSLNTVDSIETFVADINSGRWDAILPQVSQLKLPRNKLEDLYEQIVLEMIELRELDTARAILRQTQVMGVMKQEQPERYLRLEHLLVRTYFDPNEAYQDSTKEKRRAQIAQALAAEVTVVAPSRLMALIGQALKWQQHQGLLPPGTQFDLFRGTAAMKQDVEDVYPTTLSHTIKFGTKSHAECARFSPDGQFLVSCSVDGFIEVWDYISGKLKKDLQYQADETFMMHDDPVLCVDFSRDSEMIASGSQDGKIKVWRIRTGQCLRRLERAHSQGVTSVVFSRDGTQLLSTSFDTTARIHGLKSGKLLKEFRGHSSYVNDAVFTNDGARVITASSDCTVKVWDVKTTDCLHTFKPPPPLRGGDASVNSVHIFPKNADHIVVCNKTSSIYIMTLQGQVVKSFSSGKREGGDFVAACLSPKGEWIYCIGEDRNMYCFSHQSGKLEHLMKVHEKDVIGVSHHPHRNLVATYSEDSTMKLWKP Homology
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8W117 (Suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SMU1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 922.2 bits (2382), Expect = 2.7e-267 Identity = 443/510 (86.86%), Postives = 484/510 (94.90%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZME8 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=SMU1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 714.1 bits (1842), Expect = 1.1e-204 Identity = 343/512 (66.99%), Postives = 420/512 (82.03%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TBS9 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Bos taurus OX=9913 GN=SMU1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 712.6 bits (1838), Expect = 3.2e-204 Identity = 341/512 (66.60%), Postives = 420/512 (82.03%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q76B40 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Cricetulus griseus OX=10029 GN=SMU1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 712.6 bits (1838), Expect = 3.2e-204 Identity = 341/512 (66.60%), Postives = 420/512 (82.03%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2TAY7 (WD40 repeat-containing protein SMU1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMU1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 712.6 bits (1838), Expect = 3.2e-204 Identity = 341/512 (66.60%), Postives = 420/512 (82.03%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3I2 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485374 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1034.6 bits (2674), Expect = 1.4e-298 Identity = 511/513 (99.61%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DGD4 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020200 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1030.4 bits (2663), Expect = 2.6e-297 Identity = 507/513 (98.83%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HHA4 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463533 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1028.1 bits (2657), Expect = 1.3e-296 Identity = 506/513 (98.64%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JTQ7 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487429 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1027.7 bits (2656), Expect = 1.7e-296 Identity = 506/513 (98.64%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FGH2 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445274 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1021.1 bits (2639), Expect = 1.5e-294 Identity = 504/513 (98.25%), Postives = 509/513 (99.22%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. NCBI nr
Match: XP_004138672.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Cucumis sativus] >KGN63274.2 hypothetical protein Csa_022473 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1038.5 bits (2684), Expect = 1.9e-299 Identity = 513/513 (100.00%), Postives = 513/513 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. NCBI nr
Match: XP_008441151.1 (PREDICTED: suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1034.6 bits (2674), Expect = 2.8e-298 Identity = 511/513 (99.61%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. NCBI nr
Match: XP_038886288.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1032.7 bits (2669), Expect = 1.1e-297 Identity = 509/513 (99.22%), Postives = 511/513 (99.61%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. NCBI nr
Match: XP_022152482.1 (suppressor of mec-8 and unc-52 protein homolog 1 isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1030.4 bits (2663), Expect = 5.3e-297 Identity = 507/513 (98.83%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. NCBI nr
Match: KAG7033424.1 (Suppressor of mec-8 and unc-52 protein-like 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1029.2 bits (2660), Expect = 1.2e-296 Identity = 507/513 (98.83%), Postives = 512/513 (99.81%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. TAIR 10
Match: AT1G73720.1 (transducin family protein / WD-40 repeat family protein ) HSP 1 Score: 922.2 bits (2382), Expect = 1.9e-268 Identity = 443/510 (86.86%), Postives = 484/510 (94.90%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. TAIR 10
Match: AT4G02730.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 119.8 bits (299), Expect = 6.5e-27 Identity = 83/305 (27.21%), Postives = 141/305 (46.23%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. TAIR 10
Match: AT3G49660.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 117.9 bits (294), Expect = 2.5e-26 Identity = 84/296 (28.38%), Postives = 139/296 (46.96%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. TAIR 10
Match: AT5G08390.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 91.7 bits (226), Expect = 1.9e-18 Identity = 63/255 (24.71%), Postives = 99/255 (38.82%), Query Frame = 0
BLAST of PI0006013 vs. TAIR 10
Match: AT1G62020.1 (Coatomer, alpha subunit ) HSP 1 Score: 90.1 bits (222), Expect = 5.5e-18 Identity = 79/305 (25.90%), Postives = 130/305 (42.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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