
PI0005033 (gene) Melon (PI 482460) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GCCGACCGCCCACCCCTCTCTCGAAAATTTTCTTCTTCTGCCGTCACCTCTCTCTCTCCTTCACACCGACGCCGACGCCACCACCCAGTCGTCCCCTAGCGTCAGACGACAACACGTCGCGTCGCCACTGTTCACATCGATTGAGGCCGACGACCATCTCAACATCTCTCGATCCGAGTTTCTTCCAGGAGTTACGTGTCAATCGAGCAGTTCAACGTCCAACCACCCCTTGTCGTCGTCAATCGAGCAGTTCAACGTCTAACTACCCCTTGTCGTCATTCGCAAGCCCATTTGCCGCTAGCCCGTTCTTTTCTAGTCGTCTCACATCGGACCTAAGATTTGGGATAAATTTTCTTGGATTTCTTGAAAAGCTTCAAATACCCATTAAGTTTTGGTTTGATTTTCACAATACCCGTTACATTTTGTTGTTAGATTTGGATTCTCGGACGATTTTAGCCGTTGTTCAATCGTTAGGAAGCTTCGAACTTGGGCGTTTTGGCACAACTTAGGTAAGATTATAAGCTTTATGAAATGGGTTTAAGTACCCATCTAATATTAGTGATATTATTGAGTAACCCATGATGTTGGATGTTTAATTTTGAATTTAGAAGGTAGTTAGGATGTTGTCCGTTGAAGTTAAGGATACTTTGTTAAGTTCTGGGTAAGCTTTGGAGTAATTTTATTGAACTTTCTTAGAGTTCTTGAATGCCCATTAAGTCTAAGCGTTAAAAGAGATTTACCAATGATACTTCGGTCCTAGAGTTGAATGATTAAAGGTCGAAATGGGCTTTCCATTAACTTTGTTCGTTTGGGTGTTATCTCTATAAGGTTCGAAACATAAATGGTTTAGGTGAGTTTAGGAAGAGTTAAGATTGTTGACTCATGAGGATATATTGGATCTAAATCTCTAAAAATACTGATATTTAGTGTAGTGTATAAGAGTGTATGTGATTAAAAGACTCACTAAGATCGACTTAAGTTGGGTGCTTATGGTGTTGAGAGTTGAAGTTGAAGTTAAGGGTCAAAAAGTGAATTTAGTAAATTAAAGCATTTAGAGAACGATACAAGTTTAATATGGGAAGTGAGAATTGAAGCCTTTGGAACATAAATAGCTCGAGTTAACTTTATGAAGTACGTCGGGAATAGTTGTGGTATCTTGACATGTGAAGATAACTGAGTGATCCTAATCTTTGTTTCAGGCAAAATCGAAGTGGGAAAAGCGTATAATCCCGGGGGGATCGAGCCATTAACTGTGAATGGTTTCTTTCAAACATTGGATATGAAAAATTATTTTAGACATACCGTTGAGCTTAGTTTGTGAATAAGTGTTTGACATAAATACTTTTGAGTTCTTCTAGAAATGTGTGATAAAATTTGTTTAGTTTGGTTTTATCAATGAGAATGTTTTTGTTTTGTTATTAAGAAAAATTTGTTTTAGCTTTGGCTTGCCTAAAATGTTTGAGTATGAAATGTATTTACTGATGTTGGTTTATAATAATGGAATGTGAAGGTTGGTTTTTCGAACCACAAAATCGATGTGCTAAGTGATTTTACTCGTAAGCTATGTGAATGTGTTTTCGTAGCGCCACCTATGGTGTCAAGGGATTTCGAGGCTGAAAAAGAACGTGATCGGAGATCCAGGAACCTAAGCCTAGGTGAGGATATGGATGGAGGTTGTGATTGTGGTTTCGGGCCTAGATTAACCCGTTGTGGGTGGTTCTATGTGCACATATGAGTATGAATTTTGAGGATGTGAATAAGATGTGCAAGTTGACACCATGGCAGGGACTAACATGCGTGAGCTCAGTTTGCCGCATGATCCTTGAGGATAAGGGTCATGGGAGAGCTATTTTCAACCGTGTATTTAGTACGTCCTATCAGGGTGACCGACATATGGTATGGACTGGATGGTTAATATGCGTGAGCTCAGTTTGGCTGCATGTTTCATCCTTGACTTGAACATGTGTGAGCTATTCTTGGTCGCATATTCACCATTAGTTATGGTATTTTTCTTGGATATGGATAGGTTTGAGAAAATTTTCAAAATGATATGTAACTATTTGTAAGGCTAGGATCAAAAAAGGGAGTTGAGCCTTGGATAAAAGAATGATTATTCTAAATAAGACGTTAAGCATGAAGAAGTTTGCATTTTGAGGAAAGACAACGCGAGACAAAGTATTTGCATCTAAGAGTGGCGCGGTAAAGCAGGTGTTTCATGGAAGAGTTAAGCTTTTGCGTAGCAATGGAAAATGAGGTCTGGCAAAATGGAGTAAACGTTTGCTATTCGTCACGAAGTGAAGTTGAGAAGAGGGAGTTGGCGTTTGTAGTCTATTGCGAGAAGAAGAAGGTGAGGTTTAACTTCCCCAGATGATAAGGTTAGCATCTCAAAGGAAGTGTCTAATCCTGGGTTGACAACTGGCTACATGTTGAACTTTGGTTGGTTGCATGGTCTGGCAAGCAGTATGACGACACGTGTAAAGTTGCAAGTAGAAGCTGGCGAGTAAAGAGAGTTTTGGTGGTGACTAATTGGACCAAAGGATTAGTATAAATAAGGTTGAAGGGATCTAAGGAAGTTTTGTTATTCTAAGAAGTTATCAAGAAATAGAAATACTGAGCTTTTGTCAAGGAAGTTAGGCGAAAAAAGAAGAAGCTAGGCGTTTTGAGAATAAGGGAACCAAGTATTTTTGTGAGTGACATTTAAAAAATAAAAGAAGTATTTTGTGAGTGATTTCTTAAAAGAAATGTATTTGAAAGTATTCTTTTCGCGTTTGTAGTTATGCGTAACGCGTTCTGTATATCTATATATGTTGAGTTGTTGTTGATGTTGTTGATGTTGTTATTTGAAAAGAGAAAACTGTTGATTTCTATATGATGCTTGTGTGCGAGTAAACCATTAGTCTTATTCCTATCAAGTGAGTGGAAATTATGTGGTGTGCACATAATGTGTGAAGGCGTCGTGTGGACGACCTATGTAATGTGAAATGAATCAAGAAAATTTCGAAAATGTGGATAGAGTGAACATCGCAGTAGTCTAGACGTAGGGTGCTGGCAAGAGTGAATTGAAATAGTCTTAGGGCAGAGTATGATTCATGCTGTTGGTGGAAAGGAATAAAAGGTTAATGTGTGATTTACAAAATTAGCCTTTGTGAGCTTGCATTTATGAAAGATAGAGATTTTCTGTGATTTATGAAATGAGGCACTGTGAGCATGTGTTTATGAAATGAAAATGAGTTTCTGTGATTGTGTTATATTCCCCAAAAGGTACTTCTAAACTCTCACTCACTAAGTTTTTTACTTACGTTTTGAGTTTTCTTTTCCCAAGTGTTCAGGCGTTGAGGCCAAGTAAAGAAAGGTAAGATGAGTTATCTCACATGGAAGCTGAGCAAACAAACTACACTTTTTTACTTTGTATTTTATTGTAGTAAGAGAGTAGTTATACTCCTAAACACCTTGATCGCCGAAGGCTGCATCACAGTTTTGTGAAGGCGCGGCGAGACGAGACGTTCAAGGCTAGGATTTCCTTGTACTTAGAAAGAAAGGAAAGCGTAATTGTAAAGTGTTGGTCCAAGTGAATAAAAGTGGAGTTGTATCATTTAAGATGTTTGTTTGTTGATTTATTCCCGTTGCATTGTATTATGTCTATCGCTTAAAAGCTTCAAGAGCTTAAGTGTTGGAGACTAGGCGATAGAGTAAAGTTAAGCAAATTTGTGATTGGTTATCTTATTTGTTTTTCCGCTGCGATGTTGAAGTCTTTTGAGTTCAAAGTTAGAGCTCTACGATTGAGACTAGCTTAAGAAGTTGTTCTGCTTACTAGGCGTTCAGCGTTCATCAGGCGATGTGATTTACGTTGAGTGTCTAGGCGGCACGCCTCCATCTGGTCGCATGAAGTGACATTTGGGACAGGGATGACACTACTTTACATTATATGTTGAGGGGCTTTAATCATGTTTTTCTTTTAATTACCAACCCGTGTTTTGTTTATTCCTTGTTGGAATCATGTTTTATAATTCTGATTTTATTTTCTAAACTTGCTACTCATTGGGCATTAACTCACATTTTCAATGTTTTTTTTCTCCCAGGTAGCGGTTAAGTTTCAGATTTCCGTTGATTAGTGTCATAGATTGAAGACCCACCTAACTTTGTAACATTATTTTTTAGTTGAAAGCATATAGAAGTGTGCATTTTTTTCTCCCATTTTCAAGTTTGGCTGACCCATTTTTTAAGGAAAACTCTGTCAAAATTTTTATGGAATTTTATAAATGGCATTTTATCAATCTAGCGTGAAAGAAAGATTTTTAAAAGTAGCCTCACGTCTTGATCTAGGTTAGAGAGGGAAACTGGAATAGGGTGTGACAGTAATGTACAAGAGGACTATTGAATATAACATCTATATCAACAAAGCGATCGAATACTGTCTTTTTGAAGAGATCAAGTTGCGTAGGTGTAAGCTTCTCCTTCACTATCTTATTGGTTAGTGTGATGTGGGAAGACAAACTAGTAGTTTGGCCAAGAAACTGATCCCTTACATGAATTTTGAATTGCTTTGCCATATTGCATAGGAGAAAAGGAAAAAATTATAATTAGGCCACTATTAAATCCTCGTTCCTCGCTACCATTACACTCGTTACTTGATGCACGATATATTCGATACTCGATGCTCGTGCTTAATGCAAGATACACGATACTCAACCCTCTTAGACTTGTTACATGACAACCTATACTCGACGCTCATGTTCGGTGTTCGTTACGACACTATGTACAAGTGGCTATGCTTGAAATAACTTTTGTAAACATTAAACCACAAAAATAAATGTACATTCTAATTCTAATCACCAATGAGACAAACAAAAATGATATGTATATGCTTCAAATAAGGTTGAGTATCGAGATACTTGTTACATACATATGCTTCATAAAGGTTGTTACCTTTAGCAAATCAGAGTGACGTCAATAAGATGATGAATCACAAGAAGACAATGAATCGAATTTGAGAA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MILRSQSSSVFTVSSTITDNHTFKFHRRQLQLRDYGDGCGHRQFHVRVSKILLPTTAVTIGSCGGSLARRKSRNRFINVRSSASASDLSSSSQSQDITTPGSGPDKNEEAQRPGPDLKILLKRFWKVAAPYWFSDDKVQARWQLAAVFALTLGTTGISVGFNFLGRDFYNALANKDQEQFTKQLLYYLGAFAGGIPVFVLRDYAKDMLSLRWRSWMTKHYMERYLKDQSFYKIQSQSIIDNPDQRIVDDLSSFTGTALSFSLALFNSTVDLISFSNILYGIYPPLFVILLLYSIGGTAISVFLGKGLVNLNFLQEKKEADFRYGLVRIRENAESIAFYGGEENEMQLILQRFRSAVENLTKLLVASRNLEFFTNGYRYLIQILPAAVVAPMYFSGKIEFGVINQSVSAFNHILGDFSIIVYQFQAISAFSAIIDRLGEFDDLLDGSAPKALSNISEKIHLMYSHMESSPLLESNGSMAPDKRQKLLEIENMTLGAPNGATLVRDLTLIVKEKEHLLVMGPSGCGKTSLLRVLAGLWNVGKGKITFYIKDYPEQLVSQNEGPTEGHTGEDVSKENSRPLNKNYQGIFFLPQRPYMVLGTLRQQLLYPTWAEGSVTSAGHAESNVFPSFLTGASNINNVGENPDKPTTDDLIQVLDKVGLGYLLTRFSSLDITCEWSSVLSLGEQQRIAFARLLLSRPKLILLDESTSALDEANEARLYKLIASAGITYISIGHRRTLRHHHNSILHISKLSDDNQRNWNIEPIIRDDLYELSKQ Homology
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6NLC1 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ABCC2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 857.8 bits (2215), Expect = 9.3e-248 Identity = 463/680 (68.09%), Postives = 534/680 (78.53%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q55774 (Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein sll0182 OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=sll0182 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 383.3 bits (983), Expect = 6.7e-105 Identity = 237/634 (37.38%), Postives = 339/634 (53.47%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q57335 (Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein HI_0036 OS=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) OX=71421 GN=HI_0036 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 241.5 bits (615), Expect = 3.1e-62 Identity = 170/652 (26.07%), Postives = 302/652 (46.32%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P45221 (Uncharacterized ABC transporter ATP-binding protein HI_1467 OS=Haemophilus influenzae (strain ATCC 51907 / DSM 11121 / KW20 / Rd) OX=71421 GN=HI_1467 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 237.3 bits (604), Expect = 5.9e-61 Identity = 179/643 (27.84%), Postives = 297/643 (46.19%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P9WQI8 (Hydrophilic compounds import ATP-binding/permease protein BacA OS=Mycobacterium tuberculosis (strain CDC 1551 / Oshkosh) OX=83331 GN=bacA PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 216.1 bits (549), Expect = 1.4e-54 Identity = 193/667 (28.94%), Postives = 289/667 (43.33%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2X7 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496263 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1459.9 bits (3778), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/774 (96.77%), Postives = 757/774 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KEC9 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G134350 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1445.3 bits (3740), Expect = 0.0e+00 Identity = 738/773 (95.47%), Postives = 752/773 (97.28%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G908 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451833 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1362.4 bits (3525), Expect = 0.0e+00 Identity = 698/772 (90.41%), Postives = 726/772 (94.04%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1G8J5 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111451833 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1360.5 bits (3520), Expect = 0.0e+00 Identity = 695/768 (90.49%), Postives = 724/768 (94.27%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KXR4 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111499720 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1355.1 bits (3506), Expect = 0.0e+00 Identity = 693/772 (89.77%), Postives = 725/772 (93.91%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. NCBI nr
Match: XP_008456269.1 (PREDICTED: ABC transporter D family member 2, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1459.9 bits (3778), Expect = 0.0e+00 Identity = 749/774 (96.77%), Postives = 757/774 (97.80%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. NCBI nr
Match: XP_004140024.1 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN46777.1 hypothetical protein Csa_020665 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1445.3 bits (3740), Expect = 0.0e+00 Identity = 738/773 (95.47%), Postives = 752/773 (97.28%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. NCBI nr
Match: XP_038900355.1 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1418.7 bits (3671), Expect = 0.0e+00 Identity = 720/773 (93.14%), Postives = 744/773 (96.25%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. NCBI nr
Match: KAG6605375.1 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1373.6 bits (3554), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/773 (90.82%), Postives = 731/773 (94.57%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. NCBI nr
Match: KAG7035333.1 (ABC transporter D family member 2, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1372.5 bits (3551), Expect = 0.0e+00 Identity = 701/773 (90.69%), Postives = 731/773 (94.57%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. TAIR 10
Match: AT1G54350.1 (ABC transporter family protein ) HSP 1 Score: 857.8 bits (2215), Expect = 6.6e-249 Identity = 463/680 (68.09%), Postives = 534/680 (78.53%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. TAIR 10
Match: AT4G39850.1 (peroxisomal ABC transporter 1 ) HSP 1 Score: 167.2 bits (422), Expect = 5.3e-41 Identity = 182/645 (28.22%), Postives = 273/645 (42.33%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. TAIR 10
Match: AT4G39850.2 (peroxisomal ABC transporter 1 ) HSP 1 Score: 164.9 bits (416), Expect = 2.7e-40 Identity = 183/646 (28.33%), Postives = 274/646 (42.41%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. TAIR 10
Match: AT4G39850.3 (peroxisomal ABC transporter 1 ) HSP 1 Score: 157.9 bits (398), Expect = 3.2e-38 Identity = 180/650 (27.69%), Postives = 271/650 (41.69%), Query Frame = 0
BLAST of PI0005033 vs. TAIR 10
Match: AT2G36910.1 (ATP binding cassette subfamily B1 ) HSP 1 Score: 65.9 bits (159), Expect = 1.7e-10 Identity = 86/340 (25.29%), Postives = 152/340 (44.71%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (PI 482460) v1
Date Performed: 2021-10-25 Position : 0 Zoom : x 1
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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